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***  2J5L Structure of a Plasmodium falciparum apical membrane antigen 1-Fab F8. 12.19 complex  ***

LOGs for ID: 2608162332391822803

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2608162332391822803.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2608162332391822803.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2608162332391822803.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    461
            First residue number     =    479
            Last  residue number     =    233
            Number of atoms found    =   3597
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    58.317446 +/-    12.297255 From:    29.990000 To:    83.751000
 =   -66.589312 +/-    20.365552 From:  -106.120000 To:   -25.130000
 =     0.039627 +/-     9.074575 From:   -22.516000 To:    22.936000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.3164 % Filled.
 Pdbmat>      1348810  non-zero elements.
 Pdbmat>       147492 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.01 +/-     23.28
         Maximum number =    130
         Minimum number =     18

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.949840E+06
 Pdbmat> Larger element =  498.769    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
461 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2608162332391822803.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2608162332391822803.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608162332391822803.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3597 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   461 residues.
 Blocpdb>    27 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     28
 Blocpdb>    23 atoms in block      3
 Block first atom:     50
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     73
 Blocpdb>    21 atoms in block      5
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    24 atoms in block      6
 Block first atom:    117
 Blocpdb>    22 atoms in block      7
 Block first atom:    141
 Blocpdb>    19 atoms in block      8
 Block first atom:    163
 Blocpdb>    33 atoms in block      9
 Block first atom:    182
 Blocpdb>    22 atoms in block     10
 Block first atom:    215
 Blocpdb>    22 atoms in block     11
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    11 atoms in block     12
 Block first atom:    259
 Blocpdb>    21 atoms in block     13
 Block first atom:    270
 Blocpdb>    21 atoms in block     14
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    20 atoms in block     15
 Block first atom:    312
 Blocpdb>    19 atoms in block     16
 Block first atom:    332
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    351
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    368
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    393
 Blocpdb>    22 atoms in block     20
 Block first atom:    415
 Blocpdb>    17 atoms in block     21
 Block first atom:    437
 Blocpdb>    19 atoms in block     22
 Block first atom:    454
 Blocpdb>    30 atoms in block     23
 Block first atom:    473
 Blocpdb>    35 atoms in block     24
 Block first atom:    503
 Blocpdb>    24 atoms in block     25
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    562
 Blocpdb>    23 atoms in block     27
 Block first atom:    578
 Blocpdb>    32 atoms in block     28
 Block first atom:    601
 Blocpdb>    18 atoms in block     29
 Block first atom:    633
 Blocpdb>    21 atoms in block     30
 Block first atom:    651
 Blocpdb>    17 atoms in block     31
 Block first atom:    672
 Blocpdb>    23 atoms in block     32
 Block first atom:    689
 Blocpdb>    21 atoms in block     33
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    733
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    749
 Blocpdb>    26 atoms in block     36
 Block first atom:    766
 Blocpdb>    21 atoms in block     37
 Block first atom:    792
 Blocpdb>    27 atoms in block     38
 Block first atom:    813
 Blocpdb>    22 atoms in block     39
 Block first atom:    840
 Blocpdb>    17 atoms in block     40
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    30 atoms in block     41
 Block first atom:    879
 Blocpdb>    32 atoms in block     42
 Block first atom:    909
 Blocpdb>    22 atoms in block     43
 Block first atom:    941
 Blocpdb>    21 atoms in block     44
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    21 atoms in block     45
 Block first atom:    984
 Blocpdb>    20 atoms in block     46
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    25 atoms in block     47
 Block first atom:   1025
 Blocpdb>    25 atoms in block     48
 Block first atom:   1050
 Blocpdb>    18 atoms in block     49
 Block first atom:   1075
 Blocpdb>    21 atoms in block     50
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    25 atoms in block     51
 Block first atom:   1114
 Blocpdb>    20 atoms in block     52
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    24 atoms in block     53
 Block first atom:   1159
 Blocpdb>    21 atoms in block     54
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    13 atoms in block     55
 Block first atom:   1204
 Blocpdb>    20 atoms in block     56
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1237
 Blocpdb>    27 atoms in block     58
 Block first atom:   1262
 Blocpdb>    28 atoms in block     59
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>    24 atoms in block     60
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    30 atoms in block     61
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1371
 Blocpdb>    19 atoms in block     63
 Block first atom:   1396
 Blocpdb>    28 atoms in block     64
 Block first atom:   1415
 Blocpdb>    19 atoms in block     65
 Block first atom:   1443
 Blocpdb>    28 atoms in block     66
 Block first atom:   1462
 Blocpdb>    24 atoms in block     67
