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LOGs for ID: 260812040611454350

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260812040611454350.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260812040611454350.atom to be opened. Openam> File opened: 260812040611454350.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 84 Number of atoms found = 4526 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.988523 +/- 11.881267 From: -8.679000 To: 56.637000 = 12.574845 +/- 15.421534 From: -28.395000 To: 51.195000 = 45.163659 +/- 18.177361 From: 4.321000 To: 94.173000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6959 % Filled. Pdbmat> 1563424 non-zero elements. Pdbmat> 170732 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 75.44 +/- 22.80 Maximum number = 135 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 3.414640E+06 Pdbmat> Larger element = 523.442 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 587 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260812040611454350.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260812040611454350.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260812040611454350.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4526 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 587 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 44 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 61 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 84 Blocpdb> 22 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 142 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 163 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 186 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 217 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 240 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 263 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 281 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 302 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 325 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 349 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 371 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 387 Blocpdb> 27 atoms in block 19 Block first atom: 406 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 433 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 457 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 470 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 493 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 516 Blocpdb> 23 atoms in block 25 Block first atom: 540 Blocpdb> 27 atoms in block 26 Block first atom: 563 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 590 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 609 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 632 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 657 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 675 Blocpdb> 25 atoms in block 32 Block first atom: 697 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 722 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 750 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 771 Blocpdb> 25 atoms in block 36 Block first atom: 794 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 819 Blocpdb> 30 atoms in block 38 Block first atom: 844 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 874 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 895 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 917 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 939 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 958 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 982 Blocpdb> 27 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 23 atoms in block 46 Block first atom: 1030 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1053 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1075 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 1098 Blocpdb> 30 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 1147 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1165 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1185 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1206 Blocpdb> 27 atoms in block 55 Block first atom: 1225 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1252 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1278 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1306 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 1328 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1344 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1364 Blocpdb> 26 atoms in block 62 Block first atom: 1386 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1412 Blocpdb> 23 atoms in block 64 Block first atom: 1432 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1455 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1474 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1494 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1520 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1541 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1562 Blocpdb> 22 atoms in block 71 Block first atom: 1579 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1601 Blocpdb> 21 atoms in block 73 Block first atom: 1623 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1644 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 1671 Blocpdb> 24 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 1722 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 1753 Blocpdb> 27 atoms in block 79 Block first atom: 1782 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1809 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 1836 Blocpdb> 27 atoms in block 82 Block first atom: 1864 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1891 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 1910 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1941 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 1961 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 1987 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2011 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 2034 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 2050 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 2072 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 93 Block first atom: 2117 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2139 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2159 