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LOGs for ID: 260812025555442844

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260812025555442844.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260812025555442844.atom to be opened. Openam> File opened: 260812025555442844.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 587 Number of atoms found = 9275 Mean number per residue = 15.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.083814 +/- 13.329539 From: -30.885000 To: 36.272000 = 0.015875 +/- 13.651133 From: -44.471000 To: 38.277000 = -0.565713 +/- 18.106031 From: -48.782000 To: 42.593000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 3 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6780 % Filled. Pdbmat> 6495912 non-zero elements. Pdbmat> 715703 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.33 +/- 49.14 Maximum number = 246 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.431406E+07 Pdbmat> Larger element = 886.694 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 587 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260812025555442844.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260812025555442844.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260812025555442844.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9275 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 587 residues. Blocpdb> 49 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 50 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 91 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 122 Blocpdb> 68 atoms in block 5 Block first atom: 168 Blocpdb> 41 atoms in block 6 Block first atom: 236 Blocpdb> 48 atoms in block 7 Block first atom: 277 Blocpdb> 54 atoms in block 8 Block first atom: 325 Blocpdb> 64 atoms in block 9 Block first atom: 379 Blocpdb> 42 atoms in block 10 Block first atom: 443 Blocpdb> 52 atoms in block 11 Block first atom: 485 Blocpdb> 37 atoms in block 12 Block first atom: 537 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 574 Blocpdb> 47 atoms in block 14 Block first atom: 613 Blocpdb> 50 atoms in block 15 Block first atom: 660 Blocpdb> 39 atoms in block 16 Block first atom: 710 Blocpdb> 31 atoms in block 17 Block first atom: 749 Blocpdb> 42 atoms in block 18 Block first atom: 780 Blocpdb> 53 atoms in block 19 Block first atom: 822 Blocpdb> 47 atoms in block 20 Block first atom: 875 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 922 Blocpdb> 50 atoms in block 22 Block first atom: 946 Blocpdb> 50 atoms in block 23 Block first atom: 996 Blocpdb> 49 atoms in block 24 Block first atom: 1046 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 1095 Blocpdb> 54 atoms in block 26 Block first atom: 1142 Blocpdb> 38 atoms in block 27 Block first atom: 1196 Blocpdb> 54 atoms in block 28 Block first atom: 1234 Blocpdb> 55 atoms in block 29 Block first atom: 1288 Blocpdb> 37 atoms in block 30 Block first atom: 1343 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1380 Blocpdb> 48 atoms in block 32 Block first atom: 1427 Blocpdb> 58 atoms in block 33 Block first atom: 1475 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1533 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1567 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1617 Blocpdb> 46 atoms in block 37 Block first atom: 1673 Blocpdb> 59 atoms in block 38 Block first atom: 1719 Blocpdb> 46 atoms in block 39 Block first atom: 1778 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1824 Blocpdb> 46 atoms in block 41 Block first atom: 1865 Blocpdb> 42 atoms in block 42 Block first atom: 1911 Blocpdb> 57 atoms in block 43 Block first atom: 1953 Blocpdb> 41 atoms in block 44 Block first atom: 2010 Blocpdb> 55 atoms in block 45 Block first atom: 2051 Blocpdb> 38 atoms in block 46 Block first atom: 2106 Blocpdb> 49 atoms in block 47 Block first atom: 2144 Blocpdb> 49 atoms in block 48 Block first atom: 2193 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 2242 Blocpdb> 61 atoms in block 50 Block first atom: 2282 Blocpdb> 39 atoms in block 51 Block first atom: 2343 Blocpdb> 41 atoms in block 52 Block first atom: 2382 Blocpdb> 48 atoms in block 53 Block first atom: 2423 Blocpdb> 38 atoms in block 54 Block first atom: 2471 Blocpdb> 58 atoms in block 55 Block first atom: 2509 Blocpdb> 50 atoms in block 56 Block first atom: 2567 Blocpdb> 58 atoms in block 57 Block first atom: 2617 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2675 Blocpdb> 33 atoms in block 59 Block first atom: 2721 Blocpdb> 40 atoms in block 60 Block first atom: 2754 Blocpdb> 49 atoms in block 61 Block first atom: 2794 Blocpdb> 55 atoms in