*** VvWTDHK ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610090002023416476.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610090002023416476.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610090002023416476.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.062474 +/- 12.472431 From: 10.354000 To: 65.625000
= 37.931205 +/- 11.294495 From: 10.807000 To: 63.668000
= 41.955421 +/- 10.434507 From: 19.422000 To: 67.043000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1421 % Filled.
Pdbmat> 916647 non-zero elements.
Pdbmat> 100169 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.69 +/- 21.88
Maximum number = 127
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 2.003380E+06
Pdbmat> Larger element = 491.275
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
324 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610090002023416476.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610090002023416476.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610090002023416476.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2546 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 324 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 53
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 63
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 82
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 92
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 114
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 129
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 148
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 180
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 199
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 229
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 262
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 328
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 344
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 360
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 376
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 390
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 407
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 422
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 444
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 458
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 474
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 487
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 500
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 517
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 534
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 547
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 560
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 573
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 584
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 605
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 617
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 631
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 647
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 667
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 682
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 714
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 730
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 747
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 761
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 778
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 790
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 802
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 818
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 833
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 844
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 854
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 870
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 907
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 925
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 938
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 949
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 960
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 975
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 992
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1011
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1028
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1042
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1062
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1077
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1097
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1111
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1128
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1145
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1161
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1179
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1194
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1233
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1251
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1266
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1281
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1295
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1309
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1328
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1349
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1363
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1380
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1396
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1415
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1430
