*** Vv N133C DHK ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610082102113386154.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610082102113386154.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610082102113386154.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2544
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 38.187149 +/- 13.600527 From: 8.736000 To: 71.256000
= 37.018336 +/- 9.176368 From: 10.564000 To: 62.556000
= 34.749119 +/- 11.222497 From: 8.307000 To: 58.179000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1438 % Filled.
Pdbmat> 915715 non-zero elements.
Pdbmat> 100069 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.67 +/- 21.07
Maximum number = 131
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.001380E+06
Pdbmat> Larger element = 475.552
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
324 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610082102113386154.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610082102113386154.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610082102113386154.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2544 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 324 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 53
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 63
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 82
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 92
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 114
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 129
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 148
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 180
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 199
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 229
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 262
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 328
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 344
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 360
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 376
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 390
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 407
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 422
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 444
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 458
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 474
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 487
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 500
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 517
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 534
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 547
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 560
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 573
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 584
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 605
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 617
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 631
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 647
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 667
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 682
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 714
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 730
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 747
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 761
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 778
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 790
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 802
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 818
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 833
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 844
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 854
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 870
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 907
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 925
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 938
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 949
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 960
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 973
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 990
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1009
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1026
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1040
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1060
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1075
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1095
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1109
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1126
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1143
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1159
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1177
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1192
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1211
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1231
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1249
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1264
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1279
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1293
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1307
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1326
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1347
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1361
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1378
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1394
