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* cadeias C e D imunoglobulina *

LOGs for ID: 2610021250001802171

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2610021250001802171.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2610021250001802171.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2610021250001802171.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    423
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    226
            Number of atoms found    =   2085
            Mean number per residue  =      4.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -25.677430 +/-    12.997762 From:   -54.228000 To:     1.620000
 =    24.946914 +/-    15.893027 From:    -9.499000 To:    56.508000
 =     8.358828 +/-    12.838412 From:   -22.298000 To:    39.463000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'sD  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sI  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sV  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sL  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sT  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sQ  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sS  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sP  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'sS  ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........

%Pdbmat-W>    423 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.4339 % Filled.
 Pdbmat>       476215  non-zero elements.
 Pdbmat>        51535 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     49.43 +/-     13.16
         Maximum number =     86
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.030700E+06
 Pdbmat> Larger element =  336.759    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
423 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2610021250001802171.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2610021250001802171.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2610021250001802171.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2085 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   423 residues.
 Blocpdb>    14 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     15
 Blocpdb>    14 atoms in block      3
 Block first atom:     30
 Blocpdb>    14 atoms in block      4
 Block first atom:     44
 Blocpdb>    12 atoms in block      5
 Block first atom:     58
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     70
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    15 atoms in block      8
 Block first atom:     97
 Blocpdb>    14 atoms in block      9
 Block first atom:    112
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    19 atoms in block     12
 Block first atom:    158
 Blocpdb>    17 atoms in block     13
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    13 atoms in block     14
 Block first atom:    194
 Blocpdb>    13 atoms in block     15
 Block first atom:    207
 Blocpdb>    12 atoms in block     16
 Block first atom:    220
 Blocpdb>    14 atoms in block     17
 Block first atom:    232
 Blocpdb>    15 atoms in block     18
 Block first atom:    246
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    261
 Blocpdb>    13 atoms in block     20
 Block first atom:    275
 Blocpdb>    18 atoms in block     21
 Block first atom:    288
 Blocpdb>    11 atoms in block     22
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    13 atoms in block     23
 Block first atom:    317
 Blocpdb>    14 atoms in block     24
 Block first atom:    330
 Blocpdb>    13 atoms in block     25
 Block first atom:    344
 Blocpdb>    14 atoms in block     26
 Block first atom:    357
 Blocpdb>    16 atoms in block     27
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    13 atoms in block     28
 Block first atom:    387
 Blocpdb>    17 atoms in block     29
 Block first atom:    400
 Blocpdb>    16 atoms in block     30
 Block first atom:    417
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    433
 Blocpdb>    14 atoms in block     32
 Block first atom:    447
 Blocpdb>    14 atoms in block     33
 Block first atom:    461
 Blocpdb>    11 atoms in block     34
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    486
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    501
 Blocpdb>    12 atoms in block     37
 Block first atom:    517
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    529
 Blocpdb>    13 atoms in block     39
 Block first atom:    541
 Blocpdb>    14 atoms in block     40
 Block first atom:    554
 Blocpdb>    16 atoms in block     41
 Block first atom:    568
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    584
 Blocpdb>    11 atoms in block     43
 Block first atom:    599
 Blocpdb>    12 atoms in block     44
 Block first atom:    610
 Blocpdb>    14 atoms in block     45
 Block first atom:    622
 Blocpdb>    16 atoms in block     46
 Block first atom:    636
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    652
 Blocpdb>    15 atoms in block     48
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    15 atoms in block     49
 Block first atom:    683
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    698
 Blocpdb>    14 atoms in block     51
 Block first atom:    715
 Blocpdb>    19 atoms in block     52
 Block first atom:    729
 Blocpdb>    13 atoms in block     53
 Block first atom:    748
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    19 atoms in block     55
 Block first atom:    776
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    812
 Blocpdb>    16 atoms in block     58
