CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  31-MAR-25  ***

LOGs for ID: 2609252119314067755

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609252119314067755.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609252119314067755.atom to be opened. Openam> File opened: 2609252119314067755.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1112 First residue number = 1 Last residue number = 1112 Number of atoms found = 8430 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.862340 +/- 27.495094 From: -63.052000 To: 74.654000 = 5.297571 +/- 23.820953 From: -54.706000 To: 81.117000 = -5.861478 +/- 23.331203 From: -67.886000 To: 55.634000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8078 % Filled. Pdbmat> 2583407 non-zero elements. Pdbmat> 281473 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 66.78 +/- 28.57 Maximum number = 132 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 5.629460E+06 Pdbmat> Larger element = 502.174 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1112 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609252119314067755.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609252119314067755.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609252119314067755.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8430 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1112 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 49 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 46 atoms in block 3 Block first atom: 97 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 143 Blocpdb> 38 atoms in block 5 Block first atom: 196 Blocpdb> 44 atoms in block 6 Block first atom: 234 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 278 Blocpdb> 45 atoms in block 8 Block first atom: 317 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 362 Blocpdb> 43 atoms in block 10 Block first atom: 400 Blocpdb> 41 atoms in block 11 Block first atom: 443 Blocpdb> 49 atoms in block 12 Block first atom: 484 Blocpdb> 50 atoms in block 13 Block first atom: 533 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 583 Blocpdb> 34 atoms in block 15 Block first atom: 628 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 662 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 708 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 752 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 802 Blocpdb> 41 atoms in block 20 Block first atom: 849 Blocpdb> 53 atoms in block 21 Block first atom: 890 Blocpdb> 55 atoms in block 22 Block first atom: 943 Blocpdb> 37 atoms in block 23 Block first atom: 998 Blocpdb> 38 atoms in block 24 Block first atom: 1035 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 1073 Blocpdb> 40 atoms in block 26 Block first atom: 1120 Blocpdb> 45 atoms in block 27 Block first atom: 1160 Blocpdb> 44 atoms in block 28 Block first atom: 1205 Blocpdb> 36 atoms in block 29 Block first atom: 1249 Blocpdb> 47 atoms in block 30 Block first atom: 1285 Blocpdb> 49 atoms in block 31 Block first atom: 1332 Blocpdb> 50 atoms in block 32 Block first atom: 1381 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1431 Blocpdb> 41 atoms in block 34 Block first atom: 1471 Blocpdb> 36 atoms in block 35 Block first atom: 1512 Blocpdb> 44 atoms in block 36 Block first atom: 1548 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1592 Blocpdb> 56 atoms in block 38 Block first atom: 1630 Blocpdb> 54 atoms in block 39 Block first atom: 1686 Blocpdb> 49 atoms in block 40 Block first atom: 1740 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 1789 Blocpdb> 52 atoms in block 42 Block first atom: 1845 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 1897 Blocpdb> 43 atoms in block 44 Block first atom: 1945 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 1988 Blocpdb> 34 atoms in block 46 Block first atom: 2031 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 2065 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 2105 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 2150 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 2190 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2240 Blocpdb> 44 atoms in block 52 Block first atom: 2285 Blocpdb> 46 atoms in block 53 Block first atom: 2329 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2375 Blocpdb> 49 atoms in block 55 Block first atom: 2417 Blocpdb> 48 atoms in block 56 Block first atom: 2466 Blocpdb> 47 atoms in block 57 Block first atom: 2514 Blocpdb> 49 atoms in block 58 Block first atom: 2561 Blocpdb> 39 atoms in block 59 Block first atom: 2610 Blocpdb> 41 atoms in block 60 Block first atom: 2649 Blocpdb> 41 atoms in block 61 Block first atom: 2690 Blocpdb> 45 atoms in block 62 Block first atom: 2731 Blocpdb> 41 atoms in block 63 Block first atom: 2776 Blocpdb> 50 atoms in block 64 Block first atom: 2817 Blocpdb> 46 atoms in block 65 Block first atom: 2867 Blocpdb> 54 atoms in block 66 Block first atom: 2913 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 2967 Blocpdb> 37 atoms in block 68 Block first atom: 3013 Blocpdb> 38 atoms in block 69 Block first atom: 3050 Blocpdb> 39 atoms in block 70 Block first atom: 3088 Blocpdb> 45 