*** VVWT DHQ ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610090010133421365.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610090010133421365.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610090010133421365.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 39.166083 +/- 10.536084 From: 12.751000 To: 64.659000
= 38.364551 +/- 13.349328 From: 9.076000 To: 71.244000
= 34.590710 +/- 9.776821 From: 11.197000 To: 58.241000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1662 % Filled.
Pdbmat> 923692 non-zero elements.
Pdbmat> 100949 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.30 +/- 22.19
Maximum number = 128
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 2.018980E+06
Pdbmat> Larger element = 471.611
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
324 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610090010133421365.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610090010133421365.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610090010133421365.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2546 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 324 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 53
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 63
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 82
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 92
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 114
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 129
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 148
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 165
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 180
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 199
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 229
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 262
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 293
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 328
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 344
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 360
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 376
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 390
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 407
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 422
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 444
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 458
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 474
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 487
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 500
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 517
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 534
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 547
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 560
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 573
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 584
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 605
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 617
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 631
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 647
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 667
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 682
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 697
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 714
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 730
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 747
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 761
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 778
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 790
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 802
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 818
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 833
Blocpdb> 10 atoms in block 56
Block first atom: 844
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 854
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 870
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 907
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 925
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 938
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 949
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 960
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 975
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 992
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1011
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1028
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1042
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1062
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1077
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1097
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1111
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1128
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1145
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1161
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1179
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1194
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1233
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1251
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1266
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1281
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1295
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1309
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1328
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1349
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1363
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1380