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1446
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1460
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1475
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1486
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1504
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1520
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1532
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1547
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1560
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1576
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1588
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1602
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1617
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1628
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1645
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1660
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1678
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1694
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1714
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1727
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1745
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1763
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1779
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1793
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1806
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1824
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1844
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1864
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1879
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1893
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1906
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 1929
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1943
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1955
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 1973
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1987
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 2003
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2019
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 2033
Blocpdb> 20 atoms in block 132
Block first atom: 2049
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 2069
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2090
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2106
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2126
Blocpdb> 16 atoms in block 137
Block first atom: 2141
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 2157
Blocpdb> 11 atoms in block 139
Block first atom: 2177
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2188
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2205
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2221
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2236
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2249
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2266
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2281
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2298
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2313
Blocpdb> 20 atoms in block 149
Block first atom: 2325
Blocpdb> 20 atoms in block 150
Block first atom: 2345
Blocpdb> 18 atoms in block 151
Block first atom: 2365
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2383
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2400
Blocpdb> 18 atoms in block 154
Block first atom: 2416
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2434
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2443
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2458
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2471
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2487
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2500
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2516
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2529
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 916809 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7638
Prepmat> Matrix trace = 2003380.0000
Prepmat> Last element read: 7638 7638 184.6711
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11454 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2546
RTB> Total mass = 2546.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2546
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 215372.5902
RTB> 60534 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60534
Diagstd> Projected matrix trace = 215372.5902
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 215372.5902
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.3994449 2.7146107 4.1471049 5.1142464
5.9294557 7.4917751 8.3596717 9.0662695 9.6745501
9.8987245 10.7731643 11.2251360 11.8161108 12.6456401
13.2506202 13.8878454 14.8100715 15.5129210 15.8219593
16.5995522 16.8348643 17.8552201 18.1013317 19.0485703
19.8119981 20.2574980 21.4560337 21.7552917 22.2950650
23.2983916 23.6510446 24.9361280 25.4525554 26.2878911
26.8102873 27.7248342 28.7297923 29.9984646 30.2995885
30.4608852 31.6174900 32.3910681 32.8225954 33.1439937
34.2549690 34.6763710 35.3571867 36.2281358 36.5538855
37.6326771 38.7938064 38.9775382 39.6832388 40.0505372
40.2058715 41.8775856 42.3512821 42.5051273 43.0042285
43.6688697 43.9588989 44.5242010 45.3085635 45.4978219
46.0692468 47.5058653 47.5629010 47.8230152 48.1019426
49.4006547 49.7506092 50.2060448 51.6417071 52.3255124
52.5737726 52.7026178 53.2710165 54.4075562 55.3191816
56.0552365 56.5986674 57.5626343 58.1795352 58.6656043
59.3027945 59.6347599 60.1597291 60.6124422 61.4458349
