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***  2J4W Structure of a Plasmodium vivax apical membrane antigen 1-Fab F8.12.19 complex  ***

CA distance fluctuations for 2608162333311823063

---  normal mode 8  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
SER 27 0.06 ILE 421 -0.04 ASP 61
SER 29 0.05 PHE 422 -0.05 ASP 61
SER 216 0.06 ILE 423 -0.04 LYS 169
SER 216 0.06 SER 424 -0.05 LYS 169
SER 216 0.08 ASN 425 -0.06 LYS 169
SER 216 0.07 ASP 426 -0.06 LYS 169
SER 216 0.07 LYS 427 -0.07 LYS 169
SER 216 0.06 GLU 428 -0.06 LYS 169
SER 216 0.05 SER 429 -0.05 LYS 169
SER 27 0.05 ILE 430 -0.04 LYS 169
SER 2 0.05 LYS 431 -0.04 LYS 169
SER 216 0.05 CYS 432 -0.04 LYS 169
ASN 145 0.04 PRO 433 -0.05 ASP 61
SER 216 0.06 CYS 434 -0.05 LYS 169
SER 216 0.08 GLU 435 -0.07 LYS 169
SER 216 0.08 PRO 436 -0.06 LYS 169
SER 216 0.09 GLU 437 -0.06 LYS 169
SER 216 0.10 ARG 438 -0.07 LYS 169
SER 216 0.10 ILE 439 -0.07 PRO 59
SER 216 0.11 SER 440 -0.08 ALA 60
SER 216 0.11 GLU 441 -0.08 ALA 60
SER 216 0.12 SER 442 -0.08 ALA 60
SER 216 0.13 THR 443 -0.08 ALA 60
SER 216 0.11 CYS 444 -0.08 LYS 169
SER 216 0.10 ASN 445 -0.07 LYS 169
SER 216 0.09 PHE 446 -0.06 LYS 169
SER 216 0.08 TYR 447 -0.06 LYS 169
SER 216 0.07 VAL 448 -0.05 LYS 169
SER 216 0.06 CYS 449 -0.04 LYS 169
SER 216 0.06 ASN 450 -0.04 GLU 85
SER 216 0.04 CYS 451 -0.05 GLU 85
SER 2 0.06 VAL 452 -0.06 GLU 85
SER 2 0.07 GLU 453 -0.08 ASP 61
SER 2 0.09 LYS 454 -0.09 ASP 61
SER 216 0.21 GLU 1 -0.21 LYS 169
SER 216 0.20 VAL 2 -0.18 LYS 169
PRO 213 0.23 GLN 3 -0.18 LYS 169
PRO 213 0.20 LEU 4 -0.16 SER 168
ALA 214 0.24 VAL 5 -0.19 SER 168
ALA 214 0.23 GLU 6 -0.17 SER 168
ALA 214 0.22 SER 7 -0.21 GLY 164
GLY 10 0.21 GLY 8 -0.21 GLY 164
GLY 10 0.31 GLY 9 -0.17 GLY 164
GLY 9 0.31 GLY 10 -0.25 PRO 213
GLY 9 0.14 LEU 11 -0.27 ALA 214
ASN 157 0.14 VAL 12 -0.23 ALA 214
ASN 157 0.16 LYS 13 -0.21 ALA 214
ASN 157 0.19 PRO 14 -0.15 ALA 214
ASN 157 0.18 GLY 15 -0.16 PRO 213
ASN 157 0.15 GLY 16 -0.20 PRO 213
ASN 157 0.13 SER 17 -0.18 PRO 213
ASN 157 0.11 LEU 18 -0.17 PRO 213
LYS 115 0.13 LYS 19 -0.16 GLY 164
GLY 10 0.14 LEU 20 -0.16 GLY 164
THR 116 0.15 SER 21 -0.17 GLY 164
ALA 214 0.17 CYS 22 -0.15 SER 168
ALA 214 0.20 ALA 23 -0.18 SER 168
SER 216 0.18 ALA 24 -0.16 SER 168
SER 216 0.20 SER 25 -0.17 SER 168
SER 216 0.20 GLY 26 -0.17 LYS 169
SER 216 0.16 PHE 27 -0.14 LYS 169
SER 216 0.14 ILE 28 -0.13 LYS 169
SER 216 0.13 PHE 29 -0.12 SER 168
SER 216 0.11 SER 30 -0.11 SER 168
SER 216 0.11 ASP 31 -0.10 LYS 169
SER 216 0.11 TYR 32 -0.09 LYS 169