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1396
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1415
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1430
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1446
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1460
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1475
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1486
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1504
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1520
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1532
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1547
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1560
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1576
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1588
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1602
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1617
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1628
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1645
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1660
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1678
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1694
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1714
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1727
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1745
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1763
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1779
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1793
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1806
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1824
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1844
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1864
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1879
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1893
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1906
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 1929
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1943
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1955
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 1973
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1987
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 2003
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2019
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 2033
Blocpdb> 20 atoms in block 132
Block first atom: 2049
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 2069
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2090
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2106
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2126
Blocpdb> 16 atoms in block 137
Block first atom: 2141
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 2157
Blocpdb> 11 atoms in block 139
Block first atom: 2177
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2188
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2205
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2221
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2236
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2249
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2266
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2281
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2298
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2313
Blocpdb> 20 atoms in block 149
Block first atom: 2325
Blocpdb> 20 atoms in block 150
Block first atom: 2345
Blocpdb> 18 atoms in block 151
Block first atom: 2365
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2383
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2400
Blocpdb> 18 atoms in block 154
Block first atom: 2416
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2434
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2443
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2458
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2471
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2487
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2500
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2516
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2529
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 923854 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7638
Prepmat> Matrix trace = 2018980.0000
Prepmat> Last element read: 7638 7638 122.6054
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11406 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2546
RTB> Total mass = 2546.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2546
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 217998.9161
RTB> 62262 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62262
Diagstd> Projected matrix trace = 217998.9161
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 217998.9161
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.7363383 3.2856927 4.0842781 5.3889439
6.3057377 6.8801661 7.1143580 8.8773539 9.3688197
9.9338100 10.6140052 11.1997615 11.4654648 13.1105641
13.4193788 15.0011858 15.2601849 15.7890540 16.2501369
16.9963664 17.5379438 17.8936252 18.4795666 19.0204203
19.5028353 20.3959592 22.0003254 22.6561365 22.9290650
24.0054039 24.3372530 24.6517016 25.9105742 26.5373885
27.1342885 27.7020609 28.7823642 29.3716620 30.3428853
30.7935308 31.6554221 33.3083417 34.0332691 34.1762063
34.2955898 34.8218758 35.7519581 36.4115395 37.5269508
37.6587055 38.7765112 39.3576830 40.3487378 40.8226048
40.9473439 41.6930886 42.6362886 44.2442294 44.4156073
44.9460305 45.1295771 45.6548666 46.2362862 46.8819504
46.9409099 47.6950161 48.5039929 49.1502169 49.2823218
49.9144008 50.5121577 51.2241163 52.2554794 52.5030685
