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***  7AMA_L23_corrected  ***

LOGs for ID: 2608070735553363829

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608070735553363829.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608070735553363829.atom to be opened. Openam> File opened: 2608070735553363829.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 19 Last residue number = 1 Number of atoms found = 1668 Mean number per residue = 8.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -20.574019 +/- 12.788434 From: -48.262000 To: 7.288000 = -13.879899 +/- 8.240376 From: -33.370000 To: 6.172000 = -11.300230 +/- 11.811907 From: -38.256000 To: 15.623000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'L23 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.8644 % Filled. Pdbmat> 609144 non-zero elements. Pdbmat> 66584 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.84 +/- 23.30 Maximum number = 137 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 1.331680E+06 Pdbmat> Larger element = 498.132 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 198 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608070735553363829.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608070735553363829.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608070735553363829.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1668 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 198 residues. Blocpdb> 7 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 8 Blocpdb> 7 atoms in block 3 Block first atom: 19 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 26 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 33 Blocpdb> 7 atoms in block 6 Block first atom: 41 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 56 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 64 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 72 Blocpdb> 10 atoms in block 11 Block first atom: 80 Blocpdb> 6 atoms in block 12 Block first atom: 90 Blocpdb> 6 atoms in block 13 Block first atom: 96 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 102 Blocpdb> 12 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 122 Blocpdb> 8 atoms in block 17 Block first atom: 134 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 142 Blocpdb> 6 atoms in block 19 Block first atom: 153 Blocpdb> 7 atoms in block 20 Block first atom: 159 Blocpdb> 6 atoms in block 21 Block first atom: 166 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 172 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 179 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 193 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 201 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 209 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 219 Blocpdb> 8 atoms in block 28 Block first atom: 230 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 238 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 247 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 255 Blocpdb> 9 atoms in block 32 Block first atom: 262 Blocpdb> 11 atoms in block 33 Block first atom: 271 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 282 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 294 Blocpdb> 6 atoms in block 36 Block first atom: 301 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 307 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 314 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 322 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 336 Blocpdb> 5 atoms in block 41 Block first atom: 345 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 350 Blocpdb> 6 atoms in block 43 Block first atom: 359 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 365 Blocpdb> 10 atoms in block 45 Block first atom: 376 Blocpdb> 8 atoms in block 46 Block first atom: 386 Blocpdb> 4 atoms in block 47 Block first atom: 394 Blocpdb> 6 atoms in block 48 Block first atom: 398 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 404 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 412 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 420 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 425 Blocpdb> 4 atoms in block 53 Block first atom: 433 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 437 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 445 Blocpdb> 8 atoms in block 56 Block first atom: 452 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 460 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 472 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 482 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 490 Blocpdb> 6 atoms in block 61 Block first atom: 498 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 504 Blocpdb> 7 atoms in block 63 Block first atom: 511 Blocpdb> 8 atoms in block 64 Block first atom: 518 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 526 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 535 Blocpdb> 9 atoms in block 67 Block first atom: 550 Blocpdb> 8 atoms in block 68 Block first atom: 559 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 567 Blocpdb> 7 atoms in block 70 Block first atom: 575 Blocpdb> 8 atoms in block 71 Block first atom: 582 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 590 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 601 Blocpdb> 9 atoms in block 74 Block first atom: 612 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 621 Blocpdb> 7 atoms in block 76 Block first atom: 628 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 635 Blocpdb> 6 atoms in block 78 Block first atom: 645 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 651 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 658 Blocpdb> 6 atoms in block 81 Block first atom: 674 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 680 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 691 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 702 Blocpdb> 9 atoms in block 85 Block first atom: 710 Blocpdb> 9 atoms in block 86 Block first atom: 719 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 728 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 736 Blocpdb> 7 atoms in block 89 Block first atom: 744 Blocpdb> 6 atoms in block 90 Block first atom: 751 Blocpdb> 7 