Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
Some cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR 02-AUG-16 5L2T *

LOGs for ID: 260928132318434842

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260928132318434842.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260928132318434842.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260928132318434842.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    261
            First residue number     =     11
            Last  residue number     =    301
            Number of atoms found    =   2073
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    13.501128 +/-    14.343613 From:   -16.319000 To:    47.052000
 =    32.594577 +/-     8.375667 From:    10.202000 To:    51.143000
 =    -0.104511 +/-     9.913521 From:   -23.445000 To:    26.286000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.8152 % Filled.
 Pdbmat>       737908  non-zero elements.
 Pdbmat>        80620 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     77.78 +/-     23.05
         Maximum number =    124
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.612400E+06
 Pdbmat> Larger element =  480.238    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
261 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260928132318434842.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260928132318434842.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260928132318434842.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2073 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   261 residues.
 Blocpdb>    18 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    21 atoms in block      2
 Block first atom:     19
 Blocpdb>    13 atoms in block      3
 Block first atom:     40
 Blocpdb>    14 atoms in block      4
 Block first atom:     53
 Blocpdb>    12 atoms in block      5
 Block first atom:     67
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     79
 Blocpdb>    10 atoms in block      7
 Block first atom:     92
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    102
 Blocpdb>    18 atoms in block      9
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    14 atoms in block     10
 Block first atom:    133
 Blocpdb>    19 atoms in block     11
 Block first atom:    147
 Blocpdb>    17 atoms in block     12
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    12 atoms in block     13
 Block first atom:    183
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    195
 Blocpdb>    18 atoms in block     15
 Block first atom:    210
 Blocpdb>    13 atoms in block     16
 Block first atom:    228
 Blocpdb>    20 atoms in block     17
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    10 atoms in block     18
 Block first atom:    261
 Blocpdb>     5 atoms in block     19
 Block first atom:    271
 Blocpdb>    13 atoms in block     20
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    289
 Blocpdb>    16 atoms in block     22
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    12 atoms in block     23
 Block first atom:    324
 Blocpdb>    19 atoms in block     24
 Block first atom:    336
 Blocpdb>    18 atoms in block     25
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    373
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    389
 Blocpdb>    17 atoms in block     28
 Block first atom:    409
 Blocpdb>    15 atoms in block     29
 Block first atom:    426
 Blocpdb>    18 atoms in block     30
 Block first atom:    441
 Blocpdb>    19 atoms in block     31
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    15 atoms in block     32
 Block first atom:    478
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    17 atoms in block     34
 Block first atom:    506
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    523
 Blocpdb>    18 atoms in block     36
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    556
 Blocpdb>    15 atoms in block     38
 Block first atom:    575
 Blocpdb>    17 atoms in block     39
 Block first atom:    590
 Blocpdb>    15 atoms in block     40
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    19 atoms in block     41
 Block first atom:    622
 Blocpdb>    16 atoms in block     42
 Block first atom:    641
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    657
 Blocpdb>    16 atoms in block     44
 Block first atom:    673
 Blocpdb>    11 atoms in block     45
 Block first atom:    689
 Blocpdb>    14 atoms in block     46
 Block first atom:    700
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    15 atoms in block     48
 Block first atom:    730
 Blocpdb>    17 atoms in block     49
 Block first atom:    745
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    762
 Blocpdb>    20 atoms in block     51
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    16 atoms in block     52
 Block first atom:    798
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:    814
 Blocpdb>    16 atoms in block     54
 Block first atom:    829
 Blocpdb>    19 atoms in block     55
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    16 atoms in block     56
 Block first atom:    864
 Blocpdb>    21 atoms in block     57
 Block first atom:    880
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    901
 Blocpdb>    21 atoms in block     59
 Block first atom:    915
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    936
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:    952
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    968
 Blocpdb>    16 atoms in block     63
 Block first atom:    985
 Blocpdb>    14 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    12 atoms in block     65
 Block first atom:   1015
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:   1027
 Blocpdb>    17 atoms in block     67
 Block first atom:   1040
 Blocpdb>    13 atoms in block     68
 Block first atom:   1057
 Blocpdb>    19 atoms in block     69
 Block first atom:   1070
 Blocpdb>    12 atoms in block     70
 Block first atom:   1089
 Blocpdb>     5 atoms in block     71
 Block first atom:   1101
 Blocpdb>    12 atoms in block     72
 Block first atom:   1106
 Blocpdb>    22 atoms in block     73
 Block first atom:   1118
 Blocpdb>    23 atoms in block     74
 Block first atom:   1140
 Blocpdb>    12 atoms in block     75
 Block first atom:   1163
 Blocpdb>    16 atoms in block     76
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    16 atoms in block     77
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    18 atoms in block     79
 Block first atom:   1222
 Blocpdb>    12 atoms in block     80
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    14 atoms in block     81
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    16 atoms in block     82
 Block first atom:   1266
 Blocpdb>    20 atoms in block     83
 Block first atom:   1282
 Blocpdb>    11 atoms in block     84
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    14 atoms in block     85
 Block first atom:   1313
 Blocpdb>    16 atoms in block     86
 Block first atom:   1327
 Blocpdb>    17 atoms in block     87
 Block first atom:   1343
 Blocpdb>    22 atoms in block     88
 Block first atom:   1360
 Blocpdb>    20 atoms in block     89
 Block first atom:   1382
 Blocpdb>    15 atoms in block     90
 Block first atom:   1402
 Blocpdb>    22 atoms in block     91
 Block first atom:   1417
 Blocpdb>    10 atoms in block     92
 Block first atom:   1439
 Blocpdb>    14 atoms in block     93
 Block first atom:   1449
 Blocpdb>    15 atoms in block     94
 Block first atom:   1463
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1495
 Blocpdb>    16 atoms in block     97
 Block first atom:   1508
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1524
 Blocpdb>    12 atoms in block     99
 Block first atom:   1539
 Blocpdb>    15 atoms in block    100
 Block first atom:   1551
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1566
 Blocpdb>    17 atoms in block    102
 Block first atom:   1579
 Blocpdb>    21 atoms in block    103
 Block first atom:   1596
 Blocpdb>    19 atoms in block    104
 Block first atom:   1617
 Blocpdb>    12 atoms in block    105
 Block first atom:   1636
 Blocpdb>    15 atoms in block    106
 Block first atom:   1648
 Blocpdb>    20 atoms in block    107
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1683
 Blocpdb>    16 atoms in block    109
 Block first atom:   1699
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1715
 Blocpdb>    14 atoms in block    111
 Block first atom:   1730
 Blocpdb>    15 atoms in block    112
 Block first atom:   1744
 Blocpdb>    18 atoms in block    113
 Block first atom:   1759
 Blocpdb>    18 atoms in block    114
 Block first atom:   1777
 Blocpdb>    15 atoms in block    115
 Block first atom:   1795
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    17 atoms in block    117
 Block first atom:   1826
 Blocpdb>    13 atoms in block    118
 Block first atom:   1843
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1856
 Blocpdb>    16 atoms in block    120
 Block first atom:   1872
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1888
 Blocpdb>    15 atoms in block    122
 Block first atom:   1903
 Blocpdb>    19 atoms in block    123
 Block first atom:   1918
 Blocpdb>    12 atoms in block    124
 Block first atom:   1937
 Blocpdb>    20 atoms in block    125
 Block first atom:   1949
 Blocpdb>    14 atoms in block    126
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    17 atoms in block    127
 Block first atom:   1983
 Blocpdb>    11 atoms in block    128
 Block first atom:   2000
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   2011
 Blocpdb>    17 atoms in block    130
 Block first atom:   2025
 Blocpdb>    23 atoms in block    131
 Block first atom:   2042
 Blocpdb>     9 atoms in block    132
 Block first atom:   2064