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2185 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2212 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2231 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2258 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 2281 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 2312 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 2333 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2353 Blocpdb> 27 atoms in block 104 Block first atom: 2378 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2405 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 2426 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 2456 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2485 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2510 Blocpdb> 24 atoms in block 110 Block first atom: 2536 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2560 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2582 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 2607 Blocpdb> 19 atoms in block 114 Block first atom: 2633 Blocpdb> 18 atoms in block 115 Block first atom: 2652 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2670 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 2697 Blocpdb> 25 atoms in block 118 Block first atom: 2715 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 2740 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 2771 Blocpdb> 23 atoms in block 121 Block first atom: 2795 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2818 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 2840 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2857 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2883 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2903 Blocpdb> 24 atoms in block 127 Block first atom: 2924 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 2948 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 2981 Blocpdb> 24 atoms in block 130 Block first atom: 2999 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 3023 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3039 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 3063 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3087 Blocpdb> 24 atoms in block 135 Block first atom: 3109 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3133 Blocpdb> 25 atoms in block 137 Block first atom: 3157 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3182 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 3205 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 3227 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3256 Blocpdb> 24 atoms in block 142 Block first atom: 3277 Blocpdb> 31 atoms in block 143 Block first atom: 3301 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 3332 Blocpdb> 10 atoms in block 145 Block first atom: 3357 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 3367 Blocpdb> 21 atoms in block 147 Block first atom: 3394 Blocpdb> 21 atoms in block 148 Block first atom: 3415 Blocpdb> 27 atoms in block 149 Block first atom: 3436 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 3463 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3485 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3510 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3532 Blocpdb> 25 atoms in block 154 Block first atom: 3554 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 3579 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 3608 Blocpdb> 27 atoms in block 157 Block first atom: 3628 Blocpdb> 23 atoms in block 158 Block first atom: 3655 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3678 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3700 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3720 Blocpdb> 23 atoms in block 162 Block first atom: 3742 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3765 Blocpdb> 26 atoms in block 164 Block first atom: 3791 Blocpdb> 26 atoms in block 165 Block first atom: 3817 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3843 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3865 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3884 Blocpdb> 6 atoms in block 169 Block first atom: 3908 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 3914 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 3939 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 3958 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 3985 Blocpdb> 21 atoms in block 174 Block first atom: 4005 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 4026 Blocpdb> 27 atoms in block 176 Block first atom: 4050 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4077 Blocpdb> 23 atoms in block 178 Block first atom: 4100 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 4123 Blocpdb> 23 atoms in block 180 Block first atom: 4145 Blocpdb> 19 atoms in block 181 Block first atom: 4168 Blocpdb> 19 atoms in block 182 Block first atom: 4187 Blocpdb> 20 atoms in block 183 Block first atom: 4206 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4226 Blocpdb> 18 atoms in block 185 Block first atom: 4248 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4266 Blocpdb> 18 atoms in block 187 Block first atom: 4290 Blocpdb> 23 atoms in block 188 Block first atom: 4308 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4331 Blocpdb> 20 atoms in block 190 Block first atom: 4353 Blocpdb> 19 atoms in block 191 Block first atom: 4373 Blocpdb> 21 atoms in block 192 Block first atom: 4392 Blocpdb> 23 atoms in block 193 Block first atom: 4413 Blocpdb> 23 atoms in block 194 Block first atom: 4436 Blocpdb> 19 atoms in block 195 Block first atom: 4459 Blocpdb> 20 atoms in block 196 Block first atom: 4478 Blocpdb> 29 atoms in block 197 Block first atom: 4497 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1563621 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13578 Prepmat> Matrix trace = 3414640.0000 Prepmat> Last element read: 13578 13578 177.2594 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 17692 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4526 RTB> Total mass = 4526.