*** Zm A1b DHK ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610090027463442181.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610090027463442181.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610090027463442181.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 34.796556 +/- 10.882879 From: 9.971000 To: 59.146000
= 38.734295 +/- 12.256519 From: 12.650000 To: 69.056000
= 38.750456 +/- 11.110614 From: 11.505000 To: 64.109000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1477 % Filled.
Pdbmat> 893215 non-zero elements.
Pdbmat> 97596 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.73 +/- 21.24
Maximum number = 126
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.951920E+06
Pdbmat> Larger element = 482.152
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
323 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610090027463442181.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610090027463442181.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610090027463442181.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2511 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 323 residues.
Blocpdb> 11 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 12
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 26
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 49
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 59
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 77
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 87
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 109
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 141
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 158
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 167
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 186
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 204
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 216
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 249
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 266
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 293
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 325
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 341
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 352
Blocpdb> 20 atoms in block 26
Block first atom: 364
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 384
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 398
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 420
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 434
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 450
Blocpdb> 17 atoms in block 32
Block first atom: 463
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 480
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 497
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 514
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 527
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 542
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 555
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 566
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 587
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 599
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 613
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 628
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 648
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 663
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 678
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 695
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 711
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 728
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 742
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 758
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 770
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 789
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 805
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 821
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 836
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 850
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 861
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 879
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 898
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 916
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 929
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 940
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 951
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 964
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 980
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1000
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1022
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1036
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1056
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1074
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1096
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1110
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1125
Blocpdb> 22 atoms in block 75
Block first atom: 1142
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1180
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1195
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1233
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1251
