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***  2J4W Structure of a Plasmodium vivax apical membrane antigen 1-Fab F8.12.19 complex  ***

LOGs for ID: 2608162333311823063

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2608162333311823063.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2608162333311823063.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2608162333311823063.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    461
            First residue number     =    421
            Last  residue number     =    214
            Number of atoms found    =   3610
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    86.663240 +/-    20.639141 From:    45.091000 To:   128.523000
 =    17.128571 +/-    11.760006 From:   -13.058000 To:    46.297000
 =    21.490309 +/-     9.099432 From:    -1.217000 To:    43.832000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.3120 % Filled.
 Pdbmat>      1355973  non-zero elements.
 Pdbmat>       148287 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.15 +/-     23.85
         Maximum number =    133
         Minimum number =      8

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.965740E+06
 Pdbmat> Larger element =  507.021    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
461 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2608162333311823063.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2608162333311823063.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608162333311823063.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3610 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   461 residues.
 Blocpdb>    27 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     28
 Blocpdb>    24 atoms in block      3
 Block first atom:     50
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     74
 Blocpdb>    22 atoms in block      5
 Block first atom:     97
 Blocpdb>    27 atoms in block      6
 Block first atom:    119
 Blocpdb>    23 atoms in block      7
 Block first atom:    146
 Blocpdb>    19 atoms in block      8
 Block first atom:    169
 Blocpdb>    31 atoms in block      9
 Block first atom:    188
 Blocpdb>    21 atoms in block     10
 Block first atom:    219
 Blocpdb>    22 atoms in block     11
 Block first atom:    240
 Blocpdb>     9 atoms in block     12
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    25 atoms in block     13
 Block first atom:    271
 Blocpdb>    24 atoms in block     14
 Block first atom:    296
 Blocpdb>    14 atoms in block     15
 Block first atom:    320
 Blocpdb>    19 atoms in block     16
 Block first atom:    334
 Blocpdb>    20 atoms in block     17
 Block first atom:    353
 Blocpdb>    18 atoms in block     18
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    23 atoms in block     19
 Block first atom:    391
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    21 atoms in block     21
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    25 atoms in block     22
 Block first atom:    451
 Blocpdb>    32 atoms in block     23
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    34 atoms in block     24
 Block first atom:    508
 Blocpdb>    27 atoms in block     25
 Block first atom:    542
 Blocpdb>    23 atoms in block     26
 Block first atom:    569
 Blocpdb>    28 atoms in block     27
 Block first atom:    592
 Blocpdb>    30 atoms in block     28
 Block first atom:    620
 Blocpdb>    20 atoms in block     29
 Block first atom:    650
 Blocpdb>    26 atoms in block     30
 Block first atom:    670
 Blocpdb>    25 atoms in block     31
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    31 atoms in block     32
 Block first atom:    721
 Blocpdb>    21 atoms in block     33
 Block first atom:    752
 Blocpdb>    24 atoms in block     34
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:    797
 Blocpdb>    25 atoms in block     36
 Block first atom:    823
