CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  lpd0195  ***

LOGs for ID: 2609211528522946596

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609211528522946596.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609211528522946596.atom to be opened. Openam> File opened: 2609211528522946596.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 334 First residue number = 1 Last residue number = 334 Number of atoms found = 2654 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.519472 +/- 10.159693 From: -26.825000 To: 26.080000 = 0.341104 +/- 18.553046 From: -35.273000 To: 44.302000 = -0.830992 +/- 10.512244 From: -24.992000 To: 28.309000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0268 % Filled. Pdbmat> 959532 non-zero elements. Pdbmat> 104862 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.02 +/- 23.10 Maximum number = 131 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 2.097240E+06 Pdbmat> Larger element = 496.761 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 334 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609211528522946596.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609211528522946596.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609211528522946596.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2654 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 334 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 49 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 65 Blocpdb> 13 atoms in block 6 Block first atom: 86 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 99 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 113 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 127 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 146 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 161 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 176 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 195 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 208 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 222 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 241 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 258 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 275 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 290 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 307 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 321 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 337 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 351 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 365 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 380 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 392 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 408 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 419 Blocpdb> 18 atoms in block 29 Block first atom: 433 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 451 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 467 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 481 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 498 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 514 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 531 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 548 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 564 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 596 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 611 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 628 Blocpdb> 21 atoms in block 42 Block first atom: 645 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 666 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 680 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 691 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 709 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 728 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 741 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 753 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 770 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 786 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 806 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 819 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 837 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 850 Blocpdb> 12 atoms in block 56 Block first atom: 870 Blocpdb> 12 atoms in block 57 Block first atom: 882 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 894 Blocpdb> 14 atoms in block 59 Block first atom: 910 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 924 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 939 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 956 Blocpdb> 15 atoms in block 63 Block first atom: 974 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 989 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 1005 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1019 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1041 Blocpdb> 15 atoms in block 68 Block first atom: 1059 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1074 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1089 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1121 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1138 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1156 Blocpdb> 8 atoms in block 75 Block first atom: 1172 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1180 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1194 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1208 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1220 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1235 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1251 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1270 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1288 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1304 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1322 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1339 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1356 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1369 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1390 