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1413
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1428
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1444
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1458
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1473
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1484
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1502
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1518
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1530
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1545
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1558
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1574
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1586
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1600
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1615
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1626
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1643
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1658
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1676
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1692
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1712
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1725
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1743
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1761
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1777
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1791
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1804
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1822
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1842
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1862
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1877
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1891
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1904
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 1927
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1941
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1953
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 1971
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1985
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 2001
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2017
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 2031
Blocpdb> 20 atoms in block 132
Block first atom: 2047
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 2067
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2088
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2104
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2124
Blocpdb> 16 atoms in block 137
Block first atom: 2139
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 2155
Blocpdb> 11 atoms in block 139
Block first atom: 2175
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2186
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2203
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2219
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2234
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2247
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2264
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2279
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2296
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2311
Blocpdb> 20 atoms in block 149
Block first atom: 2323
Blocpdb> 20 atoms in block 150
Block first atom: 2343
Blocpdb> 18 atoms in block 151
Block first atom: 2363
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2381
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2398
Blocpdb> 18 atoms in block 154
Block first atom: 2414
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2432
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2441
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2456
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2469
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2485
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2498
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2514
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2527
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 915877 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7632
Prepmat> Matrix trace = 2001380.0000
Prepmat> Last element read: 7632 7632 76.1488
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11462 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2544
RTB> Total mass = 2544.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2544
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 215858.5977
RTB> 60246 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60246
Diagstd> Projected matrix trace = 215858.5977
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 215858.5977
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.2282426 2.4428994 3.8186118 5.0896228
5.9843015 7.2871644 8.8568185 9.1089840 9.3896517
10.5783129 11.3550739 12.5106476 13.1406572 13.6764552
14.7023953 14.9896939 16.0370520 16.8608068 17.7006674
18.1206492 19.5067368 19.9494269 20.4520548 21.1005733
22.7066780 23.0122148 23.3326531 24.8801093 25.1160479
25.7508626 26.6298061 27.0040923 27.3510279 27.7621909
28.4440697 29.1662012 29.9858037 31.7737498 32.4006978
33.1067181 33.5243580 34.0190928 35.3511772 35.6193081
36.4783057 36.8468300 37.6501894 38.0160664 38.6267819
39.5679901 39.8422686 40.2184369 40.4356336 41.0825906
42.4540258 42.9818715 43.4692441 44.1461664 44.5879881
45.4248280 45.9312266 46.3987993 47.4669263 48.7165645
49.0142063 49.2537362 50.5520266 50.7019195 51.3384230
52.3888324 53.0875277 53.9620687 54.4741542 55.1003024
55.5170098 55.9730224 56.6346181 57.1206708 57.4000072
58.5911160 59.2826365 59.7605561 60.0000087 61.0038582