 Block first atom:    828
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    844
 Blocpdb>    14 atoms in block     60
 Block first atom:    858
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    872
 Blocpdb>    18 atoms in block     62
 Block first atom:    886
 Blocpdb>    19 atoms in block     63
 Block first atom:    904
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:    940
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:    955
 Blocpdb>    15 atoms in block     67
 Block first atom:    969
 Blocpdb>    14 atoms in block     68
 Block first atom:    984
 Blocpdb>    13 atoms in block     69
 Block first atom:    998
 Blocpdb>    17 atoms in block     70
 Block first atom:   1011
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>     4 atoms in block     72
 Block first atom:   1047
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1051
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1066
 Blocpdb>    11 atoms in block     75
 Block first atom:   1082
 Blocpdb>    11 atoms in block     76
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1104
 Blocpdb>    12 atoms in block     78
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   1129
 Blocpdb>    12 atoms in block     80
 Block first atom:   1143
 Blocpdb>    14 atoms in block     81
 Block first atom:   1155
 Blocpdb>    16 atoms in block     82
 Block first atom:   1169
 Blocpdb>    18 atoms in block     83
 Block first atom:   1185
 Blocpdb>    18 atoms in block     84
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    17 atoms in block     85
 Block first atom:   1221
 Blocpdb>    15 atoms in block     86
 Block first atom:   1238
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1253
 Blocpdb>    18 atoms in block     88
 Block first atom:   1269
 Blocpdb>    13 atoms in block     89
 Block first atom:   1287
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:   1300
 Blocpdb>    13 atoms in block     91
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    16 atoms in block     92
 Block first atom:   1330
 Blocpdb>    15 atoms in block     93
 Block first atom:   1346
 Blocpdb>    15 atoms in block     94
 Block first atom:   1361
 Blocpdb>    15 atoms in block     95
 Block first atom:   1376
 Blocpdb>    18 atoms in block     96
 Block first atom:   1391
 Blocpdb>    14 atoms in block     97
 Block first atom:   1409
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1423
 Blocpdb>    16 atoms in block     99
 Block first atom:   1438
 Blocpdb>    30 atoms in block    100
 Block first atom:   1454
 Blocpdb>    17 atoms in block    101
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    13 atoms in block    102
 Block first atom:   1501
 Blocpdb>    13 atoms in block    103
 Block first atom:   1514
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>     3 atoms in block    105
 Block first atom:   1543
 Blocpdb>    31 atoms in block    106
 Block first atom:   1546
 Blocpdb>    17 atoms in block    107
 Block first atom:   1577
 Blocpdb>    13 atoms in block    108
 Block first atom:   1594
 Blocpdb>    13 atoms in block    109
 Block first atom:   1607
 Blocpdb>    13 atoms in block    110
 Block first atom:   1620
 Blocpdb>    15 atoms in block    111
 Block first atom:   1633
 Blocpdb>    12 atoms in block    112
 Block first atom:   1648
 Blocpdb>    14 atoms in block    113
 Block first atom:   1660
 Blocpdb>    11 atoms in block    114
 Block first atom:   1674
 Blocpdb>    11 atoms in block    115
 Block first atom:   1685
 Blocpdb>     6 atoms in block    116
 Block first atom:   1696
 Blocpdb>    13 atoms in block    117
 Block first atom:   1702
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1715
 Blocpdb>    12 atoms in block    119
 Block first atom:   1729
 Blocpdb>    12 atoms in block    120
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    14 atoms in block    121
 Block first atom:   1753
 Blocpdb>    16 atoms in block    122
 Block first atom:   1767
 Blocpdb>    13 atoms in block    123
 Block first atom:   1783
 Blocpdb>     4 atoms in block    124
 Block first atom:   1796
 Blocpdb>    13 atoms in block    125
 Block first atom:   1800
 Blocpdb>    14 atoms in block    126
 Block first atom:   1813
 Blocpdb>    14 atoms in block    127
 Block first atom:   1827
 Blocpdb>     8 atoms in block    128
 Block first atom:   1841
 Blocpdb>    15 atoms in block    129
 Block first atom:   1849
 Blocpdb>    13 atoms in block    130
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    14 atoms in block    131
 Block first atom:   1877
 Blocpdb>     5 atoms in block    132
 Block first atom:   1891
 Blocpdb>    16 atoms in block    133
 Block first atom:   1896
 Blocpdb>    14 atoms in block    134
 Block first atom:   1912
 Blocpdb>    14 atoms in block    135
 Block first atom:   1926
 Blocpdb>    14 atoms in block    136
 Block first atom:   1940
 Blocpdb>    10 atoms in block    137
 Block first atom:   1954
 Blocpdb>    17 atoms in block    138
 Block first atom:   1964
 Blocpdb>    16 atoms in block    139
 Block first atom:   1981
 Blocpdb>     9 atoms in block    140
 Block first atom:   1997
 Blocpdb>    14 atoms in block    141
 Block first atom:   2006
 Blocpdb>    13 atoms in block    142
 Block first atom:   2020
 Blocpdb>    13 atoms in block    143
 Block first atom:   2033
 Blocpdb>    14 atoms in block    144
 Block first atom:   2046
 Blocpdb>    16 atoms in block    145
 Block first atom:   2060
 Blocpdb>     4 atoms in block    146
 Block first atom:   2076
 Blocpdb>     6 atoms in block    147
 Block first atom:   2079

