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LOGs for ID: 2608180245462149670

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608180245462149670.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608180245462149670.atom to be opened. Openam> File opened: 2608180245462149670.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 526 First residue number = 1 Last residue number = 526 Number of atoms found = 4230 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.124027 +/- 20.951212 From: -48.393000 To: 45.095000 = -1.474059 +/- 18.063980 From: -39.777000 To: 41.473000 = 1.927653 +/- 14.112215 From: -31.929000 To: 33.429000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9587 % Filled. Pdbmat> 1577195 non-zero elements. Pdbmat> 172450 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.54 +/- 22.75 Maximum number = 134 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 3.449000E+06 Pdbmat> Larger element = 501.866 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 526 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608180245462149670.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608180245462149670.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608180245462149670.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4230 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 526 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 26 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 25 atoms in block 3 Block first atom: 50 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 75 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 97 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 30 atoms in block 7 Block first atom: 146 Blocpdb> 30 atoms in block 8 Block first atom: 176 Blocpdb> 21 atoms in block 9 Block first atom: 206 Blocpdb> 29 atoms in block 10 Block first atom: 227 Blocpdb> 34 atoms in block 11 Block first atom: 256 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 290 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 312 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 338 Blocpdb> 29 atoms in block 15 Block first atom: 360 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 389 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 411 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 434 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 454 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 474 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 499 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 523 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 545 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 567 Blocpdb> 26 atoms in block 25 Block first atom: 591 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 617 Blocpdb> 30 atoms in block 27 Block first atom: 641 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 671 Blocpdb> 21 atoms in block 29 Block first atom: 687 Blocpdb> 21 atoms in block 30 Block first atom: 708 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 729 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 753 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 777 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 799 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 820 Blocpdb> 27 atoms in block 36 Block first atom: 840 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 867 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 886 Blocpdb> 25 atoms in block 39 Block first atom: 910 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 935 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 962 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 988 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 1007 Blocpdb> 29 atoms in block 44 Block first atom: 1033 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1062 Blocpdb> 20 atoms in block 46 Block first atom: 1082 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 1102 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1121 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1144 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1165 Blocpdb> 29 atoms in block 51 Block first atom: 1186 Blocpdb> 26 atoms in block 52 Block first atom: 1215 Blocpdb> 26 atoms in block 53 Block first atom: 1241 Blocpdb> 21 atoms in block 54 Block first atom: 1267 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1288 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 1308 Blocpdb> 26 atoms in block 57 Block first atom: 1327 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1353 Blocpdb> 24 atoms in block 59 Block first atom: 1381 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1405 Blocpdb> 28 atoms in block 61 Block first atom: 1428 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1456 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1479 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1501 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1527 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1547 Blocpdb> 29 atoms in block 67 Block first atom: 1569 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1598 Blocpdb> 27 atoms in block 69 Block first atom: 1622 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1649 Blocpdb> 23 atoms in block 71 Block first atom: 1671 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 1694 Blocpdb> 21 atoms in block 73 Block first atom: 1721 Blocpdb> 28 atoms in block 74 Block first atom: 1742 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 1770 Blocpdb> 25 atoms in block 76 Block first atom: 1796 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 