Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
Some cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* 1J4N-pdb *

LOGs for ID: 260813043826762194

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260813043826762194.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260813043826762194.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260813043826762194.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    249
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    249
            Number of atoms found    =   1852
            Mean number per residue  =      7.4

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    33.857786 +/-     9.233520 From:    12.180000 To:    59.194000
 =    30.862950 +/-     8.458143 From:    12.676000 To:    49.823000
 =    26.944994 +/-    13.951222 From:    -3.259000 To:    61.344000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.3274 % Filled.
 Pdbmat>       668033  non-zero elements.
 Pdbmat>        72999 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.83 +/-     24.75
         Maximum number =    135
         Minimum number =     15

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.459980E+06
 Pdbmat> Larger element =  496.130    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
249 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260813043826762194.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260813043826762194.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260813043826762194.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1852 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   249 residues.
 Blocpdb>    13 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     14
 Blocpdb>    20 atoms in block      3
 Block first atom:     29
 Blocpdb>    18 atoms in block      4
 Block first atom:     49
 Blocpdb>    19 atoms in block      5
 Block first atom:     67
 Blocpdb>    25 atoms in block      6
 Block first atom:     86
 Blocpdb>    12 atoms in block      7
 Block first atom:    111
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:    123
 Blocpdb>    20 atoms in block      9
 Block first atom:    135
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    155
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:    168
 Blocpdb>    19 atoms in block     12
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    19 atoms in block     13
 Block first atom:    203
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    222
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    236
 Blocpdb>    11 atoms in block     16
 Block first atom:    248
 Blocpdb>    12 atoms in block     17
 Block first atom:    259
 Blocpdb>    21 atoms in block     18
 Block first atom:    271
 Blocpdb>    19 atoms in block     19
 Block first atom:    292
 Blocpdb>    17 atoms in block     20
 Block first atom:    311
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    328
 Blocpdb>    16 atoms in block     22
 Block first atom:    342
 Blocpdb>    11 atoms in block     23
 Block first atom:    358
 Blocpdb>    12 atoms in block     24
 Block first atom:    369
 Blocpdb>    17 atoms in block     25
 Block first atom:    381
 Blocpdb>    15 atoms in block     26
 Block first atom:    398
 Blocpdb>    16 atoms in block     27
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    14 atoms in block     28
 Block first atom:    429
 Blocpdb>    16 atoms in block     29
 Block first atom:    443
 Blocpdb>    12 atoms in block     30
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    471
 Blocpdb>    12 atoms in block     32
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    497
 Blocpdb>    15 atoms in block     34
 Block first atom:    510
 Blocpdb>    11 atoms in block     35
 Block first atom:    525
 Blocpdb>    18 atoms in block     36
 Block first atom:    536
 Blocpdb>    10 atoms in block     37
 Block first atom:    554
 Blocpdb>    15 atoms in block     38
 Block first atom:    564
 Blocpdb>    16 atoms in block     39
 Block first atom:    579
 Blocpdb>    12 atoms in block     40
 Block first atom:    595
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    12 atoms in block     42
 Block first atom:    621
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    633
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    649
 Blocpdb>    15 atoms in block     45
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    14 atoms in block     46
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    15 atoms in block     47
 Block first atom:    692
 Blocpdb>    16 atoms in block     48
 Block first atom:    707
 Blocpdb>    16 atoms in block     49
 Block first atom:    723
 Blocpdb>    20 atoms in block     50
 Block first atom:    739
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    759
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    772
