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***  GTP-BINDING 21-JAN-97 1MH1  ***

LOGs for ID: 2610071816113154659

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610071816113154659.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610071816113154659.atom to be opened. Openam> File opened: 2610071816113154659.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 183 First residue number = 1 Last residue number = 181 Number of atoms found = 1395 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 4.484504 +/- 10.299528 From: -22.115000 To: 27.450000 = 34.837938 +/- 9.044765 From: 7.473000 To: 57.151000 = 10.052948 +/- 7.886004 From: -7.874000 To: 28.903000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.7415 % Filled. Pdbmat> 502913 non-zero elements. Pdbmat> 54962 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.80 +/- 24.34 Maximum number = 132 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.099240E+06 Pdbmat> Larger element = 474.602 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 183 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610071816113154659.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610071816113154659.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610071816113154659.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1395 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 183 residues. Blocpdb> 4 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 6 atoms in block 2 Block first atom: 5 Blocpdb> 7 atoms in block 3 Block first atom: 11 Blocpdb> 9 atoms in block 4 Block first atom: 18 Blocpdb> 5 atoms in block 5 Block first atom: 27 Blocpdb> 8 atoms in block 6 Block first atom: 32 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 40 Blocpdb> 6 atoms in block 8 Block first atom: 49 Blocpdb> 10 atoms in block 9 Block first atom: 55 Blocpdb> 7 atoms in block 10 Block first atom: 65 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 72 Blocpdb> 4 atoms in block 12 Block first atom: 79 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 83 Blocpdb> 4 atoms in block 14 Block first atom: 91 Blocpdb> 5 atoms in block 15 Block first atom: 95 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 100 Blocpdb> 4 atoms in block 17 Block first atom: 107 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 111 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 120 Blocpdb> 6 atoms in block 20 Block first atom: 127 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 133 Blocpdb> 8 atoms in block 22 Block first atom: 141 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 149 Blocpdb> 6 atoms in block 24 Block first atom: 157 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 163 Blocpdb> 7 atoms in block 26 Block first atom: 175 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 182 Blocpdb> 8 atoms in block 28 Block first atom: 189 Blocpdb> 5 atoms in block 29 Block first atom: 197 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 202 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 213 Blocpdb> 4 atoms in block 32 Block first atom: 220 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 224 Blocpdb> 5 atoms in block 34 Block first atom: 233 Blocpdb> 5 atoms in block 35 Block first atom: 238 Blocpdb> 7 atoms in block 36 Block first atom: 243 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 250 Blocpdb> 5 atoms in block 38 Block first atom: 257 Blocpdb> 11 atoms in block 39 Block first atom: 262 Blocpdb> 8 atoms in block 40 Block first atom: 273 Blocpdb> 8 atoms in block 41 Block first atom: 281 Blocpdb> 12 atoms in block 42 Block first atom: 289 Blocpdb> 6 atoms in block 43 Block first atom: 301 Blocpdb> 5 atoms in block 44 Block first atom: 307 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 312 Blocpdb> 10 atoms in block 46 Block first atom: 320 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 330 Blocpdb> 7 atoms in block 48 Block first atom: 338 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 345 Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 353 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 357 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 366 Blocpdb> 7 atoms in block 53 Block first atom: 373 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 380 Blocpdb> 8 atoms in block 55 Block first atom: 388 Blocpdb> 4 atoms in block 56 Block first atom: 396 Blocpdb> 8 atoms in block 57 Block first atom: 400 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 