1821 Blocpdb> 26 atoms in block 78 Block first atom: 1846 Blocpdb> 27 atoms in block 79 Block first atom: 1872 Blocpdb> 21 atoms in block 80 Block first atom: 1899 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1920 Blocpdb> 21 atoms in block 82 Block first atom: 1943 Blocpdb> 28 atoms in block 83 Block first atom: 1964 Blocpdb> 28 atoms in block 84 Block first atom: 1992 Blocpdb> 23 atoms in block 85 Block first atom: 2020 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 2043 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2060 Blocpdb> 26 atoms in block 88 Block first atom: 2087 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2113 Blocpdb> 26 atoms in block 90 Block first atom: 2135 Blocpdb> 26 atoms in block 91 Block first atom: 2161 Blocpdb> 26 atoms in block 92 Block first atom: 2187 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 2213 Blocpdb> 24 atoms in block 94 Block first atom: 2238 Blocpdb> 24 atoms in block 95 Block first atom: 2262 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2286 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2308 Blocpdb> 32 atoms in block 98 Block first atom: 2336 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 2368 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 2396 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2418 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2462 Blocpdb> 33 atoms in block 104 Block first atom: 2487 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2520 Blocpdb> 27 atoms in block 106 Block first atom: 2541 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2568 Blocpdb> 29 atoms in block 108 Block first atom: 2593 Blocpdb> 18 atoms in block 109 Block first atom: 2622 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2640 Blocpdb> 23 atoms in block 111 Block first atom: 2667 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2690 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 2715 Blocpdb> 26 atoms in block 114 Block first atom: 2739 Blocpdb> 29 atoms in block 115 Block first atom: 2765 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2794 Blocpdb> 25 atoms in block 117 Block first atom: 2813 Blocpdb> 28 atoms in block 118 Block first atom: 2838 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 2866 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 2894 Blocpdb> 26 atoms in block 121 Block first atom: 2917 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 2943 Blocpdb> 29 atoms in block 123 Block first atom: 2963 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2992 Blocpdb> 21 atoms in block 125 Block first atom: 3019 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 3040 Blocpdb> 27 atoms in block 127 Block first atom: 3062 Blocpdb> 25 atoms in block 128 Block first atom: 3089 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 3114 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 3138 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3165 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 3187 Blocpdb> 28 atoms in block 133 Block first atom: 3213 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3241 Blocpdb> 25 atoms in block 135 Block first atom: 3263 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 3288 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3313 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 3337 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3356 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 3376 Blocpdb> 20 atoms in block 141 Block first atom: 3396 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3416 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3442 Blocpdb> 24 atoms in block 144 Block first atom: 3464 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3488 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3516 Blocpdb> 25 atoms in block 147 Block first atom: 3536 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 3561 Blocpdb> 25 atoms in block 149 Block first atom: 3581 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 3606 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3630 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 3653 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3674 Blocpdb> 25 atoms in block 154 Block first atom: 3696 Blocpdb> 27 atoms in block 155 Block first atom: 3721 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 3748 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 158 Block first atom: 3794 Blocpdb> 24 atoms in block 159 Block first atom: 3820 Blocpdb> 21 atoms in block 160 Block first atom: 3844 Blocpdb> 23 atoms in block 161 Block first atom: 3865 Blocpdb> 26 atoms in block 162 Block first atom: 3888 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3914 Blocpdb> 20 atoms in block 164 Block first atom: 3940 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 3960 Blocpdb> 19 atoms in block 166 Block first atom: 3985 Blocpdb> 25 atoms in block 167 Block first atom: 4004 Blocpdb> 30 atoms in block 168 Block first atom: 4029 Blocpdb> 21 atoms in block 169 Block first atom: 4059 Blocpdb> 20 atoms in block 170 Block first atom: 4080 Blocpdb> 26 atoms in block 171 Block first atom: 4100 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 4126 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 4151 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 4173 Blocpdb> 21 atoms in block 175 Block first atom: 4201 Blocpdb> 9 atoms in block 176 Block first atom: 4221 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1577371 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12690 Prepmat> Matrix trace = 3449000.0000 Prepmat> Last element read: 12690 12690 56.4467 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13893 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4230 RTB> Total mass = 4230.