*** DisA confo change ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606191832013078551.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606191832013078551.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606191832013078551.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 1
Last residue number = 346
Number of atoms found = 2600
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -13.830214 +/- 9.337023 From: -42.431000 To: 8.434000
= 21.341790 +/- 14.286789 From: -10.853000 To: 54.366000
= 37.364328 +/- 22.347285 From: -1.013000 To: 83.037000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.0351 % Filled.
Pdbmat> 923383 non-zero elements.
Pdbmat> 100882 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.60 +/- 21.40
Maximum number = 123
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.017640E+06
Pdbmat> Larger element = 481.302
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
346 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606191832013078551.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606191832013078551.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606191832013078551.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2600 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 346 residues.
Blocpdb> 14 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 15
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 34
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 11 atoms in block 7
Block first atom: 91
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 102
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 114
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 133
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 145
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 181
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 196
Blocpdb> 9 atoms in block 15
Block first atom: 214
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 223
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 239
Blocpdb> 14 atoms in block 18
Block first atom: 254
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 268
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 285
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 300
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 314
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 328
Blocpdb> 15 atoms in block 24
Block first atom: 340
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 355
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 369
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 384
Blocpdb> 10 atoms in block 28
Block first atom: 401
Blocpdb> 18 atoms in block 29
Block first atom: 411
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 429
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 448
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 465
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 480
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 496
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 505
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 519
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 533
Blocpdb> 10 atoms in block 38
Block first atom: 548
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 558
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 577
Blocpdb> 13 atoms in block 41
Block first atom: 595
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 608
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 624
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 639
Blocpdb> 13 atoms in block 45
Block first atom: 654
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 667
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 682
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 697
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 712
Blocpdb> 21 atoms in block 50
Block first atom: 723
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 744
Blocpdb> 14 atoms in block 52
Block first atom: 761
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 775
Blocpdb> 13 atoms in block 54
Block first atom: 791
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 804
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 820
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 836
Blocpdb> 14 atoms in block 58
Block first atom: 850
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 864
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 877
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 893
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 909
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 924
Blocpdb> 19 atoms in block 64
Block first atom: 938
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 957
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 972
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 992
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1009
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1024
Blocpdb> 12 atoms in block 70
Block first atom: 1038
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1050
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1066
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1083
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1096
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1110
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1123
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1138
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 1154
Blocpdb> 18 atoms in block 79
Block first atom: 1175