SER 216 0.09 TYR 33 -0.08 LYS 169
ALA 214 0.09 MET 34 -0.08 LYS 169
ALA 214 0.08 TYR 35 -0.07 LYS 169
ALA 214 0.07 TRP 36 -0.07 SER 168
ASN 157 0.06 VAL 37 -0.05 LYS 169
ASN 145 0.08 ARG 38 -0.05 VAL 3
ASN 145 0.09 GLN 39 -0.06 VAL 3
ASN 145 0.12 THR 40 -0.09 SER 112
ASP 143 0.14 PRO 41 -0.12 ALA 114
ASP 143 0.16 GLU 42 -0.14 ASP 183
ASP 143 0.11 LYS 43 -0.09 ASP 183
ASP 143 0.11 ARG 44 -0.09 ALA 114
ASP 143 0.08 LEU 45 -0.07 SER 112
ASP 143 0.09 GLU 46 -0.07 THR 97
ASN 145 0.07 TRP 47 -0.05 SER 112
ASN 145 0.08 VAL 48 -0.05 GLU 85
ASN 157 0.07 ALA 49 -0.05 SER 168
ASN 157 0.06 THR 50 -0.06 SER 168
ASN 157 0.06 ILE 51 -0.07 SER 168
ALA 214 0.06 SER 52 -0.07 LYS 169
ALA 214 0.08 ASP 52 -0.08 LYS 169
ALA 214 0.07 GLY 53 -0.08 SER 168
THR 116 0.06 ASN 54 -0.07 SER 168
ASN 157 0.06 SER 55 -0.07 SER 168
ASN 157 0.06 TYR 56 -0.06 SER 168
ASN 157 0.07 THR 57 -0.06 SER 165
ASN 157 0.07 TYR 58 -0.04 SER 165
ASN 145 0.08 TYR 59 -0.05 LYS 83
ASP 143 0.09 VAL 60 -0.07 SER 112
ASP 143 0.12 ASP 61 -0.09 LYS 454
ASN 145 0.13 SER 62 -0.08 GLU 113
ASN 157 0.11 VAL 63 -0.07 PRO 14
ASN 157 0.11 LYS 64 -0.06 LYS 454
ASN 157 0.11 GLY 65 -0.07 SER 163
ASN 157 0.12 ARG 66 -0.09 PRO 213
ASN 157 0.11 PHE 67 -0.09 GLY 164
ASN 157 0.09 THR 68 -0.09 SER 165
ASN 157 0.08 ILE 69 -0.09 SER 165
LYS 115 0.08 SER 70 -0.11 SER 165
LYS 115 0.10 ARG 71 -0.12 SER 165
LYS 115 0.11 ASP 72 -0.14 SER 165
THR 116 0.11 ASN 73 -0.13 SER 168
LYS 115 0.12 ALA 74 -0.15 SER 165
THR 116 0.14 LYS 75 -0.17 SER 165
ALA 214 0.14 ASN 76 -0.15 SER 168
ALA 214 0.14 ASN 77 -0.15 SER 168
THR 116 0.11 LEU 78 -0.13 SER 168
LYS 115 0.11 TYR 79 -0.13 SER 165
ASN 157 0.09 LEU 80 -0.12 GLY 164
ASN 157 0.10 GLN 81 -0.13 GLY 164
ASN 157 0.11 MET 82 -0.11 SER 163
ASN 157 0.13 SER 82 -0.13 PRO 213
ASN 157 0.15 SER 82 -0.14 PRO 213
ASN 157 0.15 LEU 82 -0.13 PRO 213
ASN 157 0.18 LYS 83 -0.11 ALA 214
ASN 157 0.19 SER 84 -0.15 SER 112
ASN 145 0.16 GLU 85 -0.12 SER 112
ASN 157 0.14 ASP 86 -0.08 SER 112
ASN 157 0.14 THR 87 -0.08 SER 112
ASN 157 0.10 ALA 88 -0.06 VAL 3
ASN 157 0.08 ILE 89 -0.07 SER 168
ASN 157 0.08 TYR 90 -0.08 SER 168
ALA 214 0.12 TYR 91 -0.09 SER 168
ALA 214 0.13 CYS 92 -0.10 SER 168
ALA 214 0.12 ALA 93 -0.10 LYS 169
SER 216 0.12 ARG 94 -0.10 LYS 169
SER 216 0.12 ASP 95 -0.09 LYS 169
PRO 213 0.14 GLY 96 -0.10 LYS 169
SER 216 0.15 PRO 97 -0.11 SER 56
SER 216 0.14 THR 98 -0.09 LYS 169
SER 216 0.13 ASP 99 -0.09 SER 56
SER 216 0.12 SER 100 -0.10 ALA 55
SER 216 0.11 SER 100 -0.07 LYS 169
SER 216 0.09 GLY 100 -0.06 LYS 169
SER 216 0.08 TYR 100 -0.05 LYS 169