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4230 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 223775.1892 RTB> 57948 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57948 Diagstd> Projected matrix trace = 223775.1892 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 223775.1892 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1154352 0.2959336 0.4194896 0.7855273 0.9819085 1.4100718 1.8020418 1.8845743 2.6880256 2.9344110 3.0494026 3.4783754 3.7809070 4.6113663 4.9304889 5.3871461 6.2150247 7.2160878 7.6519579 8.5793409 9.1840045 10.1898169 10.9786211 11.0956971 11.2038872 12.1166935 12.1881910 12.7966918 12.9249203 13.4099267 14.1622585 14.3178480 15.2823599 15.9170856 16.5795835 18.0303160 18.5989874 19.0983937 19.6561038 20.0570964 20.6356620 20.8247529 21.9637320 22.3976954 23.0831689 23.5325469 24.0454800 24.7350663 25.9445470 26.1462127 26.6008820 27.0534194 27.9053591 28.2667779 29.4187690 29.9670879 31.0817085 31.4935847 31.7612644 32.0913999 33.0074497 33.2883420 34.0526376 34.6924055 35.0328197 35.5417334 36.3724598 37.6154344 37.7826966 38.1175160 38.2835545 38.7154227 39.2211683 39.9238397 40.1934268 40.6773418 41.2940284 41.6034635 41.7893623 42.2440397 42.6122229 43.9340451 44.7047668 44.8787111 45.4237660 46.1409405 46.5462663 47.8679542 48.0212499 48.6176146 49.0715636 49.3488739 49.5988082 50.7360082 50.9742744 51.2974931 52.1589300 52.7962025 53.3699188 53.8522815 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034334 0.0034336 0.0034339 0.0034348 0.0034350 36.8947403 59.0734566 70.3324716 96.2444999 107.6045893 128.9483821 145.7732081 149.0740017 178.0377007 186.0183340 189.6280865 202.5272681 211.1510667 233.1900893 241.1239080 252.0430101 270.7177367 291.7065524 300.3872992 318.0696581 329.0874525 346.6398351 359.8066448 361.7200449 363.4792678 377.9961203 379.1097076 388.4580582 390.3994677 397.6568623 408.6594435 410.8981191 424.5125092 433.2385132 442.1626842 461.1019403 468.3170084 474.5628104 481.4420272 486.3280416 493.2924671 495.5474081 508.9186285 513.9216901 521.7266181 526.7805691 532.4906739 540.0721960 553.1186812 555.2642016 560.0712742 564.8151832 573.6395522 577.3423737 588.9894667 594.4530387 605.4073959 609.4054427 611.9897834 615.1621576 623.8802896 626.5292665 633.6809601 639.6059380 642.7362983 647.3879071 654.9099918 666.0062750 667.4853767 670.4363856 671.8949965 675.6741172 680.0730164 686.1379359 688.4506237 692.5825780 697.8127598 700.4223959 701.9855176 705.7940634 708.8631096 719.7735383 726.0594749 727.4706365 731.8748938 737.6298816 740.8626575 751.3074813 752.5095404 757.1677426 760.6944161 762.8407841 764.7701014 773.4877281 775.3018253 777.7559657 784.2591907 789.0356456 793.3111373 796.8880864 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4230 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1154 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7855 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.930 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.579 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.184 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.85 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 76140 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608180245462149670.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608180245462149670.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608180245462149670.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608180245462149670.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 526 First residue number = 1 Last residue number = 526 Number of atoms found = 4230 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1154 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.930 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.579 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.184 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.85 Bfactors> 106 vectors, 12690 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.115400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.237 for 526 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.084 +/- 0.11 Bfactors> = 92.590 +/- 9.51 Bfactors> Shiftng-fct= 92.505 Bfactors> Scaling-fct= 87.941 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608180245462149670.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608180245462149670.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2608180245462149670 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom making animated gifs 11 models are in 2608180245462149670.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608180245462149670.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608180245462149670.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2608180245462149670 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608180245462149670.eigenfacs 2608180245462149670.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608180245462149670.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2608180245462149670.10.pdb 2608180245462149670.11.pdb 2608180245462149670.7.pdb 2608180245462149670.8.pdb 2608180245462149670.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.774s user 0m22.618s sys 0m0.141s rm: cannot remove '2608180245462149670.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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