atoms in block 71 Block first atom: 3127 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3172 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 3213 Blocpdb> 39 atoms in block 74 Block first atom: 3258 Blocpdb> 49 atoms in block 75 Block first atom: 3297 Blocpdb> 47 atoms in block 76 Block first atom: 3346 Blocpdb> 39 atoms in block 77 Block first atom: 3393 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 3432 Blocpdb> 46 atoms in block 79 Block first atom: 3473 Blocpdb> 55 atoms in block 80 Block first atom: 3519 Blocpdb> 42 atoms in block 81 Block first atom: 3574 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 3616 Blocpdb> 52 atoms in block 83 Block first atom: 3661 Blocpdb> 41 atoms in block 84 Block first atom: 3713 Blocpdb> 40 atoms in block 85 Block first atom: 3754 Blocpdb> 48 atoms in block 86 Block first atom: 3794 Blocpdb> 41 atoms in block 87 Block first atom: 3842 Blocpdb> 53 atoms in block 88 Block first atom: 3883 Blocpdb> 45 atoms in block 89 Block first atom: 3936 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 3981 Blocpdb> 44 atoms in block 91 Block first atom: 4020 Blocpdb> 49 atoms in block 92 Block first atom: 4064 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 4113 Blocpdb> 42 atoms in block 94 Block first atom: 4154 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 4196 Blocpdb> 51 atoms in block 96 Block first atom: 4247 Blocpdb> 53 atoms in block 97 Block first atom: 4298 Blocpdb> 45 atoms in block 98 Block first atom: 4351 Blocpdb> 40 atoms in block 99 Block first atom: 4396 Blocpdb> 35 atoms in block 100 Block first atom: 4436 Blocpdb> 43 atoms in block 101 Block first atom: 4471 Blocpdb> 35 atoms in block 102 Block first atom: 4514 Blocpdb> 41 atoms in block 103 Block first atom: 4549 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 4590 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4628 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 4668 Blocpdb> 55 atoms in block 107 Block first atom: 4714 Blocpdb> 54 atoms in block 108 Block first atom: 4769 Blocpdb> 42 atoms in block 109 Block first atom: 4823 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4865 Blocpdb> 39 atoms in block 111 Block first atom: 4902 Blocpdb> 47 atoms in block 112 Block first atom: 4941 Blocpdb> 46 atoms in block 113 Block first atom: 4988 Blocpdb> 51 atoms in block 114 Block first atom: 5034 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 5085 Blocpdb> 40 atoms in block 116 Block first atom: 5133 Blocpdb> 44 atoms in block 117 Block first atom: 5173 Blocpdb> 48 atoms in block 118 Block first atom: 5217 Blocpdb> 43 atoms in block 119 Block first atom: 5265 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 5308 Blocpdb> 49 atoms in block 121 Block first atom: 5360 Blocpdb> 51 atoms in block 122 Block first atom: 5409 Blocpdb> 42 atoms in block 123 Block first atom: 5460 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 5502 Blocpdb> 44 atoms in block 125 Block first atom: 5538 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 5582 Blocpdb> 46 atoms in block 127 Block first atom: 5627 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 5673 Blocpdb> 47 atoms in block 129 Block first atom: 5715 Blocpdb> 43 atoms in block 130 Block first atom: 5762 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 5805 Blocpdb> 48 atoms in block 132 Block first atom: 5853 Blocpdb> 46 atoms in block 133 Block first atom: 5901 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 5947 Blocpdb> 42 atoms in block 135 Block first atom: 5993 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 6035 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6088 Blocpdb> 39 atoms in block 138 Block first atom: 6137 Blocpdb> 42 atoms in block 139 Block first atom: 6176 Blocpdb> 47 atoms in block 140 Block first atom: 6218 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 6265 Blocpdb> 46 atoms in block 142 Block first atom: 6311 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6357 Blocpdb> 35 atoms in block 144 Block first atom: 6403 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 6438 Blocpdb> 54 atoms in block 146 Block first atom: 6483 Blocpdb> 47 atoms in block 147 Block first atom: 6537 Blocpdb> 46 atoms in block 148 Block first atom: 6584 Blocpdb> 47 atoms in block 149 Block first atom: 6630 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 6677 Blocpdb> 44 atoms in block 151 Block first atom: 6726 Blocpdb> 52 atoms in block 152 Block first atom: 6770 Blocpdb> 41 atoms in block 153 Block first atom: 6822 Blocpdb> 44 atoms in block 154 Block first atom: 6863 Blocpdb> 47 atoms in block 155 Block first atom: 6907 Blocpdb> 51 atoms in block 156 Block first atom: 6954 Blocpdb> 39 atoms in block 157 Block first atom: 7005 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 7044 Blocpdb> 43 atoms in block 159 Block first atom: 7093 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7136 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7184 Blocpdb> 50 atoms in block 162 Block first atom: 7228 Blocpdb> 56 atoms in block 163 Block first atom: 7278 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7334 Blocpdb> 