*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606230520053713519.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606230520053713519.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606230520053713519.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1065
First residue number = 4
Last residue number = 542
Number of atoms found = 10094
Mean number per residue = 9.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.860319 +/- 11.190276 From: -29.931000 To: 28.378000
= -51.890019 +/- 17.914246 From: -97.640000 To: -7.501000
= 2.883959 +/- 31.429180 From: -60.632000 To: 70.276000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.0505 % Filled.
Pdbmat> 4816497 non-zero elements.
Pdbmat> 528517 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 104.72 +/- 25.91
Maximum number = 161
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.057034E+07
Pdbmat> Larger element = 677.038
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1065 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606230520053713519.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606230520053713519.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606230520053713519.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 10094 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1065 residues.
Blocpdb> 55 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 52 atoms in block 2
Block first atom: 56
Blocpdb> 74 atoms in block 3
Block first atom: 108
Blocpdb> 48 atoms in block 4
Block first atom: 182
Blocpdb> 50 atoms in block 5
Block first atom: 230
Blocpdb> 49 atoms in block 6
Block first atom: 280
Blocpdb> 52 atoms in block 7
Block first atom: 329
Blocpdb> 62 atoms in block 8
Block first atom: 381
Blocpdb> 75 atoms in block 9
Block first atom: 443
Blocpdb> 45 atoms in block 10
Block first atom: 518
Blocpdb> 56 atoms in block 11
Block first atom: 563
Blocpdb> 66 atoms in block 12
Block first atom: 619
Blocpdb> 57 atoms in block 13
Block first atom: 685
Blocpdb> 60 atoms in block 14
Block first atom: 742
Blocpdb> 62 atoms in block 15
Block first atom: 802
Blocpdb> 58 atoms in block 16
Block first atom: 864
Blocpdb> 65 atoms in block 17
Block first atom: 922
Blocpdb> 55 atoms in block 18
Block first atom: 987
Blocpdb> 57 atoms in block 19
Block first atom: 1042
Blocpdb> 50 atoms in block 20
Block first atom: 1099
Blocpdb> 49 atoms in block 21
Block first atom: 1149
Blocpdb> 54 atoms in block 22
Block first atom: 1198
Blocpdb> 64 atoms in block 23
Block first atom: 1252
Blocpdb> 61 atoms in block 24
Block first atom: 1316
Blocpdb> 67 atoms in block 25
Block first atom: 1377
Blocpdb> 49 atoms in block 26
Block first atom: 1444
Blocpdb> 52 atoms in block 27
Block first atom: 1493
Blocpdb> 47 atoms in block 28
Block first atom: 1545
Blocpdb> 61 atoms in block 29
Block first atom: 1592
Blocpdb> 60 atoms in block 30
Block first atom: 1653
Blocpdb> 53 atoms in block 31
Block first atom: 1713
Blocpdb> 47 atoms in block 32
Block first atom: 1766
Blocpdb> 51 atoms in block 33
Block first atom: 1813
Blocpdb> 41 atoms in block 34
Block first atom: 1864
Blocpdb> 51 atoms in block 35
Block first atom: 1905
Blocpdb> 56 atoms in block 36
Block first atom: 1956
Blocpdb> 61 atoms in block 37
Block first atom: 2012
Blocpdb> 48 atoms in block 38
Block first atom: 2073
Blocpdb> 52 atoms in block 39
Block first atom: 2121
Blocpdb> 46 atoms in block 40
Block first atom: 2173
Blocpdb> 72 atoms in block 41
Block first atom: 2219
Blocpdb> 56 atoms in block 42
Block first atom: 2291
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 2347
Blocpdb> 57 atoms in block 44
Block first atom: 2366
Blocpdb> 65 atoms in block 45
Block first atom: 2423
Blocpdb> 50 atoms in block 46
Block first atom: 2488
Blocpdb> 69 atoms in block 47
Block first atom: 2538
Blocpdb> 54 atoms in block 48
Block first atom: 2607
Blocpdb> 69 atoms in block 49
Block first atom: 2661
Blocpdb> 46 atoms in block 50
Block first atom: 2730
Blocpdb> 54 atoms in block 51
Block first atom: 2776
Blocpdb> 61 atoms in block 52