61.5987908 62.0457692 63.1294345 63.7634712 64.0902798
64.6388457 65.5348303 65.8815953 66.0617917 66.8850075
67.3096087
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034333 0.0034342 0.0034347 0.0034347
0.0034353 168.2095578 178.9159509 221.1402469 245.5761047
264.4251114 297.2265803 313.9712560 326.9712679 337.7619084
341.6527322 356.4239856 363.8237831 373.2781408 386.1585807
395.2877751 404.6809087 417.9014301 427.7027779 431.9419771
442.4288783 445.5537367 458.8575529 462.0091141 473.9433925
483.3474364 488.7515888 503.0023353 506.4980013 512.7428962
524.1532114 528.1051998 542.2627717 547.8491299 556.7665736
562.2714263 571.7810519 582.0516486 594.7641646 597.7418257
599.3307214 610.6030587 618.0276630 622.1308536 625.1693805
635.5607516 639.4581110 645.7049728 653.6093766 656.5413048
666.1589046 676.3577599 677.9575212 684.0673077 687.2257965
688.5571945 702.7261225 706.6893742 707.9717704 712.1161918
717.5980596 719.9770993 724.5916873 730.9462242 732.4712511
737.0565949 748.4605196 748.9096868 750.9547306 753.1415157
763.2408954 765.9395259 769.4373872 780.3610334 785.5105555
787.3717913 788.3360267 792.5757350 800.9859350 807.6685155
813.0240168 816.9554666 823.8831306 828.2861585 831.7389782
836.2437018 838.5809988 842.2639568 845.4271136 851.2193847
852.2781875 855.3647857 862.8021724 867.1240987 869.3434054
873.0559499 879.0860123 881.4087018 882.6132731 888.0955015
890.9099577
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2546
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.399
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.715
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.929
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.492
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.675
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.899
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.31
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003
0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001
1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45828 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003
0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001
1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090002023416476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090002023416476.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610090002023416476.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090002023416476.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.399
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.715
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.492
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.675
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.899
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.31
Bfactors> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.399000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.025 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.025
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090002023416476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090002023416476.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Chkmod> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2546 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7882
0.0034 0.7092
0.0034 0.7990
0.0034 0.7908
0.0034 0.7722
0.0034 0.9391
168.1867 0.5035
178.9211 0.4105
221.1280 0.3802
245.5596 0.5777
264.4036 0.4198
297.2183 0.2498
313.9639 0.2038
326.9524 0.6056
337.7553 0.2981
341.6428 0.3892
356.3563 0.0790
363.8870 0.6608
373.3235 0.2583
386.2086 0.4246
395.2616 0.3039
404.6949 0.3183
417.8825 0.3416
427.6442 0.2408
431.8967 0.3844
442.4159 0.3755
445.4702 0.4310
458.8993 0.1717
461.9723 0.3696
473.9408 0.3632
483.3023 0.5034
488.7608 0.4224
503.0272 0.3136
506.5311 0.5140
512.7776 0.2976
524.1488 0.4591
528.0709 0.4878
542.2816 0.2713
547.7981 0.4368
556.7650 0.5108
562.2443 0.4976
571.7067 0.4709
582.0288 0.5265
594.7539 0.4624
597.7202 0.4313
599.2963 0.3615
610.6011 0.0948
617.9909 0.5557
622.0796 0.3782
625.1049 0.3863
635.4874 0.3018
639.4641 0.3839
645.7029 0.4098
653.5981 0.2915
656.4782 0.4441
666.1066 0.4316
676.2955 0.4984
677.9498 0.4775
684.0100 0.4117
687.1917 0.3700
688.5630 0.5308
702.7162 0.4212
706.6483 0.4640
707.9820 0.5138
712.0506 0.4062
717.5765 0.3318
719.9552 0.4486
724.5264 0.3877
730.9264 0.2639
732.4573 0.2738
737.0310 0.4293
748.4610 0.2976
748.8547 0.3506
750.8988 0.4247
753.0940 0.5149
763.2031 0.4364
765.9020 0.4355
769.4347 0.5103
780.3146 0.5854
785.5105 0.5111
787.3097 0.4377
788.2826 0.4113
792.5342 0.4413
800.9695 0.4725
807.6398 0.3291
813.0237 0.4927
816.9300 0.4703
823.8289 0.2960
828.2539 0.3712
831.7344 0.4381
836.1881 0.4095
838.5115 0.3543
842.2297 0.3176
845.3738 0.4820
851.2117 0.4202
852.2500 0.4526
855.3572 0.5310
862.7690 0.4636
867.0633 0.4781
869.3042 0.4557
873.0263 0.4490
879.0159 0.3570
881.3602 0.3710
882.5634 0.3834
888.0905 0.4371
890.8743 0.3964
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610090002023416476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090002023416476.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610090002023416476.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090002023416476.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610090002023416476.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610090002023416476.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Projmod> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2546 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.47
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.010 Sum= 0.000 q= 0.7103
