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***  7AMA_L5_corrected  ***

LOGs for ID: 2608070735353363794

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608070735353363794.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608070735353363794.atom to be opened. Openam> File opened: 2608070735353363794.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 19 Last residue number = 1 Number of atoms found = 1671 Mean number per residue = 8.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -20.556954 +/- 12.783190 From: -48.262000 To: 7.288000 = -13.878083 +/- 8.234152 From: -33.370000 To: 6.172000 = -11.324522 +/- 11.810106 From: -38.256000 To: 15.623000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'L5 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.8666 % Filled. Pdbmat> 611610 non-zero elements. Pdbmat> 66856 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.02 +/- 23.46 Maximum number = 137 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 1.337120E+06 Pdbmat> Larger element = 498.132 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 198 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608070735353363794.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608070735353363794.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608070735353363794.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1671 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 198 residues. Blocpdb> 7 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 8 Blocpdb> 7 atoms in block 3 Block first atom: 19 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 26 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 33 Blocpdb> 7 atoms in block 6 Block first atom: 41 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 56 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 64 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 72 Blocpdb> 10 atoms in block 11 Block first atom: 80 Blocpdb> 6 atoms in block 12 Block first atom: 90 Blocpdb> 6 atoms in block 13 Block first atom: 96 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 102 Blocpdb> 12 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 122 Blocpdb> 8 atoms in block 17 Block first atom: 134 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 142 Blocpdb> 6 atoms in block 19 Block first atom: 153 Blocpdb> 7 atoms in block 20 Block first atom: 159 Blocpdb> 6 atoms in block 21 Block first atom: 166 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 172 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 179 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 193 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 201 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 209 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 219 Blocpdb> 8 atoms in block 28 Block first atom: 230 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 238 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 247 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 255 Blocpdb> 9 atoms in block 32 Block first atom: 262 Blocpdb> 11 atoms in block 33 Block first atom: 271 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 282 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 294 Blocpdb> 6 atoms in block 36 Block first atom: 301 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 307 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 314 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 322 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 336 Blocpdb> 5 atoms in block 41 Block first atom: 345 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 350 Blocpdb> 6 atoms in block 43 Block first atom: 359 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 365 Blocpdb> 10 atoms in block 45 Block first atom: 376 Blocpdb> 8 atoms in block 46 Block first atom: 386 Blocpdb> 4 atoms in block 47 Block first atom: 394 Blocpdb> 6 atoms in block 48 Block first atom: 398 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 404 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 412 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 420 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 425 Blocpdb> 4 atoms in block 53 Block first atom: 433 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 437 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 445 Blocpdb> 8 atoms in block 56 Block first atom: 452 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 460 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 472 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 482 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 490 Blocpdb> 6 atoms in block 61 Block first atom: 498 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 504 Blocpdb> 7 atoms in block 63 Block first atom: 511 Blocpdb> 8 atoms in block 64 Block first atom: 518 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 526 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 535 Blocpdb> 9 atoms in block 67 Block first atom: 550 Blocpdb> 8 atoms in block 68 Block first atom: 559 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 567 Blocpdb> 7 atoms in block 70 Block first atom: 575 Blocpdb> 8 atoms in block 71 Block first atom: 582 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 590 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 601 Blocpdb> 9 atoms in block 74 Block first atom: 612 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 621 Blocpdb> 7 atoms in block 76 Block first atom: 628 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 635 Blocpdb> 6 atoms in block 78 Block first atom: 645 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 651 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 658 Blocpdb> 6 atoms in block 81 Block first atom: 674 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 680 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 691 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 702 Blocpdb> 9 atoms in block 85 Block first atom: 710 Blocpdb> 9 atoms in block 86 Block first atom: 719 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 728 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 736 Blocpdb> 7 