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 1412 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1434 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1451 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1466 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1482 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1498 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1512 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1533 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1550 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1566 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1584 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1600 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1613 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1627 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 1646 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1664 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1676 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 1691 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1710 Blocpdb> 14 atoms in block 109 Block first atom: 1725 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1739 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1757 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1773 Blocpdb> 25 atoms in block 113 Block first atom: 1788 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1813 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1830 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1843 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1856 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 1874 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1894 Blocpdb> 14 atoms in block 120 Block first atom: 1909 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 1923 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1940 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1953 Blocpdb> 14 atoms in block 124 Block first atom: 1965 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 1979 Blocpdb> 14 atoms in block 126 Block first atom: 1996 Blocpdb> 11 atoms in block 127 Block first atom: 2010 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2021 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2037 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 2051 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2066 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 2085 Blocpdb> 13 atoms in block 133 Block first atom: 2100 Blocpdb> 20 atoms in block 134 Block first atom: 2113 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2133 Blocpdb> 13 atoms in block 136 Block first atom: 2148 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2161 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2175 Blocpdb> 14 atoms in block 139 Block first atom: 2192 Blocpdb> 18 atoms in block 140 Block first atom: 2206 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2224 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2241 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2258 Blocpdb> 14 atoms in block 144 Block first atom: 2273 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2287 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2306 Blocpdb> 14 atoms in block 147 Block first atom: 2323 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2337 Blocpdb> 12 atoms in block 149 Block first atom: 2353 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2365 Blocpdb> 21 atoms in block 151 Block first atom: 2381 Blocpdb> 16 atoms in block 152 Block first atom: 2402 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2418 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2432 Blocpdb> 16 atoms in block 155 Block first atom: 2449 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 2465 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2482 Blocpdb> 19 atoms in block 158 Block first atom: 2497 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2516 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 2528 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2545 Blocpdb> 12 atoms in block 162 Block first atom: 2561 Blocpdb> 18 atoms in block 163 Block first atom: 2573 Blocpdb> 14 atoms in block 164 Block first atom: 2591 Blocpdb> 17 atoms in block 165 Block first atom: 2605 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2622 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2636 Blocpdb> 167 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 959699 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7962 Prepmat> Matrix trace = 2097240.0000 Prepmat> Last element read: 7962 7962 62.7060 Prepmat> 14029 lines saved. Prepmat> 12290 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2654 RTB> Total mass = 2654.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2654 RTB> Number of blocks = 167 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 221792.5141 RTB> 60063 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1002 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60063 Diagstd> Projected matrix trace = 221792.5141 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1002 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 221792.5141 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5672479 0.6408214 0.7319736 1.1271458 1.8108086 2.4863313 2.6118986 3.4323100 4.0337866 4.7547667 4.9715442 5.7157054 6.4530377 6.6957909 7.2671968 7.6847016 9.0108951 9.5098219 9.7366187 10.6383768 10.8438267 12.1104847 12.4021552 12.7796796 13.3984520 14.2005517 15.3926642 15.7592899 16.1116447 17.3050255 17.8087287 18.1198262 18.7875171 19.4311952 20.3003395 20.6860074 21.5979573 22.3376838 23.2449999 24.0105379 24.2937098 25.2770000 25.8187581 26.1020209 26.6700484 27.2972520 28.0472724 28.4851375 28.6847028 29.3315565 30.2975206 30.9241846 31.2254044 32.2073332 32.3163201 32.8330281 33.5105606 34.5186569 35.0485684 35.3047533 36.0043810 36.4566948 37.0091856 37.2747404 38.2863499 38.9407367 39.5714910 40.2018027 40.5677360 40.7516870 42.1368021 42.6947182 43.4737175 43.9065923 44.3022721 44.4909479 44.9066146 45.2561272 45.7150496 46.3011476 47.5671861 47.8358026 48.5169641 49.8789223 50.2747538 50.8906228 51.3723272 