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1266
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1280
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1294
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1308
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1321
Blocpdb> 10 atoms in block 87
Block first atom: 1338
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1348
Blocpdb> 12 atoms in block 89
Block first atom: 1367
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1379
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1395
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1408
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1423
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1437
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1452
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1463
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1481
Blocpdb> 10 atoms in block 98
Block first atom: 1495
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1505
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1520
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1533
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1548
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1560
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1573
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1588
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1599
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1616
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1631
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1649
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1665
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1683
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1699
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1717
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1735
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1751
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1765
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1778
Blocpdb> 19 atoms in block 118
Block first atom: 1795
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1814
Blocpdb> 17 atoms in block 120
Block first atom: 1834
Blocpdb> 10 atoms in block 121
Block first atom: 1851
Blocpdb> 9 atoms in block 122
Block first atom: 1861
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1870
Blocpdb> 13 atoms in block 124
Block first atom: 1893
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1906
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1918
Blocpdb> 12 atoms in block 127
Block first atom: 1936
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 1948
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1966
Blocpdb> 10 atoms in block 130
Block first atom: 1978
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1988
Blocpdb> 19 atoms in block 132
Block first atom: 2004
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 2023
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2046
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2062
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2082
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 2097
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2115
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2134
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2146
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2163
Blocpdb> 16 atoms in block 142
Block first atom: 2179
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2195
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2212
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2229
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2244
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2261
Blocpdb> 14 atoms in block 148
Block first atom: 2277
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 2291
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 2309
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 2331
Blocpdb> 16 atoms in block 152
Block first atom: 2350
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2366
Blocpdb> 19 atoms in block 154
Block first atom: 2382
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2401
Blocpdb> 19 atoms in block 156
Block first atom: 2410
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2429
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2442
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2462
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2475
Blocpdb> 15 atoms in block 161
Block first atom: 2491
Blocpdb> 6 atoms in block 162
Block first atom: 2505
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 893377 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7533
Prepmat> Matrix trace = 1951920.0000
Prepmat> Last element read: 7533 7533 46.1893
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11475 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2511
RTB> Total mass = 2511.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2511
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 213083.9494
RTB> 59778 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59778
Diagstd> Projected matrix trace = 213083.9494
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 213083.9494
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.0600336 2.5310591 3.7023657 4.2145274