53.1352914 53.3567797 54.3129587 55.2394701 55.6079783
56.3757433 56.8000614 57.4040802 57.7254424 58.1711733
58.9184837 59.5472432 60.3537597 61.1588010 62.3174988
62.6720614 63.8370189 64.0442318 64.7645021 65.7522274
67.0827358 67.2042667 68.3184306 68.7751830 69.3975584
69.8620755
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034335 0.0034335 0.0034339 0.0034341
0.0034344 179.6305396 196.8379128 219.4587667 252.0850626
272.6862456 284.8359098 289.6430663 323.5467533 332.3821709
342.2576829 353.7813454 363.4123384 367.6978692 393.1931740
397.7969849 420.5891595 424.2044097 431.4925827 437.7476190
447.6858029 454.7624701 459.3507698 466.8110960 473.5930661
479.5613305 490.4190679 509.3424023 516.8781892 519.9821708
532.0467428 535.7116105 539.1613246 552.7564251 559.4024597
565.6587371 571.5461720 582.5839452 588.5177160 598.1687464
602.5943068 610.9692245 626.7174478 633.5007216 634.8296558
635.9374751 640.7983154 649.2996918 655.2617253 665.2224834
666.3892372 676.2069751 681.2555326 689.7794589 693.8181183
694.8773384 701.1764394 709.0632497 722.3099510 723.7075156
728.0160453 729.5010344 733.7342959 738.3916073 743.5293488
743.9967389 749.9490859 756.2824561 761.3038036 762.3262254
767.1993238 771.7795030 777.1995089 784.9847119 786.8421623
791.5654203 793.2134787 800.2893011 807.0864054 809.7740090
815.3450157 818.4076547 822.7476710 825.0474290 828.2266332
833.5296657 837.9654458 843.6211224 849.2288930 857.2357750
859.6709873 867.6240445 869.0310435 873.9041379 880.5428904
889.4072461 890.2125315 897.5615105 900.5568987 904.6224796
907.6450055
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2546
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9884E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.286
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.306
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.880
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.877
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.02
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.86
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000
0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45828 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
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0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090010133421365.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090010133421365.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610090010133421365.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090010133421365.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9884E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.286
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.880
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.86
Bfactors> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.736000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.023 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.023
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090010133421365.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090010133421365.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.6
Chkmod> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2546 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9200
0.0034 0.9903
0.0034 0.9468
0.0034 0.8257
0.0034 0.8366
0.0034 0.7775
179.6117 0.4348
196.8387 0.4405
219.4419 0.3665
252.0756 0.1310
272.6802 0.2755
284.8202 0.1422
289.6233 0.2613
323.5264 0.4237
332.3711 0.4569
342.2463 0.5528
353.6994 0.2573
363.4006 0.4404
367.7548 0.2576
393.1678 0.3717
397.7891 0.2329
420.5545 0.1415
424.1836 0.5061
431.4870 0.2734
437.7270 0.3577
447.7144 0.5170
454.7696 0.3729
459.2845 0.4153
466.7965 0.2923
473.5675 0.3883
479.5059 0.4485
490.4466 0.2070
509.3168 0.4992
516.9001 0.4368
519.9705 0.4518
532.0748 0.3869
535.7188 0.3253
539.1196 0.3669
552.7266 0.4442
559.4060 0.3001
565.5898 0.3527
571.5004 0.4663
582.5350 0.5479
588.4758 0.3398
598.1146 0.3910
602.5339 0.4900
610.9872 0.3043
626.7061 0.2870
633.4431 0.2993
634.8376 0.4407
635.9511 0.4361
640.7535 0.3104
649.2540 0.3354
655.2197 0.3847
665.2210 0.3247
666.3721 0.4605
676.2084 0.5036
681.2463 0.4346
689.7606 0.3641
693.7662 0.5066
694.8700 0.5353
701.1204 0.4149
709.0637 0.3348
722.2444 0.2298
723.7122 0.3878
728.0169 0.4981
729.4731 0.3845
733.6637 0.4761
738.3896 0.3628
743.4820 0.4554
743.9576 0.3734
749.9561 0.4607
756.2189 0.2813
761.2694 0.4467
762.2755 0.3176
767.1326 0.3009
771.7299 0.3823
777.1349 0.2803
784.9850 0.4366
786.7854 0.6095
791.5665 0.4900
793.2034 0.4052
800.2331 0.3569
807.0556 0.3806
809.7540 0.4355
815.3408 0.4136
818.3721 0.4728
822.6831 0.4192
825.0446 0.5263
828.1827 0.4070
833.5046 0.4665
837.9489 0.4785
843.5586 0.4506
849.2008 0.5700
857.2162 0.2449
859.6199 0.4859
867.6071 0.4552
868.9650 0.4490
873.8362 0.4674
880.4902 0.5549
889.3509 0.4595
890.1461 0.2883
897.5333 0.4905
900.5498 0.3897
904.5996 0.5195
907.5926 0.4071
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610090010133421365.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090010133421365.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610090010133421365.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090010133421365.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610090010133421365.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610090010133421365.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.6
Projmod> 106 vectors, 7638 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 324
First residue number = 6
Last residue number = 329
Number of atoms found = 2546
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2546 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.39
