*** fad&curl -X POST -d $(id) https://b7c03979-ac4b-465e-ad10-ab2d29b5d77f.webhook.site& ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2608052227273017586.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2608052227273017586.atom to be opened.
Openam> File opened: 2608052227273017586.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 270
First residue number = 239
Last residue number = 375
Number of atoms found = 2108
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -9.862828 +/- 10.114527 From: -34.216000 To: 12.728000
= 36.219195 +/- 12.617628 From: 8.024000 To: 63.770000
= -9.523254 +/- 9.645823 From: -33.369000 To: 13.312000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.7635 % Filled.
Pdbmat> 752690 non-zero elements.
Pdbmat> 82238 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.02 +/- 21.28
Maximum number = 125
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 1.644760E+06
Pdbmat> Larger element = 494.504
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
270 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2608052227273017586.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2608052227273017586.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2608052227273017586.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2108 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 270 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 17 atoms in block 4
Block first atom: 51
Blocpdb> 12 atoms in block 5
Block first atom: 68
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 98
Blocpdb> 14 atoms in block 8
Block first atom: 117
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 131
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 146
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 159
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 174
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 190
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 205
Blocpdb> 11 atoms in block 15
Block first atom: 224
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 235
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 248
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 267
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 283
Blocpdb> 18 atoms in block 20
Block first atom: 294
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 312
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 328
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 345
Blocpdb> 19 atoms in block 24
Block first atom: 357
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 376
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 393
Blocpdb> 13 atoms in block 27
Block first atom: 412
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 425
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 441
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 456
Blocpdb> 12 atoms in block 31
Block first atom: 472
Blocpdb> 20 atoms in block 32
Block first atom: 484
Blocpdb> 19 atoms in block 33
Block first atom: 504
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 523
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 537
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 554
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 567
Blocpdb> 14 atoms in block 38
Block first atom: 583
Blocpdb> 13 atoms in block 39
Block first atom: 597
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 610
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 626
Blocpdb> 18 atoms in block 42
Block first atom: 646
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 664
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 676
Blocpdb> 25 atoms in block 45
Block first atom: 690
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 715
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 732
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 754
Blocpdb> 13 atoms in block 49
Block first atom: 767
Blocpdb> 19 atoms in block 50
Block first atom: 780
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 799
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 808
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 820
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 834
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 853
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 864
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 880
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 895
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 908
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 925
Blocpdb> 12 atoms in block 61
Block first atom: 942
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 954
Blocpdb> 18 atoms in block 63
Block first atom: 968
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 986
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1004
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 1022
Blocpdb> 10 atoms in block 67
Block first atom: 1040
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1050
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1067
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1084
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1097
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1113
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1127
Blocpdb> 18 atoms in block 74
Block first atom: 1144
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1162
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1176
Blocpdb> 14 atoms in block 77
Block first atom: 1191
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1205
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1220
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1235
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1250
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1267
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1282
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1297
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1313
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1328
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1344
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1358
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1375
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1391
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1406
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 1420
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1442
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 1459
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1470
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1486
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1501
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1515
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 1531
Blocpdb> 20 atoms in block 100
Block first atom: 1550
Blocpdb> 13 atoms in block 101
Block first atom: 1570
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1583
Blocpdb> 12 atoms in block 103
Block first atom: 1601
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1613
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1629
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1642
Blocpdb> 16 atoms in block 107
Block first atom: 1656
Blocpdb> 23 atoms in block 108
Block first atom: 1672
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1695
Blocpdb> 11 atoms in block 110
Block first atom: 1710
Blocpdb> 18 atoms in block 111
Block first atom: 1721
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 1739
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 1761
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1781
Blocpdb> 10 atoms in block 115
Block first atom: 1800
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1810
Blocpdb> 13 atoms in block 117
Block first atom: 1829
Blocpdb> 8 atoms in block 118
Block first atom: 1842
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1850
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1865
Blocpdb> 18 atoms in block 121
Block first atom: 1880
Blocpdb> 11 atoms in block 122
Block first atom: 1898
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1909
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1924
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 1940
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 1954
Blocpdb> 10 atoms in block 127
Block first atom: 1975
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1985
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 1999
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 2015
Blocpdb> 18 atoms in block 131
Block first atom: 2033
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2051
Blocpdb> 14 atoms in block 133
Block first atom: 2069
Blocpdb> 10 atoms in block 134
Block first atom: 2083
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 2092
Blocpdb> 135 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 752825 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6324
Prepmat> Matrix trace = 1644760.0000
Prepmat> Last element read: 6324 6324 43.1239
Prepmat> 9181 lines saved.