block 62 Block first atom: 2843 Blocpdb> 45 atoms in block 63 Block first atom: 2898 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2943 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 2988 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 3024 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 3065 Blocpdb> 48 atoms in block 68 Block first atom: 3120 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 3168 Blocpdb> 34 atoms in block 70 Block first atom: 3204 Blocpdb> 51 atoms in block 71 Block first atom: 3238 Blocpdb> 47 atoms in block 72 Block first atom: 3289 Blocpdb> 48 atoms in block 73 Block first atom: 3336 Blocpdb> 50 atoms in block 74 Block first atom: 3384 Blocpdb> 58 atoms in block 75 Block first atom: 3434 Blocpdb> 57 atoms in block 76 Block first atom: 3492 Blocpdb> 55 atoms in block 77 Block first atom: 3549 Blocpdb> 56 atoms in block 78 Block first atom: 3604 Blocpdb> 62 atoms in block 79 Block first atom: 3660 Blocpdb> 53 atoms in block 80 Block first atom: 3722 Blocpdb> 57 atoms in block 81 Block first atom: 3775 Blocpdb> 55 atoms in block 82 Block first atom: 3832 Blocpdb> 38 atoms in block 83 Block first atom: 3887 Blocpdb> 55 atoms in block 84 Block first atom: 3925 Blocpdb> 34 atoms in block 85 Block first atom: 3980 Blocpdb> 51 atoms in block 86 Block first atom: 4014 Blocpdb> 55 atoms in block 87 Block first atom: 4065 Blocpdb> 47 atoms in block 88 Block first atom: 4120 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 4167 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 4200 Blocpdb> 49 atoms in block 91 Block first atom: 4247 Blocpdb> 43 atoms in block 92 Block first atom: 4296 Blocpdb> 49 atoms in block 93 Block first atom: 4339 Blocpdb> 41 atoms in block 94 Block first atom: 4388 Blocpdb> 59 atoms in block 95 Block first atom: 4429 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4488 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 4536 Blocpdb> 46 atoms in block 98 Block first atom: 4569 Blocpdb> 54 atoms in block 99 Block first atom: 4615 Blocpdb> 64 atoms in block 100 Block first atom: 4669 Blocpdb> 37 atoms in block 101 Block first atom: 4733 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 4770 Blocpdb> 48 atoms in block 103 Block first atom: 4815 Blocpdb> 56 atoms in block 104 Block first atom: 4863 Blocpdb> 48 atoms in block 105 Block first atom: 4919 Blocpdb> 57 atoms in block 106 Block first atom: 4967 Blocpdb> 54 atoms in block 107 Block first atom: 5024 Blocpdb> 46 atoms in block 108 Block first atom: 5078 Blocpdb> 55 atoms in block 109 Block first atom: 5124 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 5179 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 5227 Blocpdb> 51 atoms in block 112 Block first atom: 5267 Blocpdb> 58 atoms in block 113 Block first atom: 5318 Blocpdb> 34 atoms in block 114 Block first atom: 5376 Blocpdb> 37 atoms in block 115 Block first atom: 5410 Blocpdb> 60 atoms in block 116 Block first atom: 5447 Blocpdb> 39 atoms in block 117 Block first atom: 5507 Blocpdb> 51 atoms in block 118 Block first atom: 5546 Blocpdb> 53 atoms in block 119 Block first atom: 5597 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 5650 Blocpdb> 50 atoms in block 121 Block first atom: 5702 Blocpdb> 49 atoms in block 122 Block first atom: 5752 Blocpdb> 36 atoms in block 123 Block first atom: 5801 Blocpdb> 51 atoms in block 124 Block first atom: 5837 Blocpdb> 43 atoms in block 125 Block first atom: 5888 Blocpdb> 46 atoms in block 126 Block first atom: 5931 Blocpdb> 50 atoms in block 127 Block first atom: 5977 Blocpdb> 62 atoms in block 128 Block first atom: 6027 Blocpdb> 37 atoms in block 129 Block first atom: 6089 Blocpdb> 45 atoms in block 130 Block first atom: 6126 Blocpdb> 33 atoms in block 131 Block first atom: 6171 Blocpdb> 45 atoms in block 132 Block first atom: 6204 Blocpdb> 57 atoms in block 133 Block first atom: 6249 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 6306 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6352 Blocpdb> 45 atoms in block 136 Block first atom: 6397 Blocpdb> 50 atoms in block 137 Block first atom: 6442 Blocpdb> 47 atoms in block 138 Block first atom: 6492 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 6539 Blocpdb> 56 atoms in block 140 Block first atom: 6578 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 6634 Blocpdb> 55 atoms in block 142 Block first atom: 6680 Blocpdb> 58 atoms in block 143 Block first atom: 6735 Blocpdb> 60 atoms in block 144 Block first atom: 6793 Blocpdb> 23 atoms in block 145 Block first atom: 6853 Blocpdb> 58 atoms in block 146 Block first atom: 6876 Blocpdb> 46 atoms