*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610042303102405003.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610042303102405003.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610042303102405003.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1692
First residue number = 132
Last residue number = 17
Number of atoms found = 13579
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 142.017772 +/- 20.718680 From: 87.568000 To: 198.903000
= 114.177996 +/- 25.971645 From: 49.296000 To: 172.249000
= 132.979235 +/- 16.570923 From: 90.264000 To: 180.493000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 17 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.6327 % Filled.
Pdbmat> 5250098 non-zero elements.
Pdbmat> 574391 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.60 +/- 21.39
Maximum number = 132
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 1.148782E+07
Pdbmat> Larger element = 516.825
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1692 non-zero elements, NRBL set to 9
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610042303102405003.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 9
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610042303102405003.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610042303102405003.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 13579 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 9 residue(s) per block.
Blocpdb> 1692 residues.
Blocpdb> 56 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 68 atoms in block 2
Block first atom: 57
Blocpdb> 67 atoms in block 3
Block first atom: 125
Blocpdb> 72 atoms in block 4
Block first atom: 192
Blocpdb> 73 atoms in block 5
Block first atom: 264
Blocpdb> 80 atoms in block 6
Block first atom: 337
Blocpdb> 79 atoms in block 7
Block first atom: 417
Blocpdb> 69 atoms in block 8
Block first atom: 496
Blocpdb> 67 atoms in block 9
Block first atom: 565
Blocpdb> 68 atoms in block 10
Block first atom: 632
Blocpdb> 82 atoms in block 11
Block first atom: 700
Blocpdb> 75 atoms in block 12
Block first atom: 782
Blocpdb> 13 atoms in block 13
Block first atom: 857
Blocpdb> 60 atoms in block 14
Block first atom: 870
Blocpdb> 65 atoms in block 15
Block first atom: 930
Blocpdb> 77 atoms in block 16
Block first atom: 995
Blocpdb> 74 atoms in block 17
Block first atom: 1072
Blocpdb> 77 atoms in block 18
Block first atom: 1146
Blocpdb> 73 atoms in block 19
Block first atom: 1223
Blocpdb> 71 atoms in block 20
Block first atom: 1296
Blocpdb> 76 atoms in block 21
Block first atom: 1367
Blocpdb> 70 atoms in block 22
Block first atom: 1443
Blocpdb> 70 atoms in block 23
Block first atom: 1513
Blocpdb> 81 atoms in block 24
Block first atom: 1583
Blocpdb> 79 atoms in block 25
Block first atom: 1664
Blocpdb> 78 atoms in block 26
Block first atom: 1743
Blocpdb> 74 atoms in block 27
Block first atom: 1821
Blocpdb> 85 atoms in block 28
Block first atom: 1895
Blocpdb> 67 atoms in block 29
Block first atom: 1980
Blocpdb> 68 atoms in block 30
Block first atom: 2047
Blocpdb> 80 atoms in block 31
Block first atom: 2115
Blocpdb> 81 atoms in block 32
Block first atom: 2195
Blocpdb> 85 atoms in block 33
Block first atom: 2276
Blocpdb> 78 atoms in block 34
Block first atom: 2361
Blocpdb> 80 atoms in block 35
Block first atom: 2439
Blocpdb> 83 atoms in block 36
Block first atom: 2519
Blocpdb> 85 atoms in block 37
Block first atom: 2602
Blocpdb> 65 atoms in block 38
Block first atom: 2687
Blocpdb> 69 atoms in block 39
Block first atom: 2752
Blocpdb> 62 atoms in block 40
Block first atom: 2821
Blocpdb> 73 atoms in block 41
Block first atom: 2883
Blocpdb> 65 atoms in block 42
Block first atom: 2956
Blocpdb> 85 atoms in block 43
Block first atom: 3021
Blocpdb> 65 atoms in block 44
Block first atom: 3106
Blocpdb> 67 atoms in block 45
Block first atom: 3171
Blocpdb> 52 atoms in block 46
Block first atom: 3238
Blocpdb> 71 atoms in block 47
Block first atom: 3290
Blocpdb> 69 atoms in block 48
Block first atom: 3361