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1193
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1209
Blocpdb> 17 atoms in block 82
Block first atom: 1225
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1242
Blocpdb> 11 atoms in block 84
Block first atom: 1259
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1270
Blocpdb> 13 atoms in block 86
Block first atom: 1284
Blocpdb> 13 atoms in block 87
Block first atom: 1297
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1310
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1324
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1343
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1358
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1373
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 1387
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1407
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1424
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 1439
Blocpdb> 12 atoms in block 97
Block first atom: 1461
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1473
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1488
Blocpdb> 20 atoms in block 100
Block first atom: 1504
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1524
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1538
Blocpdb> 11 atoms in block 103
Block first atom: 1555
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1566
Blocpdb> 14 atoms in block 105
Block first atom: 1578
Blocpdb> 19 atoms in block 106
Block first atom: 1592
Blocpdb> 17 atoms in block 107
Block first atom: 1611
Blocpdb> 16 atoms in block 108
Block first atom: 1628
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1644
Blocpdb> 12 atoms in block 110
Block first atom: 1661
Blocpdb> 12 atoms in block 111
Block first atom: 1673
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1685
Blocpdb> 16 atoms in block 113
Block first atom: 1700
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1716
Blocpdb> 15 atoms in block 115
Block first atom: 1733
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1748
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 1767
Blocpdb> 13 atoms in block 118
Block first atom: 1789
Blocpdb> 16 atoms in block 119
Block first atom: 1802
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1818
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1832
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1845
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 1858
Blocpdb> 12 atoms in block 124
Block first atom: 1874
Blocpdb> 16 atoms in block 125
Block first atom: 1886
Blocpdb> 17 atoms in block 126
Block first atom: 1902
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 1919
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1932
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1946
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1958
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1974
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 1990
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 2008
Blocpdb> 14 atoms in block 134
Block first atom: 2021
Blocpdb> 18 atoms in block 135
Block first atom: 2035
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 2053
Blocpdb> 12 atoms in block 137
Block first atom: 2069
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 2081
Blocpdb> 10 atoms in block 139
Block first atom: 2095
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2105
Blocpdb> 13 atoms in block 141
Block first atom: 2122
Blocpdb> 14 atoms in block 142
Block first atom: 2135
Blocpdb> 18 atoms in block 143
Block first atom: 2149
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2167
Blocpdb> 16 atoms in block 145
Block first atom: 2183
Blocpdb> 13 atoms in block 146
Block first atom: 2199
Blocpdb> 12 atoms in block 147
Block first atom: 2212
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 2224
Blocpdb> 17 atoms in block 149
Block first atom: 2242
Blocpdb> 16 atoms in block 150
Block first atom: 2259
Blocpdb> 15 atoms in block 151
Block first atom: 2275
Blocpdb> 16 atoms in block 152
Block first atom: 2290
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 2306
Blocpdb> 16 atoms in block 154
Block first atom: 2321
Blocpdb> 15 atoms in block 155
Block first atom: 2337
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2352
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2367
Blocpdb> 13 atoms in block 158
Block first atom: 2380
Blocpdb> 10 atoms in block 159
Block first atom: 2393
Blocpdb> 11 atoms in block 160
Block first atom: 2403
Blocpdb> 12 atoms in block 161
Block first atom: 2414
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2426
Blocpdb> 13 atoms in block 163
Block first atom: 2443
Blocpdb> 12 atoms in block 164
Block first atom: 2456
Blocpdb> 12 atoms in block 165
Block first atom: 2468
Blocpdb> 13 atoms in block 166
Block first atom: 2480
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 2493
Blocpdb> 21 atoms in block 168
Block first atom: 2512
Blocpdb> 18 atoms in block 169
Block first atom: 2533
Blocpdb> 9 atoms in block 170
Block first atom: 2551
Blocpdb> 13 atoms in block 171
Block first atom: 2560
Blocpdb> 14 atoms in block 172
Block first atom: 2573
Blocpdb> 14 atoms in block 173
Block first atom: 2586
Blocpdb> 173 blocks.
Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 923556 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7800
Prepmat> Matrix trace = 2017640.0000
Prepmat> Last element read: 7800 7800 115.7459
Prepmat> 15052 lines saved.