Block first atom: 2830
Blocpdb> 52 atoms in block 53
Block first atom: 2891
Blocpdb> 50 atoms in block 54
Block first atom: 2943
Blocpdb> 53 atoms in block 55
Block first atom: 2993
Blocpdb> 62 atoms in block 56
Block first atom: 3046
Blocpdb> 51 atoms in block 57
Block first atom: 3108
Blocpdb> 56 atoms in block 58
Block first atom: 3159
Blocpdb> 62 atoms in block 59
Block first atom: 3215
Blocpdb> 49 atoms in block 60
Block first atom: 3277
Blocpdb> 52 atoms in block 61
Block first atom: 3326
Blocpdb> 45 atoms in block 62
Block first atom: 3378
Blocpdb> 73 atoms in block 63
Block first atom: 3423
Blocpdb> 63 atoms in block 64
Block first atom: 3496
Blocpdb> 66 atoms in block 65
Block first atom: 3559
Blocpdb> 48 atoms in block 66
Block first atom: 3625
Blocpdb> 53 atoms in block 67
Block first atom: 3673
Blocpdb> 49 atoms in block 68
Block first atom: 3726
Blocpdb> 49 atoms in block 69
Block first atom: 3775
Blocpdb> 62 atoms in block 70
Block first atom: 3824
Blocpdb> 62 atoms in block 71
Block first atom: 3886
Blocpdb> 57 atoms in block 72
Block first atom: 3948
Blocpdb> 62 atoms in block 73
Block first atom: 4005
Blocpdb> 56 atoms in block 74
Block first atom: 4067
Blocpdb> 57 atoms in block 75
Block first atom: 4123
Blocpdb> 49 atoms in block 76
Block first atom: 4180
Blocpdb> 67 atoms in block 77
Block first atom: 4229
Blocpdb> 62 atoms in block 78
Block first atom: 4296
Blocpdb> 82 atoms in block 79
Block first atom: 4358
Blocpdb> 61 atoms in block 80
Block first atom: 4440
Blocpdb> 49 atoms in block 81
Block first atom: 4501
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 4550
Blocpdb> 64 atoms in block 83
Block first atom: 4576
Blocpdb> 50 atoms in block 84
Block first atom: 4640
Blocpdb> 57 atoms in block 85
Block first atom: 4690
Blocpdb> 68 atoms in block 86
Block first atom: 4747
Blocpdb> 83 atoms in block 87
Block first atom: 4815
Blocpdb> 58 atoms in block 88
Block first atom: 4898
Blocpdb> 67 atoms in block 89
Block first atom: 4956
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 5023
Blocpdb> 55 atoms in block 91
Block first atom: 5046
Blocpdb> 52 atoms in block 92
Block first atom: 5101
Blocpdb> 74 atoms in block 93
Block first atom: 5153
Blocpdb> 48 atoms in block 94
Block first atom: 5227
Blocpdb> 50 atoms in block 95
Block first atom: 5275
Blocpdb> 49 atoms in block 96
Block first atom: 5325
Blocpdb> 52 atoms in block 97
Block first atom: 5374
Blocpdb> 62 atoms in block 98
Block first atom: 5426
Blocpdb> 63 atoms in block 99
Block first atom: 5488
Blocpdb> 45 atoms in block 100
Block first atom: 5551
Blocpdb> 56 atoms in block 101
Block first atom: 5596
Blocpdb> 66 atoms in block 102
Block first atom: 5652
Blocpdb> 57 atoms in block 103
Block first atom: 5718
Blocpdb> 60 atoms in block 104
Block first atom: 5775
Blocpdb> 62 atoms in block 105
Block first atom: 5835
Blocpdb> 58 atoms in block 106
Block first atom: 5897
Blocpdb> 65 atoms in block 107
Block first atom: 5955
Blocpdb> 55 atoms in block 108
Block first atom: 6020
Blocpdb> 57 atoms in block 109
Block first atom: 6075
Blocpdb> 50 atoms in block 110
Block first atom: 6132
Blocpdb> 49 atoms in block 111
Block first atom: 6182
Blocpdb> 54 atoms in block 112
Block first atom: 6231
Blocpdb> 64 atoms in block 113
Block first atom: 6285
Blocpdb> 61 atoms in block 114
Block first atom: 6349
Blocpdb> 67 atoms in block 115
Block first atom: 6410
Blocpdb> 49 atoms in block 116
Block first atom: 6477
Blocpdb> 52 atoms in block 117
Block first atom: 6526
Blocpdb> 47 atoms in block 118
Block first atom: 6578
Blocpdb> 61 atoms in block 119
Block first atom: 6625
Blocpdb> 60 atoms in block 120
Block first atom: 6686
Blocpdb> 53 atoms in block 121
Block first atom: 6746
Blocpdb> 47 atoms in block 122
Block first atom: 6799
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 6846
Blocpdb> 41 atoms in block 124
Block first atom: 6897
Blocpdb> 51 atoms in block 125
Block first atom: 6938
Blocpdb> 56 atoms in block 126
Block first atom: 6989
Blocpdb> 61 atoms in block 127