atoms in block 89 Block first atom: 744 Blocpdb> 6 atoms in block 90 Block first atom: 751 Blocpdb> 7 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 4 atoms in block 92 Block first atom: 764 Blocpdb> 6 atoms in block 93 Block first atom: 768 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 774 Blocpdb> 6 atoms in block 95 Block first atom: 781 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 787 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 794 Blocpdb> 7 atoms in block 98 Block first atom: 801 Blocpdb> 8 atoms in block 99 Block first atom: 808 Blocpdb> 7 atoms in block 100 Block first atom: 816 Blocpdb> 11 atoms in block 101 Block first atom: 823 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 834 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 841 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 848 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 856 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 863 Blocpdb> 8 atoms in block 107 Block first atom: 871 Blocpdb> 8 atoms in block 108 Block first atom: 879 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 887 Blocpdb> 10 atoms in block 110 Block first atom: 895 Blocpdb> 6 atoms in block 111 Block first atom: 905 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 911 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 919 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 943 Blocpdb> 8 atoms in block 115 Block first atom: 955 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 963 Blocpdb> 6 atoms in block 117 Block first atom: 974 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 980 Blocpdb> 6 atoms in block 119 Block first atom: 987 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 993 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1000 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 1014 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 1022 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 1030 Blocpdb> 11 atoms in block 125 Block first atom: 1040 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 1051 Blocpdb> 9 atoms in block 127 Block first atom: 1059 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1068 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 1076 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1083 Blocpdb> 11 atoms in block 131 Block first atom: 1092 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 1103 Blocpdb> 7 atoms in block 133 Block first atom: 1115 Blocpdb> 6 atoms in block 134 Block first atom: 1122 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1128 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1135 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 1143 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 1157 Blocpdb> 5 atoms in block 139 Block first atom: 1166 Blocpdb> 9 atoms in block 140 Block first atom: 1171 Blocpdb> 6 atoms in block 141 Block first atom: 1180 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 1186 Blocpdb> 10 atoms in block 143 Block first atom: 1197 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1207 Blocpdb> 4 atoms in block 145 Block first atom: 1215 Blocpdb> 6 atoms in block 146 Block first atom: 1219 Blocpdb> 8 atoms in block 147 Block first atom: 1225 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1233 Blocpdb> 5 atoms in block 149 Block first atom: 1241 Blocpdb> 8 atoms in block 150 Block first atom: 1246 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1254 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1258 Blocpdb> 7 atoms in block 153 Block first atom: 1266 Blocpdb> 8 atoms in block 154 Block first atom: 1273 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 1281 Blocpdb> 10 atoms in block 156 Block first atom: 1293 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1303 Blocpdb> 8 atoms in block 158 Block first atom: 1311 Blocpdb> 6 atoms in block 159 Block first atom: 1319 Blocpdb> 7 atoms in block 160 Block first atom: 1325 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 1332 Blocpdb> 8 atoms in block 162 Block first atom: 1339 Blocpdb> 9 atoms in block 163 Block first atom: 1347 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 1356 Blocpdb> 9 atoms in block 165 Block first atom: 1365 Blocpdb> 8 atoms in block 166 Block first atom: 1374 Blocpdb> 8 atoms in block 167 Block first atom: 1382 Blocpdb> 7 atoms in block 168 Block first atom: 1390 Blocpdb> 8 atoms in block 169 Block first atom: 1397 Blocpdb> 11 atoms in block 170 Block first atom: 1405 Blocpdb> 11 atoms in block 171 Block first atom: 1416 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1427 Blocpdb> 7 atoms in block 173 Block first atom: 1436 Blocpdb> 7 atoms in block 174 Block first atom: 1443 Blocpdb> 10 atoms in block 175 Block first atom: 1450 Blocpdb> 6 atoms in block 176 Block first atom: 1460 Blocpdb> 7 atoms in block 177 Block first atom: 1466 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 1473 Blocpdb> 6 atoms in block 179 Block first atom: 1489 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 1495 Blocpdb> 11 atoms in block 181 Block first atom: 1506 Blocpdb> 8 atoms in block 182 Block first atom: 1517 Blocpdb> 9 atoms in block 183 Block first atom: 1525 Blocpdb> 9 atoms in block 184 Block first atom: 1534 Blocpdb> 8 atoms in block 185 Block first atom: 1543 Blocpdb> 8 atoms in block 186 Block first atom: 1551 Blocpdb> 7 atoms in block 187 Block first atom: 1559 Blocpdb> 9 atoms in block 188 Block first atom: 1566 Blocpdb> 7 atoms in block 189 Block first atom: 1575 Blocpdb> 4 atoms in block 190 Block first atom: 1582 Blocpdb> 6 atoms in block 191 Block first atom: 1586 Blocpdb> 7 atoms in block 192 Block first atom: 1592 Blocpdb> 6 atoms in block 193 Block first atom: 1599 Blocpdb> 7 atoms in block 194 Block first atom: 1605 Blocpdb> 7 atoms in block 195 Block first atom: 1612 Blocpdb> 7 atoms in block 196 Block first atom: 1619 Blocpdb> 8 atoms in block 197 Block first atom: 1626 Blocpdb> 38 atoms in block 198 Block first atom: 1633 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 38 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 611808 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5013 Prepmat> Matrix trace = 1337120.0000 Prepmat> Last element read: 5013 5013 234.1646 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17297 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1671 RTB> Total mass = 1671.