Prepmat> 13261 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2600
RTB> Total mass = 2600.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2600
RTB> Number of blocks = 173
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 225597.5489
RTB> 61845 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1038
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61845
Diagstd> Projected matrix trace = 225597.5489
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1038 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 225597.5489
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1379943 0.2060329 0.2404661 0.8421920
1.8388237 2.5614005 2.6390039 4.8640211 5.2233011
5.7529644 9.9661076 10.2003940 10.4342288 11.1327826
11.5863242 12.6655225 13.5973712 14.3911520 15.6859555
15.8062730 16.5535235 17.7849064 18.5621566 19.5049324
19.9808110 21.4577595 21.5491472 22.5986179 22.7877297
23.3960857 24.3622787 24.8708742 26.0065587 26.0994650
26.9606109 27.3510813 27.8149817 28.5462565 29.0365306
29.6283643 30.0626292 30.2728244 30.7760326 30.9836478
31.3240923 32.1936387 32.9843687 33.2265753 34.8131567
35.2511665 36.2086132 36.6451995 37.0797286 37.4749723
37.5248824 38.5767191 39.3857057 39.4957468 40.3176574
40.4164795 41.0933426 42.0859479 42.6702750 43.5344010
44.1148159 44.3632211 45.1168178 45.5881265 46.1502887
46.9794082 47.4058451 48.0357954 48.3606044 48.8460351
49.4144985 49.8040148 50.5418812 51.2500987 52.0118788
52.3789819 52.7103519 53.6624697 54.3764739 54.6158239
55.1727634 55.5736848 56.0797704 57.0335457 57.6915596
57.9192262 58.5752134 58.7571885 59.5492102 59.8144190
60.0976450 61.1373429 61.6817317 62.0719298 62.7526076
62.9646478
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034324 0.0034327 0.0034337 0.0034344
0.0034352 40.3390648 49.2905378 53.2503137 99.6553998
147.2533968 173.7936986 176.4067902 239.4931006 248.1805895
260.4600518 342.8136191 346.8196966 350.7724355 362.3240346
369.6307708 386.4620347 400.4264504 411.9486281 430.0815081
431.7278051 441.8150490 457.9531724 467.8530844 479.5871133
485.4023072 503.0225643 504.0926026 516.2216557 518.3771028
525.2509932 535.9869719 541.5528004 553.7793086 554.7675917
563.8455333 567.9139416 572.7098725 580.1894964 585.1505831
591.0838843 595.3999041 597.4777695 602.4230724 604.4516313
607.7633785 616.1412891 623.6621229 625.9477326 640.7180853
644.7361578 653.4332444 657.3608350 661.2467545 664.7616243
665.2041500 674.4626807 681.4980159 682.4493823 689.5137411
690.3582525 696.1150359 704.4721635 709.3457995 716.4923647
721.2528063 723.2805989 729.3979028 733.1977987 737.7045998
744.3017687 747.6721895 752.6234978 755.1637605 758.9443620
763.3478315 766.3505212 772.0065436 777.3965936 783.1528832
785.9117946 788.3938683 795.4824606 800.7571058 802.5175250
806.5989432 809.5242765 813.2019166 820.0880170 824.8052566
826.4311072 831.0979669 832.3879481 837.9792857 839.8432276
841.8292419 849.0798999 852.8517779 855.5450916 860.2232346
861.6753507
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2600
Rtb_to_modes> Number of blocs = 173
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9878E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.27
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
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1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
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1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
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0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 46800 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
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0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
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0.99999 0.99997 1.00003 0.99997 1.00001