 Blocpdb>   132 blocks.

 Blocpdb> At most,     23 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       738040 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6219

 Prepmat> Matrix trace    =    1612400.0000
 Prepmat> Last element read:    6219   6219        71.0489
 Prepmat>         8779 lines saved.
 Prepmat>         7439 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2073
 RTB> Total mass =        2073.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2073
 RTB> Number of blocks =   132
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  169342.9954
 RTB>     46224 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      792
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    46224
 Diagstd> Projected matrix trace =  169342.9954

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    792 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 169342.9954
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.2868190      1.9311491      2.6389008      5.1675309
      5.7045057      6.8796279      7.5137333      8.9764831      9.2211271
     10.5409830     11.4513430     12.9051972     13.3580445     14.4638946
     14.6828137     15.2292959     15.3670292     16.0371451     16.4287964
     17.2945620     17.6711039     18.3087489     19.7736728     19.9989465
     20.2070096     21.6351073     21.8358665     22.5224582     22.7433894
     23.4642788     24.5570849     25.9458766     26.7764756     27.3327316
     27.8254886     28.4204175     28.6314702     29.1924448     29.6737573
     30.3584924     31.0609674     31.4228395     32.0276579     32.5162046
     32.5781139     33.3748689     34.0878879     34.2407085     34.8910142
     35.4795990     36.2630469     36.7511833     37.5981847     38.2904122
     39.5019523     39.9009987     41.2343634     42.0891836     42.5791495
     43.2548017     43.7151528     44.1075267     44.9075029     46.0900610
     47.0201532     47.4597977     49.0573771     49.3305768     49.9233551
     51.1441919     51.6473589     52.0146229     52.6572813     53.6042200
     54.1610487     55.6146698     55.8810031     57.0654974     58.5711149
     58.6460751     59.7960811     60.4070791     61.0998254     61.2164911
     62.4720106     63.1358548     63.3254004     64.1734851     64.9008544
     65.4129482     65.6524309     66.3174872     66.5009991     67.7100491
     68.2143482     69.4404652     69.8943277     70.6338549     71.2178144
     71.7687844