408 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 422 Blocpdb> 7 atoms in block 60 Block first atom: 430 Blocpdb> 5 atoms in block 61 Block first atom: 437 Blocpdb> 4 atoms in block 62 Block first atom: 442 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 446 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 455 Blocpdb> 8 atoms in block 65 Block first atom: 464 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 472 Blocpdb> 8 atoms in block 67 Block first atom: 484 Blocpdb> 11 atoms in block 68 Block first atom: 492 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 503 Blocpdb> 11 atoms in block 70 Block first atom: 511 Blocpdb> 7 atoms in block 71 Block first atom: 522 Blocpdb> 8 atoms in block 72 Block first atom: 529 Blocpdb> 6 atoms in block 73 Block first atom: 537 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 543 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 555 Blocpdb> 9 atoms in block 76 Block first atom: 562 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 571 Blocpdb> 8 atoms in block 78 Block first atom: 578 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 586 Blocpdb> 6 atoms in block 80 Block first atom: 593 Blocpdb> 8 atoms in block 81 Block first atom: 599 Blocpdb> 8 atoms in block 82 Block first atom: 607 Blocpdb> 6 atoms in block 83 Block first atom: 615 Blocpdb> 11 atoms in block 84 Block first atom: 621 Blocpdb> 6 atoms in block 85 Block first atom: 632 Blocpdb> 8 atoms in block 86 Block first atom: 638 Blocpdb> 7 atoms in block 87 Block first atom: 646 Blocpdb> 6 atoms in block 88 Block first atom: 653 Blocpdb> 7 atoms in block 89 Block first atom: 659 Blocpdb> 5 atoms in block 90 Block first atom: 666 Blocpdb> 6 atoms in block 91 Block first atom: 671 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 677 Blocpdb> 9 atoms in block 93 Block first atom: 688 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 697 Blocpdb> 7 atoms in block 95 Block first atom: 705 Blocpdb> 11 atoms in block 96 Block first atom: 712 Blocpdb> 5 atoms in block 97 Block first atom: 723 Blocpdb> 9 atoms in block 98 Block first atom: 728 Blocpdb> 14 atoms in block 99 Block first atom: 737 Blocpdb> 12 atoms in block 100 Block first atom: 751 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 763 Blocpdb> 9 atoms in block 102 Block first atom: 770 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 779 Blocpdb> 11 atoms in block 104 Block first atom: 786 Blocpdb> 10 atoms in block 105 Block first atom: 797 Blocpdb> 10 atoms in block 106 Block first atom: 807 Blocpdb> 6 atoms in block 107 Block first atom: 817 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 823 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 830 Blocpdb> 7 atoms in block 110 Block first atom: 838 Blocpdb> 7 atoms in block 111 Block first atom: 845 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 852 Blocpdb> 8 atoms in block 113 Block first atom: 860 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 868 Blocpdb> 7 atoms in block 115 Block first atom: 876 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 883 Blocpdb> 7 atoms in block 117 Block first atom: 887 Blocpdb> 9 atoms in block 118 Block first atom: 894 Blocpdb> 8 atoms in block 119 Block first atom: 903 Blocpdb> 8 atoms in block 120 Block first atom: 911 Blocpdb> 8 atoms in block 121 Block first atom: 919 Blocpdb> 11 atoms in block 122 Block first atom: 927 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 938 Blocpdb> 8 atoms in block 124 Block first atom: 946 Blocpdb> 5 atoms in block 125 Block first atom: 954 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 959 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 967 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 974 Blocpdb> 5 atoms in block 129 Block first atom: 982 Blocpdb> 5 atoms in block 130 Block first atom: 987 Blocpdb> 8 atoms in block 131 Block first atom: 992 Blocpdb> 7 atoms in block 132 Block first atom: 1000 Blocpdb> 6 atoms in block 133 Block first atom: 1007 Blocpdb> 6 atoms in block 134 Block first atom: 1013 Blocpdb> 5 atoms in block 135 Block first atom: 1019 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1024 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 1032 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1042 Blocpdb> 8 atoms in block 139 Block first atom: 1049 Blocpdb> 7 atoms in block 140 Block first atom: 1057 Blocpdb> 12 atoms in block 141 Block first atom: 