61.1262333 61.3838793 61.8408137 62.8466885 63.7731400
64.2864230 65.4353112 65.9627672 66.6121851 67.0662931
67.1351832 67.4715457 68.0690189 69.0634289 69.7295640
70.3263330
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034328 0.0034345 0.0034346 0.0034347 0.0034349
0.0034350 162.0975747 169.7258804 212.2012969 244.9842029
265.6452256 293.1396501 323.1723180 327.7406037 332.7514998
353.1860041 365.9234668 384.0919239 393.6441702 401.5892275
416.3794895 420.4280292 434.8680984 445.8969036 456.8673275
462.2555744 479.6092957 485.0209442 491.0930117 498.8183341
517.4543957 520.9241474 524.5384661 541.6533355 544.2155306
551.0502080 560.3756850 564.3000280 567.9133873 572.1661335
579.1501156 586.4557030 594.6386412 612.1100585 618.1195247
624.8177312 628.7464055 633.3687684 645.6500972 648.0940282
655.8622126 659.1668306 666.3138846 669.5436092 674.9001796
683.0732460 685.4366300 688.6647819 690.5218203 696.0239619
707.5460648 711.9310609 715.9559855 721.5090422 725.1105411
731.8834487 735.9516815 739.6881329 748.1537127 757.9378707
760.2497178 762.1051043 772.0840232 773.2278376 778.0661872
785.9856911 791.2095685 797.6999695 801.4760114 806.0690971
809.1113877 812.4275824 817.2148851 820.7141662 822.7184824
831.2107768 836.1015629 839.4650032 841.1451339 848.1524711
849.0027512 850.7901356 853.9508552 860.8678318 867.1898390
870.6726674 878.4182828 881.9515211 886.2823906 889.2982378
889.7548609 891.9810133 895.9216385 902.4421024 906.7838053
910.6558183
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2544
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.228
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.443
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.819
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.287
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.857
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.109
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.33
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
0.99997 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45792 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
0.99997 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610082102113386154.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610082102113386154.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610082102113386154.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610082102113386154.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2544
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.443
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.287
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.857
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.109
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.33
Bfactors> 106 vectors, 7632 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.228000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.024 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.024
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610082102113386154.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610082102113386154.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.6
Chkmod> 106 vectors, 7632 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2544 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8424
0.0034 0.7475
0.0034 0.8654
0.0034 0.7634
0.0034 0.9763
0.0034 0.7069
162.0818 0.4954
169.7221 0.4618
212.2030 0.3705
244.9828 0.5690
265.6271 0.5135
293.1238 0.1421
323.1618 0.6761
327.7268 0.4499
332.7434 0.5776
353.1990 0.6666
365.9871 0.4961
384.0655 0.3808
393.6174 0.5491
401.6240 0.4075
416.3277 0.4015
420.4143 0.4673
434.8894 0.2896
445.8671 0.5142
456.8391 0.4893
462.2275 0.5571
479.6288 0.2986
485.0071 0.4441
491.0473 0.3148
498.7901 0.2612
517.4700 0.5665
520.8767 0.4066
524.4861 0.3658
541.6289 0.4279
544.2350 0.4425
551.0173 0.4801
560.3537 0.3811
564.2330 0.4457
567.8783 0.4310
572.1190 0.4894
579.0838 0.4074
586.4687 0.4633
594.6547 0.4814
612.0477 0.4099
618.0863 0.4443
624.8219 0.5236
628.6785 0.4046
633.3500 0.2686
645.6116 0.4123
648.0725 0.5729
655.8493 0.3550
659.1669 0.4110
666.2836 0.4825
669.5495 0.4171
674.8993 0.3874
683.0613 0.3837
685.3877 0.4285
688.6486 0.3770
690.5295 0.3762
695.9721 0.4063
707.4821 0.3301
711.8850 0.3737
715.9315 0.5743
721.5094 0.4301
725.0958 0.3662
731.8131 0.3377
735.9103 0.3577
739.6660 0.4398
748.1458 0.4118
757.9321 0.4591
760.1845 0.4583
762.0435 0.4386
772.0354 0.2909
773.1800 0.3555
778.0447 0.4475
785.9607 0.4993
791.1940 0.3921
797.6504 0.5404
801.4110 0.3246
806.0323 0.5174
809.0984 0.3296
812.3708 0.4324
817.1465 0.4599
820.6741 0.4086
822.6831 0.4255
831.1672 0.3266
836.0471 0.5334
839.4251 0.4096
841.1090 0.4814
848.0892 0.3439
848.9925 0.4546
850.7267 0.4602
853.9086 0.4989
860.8536 0.4099
867.1313 0.4069
870.6595 0.4014
878.4120 0.4276
881.8952 0.4034
886.2298 0.3987
889.2846 0.4965
889.7486 0.4368
891.9325 0.5442
895.8896 0.4207
902.3810 0.3680
906.7477 0.4167
910.6405 0.4409
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610082102113386154.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610082102113386154.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610082102113386154.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610082102113386154.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610082102113386154.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610082102113386154.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.6
Projmod> 106 vectors, 7632 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2544
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2544
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2544 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.37
