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***  HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR 09-JUL-13 4LL3  ***

LOGs for ID: 260928140737447247

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260928140737447247.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260928140737447247.atom to be opened. Openam> File opened: 260928140737447247.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 1578 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -11.399499 +/- 8.896968 From: -33.032000 To: 9.921000 = 19.724172 +/- 8.766758 From: -0.147000 To: 38.996000 = 26.666478 +/- 11.914264 From: -2.850000 To: 56.578000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.1873 % Filled. Pdbmat> 581379 non-zero elements. Pdbmat> 63554 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.55 +/- 23.22 Maximum number = 129 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.271080E+06 Pdbmat> Larger element = 559.443 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 198 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260928140737447247.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260928140737447247.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260928140737447247.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1578 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 198 residues. Blocpdb> 7 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 9 atoms in block 2 Block first atom: 8 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 17 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 25 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 32 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 40 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 54 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 63 Blocpdb> 7 atoms in block 9 Block first atom: 74 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 81 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 89 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 96 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 110 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 118 Blocpdb> 8 atoms in block 15 Block first atom: 127 Blocpdb> 4 atoms in block 16 Block first atom: 135 Blocpdb> 4 atoms in block 17 Block first atom: 139 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 143 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 152 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 160 Blocpdb> 9 atoms in block 21 Block first atom: 169 Blocpdb> 5 atoms in block 22 Block first atom: 178 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 183 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 191 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 199 Blocpdb> 7 atoms in block 26 Block first atom: 207 Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 214 Blocpdb> 5 atoms in block 28 Block first atom: 218 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 223 Blocpdb> 13 atoms in block 30 Block first atom: 231 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 244 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 251 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 258 Blocpdb> 9 atoms in block 34 Block first atom: 266 Blocpdb> 9 atoms in block 35 Block first atom: 275 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 284 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 292 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 300 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 308 Blocpdb> 4 atoms in block 40 Block first atom: 315 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 319 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 330 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 344 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 353 Blocpdb> 9 atoms in block 45 Block first atom: 360 Blocpdb> 8 atoms in block 46 Block first atom: 369 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 377 Blocpdb> 4 atoms in block 48 Block first atom: 385 Blocpdb> 4 atoms in block 49 Block first atom: 389 Blocpdb> 8 atoms in block 50 Block first atom: 393 Blocpdb> 4 atoms in block 51 Block first atom: 401 Blocpdb> 4 atoms in block 52 Block first atom: 405 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 409 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 428 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 436 Blocpdb> 7 atoms in block 56 Block first atom: 445 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 452 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 463 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 472 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 484 Blocpdb> 9 atoms in block 61 Block first atom: 492 Blocpdb> 8 atoms in block 62 Block