 Block first atom:   1490
 Blocpdb>    23 atoms in block     68
 Block first atom:   1514
 Blocpdb>    21 atoms in block     69
 Block first atom:   1537
 Blocpdb>    26 atoms in block     70
 Block first atom:   1558
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1584
 Blocpdb>    23 atoms in block     72
 Block first atom:   1603
 Blocpdb>    24 atoms in block     73
 Block first atom:   1626
 Blocpdb>    30 atoms in block     74
 Block first atom:   1650
 Blocpdb>    29 atoms in block     75
 Block first atom:   1680
 Blocpdb>    25 atoms in block     76
 Block first atom:   1709
 Blocpdb>    20 atoms in block     77
 Block first atom:   1734
 Blocpdb>    26 atoms in block     78
 Block first atom:   1754
 Blocpdb>    20 atoms in block     79
 Block first atom:   1780
 Blocpdb>    21 atoms in block     80
 Block first atom:   1800
 Blocpdb>    22 atoms in block     81
 Block first atom:   1821
 Blocpdb>    30 atoms in block     82
 Block first atom:   1843
 Blocpdb>    24 atoms in block     83
 Block first atom:   1873
 Blocpdb>    25 atoms in block     84
 Block first atom:   1897
 Blocpdb>    24 atoms in block     85
 Block first atom:   1922
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1946
 Blocpdb>    19 atoms in block     87
 Block first atom:   1960
 Blocpdb>    20 atoms in block     88
 Block first atom:   1979
 Blocpdb>    18 atoms in block     89
 Block first atom:   1999
 Blocpdb>    23 atoms in block     90
 Block first atom:   2017
 Blocpdb>    16 atoms in block     91
 Block first atom:   2040
 Blocpdb>    21 atoms in block     92
 Block first atom:   2056
 Blocpdb>    25 atoms in block     93
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    32 atoms in block     94
 Block first atom:   2102
 Blocpdb>    34 atoms in block     95
 Block first atom:   2134
 Blocpdb>    27 atoms in block     96
 Block first atom:   2168
 Blocpdb>    23 atoms in block     97
 Block first atom:   2195
 Blocpdb>    28 atoms in block     98
 Block first atom:   2218
 Blocpdb>    30 atoms in block     99
 Block first atom:   2246
 Blocpdb>    20 atoms in block    100
 Block first atom:   2276
 Blocpdb>    26 atoms in block    101
 Block first atom:   2296
 Blocpdb>    25 atoms in block    102
 Block first atom:   2322
 Blocpdb>    31 atoms in block    103
 Block first atom:   2347
 Blocpdb>    21 atoms in block    104
 Block first atom:   2378
 Blocpdb>    24 atoms in block    105
 Block first atom:   2399
 Blocpdb>    26 atoms in block    106
 Block first atom:   2423
 Blocpdb>    25 atoms in block    107
 Block first atom:   2449
 Blocpdb>    22 atoms in block    108
 Block first atom:   2474
 Blocpdb>    24 atoms in block    109
 Block first atom:   2496
 Blocpdb>    29 atoms in block    110
 Block first atom:   2520
 Blocpdb>    43 atoms in block    111
 Block first atom:   2549
 Blocpdb>    24 atoms in block    112
 Block first atom:   2592
 Blocpdb>    25 atoms in block    113
 Block first atom:   2616
 Blocpdb>    23 atoms in block    114
 Block first atom:   2641
 Blocpdb>    23 atoms in block    115
 Block first atom:   2664
 Blocpdb>    22 atoms in block    116
 Block first atom:   2687
 Blocpdb>    63 atoms in block    117
 Block first atom:   2709
 Blocpdb>    27 atoms in block    118
 Block first atom:   2772
 Blocpdb>    19 atoms in block    119
 Block first atom:   2799
 Blocpdb>    21 atoms in block    120
 Block first atom:   2818
 Blocpdb>    20 atoms in block    121
 Block first atom:   2839
 Blocpdb>    23 atoms in block    122
 Block first atom:   2859
 Blocpdb>    20 atoms in block    123
 Block first atom:   2882
 Blocpdb>    26 atoms in block    124
 Block first atom:   2902
 Blocpdb>    20 atoms in block    125
 Block first atom:   2928
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   2948
 Blocpdb>     5 atoms in block    127
 Block first atom:   2963
 Blocpdb>    24 atoms in block    128
 Block first atom:   2968
 Blocpdb>    21 atoms in block    129
 Block first atom:   2992
 Blocpdb>    19 atoms in block    130
 Block first atom:   3013
 Blocpdb>    21 atoms in block    131
 Block first atom:   3032
 Blocpdb>    25 atoms in block    132
 Block first atom:   3053
 Blocpdb>    27 atoms in block    133
 Block first atom:   3078
 Blocpdb>    21 atoms in block    134
 Block first atom:   3105
 Blocpdb>     7 atoms in block    135
 Block first atom:   3126
 Blocpdb>    21 atoms in block    136
 Block first atom:   3133
 Blocpdb>    18 atoms in block    137
 Block first atom:   3154
 Blocpdb>    20 atoms in block    138
 Block first atom:   3172
 Blocpdb>    10 atoms in block    139
 Block first atom:   3192
 Blocpdb>    24 atoms in block    140
 Block first atom:   3202
 Blocpdb>    23 atoms in block    141
 Block first atom:   3226
 Blocpdb>    24 atoms in block    142
 Block first atom:   3249
 Blocpdb>     6 atoms in block    143
 Block first atom:   3273
 Blocpdb>    28 atoms in block    144
 Block first atom:   3279
 Blocpdb>    21 atoms in block    145
 Block first atom:   3307
 Blocpdb>    19 atoms in block    146
 Block first atom:   3328
 Blocpdb>    21 atoms in block    147
 Block first atom:   3347
 Blocpdb>    12 atoms in block    148
 Block first atom:   3368
 Blocpdb>    25 atoms in block    149
 Block first atom:   3380
 Blocpdb>    22 atoms in block    150
 Block first atom:   3405
 Blocpdb>    14 atoms in block    151
 Block first atom:   3427
 Blocpdb>    21 atoms in block    152
 Block first atom:   3441
 Blocpdb>    22 atoms in block    153
 Block first atom:   3462
 Blocpdb>    17 atoms in block    154
 Block first atom:   3484
 Blocpdb>    23 atoms in block    155
 Block first atom:   3501
 Blocpdb>    26 atoms in block    156
 Block first atom:   3524
 Blocpdb>     8 atoms in block    157
 Block first atom:   3550
 Blocpdb>    25 atoms in block    158
 Block first atom:   3558
 Blocpdb>    15 atoms in block    159
 Block first atom:   3582