6.1852170 7.8462638 8.4064457 9.0767074 9.1268365
10.0002670 10.8894773 12.6314130 13.3583399 13.4366858
14.0082536 14.7330541 15.1785286 15.7420642 17.0743335
17.3992678 18.3965199 18.8558691 19.3769231 20.2223720
21.7561172 22.2018271 23.2552794 24.3502712 25.2518659
26.0670983 26.1700605 27.0873774 27.5107052 28.3542343
28.6364283 30.6038281 31.6889263 32.0651591 32.4485711
33.8898217 34.0887740 34.5327037 35.2777625 35.7546069
36.1596970 36.4986310 37.5505280 37.9968446 38.2758062
39.4366004 39.9869636 40.7227784 41.5173346 41.9242914
42.0328013 42.5501683 43.5947207 44.0376257 44.5869142
44.9108742 45.5215440 46.0018116 46.4819182 46.7018096
47.4896556 48.0264713 48.4952211 49.1949249 50.4230593
50.6194251 51.1286910 52.8930063 53.2435314 54.8853087
55.4341669 55.6704661 56.4773704 56.9237870 57.5595321
58.0678738 58.6683449 59.1778902 59.6573219 59.7296647
60.3435621 61.7745854 62.3848796 62.9983371 63.3451189
63.6751674 64.2984752 65.0232319 65.4646286 66.0503645
66.5875549 66.9831655 67.2830545 67.9250576 68.7578097
68.9641804
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034340 0.0034341 0.0034342 0.0034343
0.0034347 155.8591958 172.7612824 208.9464209 222.9306176
270.0677652 304.1772530 314.8483965 327.1594337 328.0616135
343.4006223 358.3428949 385.9412928 396.8912510 398.0534211
406.4314238 416.8133993 423.0679406 430.8500221 448.7114591
452.9609533 465.7609966 471.5400204 478.0107764 488.3276641
506.5076101 511.6696275 523.6680307 535.8548698 545.6850021
554.4234940 555.5173706 565.1695557 569.5687355 578.2348225
581.1051242 600.7353065 611.2924645 614.9106003 618.5760038
632.1642360 634.0170995 638.1320701 644.9793292 649.3237438
652.9917154 656.0449067 665.4314218 669.3743193 671.8270004
681.9381944 686.6801510 692.9692775 699.6970009 703.1178864
704.0272148 708.3467759 716.9885665 720.6215216 725.1018091
727.7312667 732.6621775 736.5169532 740.3503757 742.0994927
748.3328162 752.5504497 756.2140675 761.6499736 771.0985317
772.5985428 776.4752502 789.7586768 792.3712448 804.4949749
808.5074814 810.2288607 816.0795856 819.2985244 823.8609296
827.4909306 831.7584053 835.3625840 838.7396169 839.2480069
843.5498490 853.4934648 857.6990932 861.9058398 864.2748155
866.5234655 870.7542787 875.6479924 878.6150425 882.5369341
886.1185213 888.7469310 890.7342050 894.9737304 900.4431468
901.7934364
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2511
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.060
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.531
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.185
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.846
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.406
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.077
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.127
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.96
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45198 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090027463442181.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090027463442181.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610090027463442181.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090027463442181.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.185
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.846
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.077
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.28
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.96
Bfactors> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.060000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.025 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.025
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090027463442181.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090027463442181.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7
Chkmod> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2511 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8577
0.0034 0.7544
0.0034 0.7277
0.0034 0.7536
0.0034 0.8503
0.0034 0.9253
155.8512 0.5264
172.7519 0.5311
208.9271 0.5092
222.9335 0.3605
270.0514 0.1501
304.1591 0.1993
314.8265 0.6671
327.1507 0.3495
328.0505 0.5080
343.3813 0.5135
358.3361 0.6023
385.9031 0.3400
396.8989 0.2995
398.0854 0.4919
406.4393 0.3520
416.7523 0.5084
423.0703 0.4722
430.8033 0.3679
448.6353 0.3751
452.9510 0.5554
465.7851 0.5945
471.5714 0.4137
478.0282 0.3027
488.2781 0.3784
506.5311 0.4524
511.6266 0.4764
523.6987 0.5453
535.8289 0.2788
545.6414 0.5756
554.4305 0.2055
555.4929 0.3002
565.1727 0.4934
569.5370 0.6486
578.1668 0.6044
581.1164 0.5666
600.6719 0.4746
611.2766 0.5283
614.9306 0.5384
618.5631 0.5341
632.1388 0.4450
634.0013 0.2714
638.0797 0.4120
644.9721 0.4684
649.2540 0.3839
652.9664 0.2400
656.0290 0.3946
665.3982 0.4634
669.3734 0.4900
671.8350 0.4206
681.9383 0.4941
686.6767 0.3496
692.9159 0.2567
699.6894 0.3311
703.0517 0.4375
703.9735 0.4666
708.3150 0.4140
716.9190 0.1115
720.6100 0.4654
725.0958 0.3795
727.6929 0.3852
732.6183 0.2264
736.4708 0.5689
740.3033 0.4928
742.0533 0.4012
748.3034 0.3682
752.5458 0.4775
756.2189 0.2639
761.5792 0.4077
771.0420 0.2813
772.5698 0.5497
776.4519 0.4726
789.7023 0.4377
792.3110 0.5062
804.4948 0.3289
808.4424 0.4007
810.1907 0.4377
816.0636 0.5138
819.2361 0.4318
823.8289 0.4209
827.4706 0.4447