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0188
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.023 Sum= 0.001 q= -1.5567
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.005 Sum= 0.001 q= -0.3513
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.019 Sum= 0.001 q= -1.2828
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.009 Sum= 0.001 q= -0.6462
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.043 Sum= 0.003 q= 3.0018
Vector: 7 F= 162.08 Cos= -0.207 Sum= 0.046 q= -14.2973
Vector: 8 F= 169.72 Cos= 0.043 Sum= 0.048 q= 2.9954
Vector: 9 F= 212.20 Cos= 0.059 Sum= 0.051 q= 4.0771
Vector: 10 F= 244.98 Cos= 0.292 Sum= 0.136 q= 20.1598
Vector: 11 F= 265.63 Cos= 0.154 Sum= 0.160 q= 10.6416
Vector: 12 F= 293.12 Cos= 0.136 Sum= 0.178 q= 9.3973
Vector: 13 F= 323.16 Cos= -0.049 Sum= 0.181 q= -3.3534
Vector: 14 F= 327.73 Cos= -0.132 Sum= 0.198 q= -9.1515
Vector: 15 F= 332.74 Cos= 0.033 Sum= 0.199 q= 2.2497
Vector: 16 F= 353.20 Cos= 0.121 Sum= 0.214 q= 8.3836
Vector: 17 F= 365.99 Cos= 0.057 Sum= 0.217 q= 3.9295
Vector: 18 F= 384.07 Cos= 0.028 Sum= 0.218 q= 1.9367
Vector: 19 F= 393.62 Cos= 0.096 Sum= 0.227 q= 6.6380
Vector: 20 F= 401.62 Cos= -0.003 Sum= 0.227 q= -0.1853
Vector: 21 F= 416.33 Cos= 0.107 Sum= 0.239 q= 7.4212
Vector: 22 F= 420.41 Cos= 0.043 Sum= 0.241 q= 2.9971
Vector: 23 F= 434.89 Cos= 0.033 Sum= 0.242 q= 2.2755
Vector: 24 F= 445.87 Cos= -0.011 Sum= 0.242 q= -0.7363
Vector: 25 F= 456.84 Cos= -0.009 Sum= 0.242 q= -0.6131
Vector: 26 F= 462.23 Cos= 0.041 Sum= 0.244 q= 2.8067
Vector: 27 F= 479.63 Cos= 0.074 Sum= 0.249 q= 5.1073
Vector: 28 F= 485.01 Cos= 0.154 Sum= 0.273 q= 10.6459
Vector: 29 F= 491.05 Cos= -0.097 Sum= 0.282 q= -6.7148
Vector: 30 F= 498.79 Cos= 0.066 Sum= 0.287 q= 4.5695
Vector: 31 F= 517.47 Cos= 0.076 Sum= 0.293 q= 5.2525
Vector: 32 F= 520.88 Cos= -0.035 Sum= 0.294 q= -2.3996
Vector: 33 F= 524.49 Cos= -0.021 Sum= 0.294 q= -1.4228
Vector: 34 F= 541.63 Cos= 0.103 Sum= 0.305 q= 7.1330
Vector: 35 F= 544.23 Cos= 0.072 Sum= 0.310 q= 4.9922
Vector: 36 F= 551.02 Cos= -0.004 Sum= 0.310 q= -0.2861
Vector: 37 F= 560.35 Cos= 0.101 Sum= 0.320 q= 6.9786
Vector: 38 F= 564.23 Cos= 0.009 Sum= 0.320 q= 0.5975
Vector: 39 F= 567.88 Cos= -0.042 Sum= 0.322 q= -2.8894
Vector: 40 F= 572.12 Cos= -0.042 Sum= 0.324 q= -2.8733
Vector: 41 F= 579.08 Cos= 0.064 Sum= 0.328 q= 4.4012
Vector: 42 F= 586.47 Cos= -0.069 Sum= 0.333 q= -4.7431
Vector: 43 F= 594.65 Cos= -0.027 Sum= 0.333 q= -1.8909
Vector: 44 F= 612.05 Cos= 0.016 Sum= 0.334 q= 1.0740
Vector: 45 F= 618.09 Cos= -0.041 Sum= 0.335 q= -2.8477
Vector: 46 F= 624.82 Cos= 0.069 Sum= 0.340 q= 4.7889
Vector: 47 F= 628.68 Cos= -0.091 Sum= 0.348 q= -6.3125
Vector: 48 F= 633.35 Cos= 0.069 Sum= 0.353 q= 4.7518
Vector: 49 F= 645.61 Cos= 0.019 Sum= 0.354 q= 1.3167
Vector: 50 F= 648.07 Cos= 0.007 Sum= 0.354 q= 0.4864
Vector: 51 F= 655.85 Cos= 0.002 Sum= 0.354 q= 0.1411
Vector: 52 F= 659.17 Cos= 0.006 Sum= 0.354 q= 0.3865
Vector: 53 F= 666.28 Cos= -0.071 Sum= 0.359 q= -4.8984
Vector: 54 F= 669.55 Cos= -0.023 Sum= 0.359 q= -1.6074
Vector: 55 F= 674.90 Cos= 0.077 Sum= 0.365 q= 5.2853
Vector: 56 F= 683.06 Cos= 0.031 Sum= 0.366 q= 2.1685
Vector: 57 F= 685.39 Cos= 0.011 Sum= 0.366 q= 0.7326
Vector: 58 F= 688.65 Cos= 0.085 Sum= 0.373 q= 5.8926
Vector: 59 F= 690.53 Cos= -0.025 Sum= 0.374 q= -1.7060
Vector: 60 F= 695.97 Cos= -0.012 Sum= 0.374 q= -0.8437
Vector: 61 F= 707.48 Cos= -0.039 Sum= 0.376 q= -2.7239
Vector: 62 F= 711.89 Cos= 0.088 Sum= 0.383 q= 6.0871
Vector: 63 F= 715.93 Cos= 0.010 Sum= 0.384 q= 0.6816
Vector: 64 F= 721.51 Cos= -0.036 Sum= 0.385 q= -2.4997
Vector: 65 F= 725.10 Cos= 0.061 Sum= 0.389 q= 4.2450
Vector: 66 F= 731.81 Cos= 0.061 Sum= 0.392 q= 4.2462
Vector: 67 F= 735.91 Cos= -0.061 Sum= 0.396 q= -4.2460
Vector: 68 F= 739.67 Cos= 0.034 Sum= 0.397 q= 2.3497
Vector: 69 F= 748.15 Cos= -0.069 Sum= 0.402 q= -4.7856
Vector: 70 F= 757.93 Cos= 0.000 Sum= 0.402 q= 0.0305
Vector: 71 F= 760.18 Cos= -0.090 Sum= 0.410 q= -6.2307
Vector: 72 F= 762.04 Cos= -0.049 Sum= 0.413 q= -3.3574
Vector: 73 F= 772.04 Cos= 0.018 Sum= 0.413 q= 1.2516
Vector: 74 F= 773.18 Cos= -0.057 Sum= 0.416 q= -3.9249
Vector: 75 F= 778.04 Cos= 0.089 Sum= 0.424 q= 6.1285
Vector: 76 F= 785.96 Cos= -0.045 Sum= 0.426 q= -3.1164
Vector: 77 F= 791.19 Cos= -0.013 Sum= 0.426 q= -0.8745
Vector: 78 F= 797.65 Cos= 0.057 Sum= 0.430 q= 3.9639
Vector: 79 F= 801.41 Cos= 0.056 Sum= 0.433 q= 3.8413
Vector: 80 F= 806.03 Cos= 0.033 Sum= 0.434 q= 2.2851
Vector: 81 F= 809.10 Cos= -0.020 Sum= 0.434 q= -1.4115
Vector: 82 F= 812.37 Cos= -0.050 Sum= 0.437 q= -3.4523
Vector: 83 F= 817.15 Cos= -0.006 Sum= 0.437 q= -0.4249
Vector: 84 F= 820.67 Cos= 0.031 Sum= 0.438 q= 2.1081
Vector: 85 F= 822.68 Cos= -0.015 Sum= 0.438 q= -1.0317
Vector: 86 F= 831.17 Cos= 0.041 Sum= 0.440 q= 2.8351
Vector: 87 F= 836.05 Cos= -0.009 Sum= 0.440 q= -0.6160
Vector: 88 F= 839.43 Cos= 0.043 Sum= 0.442 q= 2.9939
Vector: 89 F= 841.11 Cos= -0.018 Sum= 0.442 q= -1.2615
Vector: 90 F= 848.09 Cos= 0.067 Sum= 0.446 q= 4.6228
Vector: 91 F= 848.99 Cos= -0.038 Sum= 0.448 q= -2.6465
Vector: 92 F= 850.73 Cos= 0.045 Sum= 0.450 q= 3.1067
Vector: 93 F= 853.91 Cos= 0.044 Sum= 0.452 q= 3.0666
Vector: 94 F= 860.85 Cos= 0.035 Sum= 0.453 q= 2.3994
Vector: 95 F= 867.13 Cos= -0.002 Sum= 0.453 q= -0.1178
Vector: 96 F= 870.66 Cos= 0.002 Sum= 0.453 q= 0.1671
Vector: 97 F= 878.41 Cos= 0.042 Sum= 0.455 q= 2.9351
Vector: 98 F= 881.90 Cos= -0.034 Sum= 0.456 q= -2.3680
Vector: 99 F= 886.23 Cos= -0.077 Sum= 0.462 q= -5.2970
Vector: 100 F= 889.28 Cos= -0.051 Sum= 0.464 q= -3.5543
Vector: 101 F= 889.75 Cos= 0.014 Sum= 0.465 q= 0.9986
Vector: 102 F= 891.93 Cos= -0.049 Sum= 0.467 q= -3.3717
Vector: 103 F= 895.89 Cos= -0.062 Sum= 0.471 q= -4.2928
Vector: 104 F= 902.38 Cos= -0.016 Sum= 0.471 q= -1.1031