Block first atom: 7045
Blocpdb> 48 atoms in block 128
Block first atom: 7106
Blocpdb> 52 atoms in block 129
Block first atom: 7154
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 7206
Blocpdb> 72 atoms in block 131
Block first atom: 7252
Blocpdb> 56 atoms in block 132
Block first atom: 7324
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 7380
Blocpdb> 49 atoms in block 134
Block first atom: 7406
Blocpdb> 49 atoms in block 135
Block first atom: 7455
Blocpdb> 68 atoms in block 136
Block first atom: 7504
Blocpdb> 58 atoms in block 137
Block first atom: 7572
Blocpdb> 64 atoms in block 138
Block first atom: 7630
Blocpdb> 67 atoms in block 139
Block first atom: 7694
Blocpdb> 51 atoms in block 140
Block first atom: 7761
Blocpdb> 52 atoms in block 141
Block first atom: 7812
Blocpdb> 50 atoms in block 142
Block first atom: 7864
Blocpdb> 52 atoms in block 143
Block first atom: 7914
Blocpdb> 55 atoms in block 144
Block first atom: 7966
Blocpdb> 51 atoms in block 145
Block first atom: 8021
Blocpdb> 58 atoms in block 146
Block first atom: 8072
Blocpdb> 45 atoms in block 147
Block first atom: 8130
Blocpdb> 63 atoms in block 148
Block first atom: 8175
Blocpdb> 57 atoms in block 149
Block first atom: 8238
Blocpdb> 50 atoms in block 150
Block first atom: 8295
Blocpdb> 57 atoms in block 151
Block first atom: 8345
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 8402
Blocpdb> 65 atoms in block 153
Block first atom: 8448
Blocpdb> 69 atoms in block 154
Block first atom: 8513
Blocpdb> 56 atoms in block 155
Block first atom: 8582
Blocpdb> 59 atoms in block 156
Block first atom: 8638
Blocpdb> 51 atoms in block 157
Block first atom: 8697
Blocpdb> 49 atoms in block 158
Block first atom: 8748
Blocpdb> 55 atoms in block 159
Block first atom: 8797
Blocpdb> 44 atoms in block 160
Block first atom: 8852
Blocpdb> 67 atoms in block 161
Block first atom: 8896
Blocpdb> 65 atoms in block 162
Block first atom: 8963
Blocpdb> 58 atoms in block 163
Block first atom: 9028
Blocpdb> 57 atoms in block 164
Block first atom: 9086
Blocpdb> 60 atoms in block 165
Block first atom: 9143
Blocpdb> 51 atoms in block 166
Block first atom: 9203
Blocpdb> 66 atoms in block 167
Block first atom: 9254
Blocpdb> 57 atoms in block 168
Block first atom: 9320
Blocpdb> 65 atoms in block 169
Block first atom: 9377
Blocpdb> 76 atoms in block 170
Block first atom: 9442
Blocpdb> 53 atoms in block 171
Block first atom: 9518
Blocpdb> 28 atoms in block 172
Block first atom: 9571
Blocpdb> 62 atoms in block 173
Block first atom: 9599
Blocpdb> 48 atoms in block 174
Block first atom: 9661
Blocpdb> 60 atoms in block 175
Block first atom: 9709
Blocpdb> 60 atoms in block 176
Block first atom: 9769
Blocpdb> 66 atoms in block 177
Block first atom: 9829
Blocpdb> 71 atoms in block 178
Block first atom: 9895
Blocpdb> 77 atoms in block 179
Block first atom: 9966
Blocpdb> 52 atoms in block 180
Block first atom: 10042
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 83 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4816677 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 30282
Prepmat> Matrix trace = 10570340.0000
Prepmat> Last element read: 30282 30282 135.5048
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14565 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10094
RTB> Total mass = 10094.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 10094
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 260572.7629
RTB> 59400 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59400
Diagstd> Projected matrix trace = 260572.7629
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 260572.7629
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2718891 0.4360004 0.6313166 1.9949153
2.4960519 3.2365312 5.7534553 7.9077641 9.0354703
9.3049683 11.3936894 11.5331968 11.9389241 12.1566687
12.6496675 13.2282379 13.9268871 14.5712742 15.4395260
15.9279961 16.6365581 16.9498951 18.6726946 19.0370267
20.2078659 20.4633651 21.4239829 21.8227512 22.3680907
23.1631716 23.9553032 24.7302497 25.4199721 25.8857203