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 4 atoms in block 92 Block first atom: 764 Blocpdb> 6 atoms in block 93 Block first atom: 768 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 774 Blocpdb> 6 atoms in block 95 Block first atom: 781 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 787 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 794 Blocpdb> 7 atoms in block 98 Block first atom: 801 Blocpdb> 8 atoms in block 99 Block first atom: 808 Blocpdb> 7 atoms in block 100 Block first atom: 816 Blocpdb> 11 atoms in block 101 Block first atom: 823 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 834 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 841 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 848 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 856 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 863 Blocpdb> 8 atoms in block 107 Block first atom: 871 Blocpdb> 8 atoms in block 108 Block first atom: 879 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 887 Blocpdb> 10 atoms in block 110 Block first atom: 895 Blocpdb> 6 atoms in block 111 Block first atom: 905 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 911 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 919 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 943 Blocpdb> 8 atoms in block 115 Block first atom: 955 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 963 Blocpdb> 6 atoms in block 117 Block first atom: 974 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 980 Blocpdb> 6 atoms in block 119 Block first atom: 987 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 993 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1000 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 1014 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 1022 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 1030 Blocpdb> 11 atoms in block 125 Block first atom: 1040 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 1051 Blocpdb> 9 atoms in block 127 Block first atom: 1059 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1068 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 1076 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1083 Blocpdb> 11 atoms in block 131 Block first atom: 1092 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 1103 Blocpdb> 7 atoms in block 133 Block first atom: 1115 Blocpdb> 6 atoms in block 134 Block first atom: 1122 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1128 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1135 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 1143 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 1157 Blocpdb> 5 atoms in block 139 Block first atom: 1166 Blocpdb> 9 atoms in block 140 Block first atom: 1171 Blocpdb> 6 atoms in block 141 Block first atom: 1180 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 1186 Blocpdb> 10 atoms in block 143 Block first atom: 1197 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1207 Blocpdb> 4 atoms in block 145 Block first atom: 1215 Blocpdb> 6 atoms in block 146 Block first atom: 1219 Blocpdb> 8 atoms in block 147 Block first atom: 1225 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1233 Blocpdb> 5 atoms in block 149 Block first atom: 1241 Blocpdb> 8 atoms in block 150 Block first atom: 1246 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1254 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1258 Blocpdb> 7 atoms in block 153 Block first atom: 1266 Blocpdb> 8 atoms in block 154 Block first atom: 1273 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 1281 Blocpdb> 10 atoms in block 156 Block first atom: 1293 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1303 Blocpdb> 8 atoms in block 158 Block first atom: 1311 Blocpdb> 6 atoms in block 159 Block first atom: 1319 Blocpdb> 7 atoms in block 160 Block first atom: 1325 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 1332 Blocpdb> 8 atoms in block 162 Block first atom: 1339 Blocpdb> 9 atoms in block 163 Block first atom: 1347 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 1356 Blocpdb> 9 atoms in block 165 Block first atom: 1365 Blocpdb> 8 atoms in block 166 Block first atom: 1374 Blocpdb> 8 atoms in block 167 Block first atom: 1382 Blocpdb> 7 atoms in block 168 Block first atom: 1390 Blocpdb> 8 atoms in block 169 Block first atom: 1397 Blocpdb> 11 atoms in block 170 Block first atom: 1405 Blocpdb> 11 atoms in block 171 Block first atom: 1416 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1427 Blocpdb> 7 atoms in block 173 Block first atom: 1436 Blocpdb> 7 atoms in block 174 Block first atom: 1443 Blocpdb> 10 atoms in block 175 Block first atom: 1450 Blocpdb> 6 atoms in block 176 Block first atom: 1460 Blocpdb> 7 atoms in block 177 Block first atom: 1466 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 1473 Blocpdb> 6 atoms in block 179 Block first atom: 1489 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 1495 Blocpdb> 11 atoms in block 181 Block first atom: 1506 Blocpdb> 8 atoms in block 182 Block first atom: 1517 Blocpdb> 9 atoms in block 183 Block first atom: 1525 Blocpdb> 9 atoms in block 184 Block first atom: 1534 Blocpdb> 8 atoms in block 185 Block first atom: 1543 Blocpdb> 8 atoms in block 186 Block first atom: 1551 Blocpdb> 7 atoms in block 187 Block first atom: 1559 Blocpdb> 9 atoms in block 188 Block first atom: 1566 Blocpdb> 7 atoms in block 189 Block first atom: 1575 Blocpdb> 4 atoms in block 190 Block first atom: 1582 Blocpdb> 6 atoms in block 191 Block first atom: 1586 Blocpdb> 7 atoms in block 192 Block first atom: 1592 Blocpdb> 6 atoms in block 193 Block first atom: 1599 Blocpdb> 7 atoms in block 194 Block first atom: 1605 Blocpdb> 7 atoms in block 195 Block first atom: 1612 Blocpdb> 7 atoms in block 196 Block first atom: 1619 Blocpdb> 8 atoms in block 197 Block first atom: 1626 Blocpdb> 35 atoms in block 198 Block first atom: 1633 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 609342 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5004 Prepmat> Matrix trace = 1331680.0000 Prepmat> Last element read: 5004 5004 218.4604 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17297 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1668 RTB> Total mass = 1668.