CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  legionella_normal_mode_analysis  ***

CA distance fluctuations for 2609211528292946550

---  normal mode 9  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ARG 131 0.09 MET 1 -1.29 ASN 299
LYS 142 0.22 GLU 2 -0.82 ASN 299
THR 309 0.24 ASN 3 -0.43 HIS 301
LYS 285 0.17 ASP 4 -0.47 GLU 303
GLU 146 0.21 MET 5 -0.22 GLU 303
SER 287 0.10 PRO 6 -0.16 ASN 174
VAL 304 0.11 LYS 7 -0.20 ASN 174
LYS 145 0.13 THR 8 -0.13 THR 309
GLU 303 0.09 LYS 9 -0.23 MET 1
MET 5 0.07 TYR 10 -0.22 MET 1
LYS 306 0.10 ALA 11 -0.28 MET 1
LYS 306 0.05 LEU 12 -0.33 MET 1
GLU 322 0.05 PRO 13 -0.35 MET 1
GLU 322 0.04 PRO 14 -0.27 MET 1
GLU 322 0.03 VAL 15 -0.32 MET 1
GLU 322 0.03 VAL 16 -0.29 MET 1
GLU 322 0.02 LEU 17 -0.31 MET 1
GLU 322 0.03 PHE 18 -0.29 MET 1
ALA 190 0.01 GLU 19 -0.28 MET 1
ALA 190 0.02 SER 20 -0.27 MET 1
GLN 189 0.02 HIS 21 -0.23 MET 1
SER 93 0.02 ALA 22 -0.24 MET 1
LEU 79 0.03 ASP 23 -0.29 MET 1
LEU 79 0.07 ARG 24 -0.30 MET 1
LEU 79 0.07 SER 25 -0.35 MET 1
LEU 79 0.04 THR 26 -0.33 MET 1
LEU 79 0.06 SER 27 -0.29 MET 1
LEU 79 0.09 ASP 28 -0.33 MET 1
LEU 79 0.08 PHE 29 -0.38 MET 1
LEU 79 0.06 LEU 30 -0.34 MET 1
LEU 79 0.08 ILE 31 -0.32 MET 1
LEU 79 0.10 LYS 32 -0.37 MET 1
LEU 79 0.07 GLN 33 -0.39 MET 1
THR 309 0.08 LEU 34 -0.32 MET 1
THR 309 0.09 PRO 35 -0.34 MET 1
THR 309 0.07 ASP 36 -0.39 MET 1
LYS 308 0.08 LEU 37 -0.35 MET 1
THR 309 0.11 LYS 38 -0.29 MET 1
THR 309 0.11 LYS 39 -0.34 MET 1
THR 309 0.09 ALA 40 -0.37 MET 1
LYS 308 0.13 GLY 41 -0.28 MET 1
LYS 308 0.11 TYR 42 -0.25 MET 1
LYS 308 0.13 THR 43 -0.18 MET 1
LYS 308 0.10 THR 44 -0.15 MET 1
LYS 308 0.07 ILE 45 -0.17 MET 1
MET 5 0.06 CYS 46 -0.13 MET 1
MET 5 0.04 VAL 47 -0.14 MET 1
MET 5 0.03 ASP 48 -0.12 GLU 83
MET 5 0.04 GLY 49 -0.13 GLU 83
MET 5 0.07 MET 50 -0.10 GLU 83
GLU 2 0.13 GLU 51 -0.11 GLU 83
GLU 2 0.17 PRO 52 -0.09 GLU 83
GLU 2 0.17 CYS 53 -0.07 GLU 83
GLU 2 0.12 ALA 54 -0.07 GLU 83
MET 5 0.11 SER 55 -0.06 GLU 83
MET 5 0.09 LEU 56 -0.09 MET 1
THR 309 0.09 GLU 57 -0.08 MET 1
MET 5 0.09 GLU 58 -0.06 MET 1
MET 5 0.07 ASN 59 -0.09 MET 1
THR 309 0.07 ILE 60 -0.12 MET 1
THR 309 0.07 SER 61 -0.10 MET 1
MET 5 0.06 MET 62 -0.09 MET 1
THR 309 0.05 MET 63 -0.13 MET 1