1064 Blocpdb> 7 atoms in block 142 Block first atom: 1076 Blocpdb> 9 atoms in block 143 Block first atom: 1083 Blocpdb> 4 atoms in block 144 Block first atom: 1092 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1096 Blocpdb> 5 atoms in block 146 Block first atom: 1104 Blocpdb> 8 atoms in block 147 Block first atom: 1109 Blocpdb> 5 atoms in block 148 Block first atom: 1117 Blocpdb> 9 atoms in block 149 Block first atom: 1122 Blocpdb> 9 atoms in block 150 Block first atom: 1131 Blocpdb> 8 atoms in block 151 Block first atom: 1140 Blocpdb> 4 atoms in block 152 Block first atom: 1148 Blocpdb> 5 atoms in block 153 Block first atom: 1152 Blocpdb> 10 atoms in block 154 Block first atom: 1157 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 1167 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 1181 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1193 Blocpdb> 9 atoms in block 158 Block first atom: 1201 Blocpdb> 6 atoms in block 159 Block first atom: 1210 Blocpdb> 6 atoms in block 160 Block first atom: 1216 Blocpdb> 5 atoms in block 161 Block first atom: 1222 Blocpdb> 8 atoms in block 162 Block first atom: 1227 Blocpdb> 7 atoms in block 163 Block first atom: 1235 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 1242 Blocpdb> 11 atoms in block 165 Block first atom: 1251 Blocpdb> 4 atoms in block 166 Block first atom: 1262 Blocpdb> 8 atoms in block 167 Block first atom: 1266 Blocpdb> 9 atoms in block 168 Block first atom: 1274 Blocpdb> 7 atoms in block 169 Block first atom: 1283 Blocpdb> 7 atoms in block 170 Block first atom: 1290 Blocpdb> 11 atoms in block 171 Block first atom: 1297 Blocpdb> 8 atoms in block 172 Block first atom: 1308 Blocpdb> 9 atoms in block 173 Block first atom: 1316 Blocpdb> 5 atoms in block 174 Block first atom: 1325 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 1330 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 1338 Blocpdb> 5 atoms in block 177 Block first atom: 1349 Blocpdb> 7 atoms in block 178 Block first atom: 1354 Blocpdb> 8 atoms in block 179 Block first atom: 1361 Blocpdb> 6 atoms in block 180 Block first atom: 1369 Blocpdb> 7 atoms in block 181 Block first atom: 1375 Blocpdb> 7 atoms in block 182 Block first atom: 1382 Blocpdb> 7 atoms in block 183 Block first atom: 1388 Blocpdb> 183 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 503096 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4185 Prepmat> Matrix trace = 1099240.0000 Prepmat> Last element read: 4185 4185 50.1343 Prepmat> 16837 lines saved. Prepmat> 14526 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1395 RTB> Total mass = 1395.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1395 RTB> Number of blocks = 183 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 261729.3986 RTB> 80415 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1098 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80415 Diagstd> Projected matrix trace = 261729.3986 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1098 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 261729.3986 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0809185 3.2239784 3.5592454 3.7675599 4.3980223 4.6971033 6.0638602 6.5844069 6.9048467 7.7655779 9.0609130 10.5499439 10.7016491 11.2024978 11.4292659 12.7050948 13.8690671 15.6215293 16.4660415 17.6539976 18.1659891 19.1401911 20.1056345 20.4469188 21.5206677 22.4330371 22.9657686 24.2046383 24.8778070 25.3494363 25.6040264 26.6125819 28.1770129 28.9229560 29.4075947 30.3417112 31.1732139 31.2502487 32.5127652 33.4872049 34.1886007 35.0314908 35.4420901 35.7828031 36.8209362 37.6892832 38.1524740 39.1021708 39.5012735 40.1951138 40.9487737 41.4487009 42.5829853 42.8822966 43.3635853 43.6342070 44.6375628 45.4791730 45.9453166 46.9454189 47.1462120 48.4718624 49.3666802 49.7025343 50.4050240 50.8925651 51.5231478 51.8249912 52.7066816 54.0717326 54.7796852 55.8153182 55.9625052 56.6603127 57.2403378 57.7448529 58.9793293 60.2176598 61.1351580 61.2764300 62.2078736 63.0771490 63.1762580 63.3630766 64.2270064 64.4506446 65.7538047 66.3421799 66.7034035 67.6056791 68.0594793 68.2461792 69.6815772 71.0423741 71.7338604 71.8859446 72.4781894 72.9952953 73.5551332 73.8424288 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034337 0.0034338 0.0034345 0.0034348 156.6472629 194.9805741 204.8680569 210.7780409 227.7319662 235.3479047 267.4052126 278.6465120 285.3463362 302.6092301 326.8746652 352.7120972 355.2389955 363.4567286 