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.021 Sum= 0.000 q= 1.4827
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.016 Sum= 0.001 q= -1.0962
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.009 Sum= 0.001 q= 0.6058
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.020 Sum= 0.001 q= 1.3809
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.008 Sum= 0.001 q= -0.5475
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.039 Sum= 0.003 q= -2.7266
Vector: 7 F= 179.61 Cos= -0.121 Sum= 0.017 q= -8.5377
Vector: 8 F= 196.84 Cos= -0.212 Sum= 0.063 q= -14.9371
Vector: 9 F= 219.44 Cos= 0.186 Sum= 0.097 q= 13.1160
Vector: 10 F= 252.08 Cos= -0.146 Sum= 0.119 q= -10.2386
Vector: 11 F= 272.68 Cos= 0.061 Sum= 0.122 q= 4.3025
Vector: 12 F= 284.82 Cos= 0.239 Sum= 0.179 q= 16.8109
Vector: 13 F= 289.62 Cos= 0.045 Sum= 0.181 q= 3.1333
Vector: 14 F= 323.53 Cos= -0.042 Sum= 0.183 q= -2.9662
Vector: 15 F= 332.37 Cos= -0.148 Sum= 0.205 q= -10.3923
Vector: 16 F= 342.25 Cos= 0.115 Sum= 0.218 q= 8.0552
Vector: 17 F= 353.70 Cos= -0.173 Sum= 0.248 q= -12.1424
Vector: 18 F= 363.40 Cos= 0.092 Sum= 0.256 q= 6.4669
Vector: 19 F= 367.75 Cos= 0.046 Sum= 0.258 q= 3.2488
Vector: 20 F= 393.17 Cos= -0.009 Sum= 0.259 q= -0.6143
Vector: 21 F= 397.79 Cos= 0.029 Sum= 0.259 q= 2.0213
Vector: 22 F= 420.55 Cos= 0.068 Sum= 0.264 q= 4.7968
Vector: 23 F= 424.18 Cos= 0.057 Sum= 0.267 q= 3.9845
Vector: 24 F= 431.49 Cos= 0.001 Sum= 0.267 q= 0.0894
Vector: 25 F= 437.73 Cos= -0.023 Sum= 0.268 q= -1.6209
Vector: 26 F= 447.71 Cos= -0.070 Sum= 0.273 q= -4.9300
Vector: 27 F= 454.77 Cos= -0.098 Sum= 0.282 q= -6.8668
Vector: 28 F= 459.28 Cos= 0.041 Sum= 0.284 q= 2.8850
Vector: 29 F= 466.80 Cos= -0.052 Sum= 0.287 q= -3.6609
Vector: 30 F= 473.57 Cos= 0.030 Sum= 0.288 q= 2.1154
Vector: 31 F= 479.51 Cos= -0.042 Sum= 0.289 q= -2.9843
Vector: 32 F= 490.45 Cos= 0.049 Sum= 0.292 q= 3.4116
Vector: 33 F= 509.32 Cos= -0.005 Sum= 0.292 q= -0.3827
Vector: 34 F= 516.90 Cos= -0.103 Sum= 0.302 q= -7.2296
Vector: 35 F= 519.97 Cos= 0.015 Sum= 0.302 q= 1.0347
Vector: 36 F= 532.07 Cos= -0.040 Sum= 0.304 q= -2.8121
Vector: 37 F= 535.72 Cos= -0.048 Sum= 0.306 q= -3.3488
Vector: 38 F= 539.12 Cos= 0.002 Sum= 0.306 q= 0.1206
Vector: 39 F= 552.73 Cos= 0.013 Sum= 0.306 q= 0.8877
Vector: 40 F= 559.41 Cos= 0.146 Sum= 0.328 q= 10.2575
Vector: 41 F= 565.59 Cos= 0.099 Sum= 0.338 q= 6.9782
Vector: 42 F= 571.50 Cos= 0.023 Sum= 0.338 q= 1.6355
Vector: 43 F= 582.54 Cos= -0.037 Sum= 0.340 q= -2.6092
Vector: 44 F= 588.48 Cos= 0.052 Sum= 0.342 q= 3.6693
Vector: 45 F= 598.11 Cos= 0.025 Sum= 0.343 q= 1.7395
Vector: 46 F= 602.53 Cos= -0.062 Sum= 0.347 q= -4.3682
Vector: 47 F= 610.99 Cos= 0.099 Sum= 0.356 q= 6.9477
Vector: 48 F= 626.71 Cos= 0.019 Sum= 0.357 q= 1.3582
Vector: 49 F= 633.44 Cos= -0.067 Sum= 0.361 q= -4.7284
Vector: 50 F= 634.84 Cos= 0.069 Sum= 0.366 q= 4.8804
Vector: 51 F= 635.95 Cos= 0.083 Sum= 0.373 q= 5.8627
Vector: 52 F= 640.75 Cos= 0.003 Sum= 0.373 q= 0.2176
Vector: 53 F= 649.25 Cos= 0.055 Sum= 0.376 q= 3.8618
Vector: 54 F= 655.22 Cos= 0.019 Sum= 0.376 q= 1.3062
Vector: 55 F= 665.22 Cos= -0.019 Sum= 0.377 q= -1.3525
Vector: 56 F= 666.37 Cos= -0.017 Sum= 0.377 q= -1.2086
Vector: 57 F= 676.21 Cos= -0.007 Sum= 0.377 q= -0.4864
Vector: 58 F= 681.25 Cos= 0.008 Sum= 0.377 q= 0.5767
Vector: 59 F= 689.76 Cos= -0.108 Sum= 0.389 q= -7.5968
Vector: 60 F= 693.77 Cos= -0.042 Sum= 0.391 q= -2.9424
Vector: 61 F= 694.87 Cos= 0.018 Sum= 0.391 q= 1.2452
Vector: 62 F= 701.12 Cos= 0.044 Sum= 0.393 q= 3.0679
Vector: 63 F= 709.06 Cos= 0.012 Sum= 0.393 q= 0.8709
Vector: 64 F= 722.24 Cos= -0.021 Sum= 0.393 q= -1.4427
Vector: 65 F= 723.71 Cos= -0.064 Sum= 0.398 q= -4.4835
Vector: 66 F= 728.02 Cos= 0.003 Sum= 0.398 q= 0.2043
Vector: 67 F= 729.47 Cos= 0.051 Sum= 0.400 q= 3.6001
Vector: 68 F= 733.66 Cos= 0.052 Sum= 0.403 q= 3.6809
Vector: 69 F= 738.39 Cos= 0.046 Sum= 0.405 q= 3.2220
Vector: 70 F= 743.48 Cos= 0.017 Sum= 0.405 q= 1.1842
Vector: 71 F= 743.96 Cos= -0.016 Sum= 0.406 q= -1.1018
Vector: 72 F= 749.96 Cos= -0.022 Sum= 0.406 q= -1.5427
Vector: 73 F= 756.22 Cos= -0.015 Sum= 0.406 q= -1.0531
Vector: 74 F= 761.27 Cos= 0.055 Sum= 0.409 q= 3.8902
Vector: 75 F= 762.28 Cos= 0.002 Sum= 0.409 q= 0.1150
Vector: 76 F= 767.13 Cos= 0.035 Sum= 0.411 q= 2.4883
Vector: 77 F= 771.73 Cos= 0.061 Sum= 0.414 q= 4.2713
Vector: 78 F= 777.13 Cos= 0.004 Sum= 0.414 q= 0.2710
Vector: 79 F= 784.98 Cos= 0.033 Sum= 0.415 q= 2.3350
Vector: 80 F= 786.79 Cos= -0.016 Sum= 0.416 q= -1.1319
Vector: 81 F= 791.57 Cos= 0.025 Sum= 0.416 q= 1.7845
Vector: 82 F= 793.20 Cos= 0.037 Sum= 0.418 q= 2.5938
Vector: 83 F= 800.23 Cos= -0.053 Sum= 0.420 q= -3.7318
Vector: 84 F= 807.06 Cos= -0.028 Sum= 0.421 q= -2.0034
Vector: 85 F= 809.75 Cos= -0.005 Sum= 0.421 q= -0.3242
Vector: 86 F= 815.34 Cos= 0.002 Sum= 0.421 q= 0.1540
Vector: 87 F= 818.37 Cos= 0.058 Sum= 0.425 q= 4.0753
Vector: 88 F= 822.68 Cos= 0.060 Sum= 0.428 q= 4.1853
Vector: 89 F= 825.04 Cos= 0.001 Sum= 0.428 q= 0.0545
Vector: 90 F= 828.18 Cos= -0.027 Sum= 0.429 q= -1.8722
Vector: 91 F= 833.50 Cos= 0.115 Sum= 0.442 q= 8.0640
Vector: 92 F= 837.95 Cos= -0.015 Sum= 0.442 q= -1.0503
Vector: 93 F= 843.56 Cos= 0.005 Sum= 0.442 q= 0.3241
Vector: 94 F= 849.20 Cos= 0.002 Sum= 0.442 q= 0.1685
Vector: 95 F= 857.22 Cos= -0.026 Sum= 0.443 q= -1.8585
Vector: 96 F= 859.62 Cos= 0.068 Sum= 0.448 q= 4.8078
Vector: 97 F= 867.61 Cos= 0.025 Sum= 0.448 q= 1.7261
Vector: 98 F= 868.97 Cos= -0.006 Sum= 0.448 q= -0.3999
Vector: 99 F= 873.84 Cos= 0.044 Sum= 0.450 q= 3.0812
Vector: 100 F= 880.49 Cos= -0.002 Sum= 0.450 q= -0.1752
Vector: 101 F= 889.35 Cos= 0.059 Sum= 0.454 q= 4.1305
Vector: 102 F= 890.15 Cos= -0.049 Sum= 0.456 q= -3.4774