THR 309 0.06 LYS 64 -0.13 MET 1
THR 309 0.05 ILE 65 -0.11 MET 1
THR 309 0.03 LEU 66 -0.12 MET 1
VAL 71 0.04 ILE 67 -0.16 MET 1
THR 309 0.05 GLN 68 -0.14 MET 1
GLN 68 0.03 ILE 69 -0.13 MET 1
ASP 99 0.03 GLN 70 -0.16 MET 1
ASP 99 0.07 VAL 71 -0.17 MET 1
GLU 106 0.05 LYS 72 -0.15 MET 1
ASP 99 0.03 LYS 73 -0.17 LEU 122
ASP 99 0.06 LEU 74 -0.18 MET 1
ASP 99 0.08 SER 75 -0.17 MET 1
ASP 99 0.06 GLU 76 -0.16 LEU 122
LYS 32 0.06 LEU 77 -0.18 LYS 125
SER 217 0.08 PRO 78 -0.19 MET 1
SER 217 0.10 LEU 79 -0.21 MET 1
SER 217 0.10 GLU 80 -0.22 MET 1
ASP 185 0.08 HIS 81 -0.22 LYS 125
ASP 185 0.09 PRO 82 -0.24 LYS 125
ASP 185 0.06 GLU 83 -0.24 LYS 125
ASP 185 0.06 TYR 84 -0.21 MET 1
ASP 185 0.09 ALA 85 -0.23 MET 1
ASP 185 0.06 GLN 86 -0.22 MET 1
ASP 185 0.03 GLY 87 -0.20 MET 1
ARG 92 0.06 VAL 88 -0.22 MET 1
ASN 186 0.04 GLU 89 -0.23 MET 1
ASP 185 0.01 LYS 90 -0.20 MET 1
LEU 79 0.04 LEU 91 -0.20 MET 1
VAL 88 0.06 ARG 92 -0.23 MET 1
LYS 308 0.02 SER 93 -0.22 MET 1
LYS 308 0.03 VAL 94 -0.18 MET 1
LEU 79 0.08 VAL 95 -0.21 MET 1
LEU 79 0.07 ALA 96 -0.24 MET 1
LYS 308 0.05 LYS 97 -0.20 MET 1
LEU 79 0.06 LEU 98 -0.18 MET 1
LEU 79 0.09 ASP 99 -0.23 MET 1
LEU 79 0.06 LEU 100 -0.23 MET 1
THR 309 0.07 PHE 101 -0.18 MET 1
THR 309 0.08 GLU 102 -0.19 MET 1
LEU 79 0.08 ALA 103 -0.24 MET 1
THR 309 0.09 MET 104 -0.20 MET 1
THR 309 0.10 LYS 105 -0.17 MET 1
THR 309 0.10 GLU 106 -0.21 MET 1
THR 309 0.11 GLN 107 -0.23 MET 1
THR 309 0.13 GLY 108 -0.17 MET 1
THR 309 0.11 PHE 109 -0.17 MET 1
THR 309 0.11 LYS 110 -0.11 MET 1
MET 5 0.10 LEU 111 -0.10 MET 1
MET 5 0.11 GLY 112 -0.07 GLU 83
GLU 2 0.10 GLY 113 -0.08 GLU 83
GLU 2 0.11 ILE 114 -0.10 GLU 83
GLU 2 0.10 ASP 115 -0.13 GLU 83
GLU 2 0.14 LEU 116 -0.14 GLU 83
GLU 2 0.14 PRO 117 -0.14 GLU 83
GLU 2 0.10 VAL 118 -0.16 GLU 83
GLU 2 0.13 SER 119 -0.17 GLU 83
GLU 2 0.15 GLU 120 -0.17 GLU 83
GLU 2 0.10 GLN 121 -0.19 GLU 83
GLU 2 0.09 LEU 122 -0.23 GLU 83
GLU 2 0.12 LYS 123 -0.21 GLU 83
GLU 2 0.10 GLU 124 -0.22 GLU 83
GLU 2 0.07 LYS 125 -0.24 PRO 82
GLU 322 0.04 SER 126 -0.24 PRO 82
GLU 322 0.03 LEU 127 -0.22 GLU 83
GLU 322 0.04 ASN 128 -0.19 GLU 83
GLU 2 0.07 SER 129 -0.19 PRO 82
GLU 2 0.10 ILE 130 -0.16 PRO 82
GLU 2 0.16 ARG 131 -0.16 GLU 83
GLU 2 0.11 ARG 132 -0.16 GLU 83