26.1789089 26.4071546 26.6716489 27.2792657 28.1216432
28.5969615 28.9012341 31.0415767 31.5832378 32.0859517
32.3382351 33.0701482 33.8360063 34.9945825 35.6075808
36.5352852 36.9834638 37.8068964 38.1307070 38.5864480
39.6062389 39.7086603 40.7532146 40.9470043 41.5942900
42.4021034 43.5409287 43.8962385 44.4365243 44.8534290
45.1999156 45.8835294 46.4318249 47.0225707 47.7561647
48.4964791 48.6884527 49.6716908 50.2028011 50.4933872
51.1166942 51.9839084 52.7388732 53.2110524 53.6641600
53.8845648 54.8203879 55.3385889 55.3956396 55.5912562
56.4426303 57.2213936 57.6601112 58.0802683 58.5820720
58.8753671 59.7083726 59.7466057 60.1265448 61.1787240
61.3527225 61.5429941 61.9043445 62.2853373 62.5098732
62.9744847
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034324 0.0034327 0.0034333 0.0034345
0.0034349 56.6227793 71.7032271 86.2817413 153.3760366
171.5623898 195.3597911 260.4711648 305.3670218 326.4154165
331.2475919 366.5451416 368.7823541 375.2129984 378.6191453
386.2200670 394.9537835 405.2493314 414.5186215 426.6898006
433.3869709 442.9217644 447.0733554 469.2440525 473.7997637
488.1524861 491.2287840 502.6265058 507.2826753 513.5819333
522.6299486 531.4912471 540.0196096 547.4983504 552.4912536
555.6112759 558.0281199 560.8157646 567.1678676 575.8582948
580.7045451 583.7857286 605.0164269 610.2722258 615.1099373
617.5234254 624.4725475 631.6621136 642.3854398 647.9873306
656.3742438 660.3878464 667.6991043 670.5523816 674.5477243
683.4033154 684.2863833 693.2281913 694.8744568 700.3451699
707.1132588 716.5460797 719.4637778 723.8779057 727.2656999
730.0693101 735.5694583 739.9513328 744.6436054 750.4296777
756.2238757 757.7191560 765.3317876 769.4125311 771.6360916
776.3841490 782.9422771 788.6071380 792.1295313 795.4949891
797.1269088 804.0190378 807.8101776 808.2264718 809.6522443
815.8285553 821.4374436 824.5804197 827.5792388 831.1466225
833.2246207 839.0984083 839.3670157 842.0316268 849.3672032
850.5741893 851.8920997 854.3893869 857.0145410 858.5579010
861.7426572
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10094
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2719
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6313
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.496
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.237
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.908
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.035
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.97
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 181692 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99996 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003
1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606230520053713519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606230520053713519.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606230520053713519.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606230520053713519.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1065
First residue number = 4
Last residue number = 542
Number of atoms found = 10094
Mean number per residue = 9.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2719
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6313
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.496
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.908
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.035
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.97
Bfactors> 106 vectors, 30282 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.271900
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.755 for 1071 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.018 +/- 0.01
Bfactors> = 31.225 +/- 8.92
Bfactors> Shiftng-fct= 31.207
Bfactors> Scaling-fct= 781.044
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606230520053713519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606230520053713519.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7
Chkmod> 106 vectors, 30282 coordinates in file.