1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606191832013078551.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606191832013078551.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606191832013078551.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606191832013078551.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 1
Last residue number = 346
Number of atoms found = 2600
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9878E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1380
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2405
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8422
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.839
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.639
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.223
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.966
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96
Bfactors> 106 vectors, 7800 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.138000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.549 for 346 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.127 +/- 0.07
Bfactors> = 91.535 +/- 3.32
Bfactors> Shiftng-fct= 91.408
Bfactors> Scaling-fct= 46.687
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606191832013078551.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606191832013078551.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6
Chkmod> 106 vectors, 7800 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2600 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7384
0.0034 0.8271
0.0034 0.9649
0.0034 0.7789
0.0034 0.9244
0.0034 0.8746
40.3382 0.7157
49.2845 0.7156
53.2518 0.7809
99.6516 0.6565
147.2541 0.6003
173.7727 0.5851
176.3991 0.6952
239.4823 0.5334
248.1628 0.4940
260.4497 0.5333
342.7971 0.3486
346.7981 0.5334
350.6863 0.4955
362.2632 0.2683
369.6735 0.5010
386.5137 0.5635
400.4480 0.5693
411.9145 0.5805
430.1185 0.3905
431.7602 0.3950
441.7491 0.4067
457.8703 0.4468
467.8058 0.5053
479.5059 0.2797
485.3716 0.5226
503.0272 0.2552
504.0809 0.0823
516.2153 0.2778
518.3807 0.2793
525.2724 0.1819
535.9389 0.4775
541.5200 0.2139
553.7922 0.2325
554.7495 0.0561
563.8149 0.1516
567.8783 0.3001
572.6340 0.3364
580.2026 0.5146
585.1604 0.4815
591.0748 0.3669
595.3483 0.1365
597.4243 0.3081
602.4360 0.2279
604.3901 0.2601
607.6976 0.2590
616.0800 0.3737
623.5940 0.4495
625.9531 0.4088
640.6615 0.4434
644.6978 0.4078
653.4177 0.4497
657.3757 0.4505
661.2208 0.4932
664.6890 0.3795
665.1323 0.3309
674.4624 0.4644
681.5059 0.2493
682.4568 0.3824
689.5042 0.2979
690.3587 0.4002
696.0568 0.4114
704.4758 0.5159
709.3131 0.2213
716.4254 0.4240
721.1825 0.4321
723.2233 0.4954
729.3923 0.2780
733.1814 0.2489
737.6706 0.3474
744.2745 0.4855
747.6729 0.4471
752.6241 0.2943
755.1266 0.2480
758.9426 0.1870
763.2803 0.2476
766.2867 0.3450
771.9590 0.3934
777.3625 0.4347
783.1051 0.4485
785.8857 0.2851
788.3574 0.3413
795.4300 0.5432
800.7487 0.5624
802.5138 0.4057
806.5441 0.3855
809.4627 0.3898
813.1687 0.3381
820.0273 0.4526
824.7587 0.3949
826.4012 0.4263
831.0962 0.2759
832.3721 0.4702
837.9489 0.4563
839.7762 0.3329
841.8096 0.4076
849.0619 0.4273
852.8032 0.4881
855.4951 0.4125
860.1684 0.3646
861.6066 0.3121
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2606191832013078551.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606191832013078551.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2606191832013078551.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606191832013078551.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2606191832013078551.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2606191832013078551.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6
Projmod> 106 vectors, 7800 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 1
Last residue number = 346
Number of atoms found = 2600
Mean number per residue = 7.5
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 346
First residue number = 1
Last residue number = 346
Number of atoms found = 2600
Mean number per residue = 7.5