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1668 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 293727.5817 RTB> 83574 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 83574 Diagstd> Projected matrix trace = 293727.5817 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 293727.5817 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3040005 1.4432889 3.3590258 4.7659687 5.9742883 6.6623140 7.0251940 7.3162394 8.0997157 8.2991263 9.0697577 9.6832899 9.7650942 13.2176710 13.6241026 14.0480288 15.1495399 15.8044616 16.6873183 17.0392277 18.2027959 18.4244030 18.7548711 19.6566363 20.0357248 20.1252782 20.6864105 21.4843001 22.2744514 23.2120643 24.3688073 25.0266445 25.9301185 26.7913329 27.1261827 28.5640746 29.7632572 30.1552232 31.1313436 31.2287759 32.3340277 32.7401656 33.7060530 34.4289233 35.0688470 35.9942016 36.5186080 37.5006715 38.4501745 39.3886235 39.6148870 40.4170884 41.3848526 41.9766255 42.1401595 42.8399614 43.3942295 44.4142080 44.6615505 45.1297708 46.7050049 47.1786241 47.6868533 49.5464327 50.5624300 51.3730548 52.0005901 52.2318333 52.5285916 53.0937838 54.3106134 54.4611055 55.6927620 56.6103455 57.1585041 57.6415829 58.8723086 59.7932034 60.0043698 61.1638467 61.8859206 62.2120546 63.2686132 64.4158380 64.8244327 65.3340390 65.7895094 66.8286455 67.0161207 67.3449568 68.1815051 68.4250342 69.2231381 69.9213133 70.4887664 71.1736948 71.4736211 71.5138355 71.7849719 72.6009104 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034328 0.0034329 0.0034333 0.0034333 0.0034346 124.0035614 130.4583611 199.0223972 237.0668731 265.4228863 280.2901454 287.8223013 293.7238646 309.0510105 312.8322128 327.0341631 337.9144377 339.3387836 394.7960046 400.8198606 407.0080269 422.6637500 431.7030666 443.5969533 448.2499327 463.3021654 466.1138337 470.2754659 481.4485481 486.0688715 487.1539479 493.8986617 503.3335568 512.5058045 523.1812393 536.0587842 543.2460688 552.9648571 562.0726334 565.5742412 580.3705403 592.4279080 596.3161255 605.8905972 606.8379897 617.4832526 621.3491609 630.4479396 637.1724664 643.0667040 651.4956990 656.2244204 664.9895221 673.3555400 681.5232596 683.4779229 690.3634528 698.5797406 703.5566005 704.9257386 710.7548235 715.3379589 723.6961148 725.7084471 729.5026005 742.1248789 745.8782033 749.8849075 764.3662025 772.1634649 778.3285763 783.0678905 784.8070847 787.0333913 791.2561866 800.2720225 801.3800132 810.3910919 817.0397445 820.9859168 824.4479255 833.2029781 839.6942728 841.1757026 849.2639235 854.2622360 856.5102264 863.7527392 871.5486026 874.3083831 877.7382692 880.7924922 887.7212373 888.9655324 891.1438609 896.6616021 898.2615123 903.4849486 908.0297312 911.7068871 916.1256359 918.0538858 918.3121191 920.0513090 925.2653821 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1668 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.443 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.974 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.60 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99996 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 30024 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99996 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608070735553363829.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608070735553363829.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608070735553363829.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608070735553363829.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 19 Last residue number = 1 Number of atoms found = 1668 Mean number per residue = 8.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.443 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.974 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.60 Bfactors> 106 vectors, 5004 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.304000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.451 for 202 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.043 +/- 0.05 Bfactors> = 101.570 +/- 21.51 Bfactors> Shiftng-fct= 101.526 Bfactors> Scaling-fct= 455.366 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608070735553363829.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608070735553363829.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9 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vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.2 Chkmod> 106 vectors, 5004 coordinates in file. Chkmod> That is: 1668 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 82 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7931 0.0034 0.6994 0.0034 0.9803 0.0034 0.7468 0.0034 0.9193 0.0034 0.7503 123.9982 0.6774 130.4397 0.7158 199.0131 0.5919 237.0575 0.0683 265.4051 0.4981 280.2715 0.4956 287.8060 0.3413 293.7065 0.4990 309.0432 0.5105 312.8164 0.1341 327.0245 0.3166 337.8949 0.0228 339.3226 0.5426 394.8138 0.3437 400.7423 0.4271 407.0191 0.3376 422.6520 0.1921 431.6236 0.0099 443.6136 0.4019 448.2408 0.0952 463.2467 0.3767 466.0381 0.1305 470.1942 0.0790 481.4691 0.1128 486.0999 0.2334 487.1902 0.0631 493.9203 0.3197 503.2616 0.2772 512.4326 0.3979 523.1355 0.4226 536.0489 0.3559 543.2592 0.1886 552.9399 0.4176 562.0345 0.4256 565.5898 0.2761 580.3042 0.4955 592.3701 0.2834 596.3378 0.5078 605.8515 0.5589 606.8238 0.5148 617.4183 0.4474 621.3209 0.4068 630.4578 0.4934 637.1551 0.4375 643.0497 0.5009 651.4297 0.5315 656.2088 0.5780 664.9550 0.5033 673.3251 0.4860 681.5059 0.4665 683.4064 0.3751 690.3587 0.3212 698.5088 0.3746 703.5547 0.3699 704.8941 0.3140 710.7246 0.4594 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DQ=-80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom making animated gifs 11 models are in 2608070735553363829.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2608070735553363829 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom making animated gifs 11 models are in 2608070735553363829.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2608070735553363829 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608070735553363829.eigenfacs 2608070735553363829.atom making animated gifs 11 models are in 2608070735553363829.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608070735553363829.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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