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     63 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1348969 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      10791

 Prepmat> Matrix trace    =    2949840.0000
 Prepmat> Last element read:   10791  10791        99.5407
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        11232 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3597
 RTB> Total mass =        3597.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3597
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  202629.6239
 RTB>     51172 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    51172
 Diagstd> Projected matrix trace =  202629.6239

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 202629.6239
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.3677646      1.0567917      2.1226339      2.5252578
      2.9003771      3.1015815      4.0599369      5.3907441      6.5821870
      6.9791547      7.4846423      8.7354315      9.2690897     10.8271735
     11.2634284     11.8862412     12.9881779     13.4683916     14.7114918
     15.4501356     15.5847776     16.7648205     17.4102967     18.2290543
     18.9221806     19.2061565     19.5667553     20.0879120     21.5139486
     22.2127728     22.7244115     23.3033841     23.7668326     24.1441988
     24.4635322     24.9381007     25.6019287     25.9236575     26.8153954
     27.1878922     28.1522596     28.6440629     29.6929833     29.8603202
     30.4103295     30.9998674     31.6249856     31.8959685     32.8188437
     33.8802269     34.4265952     34.6753195     35.3289958     35.9270846
     36.6637174     37.4811535     38.1768521     38.4594293     38.8756013
     39.4759548     39.7478682     40.6432379     41.0632425     41.6976114
     41.9860479     42.3997250     43.5547049     44.1719772     44.7734853
     45.1732312     45.4034557     45.7216815     46.8503214     47.2219549
     47.8510746     48.0554958     48.5345746     49.1614097     49.2703434
     50.0894362     50.4638567     51.7059591     52.7217850     53.2662322
     53.8599165     54.1357432     54.5566423     55.5356807     56.2544435
     56.9998997     57.1349389     57.4697114     58.1752412     58.3851167
     58.5949989     59.7859127     60.6576830     60.9751720     61.2827303
     61.7587309

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034313      0.0034321      0.0034329      0.0034335      0.0034342
      0.0034346     65.8537079    111.6323285    158.2095982    172.5631839
    184.9364490    191.2435856    218.8038323    252.1271638    278.5995355
    286.8776360    297.0850542    320.9500600    330.6083534    357.3162999
    364.4438134    374.3842322    391.3536550    398.5227768    416.5082786
    426.8363798    428.6922029    444.6258769    453.1044911    463.6362132
    472.3684379    475.8997889    480.3465622    486.7014934    503.6807393
    511.7957407    517.6564181    524.2093668    529.3963395    533.5826249
    537.0996410    542.2842201    549.4543579    552.8959618    562.3249882
    566.2171897    576.1716816    581.1825810    591.7281056    593.3931256
    598.8331630    604.6098225    610.6754326    613.2861788    622.0952965
    632.0747413    637.1509234    639.4484159    645.4475060    650.8880057
    657.5269057    664.8164462    670.9580037    673.4365724    677.0704193
    682.2783679    684.6241279    692.2921866    695.8600442    701.2144693
    703.6355588    707.0934268    716.6594271    721.7199323    726.6172960
    729.8537750    731.7112537    734.2710021    743.2784951    746.2206467
    751.1750037    752.7778146    756.5208365    761.3904834    762.2335755
    768.5433196    771.4104171    780.8463410    788.4793671    792.5401437
    796.9445740    798.9826191    802.0826040    809.2474321    814.4673824
    819.8460826    820.8166623    823.2178683    828.2555917    829.7482717
    831.2383193    839.6430780    845.7425654    847.9530319    850.0888762
    853.3839324