Blocpdb> 64 atoms in block 49
Block first atom: 3430
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 3494
Blocpdb> 73 atoms in block 51
Block first atom: 3516
Blocpdb> 69 atoms in block 52
Block first atom: 3589
Blocpdb> 79 atoms in block 53
Block first atom: 3658
Blocpdb> 72 atoms in block 54
Block first atom: 3737
Blocpdb> 83 atoms in block 55
Block first atom: 3809
Blocpdb> 75 atoms in block 56
Block first atom: 3892
Blocpdb> 65 atoms in block 57
Block first atom: 3967
Blocpdb> 77 atoms in block 58
Block first atom: 4032
Blocpdb> 70 atoms in block 59
Block first atom: 4109
Blocpdb> 66 atoms in block 60
Block first atom: 4179
Blocpdb> 87 atoms in block 61
Block first atom: 4245
Blocpdb> 75 atoms in block 62
Block first atom: 4332
Blocpdb> 69 atoms in block 63
Block first atom: 4407
Blocpdb> 76 atoms in block 64
Block first atom: 4476
Blocpdb> 84 atoms in block 65
Block first atom: 4552
Blocpdb> 63 atoms in block 66
Block first atom: 4636
Blocpdb> 71 atoms in block 67
Block first atom: 4699
Blocpdb> 73 atoms in block 68
Block first atom: 4770
Blocpdb> 80 atoms in block 69
Block first atom: 4843
Blocpdb> 72 atoms in block 70
Block first atom: 4923
Blocpdb> 66 atoms in block 71
Block first atom: 4995
Blocpdb> 65 atoms in block 72
Block first atom: 5061
Blocpdb> 34 atoms in block 73
Block first atom: 5126
Blocpdb> 65 atoms in block 74
Block first atom: 5160
Blocpdb> 76 atoms in block 75
Block first atom: 5225
Blocpdb> 67 atoms in block 76
Block first atom: 5301
Blocpdb> 69 atoms in block 77
Block first atom: 5368
Blocpdb> 71 atoms in block 78
Block first atom: 5437
Blocpdb> 75 atoms in block 79
Block first atom: 5508
Blocpdb> 81 atoms in block 80
Block first atom: 5583
Blocpdb> 79 atoms in block 81
Block first atom: 5664
Blocpdb> 81 atoms in block 82
Block first atom: 5743
Blocpdb> 74 atoms in block 83
Block first atom: 5824
Blocpdb> 49 atoms in block 84
Block first atom: 5898
Blocpdb> 71 atoms in block 85
Block first atom: 5947
Blocpdb> 72 atoms in block 86
Block first atom: 6018
Blocpdb> 77 atoms in block 87
Block first atom: 6090
Blocpdb> 74 atoms in block 88
Block first atom: 6167
Blocpdb> 75 atoms in block 89
Block first atom: 6241
Blocpdb> 75 atoms in block 90
Block first atom: 6316
Blocpdb> 78 atoms in block 91
Block first atom: 6391
Blocpdb> 62 atoms in block 92
Block first atom: 6469
Blocpdb> 76 atoms in block 93
Block first atom: 6531
Blocpdb> 83 atoms in block 94
Block first atom: 6607
Blocpdb> 77 atoms in block 95
Block first atom: 6690
Blocpdb> 77 atoms in block 96
Block first atom: 6767
Blocpdb> 76 atoms in block 97
Block first atom: 6844
Blocpdb> 73 atoms in block 98
Block first atom: 6920
Blocpdb> 72 atoms in block 99
Block first atom: 6993
Blocpdb> 64 atoms in block 100
Block first atom: 7065
Blocpdb> 76 atoms in block 101
Block first atom: 7129
Blocpdb> 73 atoms in block 102
Block first atom: 7205
Blocpdb> 62 atoms in block 103
Block first atom: 7278
Blocpdb> 79 atoms in block 104
Block first atom: 7340
Blocpdb> 77 atoms in block 105
Block first atom: 7419
Blocpdb> 76 atoms in block 106
Block first atom: 7496
Blocpdb> 68 atoms in block 107
Block first atom: 7572
Blocpdb> 79 atoms in block 108
Block first atom: 7640
Blocpdb> 69 atoms in block 109
Block first atom: 7719
Blocpdb> 74 atoms in block 110
Block first atom: 7788
Blocpdb> 68 atoms in block 111
Block first atom: 7862
Blocpdb> 67 atoms in block 112
Block first atom: 7930
Blocpdb> 60 atoms in block 113
Block first atom: 7997
Blocpdb> 71 atoms in block 114
Block first atom: 8057
Blocpdb> 66 atoms in block 115
Block first atom: 8128
Blocpdb> 73 atoms in block 116
Block first atom: 8194
Blocpdb> 66 atoms in block 117
Block first atom: 8267
Blocpdb> 68 atoms in block 118
Block first atom: 8333
Blocpdb> 70 atoms in block 119
Block first atom: 8401
Blocpdb> 68 atoms in block 120
Block first atom: 8471
Blocpdb> 77 atoms in block 121
Block first atom: 8539
Blocpdb> 65 atoms in block 122
Block first atom: 8616
Blocpdb> 67 atoms in block 123
Block first atom: 8681