GLU 2 0.08 GLU 133 -0.15 GLU 83
GLU 2 0.15 GLN 134 -0.13 GLU 83
GLU 2 0.17 THR 135 -0.13 GLU 83
GLU 2 0.10 ILE 136 -0.12 GLU 83
GLU 2 0.11 THR 137 -0.11 GLU 83
GLU 2 0.21 ASP 138 -0.10 GLU 83
GLU 2 0.18 ASN 139 -0.10 GLU 83
GLU 2 0.10 THR 140 -0.09 GLU 83
GLU 2 0.16 LEU 141 -0.08 GLU 83
GLU 2 0.22 LYS 142 -0.08 GLU 83
MET 5 0.15 HIS 143 -0.07 PRO 238
MET 5 0.13 VAL 144 -0.08 MET 1
MET 5 0.21 LYS 145 -0.09 PRO 238
MET 5 0.21 GLU 146 -0.10 PRO 238
MET 5 0.15 ASN 147 -0.10 PRO 238
MET 5 0.16 ASP 148 -0.12 MET 1
MET 5 0.08 GLY 149 -0.19 MET 1
LYS 308 0.09 GLY 150 -0.22 MET 1
LYS 308 0.07 VAL 151 -0.20 MET 1
LYS 308 0.05 VAL 152 -0.24 MET 1
LYS 308 0.03 VAL 153 -0.20 MET 1
LYS 308 0.03 VAL 154 -0.22 MET 1
GLU 322 0.02 LEU 155 -0.19 MET 1
GLU 322 0.02 GLY 156 -0.20 MET 1
GLU 322 0.03 PHE 157 -0.25 MET 1
GLU 322 0.04 GLY 158 -0.19 MET 1
GLU 322 0.05 HIS 159 -0.15 MET 1
GLU 322 0.06 CYS 160 -0.18 MET 1
GLU 322 0.06 ILE 161 -0.14 PRO 82
GLU 322 0.06 PHE 162 -0.12 GLU 83
GLU 322 0.07 GLN 163 -0.17 MET 1
GLU 322 0.08 GLN 164 -0.13 ASP 4
GLU 322 0.08 MET 165 -0.11 PRO 82
GLU 322 0.08 ILE 166 -0.10 GLU 83
GLU 322 0.10 LYS 167 -0.14 ASP 4
GLU 322 0.09 GLU 168 -0.11 THR 309
GLU 2 0.18 GLN 169 -0.10 THR 309
GLU 2 0.11 ASP 170 -0.11 THR 309
HIS 301 0.11 GLU 171 -0.14 THR 309
HIS 301 0.10 ASN 172 -0.15 MET 1
GLU 322 0.09 ALA 173 -0.19 MET 1
GLU 322 0.11 ASN 174 -0.35 MET 1
GLU 322 0.09 GLN 175 -0.37 MET 1
GLU 322 0.07 TYR 176 -0.33 MET 1
GLU 322 0.06 LEU 177 -0.42 MET 1
GLU 322 0.06 TRP 178 -0.39 MET 1
PRO 321 0.04 TYR 179 -0.41 MET 1
PRO 321 0.03 HIS 180 -0.38 MET 1
LEU 79 0.03 VAL 181 -0.40 MET 1
LEU 79 0.03 HIS 182 -0.38 MET 1
GLU 80 0.06 ASN 183 -0.38 MET 1
GLU 80 0.05 PRO 184 -0.38 MET 1
GLU 80 0.09 ASP 185 -0.35 MET 1
ALA 85 0.06 ASN 186 -0.31 MET 1
GLU 242 0.02 GLU 187 -0.31 MET 1
PRO 321 0.01 THR 188 -0.26 MET 1
PRO 321 0.02 GLN 189 -0.25 MET 1
PRO 321 0.02 ALA 190 -0.23 PRO 82
PRO 321 0.03 TYR 191 -0.26 MET 1
PRO 321 0.03 LYS 192 -0.29 MET 1
PRO 321 0.04 GLU 193 -0.25 MET 1
PRO 321 0.04 LEU 194 -0.24 MET 1
PRO 321 0.04 VAL 195 -0.31 MET 1
PRO 321 0.05 GLU 196 -0.30 MET 1
PRO 321 0.05 SER 197 -0.25 MET 1
PRO 321 0.06 TYR 198 -0.29 MET 1
PRO 321 0.07 THR 199 -0.35 MET 1