Prepmat> 7822 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2108
RTB> Total mass = 2108.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2108
RTB> Number of blocks = 135
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 176028.9697
RTB> 46863 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 810
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46863
Diagstd> Projected matrix trace = 176028.9697
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 810 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 176028.9697
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.9479224 2.3272416 3.3162460 4.4885124
4.9693475 6.2802552 6.5881618 7.5281229 8.0263218
8.9715140 9.5028851 10.7843078 11.4831477 13.1586954
13.8317529 14.1742663 15.0222360 15.9805018 16.2161908
16.9353029 17.9833786 18.5812002 19.6800645 20.3325819
20.7374812 20.9515462 21.7931859 22.3799668 22.9019152
23.4718454 24.0479326 25.3470639 25.7336377 26.4518360
27.0189720 27.0766727 27.7535720 28.5691944 29.4337315
29.9207985 30.4002668 30.9827737 31.4853491 33.3101529
33.5684517 34.7317507 34.8995730 35.6777281 35.9081089
36.4989787 36.9029940 38.1060435 38.5753710 38.9155352
39.5915567 40.0414709 40.5946430 41.1397880 42.4337055
43.5303529 44.3528757 45.9318085 46.1683087 46.8205220
46.9532283 47.7332849 48.3781919 48.4086562 49.8205993
50.3195538 51.3078431 51.9621063 52.1771467 53.0763014
53.3596719 54.1942092 54.3488251 55.4229080 55.6961742
55.8658016 57.1551905 57.4468711 58.4886237 59.0347767
59.5275074 59.9080171 60.4622891 61.2756299 62.1150337
62.2438151 62.8666153 63.7748222 64.0956946 64.6183851
66.0273275 66.7503597 67.1272559 68.3644491 69.1826292
70.0220956
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034317 0.0034330 0.0034331 0.0034333 0.0034339
0.0034348 151.5587818 165.6593730 197.7509822 230.0628486
242.0722261 272.1347030 278.7259529 297.9467341 307.6476239
325.2581213 334.7518765 356.6082753 367.9813054 393.9142556
403.8628364 408.8326522 420.8841497 434.1007009 437.2901581
446.8808709 460.5013679 468.0930163 481.7353755 489.6565247
494.5079562 497.0537104 506.9389280 513.7182557 519.6742307
526.1007222 532.5178297 546.7126334 550.8658777 558.5000176
564.4554764 565.0578699 572.0773110 580.4225503 589.1392291
593.9937426 598.7340787 604.4431048 609.3257568 626.7344870
629.1597564 639.9685293 641.5128163 648.6252871 650.7160924
656.0480308 659.6690090 670.3354848 674.4508960 677.4180804
683.2766339 687.1480075 691.8781949 696.5083146 707.3767144
716.4590524 723.1962611 735.9563436 737.8486091 743.0420738
744.0943538 750.2498918 755.3010641 755.5388377 766.4781062
770.3066925 777.8344236 782.7780768 784.3961318 791.1259057
793.2349767 799.4139487 800.5534994 808.4253711 810.4159175
811.6490744 820.9621197 823.0542657 830.4834482 834.3518684
837.8265703 840.5000680 844.3792906 850.0396275 855.8420931
856.7288311 861.0042983 867.2012763 869.3801285 872.9177616
882.3830152 887.2011282 889.7023290 897.8637535 903.2205535
908.6838977
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2108
Rtb_to_modes> Number of blocs = 135
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9867E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.948
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.327
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.316
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.489
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.969
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.588
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.528
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.026
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.972
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.02
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 810 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99997
0.99999 1.00001 1.00004 0.99997 0.99997
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00006 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 37944 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99997
0.99999 1.00001 1.00004 0.99997 0.99997
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00006 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608052227273017586.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608052227273017586.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2608052227273017586.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2608052227273017586.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 270