Vector: 103 F= 897.53 Cos= 0.104 Sum= 0.467 q= 7.3480
Vector: 104 F= 900.55 Cos= -0.050 Sum= 0.470 q= -3.5367
Vector: 105 F= 904.60 Cos= 0.046 Sum= 0.472 q= 3.2561
Vector: 106 F= 907.59 Cos= -0.032 Sum= 0.473 q= -2.2501
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 179.611725
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.24 for mode 12 with F= 284.82 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.057 0.137 0.210 0.259 0.295 0.473
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090010133421365 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090010133421365.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 324 1.967 301 1.512
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 324 1.645 311 1.359
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 324 1.354 314 1.166
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 324 1.118 319 1.036
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 324 0.978 324 0.978
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 324 0.976 324 0.976
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 324 1.113 321 1.074
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 324 1.347 315 1.220
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 324 1.638 307 1.377
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 324 1.959 291 1.490
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 324 2.299 266 1.541
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090010133421365 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090010133421365.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 324 1.884 291 1.422
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 324 1.560 308 1.321
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 324 1.272 318 1.171
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 324 1.049 321 1.003
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 324 0.937 324 0.937
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 324 0.976 324 0.976
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 324 1.151 322 1.126
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 324 1.412 309 1.245
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 324 1.720 293 1.323
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 324 2.054 274 1.360
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 324 2.404 263 1.375
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090010133421365 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090010133421365.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 324 2.311 273 1.533
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 324 1.977 295 1.511
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 324 1.659 310 1.390
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 324 1.369 314 1.198
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 324 1.129 319 1.048
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 324 0.976 324 0.976
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 324 0.954 323 0.934
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 324 1.070 320 0.966
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 324 1.287 315 1.062
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 324 1.565 311 1.201
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 324 1.876 303 1.335
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090010133421365 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090010133421365.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 324 1.675 310 1.303
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 324 1.408 316 1.188
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 324 1.177 320 1.059
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 324 1.007 321 0.950
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 324 0.933 324 0.933
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 324 0.976 324 0.976
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 324 1.123 318 1.002
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 324 1.340 312 1.037
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 324 1.599 310 1.139
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 324 1.883 305 1.230
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 324 2.181 299 1.343
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090010133421365 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090010133421365.eigenfacs
2610090010133421365.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090010133421365.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090010133421365.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 324 2.147 296 1.348
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 324 1.837 299 1.212
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 324 1.547 305 1.095
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 324 1.289 310 1.004
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 324 1.087 319 0.995
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 324 0.976 324 0.976
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 324 0.987 322 0.953
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 324 1.116 321 1.044
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 324 1.330 313 1.121
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 324 1.595 309 1.283
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 324 1.889 293 1.346
2610090010133421365.10.pdb
2610090010133421365.11.pdb
2610090010133421365.7.pdb
2610090010133421365.8.pdb
2610090010133421365.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.547s
user 0m12.465s
sys 0m0.080s
rm: cannot remove '2610090010133421365.sdijf': No such file or directory
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