*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260811120108232474.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260811120108232474.atom to be opened.
Openam> File opened: 260811120108232474.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 437
First residue number = 1
Last residue number = 439
Number of atoms found = 3477
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 12.623750 +/- 11.578816 From: -21.436000 To: 36.097000
= 20.635850 +/- 16.661882 From: -15.362000 To: 54.617000
= 35.897203 +/- 13.857079 From: 0.222000 To: 62.658000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4650 % Filled.
Pdbmat> 1341185 non-zero elements.
Pdbmat> 146727 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.40 +/- 22.10
Maximum number = 139
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 2.934540E+06
Pdbmat> Larger element = 523.519
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
437 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260811120108232474.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260811120108232474.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260811120108232474.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3477 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 437 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 23 atoms in block 3
Block first atom: 46
Blocpdb> 28 atoms in block 4
Block first atom: 69
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 97
Blocpdb> 25 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 143
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 162
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 182
Blocpdb> 28 atoms in block 10
Block first atom: 203
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 231
Blocpdb> 27 atoms in block 12
Block first atom: 249
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 276
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 301
Blocpdb> 18 atoms in block 15
Block first atom: 320
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 338
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 360
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 377
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 393
Blocpdb> 27 atoms in block 20
Block first atom: 413
Blocpdb> 23 atoms in block 21
Block first atom: 440
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 463
Blocpdb> 27 atoms in block 23
Block first atom: 485
Blocpdb> 27 atoms in block 24
Block first atom: 512
Blocpdb> 21 atoms in block 25
Block first atom: 539
Blocpdb> 26 atoms in block 26
Block first atom: 560
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 586
Blocpdb> 21 atoms in block 28
Block first atom: 612
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 633
Blocpdb> 30 atoms in block 30
Block first atom: 655
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 685
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 707
Blocpdb> 26 atoms in block 33
Block first atom: 729
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 755
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 775
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 804
Blocpdb> 29 atoms in block 37
Block first atom: 829
Blocpdb> 25 atoms in block 38
Block first atom: 858
Blocpdb> 28 atoms in block 39
Block first atom: 883
Blocpdb> 25 atoms in block 40
Block first atom: 911
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 936
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 955
Blocpdb> 33 atoms in block 43
Block first atom: 978
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 1011
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 1033
Blocpdb> 23 atoms in block 46
Block first atom: 1054
Blocpdb> 17 atoms in block 47
Block first atom: 1077
Blocpdb> 35 atoms in block 48
Block first atom: 1094
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1129
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 1156
Blocpdb> 24 atoms in block 51
Block first atom: 1173
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 1197
Blocpdb> 28 atoms in block 53
Block first atom: 1213
Blocpdb> 39 atoms in block 54
Block first atom: 1241
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1280
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 1302
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1325
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1347
Blocpdb> 33 atoms in block 59
Block first atom: 1369
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1402
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 1422
Blocpdb> 37 atoms in block 62
Block first atom: 1443
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 1480
Blocpdb> 21 atoms in block 64
Block first atom: 1494
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1515
Blocpdb> 32 atoms in block 66
Block first atom: 1533
Blocpdb> 27 atoms in block 67
Block first atom: 1565
Blocpdb> 28 atoms in block 68
Block first atom: 1592
Blocpdb> 24 atoms in block 69
Block first atom: 1620
Blocpdb> 26 atoms in block 70
Block first atom: 1644
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1670
Blocpdb> 23 atoms in block 72
Block first atom: 1686
Blocpdb> 28 atoms in block 73
Block first atom: 1709
Blocpdb> 23 atoms in block 74
Block first atom: 1737
Blocpdb> 21 atoms in block 75
Block first atom: 1760
Blocpdb> 27 atoms in block 76
Block first atom: 1781
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1808