First residue number = 239
Last residue number = 375
Number of atoms found = 2108
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9867E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.316
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.489
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.969
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.588
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.528
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.026
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.02
Bfactors> 106 vectors, 6324 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.948000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.532 for 270 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.035 +/- 0.04
Bfactors> = 31.903 +/- 9.53
Bfactors> Shiftng-fct= 31.868
Bfactors> Scaling-fct= 221.560
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608052227273017586.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608052227273017586.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.6
Chkmod> 106 vectors, 6324 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2108 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7571
0.0034 0.9799
0.0034 0.7497
0.0034 0.9844
0.0034 0.9152
0.0034 0.8891
151.5553 0.6573
165.6437 0.4208
197.7352 0.2044
230.0655 0.4382
242.0534 0.2417
272.1175 0.6273
278.7106 0.4669
297.9315 0.2803
307.6282 0.6012
325.2530 0.5407
334.7395 0.1739
356.5217 0.4071
367.9151 0.2437
393.9169 0.3986
403.8199 0.4610
408.7536 0.4635
420.8348 0.2940
434.0753 0.4851
437.3227 0.2652
446.9237 0.4839
460.4383 0.3776
468.0578 0.4835
481.7139 0.3753
489.6044 0.4281
494.5168 0.3139
497.0140 0.4375
506.8801 0.3273
513.6966 0.4138
519.6302 0.3168
526.0575 0.4999
532.5179 0.3686
546.7208 0.3983
550.8033 0.3387
558.4567 0.3469
564.4420 0.3416
565.0683 0.4096
572.0159 0.4693
580.4058 0.4082
589.0766 0.4635
593.9603 0.2798
598.7057 0.2746
604.3901 0.3202
609.3446 0.5521
626.7061 0.4462
629.1473 0.5283
639.9249 0.4284
641.4892 0.2620
648.6181 0.3969
650.7053 0.5241
656.0290 0.5512
659.6139 0.3871
670.3415 0.3143
674.4624 0.5270
677.4279 0.4107
683.2339 0.5345
687.1059 0.3868
691.8089 0.3679
696.4802 0.1617
707.3155 0.5460
716.4254 0.3847
723.1418 0.4850
735.9103 0.3527
737.8304 0.4077
743.0060 0.5198
744.0368 0.4869
750.1919 0.4165
755.2828 0.4099
755.5169 0.4499
766.4406 0.3732
770.2770 0.2874
777.8174 0.2989
782.7286 0.4759
784.3839 0.2011
791.1195 0.4554
793.2034 0.4871
799.3486 0.3667
800.5278 0.3085
808.3695 0.2673
810.4090 0.4838
811.6447 0.3323
820.9614 0.3049
823.0413 0.3109
830.4576 0.3315
834.2823 0.2906
837.8081 0.4644
840.4779 0.3548
844.3271 0.3809
850.0334 0.3457
855.8396 0.4027
856.6658 0.4232
860.9905 0.3561
867.1313 0.2637
869.3720 0.4832
872.8912 0.3475
882.3630 0.3883
887.1607 0.5026
889.6823 0.4320
897.7960 0.4482
903.1646 0.4947
908.6313 0.4588
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608052227273017586 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
making animated gifs
11 models are in 2608052227273017586.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2608052227273017586 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
making animated gifs
11 models are in 2608052227273017586.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2608052227273017586 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
making animated gifs
11 models are in 2608052227273017586.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2608052227273017586 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
making animated gifs
11 models are in 2608052227273017586.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2608052227273017586 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608052227273017586.eigenfacs
2608052227273017586.atom
making animated gifs
11 models are in 2608052227273017586.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608052227273017586.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2608052227273017586.10.pdb
2608052227273017586.11.pdb
2608052227273017586.7.pdb
2608052227273017586.8.pdb
2608052227273017586.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.374s
user 0m8.307s
sys 0m0.062s
rm: cannot remove '2608052227273017586.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