first atom: 501 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 509 Blocpdb> 8 atoms in block 64 Block first atom: 517 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 525 Blocpdb> 8 atoms in block 66 Block first atom: 534 Blocpdb> 6 atoms in block 67 Block first atom: 542 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 548 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 552 Blocpdb> 9 atoms in block 70 Block first atom: 562 Blocpdb> 5 atoms in block 71 Block first atom: 571 Blocpdb> 8 atoms in block 72 Block first atom: 576 Blocpdb> 4 atoms in block 73 Block first atom: 584 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 588 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 595 Blocpdb> 8 atoms in block 76 Block first atom: 602 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 610 Blocpdb> 4 atoms in block 78 Block first atom: 617 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 621 Blocpdb> 7 atoms in block 80 Block first atom: 628 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 635 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 642 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 649 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 657 Blocpdb> 8 atoms in block 85 Block first atom: 673 Blocpdb> 4 atoms in block 86 Block first atom: 681 Blocpdb> 11 atoms in block 87 Block first atom: 685 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 696 Blocpdb> 8 atoms in block 89 Block first atom: 704 Blocpdb> 8 atoms in block 90 Block first atom: 712 Blocpdb> 7 atoms in block 91 Block first atom: 720 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 727 Blocpdb> 8 atoms in block 93 Block first atom: 736 Blocpdb> 4 atoms in block 94 Block first atom: 744 Blocpdb> 6 atoms in block 95 Block first atom: 748 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 754 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 761 Blocpdb> 8 atoms in block 98 Block first atom: 769 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 777 Blocpdb> 7 atoms in block 100 Block first atom: 789 Blocpdb> 9 atoms in block 101 Block first atom: 796 Blocpdb> 8 atoms in block 102 Block first atom: 805 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 813 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 820 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 828 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 842 Blocpdb> 11 atoms in block 107 Block first atom: 857 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 868 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 875 Blocpdb> 7 atoms in block 110 Block first atom: 883 Blocpdb> 7 atoms in block 111 Block first atom: 890 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 897 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 905 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 914 Blocpdb> 4 atoms in block 115 Block first atom: 922 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 926 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 930 Blocpdb> 8 atoms in block 118 Block first atom: 939 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 947 Blocpdb> 9 atoms in block 120 Block first atom: 956 Blocpdb> 5 atoms in block 121 Block first atom: 965 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 970 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 978 Blocpdb> 8 atoms in block 124 Block first atom: 986 Blocpdb> 7 atoms in block 125 Block first atom: 994 Blocpdb> 4 atoms in block 126 Block first atom: 1001 Blocpdb> 5 atoms in block 127 Block first atom: 1005 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 1010 Blocpdb> 16 atoms in block 129 Block first atom: 1018 Blocpdb> 7 atoms in block 130 Block first atom: 1034 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 1041 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1048 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1056 Blocpdb> 9 atoms in block 134 Block first atom: 1065 Blocpdb> 8 atoms in block 135 Block first atom: 1074 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1082 Blocpdb> 8 atoms in block 137 Block first atom: 1090 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1098 Blocpdb> 4 atoms in block 139 Block first atom: 1105 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 1109 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 1120 Blocpdb> 9 atoms in block 142 Block first atom: 1134 Blocpdb> 7 atoms in block 143 Block first atom: 1143 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 1150 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1159 Blocpdb> 8 atoms in block 146 Block first atom: 1167 Blocpdb> 4 atoms in block 147 Block first atom: 1175 Blocpdb> 4 atoms in block 148 Block first atom: 1179 Blocpdb> 8 atoms in