 Blocpdb>   147 blocks.

 Blocpdb> At most,     31 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     3 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       476362 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6255

 Prepmat> Matrix trace    =    1030700.0000
 Prepmat> Last element read:    6255   6255        30.1172
 Prepmat>        10879 lines saved.
 Prepmat>         9639 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2085
 RTB> Total mass =        2085.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2085
 RTB> Number of blocks =   147
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  113041.5507
 RTB>     42399 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      882
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    42399
 Diagstd> Projected matrix trace =  113041.5507

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    882 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 113041.5507
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.3295529      0.6751616      1.4111548      1.6843926
      1.8509895      3.0284599      3.4148542      3.6074261      4.1358157
      4.3233739      4.9705743      5.4333065      5.8429887      6.5064147
      7.2103040      7.4671699      8.4260942      8.6063973      8.7450147
      9.0649890      9.5642496     10.4921785     10.7493739     11.3620039
     11.6185654     11.9526967     12.0807087     12.4406647     12.8962845
     13.4200718     13.5458314     14.4608700     14.9799342     15.0110437
     15.3949644     15.7927465     16.3239957     16.8483337     17.1541424
     17.5780503     18.3821154     18.7692134     19.3544909     19.5501981
     20.0946956     20.6272360     20.7477553     21.3714414     21.7927982
     22.0228465     22.4775769     22.5566968     22.7179129     23.5828655
     23.6448594     23.9534461     24.5064809     24.8406666     25.0057564
     25.2892502     25.6495662     25.7759107     26.2625553     26.3587160
     26.5465611     26.6929884     27.4989453     27.5748243     28.2160731
     28.2992894     29.0299471     29.1443381     29.3218400     29.5588812
     29.9488971     30.4641334     31.1513319     31.2165131     31.5657482
     31.7074960     31.8694282     32.2747030     32.5577447     32.9300517
     33.3807241     33.4867347     33.9580814     34.3425674     34.6024266
     34.9165545     35.1962011     35.6777680     36.0648947     36.2544036
     36.6548921     36.9656015     37.0889762     37.2555767     37.5763913
     38.1271205

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034332      0.0034333      0.0034335      0.0034337      0.0034338
      0.0034341     62.3387166     89.2275895    128.9978892    140.9343795
    147.7397147    188.9758014    200.6694985    206.2500206    220.8390484
    225.7910257    242.1021053    253.1205360    262.4900245    276.9913140
    291.5896262    296.7380900    315.2161317    318.5708070    321.1260612
    326.9481771    335.8309593    351.7451479    356.0302221    366.0351126
    370.1446982    375.4293575    377.4344062    383.0161381    389.9667538
    397.8072561    399.6668362    412.9452650    420.2911381    420.7273301
    426.0735994    431.5430361    438.7412985    445.7319428    449.7589209
    455.2821588    465.5786149    470.4552461    477.7340058    480.1432870
    486.7836648    493.1917457    494.6304387    502.0097905    506.9344185
    509.6030348    514.8373269    515.7426303    517.5823949    527.3434637
    528.0361406    531.4706443    537.5709064    541.2238210    543.0193157
    546.0887845    549.9653046    551.3181487    556.4982079    557.5160902
    559.4991298    561.0400684    569.4469868    570.2320948    576.8243242
    577.6742988    585.0842430    586.2358574    588.0183647    590.3903857
    594.2725867    599.3626754    606.0850758    606.7188321    610.1032299
    611.4715477    613.0309707    616.9165307    619.6157338    623.1484036
    627.3980385    628.3934951    632.8005575    636.3728752    638.7759530
    641.6688712    644.2333089    648.6256497    652.1351576    653.8462882
    657.4477641    660.2283498    661.3292066    662.8128593    665.6605433
    670.5208454