 Blocpdb>    11 atoms in block     53
 Block first atom:    787
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    798
 Blocpdb>    12 atoms in block     55
 Block first atom:    811
 Blocpdb>    12 atoms in block     56
 Block first atom:    823
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    835
 Blocpdb>    10 atoms in block     58
 Block first atom:    851
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    12 atoms in block     60
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    15 atoms in block     61
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    16 atoms in block     62
 Block first atom:    903
 Blocpdb>    14 atoms in block     63
 Block first atom:    919
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:    933
 Blocpdb>    13 atoms in block     65
 Block first atom:    945
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:    958
 Blocpdb>    11 atoms in block     67
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    15 atoms in block     68
 Block first atom:    982
 Blocpdb>    10 atoms in block     69
 Block first atom:    997
 Blocpdb>    13 atoms in block     70
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    12 atoms in block     71
 Block first atom:   1020
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1032
 Blocpdb>    16 atoms in block     73
 Block first atom:   1049
 Blocpdb>    11 atoms in block     74
 Block first atom:   1065
 Blocpdb>    17 atoms in block     75
 Block first atom:   1076
 Blocpdb>    15 atoms in block     76
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    14 atoms in block     77
 Block first atom:   1108
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1122
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:   1137
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1149
 Blocpdb>    22 atoms in block     81
 Block first atom:   1164
 Blocpdb>    22 atoms in block     82
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    16 atoms in block     83
 Block first atom:   1208
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    10 atoms in block     85
 Block first atom:   1232
 Blocpdb>    15 atoms in block     86
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>    13 atoms in block     87
 Block first atom:   1257
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1270
 Blocpdb>    13 atoms in block     89
 Block first atom:   1285
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1298
 Blocpdb>    14 atoms in block     91
 Block first atom:   1311
 Blocpdb>    16 atoms in block     92
 Block first atom:   1325
 Blocpdb>    13 atoms in block     93
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    20 atoms in block     94
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    11 atoms in block     95
 Block first atom:   1374
 Blocpdb>    10 atoms in block     96
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    16 atoms in block     97
 Block first atom:   1395
 Blocpdb>    12 atoms in block     98
 Block first atom:   1411
 Blocpdb>    17 atoms in block     99
 Block first atom:   1423
 Blocpdb>    15 atoms in block    100
 Block first atom:   1440
 Blocpdb>    12 atoms in block    101
 Block first atom:   1455
 Blocpdb>    15 atoms in block    102
 Block first atom:   1467
 Blocpdb>    17 atoms in block    103
 Block first atom:   1482
 Blocpdb>    19 atoms in block    104
 Block first atom:   1499
 Blocpdb>    17 atoms in block    105
 Block first atom:   1518
 Blocpdb>    24 atoms in block    106
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>    19 atoms in block    107
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    21 atoms in block    108
 Block first atom:   1578
 Blocpdb>    11 atoms in block    109
 Block first atom:   1599
 Blocpdb>    19 atoms in block    110
 Block first atom:   1610
 Blocpdb>     9 atoms in block    111
 Block first atom:   1629
 Blocpdb>    13 atoms in block    112
 Block first atom:   1638
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1651
 Blocpdb>    16 atoms in block    114
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    20 atoms in block    115
 Block first atom:   1679
 Blocpdb>    19 atoms in block    116
 Block first atom:   1699
 Blocpdb>    13 atoms in block    117
 Block first atom:   1718
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   1731
 Blocpdb>    12 atoms in block    119
 Block first atom:   1749
 Blocpdb>    16 atoms in block    120
 Block first atom:   1761
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1777
 Blocpdb>    18 atoms in block    122
 Block first atom:   1792
 Blocpdb>    16 atoms in block    123
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    21 atoms in block    124
 Block first atom:   1826
 Blocpdb>     6 atoms in block    125
 Block first atom:   1846