Vector: 105 F= 906.75 Cos= -0.013 Sum= 0.471 q= -0.8776
Vector: 106 F= 910.64 Cos= -0.051 Sum= 0.474 q= -3.5049
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 162.081792
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.29 for mode 10 with F= 244.98 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.085 0.152 0.211 0.248 0.277 0.474
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610082102113386154 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
making animated gifs
11 models are in 2610082102113386154.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 324 1.905 295 1.576
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 324 1.580 314 1.448
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 324 1.289 321 1.246
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 324 1.060 323 1.047
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 324 0.941 324 0.941
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 324 0.971 324 0.971
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 324 1.140 321 1.101
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 324 1.398 315 1.279
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 324 1.705 298 1.399
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 324 2.039 285 1.538
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 324 2.389 268 1.660
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610082102113386154 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
making animated gifs
11 models are in 2610082102113386154.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 324 2.246 275 1.565
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 324 1.907 293 1.485
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 324 1.588 306 1.355
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 324 1.304 317 1.214
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 324 1.084 323 1.072
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 324 0.971 324 0.971
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 324 1.003 324 1.003
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 324 1.167 324 1.167
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 324 1.418 316 1.338
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 324 1.719 302 1.478
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 324 2.048 283 1.589
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610082102113386154 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
making animated gifs
11 models are in 2610082102113386154.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 324 2.166 279 1.478
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 324 1.837 293 1.401
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 324 1.531 306 1.305
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 324 1.263 316 1.170
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 324 1.062 323 1.049
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 324 0.971 324 0.971
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 324 1.021 324 1.021
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 324 1.194 321 1.139
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 324 1.445 315 1.265
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 324 1.742 302 1.358
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 324 2.066 289 1.427
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610082102113386154 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
making animated gifs
11 models are in 2610082102113386154.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 324 2.489 258 1.666
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 324 2.131 277 1.597
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 324 1.787 299 1.496
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 324 1.464 311 1.312
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 324 1.181 320 1.130
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 324 0.971 324 0.971
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 324 0.891 324 0.891
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 324 0.972 322 0.940
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 324 1.181 322 1.149
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 324 1.464 313 1.336
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 324 1.787 297 1.479
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610082102113386154 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610082102113386154.eigenfacs
2610082102113386154.atom
making animated gifs
11 models are in 2610082102113386154.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610082102113386154.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 324 2.283 282 1.669
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 324 1.949 296 1.541
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 324 1.632 311 1.424
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 324 1.345 316 1.232
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 324 1.112 322 1.085
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 324 0.971 324 0.971
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 324 0.965 323 0.950
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 324 1.095 321 1.049
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 324 1.322 313 1.176
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 324 1.605 300 1.279
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 324 1.920 292 1.464
2610082102113386154.10.pdb
2610082102113386154.11.pdb
2610082102113386154.7.pdb
2610082102113386154.8.pdb
2610082102113386154.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m14.291s
user 0m14.182s
sys 0m0.106s
rm: cannot remove '2610082102113386154.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