SER 216 0.07 GLY 100 -0.04 LYS 169
PRO 213 0.09 GLY 100 -0.06 LYS 169
PRO 213 0.11 PHE 100 -0.07 LYS 169
PRO 213 0.14 GLY 101 -0.10 LYS 169
PRO 213 0.17 TYR 102 -0.12 LYS 169
PRO 213 0.16 TRP 103 -0.11 LYS 169
PRO 213 0.20 GLY 104 -0.13 LYS 169
PRO 213 0.25 GLN 105 -0.15 SER 168
ALA 214 0.17 GLY 106 -0.13 SER 168
ALA 214 0.17 THR 107 -0.14 SER 167
PRO 149 0.12 LEU 108 -0.11 GLY 164
LEU 178 0.11 VAL 109 -0.11 GLY 164
LEU 178 0.16 THR 110 -0.13 PRO 213
LEU 178 0.17 VAL 111 -0.16 ALA 214
GLN 179 0.20 SER 112 -0.15 SER 84
ASN 157 0.19 GLU 113 -0.13 ALA 214
ASN 157 0.15 ALA 114 -0.13 GLU 42
GLY 8 0.19 LYS 115 -0.12 GLU 113
GLY 8 0.20 THR 116 -0.12 LYS 13
VAL 5 0.15 THR 117 -0.07 GLU 42
VAL 5 0.15 PRO 118 -0.09 LYS 13
GLY 41 0.12 PRO 119 -0.05 LYS 13
GLY 57 0.11 SER 120 -0.04 ALA 9
GLY 57 0.12 VAL 121 -0.06 GLY 10
GLU 81 0.10 TYR 122 -0.05 GLY 10
GLU 81 0.11 PRO 123 -0.06 GLY 10
GLU 81 0.10 LEU 124 -0.05 GLY 10
LYS 169 0.11 ALA 125 -0.05 GLY 10
LYS 169 0.09 PRO 126 -0.05 SER 7
LYS 169 0.08 GLY 127 -0.03 SER 208
LYS 169 0.07 SER 128 -0.03 PRO 227
ASP 170 0.07 ALA 129 -0.04 LYS 75
ASP 170 0.08 ALA 130 -0.06 GLU 1
ASP 170 0.09 GLN 133 -0.07 LYS 75
PRO 15 0.11 THR 134 -0.08 GLU 1
ALA 109 0.12 ASN 135 -0.10 GLU 1
PRO 15 0.15 SER 136 -0.11 GLU 1
ASP 170 0.16 MET 137 -0.10 SER 25
ASP 170 0.14 VAL 138 -0.09 SER 7
ASP 170 0.13 THR 139 -0.08 SER 7
LYS 169 0.13 LEU 140 -0.08 SER 7
SER 168 0.12 GLY 141 -0.07 GLY 10
GLU 81 0.12 CYS 142 -0.07 GLY 10
GLU 81 0.10 LEU 143 -0.04 GLY 10
GLY 41 0.11 VAL 144 -0.05 GLY 10
GLY 41 0.09 LYS 145 -0.06 ALA 9
GLY 41 0.09 GLY 146 -0.08 ALA 9
VAL 5 0.11 TYR 147 -0.07 ALA 9
GLU 6 0.13 PHE 148 -0.10 GLU 42
GLY 9 0.15 PRO 149 -0.11 PRO 41
GLY 41 0.14 GLU 150 -0.10 PRO 151
GLY 41 0.23 PRO 151 -0.17 GLY 10
GLY 41 0.23 VAL 152 -0.16 GLY 10
GLY 41 0.26 THR 153 -0.17 GLY 10
GLU 81 0.18 VAL 154 -0.14 GLY 10
GLU 81 0.22 THR 156 -0.17 GLY 8
GLU 81 0.22 TRP 157 -0.15 GLY 8
GLU 81 0.21 ASN 162 -0.16 GLY 8
PRO 59 0.24 SER 163 -0.20 GLY 8
GLU 81 0.27 GLY 164 -0.21 SER 7
GLU 81 0.26 SER 165 -0.20 SER 7
GLU 81 0.25 LEU 166 -0.18 SER 7
LYS 169 0.31 SER 167 -0.20 SER 7
LYS 169 0.33 SER 168 -0.19 VAL 5
LYS 169 0.26 GLY 169 -0.15 SER 7
SER 168 0.22 VAL 171 -0.13 SER 7
ASP 167 0.18 HIS 172 -0.11 SER 7
GLU 81 0.15 THR 173 -0.10 SER 7
GLU 81 0.09 PHE 174 -0.06 SER 7
GLY 41 0.09 PRO 175 -0.05 ALA 9
GLY 41 0.11 ALA 176 -0.07 ALA 9
SER 84 0.14 VAL 177 -0.11 ALA 9
SER 112 0.19 LEU 178 -0.13 ALA 9
SER 112 0.20 GLN 179 -0.13 ALA 9
GLY 158 0.17 SER 180 -0.14 ALA 9
SER 112 0.16 ASP 183 -0.14 GLU 42