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2600 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 78.31
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.025 Sum= 0.001 q= 98.1898
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.044 Sum= 0.003 q= 175.4652
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.685 Sum= 0.472 q= 2735.0186
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.306 Sum= 0.565 q= -1222.0822
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.159 Sum= 0.590 q= 633.5483
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.061 Sum= 0.594 q= 243.3204
Vector: 7 F= 40.34 Cos= 0.182 Sum= 0.627 q= 728.4476
Vector: 8 F= 49.28 Cos= -0.002 Sum= 0.627 q= -8.1544
Vector: 9 F= 53.25 Cos= 0.268 Sum= 0.699 q= 1070.2481
Vector: 10 F= 99.65 Cos= 0.325 Sum= 0.805 q= 1296.8455
Vector: 11 F= 147.25 Cos= 0.099 Sum= 0.815 q= 396.8553
Vector: 12 F= 173.77 Cos= -0.015 Sum= 0.815 q= -60.3051
Vector: 13 F= 176.40 Cos= 0.229 Sum= 0.867 q= 912.9820
Vector: 14 F= 239.48 Cos= -0.183 Sum= 0.900 q= -729.0290
Vector: 15 F= 248.16 Cos= -0.045 Sum= 0.903 q= -180.0457
Vector: 16 F= 260.45 Cos= -0.041 Sum= 0.904 q= -163.0518
Vector: 17 F= 342.80 Cos= 0.038 Sum= 0.906 q= 152.0416
Vector: 18 F= 346.80 Cos= 0.109 Sum= 0.918 q= 436.7288
Vector: 19 F= 350.69 Cos= 0.047 Sum= 0.920 q= 186.9428
Vector: 20 F= 362.26 Cos= 0.005 Sum= 0.920 q= 21.3414
Vector: 21 F= 369.67 Cos= -0.037 Sum= 0.921 q= -147.5790
Vector: 22 F= 386.51 Cos= 0.098 Sum= 0.931 q= 390.0750
Vector: 23 F= 400.45 Cos= 0.082 Sum= 0.937 q= 326.5791
Vector: 24 F= 411.91 Cos= 0.009 Sum= 0.937 q= 34.2814
Vector: 25 F= 430.12 Cos= 0.006 Sum= 0.938 q= 22.5186
Vector: 26 F= 431.76 Cos= 0.006 Sum= 0.938 q= 24.4222
Vector: 27 F= 441.75 Cos= -0.038 Sum= 0.939 q= -149.9624
Vector: 28 F= 457.87 Cos= 0.051 Sum= 0.942 q= 203.7242
Vector: 29 F= 467.81 Cos= 0.025 Sum= 0.942 q= 99.5872
Vector: 30 F= 479.51 Cos= -0.036 Sum= 0.944 q= -144.9166
Vector: 31 F= 485.37 Cos= -0.016 Sum= 0.944 q= -64.2335
Vector: 32 F= 503.03 Cos= 0.016 Sum= 0.944 q= 64.1925
Vector: 33 F= 504.08 Cos= 0.008 Sum= 0.944 q= 30.2615
Vector: 34 F= 516.22 Cos= 0.010 Sum= 0.944 q= 40.1753
Vector: 35 F= 518.38 Cos= 0.005 Sum= 0.944 q= 18.4261
Vector: 36 F= 525.27 Cos= -0.012 Sum= 0.944 q= -48.4052
Vector: 37 F= 535.94 Cos= 0.030 Sum= 0.945 q= 120.9265
Vector: 38 F= 541.52 Cos= 0.004 Sum= 0.945 q= 14.9943
Vector: 39 F= 553.79 Cos= 0.011 Sum= 0.945 q= 45.5351
Vector: 40 F= 554.75 Cos= 0.012 Sum= 0.946 q= 49.1074
Vector: 41 F= 563.81 Cos= -0.001 Sum= 0.946 q= -3.3212
Vector: 42 F= 567.88 Cos= -0.014 Sum= 0.946 q= -57.4563
Vector: 43 F= 572.63 Cos= -0.028 Sum= 0.947 q= -110.1332
Vector: 44 F= 580.20 Cos= -0.019 Sum= 0.947 q= -75.0681
Vector: 45 F= 585.16 Cos= 0.002 Sum= 0.947 q= 7.0957
Vector: 46 F= 591.07 Cos= -0.001 Sum= 0.947 q= -3.5895
Vector: 47 F= 595.35 Cos= 0.020 Sum= 0.947 q= 78.1629
Vector: 48 F= 597.42 Cos= 0.015 Sum= 0.947 q= 60.0662
Vector: 49 F= 602.44 Cos= -0.017 Sum= 0.948 q= -68.3908
Vector: 50 F= 604.39 Cos= -0.003 Sum= 0.948 q= -11.4554
Vector: 51 F= 607.70 Cos= 0.008 Sum= 0.948 q= 31.1676
Vector: 52 F= 616.08 Cos= -0.003 Sum= 0.948 q= -10.4452
Vector: 53 F= 623.59 Cos= -0.007 Sum= 0.948 q= -26.3536
Vector: 54 F= 625.95 Cos= 0.014 Sum= 0.948 q= 57.1367
Vector: 55 F= 640.66 Cos= 0.003 Sum= 0.948 q= 10.1617
Vector: 56 F= 644.70 Cos= 0.007 Sum= 0.948 q= 28.9995
Vector: 57 F= 653.42 Cos= -0.028 Sum= 0.949 q= -112.2697
Vector: 58 F= 657.38 Cos= 0.004 Sum= 0.949 q= 14.5082
Vector: 59 F= 661.22 Cos= -0.042 Sum= 0.951 q= -165.9552
Vector: 60 F= 664.69 Cos= -0.037 Sum= 0.952 q= -148.4285
Vector: 61 F= 665.13 Cos= -0.018 Sum= 0.952 q= -71.9673
Vector: 62 F= 674.46 Cos= -0.001 Sum= 0.952 q= -3.6482
Vector: 63 F= 681.51 Cos= -0.030 Sum= 0.953 q= -121.6998
Vector: 64 F= 682.46 Cos= -0.013 Sum= 0.954 q= -53.2975
Vector: 65 F= 689.50 Cos= 0.035 Sum= 0.955 q= 139.7956
Vector: 66 F= 690.36 Cos= 0.012 Sum= 0.955 q= 46.9267
Vector: 67 F= 696.06 Cos= -0.017 Sum= 0.955 q= -66.6685