 Blocpdb>   125 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     6 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       668158 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       5556

 Prepmat> Matrix trace    =    1459980.0000
 Prepmat> Last element read:    5556   5556       127.2443
 Prepmat>         7876 lines saved.
 Prepmat>         6594 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1852
 RTB> Total mass =        1852.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1852
 RTB> Number of blocks =   125
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  168476.4806
 RTB>     44241 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      750
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    44241
 Diagstd> Projected matrix trace =  168476.4806

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    750 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 168476.4806
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.2465513      1.9429903      2.3549484      2.8498546
      3.1149468      3.6770497      4.3661281      6.1724350      6.5578641
      7.7563863      7.9633546      8.2422471      8.6516737     10.2815208
     10.7089543     11.4938510     12.1987970     12.7555618     13.3867273
     14.6942553     15.0125065     15.4053019     16.3802870     16.5010885
     17.6026378     18.7340930     19.4235096     19.9822866     20.6966976
     20.8893221     21.3596015     21.7714683     22.8691077     24.4288239
     24.8770719     26.0087507     26.7044428     27.3824265     28.3933484
     28.6797554     30.0702438     30.8361548     32.0581584     33.0477369
     33.3750658     34.1521904     34.4225896     35.2667146     36.0847382
     37.0865301     37.4671535     37.9238101     39.5613490     40.1199153
     40.7452196     41.7369804     41.9526371     43.6529080     44.3019518
     45.1228256     45.5685830     46.1207180     46.4857041     48.1285451
     48.5645225     49.3018516     50.1166898     50.4778376     51.9959073
     52.8439450     53.2723255     54.2475163     54.8208868     55.9239563
     56.7966413     57.3848128     58.1427793     58.8656059     59.6375019
     60.2991051     60.4333101     61.4716531     61.9058075     62.3410249
     63.7820228     64.2378303     65.4783532     66.0912273     66.8546012
     67.2591976     68.5668124     68.8938325     69.2421911     70.4410177
     71.7530779     72.1403521     72.8172238     72.9112559     73.8727378
     74.5967574

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034337      0.0034339      0.0034341      0.0034343      0.0034348
      0.0034354    121.2412364    151.3667890    166.6425788    183.3186415
    191.6551971    208.2308301    226.9047123    269.7885688    278.0843112
    302.4300876    306.4384851    311.7583515    319.4076741    348.1961463
    355.3602225    368.1527606    379.2746209    387.8332827    397.3127382
    416.2642079    420.7478298    426.2166266    439.4971201    441.1147470
    455.6004626    470.0148896    478.5850549    485.4202306    494.0214511
    496.3150604    501.8707137    506.6862741    519.3018747    536.7184929
    541.6202723    553.8026459    561.1604314    568.2392724    578.6335165
    581.5445656    595.4753046    603.0112140    614.8434703    624.2609123
    627.3448625    634.6065672    637.1138552    644.8783272    652.3145407
    661.3073976    664.6922732    668.7307009    683.0159197    687.8207665
    693.1601893    701.5454191    703.3555404    717.4669009    722.7809714
    729.4464649    733.0406221    737.4682208    740.3805258    753.3497476
    756.7542030    762.4772591    768.7523726    771.5172692    783.0326308
    789.3923189    792.5854727    799.8070168    804.0226967    812.0714163
    818.3830153    822.6095836    828.0244751    833.1555456    838.6002781
    843.2390563    844.1769146    851.3981978    854.3994826    857.3975721
    867.2502314    870.3435438    878.7071384    882.8098877    887.8936120
    890.5762746    899.1916396    901.3333754    903.6092780    911.3980420
    919.8468975    922.3259102    926.6427644    927.2408783    933.3346251
    937.8972341

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1852
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    125

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.247    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.943    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.355    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.850    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.115    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.677    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.366    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.172    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.558    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.756    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.963    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.242    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.652    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.60    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    750 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99995 1.00000 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 1.00002
 0.99995 0.99998 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 0.99997 1.00002 0.99997 0.99996 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99996
 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00004
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99996

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    33336 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99995 1.00000 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 1.00002
 0.99995 0.99998 0.99999 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 0.99997 1.00002 0.99997 0.99996 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99996
 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00004
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99996

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260813043826762194.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260813043826762194.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260813043826762194.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260813043826762194.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    249
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    249
            Number of atoms found    =   1852
            Mean number per residue  =      7.4

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.247    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.943    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.355    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.850    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.115    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.677    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.366    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.172    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.558    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.756    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.963    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.242    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.652    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.60    

 Bfactors>  106 vectors,   5556 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.247000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.630 for    249 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.048 +/-   0.08
 Bfactors> =     46.514 +/-  30.99
 Bfactors> Shiftng-fct=     46.465
 Bfactors> Scaling-fct=    397.213

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260813043826762194.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260813043826762194.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4352E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   121.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   151.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   166.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   183.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   191.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   208.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   226.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   269.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   278.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   302.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   306.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   311.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   319.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   348.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   355.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   368.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   379.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   387.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   397.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   416.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   420.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   426.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   439.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   441.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   455.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   469.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   478.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   485.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   494.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   496.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   501.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   519.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   536.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   541.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   553.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   568.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   578.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   581.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   595.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   603.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   614.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   627.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   634.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   637.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   644.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   652.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   661.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   664.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   683.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   687.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   693.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   701.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   703.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   722.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   729.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   733.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   737.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   756.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   768.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   783.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   789.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   799.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   804.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   833.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   838.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   843.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   851.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   854.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   870.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   878.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   882.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   887.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   890.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   899.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   901.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   903.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   911.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   922.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   937.9    