in block 147 Block first atom: 6934 Blocpdb> 38 atoms in block 148 Block first atom: 6980 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 7018 Blocpdb> 42 atoms in block 150 Block first atom: 7072 Blocpdb> 55 atoms in block 151 Block first atom: 7114 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 7169 Blocpdb> 44 atoms in block 153 Block first atom: 7213 Blocpdb> 45 atoms in block 154 Block first atom: 7257 Blocpdb> 61 atoms in block 155 Block first atom: 7302 Blocpdb> 43 atoms in block 156 Block first atom: 7363 Blocpdb> 58 atoms in block 157 Block first atom: 7406 Blocpdb> 54 atoms in block 158 Block first atom: 7464 Blocpdb> 49 atoms in block 159 Block first atom: 7518 Blocpdb> 43 atoms in block 160 Block first atom: 7567 Blocpdb> 49 atoms in block 161 Block first atom: 7610 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 7659 Blocpdb> 48 atoms in block 163 Block first atom: 7701 Blocpdb> 55 atoms in block 164 Block first atom: 7749 Blocpdb> 59 atoms in block 165 Block first atom: 7804 Blocpdb> 51 atoms in block 166 Block first atom: 7863 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 7914 Blocpdb> 47 atoms in block 168 Block first atom: 7956 Blocpdb> 11 atoms in block 169 Block first atom: 8003 Blocpdb> 50 atoms in block 170 Block first atom: 8014 Blocpdb> 38 atoms in block 171 Block first atom: 8064 Blocpdb> 56 atoms in block 172 Block first atom: 8102 Blocpdb> 43 atoms in block 173 Block first atom: 8158 Blocpdb> 43 atoms in block 174 Block first atom: 8201 Blocpdb> 49 atoms in block 175 Block first atom: 8244 Blocpdb> 58 atoms in block 176 Block first atom: 8293 Blocpdb> 54 atoms in block 177 Block first atom: 8351 Blocpdb> 54 atoms in block 178 Block first atom: 8405 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 8459 Blocpdb> 38 atoms in block 180 Block first atom: 8501 Blocpdb> 40 atoms in block 181 Block first atom: 8539 Blocpdb> 34 atoms in block 182 Block first atom: 8579 Blocpdb> 38 atoms in block 183 Block first atom: 8613 Blocpdb> 44 atoms in block 184 Block first atom: 8651 Blocpdb> 35 atoms in block 185 Block first atom: 8695 Blocpdb> 49 atoms in block 186 Block first atom: 8730 Blocpdb> 33 atoms in block 187 Block first atom: 8779 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8812 Blocpdb> 51 atoms in block 189 Block first atom: 8854 Blocpdb> 43 atoms in block 190 Block first atom: 8905 Blocpdb> 42 atoms in block 191 Block first atom: 8948 Blocpdb> 40 atoms in block 192 Block first atom: 8990 Blocpdb> 49 atoms in block 193 Block first atom: 9030 Blocpdb> 52 atoms in block 194 Block first atom: 9079 Blocpdb> 42 atoms in block 195 Block first atom: 9131 Blocpdb> 38 atoms in block 196 Block first atom: 9173 Blocpdb> 65 atoms in block 197 Block first atom: 9210 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6496109 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27825 Prepmat> Matrix trace = 14314060.0000 Prepmat> Last element read: 27825 27825 201.8793 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 17300 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9275 RTB> Total mass = 9275.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9275 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 473372.8158 RTB> 76353 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 76353 Diagstd> Projected matrix trace = 473372.8158 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 473372.8158 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4279283 0.7345782 1.0597255 1.1087913 1.5682780 1.7863079 2.4586945 4.0223843 4.0676511 4.9584492 5.4684264 5.5232127 5.9951739 6.2068351 6.5400799 6.9929690 7.7070669 8.3349957 9.1283657 9.8955679 11.7468644 12.0080510 12.7797287 13.1737122 13.8703047 15.4427977 16.0505099 16.8664151 17.0644473 17.8545872 18.7569836 19.4539575 19.7102605 21.5605473 22.3003642 22.7742250 23.4145006 24.8418930 25.8156376 26.0172867 27.2058116 27.7979445 28.2958655 29.1519884 29.3217900 29.9652789 31.3213778 31.8822297 32.1770003 33.8842031 34.8151440 35.3198222 36.0655044 37.0182802 37.6433282 38.0150470 39.9528215 41.2154457 41.6839155 42.4879367 42.8306591 44.2167060 44.9958160 45.8496179 46.7815600 47.6290522 48.0450528 48.8529221 49.3681724 50.2560978 50.6745056 51.4238324 52.7166298 54.1207053 55.1394047 55.8040950 56.5812582 57.5640164 58.7216639 60.1114967 60.9239358 61.3671674 61.6786324 62.5838531 63.1297141 64.8581696 66.0873716 66.7532332 67.0871761 68.0388001 68.9969117 69.8079911 70.6740996 71.2346414 72.1206333 72.4409922 73.3808669 74.9672751 75.5533759 76.5041094 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034298 0.0034300 0.0034328 0.0034332 