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.010 Sum= 0.000 q= 0.7142
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.004 Sum= 0.000 q= -0.3062
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.013 Sum= 0.000 q= 0.9955
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.006 Sum= 0.000 q= -0.4774
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.017 Sum= 0.001 q= -1.2541
Vector: 7 F= 168.19 Cos= -0.124 Sum= 0.016 q= -9.1975
Vector: 8 F= 178.92 Cos= -0.223 Sum= 0.066 q= -16.6064
Vector: 9 F= 221.13 Cos= -0.015 Sum= 0.066 q= -1.1110
Vector: 10 F= 245.56 Cos= 0.016 Sum= 0.066 q= 1.1608
Vector: 11 F= 264.40 Cos= -0.098 Sum= 0.076 q= -7.3156
Vector: 12 F= 297.22 Cos= -0.091 Sum= 0.084 q= -6.7721
Vector: 13 F= 313.96 Cos= 0.122 Sum= 0.099 q= 9.0821
Vector: 14 F= 326.95 Cos= -0.084 Sum= 0.106 q= -6.2171
Vector: 15 F= 337.76 Cos= -0.185 Sum= 0.141 q= -13.7761
Vector: 16 F= 341.64 Cos= 0.173 Sum= 0.171 q= 12.8637
Vector: 17 F= 356.36 Cos= -0.032 Sum= 0.172 q= -2.3781
Vector: 18 F= 363.89 Cos= -0.074 Sum= 0.177 q= -5.5354
Vector: 19 F= 373.32 Cos= -0.145 Sum= 0.198 q= -10.7658
Vector: 20 F= 386.21 Cos= -0.020 Sum= 0.199 q= -1.4822
Vector: 21 F= 395.26 Cos= 0.047 Sum= 0.201 q= 3.4740
Vector: 22 F= 404.69 Cos= 0.003 Sum= 0.201 q= 0.2162
Vector: 23 F= 417.88 Cos= 0.078 Sum= 0.207 q= 5.7686
Vector: 24 F= 427.64 Cos= 0.054 Sum= 0.210 q= 4.0455
Vector: 25 F= 431.90 Cos= -0.163 Sum= 0.236 q= -12.0895
Vector: 26 F= 442.42 Cos= -0.004 Sum= 0.236 q= -0.3184
Vector: 27 F= 445.47 Cos= 0.113 Sum= 0.249 q= 8.3893
Vector: 28 F= 458.90 Cos= 0.041 Sum= 0.251 q= 3.0318
Vector: 29 F= 461.97 Cos= 0.050 Sum= 0.253 q= 3.6817
Vector: 30 F= 473.94 Cos= -0.000 Sum= 0.253 q= -0.0238
Vector: 31 F= 483.30 Cos= -0.085 Sum= 0.260 q= -6.3292
Vector: 32 F= 488.76 Cos= -0.058 Sum= 0.264 q= -4.2913
Vector: 33 F= 503.03 Cos= 0.018 Sum= 0.264 q= 1.3404
Vector: 34 F= 506.53 Cos= 0.017 Sum= 0.264 q= 1.2847
Vector: 35 F= 512.78 Cos= 0.062 Sum= 0.268 q= 4.5742
Vector: 36 F= 524.15 Cos= 0.100 Sum= 0.278 q= 7.4053
Vector: 37 F= 528.07 Cos= 0.012 Sum= 0.278 q= 0.8552
Vector: 38 F= 542.28 Cos= 0.039 Sum= 0.280 q= 2.9176
Vector: 39 F= 547.80 Cos= -0.072 Sum= 0.285 q= -5.3685
Vector: 40 F= 556.77 Cos= 0.070 Sum= 0.290 q= 5.1763
Vector: 41 F= 562.24 Cos= 0.012 Sum= 0.290 q= 0.9100
Vector: 42 F= 571.71 Cos= 0.095 Sum= 0.299 q= 7.0640
Vector: 43 F= 582.03 Cos= -0.047 Sum= 0.301 q= -3.5208
Vector: 44 F= 594.75 Cos= -0.046 Sum= 0.303 q= -3.3850
Vector: 45 F= 597.72 Cos= -0.031 Sum= 0.304 q= -2.2806
Vector: 46 F= 599.30 Cos= 0.045 Sum= 0.306 q= 3.3507
%Projmod-Wn> Eigenvector 47 Norm= 1.0001
Vector: 47 F= 610.60 Cos= 0.069 Sum= 0.311 q= 5.1593
Vector: 48 F= 617.99 Cos= 0.005 Sum= 0.311 q= 0.4054
Vector: 49 F= 622.08 Cos= 0.013 Sum= 0.311 q= 0.9293
Vector: 50 F= 625.10 Cos= 0.018 Sum= 0.312 q= 1.3456
Vector: 51 F= 635.49 Cos= 0.043 Sum= 0.314 q= 3.1941
Vector: 52 F= 639.46 Cos= 0.071 Sum= 0.319 q= 5.3094
Vector: 53 F= 645.70 Cos= -0.067 Sum= 0.323 q= -4.9867
Vector: 54 F= 653.60 Cos= -0.048 Sum= 0.326 q= -3.5760
Vector: 55 F= 656.48 Cos= -0.078 Sum= 0.332 q= -5.7855
Vector: 56 F= 666.11 Cos= 0.115 Sum= 0.345 q= 8.5129
Vector: 57 F= 676.30 Cos= -0.001 Sum= 0.345 q= -0.0875
Vector: 58 F= 677.95 Cos= -0.030 Sum= 0.346 q= -2.2549
Vector: 59 F= 684.01 Cos= -0.073 Sum= 0.351 q= -5.4523
Vector: 60 F= 687.19 Cos= -0.000 Sum= 0.351 q= -0.0291
Vector: 61 F= 688.56 Cos= -0.031 Sum= 0.352 q= -2.3005
Vector: 62 F= 702.72 Cos= 0.053 Sum= 0.355 q= 3.9119
Vector: 63 F= 706.65 Cos= 0.002 Sum= 0.355 q= 0.1220
Vector: 64 F= 707.98 Cos= 0.030 Sum= 0.356 q= 2.2158
Vector: 65 F= 712.05 Cos= -0.023 Sum= 0.356 q= -1.6940
Vector: 66 F= 717.58 Cos= 0.038 Sum= 0.358 q= 2.8387
Vector: 67 F= 719.96 Cos= 0.004 Sum= 0.358 q= 0.3170
Vector: 68 F= 724.53 Cos= -0.055 Sum= 0.361 q= -4.0916
Vector: 69 F= 730.93 Cos= 0.066 Sum= 0.365 q= 4.9082
Vector: 70 F= 732.46 Cos= 0.058 Sum= 0.368 q= 4.3186
Vector: 71 F= 737.03 Cos= 0.041 Sum= 0.370 q= 3.0528
Vector: 72 F= 748.46 Cos= -0.004 Sum= 0.370 q= -0.2849
Vector: 73 F= 748.85 Cos= -0.010 Sum= 0.370 q= -0.7685
Vector: 74 F= 750.90 Cos= 0.043 Sum= 0.372 q= 3.1841
Vector: 75 F= 753.09 Cos= -0.036 Sum= 0.373 q= -2.6435
Vector: 76 F= 763.20 Cos= -0.101 Sum= 0.384 q= -7.5167
Vector: 77 F= 765.90 Cos= 0.036 Sum= 0.385 q= 2.6674
Vector: 78 F= 769.43 Cos= -0.051 Sum= 0.387 q= -3.7935
Vector: 79 F= 780.31 Cos= 0.025 Sum= 0.388 q= 1.8563
Vector: 80 F= 785.51 Cos= 0.069 Sum= 0.393 q= 5.1309
Vector: 81 F= 787.31 Cos= 0.035 Sum= 0.394 q= 2.6199
Vector: 82 F= 788.28 Cos= -0.087 Sum= 0.402 q= -6.4463
Vector: 83 F= 792.53 Cos= -0.004 Sum= 0.402 q= -0.2947
Vector: 84 F= 800.97 Cos= 0.029 Sum= 0.402 q= 2.1750
Vector: 85 F= 807.64 Cos= 0.067 Sum= 0.407 q= 4.9626
Vector: 86 F= 813.02 Cos= 0.033 Sum= 0.408 q= 2.4764
Vector: 87 F= 816.93 Cos= -0.009 Sum= 0.408 q= -0.6982
Vector: 88 F= 823.83 Cos= -0.064 Sum= 0.412 q= -4.7526
Vector: 89 F= 828.25 Cos= -0.037 Sum= 0.414 q= -2.7597
Vector: 90 F= 831.73 Cos= 0.000 Sum= 0.414 q= 0.0283
Vector: 91 F= 836.19 Cos= -0.049 Sum= 0.416 q= -3.6469
Vector: 92 F= 838.51 Cos= 0.004 Sum= 0.416 q= 0.2677
Vector: 93 F= 842.23 Cos= -0.002 Sum= 0.416 q= -0.1629
Vector: 94 F= 845.37 Cos= 0.006 Sum= 0.416 q= 0.4442
Vector: 95 F= 851.21 Cos= -0.031 Sum= 0.417 q= -2.2871
Vector: 96 F= 852.25 Cos= -0.001 Sum= 0.417 q= -0.1052
Vector: 97 F= 855.36 Cos= -0.049 Sum= 0.419 q= -3.6124
Vector: 98 F= 862.77 Cos= 0.002 Sum= 0.419 q= 0.1404
Vector: 99 F= 867.06 Cos= -0.048 Sum= 0.422 q= -3.5529
Vector: 100 F= 869.30 Cos= -0.055 Sum= 0.425 q= -4.0902
Vector: 101 F= 873.03 Cos= -0.033 Sum= 0.426 q= -2.4614
Vector: 102 F= 879.02 Cos= 0.017 Sum= 0.426 q= 1.2604
Vector: 103 F= 881.36 Cos= 0.017 Sum= 0.426 q= 1.2276
Vector: 104 F= 882.56 Cos= 0.036 Sum= 0.428 q= 2.6503