block 149 Block first atom: 1183 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1191 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1195 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 1199 Blocpdb> 8 atoms in block 153 Block first atom: 1218 Blocpdb> 9 atoms in block 154 Block first atom: 1226 Blocpdb> 7 atoms in block 155 Block first atom: 1235 Blocpdb> 11 atoms in block 156 Block first atom: 1242 Blocpdb> 9 atoms in block 157 Block first atom: 1253 Blocpdb> 12 atoms in block 158 Block first atom: 1262 Blocpdb> 8 atoms in block 159 Block first atom: 1274 Blocpdb> 9 atoms in block 160 Block first atom: 1282 Blocpdb> 8 atoms in block 161 Block first atom: 1291 Blocpdb> 8 atoms in block 162 Block first atom: 1299 Blocpdb> 8 atoms in block 163 Block first atom: 1307 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 1315 Blocpdb> 8 atoms in block 165 Block first atom: 1324 Blocpdb> 6 atoms in block 166 Block first atom: 1332 Blocpdb> 4 atoms in block 167 Block first atom: 1338 Blocpdb> 10 atoms in block 168 Block first atom: 1342 Blocpdb> 9 atoms in block 169 Block first atom: 1352 Blocpdb> 5 atoms in block 170 Block first atom: 1361 Blocpdb> 8 atoms in block 171 Block first atom: 1366 Blocpdb> 4 atoms in block 172 Block first atom: 1374 Blocpdb> 7 atoms in block 173 Block first atom: 1378 Blocpdb> 7 atoms in block 174 Block first atom: 1385 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 1392 Blocpdb> 7 atoms in block 176 Block first atom: 1400 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 1407 Blocpdb> 7 atoms in block 178 Block first atom: 1411 Blocpdb> 7 atoms in block 179 Block first atom: 1418 Blocpdb> 7 atoms in block 180 Block first atom: 1425 Blocpdb> 7 atoms in block 181 Block first atom: 1432 Blocpdb> 8 atoms in block 182 Block first atom: 1439 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 1447 Blocpdb> 8 atoms in block 184 Block first atom: 1463 Blocpdb> 4 atoms in block 185 Block first atom: 1471 Blocpdb> 11 atoms in block 186 Block first atom: 1475 Blocpdb> 8 atoms in block 187 Block first atom: 1486 Blocpdb> 8 atoms in block 188 Block first atom: 1494 Blocpdb> 8 atoms in block 189 Block first atom: 1502 Blocpdb> 7 atoms in block 190 Block first atom: 1510 Blocpdb> 9 atoms in block 191 Block first atom: 1517 Blocpdb> 8 atoms in block 192 Block first atom: 1526 Blocpdb> 4 atoms in block 193 Block first atom: 1534 Blocpdb> 6 atoms in block 194 Block first atom: 1538 Blocpdb> 7 atoms in block 195 Block first atom: 1544 Blocpdb> 8 atoms in block 196 Block first atom: 1551 Blocpdb> 8 atoms in block 197 Block first atom: 1559 Blocpdb> 12 atoms in block 198 Block first atom: 1566 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 19 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 581577 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4734 Prepmat> Matrix trace = 1271080.0000 Prepmat> Last element read: 4734 4734 247.4424 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17165 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1578 RTB> Total mass = 1578.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1578 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 297726.1407 RTB> 88326 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 88326 Diagstd> Projected matrix trace = 297726.1407 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 297726.1407 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.9479557 3.4050911 5.5330850 8.0200580 8.4854372 9.2907129 11.3981341 11.4869924 12.3426612 14.6927945 16.7343807 17.4029570 17.9277991 18.7943353 19.8404613 20.0623728 21.0394145 22.2364496 23.3604308 24.8968856 26.3283302 26.4490681 27.6719199 28.7596876 29.4102707 29.7606306 30.4356801 32.7354829 33.5107960 34.1158522 36.6093532 36.7983330 37.6431565 38.5594427 39.3471052 39.5773328 40.4349388 41.0123120 42.3701973 42.7372808 43.1749050 44.1111010 45.0981983 45.4629905 45.8384076 46.5487778 47.5679137 47.8469778 48.7746198 48.9850823 49.5779040 50.8686000 51.7382214 52.9279258 53.3880016 54.1745803 54.3605048 54.8479855 56.0357334 56.6292989 57.1404168 58.3390546 59.6739215 60.7088799 61.1163221 61.6879374 62.1392554 63.1460222 63.5968717 63.8919559 65.0324266 65.7762083 66.6402589 67.0772680 68.4900083 69.1596073 69.7291858 70.1332166 71.1011379 71.1726986 72.4763074 73.9069332 74.6291502 74.6670832 75.3629706 76.0100666 76.3190725 76.9957204 78.2718741 79.3113931 80.5745830 81.0440416 81.3564687 81.7039117 82.6383052 82.9939431 83.6690127 84.6536423 85.3631996 85.6215084 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034333 0.0034338 0.0034340 0.0034346 0.0034349 0.0034352 186.4471523 200.3824345 255.4341459 307.5275554 316.3241807 330.9937549 366.6166296 368.0429019 381.5045164 416.2435174 