56 atoms in block 165 Block first atom: 7379 Blocpdb> 48 atoms in block 166 Block first atom: 7435 Blocpdb> 40 atoms in block 167 Block first atom: 7483 Blocpdb> 51 atoms in block 168 Block first atom: 7523 Blocpdb> 41 atoms in block 169 Block first atom: 7574 Blocpdb> 51 atoms in block 170 Block first atom: 7615 Blocpdb> 53 atoms in block 171 Block first atom: 7666 Blocpdb> 49 atoms in block 172 Block first atom: 7719 Blocpdb> 37 atoms in block 173 Block first atom: 7768 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 7805 Blocpdb> 50 atoms in block 175 Block first atom: 7862 Blocpdb> 47 atoms in block 176 Block first atom: 7912 Blocpdb> 50 atoms in block 177 Block first atom: 7959 Blocpdb> 52 atoms in block 178 Block first atom: 8009 Blocpdb> 50 atoms in block 179 Block first atom: 8061 Blocpdb> 48 atoms in block 180 Block first atom: 8111 Blocpdb> 51 atoms in block 181 Block first atom: 8159 Blocpdb> 47 atoms in block 182 Block first atom: 8210 Blocpdb> 58 atoms in block 183 Block first atom: 8257 Blocpdb> 47 atoms in block 184 Block first atom: 8315 Blocpdb> 53 atoms in block 185 Block first atom: 8362 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 8414 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2583593 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 25290 Prepmat> Matrix trace = 5629460.0000 Prepmat> Last element read: 25290 25290 320.5092 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 16233 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8430 RTB> Total mass = 8430.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8430 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 150045.5131 RTB> 38898 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 38898 Diagstd> Projected matrix trace = 150045.5131 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 150045.5131 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000017 0.0000045 0.0000112 0.0000320 0.0000781 0.0001761 0.0002029 0.0002611 0.0004719 0.0006933 0.0009186 0.0014284 0.0018327 0.0019839 0.0022415 0.0035319 0.0038765 0.0039849 0.0048633 0.0062902 0.0092663 0.0099657 0.0115129 0.0122604 0.0135072 0.0168757 0.0203297 0.0235665 0.0282664 0.0306229 0.0352911 0.0359162 0.0424601 0.0448717 0.0503022 0.0526053 0.0632308 0.0748158 0.0792581 0.1008119 0.1025826 0.1038496 0.1170793 0.1185908 0.1238430 0.1416345 0.1473508 0.1772220 0.1883709 0.1962226 0.2044268 0.2336810 0.2430974 0.2626334 0.2896689 0.3058379 0.3435245 0.3665801 0.4059770 0.4170853 0.4353411 0.4496498 0.4784388 0.4933431 0.5303927 0.5522887 0.5556132 0.6025719 0.6494946 0.6638637 0.6829186 0.7142156 0.7529269 0.7734367 0.8130885 0.8625401 0.8842191 0.9555835 0.9599910 0.9828403 1.0136241 1.0392210 1.1102314 1.1209280 1.1716682 1.1841154 1.2131633 1.2855421 1.2899977 1.3398634 1.3488734 1.3745716 1.4540410 1.5256450 1.5890431 1.6256203 1.6507447 1.7385563 1.8406914 2.0573680 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034341 0.1402216 0.2303708 0.3641005 0.6143482 0.9596419 1.4409502 1.5469159 1.7547822 2.3589950 2.8593489 3.2913059 4.1041524 4.6488305 4.8367188 5.1412144 6.4535226 6.7611028 6.8549215 7.5728537 8.6124853 10.4531677 10.8404710 11.6516653 12.0239841 12.6205210 14.1067187 15.4831932 16.6702886 18.2570522 19.0028224 20.3998939 20.5797673 22.3761613 23.0028365 24.3550241 24.9063440 27.3060883 29.7024355 30.5715301 34.4787320 34.7802109 34.9943244 37.1565532 37.3956239 38.2147438 40.8676585 41.6842126 45.7145171 47.1305189 48.1027414 49.0980480 52.4936719 53.5408674 55.6506540 58.4448426 60.0538634 63.6464471 65.7475684 69.1904207 70.1306295 71.6489990 72.8169488 75.1118546 76.2728176 79.0849882 80.7008995 80.9434191 84.2945905 87.5151087 88.4778873 89.7386955 91.7719477 94.2261996 95.5009448 97.9183724 100.8520947 102.1116369 106.1523488 106.3968701 107.6556327 109.3285899 110.7004123 114.4200246 114.9698986 117.5432253 118.1659353 119.6065377 123.1227867 123.3359678 125.6971805 126.1191043 127.3148227 130.9433995 134.1287961 136.8872881 138.4537865 139.5196047 143.1824072 147.3281636 155.7583269 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8430 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6674E-06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5005E-06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1242E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2007E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8096E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7608E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0293E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6113E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7191E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9334E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1864E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4284E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8327E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9839E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2415E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5319E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8765E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9849E