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2085
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    147

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3296    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6752    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.411    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.684    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.851    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.028    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.415    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.607    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.136    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.323    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.971    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.433    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.843    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.506    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.210    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.467    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.426    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.606    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.745    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.065    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.564    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.13    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    882 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
 0.99997 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99997 1.00003 0.99997 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997
 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    37530 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
 0.99997 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99997 1.00003 0.99997 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997
 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2610021250001802171.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2610021250001802171.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2610021250001802171.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2610021250001802171.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    423
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    226
            Number of atoms found    =   2085
            Mean number per residue  =      4.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3296    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6752    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.411    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.684    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.851    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.028    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.415    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.607    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.136    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.323    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.971    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.433    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.843    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.506    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.210    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.467    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.426    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.606    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.745    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.065    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.564    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.13    

 Bfactors>  106 vectors,   6255 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.329600
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

%Bfactors-Wn>     0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2610021250001802171.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2610021250001802171.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   494.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   509.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   514.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   515.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   517.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   527.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   528.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   531.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   537.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   541.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   543.0    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   551.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   556.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   557.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   569.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   570.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   576.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   585.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   586.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   588.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   590.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   594.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   599.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   606.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   606.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   610.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   611.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   613.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   616.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   619.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   623.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   627.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   628.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   632.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   636.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   648.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   652.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   653.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   660.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   661.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   662.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   665.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   670.5    

 Chkmod>  106 vectors,   6255 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2085 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7575
      0.0034      0.9682
      0.0034      0.8574
      0.0034      0.7677
      0.0034      0.8228
      0.0034      0.7782
     62.3405      0.7363
     89.2263      0.7125
    128.9853      0.6282
    140.9119      0.6934
    147.7338      0.7657
    188.9533      0.7329
    200.6652      0.5418
    206.2290      0.5342
    220.8345      0.3094
    225.7716      0.3673
    242.1021      0.5173
    253.1025      0.2155
    262.4790      0.5238
    276.9706      0.4351
    291.5710      0.4775
    296.7220      0.5247
    315.2008      0.4009
    318.5498      0.2819
    321.1120      0.6056
    326.9343      0.5012
    335.8122      0.5703
    351.6935      0.3811
    356.0253      0.3623
    365.9871      0.3813
    370.1517      0.5621
    375.3709      0.5207
    377.4071      0.4925
    382.9895      0.4689
    390.0062      0.4069
    397.7891      0.5651
    399.7112      0.4739
    412.9151      0.4676
    420.2740      0.5197
    420.6946      0.5549
    425.9866      0.3019
    431.4870      0.5745
    438.6688      0.4245
    445.7348      0.4184
    449.6853      0.2822
    455.2879      0.2390
    465.5318      0.3417
    470.4449      0.4774
    477.6581      0.2648
    480.1202      0.4430
    486.7059      0.4661
    493.2036      0.5094
    494.6360      0.5688
    501.9713      0.3596
    506.8801      0.3332
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    541.1933      0.4062
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    546.0734      0.3537
    549.9463      0.5133
    551.3382      0.1647
    556.4472      0.4844
    557.5057      0.5198
    559.5113      0.5515
    560.9846      0.4870
    569.4335      0.5964
    570.1577      0.4675
    576.8397      0.4874
    577.6568      0.4650
    585.0597      0.3768
    586.1671      0.3049
    587.9747      0.4510
    590.3762      0.5675
    594.2580      0.3815
    599.2963      0.3094
    606.0461      0.4912
    606.7267      0.2760
    610.1181      0.3042
    611.4694      0.5136
    613.0102      0.4922
    616.8451      0.4050
    619.6106      0.5194
    623.1212      0.3784
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    665.6639      0.5030
    670.5174      0.3335
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610021250001802171 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610021250001802171.eigenfacs
2610021250001802171.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610021250001802171.eigenfacs
2610021250001802171.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610021250001802171.eigenfacs
2610021250001802171.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610021250001802171.eigenfacs
2610021250001802171.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610021250001802171.eigenfacs
2610021250001802171.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610021250001802171.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 1 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2610021250001802171.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m11.648s
user	0m11.570s
sys	0m0.070s
rm: cannot remove '2610021250001802171.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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