Vector: 68 F= 704.48 Cos= -0.002 Sum= 0.955 q= -6.6049
Vector: 69 F= 709.31 Cos= -0.010 Sum= 0.955 q= -40.5268
Vector: 70 F= 716.43 Cos= 0.022 Sum= 0.956 q= 88.0954
Vector: 71 F= 721.18 Cos= -0.021 Sum= 0.956 q= -85.5753
Vector: 72 F= 723.22 Cos= 0.012 Sum= 0.956 q= 46.4153
Vector: 73 F= 729.39 Cos= -0.009 Sum= 0.956 q= -37.1089
Vector: 74 F= 733.18 Cos= -0.012 Sum= 0.957 q= -49.1623
Vector: 75 F= 737.67 Cos= 0.010 Sum= 0.957 q= 39.4228
Vector: 76 F= 744.27 Cos= -0.003 Sum= 0.957 q= -11.2100
Vector: 77 F= 747.67 Cos= 0.020 Sum= 0.957 q= 81.5793
Vector: 78 F= 752.62 Cos= 0.006 Sum= 0.957 q= 24.2099
%Projmod-Wn> Eigenvector 79 Norm= 1.0001
Vector: 79 F= 755.13 Cos= -0.019 Sum= 0.958 q= -75.7528
Vector: 80 F= 758.94 Cos= 0.009 Sum= 0.958 q= 35.7509
Vector: 81 F= 763.28 Cos= -0.006 Sum= 0.958 q= -23.5208
Vector: 82 F= 766.29 Cos= -0.045 Sum= 0.960 q= -180.5938
Vector: 83 F= 771.96 Cos= -0.029 Sum= 0.961 q= -117.0086
Vector: 84 F= 777.36 Cos= -0.019 Sum= 0.961 q= -75.4329
Vector: 85 F= 783.11 Cos= 0.017 Sum= 0.961 q= 66.6079
Vector: 86 F= 785.89 Cos= 0.033 Sum= 0.962 q= 131.1722
Vector: 87 F= 788.36 Cos= -0.014 Sum= 0.962 q= -56.2184
Vector: 88 F= 795.43 Cos= -0.008 Sum= 0.962 q= -32.1857
Vector: 89 F= 800.75 Cos= 0.014 Sum= 0.963 q= 56.4019
Vector: 90 F= 802.51 Cos= 0.005 Sum= 0.963 q= 20.5392
Vector: 91 F= 806.54 Cos= 0.013 Sum= 0.963 q= 50.0691
Vector: 92 F= 809.46 Cos= -0.018 Sum= 0.963 q= -71.6803
Vector: 93 F= 813.17 Cos= -0.004 Sum= 0.963 q= -15.8166
Vector: 94 F= 820.03 Cos= -0.013 Sum= 0.963 q= -51.7689
Vector: 95 F= 824.76 Cos= 0.011 Sum= 0.964 q= 42.4489
Vector: 96 F= 826.40 Cos= 0.021 Sum= 0.964 q= 84.9990
Vector: 97 F= 831.10 Cos= 0.007 Sum= 0.964 q= 26.5976
Vector: 98 F= 832.37 Cos= 0.018 Sum= 0.964 q= 71.9968
Vector: 99 F= 837.95 Cos= -0.005 Sum= 0.964 q= -20.1376
Vector: 100 F= 839.78 Cos= -0.026 Sum= 0.965 q= -104.9969
Vector: 101 F= 841.81 Cos= 0.000 Sum= 0.965 q= 1.8284
Vector: 102 F= 849.06 Cos= -0.017 Sum= 0.965 q= -68.9840
Vector: 103 F= 852.80 Cos= 0.003 Sum= 0.965 q= 11.9683
Vector: 104 F= 855.50 Cos= 0.010 Sum= 0.965 q= 39.2509
Vector: 105 F= 860.17 Cos= -0.028 Sum= 0.966 q= -111.5062
Vector: 106 F= 861.61 Cos= 0.008 Sum= 0.966 q= 32.2697
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 40.338169
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.68 for mode 3 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.469 0.668 0.826 0.896 0.922 0.966
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606191832013078551 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
making animated gifs
11 models are in 2606191832013078551.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 346 2.189 301 1.872
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 346 1.868 327 1.738
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 346 1.578 341 1.531
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 346 1.339 343 1.312
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 346 1.184 346 1.184
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 346 1.145 346 1.145
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 346 1.235 345 1.226
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 346 1.429 344 1.411
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 346 1.693 340 1.647
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 346 1.997 319 1.823
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 346 2.328 290 1.949
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606191832013078551 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
making animated gifs
11 models are in 2606191832013078551.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 346 1.980 319 1.780
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 346 1.676 335 1.587
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 346 1.411 343 1.385
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 346 1.212 346 1.212