PRO 321 0.07 LYS 200 -0.31 MET 1
GLU 322 0.07 LYS 201 -0.29 GLU 2
PRO 321 0.08 GLY 202 -0.35 MET 1
GLU 322 0.08 LEU 203 -0.36 MET 1
GLU 322 0.10 SER 204 -0.36 MET 1
GLU 322 0.09 THR 205 -0.27 ASN 3
GLU 322 0.08 TYR 206 -0.24 MET 1
GLU 322 0.08 PHE 207 -0.30 MET 1
GLU 322 0.10 PRO 208 -0.29 MET 1
GLU 322 0.11 LEU 209 -0.36 MET 1
GLU 322 0.09 GLY 210 -0.43 MET 1
PRO 321 0.07 VAL 211 -0.43 MET 1
PRO 321 0.06 ASN 212 -0.50 MET 1
PRO 321 0.04 ILE 213 -0.47 MET 1
LEU 79 0.03 PHE 214 -0.49 MET 1
LEU 79 0.05 LYS 215 -0.46 MET 1
LEU 79 0.08 SER 216 -0.44 MET 1
LEU 79 0.10 SER 217 -0.47 MET 1
LEU 79 0.08 ASP 218 -0.53 MET 1
LEU 79 0.08 LYS 219 -0.57 MET 1
LEU 79 0.07 GLU 220 -0.62 MET 1
LEU 79 0.06 LEU 221 -0.55 MET 1
LEU 79 0.07 ASP 222 -0.54 MET 1
HIS 267 0.06 THR 223 -0.62 MET 1
HIS 267 0.05 ASP 224 -0.64 MET 1
LEU 79 0.04 PHE 225 -0.55 MET 1
ASP 264 0.05 TRP 226 -0.57 MET 1
HIS 267 0.06 ASN 227 -0.67 MET 1
GLU 320 0.06 LYS 228 -0.62 MET 1
LEU 177 0.03 VAL 229 -0.52 MET 1
ASN 174 0.04 SER 230 -0.59 MET 1
GLU 320 0.09 ALA 231 -0.67 MET 1
GLU 322 0.07 ASN 232 -0.54 MET 1
GLU 322 0.03 CYS 233 -0.48 MET 1
GLY 41 0.04 TYR 234 -0.42 MET 1
LYS 310 0.08 ASN 235 -0.36 MET 1
LYS 310 0.08 TYR 236 -0.38 MET 1
THR 277 0.08 ASP 237 -0.36 MET 1
THR 277 0.10 PRO 238 -0.30 MET 1
THR 277 0.07 LYS 239 -0.34 MET 1
THR 277 0.06 ALA 240 -0.39 MET 1
HIS 267 0.06 LEU 241 -0.45 MET 1
HIS 267 0.06 GLU 242 -0.47 MET 1
LEU 79 0.05 THR 243 -0.55 MET 1
LEU 79 0.05 SER 244 -0.59 MET 1
ASN 174 0.04 THR 245 -0.66 MET 1
LEU 79 0.04 ALA 246 -0.58 MET 1
LEU 79 0.04 SER 247 -0.54 MET 1
LEU 79 0.03 ILE 248 -0.62 MET 1
LEU 79 0.03 LEU 249 -0.63 MET 1
LEU 79 0.03 LYS 250 -0.51 MET 1
LEU 79 0.03 SER 251 -0.51 MET 1
LYS 7 0.03 LEU 252 -0.58 MET 1
LYS 7 0.03 VAL 253 -0.53 MET 1
PRO 238 0.03 GLY 254 -0.42 MET 1
PRO 238 0.04 PRO 255 -0.37 MET 1
PRO 238 0.06 GLU 256 -0.35 MET 1
PRO 238 0.03 VAL 257 -0.46 MET 1
LEU 261 0.04 THR 258 -0.44 MET 1
LEU 79 0.04 ALA 259 -0.50 MET 1
LEU 261 0.07 HIS 260 -0.47 MET 1
HIS 260 0.07 LEU 261 -0.49 MET 1
LEU 79 0.05 ARG 262 -0.49 MET 1
LYS 310 0.07 THR 263 -0.42 MET 1
LEU 79 0.05 ASP 264 -0.48 MET 1
LYS 239 0.07 GLY 265 -0.49 MET 1
LYS 239 0.06 GLN 266 -0.58 MET 1
LEU 241 0.06 HIS 267 -0.56 MET 1