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1671 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 294144.3040 RTB> 83574 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 83574 Diagstd> Projected matrix trace = 294144.3040 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 294144.3040 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3184513 1.4510112 3.3602553 4.7651682 5.9751371 6.6387970 6.9837872 7.2994853 8.0876259 8.3480320 9.1566411 9.6835284 9.7453146 13.2166765 13.6879204 14.0618774 15.1290272 15.8066406 16.8186554 17.0508149 18.2830172 18.4649521 18.7891427 19.7087155 20.0614251 20.1875917 20.9970732 21.5184607 22.2666928 23.4391400 24.3723356 25.0438113 25.8744107 26.9290590 27.1531233 28.5604323 29.4720289 30.0735147 31.1299962 31.4294876 32.3909197 33.1713439 33.8632185 34.5736874 35.0929541 36.1269241 36.6428030 37.8171874 38.5825929 39.4645202 39.7602638 40.4728234 41.3510858 41.9821523 42.1267829 42.9469987 43.5486909 43.9593763 44.6180103 45.1154038 46.9331046 47.1323631 47.6922996 49.5527110 50.3401579 51.3233008 52.0652772 52.2716300 52.4871883 53.1225390 54.0151690 54.6221055 55.7281606 56.6238946 57.1411012 57.7377489 58.7086792 59.3143626 59.8229919 61.2441216 61.8680657 62.0180870 62.9890412 64.3501248 64.6691836 65.3578169 65.8329922 66.8433941 67.0803290 67.8449264 68.1163089 68.4440503 69.0927519 69.4452826 70.5190781 71.0835195 71.3651659 71.6053021 71.9077153 72.6942393 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034329 0.0034334 0.0034339 0.0034346 0.0034347 124.6887671 130.8069011 199.0588158 237.0469650 265.4417402 279.7950171 286.9728290 293.3873599 308.8202771 313.7525994 328.5968348 337.9185993 338.9949369 394.7811523 401.7575216 407.2085923 422.3775064 431.7328245 445.3391910 448.4023191 464.3219496 466.6264718 470.7049467 482.0859121 486.3805181 487.9075479 497.5934579 503.7335551 512.4165395 525.7340635 536.0975903 543.4323547 552.3705478 563.5155037 565.8550243 580.3335366 589.5223811 595.5076901 605.8774856 608.7849821 618.0262477 625.4272704 631.9160658 638.5106283 643.2876953 652.6957330 657.3393398 667.7899718 674.5140271 682.1795464 684.7308721 690.8392932 698.2946892 703.6029153 704.8138469 711.6421936 716.6099479 719.9810096 725.3546170 729.3864731 743.9348810 745.5124279 749.9277288 764.4146293 770.4643830 777.9515852 783.5547952 785.1060096 786.7231582 791.4704273 798.0923537 802.5636741 810.6485954 817.1375138 820.8609257 825.1353703 832.0442723 836.3252599 839.9034110 849.8210521 854.1389944 855.1739502 861.8422473 871.1039376 873.2608083 877.8979782 881.0835193 887.8191884 889.3912904 894.4456743 896.2327986 898.3863220 902.6336618 904.9334779 911.9028929 915.5450975 917.3570865 918.8991949 920.8375599 925.8599079 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1671 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.318 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.348 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.157 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.69 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 30078 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608070735353363794.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608070735353363794.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608070735353363794.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608070735353363794.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 19 Last residue number = 1 Number of atoms found = 1671 Mean number per residue = 8.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.157 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69 Bfactors> 106 vectors, 5013 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.318000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.449 for 202 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.043 +/- 0.05 Bfactors> = 101.570 +/- 21.51 Bfactors> Shiftng-fct= 101.526 Bfactors> Scaling-fct= 455.628 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608070735353363794.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608070735353363794.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.5 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8 Chkmod> 106 vectors, 5013 coordinates in file. Chkmod> That is: 1671 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9580 0.0034 0.9545 0.0034 0.6631 0.0034 0.8001 0.0034 0.7482 0.0034 0.6994 124.6621 0.6759 130.8008 0.7086 199.0427 0.5899 237.0326 0.0683 265.4273 0.5035 279.7873 0.5028 286.9649 0.4164 293.3650 0.4436 308.8142 0.3468 313.7385 0.1959 328.5892 0.3301 337.9123 0.0361 338.9749 0.4777 394.8138 0.3458 401.7708 0.4194 407.1639 0.3318 422.3730 0.1864 431.7602 0.0094 445.3379 0.3892 448.3724 0.0924 464.2637 0.3305 466.5439 0.1454 470.6955 0.0808 482.0809 0.1173 486.3424 0.2077 487.9157 0.0761 497.6068 0.3681 503.7299 0.2699 512.4326 0.3889 525.7211 0.4254 536.0489 0.3481 543.3677 0.1987 552.2998 0.3788 563.5012 0.3041 565.7982 0.4383 580.3042 0.5267 589.4768 0.3639 595.4473 0.4285 605.8515 0.5140 608.7638 0.5842 617.9909 0.4957 625.3878 0.3490 631.8589 0.4881 638.4492 0.4370 643.2330 0.4893 652.6955 0.5324 657.2860 0.5745 667.7861 0.4342 674.4624 0.4805 682.1112 0.5054 684.6992 0.4023 690.7855 0.3501 698.2555 0.3857 703.5547 0.3543 704.8105 0.2937 711.6365 0.4602 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DQ=-80 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735353363794.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2608070735353363794 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608070735353363794.eigenfacs 2608070735353363794.atom making animated gifs 11 models are in 2608070735353363794.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735353363794.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735353363794.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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