 Blocpdb>    22 atoms in block     37
 Block first atom:    848
 Blocpdb>    24 atoms in block     38
 Block first atom:    870
 Blocpdb>    29 atoms in block     39
 Block first atom:    894
 Blocpdb>    43 atoms in block     40
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    24 atoms in block     41
 Block first atom:    966
 Blocpdb>    25 atoms in block     42
 Block first atom:    990
 Blocpdb>    23 atoms in block     43
 Block first atom:   1015
 Blocpdb>    23 atoms in block     44
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>    22 atoms in block     45
 Block first atom:   1061
 Blocpdb>    63 atoms in block     46
 Block first atom:   1083
 Blocpdb>    27 atoms in block     47
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:   1173
 Blocpdb>    21 atoms in block     49
 Block first atom:   1192
 Blocpdb>    20 atoms in block     50
 Block first atom:   1213
 Blocpdb>    23 atoms in block     51
 Block first atom:   1233
 Blocpdb>    20 atoms in block     52
 Block first atom:   1256
 Blocpdb>    26 atoms in block     53
 Block first atom:   1276
 Blocpdb>    20 atoms in block     54
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:   1322
 Blocpdb>     5 atoms in block     56
 Block first atom:   1337
 Blocpdb>    24 atoms in block     57
 Block first atom:   1342
 Blocpdb>    21 atoms in block     58
 Block first atom:   1366
 Blocpdb>    19 atoms in block     59
 Block first atom:   1387
 Blocpdb>    21 atoms in block     60
 Block first atom:   1406
 Blocpdb>    25 atoms in block     61
 Block first atom:   1427
 Blocpdb>    27 atoms in block     62
 Block first atom:   1452
 Blocpdb>    21 atoms in block     63
 Block first atom:   1479
 Blocpdb>     7 atoms in block     64
 Block first atom:   1500
 Blocpdb>    21 atoms in block     65
 Block first atom:   1507
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1528
 Blocpdb>    20 atoms in block     67
 Block first atom:   1546
 Blocpdb>    10 atoms in block     68
 Block first atom:   1566
 Blocpdb>    24 atoms in block     69
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    23 atoms in block     70
 Block first atom:   1600
 Blocpdb>    24 atoms in block     71
 Block first atom:   1623
 Blocpdb>     6 atoms in block     72
 Block first atom:   1647
 Blocpdb>    28 atoms in block     73
 Block first atom:   1653
 Blocpdb>    21 atoms in block     74
 Block first atom:   1681
 Blocpdb>    19 atoms in block     75
 Block first atom:   1702
 Blocpdb>    21 atoms in block     76
 Block first atom:   1721
 Blocpdb>    12 atoms in block     77
 Block first atom:   1742
 Blocpdb>    25 atoms in block     78
 Block first atom:   1754
 Blocpdb>    22 atoms in block     79
 Block first atom:   1779
 Blocpdb>    14 atoms in block     80
 Block first atom:   1801
 Blocpdb>    21 atoms in block     81
 Block first atom:   1815
 Blocpdb>    22 atoms in block     82
 Block first atom:   1836
 Blocpdb>    17 atoms in block     83
 Block first atom:   1858
 Blocpdb>    23 atoms in block     84
 Block first atom:   1875
 Blocpdb>    26 atoms in block     85
 Block first atom:   1898
 Blocpdb>     8 atoms in block     86
 Block first atom:   1924
 Blocpdb>    25 atoms in block     87
 Block first atom:   1932
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1957
 Blocpdb>    21 atoms in block     89
 Block first atom:   1972
 Blocpdb>    21 atoms in block     90
 Block first atom:   1993
 Blocpdb>    20 atoms in block     91
 Block first atom:   2014
 Blocpdb>    19 atoms in block     92
 Block first atom:   2034
 Blocpdb>    17 atoms in block     93
 Block first atom:   2053
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   2070
 Blocpdb>    22 atoms in block     95
 Block first atom:   2095
 Blocpdb>    22 atoms in block     96
 Block first atom:   2117
 Blocpdb>    17 atoms in block     97
 Block first atom:   2139
 Blocpdb>    19 atoms in block     98