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8633E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2902E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2663E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9657E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1513E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2260E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3507E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6876E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0330E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3567E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8266E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0623E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5291E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5916E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2460E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4872E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0302E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2605E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3231E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4816E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9258E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1038 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1474 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2337 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2431 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4496 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5523 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6495 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7529 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.014 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.039 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.172 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.184 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.454 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.589 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.739 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.841 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.057 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 0.99995 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00004 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 1.00006 1.00001 0.99996 1.00000 1.00004 0.99996 0.99996 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 151740 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 0.99995 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00004 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 1.00006 1.00001 0.99996 1.00000 1.00004 0.99996 0.99996 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609252119314067755.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609252119314067755.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609252119314067755.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609252119314067755.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1112 First residue number = 1 Last residue number = 1112 Number of atoms found = 8430 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6674E-06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5005E-06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1242E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2007E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8096E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7608E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0293E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6113E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7191E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9334E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1864E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4284E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9839E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2415E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8765E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9849E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8633E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2902E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2663E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9657E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1513E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2260E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3507E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6876E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0330E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3567E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8266E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0623E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5291E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5916E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2460E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4872E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0302E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2605E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3231E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4816E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9258E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1038 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1474 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2337 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4496 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6495 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7529 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.014 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.039 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.172 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.184 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.454 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.526 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.589 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.739 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.841 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.057 Bfactors> 106 vectors, 25290 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000002 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.018 for 1112 C-alpha atoms. Bfactors> = 1772.679 +/- ****** Bfactors> = 71.414 +/- 26.31 Bfactors> Shiftng-fct= -1701.265 Bfactors> Scaling-fct= 0.026 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609252119314067755.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609252119314067755.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.1402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.2304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.3641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.9596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.441 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.859 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.573 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.7 Chkmod> 106 vectors, 25290 coordinates in file. Chkmod> That is: 8430 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 100 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 102 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8147 0.0034 0.9122 0.0034 0.8256 0.0034 0.8175 0.0034 0.8611 0.0034 0.9193 0.1402 0.7789 0.2304 0.6578 0.3641 0.5109 0.6143 0.4513 0.9596 0.4589 1.4409 0.3165 1.5469 0.2274 1.7547 0.2574 2.3589 0.1568 2.8592 0.1363 3.2912 0.1321 4.1039 0.1427 4.6486 0.4347 4.8366 0.1518 5.1410 0.0836 6.4533 0.3609 6.7608 0.1323 6.8547 0.2057 7.5726 0.1824 8.6121 0.0922 10.4527 0.1175 10.8400 0.2200 11.6512 0.4947 12.0232 0.2713 12.6199 0.2985 14.1062 0.3840 15.4827 0.1969 16.6697 0.2384 18.2561 0.0768 19.0021 0.1561 20.3990 0.2866 20.5788 0.3129 22.3752 0.1921 23.0019 0.2710 24.3539 0.4341 24.9052 0.2313 27.3050 0.2189 29.7012 0.1996 30.5702 0.2755 34.4752 0.1963 34.7817 0.1246 34.9845 0.2659 37.1582 0.1405 37.3955 0.1022 38.2065 0.3098 40.8609 0.0247 41.6894 0.1133 45.7097 0.2385 47.1321 0.2179 48.0979 0.1180 49.0927 0.1003 52.4936 0.0950 53.5389 0.1034 55.6447 0.0593 58.4455 0.0700 60.0476 0.1622 63.6414 0.0652 65.7465 0.0624 69.1894 0.1876 70.1289 0.0841 71.6425 0.0950 72.8098 0.0319 75.1056 0.1380 76.2662 0.1708 79.0821 0.1448 80.6983 0.1267 80.9390 0.1602 84.2929 0.1368 87.5117 0.1098 88.4765 0.1629 89.7336 0.2261 91.7670 0.2157 94.2205 0.1091 95.4946 0.1182 97.9149 0.0886 100.8454 0.1300 102.1061 0.0666 106.1487 0.0477 106.3928 0.1123 107.6488 0.0388 109.3442 0.0393 110.6839 0.0435 114.4032 0.0366 114.9687 0.0340 117.5548 0.0363 118.1551 0.0534 119.5934 0.1292 123.1394 0.0938 123.3308 0.0648 125.6982 0.0478 126.1196 0.0226 127.3292 0.0582 130.9359 0.1144 134.1386 0.0741 136.8796 0.0213 138.4640 0.0211 139.5244 0.0558 143.1945 0.0289 147.3342 0.0233 155.7377 0.0603 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2609252119314067755 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom making animated gifs 11 models are in 2609252119314067755.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609252119314067755 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom making animated gifs 11 models are in 2609252119314067755.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609252119314067755 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom making animated gifs 11 models are in 2609252119314067755.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609252119314067755 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom making animated gifs 11 models are in 2609252119314067755.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609252119314067755 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609252119314067755.eigenfacs 2609252119314067755.atom making animated gifs 11 models are in 2609252119314067755.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609252119314067755.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609252119314067755.10.pdb 2609252119314067755.11.pdb 2609252119314067755.7.pdb 2609252119314067755.8.pdb 2609252119314067755.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m46.947s user 0m46.632s sys 0m0.293s rm: cannot remove '2609252119314067755.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.