0.0034353 0.0034360 71.0363713 93.0709833 111.7871745 114.3457920 135.9899472 145.1354271 170.2736952 217.7895624 219.0116040 241.8066356 253.9372807 255.2061667 265.8864302 270.5393140 277.7069871 287.1614140 301.4670457 313.5075257 328.0890956 341.5982540 372.1827644 376.2976809 388.2005058 394.1389598 404.4252678 426.7350063 435.0505251 445.9710548 448.5815353 458.8494202 470.3019506 478.9600185 482.1048077 504.2259246 512.8038276 518.2234772 525.4576635 541.2371811 551.7428431 553.8935163 566.4037541 572.5344482 577.6393508 586.3127946 588.0178636 594.4350955 607.7370438 613.1540814 615.9820514 632.1118300 640.7363729 645.3637009 652.1406699 660.6986196 666.2531680 669.5346321 686.3869343 697.1484729 701.0993006 707.8285914 710.6776523 722.0852491 728.4191358 735.2975867 742.7328463 749.4303032 752.6960168 758.9978632 762.9899287 769.8208376 773.0187722 778.7131346 788.4408168 798.8716404 806.3550620 811.2006968 816.8298134 823.8930218 832.1362794 841.9262510 847.5966981 850.6743131 852.8303514 859.0657987 862.8040827 874.5358638 882.7841361 887.2202241 889.4366807 895.7227470 902.0074121 907.2936064 912.9046566 916.5177950 922.1998479 924.2457778 930.2221986 940.2235892 943.8918096 949.8120220 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9275 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9760E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9768E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4279 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.786 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.958 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.523 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.50 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 166950 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260812025555442844.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260812025555442844.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260812025555442844.atom Openam> file on opening on unit 11: 260812025555442844.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 587 Number of atoms found = 9275 Mean number per residue = 15.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9760E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9768E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4279 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.786 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.958 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.207 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.50 Bfactors> 106 vectors, 27825 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.427900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.308 for 587 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.016 +/- 0.04 Bfactors> = 79.969 +/- 12.25 Bfactors> Shiftng-fct= 79.952 Bfactors> Scaling-fct= 275.823 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260812025555442844.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260812025555442844.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4297E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4298E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 9275 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8450 0.0034 0.6576 0.0034 0.7772 0.0034 0.9708 0.0034 0.8531 0.0034 0.8515 71.0310 0.0663 93.0684 0.0752 111.7969 0.0773 114.3516 0.1433 135.9721 0.0373 145.1167 0.1053 170.2770 0.0384 217.7698 0.4213 219.0116 0.3223 241.7853 0.0434 253.9165 0.1047 255.1903 0.0555 265.8712 0.2418 270.5313 0.4049 277.6934 0.3127 287.1497 0.2219 301.4528 0.2669 313.4941 0.2745 328.0684 0.2244 341.5910 0.3390 372.2165 0.3346 376.3121 0.3203 388.1880 0.2491 394.0665 0.1724 404.4035 0.2649 426.6780 0.1078 435.0249 0.3814 445.9993 0.3808 448.5038 0.4318 458.7708 0.3171 470.3196 0.3106 478.8907 0.1176 482.0809 0.2987 504.1979 0.4319 512.7776 0.2791 518.1532 0.4605 525.3846 0.2609 541.1933 0.3506 551.7658 0.3991 553.8986 0.3764 566.4230 0.1946 572.5310 0.2629 577.6568 0.4125 586.2676 0.2692 587.9747 0.2990 594.4564 0.3102 607.6976 0.3750 613.1063 0.3892 615.9843 0.4185 632.0455 0.3719 640.7535 0.2546 645.3376 0.3508 652.1533 0.3912 660.6856 0.3632 666.1951 0.4526 669.5495 0.2411 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260812025555442844.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260812025555442844.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260812025555442844 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260812025555442844 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260812025555442844.eigenfacs 260812025555442844.atom 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