Vector: 105 F= 888.09 Cos= 0.015 Sum= 0.428 q= 1.1322
Vector: 106 F= 890.87 Cos= -0.044 Sum= 0.430 q= -3.2403
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 168.186743
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.22 for mode 8 with F= 178.92 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.050 0.114 0.177 0.218 0.248 0.430
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090002023416476 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 324 2.056 281 1.438
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 324 1.735 294 1.341
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 324 1.446 309 1.253
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 324 1.213 318 1.135
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 324 1.071 322 1.043
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 324 1.059 320 1.006
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 324 1.180 321 1.140
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 324 1.401 320 1.347
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 324 1.682 306 1.507
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 324 1.998 285 1.611
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 324 2.335 260 1.681
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090002023416476 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 324 1.855 297 1.455
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 324 1.547 307 1.318
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 324 1.279 317 1.196
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 324 1.083 322 1.056
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 324 1.000 322 0.974
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 324 1.059 320 1.006
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 324 1.239 320 1.184
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 324 1.497 309 1.307
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 324 1.800 296 1.422
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 324 2.128 279 1.510
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 324 2.473 262 1.595
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090002023416476 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090002023416476.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 324 2.123 293 1.480
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 324 1.807 300 1.334
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 324 1.519 306 1.196
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 324 1.276 314 1.091
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 324 1.111 318 1.010
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 324 1.059 320 1.006
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 324 1.136 323 1.123
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 324 1.320 317 1.210
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 324 1.573 307 1.282
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 324 1.868 298 1.387
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 324 2.188 290 1.539
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090002023416476 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
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2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
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2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090002023416476.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 324 2.220 264 1.548
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 324 1.889 298 1.587
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 324 1.584 308 1.399
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 324 1.322 318 1.239
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 324 1.134 320 1.075
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 324 1.059 320 1.006
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 324 1.121 322 1.097
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 324 1.300 321 1.262
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 324 1.556 307 1.367
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 324 1.858 293 1.484
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 324 2.187 284 1.662
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090002023416476 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090002023416476.eigenfacs
2610090002023416476.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090002023416476.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090002023416476.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 324 2.011 285 1.415
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 324 1.705 302 1.423
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 324 1.430 315 1.328
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 324 1.208 323 1.198
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 324 1.073 324 1.073
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 324 1.059 320 1.006
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 324 1.169 319 1.091
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 324 1.375 311 1.195
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 324 1.640 301 1.315
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 324 1.941 290 1.434
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 324 2.263 278 1.514
2610090002023416476.10.pdb
2610090002023416476.11.pdb
2610090002023416476.7.pdb
2610090002023416476.8.pdb
2610090002023416476.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.039s
user 0m12.956s
sys 0m0.079s
rm: cannot remove '2610090002023416476.sdijf': No such file or directory
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