367.1169599 387.0652968 404.4072240 429.1973717 440.6460521 456.2646395 462.8335210 475.0818238 486.9161421 491.0313448 503.7593865 514.3269925 520.3981841 534.2500587 541.6282747 546.7382190 549.4768676 560.1944290 576.4249299 584.0050721 588.8775972 598.1571739 606.2979081 607.0465835 619.1875771 628.3979071 634.9447597 642.7241077 646.4797751 649.5797231 658.9351785 666.6597254 670.7437473 679.0405571 682.4971288 688.4650710 694.8894694 699.1184154 708.6198810 711.1059266 715.0853349 717.3132025 725.5135324 732.3211207 736.0645542 744.0324715 745.6219466 756.0319229 762.9783973 765.5693660 770.9606162 774.6801906 779.4647403 781.7446160 788.3664195 798.5101174 803.7205010 811.2822662 812.3512519 817.4002456 821.5734085 825.1861310 833.9599510 842.6693873 849.0647281 850.0451776 856.4814446 862.4448004 863.1220856 864.3973138 870.2702158 871.7840376 880.5534521 884.4843420 886.8890181 892.8672019 895.8588563 897.0867687 906.4717340 915.2800861 919.7237087 920.6981533 924.4830397 927.7751057 931.3260987 933.1431380 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1395 Rtb_to_modes> Number of blocs = 183 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.905 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.061 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.84 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1098 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99996 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 25110 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99996 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610071816113154659.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610071816113154659.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610071816113154659.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610071816113154659.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 183 First residue number = 1 Last residue number = 181 Number of atoms found = 1395 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.905 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.84 Bfactors> 106 vectors, 4185 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.081000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.419 for 183 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.053 +/- 0.16 Bfactors> = 14.365 +/- 9.08 Bfactors> Shiftng-fct= 14.312 Bfactors> Scaling-fct= 55.501 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610071816113154659.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610071816113154659.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0 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Chkmod> That is: 1395 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 34 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 50 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 56 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 66 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8208 0.0034 0.9705 0.0034 0.9468 0.0034 0.9552 0.0034 0.6925 0.0034 0.7574 156.6436 0.0167 194.9729 0.2052 204.8522 0.0518 210.7813 0.0460 227.7216 0.1000 235.3352 0.0404 267.3968 0.1258 278.6259 0.1337 285.3373 0.0892 302.6045 0.1375 326.8622 0.2121 352.6979 0.2350 355.1964 0.1468 363.4006 0.1380 367.1130 0.1193 387.1234 0.1763 404.4035 0.1317 429.1579 0.2828 440.6801 0.2676 456.1934 0.3933 462.8647 0.3592 475.0591 0.3520 486.9481 0.2860 491.0473 0.3617 503.7299 0.3854 514.2701 0.1085 520.4238 0.5859 534.1759 0.1346 541.6289 0.2711 546.7208 0.1237 549.4101 0.4061 560.1432 0.4287 576.4307 0.3793 583.9502 0.1812 588.8764 0.3581 598.1146 0.4221 606.2406 0.1094 607.0181 0.3956 619.1347 0.0728 628.3972 0.3028 634.9305 0.4456 642.6828 0.2388 646.4330 0.1592 649.5264 0.2956 658.8985 0.1381 666.6374 0.1234 670.6932 0.2194 678.9926 0.0438 682.4568 0.2620 688.4774 0.1430 694.8700 0.1675 699.0994 0.1023 708.5646 0.1791 711.0564 0.2436 715.0251 0.1812 717.2478 0.1661 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610071816113154659.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610071816113154659 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610071816113154659.eigenfacs 2610071816113154659.atom making animated gifs 11 models are in 2610071816113154659.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610071816113154659.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610071816113154659.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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