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4526 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 227844.3295 RTB> 62241 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 62241 Diagstd> Projected matrix trace = 227844.3295 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 227844.3295 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1874605 0.1972466 0.2698090 0.3731942 0.5258880 0.6994257 0.7988937 0.9834831 1.1585385 1.2156154 1.4680764 1.5794199 1.8143045 2.0596658 2.2872325 2.4572378 2.5542076 2.6975194 2.7392487 3.2483755 3.3838687 3.8228322 4.0277834 4.0900236 4.3836106 4.6015463 4.8027350 5.1276866 5.2836239 5.3638887 5.7069324 5.8048071 6.1543113 6.5926848 7.0593427 7.2443298 7.4345830 7.6567013 7.9658388 8.2849667 8.5567739 8.7200315 9.0588323 9.3524302 9.6322682 9.8841414 10.5009667 10.5909105 10.9743977 11.4863687 11.6509187 11.9696326 12.2131706 12.5900100 13.0958636 13.2492271 13.6284437 13.8876630 14.0434867 14.7678975 15.0914193 15.5212819 15.6801606 15.7106155 16.1433537 16.4103982 16.5496904 16.9537110 17.0803695 17.4518827 17.9602602 18.0915780 18.2804347 18.4617133 18.6386218 19.3569427 19.4903938 19.9128085 19.9833670 20.7117194 21.0009641 21.7544800 22.1035905 22.5782417 22.7515613 23.0352108 23.3032843 23.6056981 24.0461209 24.5654839 25.0725130 25.4512967 25.6046377 25.9404626 26.2434559 26.5094185 26.5776563 27.0128175 27.4147562 27.6765119 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034318 0.0034333 0.0034333 0.0034334 0.0034343 47.0164844 48.2280820 56.4057644 66.3380560 78.7484320 90.8167714 97.0598876 107.6908329 116.8827743 119.7273500 131.5738571 136.4721652 146.2683520 155.8452804 164.2292211 170.2232470 173.5495039 178.3518308 179.7260417 195.7169294 199.7570112 212.3185294 217.9356789 219.6130731 227.3585365 232.9416670 237.9795256 245.8985775 249.6095667 251.4983618 259.4159314 261.6309857 269.3921956 278.8216138 288.5209893 292.2768288 296.0898962 300.4803883 306.4862788 312.5652287 317.6510591 320.6670284 326.8371315 332.0913153 337.0230179 341.4009741 351.8924279 353.3962442 359.7374298 368.0329113 370.6596969 375.6952379 379.4980000 385.3082589 392.9726741 395.2669946 400.8837129 404.6782514 406.9422235 417.3059858 421.8522043 427.8180199 430.0020574 430.4194420 436.3069808 439.9008894 441.7638931 447.1236769 448.7907643 453.6453078 460.2052747 461.8846235 464.2891547 466.5855468 468.8157333 477.7642646 479.4083431 484.5755968 485.4333526 494.2007015 497.6395584 506.4885519 510.5363783 515.9888760 517.9655579 521.1843615 524.2082446 527.5986854 532.4977700 538.2176581 543.7436679 547.8355832 549.4834263 553.0751409 556.2958155 559.1075808 559.8267172 564.3911857 568.5746259 571.2825488 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4526 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9826E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9877E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9835 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.579 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.739 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.823 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.090 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.602 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.154 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.657 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.966 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00006 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81468 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00006 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260812040611454350.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260812040611454350.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260812040611454350.atom Openam> file on opening on unit 11: 260812040611454350.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 84 Number of atoms found = 4526 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9826E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9877E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9835 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.579 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.739 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.823 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.090 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.602 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.154 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.244 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.657 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.966 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.68 Bfactors> 106 vectors, 13578 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.187500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.247 for 587 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.106 +/- 0.29 Bfactors> = 73.955 +/- 27.68 Bfactors> Shiftng-fct= 73.849 Bfactors> Scaling-fct= 93.936 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260812040611454350.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260812040611454350.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4526 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 36 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7496 0.0034 0.9945 0.0034 0.7242 0.0034 0.8273 0.0034 0.8123 0.0034 0.7882 47.0194 0.0598 48.2203 0.0486 56.4024 0.0844 66.3357 0.0343 78.7459 0.0872 90.8112 0.1188 97.0561 0.0387 107.6871 0.0941 116.9010 0.0546 119.7411 0.2896 131.5648 0.1012 136.4482 0.1676 146.2498 0.1602 155.8512 0.1990 164.2138 0.1734 170.2077 0.2842 173.5350 0.2468 178.3601 0.0927 179.7102 0.2747 195.6972 0.1571 199.7523 0.3214 212.3141 0.3320 217.9322 0.3093 219.6030 0.0332 227.3589 0.1933 232.9431 0.2137 237.9759 0.1901 245.8955 0.1361 249.6077 0.3461 251.4902 0.2074 259.4063 0.2023 261.6241 0.5054 269.3738 0.3212 278.8163 0.2639 288.5016 0.3170 292.2576 0.2428 296.0855 0.3092 300.4734 0.3102 306.4762 0.4306 312.5524 0.4406 317.6416 0.2390 320.6527 0.2264 326.8261 0.2608 332.0694 0.5047 337.0039 0.1906 341.3839 0.2843 351.8611 0.1857 353.3659 0.2761 359.6499 0.3409 368.0753 0.2036 370.6292 0.4006 375.6849 0.2777 379.4324 0.2749 385.2916 0.3262 393.0179 0.3245 395.2616 0.4077 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260812040611454350.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260812040611454350.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260812040611454350 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260812040611454350.eigenfacs 260812040611454350.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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