Blocpdb> 67 atoms in block 124
Block first atom: 8748
Blocpdb> 81 atoms in block 125
Block first atom: 8815
Blocpdb> 82 atoms in block 126
Block first atom: 8896
Blocpdb> 75 atoms in block 127
Block first atom: 8978
Blocpdb> 75 atoms in block 128
Block first atom: 9053
Blocpdb> 73 atoms in block 129
Block first atom: 9128
Blocpdb> 66 atoms in block 130
Block first atom: 9201
Blocpdb> 78 atoms in block 131
Block first atom: 9267
Blocpdb> 62 atoms in block 132
Block first atom: 9345
Blocpdb> 81 atoms in block 133
Block first atom: 9407
Blocpdb> 81 atoms in block 134
Block first atom: 9488
Blocpdb> 78 atoms in block 135
Block first atom: 9569
Blocpdb> 76 atoms in block 136
Block first atom: 9647
Blocpdb> 78 atoms in block 137
Block first atom: 9723
Blocpdb> 70 atoms in block 138
Block first atom: 9801
Blocpdb> 72 atoms in block 139
Block first atom: 9871
Blocpdb> 67 atoms in block 140
Block first atom: 9943
Blocpdb> 63 atoms in block 141
Block first atom: 10010
Blocpdb> 66 atoms in block 142
Block first atom: 10073
Blocpdb> 77 atoms in block 143
Block first atom: 10139
Blocpdb> 63 atoms in block 144
Block first atom: 10216
Blocpdb> 73 atoms in block 145
Block first atom: 10279
Blocpdb> 68 atoms in block 146
Block first atom: 10352
Blocpdb> 80 atoms in block 147
Block first atom: 10420
Blocpdb> 74 atoms in block 148
Block first atom: 10500
Blocpdb> 81 atoms in block 149
Block first atom: 10574
Blocpdb> 89 atoms in block 150
Block first atom: 10655
Blocpdb> 79 atoms in block 151
Block first atom: 10744
Blocpdb> 85 atoms in block 152
Block first atom: 10823
Blocpdb> 74 atoms in block 153
Block first atom: 10908
Blocpdb> 64 atoms in block 154
Block first atom: 10982
Blocpdb> 57 atoms in block 155
Block first atom: 11046
Blocpdb> 74 atoms in block 156
Block first atom: 11103
Blocpdb> 64 atoms in block 157
Block first atom: 11177
Blocpdb> 67 atoms in block 158
Block first atom: 11241
Blocpdb> 66 atoms in block 159
Block first atom: 11308
Blocpdb> 73 atoms in block 160
Block first atom: 11374
Blocpdb> 69 atoms in block 161
Block first atom: 11447
Blocpdb> 60 atoms in block 162
Block first atom: 11516
Blocpdb> 69 atoms in block 163
Block first atom: 11576
Blocpdb> 53 atoms in block 164
Block first atom: 11645
Blocpdb> 52 atoms in block 165
Block first atom: 11698
Blocpdb> 55 atoms in block 166
Block first atom: 11750
Blocpdb> 75 atoms in block 167
Block first atom: 11805
Blocpdb> 82 atoms in block 168
Block first atom: 11880
Blocpdb> 67 atoms in block 169
Block first atom: 11962
Blocpdb> 75 atoms in block 170
Block first atom: 12029
Blocpdb> 67 atoms in block 171
Block first atom: 12104
Blocpdb> 79 atoms in block 172
Block first atom: 12171
Blocpdb> 72 atoms in block 173
Block first atom: 12250
Blocpdb> 67 atoms in block 174
Block first atom: 12322
Blocpdb> 67 atoms in block 175
Block first atom: 12389
Blocpdb> 68 atoms in block 176
Block first atom: 12456
Blocpdb> 71 atoms in block 177
Block first atom: 12524
Blocpdb> 73 atoms in block 178
Block first atom: 12595
Blocpdb> 84 atoms in block 179
Block first atom: 12668
Blocpdb> 75 atoms in block 180
Block first atom: 12752
Blocpdb> 78 atoms in block 181
Block first atom: 12827
Blocpdb> 82 atoms in block 182
Block first atom: 12905
Blocpdb> 73 atoms in block 183
Block first atom: 12987
Blocpdb> 58 atoms in block 184
Block first atom: 13060
Blocpdb> 69 atoms in block 185
Block first atom: 13118
Blocpdb> 60 atoms in block 186
Block first atom: 13187
Blocpdb> 76 atoms in block 187
Block first atom: 13247
Blocpdb> 63 atoms in block 188
Block first atom: 13323
Blocpdb> 6 atoms in block 189
Block first atom: 13386
Blocpdb> 100 atoms in block 190
Block first atom: 13392
Blocpdb> 88 atoms in block 191
Block first atom: 13491
Blocpdb> 191 blocks.
Blocpdb> At most, 100 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5250289 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 40737
Prepmat> Matrix trace = 11487820.0000
Prepmat> Last element read: 40737 40737 310.8153
Prepmat> 18337 lines saved.