 Block first atom:   2156
 Blocpdb>    30 atoms in block     99
 Block first atom:   2175
 Blocpdb>    35 atoms in block    100
 Block first atom:   2205
 Blocpdb>    24 atoms in block    101
 Block first atom:   2240
 Blocpdb>    16 atoms in block    102
 Block first atom:   2264
 Blocpdb>    23 atoms in block    103
 Block first atom:   2280
 Blocpdb>    38 atoms in block    104
 Block first atom:   2303
 Blocpdb>    18 atoms in block    105
 Block first atom:   2341
 Blocpdb>    21 atoms in block    106
 Block first atom:   2359
 Blocpdb>    17 atoms in block    107
 Block first atom:   2380
 Blocpdb>    23 atoms in block    108
 Block first atom:   2397
 Blocpdb>    21 atoms in block    109
 Block first atom:   2420
 Blocpdb>    16 atoms in block    110
 Block first atom:   2441
 Blocpdb>    17 atoms in block    111
 Block first atom:   2457
 Blocpdb>    26 atoms in block    112
 Block first atom:   2474
 Blocpdb>    21 atoms in block    113
 Block first atom:   2500
 Blocpdb>    33 atoms in block    114
 Block first atom:   2521
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   2554
 Blocpdb>    17 atoms in block    116
 Block first atom:   2576
 Blocpdb>    30 atoms in block    117
 Block first atom:   2593
 Blocpdb>    32 atoms in block    118
 Block first atom:   2623
 Blocpdb>    22 atoms in block    119
 Block first atom:   2655
 Blocpdb>    21 atoms in block    120
 Block first atom:   2677
 Blocpdb>    21 atoms in block    121
 Block first atom:   2698
 Blocpdb>    20 atoms in block    122
 Block first atom:   2719
 Blocpdb>    25 atoms in block    123
 Block first atom:   2739
 Blocpdb>    25 atoms in block    124
 Block first atom:   2764
 Blocpdb>    18 atoms in block    125
 Block first atom:   2789
 Blocpdb>    21 atoms in block    126
 Block first atom:   2807
 Blocpdb>    25 atoms in block    127
 Block first atom:   2828
 Blocpdb>    20 atoms in block    128
 Block first atom:   2853
 Blocpdb>    24 atoms in block    129
 Block first atom:   2873
 Blocpdb>    21 atoms in block    130
 Block first atom:   2897
 Blocpdb>    13 atoms in block    131
 Block first atom:   2918
 Blocpdb>    20 atoms in block    132
 Block first atom:   2931
 Blocpdb>    25 atoms in block    133
 Block first atom:   2951
 Blocpdb>    27 atoms in block    134
 Block first atom:   2976
 Blocpdb>    28 atoms in block    135
 Block first atom:   3003
 Blocpdb>    24 atoms in block    136
 Block first atom:   3031
 Blocpdb>    30 atoms in block    137
 Block first atom:   3055
 Blocpdb>    25 atoms in block    138
 Block first atom:   3085
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   3110
 Blocpdb>    28 atoms in block    140
 Block first atom:   3129
 Blocpdb>    19 atoms in block    141
 Block first atom:   3157
 Blocpdb>    28 atoms in block    142
 Block first atom:   3176
 Blocpdb>    24 atoms in block    143
 Block first atom:   3204
 Blocpdb>    23 atoms in block    144
 Block first atom:   3228
 Blocpdb>    21 atoms in block    145
 Block first atom:   3251
 Blocpdb>    26 atoms in block    146
 Block first atom:   3272
 Blocpdb>    19 atoms in block    147
 Block first atom:   3298
 Blocpdb>    23 atoms in block    148
 Block first atom:   3317
 Blocpdb>    24 atoms in block    149
 Block first atom:   3340
 Blocpdb>    30 atoms in block    150
 Block first atom:   3364
 Blocpdb>    29 atoms in block    151
 Block first atom:   3394
 Blocpdb>    25 atoms in block    152
 Block first atom:   3423
 Blocpdb>    20 atoms in block    153
 Block first atom:   3448
 Blocpdb>    26 atoms in block    154
 Block first atom:   3468
 Blocpdb>    20 atoms in block    155
 Block first atom:   3494
 Blocpdb>    21 atoms in block    156
 Block first atom:   3514
 Blocpdb>    22 atoms in block    157
 Block first atom:   3535
 Blocpdb>    30 atoms in block    158
 Block first atom:   3557
 Blocpdb>    24 atoms in block    159
 Block first atom:   3586