444.2220407 453.0089719 459.7892032 470.7699849 483.6945156 486.3920055 498.0949117 512.0684321 524.8506069 541.8359196 557.1946503 558.4707966 571.2351538 582.3544020 588.9043887 592.4017662 599.0827096 621.3047249 628.6192156 634.2688635 657.0392409 658.7328976 666.2516487 674.3116370 681.1639787 683.1538836 690.5158879 695.4283744 706.8471700 709.9025291 713.5279268 721.2224372 729.2473781 732.1908213 735.2076909 740.8826446 748.9491497 751.1428469 758.3893518 760.0238158 764.6089219 774.4977724 781.0899103 790.0193299 793.4455208 799.2691639 800.6395154 804.2213919 812.8825682 817.1765068 820.8560096 829.4208984 838.8562982 846.0994061 848.9339184 852.8946793 856.0089448 862.9155184 865.9905583 867.9972955 875.7099011 880.7034498 886.4691330 889.3709979 898.6878906 903.0702588 906.7813460 909.4046263 915.6585520 916.1192242 924.4710370 933.5506183 938.1008480 938.3392297 942.7016880 946.7402403 948.6626938 952.8588537 960.7229082 967.0814864 974.7524006 977.5879182 979.4704209 981.5596681 987.1564354 989.2782926 993.2935206 999.1210397 1003.2995624 1004.8164065 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1578 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.405 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.020 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.62 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 0.99997 1.00006 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 28404 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 0.99997 1.00006 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260928140737447247.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260928140737447247.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260928140737447247.atom Openam> file on opening on unit 11: 260928140737447247.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 198 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 1578 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.405 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.020 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.62 Bfactors> 106 vectors, 4734 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.948000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.624 for 206 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.027 +/- 0.02 Bfactors> = 37.743 +/- 15.94 Bfactors> Shiftng-fct= 37.716 Bfactors> Scaling-fct= 767.166 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260928140737447247.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260928140737447247.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.4 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vecteur en lecture: 880.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Chkmod> 106 vectors, 4734 coordinates in file. Chkmod> That is: 1578 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9650 0.0034 0.8866 0.0034 0.7666 0.0034 0.7727 0.0034 0.7582 0.0034 0.9684 186.4406 0.5848 200.3712 0.6302 255.4212 0.5422 307.5132 0.4645 316.3025 0.4265 330.9847 0.5597 366.6309 0.6000 368.0753 0.3778 381.4470 0.2736 416.1861 0.6018 444.1448 0.1629 452.9510 0.2260 459.7977 0.2073 470.6955 0.1608 483.6681 0.0733 486.3424 0.3451 498.0805 0.3491 512.0873 0.3901 524.8232 0.2025 541.8465 0.4653 557.1884 0.5307 558.4567 0.3372 571.1908 0.5111 582.3326 0.5829 588.8764 0.3046 592.3701 0.3882 599.0995 0.5154 621.3209 0.4348 628.5848 0.3950 634.2802 0.4975 657.0168 0.3502 658.7195 0.3768 666.1951 0.4394 674.2876 0.4152 681.1598 0.4354 683.1476 0.5062 690.4441 0.4485 695.3789 0.5323 706.8152 0.3115 709.8946 0.4479 713.4568 0.3366 721.1825 0.4613 729.2306 0.3207 732.1353 0.2575 735.1889 0.2546 740.8606 0.4120 748.9334 0.4756 751.1343 0.3493 758.3209 0.4370 760.0293 0.4221 764.5923 0.4529 774.4752 0.3160 781.0698 0.3971 790.0009 0.4886 793.4263 0.2741 799.2011 0.4551 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260928140737447247.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260928140737447247.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260928140737447247 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260928140737447247 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260928140737447247 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260928140737447247.eigenfacs 260928140737447247.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260928140737447247.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260928140737447247.10.pdb 260928140737447247.11.pdb 260928140737447247.7.pdb 260928140737447247.8.pdb 260928140737447247.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m25.373s user 0m25.289s sys 0m0.068s rm: cannot remove '260928140737447247.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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