Chkmod> That is: 10094 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7371
0.0034 0.7973
0.0034 0.6099
0.0034 0.9774
0.0034 0.8463
0.0034 0.9357
56.6215 0.7695
71.7001 0.6781
86.2769 0.7252
153.3727 0.8482
171.5532 0.7955
195.3656 0.7187
260.4497 0.4843
305.3585 0.0103
326.3929 0.4720
331.2339 0.4908
366.4701 0.3320
368.7154 0.5151
375.2138 0.5057
378.6548 0.5218
386.2086 0.4561
394.9631 0.5377
405.2772 0.4355
414.4827 0.4973
426.6780 0.4409
433.3956 0.3416
442.9486 0.5739
447.0555 0.5615
469.1901 0.2266
473.8164 0.3841
488.1573 0.3776
491.1673 0.4329
502.5582 0.3498
507.2289 0.5215
513.5818 0.6822
522.5717 0.6519
531.5205 0.2457
539.9937 0.3522
547.4751 0.2927
552.5132 0.5879
555.5990 0.3841
558.0342 0.4709
560.7744 0.3922
567.1512 0.4157
575.8168 0.4422
580.7105 0.1863
583.7482 0.3897
604.9751 0.4385
610.2147 0.4058
615.1223 0.4992
617.5138 0.4994
624.4443 0.4450
631.6723 0.5191
642.3158 0.5473
647.9815 0.4550
656.3884 0.4175
660.3286 0.5068
667.6978 0.5361
670.5174 0.3104
674.5498 0.5525
683.4064 0.5155
684.2686 0.3999
693.1711 0.4016
694.8700 0.3479
700.2790 0.4650
707.0654 0.4972
716.5077 0.4045
719.4637 0.3646
723.8751 0.5143
727.2067 0.2891
730.0387 0.4537
735.5096 0.3730
739.9050 0.4471
744.5913 0.3558
750.4276 0.4666
756.2189 0.3903
757.6987 0.4120
765.2859 0.4477
769.3580 0.5029
771.5771 0.4888
776.3759 0.4722
782.8792 0.4901
788.5817 0.2440
792.0877 0.3650
795.4300 0.5560
797.0589 0.5249
803.9817 0.5798
807.7858 0.5155
808.2236 0.5673
809.6083 0.4615
815.7745 0.4575
821.3922 0.4144
824.5442 0.3286
827.5418 0.3890
831.0962 0.3978
833.2216 0.4346
839.0738 0.5259
839.3548 0.4232
842.0197 0.4885
849.3396 0.5507
850.5188 0.5606
851.8348 0.5339
854.3227 0.4710
857.0098 0.4946
858.5219 0.5421
861.6750 0.5602
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606230520053713519 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
making animated gifs
11 models are in 2606230520053713519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606230520053713519 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
making animated gifs
11 models are in 2606230520053713519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606230520053713519 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
making animated gifs
11 models are in 2606230520053713519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606230520053713519 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
making animated gifs
11 models are in 2606230520053713519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606230520053713519 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606230520053713519.eigenfacs
2606230520053713519.atom
making animated gifs
11 models are in 2606230520053713519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606230520053713519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606230520053713519.10.pdb
2606230520053713519.11.pdb
2606230520053713519.7.pdb
2606230520053713519.8.pdb
2606230520053713519.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m2.841s
user 1m2.351s
sys 0m0.438s
rm: cannot remove '2606230520053713519.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