THR 180 0.12 LEU 184 -0.11 ALA 9
GLY 41 0.09 TYR 185 -0.10 ALA 9
GLY 41 0.10 THR 186 -0.07 ALA 9
GLY 41 0.10 LEU 187 -0.05 ALA 9
GLU 81 0.10 SER 188 -0.05 GLY 10
GLU 81 0.13 SER 189 -0.07 SER 7
SER 168 0.14 SER 190 -0.09 SER 7
LYS 169 0.18 VAL 191 -0.11 SER 7
ASP 170 0.19 THR 192 -0.11 SER 7
LYS 169 0.20 VAL 193 -0.12 SER 7
PRO 15 0.18 PRO 194 -0.12 LYS 75
PRO 15 0.15 SER 195 -0.10 LYS 75
GLY 16 0.17 SER 196 -0.12 LYS 75
GLY 16 0.18 PRO 198 -0.12 SER 7
LYS 169 0.15 ARG 199 -0.10 SER 7
LYS 169 0.14 PRO 200 -0.09 GLY 8
GLY 16 0.15 SER 202 -0.10 GLY 8
GLU 79 0.18 GLU 203 -0.11 GLY 8
GLU 79 0.17 THR 204 -0.12 GLY 8
GLU 81 0.17 VAL 205 -0.11 GLY 8
GLU 81 0.17 THR 206 -0.11 GLY 8
GLU 81 0.17 CYS 208 -0.11 GLY 10
GLY 57 0.18 ASN 209 -0.14 GLY 10
GLY 57 0.18 VAL 210 -0.15 GLY 10
SER 42 0.20 ALA 211 -0.17 GLY 10
GLN 105 0.19 HIS 212 -0.17 GLY 10
GLN 105 0.25 PRO 213 -0.25 GLY 10
VAL 5 0.24 ALA 214 -0.27 LEU 11
VAL 5 0.21 SER 215 -0.18 LYS 13
VAL 5 0.23 SER 216 -0.18 GLY 16
GLU 1 0.18 THR 217 -0.15 GLY 16
GLY 57 0.19 LYS 218 -0.15 GLY 16
GLY 57 0.17 VAL 219 -0.11 GLY 10
GLY 57 0.17 ASP 220 -0.12 GLY 10
PRO 59 0.14 LYS 221 -0.09 GLY 10
GLU 81 0.15 LYS 222 -0.09 GLY 10
GLU 81 0.13 ILE 223 -0.08 GLY 10
GLU 81 0.12 VAL 226 -0.07 GLY 10
LYS 169 0.11 PRO 227 -0.05 GLY 10
LYS 169 0.09 ARG 228 -0.04 GLY 10
LYS 169 0.08 ASP 232 -0.04 GLY 10
LYS 169 0.07 CYS 233 -0.03 GLY 10
LYS 454 0.09 SER 2 -0.11 GLU 85
LYS 199 0.07 VAL 3 -0.11 GLU 113
SER 5 0.10 LEU 4 -0.10 ASP 183
LEU 4 0.10 SER 5 -0.12 ASP 183
ALA 9 0.08 GLN 6 -0.11 SER 180
PRO 8 0.15 SER 7 -0.12 SER 180
SER 7 0.15 PRO 8 -0.13 SER 180
LEU 4 0.08 ALA 9 -0.14 SER 180
SER 167 0.09 ILE 10 -0.12 SER 180
SER 167 0.12 LEU 11 -0.11 ASN 157
SER 167 0.13 SER 12 -0.13 ASP 143
SER 168 0.16 ALA 13 -0.13 ASP 143
SER 168 0.19 SER 14 -0.15 ASP 143
SER 168 0.24 PRO 15 -0.11 LYS 199
SER 168 0.23 GLY 16 -0.11 LYS 199
SER 168 0.19 GLU 17 -0.11 ASP 143
SER 167 0.18 LYS 18 -0.09 ASP 143
SER 167 0.16 VAL 19 -0.08 ASN 157
SER 167 0.14 THR 20 -0.07 SER 180
SER 167 0.12 MET 21 -0.08 SER 180
SER 167 0.10 THR 22 -0.09 SER 180
SER 167 0.08 CYS 23 -0.09 SER 180
SER 167 0.07 ARG 24 -0.10 SER 180
LYS 454 0.07 ALA 25 -0.09 ASP 183
LYS 454 0.08 ARG 26 -0.11 GLU 113
LYS 454 0.08 SER 27 -0.10 GLU 113
ILE 421 0.06 SER 29 -0.08 GLU 113
GLY 164 0.06 VAL 30 -0.07 GLU 113
GLY 164 0.07 SER 31 -0.06 GLU 85
GLY 164 0.08 TYR 32 -0.05 GLU 85
GLY 164 0.08 MET 33 -0.05 SER 112
GLY 164 0.09 HIS 34 -0.04 SER 112
GLY 164 0.11 TRP 35 -0.04 GLU 1
THR 153 0.12 TYR 36 -0.06 GLU 1