Blocpdb> 25 atoms in block 78
Block first atom: 1827
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1852
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1874
Blocpdb> 28 atoms in block 81
Block first atom: 1896
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 1924
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1949
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1970
Blocpdb> 21 atoms in block 85
Block first atom: 1992
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 2013
Blocpdb> 35 atoms in block 87
Block first atom: 2028
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 2063
Blocpdb> 27 atoms in block 89
Block first atom: 2086
Blocpdb> 25 atoms in block 90
Block first atom: 2113
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2138
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 2164
Blocpdb> 27 atoms in block 93
Block first atom: 2183
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2210
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2232
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2256
Blocpdb> 20 atoms in block 97
Block first atom: 2281
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2301
Blocpdb> 31 atoms in block 99
Block first atom: 2321
Blocpdb> 21 atoms in block 100
Block first atom: 2352
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 2373
Blocpdb> 31 atoms in block 102
Block first atom: 2393
Blocpdb> 33 atoms in block 103
Block first atom: 2424
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 2457
Blocpdb> 23 atoms in block 105
Block first atom: 2478
Blocpdb> 37 atoms in block 106
Block first atom: 2501
Blocpdb> 23 atoms in block 107
Block first atom: 2538
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2561
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2586
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 2612
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2631
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 2653
Blocpdb> 22 atoms in block 113
Block first atom: 2669
Blocpdb> 32 atoms in block 114
Block first atom: 2691
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 2723
Blocpdb> 25 atoms in block 116
Block first atom: 2750
Blocpdb> 20 atoms in block 117
Block first atom: 2775
Blocpdb> 17 atoms in block 118
Block first atom: 2795
Blocpdb> 25 atoms in block 119
Block first atom: 2812
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 2837
Blocpdb> 18 atoms in block 121
Block first atom: 2857
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2875
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 2898
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 2926
Blocpdb> 19 atoms in block 125
Block first atom: 2952
Blocpdb> 29 atoms in block 126
Block first atom: 2971
Blocpdb> 21 atoms in block 127
Block first atom: 3000
Blocpdb> 23 atoms in block 128
Block first atom: 3021
Blocpdb> 25 atoms in block 129
Block first atom: 3044
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 3069
Blocpdb> 23 atoms in block 131
Block first atom: 3087
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 3110
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 3132
Blocpdb> 19 atoms in block 134
Block first atom: 3155
Blocpdb> 23 atoms in block 135
Block first atom: 3174
Blocpdb> 30 atoms in block 136
Block first atom: 3197
Blocpdb> 21 atoms in block 137
Block first atom: 3227
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 3248
Blocpdb> 23 atoms in block 139
Block first atom: 3264
Blocpdb> 35 atoms in block 140
Block first atom: 3287
Blocpdb> 40 atoms in block 141
Block first atom: 3322
Blocpdb> 26 atoms in block 142
Block first atom: 3362
Blocpdb> 21 atoms in block 143
Block first atom: 3388
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3409
Blocpdb> 26 atoms in block 145
Block first atom: 3433
Blocpdb> 19 atoms in block 146
Block first atom: 3458
Blocpdb> 146 blocks.
Blocpdb> At most, 40 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1341331 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10431
Prepmat> Matrix trace = 2934540.0000
Prepmat> Last element read: 10431 10431 192.4213
Prepmat> 10732 lines saved.
Prepmat> 9373 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3477
RTB> Total mass = 3477.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3477
RTB> Number of blocks = 146
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 192772.0576
RTB> 46698 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 876
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46698
Diagstd> Projected matrix trace = 192772.0576
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 876 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 192772.0576
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6016880 0.9198053 2.2072476 2.7598015
3.9398263 4.5317832 5.6674099 6.3569082 6.8557699
7.3403905 8.0265065 9.1438209 9.3958041 10.7505224
11.4474607 12.5524756 13.8106075 14.4067739 14.8988584
15.6520541 16.3032932 16.9298731 17.6161396 19.1337313
19.3391648 20.5349052 20.9353558 22.5195168 22.8158972
23.2338803 23.5813473 24.7910603 25.7026325 26.0322234
26.5873226 27.0971825 27.8746626 28.3189708 30.4449696
31.1495887 31.4704490 31.9283856 32.5163306 33.2802860
33.9931677 34.0712546 35.4178809 36.3728975 37.2140269
37.6525080 38.2173557 38.8363476 39.4506978 39.7093429
40.8670394 41.1818608 42.2589366 42.7765029 42.9853264
44.7517176 45.4397961 46.0288089 46.1613168 46.9067384