Prepmat> 16775 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13579
RTB> Total mass = 13579.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 13579
RTB> Number of blocks = 191
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 187758.9574
RTB> 53331 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1146
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53331
Diagstd> Projected matrix trace = 187758.9574
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1146 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 187758.9574
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0262610 1.2387722 1.3721404 1.9291468
2.1942344 2.4912441 2.7104947 2.9614231 3.1694354
3.5358838 3.9096522 4.1410748 4.2842603 4.5613968
4.8418795 5.2071367 5.4021528 5.4828950 5.6984124
6.1661141 6.2968685 6.4687496 6.6273646 6.8381072
7.1646625 7.7190035 7.8655545 8.1300593 8.5667828
8.7807234 9.1533612 9.4567001 9.6411498 10.2993664
10.4199019 10.6370903 10.9250636 11.2869491 11.6241859
11.8605233 12.2150609 12.3067725 12.8106532 13.1868618
13.6915338 14.1611589 14.3972028 14.5653976 14.9218243
15.2361636 15.4333184 15.6374298 15.9096701 16.6780661
16.7536697 16.8535659 17.5974431 17.8200821 18.1273731
18.2498634 18.4366438 18.8153967 19.0698136 19.6416978
20.1179942 20.3811283 20.6792637 20.9856416 21.3502387
21.4782523 21.7612589 22.5608278 22.5848754 22.6874760
23.0534433 23.5426444 23.6458932 23.8214064 24.3725124
24.6636037 25.2972029 25.5657394 26.0072746 26.0612966
26.8543970 27.0410530 27.3585411 27.5450229 27.7864057
28.2223868 28.3714445 29.2371192 29.4712794 29.8467578
29.9888811 30.2239746 30.7386413 30.9636333 31.4014769
32.0206985
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034332 0.0034334 0.0034340 0.0034346
0.0034357 110.0079830 120.8623403 127.2021789 150.8265931
160.8558250 171.3970803 178.7802581 186.8725486 193.3242043
204.1946094 214.7159672 220.9794153 224.7673400 231.9232064
238.9473771 247.7962740 252.3938165 254.2729985 259.2222153
269.6503936 272.4944071 276.1884111 279.5540015 283.9639654
290.6652727 301.7004090 304.5509463 309.6293613 317.8367843
321.7810234 328.5379784 333.9374211 337.1783609 348.4981961
350.5315353 354.1658675 358.9279399 364.8241362 370.2342171
373.9789914 379.5273681 380.9494644 388.6699083 394.3356187
401.8105471 408.6435783 412.0352208 414.4350251 419.4751530
423.8704038 426.6040142 429.4157479 433.1375822 443.4739621
444.4779843 445.8011476 455.5332314 458.4058279 462.3413289
463.9007659 466.2686461 471.0336897 474.2075934 481.2655693
487.0657815 490.2407322 493.8133383 497.4579846 501.7607056
503.2627083 506.5674595 515.7898550 516.0646718 517.2355557
521.3905806 526.8935739 528.0476834 530.0037948 536.0995342
539.2914645 546.1746412 549.0658835 553.7869302 554.3617920
562.7337763 564.6860768 567.9913834 569.9238727 572.4156069
576.8888568 578.4102812 587.1682577 589.5148852 593.2583522
594.6691530 596.9955142 602.0570052 604.2563705 608.5136404
614.4841445
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13579
Rtb_to_modes> Number of blocs = 191
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.026
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.239
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.929
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.710
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.961
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.169
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.910
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.141
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.842
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.207
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.402
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.483
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.698
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.166
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.469
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.719
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.866
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.567
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.781
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.153
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.457
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.641
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
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0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 244422 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003
0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610042303102405003.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610042303102405003.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610042303102405003.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610042303102405003.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1692
First residue number = 132
Last residue number = 17
Number of atoms found = 13579
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.026
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.239
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.169
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.910
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.141
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.842
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.483
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02
Bfactors> 106 vectors, 40737 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.026000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.695 for 1675 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.015 +/- 0.02
Bfactors> = 123.347 +/- 25.36
Bfactors> Shiftng-fct= 123.333
Bfactors> Scaling-fct= 1088.132
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610042303102405003.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610042303102405003.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Chkmod> 106 vectors, 40737 coordinates in file.
Chkmod> That is: 13579 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9837
0.0034 0.9295
0.0034 0.7579
0.0034 0.7495
0.0034 0.6912
0.0034 0.8699
109.9893 0.4641
120.8683 0.4368
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 16 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
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MODEL 13 will be plotted
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getting mode 8
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
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MODEL 13 will be plotted
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getting mode 9
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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2610042303102405003.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2610042303102405003.10.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610042303102405003 11 -150 150 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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2610042303102405003.eigenfacs
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MODEL 10 will be plotted
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MODEL 10 will be plotted
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MODEL 10 will be plotted
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MODEL 4 will be plotted
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MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 16
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
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