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     63 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1356132 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      10830

 Prepmat> Matrix trace    =    2965740.0000
 Prepmat> Last element read:   10830  10830       107.6879
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        11205 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3610
 RTB> Total mass =        3610.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3610
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  202590.4244
 RTB>     52155 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    52155
 Diagstd> Projected matrix trace =  202590.4244

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 202590.4244
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.3837016      1.1048931      2.1672458      2.6692335
      2.9124307      3.1416229      4.4026202      5.4063128      6.0409880
      6.6854863      7.1795387      7.8125612      8.9295666      9.3160793
     10.2490291     10.6106193     11.6329757     11.9132848     12.6063006
     13.5998600     14.5047451     15.3583466     15.7749332     16.3774194
     17.3811336     17.9127031     18.4210269     19.0138266     19.4771292
     19.9542088     20.4430417     21.4327495     21.8588173     22.4874698
     23.0289756     23.8908567     24.0656474     24.5579338     25.3407893
     25.8077713     26.3475853     26.4246853     27.4924390     28.0172485
     28.9891201     29.9185354     30.1301473     30.4762817     30.8273272
     31.5782467     31.6996344     32.3567375     33.1312974     33.7622118
     34.5086039     34.7892589     35.7913313     36.5108520     36.8296636
     37.0597458     38.1777334     38.8764421     39.4307139     39.6540118
     39.8747146     40.6893796     41.0884385     41.5278894     42.2897399
     43.3336222     43.7265753     44.3804925     45.3187392     45.7381558
     46.0435987     46.5085588     46.9919535     47.9264718     48.6367227
     48.8945675     49.3673080     49.8004181     50.1569290     51.2974625
     51.9032771     52.3862632     53.0975127     53.6008137     53.9609957
     54.5275523     54.8767447     55.4315502     55.9809634     56.2007188
     56.7561506     57.5458253     57.9338122     59.1898222     59.4498364
     60.0516406

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034318      0.0034323      0.0034330      0.0034335      0.0034338
      0.0034348     67.2654559    114.1446130    159.8635166    177.4142766
    185.3203365    192.4741040    227.8509742    252.4909777    266.9004259
    280.7771622    290.9668762    303.5232734    324.4968383    331.4453020
    347.6455256    353.7249113    370.3741702    374.8098906    385.5574592
    400.4630940    413.5712407    425.5665769    431.2995889    439.4586479
    452.7248458    459.5955813    466.0711263    473.5109702    479.2451790
    485.0790704    490.9847885    502.7293310    507.7016916    514.9506095
    521.1138189    530.7758351    532.7139320    538.1349420    546.6449607
    551.6587751    557.3983643    558.2133165    569.3796160    574.7884355
    584.6726742    593.9712780    596.0681374    599.4821688    602.9248950
    610.2240037    611.3957377    617.7000594    625.0496289    630.9729263
    637.9093605    640.4981344    649.6571266    656.1547305    659.0132649
    661.0685535    670.9657485    677.0777412    681.8872977    683.8153510
    685.7156704    692.6850493    696.0734974    699.7859356    706.1757299
    714.8382398    718.0720332    723.4213788    731.0282996    734.4032755
    736.8513955    740.5625072    744.4011404    751.7665702    757.3165220
    759.3213038    762.9832484    766.3228490    769.0609306    777.7557341
    782.3348375    785.9664186    791.2839719    795.0253406    797.6920388
    801.8687374    804.4322080    808.4883986    812.4852107    814.0783692
    818.0912477    823.7628303    826.5351624    835.4467965    837.2797975
    841.5069725