52.2615998 52.3051411 52.7990126 53.3659382 54.0089767 54.3618063 54.8834610 55.6327014 56.1285229 57.1439960 57.3989689 57.8091086 58.3024702 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034308 0.0034330 0.0034333 0.0034339 0.0034347 0.0034352 81.7865186 86.9288221 92.9058316 115.2883249 146.1273636 171.2279995 175.4985112 201.1817279 218.0980278 236.7881082 242.1257242 259.6152481 275.8527902 280.9934662 292.7377564 301.0293111 325.9712111 334.8740327 338.8436579 354.1872838 357.5909868 377.8992613 382.4228747 388.1997605 397.4866912 409.2115550 426.0417680 431.0856859 435.8782703 451.7325678 458.2597763 462.2450761 470.6845842 478.6797305 489.2681339 493.8938499 504.6631797 513.2327365 523.5522789 532.1036342 535.2321597 545.9565048 551.7761882 554.7947550 560.7989378 567.3548152 575.0963304 579.5680561 581.5947237 588.1157834 597.7214271 603.8713264 606.8052309 616.2723220 617.3141490 622.2297182 628.6170072 638.0022714 642.8807503 645.2260171 651.5878161 655.6679065 660.6174552 662.9833077 671.9195264 677.6373915 683.1034635 688.5223532 691.6488605 693.2151994 704.8976558 709.5489403 715.9928239 719.5486223 722.7835846 724.3210548 727.6967548 730.5231337 734.2177471 738.9093432 748.9434219 751.0551233 756.3835746 766.9266178 769.9637104 774.6654078 778.3230647 785.0306808 785.3576334 789.0566434 793.2815519 798.0466055 800.6491000 804.4814333 809.9540000 813.5553152 820.8817180 822.7110411 825.6451165 829.1607924 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2654 Rtb_to_modes> Number of blocs = 167 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.034 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.453 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.30 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997 0.99994 0.99996 0.99998 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 47772 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997 0.99994 0.99996 0.99998 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609211528522946596.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609211528522946596.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609211528522946596.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609211528522946596.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 334 First residue number = 1 Last residue number = 334 Number of atoms found = 2654 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.034 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.30 Bfactors> 106 vectors, 7962 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.567200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.670 for 334 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.059 +/- 0.11 Bfactors> = 93.539 +/- 7.08 Bfactors> Shiftng-fct= 93.481 Bfactors> Scaling-fct= 61.608 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609211528522946596.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609211528522946596.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.1 Chkmod> 106 vectors, 7962 coordinates in file. Chkmod> That is: 2654 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7233 0.0034 0.9564 0.0034 0.6219 0.0034 0.8225 0.0034 0.8013 0.0034 0.8558 81.7796 0.2091 86.9236 0.5604 92.9035 0.1059 115.2759 0.1978 146.1288 0.4607 171.2092 0.0977 175.4944 0.2289 201.1640 0.3087 218.0944 0.0158 236.7838 0.5376 242.1264 0.3045 259.6108 0.2543 275.8401 0.5903 280.9858 0.2228 292.7212 0.2295 301.0222 0.2704 325.9591 0.2501 334.8628 0.2335 338.8357 0.1790 354.1991 0.1511 357.5125 0.2813 377.8755 0.1785 382.3732 0.3505 388.1880 0.4717 397.4926 0.4004 409.1860 0.3077 425.9866 0.3517 431.0769 0.3908 435.8373 0.3878 451.7781 0.1184 458.2565 0.3173 462.2275 0.2153 470.6955 0.2700 478.6445 0.4307 489.2430 0.4309 493.9203 0.3288 504.6654 0.3722 513.2373 0.5208 523.4735 0.5052 532.0748 0.5016 535.1683 0.3863 545.9655 0.2488 551.7658 0.3692 554.7495 0.5094 560.7744 0.6349 567.3590 0.4749 575.0996 0.2634 579.5926 0.4169 581.5221 0.3181 588.0749 0.4152 597.7202 0.3979 603.8045 0.1982 606.8238 0.4056 616.2714 0.3998 617.3228 0.3680 622.1743 0.4696 628.5848 0.3883 637.9873 0.2488 642.8663 0.3236 645.1549 0.4367 651.5202 0.3710 655.6695 0.2175 660.5964 0.2775 662.9127 0.3483 671.9227 0.3348 677.6019 0.3788 683.0613 0.4287 688.4774 0.2362 691.6385 0.4700 693.1711 0.2461 704.8941 0.2727 709.4793 0.4182 715.9315 0.1772 719.5457 0.3617 722.7340 0.3173 724.2822 0.3675 727.6929 0.4219 730.5230 0.3980 734.2260 0.3942 738.8685 0.5119 748.9334 0.2982 751.0558 0.4845 756.3748 0.3857 766.9020 0.4153 769.8943 0.5071 774.6274 0.4721 778.2720 0.4024 784.9850 0.3778 785.3604 0.4740 789.0301 0.4431 793.2777 0.2280 798.0199 0.4377 800.6014 0.3080 804.4215 0.3454 809.8996 0.2149 813.5311 0.2953 820.8178 0.3569 822.6831 0.3594 825.6160 0.3921 829.1076 0.3012 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2609211528522946596 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom making animated gifs 11 models are in 2609211528522946596.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609211528522946596 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom making animated gifs 11 models are in 2609211528522946596.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609211528522946596 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom making animated gifs 11 models are in 2609211528522946596.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609211528522946596 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom making animated gifs 11 models are in 2609211528522946596.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609211528522946596 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609211528522946596.eigenfacs 2609211528522946596.atom making animated gifs 11 models are in 2609211528522946596.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609211528522946596.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609211528522946596.10.pdb 2609211528522946596.11.pdb 2609211528522946596.7.pdb 2609211528522946596.8.pdb 2609211528522946596.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.517s user 0m19.385s sys 0m0.116s rm: cannot remove '2609211528522946596.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.