47.7650101 48.3329731 49.2162252 49.4197209 49.6765208
50.6836083 51.7267387 52.6322949 52.8653258 53.2649926
54.0204578 54.2294186 54.7830871 55.4862264 56.5530496
56.9691513 58.0997842 59.0005531 59.3219941 60.0239470
60.7972184 61.1280865 61.7987662 62.4666341 63.3932745
63.7490058 64.6252378 65.1344691 65.4410556 65.9181036
66.6833460 67.6388770 67.9885514 68.2433620 69.3036518
69.8779658
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034333 0.0034334 0.0034340 0.0034352
0.0034356 84.2327418 104.1461531 161.3321083 180.3990316
215.5429473 231.1691310 258.5160972 273.7904214 284.3304664
294.2082610 307.6511627 328.3667202 332.8604959 356.0492407
367.4090593 384.7334727 403.5540136 412.1721559 419.1522262
429.6164982 438.4629982 446.8092250 455.7751602 475.0016475
477.5448189 492.0867054 496.8616225 515.3174084 518.6973822
523.4270395 527.3264886 540.6831453 550.5339218 554.0524902
559.9285126 565.2718370 573.3239573 577.8751419 599.1741283
606.0681174 609.1815620 613.5977527 619.2215261 626.4534498
633.1273853 633.8541575 646.2589441 654.9139326 662.4431501
666.3344004 671.3138351 676.7285045 682.0600694 684.2922644
694.1956186 696.8643755 705.9184985 710.2282108 711.9596728
726.4406434 732.0040221 736.7330427 737.7927355 743.7258870
750.4991716 754.9479944 761.8148441 763.3881684 765.3689968
773.0881980 781.0032287 787.8098993 789.5519978 792.5309215
798.1314246 799.6735919 803.7454572 808.8870359 816.6261729
819.6249216 827.7182674 834.1099881 836.3790595 841.3129139
846.7147689 849.0156209 853.6604923 858.2609101 864.6032687
867.0257351 872.9640464 876.3966710 878.4568393 881.6528843
886.7556655 893.0863968 895.3919264 897.0682527 904.0102195
907.7482226
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3477
Rtb_to_modes> Number of blocs = 146
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9842E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.88
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 876 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 62586 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
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1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
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1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260811120108232474.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260811120108232474.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260811120108232474.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260811120108232474.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 437
First residue number = 1
Last residue number = 439
Number of atoms found = 3477
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6017
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9198
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.760
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.940
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.357
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.027
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.88
Bfactors> 106 vectors, 10431 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.601700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.471 for 455 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.032 +/- 0.03
Bfactors> = 37.534 +/- 6.54
Bfactors> Shiftng-fct= 37.502
Bfactors> Scaling-fct= 259.881
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260811120108232474.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260811120108232474.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.7
Chkmod> 106 vectors, 10431 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3477 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7291
0.0034 0.8226
0.0034 0.8817
0.0034 0.8269
0.0034 0.8193
0.0034 0.8859
84.2300 0.5775
104.1414 0.5013
161.3161 0.6120
180.3978 0.4429
215.5384 0.6152
231.1647 0.7308
258.4957 0.7791
273.7806 0.7059
284.3230 0.4507
294.1878 0.3361
307.6474 0.6847
328.3558 0.5935
332.8497 0.6411
356.0253 0.3915
367.4340 0.6038
384.6790 0.6494
403.5278 0.5843
412.2006 0.5868
419.1503 0.4978
429.5699 0.4492
438.3999 0.5618
446.7917 0.4835
455.8055 0.4915
474.9349 0.4887
477.5346 0.3768
492.0068 0.4625
496.8954 0.1917
515.3008 0.4206
518.7217 0.5030
523.3609 0.3836
527.2888 0.4673
540.6484 0.4858
550.4821 0.3924
554.0050 0.5345
559.9327 0.4577
565.2770 0.3950
573.2514 0.4056
577.8608 0.4371
599.0995 0.2392
606.0461 0.5416
609.1511 0.5400
613.5869 0.3469
619.2299 0.4643
626.4239 0.4789
633.0707 0.5272
633.8153 0.3912
646.2505 0.4417
654.8597 0.4611
662.3789 0.3930
666.2836 0.4407
671.3082 0.2974
676.7313 0.4310
682.0248 0.4237
684.2686 0.4248
694.1910 0.4673
696.8187 0.4552
705.8971 0.4249
710.2268 0.3701
711.9678 0.4871
726.3955 0.5287
731.9742 0.3471
736.7109 0.4964
737.7505 0.3681
743.7198 0.4447
750.5062 0.4604
754.8924 0.5081
761.8114 0.5280
763.3576 0.4785
765.3629 0.5261
773.0275 0.5409
780.9943 0.4469
787.7589 0.5601
789.5530 0.6028
792.4598 0.4478
798.0938 0.4552
799.6436 0.4819
803.6883 0.5224
808.8798 0.4366
816.5691 0.4777
819.5958 0.5402
827.6843 0.3854
834.0703 0.5644
836.3291 0.5308
841.2491 0.5093
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848.9925 0.3590
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.542s
user 0m13.424s
sys 0m0.115s
rm: cannot remove '260811120108232474.sdijf': No such file or directory
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