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 346 1.115 346 1.115
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 346 1.145 346 1.145
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 346 1.295 345 1.285
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 346 1.529 338 1.462
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 346 1.815 330 1.675
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 346 2.132 304 1.784
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 346 2.468 273 1.726
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606191832013078551 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
making animated gifs
11 models are in 2606191832013078551.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 346 1.647 340 1.601
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 346 1.354 345 1.340
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 346 1.120 345 1.105
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 346 0.987 345 0.973
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 346 0.997 346 0.997
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 346 1.145 346 1.145
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 346 1.389 345 1.381
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 346 1.687 330 1.555
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 346 2.015 308 1.669
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 346 2.361 288 1.759
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 346 2.718 250 1.264
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606191832013078551 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
making animated gifs
11 models are in 2606191832013078551.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 346 2.387 256 1.748
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 346 2.057 307 1.807
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 346 1.748 334 1.658
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 346 1.476 342 1.443
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 346 1.264 346 1.264
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 346 1.145 346 1.145
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 346 1.150 346 1.150
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 346 1.276 346 1.276
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 346 1.493 343 1.471
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 346 1.768 332 1.660
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 346 2.078 310 1.773
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606191832013078551 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606191832013078551.eigenfacs
2606191832013078551.atom
making animated gifs
11 models are in 2606191832013078551.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606191832013078551.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 346 1.689 319 1.282
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 346 1.401 333 1.201
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 346 1.169 342 1.104
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 346 1.028 345 1.009
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 346 1.020 346 1.020
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 346 1.145 346 1.145
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 346 1.369 346 1.369
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 346 1.651 339 1.601
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 346 1.967 322 1.805
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 346 2.302 284 1.918
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 346 2.650 253 2.031
2606191832013078551.10.pdb
2606191832013078551.11.pdb
2606191832013078551.7.pdb
2606191832013078551.8.pdb
2606191832013078551.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m16.876s
user 0m16.760s
sys 0m0.111s
rm: cannot remove '2606191832013078551.sdijf': No such file or directory
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