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034331      0.0034331      0.0034335      0.0034336      0.0034339
      0.0034339    123.1839200    150.9048432    176.4033432    246.8520973
    259.3607713    284.8247692    297.6618437    325.3481864    329.7518830
    352.5622725    367.4713554    390.1014850    396.8868618    412.9884486
    416.1021158    423.7748640    425.6868538    434.8693607    440.1474138
    451.5959772    456.4856403    464.6485802    482.8797041    485.6225433
    488.1421441    505.0970208    507.4350891    515.3510617    517.8725289
    526.0159167    538.1256408    553.1328539    561.9167612    567.7234044
    572.8180304    578.9092744    581.0548160    586.7194882    591.5365038
    598.3225629    605.2053650    608.7205923    614.5509162    619.2203261
    619.8095290    627.3430112    634.0088600    635.4284440    641.4341486
    646.8217746    653.9242243    658.3107447    665.8535489    671.9551721
    682.5029930    685.9416330    697.3084484    704.4992439    708.5879647
    714.1878261    717.9782373    721.1932166    727.7039521    737.2230779
    744.6244638    748.0975312    760.5844507    762.6993511    767.2681355
    776.5929451    780.4037346    783.1735422    787.9968774    795.0506018
    799.1693381    809.8227287    811.7594945    820.3177026    831.0688903
    831.6005280    839.7144781    843.9936874    848.8193376    849.6293308
    858.2978447    862.8460446    864.1402861    869.9075355    874.8235939
    878.2681672    879.8744080    884.3197235    885.5424106    893.5561425
    896.8775377    904.9020896    907.8544908    912.6446974    916.4095386
    919.9475679

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2073
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    132

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.287    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.931    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.639    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.168    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.705    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.880    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.514    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.976    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.221    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.77    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    792 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00004 0.99998 1.00003 1.00001 1.00003
 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 0.99996
 1.00004 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 0.99997
 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00005 0.99999
 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
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 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
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 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    37314 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00004 0.99998 1.00003 1.00001 1.00003
 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 0.99996
 1.00004 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 0.99997
 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00005 0.99999
 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
 0.99994 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260928132318434842.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260928132318434842.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260928132318434842.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260928132318434842.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    261
            First residue number     =     11
            Last  residue number     =    301
            Number of atoms found    =   2073
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9977E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.287    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.931    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.639    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.168    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.705    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.880    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.514    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.976    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.221    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.77    

 Bfactors>  106 vectors,   6219 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.287000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.732 for    261 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.037 +/-   0.04
 Bfactors> =     64.241 +/-  14.55
 Bfactors> Shiftng-fct=     64.204
 Bfactors> Scaling-fct=    338.063

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260928132318434842.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260928132318434842.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   123.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   150.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   176.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   246.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   259.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   284.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   297.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   325.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   329.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   352.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   390.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   396.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   412.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   416.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   912.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   916.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.9    

 Chkmod>  106 vectors,   6219 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2073 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    96 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9557
      0.0034      0.7610
      0.0034      0.7501
      0.0034      0.7140
      0.0034      0.7447
      0.0034      0.9893
    123.1873      0.5034
    150.8925      0.4052
    176.3991      0.6059
    246.8527      0.4636
    259.3609      0.5561
    284.8202      0.5242
    297.6543      0.3881
    325.3255      0.5268
    329.7355      0.1979
    352.5307      0.4473
    367.4340      0.2096
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    396.8989      0.3032
    412.9151      0.4761
    416.0444      0.1874
    423.7665      0.0587
    425.7097      0.0430
    434.8894      0.2064
    440.1446      0.2237
    451.5170      0.2746
    456.4518      0.0900
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    919.9159      0.5267
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260928132318434842 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
260928132318434842.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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getting mode 8
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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getting mode 11
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generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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260928132318434842.8.pdb
260928132318434842.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m8.342s
user	0m8.265s
sys	0m0.073s
rm: cannot remove '260928132318434842.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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* TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR 02-AUG-16 5L2T *