 Chkmod>  106 vectors,   5556 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1852 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    13 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    63 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9408
      0.0034      0.9974
      0.0034      0.7187
      0.0034      0.8157
      0.0034      0.7403
      0.0034      0.8738
    121.2578      0.1506
    151.3607      0.2040
    166.6373      0.1819
    183.3154      0.4168
    191.6486      0.1394
    208.2205      0.2768
    226.8916      0.2298
    269.7675      0.2899
    278.0753      0.4384
    302.4096      0.1931
    306.4185      0.1515
    311.7403      0.3100
    319.4000      0.2449
    348.1554      0.3632
    355.3623      0.2562
    368.0753      0.2777
    379.2770      0.2998
    387.8841      0.4554
    397.3442      0.2435
    416.1861      0.3528
    420.6946      0.1289
    426.2633      0.3167
    439.4744      0.3278
    441.0813      0.3480
    455.5468      0.2969
    469.9434      0.5239
    478.5213      0.2652
    485.3716      0.2981
    494.0397      0.3968
    496.3018      0.2137
    501.8539      0.3208
    506.6474      0.2241
    519.2897      0.3729
    536.7084      0.4242
    541.6289      0.4692
    553.7922      0.3439
    561.0897      0.1844
    568.1897      0.5649
    578.5746      0.3958
    581.5221      0.3621
    595.4473      0.4655
    603.0229      0.4710
    614.8347      0.3192
    624.2555      0.2548
    627.3643      0.3811
    634.5590      0.1545
    637.0625      0.3051
    644.8807      0.4691
    652.2437      0.3344
    661.3099      0.5591
    664.6890      0.2783
    668.6684      0.5785
    682.9750      0.2444
    687.7920      0.5293
    693.1711      0.4185
    701.5407      0.4377
    703.3032      0.1430
    717.4122      0.3439
    722.7340      0.3895
    729.3923      0.4298
    733.0206      0.5121
    737.4308      0.3080
    740.3830      0.4696
    753.3288      0.4020
    756.6865      0.5310
    762.4302      0.4652
    768.7448      0.4609
    771.5007      0.3837
    783.0298      0.4974
    789.3290      0.4560
    792.5342      0.4377
    799.7910      0.1130
    803.9817      0.3053
    812.0078      0.3453
    818.3721      0.4158
    822.5398      0.4283
    827.9691      0.3427
    833.1509      0.4766
    838.5818      0.4906
    843.2091      0.4067
    844.1176      0.5049
    851.3502      0.4188
    854.3917      0.4954
    857.3537      0.3575
    867.1993      0.4213
    870.3209      0.2703
    878.6805      0.4916
    882.7638      0.2065
    887.8249      0.5330
    890.5434      0.3500
    899.1739      0.4754
    901.2696      0.5111
    903.5562      0.3803
    911.3523      0.4544
    919.7877      0.4287
    922.2841      0.3764
    926.6206      0.4275
    927.1931      0.5015
    933.2773      0.3812
    937.8774      0.2219
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260813043826762194 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
making animated gifs
11 models are in 260813043826762194.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260813043826762194 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
making animated gifs
11 models are in 260813043826762194.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260813043826762194 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
making animated gifs
11 models are in 260813043826762194.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260813043826762194 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
making animated gifs
11 models are in 260813043826762194.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260813043826762194 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260813043826762194.eigenfacs
260813043826762194.atom
making animated gifs
11 models are in 260813043826762194.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260813043826762194.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260813043826762194.10.pdb
260813043826762194.11.pdb
260813043826762194.7.pdb
260813043826762194.8.pdb
260813043826762194.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m6.655s
user	0m6.571s
sys	0m0.083s
rm: cannot remove '260813043826762194.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been relocated. **Some cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** 1J4N-pdb ***

LOGs for ID: 260813043826762194

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
Some cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* 1J4N-pdb *