GLY 164 0.15 GLN 37 -0.08 GLU 1
THR 153 0.15 GLN 38 -0.08 GLU 1
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THR 153 0.26 GLY 41 -0.12 ASP 167
THR 153 0.24 SER 42 -0.13 SER 168
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THR 153 0.15 PRO 44 -0.09 SER 168
THR 153 0.17 LYS 45 -0.11 SER 168
PRO 213 0.14 PRO 46 -0.09 SER 168
GLY 164 0.15 TRP 47 -0.07 ARG 108
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THR 153 0.05 TRP 91 -0.06 GLU 85
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SER 2 0.06 HIS 94 -0.07 GLU 85
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THR 97 0.08 PHE 98 -0.07 SER 112
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SER 167 0.10 THR 102 -0.09 SER 180
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SER 168 0.18 ILE 106 -0.12 ASP 143
SER 168 0.15 LYS 107 -0.16 ASP 143
SER 168 0.15 ARG 108 -0.19 ALA 80
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ASN 135 0.09 ALA 111 -0.14 GLU 1
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SER 180 0.07 PRO 120 -0.03 ALA 9
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SER 180 0.10 ALA 130 -0.05 ALA 9
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SER 84 0.10 CYS 134 -0.04 GLU 1
SER 84 0.08 PHE 135 -0.06 GLU 1
GLU 85 0.09 LEU 136 -0.08 GLU 1
GLU 42 0.07 ASN 137 -0.10 GLU 1
THR 192 0.10 ASN 138 -0.13 GLU 1
GLU 42 0.09 PHE 139 -0.12 GLU 1
GLU 42 0.10 TYR 140 -0.12 GLU 1
GLU 42 0.12 PRO 141 -0.13 LYS 107
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SER 84 0.15 VAL 146 -0.13 ASN 145
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SER 84 0.16 ARG 155 -0.09 SER 12
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SER 84 0.16 VAL 159 -0.09 SER 12
SER 84 0.16 LEU 160 -0.09 ALA 9
SER 84 0.16 ASN 161 -0.08 SER 12
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GLU 42 0.10 THR 164 -0.08 GLU 1
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SER 168 0.18 SER 171 -0.15 GLU 1
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GLU 42 0.09 SER 174 -0.09 GLU 1
GLU 85 0.10 MET 175 -0.06 GLU 1
SER 84 0.10 SER 176 -0.04 GLU 1
SER 84 0.13 SER 177 -0.06 SER 12
SER 84 0.12 THR 178 -0.06 SER 12
SER 180 0.13 LEU 179 -0.07 SER 12
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SER 180 0.16 LEU 181 -0.07 ALA 9
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GLU 113 0.09 ASN 190 -0.04 SER 12
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SER 180 0.06 GLU 213 -0.02 ARG 228
LYS 169 0.07 CYS 214 -0.03 ARG 228

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