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3610
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9876E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9901E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9944E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9973E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3837    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.105    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.167    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.669    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.912    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.142    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.403    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.406    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.041    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.685    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.180    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.813    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.930    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.316    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.05    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004
 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003
 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00005 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00005 1.00002 1.00002
 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    64980 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004
 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003
 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00005 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00005 1.00002 1.00002
 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608162333311823063.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608162333311823063.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2608162333311823063.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608162333311823063.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    461
            First residue number     =    421
            Last  residue number     =    214
            Number of atoms found    =   3610
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9876E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9901E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9944E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9973E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3837    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.105    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.167    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.669    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.912    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.142    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.403    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.406    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.041    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.685    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.180    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.813    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.930    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.316    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.05    

 Bfactors>  106 vectors,  10830 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.383700
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.752 for    471 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.037 +/-   0.03
 Bfactors> =     41.794 +/-  14.18
 Bfactors> Shiftng-fct=     41.757
 Bfactors> Scaling-fct=    417.229

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608162333311823063.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608162333311823063.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4317E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   640.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   656.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   659.0    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   699.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   706.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   714.8    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   723.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   731.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   744.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   751.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   757.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   759.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   763.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   769.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   782.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   786.0    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   797.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   804.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   814.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   823.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   826.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   835.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   841.5    

 Chkmod>  106 vectors,  10830 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3610 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    71 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7872
      0.0034      0.7837
      0.0034      0.7953
      0.0034      0.9762
      0.0034      0.6793
      0.0034      0.7264
     67.2624      0.6856
    114.1452      0.6930
    159.8476      0.6811
    177.3989      0.7150
    185.2987      0.6514
    192.4774      0.3081
    227.8510      0.1675
    252.4728      0.4613
    266.8892      0.0066
    280.7549      0.2014
    290.9637      0.4963
    303.5188      0.4115
    324.4908      0.4912
    331.4297      0.3238
    347.6471      0.3391
    353.6994      0.3638
    370.3109      0.2231
    374.7421      0.0349
    385.5975      0.3319
    400.4480      0.5814
    413.4858      0.4617
    425.5712      0.2760
    431.2136      0.3297
    439.4744      0.1687
    452.6906      0.5284
    459.5412      0.3665
    466.0381      0.3836
    473.4430      0.3780
    479.2599      0.2190
    485.0071      0.1576
    490.9272      0.2752
    502.6755      0.3219
    507.6936      0.4896
    514.9575      0.3104
    521.1030      0.4264
    530.7435      0.2230
    532.7392      0.3802
    538.1345      0.2879
    546.6130      0.2987
    551.6589      0.2964
    557.4000      0.3403
    558.1399      0.3775
    569.3299      0.3855
    574.7920      0.3531
    584.6564      0.3261
    593.9603      0.3802
    596.0411      0.3293
    599.4930      0.3157
    602.9251      0.3249
    610.2147      0.2175
    611.3730      0.1887
    617.7047      0.2151
    625.0106      0.2250
    630.9252      0.3736
    637.8949      0.2915
    640.4775      0.2903
    649.6172      0.3582
    656.1189      0.3388
    658.9880      0.3611
    661.0424      0.2000
    670.9569      0.2537
    677.0797      0.2971
    681.8519      0.3063
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    685.6457      0.1418
    692.6606      0.3175
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    699.7737      0.3192
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    714.7777      0.4079
    718.0693      0.3962
    723.3863      0.1969
    731.0071      0.4427
    734.3866      0.4641
    736.7910      0.3294
    740.5422      0.3174
    744.3537      0.4128
    751.7620      0.4588
    757.3095      0.4666
    759.2532      0.2813
    762.9713      0.5181
    766.2867      0.4006
    769.0515      0.3388
    777.7416      0.4360
    782.2766      0.3588
    785.9607      0.3412
    791.2685      0.3086
    794.9852      0.3890
    797.6504      0.4918
    801.8523      0.5378
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    818.0839      0.3633
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    826.4725      0.3770
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    837.2450      0.3544
    841.4594      0.2998
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608162333311823063 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608162333311823063.eigenfacs
2608162333311823063.atom
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making animated gif 300x300
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real	0m16.657s
user	0m16.533s
sys	0m0.115s
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