ALA 231 0.06 HIS 268 -0.63 MET 1
ALA 231 0.05 VAL 269 -0.60 MET 1
LEU 79 0.03 ASP 270 -0.62 MET 1
LEU 79 0.03 ALA 271 -0.60 MET 1
ILE 273 0.05 LEU 272 -0.49 MET 1
PRO 238 0.06 ILE 273 -0.42 MET 1
PRO 238 0.09 SER 274 -0.28 MET 1
ASN 3 0.10 LEU 275 -0.22 MET 1
ASN 3 0.22 GLU 276 -0.08 MET 1
ASN 3 0.15 THR 277 -0.15 MET 1
ASN 3 0.10 VAL 278 -0.20 MET 1
ASN 3 0.21 GLU 279 -0.07 SER 204
ASN 3 0.23 LYS 280 -0.07 PRO 208
ASN 3 0.14 THR 281 -0.11 MET 1
ASN 3 0.12 HIS 282 -0.12 MET 1
ASN 3 0.21 GLN 283 -0.06 SER 204
ASN 3 0.17 ILE 284 -0.07 SER 204
ASN 3 0.24 LYS 285 -0.08 SER 204
ASN 3 0.12 SER 286 -0.13 MET 1
PRO 6 0.10 SER 287 -0.15 GLU 2
LYS 7 0.07 ASP 288 -0.20 GLU 2
LYS 7 0.06 PHE 289 -0.34 MET 1
LYS 7 0.09 LEU 290 -0.51 MET 1
LYS 7 0.10 ARG 291 -0.56 MET 1
LYS 7 0.07 SER 292 -0.56 MET 1
LYS 7 0.07 LEU 293 -0.69 MET 1
LYS 7 0.09 SER 294 -0.92 MET 1
GLU 171 0.08 LYS 295 -0.87 MET 1
LYS 7 0.06 THR 296 -0.80 MET 1
GLU 171 0.07 LEU 297 -0.95 MET 1
GLU 171 0.09 GLY 298 -1.13 MET 1
GLU 171 0.10 ASN 299 -1.29 MET 1
GLU 171 0.09 ILE 300 -1.11 MET 1
GLU 171 0.11 HIS 301 -1.12 MET 1
GLU 171 0.09 PHE 302 -0.90 MET 1
LYS 9 0.09 GLU 303 -0.73 MET 1
LYS 7 0.11 VAL 304 -0.49 MET 1
VAL 304 0.09 ALA 305 -0.35 MET 1
ASP 148 0.13 LYS 306 -0.19 MET 1
GLY 41 0.10 ILE 307 -0.22 MET 1
MET 5 0.17 LYS 308 -0.11 MET 1
ASN 3 0.24 THR 309 -0.14 GLU 171
ASN 3 0.19 LYS 310 -0.12 MET 1
ASN 3 0.13 ASP 311 -0.18 MET 1
GLY 41 0.07 GLN 312 -0.35 MET 1
GLU 146 0.05 VAL 313 -0.52 MET 1
LYS 145 0.04 ILE 314 -0.62 MET 1
ASN 172 0.06 ILE 315 -0.76 MET 1
ASN 174 0.07 ARG 316 -0.77 MET 1
ASN 174 0.08 GLY 317 -0.76 MET 1
ASN 174 0.06 ILE 318 -0.74 MET 1
ALA 231 0.06 ASN 319 -0.70 MET 1
ASN 174 0.09 GLU 320 -0.77 MET 1
ASN 174 0.10 PRO 321 -0.79 MET 1
ASN 174 0.11 GLU 322 -0.89 MET 1
ASN 174 0.10 VAL 323 -0.90 MET 1
ASN 174 0.08 ALA 324 -0.80 MET 1
ASN 174 0.09 GLU 325 -0.83 MET 1
ASN 174 0.09 GLN 326 -0.93 MET 1
ASN 174 0.07 ILE 327 -0.83 MET 1
ASN 174 0.06 SER 328 -0.76 MET 1
ASN 174 0.07 LYS 329 -0.82 MET 1
GLU 171 0.06 LEU 330 -0.81 MET 1
ASN 174 0.05 SER 331 -0.69 MET 1
ASN 174 0.05 LYS 332 -0.70 MET 1
GLU 168 0.06 LYS 333 -0.72 MET 1
GLU 171 0.04 MET 334 -0.62 MET 1

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.