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3597
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9847E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9891E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3678    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.057    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.123    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.525    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.900    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.102    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.060    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.391    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.582    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.979    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.485    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.735    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.269    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.76    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001
 1.00006 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999
 0.99996 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999
 0.99998 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997
 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    64746 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001
 1.00006 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999
 0.99996 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999
 0.99998 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997
 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608162332391822803.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608162332391822803.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2608162332391822803.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608162332391822803.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    461
            First residue number     =    479
            Last  residue number     =    233
            Number of atoms found    =   3597
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9847E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9891E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9936E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3678    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.057    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.123    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.525    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.900    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.102    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.060    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.391    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.582    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.979    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.485    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.735    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.269    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.76    

 Bfactors>  106 vectors,  10791 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.367800
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.661 for    471 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.038 +/-   0.03
 Bfactors> =     60.615 +/-  17.24
 Bfactors> Shiftng-fct=     60.577
 Bfactors> Scaling-fct=    502.039

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608162332391822803.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608162332391822803.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4312E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   673.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   726.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   729.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   731.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   746.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   752.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.2    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   788.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   799.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   819.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   820.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   829.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   848.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   850.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.4    

 Chkmod>  106 vectors,  10791 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3597 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    41 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8476
      0.0034      0.9076
      0.0034      0.9478
      0.0034      0.7920
      0.0034      0.7566
      0.0034      0.8048
     65.8541      0.6872
    111.6385      0.6934
    158.2164      0.6797
    172.5470      0.7004
    184.9165      0.6324
    191.2483      0.2795
    218.7961      0.1634
    252.1223      0.4963
    278.5836      0.3182
    286.8621      0.4226
    297.0794      0.4599
    320.9284      0.4728
    330.5926      0.3678
    357.3476      0.4034
    364.3727      0.3953
    374.4273      0.4781
    391.3643      0.4836
    398.5295      0.5491
    416.4693      0.5031
    426.8162      0.3841
    428.6081      0.4812
    444.5429      0.4755
    453.0812      0.5067
    463.6283      0.2504
    472.3209      0.2667
    475.9270      0.4524
    480.3658      0.1925
    486.7059      0.3114
    503.6129      0.5074
    511.7418      0.5023
    517.5839      0.2018
    524.1488      0.2649
    529.4089      0.4991
    533.5133      0.4175
    537.0378      0.3935
    542.2816      0.2574
    549.4101      0.3188
    552.8332      0.4090
    562.3491      0.3749
    566.2148      0.3987
    576.1238      0.1601
    581.1164      0.4147
    591.6730      0.4006
    593.3645      0.4029
    598.8042      0.4040
    604.5852      0.3146
    610.6011      0.3059
    613.2986      0.3138
    622.0796      0.2755
    632.0455      0.4108
    637.1551      0.0828
    639.4641      0.2172
    645.4290      0.2934
    650.8865      0.2574
    657.4653      0.1765
    664.7777      0.2805
    670.9569      0.4098
    673.4127      0.3245
    677.0797      0.3680
    682.2840      0.4316
    684.6131      0.3108
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    703.6385      0.2353
    707.0654      0.2835
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    721.6728      0.3128
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    729.7963      0.3677
    731.6520      0.3968
    734.2260      0.3022
    743.2440      0.4541
    746.1732      0.3701
    751.1343      0.4211
    752.7808      0.4048
    756.4527      0.4096
    761.3469      0.2790
    762.1982      0.4771
    768.5147      0.4554
    771.3478      0.4082
    780.8433      0.4789
    788.4322      0.5349
    792.5342      0.5367
    796.9110      0.5210
    798.9797      0.4029
    802.0729      0.3377
    809.2442      0.4794
    814.4003      0.5222
    819.8116      0.4124
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    850.0334      0.4660
    853.3561      0.4127
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608162332391822803 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608162332391822803.eigenfacs
2608162332391822803.atom
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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real	0m17.505s
user	0m17.335s
sys	0m0.154s
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