831.7344 0.5199
835.3416 0.4413
838.7224 0.4728
839.2143 0.4058
843.4887 0.4303
853.4252 0.3793
857.6287 0.4672
861.8802 0.5145
864.2710 0.3797
866.5191 0.4407
870.7272 0.4700
875.5886 0.3434
878.5463 0.4171
882.4966 0.3759
886.0968 0.3920
888.6878 0.4185
890.6757 0.4730
894.9679 0.3654
900.4188 0.3855
901.7274 0.4709
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610090027463442181.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090027463442181.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610090027463442181.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090027463442181.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610090027463442181.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610090027463442181.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7
Projmod> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2511 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.31
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.011 Sum= 0.000 q= -0.7256
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.032 Sum= 0.001 q= -2.1011
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.016 Sum= 0.001 q= 1.0477
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.025 Sum= 0.002 q= 1.6637
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.009 Sum= 0.002 q= -0.6104
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.019 Sum= 0.002 q= 1.2540
Vector: 7 F= 155.85 Cos= -0.102 Sum= 0.013 q= -6.7330
Vector: 8 F= 172.75 Cos= -0.135 Sum= 0.031 q= -8.8911
Vector: 9 F= 208.93 Cos= 0.021 Sum= 0.032 q= 1.3704
Vector: 10 F= 222.93 Cos= 0.156 Sum= 0.056 q= 10.2312
Vector: 11 F= 270.05 Cos= 0.143 Sum= 0.076 q= 9.4215
Vector: 12 F= 304.16 Cos= 0.069 Sum= 0.081 q= 4.5501
Vector: 13 F= 314.83 Cos= 0.032 Sum= 0.082 q= 2.0816
Vector: 14 F= 327.15 Cos= -0.112 Sum= 0.095 q= -7.3320
Vector: 15 F= 328.05 Cos= -0.056 Sum= 0.098 q= -3.6733
Vector: 16 F= 343.38 Cos= 0.058 Sum= 0.101 q= 3.7944
Vector: 17 F= 358.34 Cos= 0.063 Sum= 0.105 q= 4.1189
Vector: 18 F= 385.90 Cos= 0.075 Sum= 0.111 q= 4.9221
Vector: 19 F= 396.90 Cos= -0.034 Sum= 0.112 q= -2.2130
Vector: 20 F= 398.09 Cos= -0.004 Sum= 0.112 q= -0.2417
Vector: 21 F= 406.44 Cos= 0.145 Sum= 0.133 q= 9.5360
Vector: 22 F= 416.75 Cos= -0.081 Sum= 0.139 q= -5.2944
Vector: 23 F= 423.07 Cos= -0.103 Sum= 0.150 q= -6.7454
Vector: 24 F= 430.80 Cos= 0.000 Sum= 0.150 q= 0.0139
Vector: 25 F= 448.64 Cos= -0.147 Sum= 0.171 q= -9.6489
Vector: 26 F= 452.95 Cos= -0.082 Sum= 0.178 q= -5.4001
Vector: 27 F= 465.79 Cos= 0.089 Sum= 0.186 q= 5.8435
Vector: 28 F= 471.57 Cos= 0.077 Sum= 0.192 q= 5.0698
Vector: 29 F= 478.03 Cos= 0.077 Sum= 0.198 q= 5.0776
Vector: 30 F= 488.28 Cos= 0.029 Sum= 0.199 q= 1.9200
Vector: 31 F= 506.53 Cos= -0.026 Sum= 0.199 q= -1.7096
Vector: 32 F= 511.63 Cos= 0.024 Sum= 0.200 q= 1.5706
Vector: 33 F= 523.70 Cos= -0.020 Sum= 0.200 q= -1.3316
Vector: 34 F= 535.83 Cos= 0.056 Sum= 0.204 q= 3.6696
Vector: 35 F= 545.64 Cos= -0.019 Sum= 0.204 q= -1.2468
Vector: 36 F= 554.43 Cos= -0.002 Sum= 0.204 q= -0.1037
Vector: 37 F= 555.49 Cos= 0.027 Sum= 0.205 q= 1.8040
Vector: 38 F= 565.17 Cos= -0.029 Sum= 0.206 q= -1.8983
Vector: 39 F= 569.54 Cos= 0.076 Sum= 0.211 q= 5.0295
Vector: 40 F= 578.17 Cos= -0.014 Sum= 0.212 q= -0.9307
Vector: 41 F= 581.12 Cos= 0.122 Sum= 0.226 q= 8.0228
Vector: 42 F= 600.67 Cos= -0.111 Sum= 0.239 q= -7.2913
Vector: 43 F= 611.28 Cos= 0.026 Sum= 0.239 q= 1.7303
Vector: 44 F= 614.93 Cos= 0.018 Sum= 0.240 q= 1.2080
Vector: 45 F= 618.56 Cos= 0.014 Sum= 0.240 q= 0.9297
Vector: 46 F= 632.14 Cos= 0.064 Sum= 0.244 q= 4.1867
Vector: 47 F= 634.00 Cos= 0.039 Sum= 0.246 q= 2.5845
Vector: 48 F= 638.08 Cos= 0.055 Sum= 0.249 q= 3.6054
Vector: 49 F= 644.97 Cos= -0.056 Sum= 0.252 q= -3.7015
Vector: 50 F= 649.25 Cos= -0.030 Sum= 0.253 q= -1.9497
Vector: 51 F= 652.97 Cos= -0.009 Sum= 0.253 q= -0.6127
Vector: 52 F= 656.03 Cos= 0.101 Sum= 0.263 q= 6.6242
Vector: 53 F= 665.40 Cos= -0.068 Sum= 0.267 q= -4.4720
Vector: 54 F= 669.37 Cos= 0.009 Sum= 0.268 q= 0.6149
Vector: 55 F= 671.83 Cos= 0.032 Sum= 0.269 q= 2.1080
Vector: 56 F= 681.94 Cos= 0.083 Sum= 0.275 q= 5.4512
Vector: 57 F= 686.68 Cos= -0.051 Sum= 0.278 q= -3.3601
Vector: 58 F= 692.92 Cos= 0.074 Sum= 0.284 q= 4.8573
Vector: 59 F= 699.69 Cos= -0.149 Sum= 0.306 q= -9.8097
Vector: 60 F= 703.05 Cos= -0.014 Sum= 0.306 q= -0.9440
Vector: 61 F= 703.97 Cos= 0.035 Sum= 0.307 q= 2.2756
Vector: 62 F= 708.31 Cos= -0.046 Sum= 0.309 q= -3.0400
Vector: 63 F= 716.92 Cos= -0.083 Sum= 0.316 q= -5.4508
Vector: 64 F= 720.61 Cos= 0.060 Sum= 0.320 q= 3.9216
Vector: 65 F= 725.10 Cos= -0.007 Sum= 0.320 q= -0.4509
Vector: 66 F= 727.69 Cos= -0.005 Sum= 0.320 q= -0.3485
Vector: 67 F= 732.62 Cos= 0.064 Sum= 0.324 q= 4.1989
Vector: 68 F= 736.47 Cos= -0.025 Sum= 0.325 q= -1.6591
Vector: 69 F= 740.30 Cos= -0.030 Sum= 0.325 q= -1.9657
Vector: 70 F= 742.05 Cos= 0.008 Sum= 0.326 q= 0.5539
Vector: 71 F= 748.30 Cos= 0.020 Sum= 0.326 q= 1.3202
Vector: 72 F= 752.55 Cos= 0.006 Sum= 0.326 q= 0.4199
Vector: 73 F= 756.22 Cos= -0.095 Sum= 0.335 q= -6.2639
Vector: 74 F= 761.58 Cos= -0.041 Sum= 0.337 q= -2.7243
Vector: 75 F= 771.04 Cos= 0.034 Sum= 0.338 q= 2.2668
Vector: 76 F= 772.57 Cos= 0.053 Sum= 0.341 q= 3.4601
Vector: 77 F= 776.45 Cos= -0.001 Sum= 0.341 q= -0.0840
Vector: 78 F= 789.70 Cos= 0.087 Sum= 0.348 q= 5.7033
Vector: 79 F= 792.31 Cos= -0.092 Sum= 0.357 q= -6.0370
Vector: 80 F= 804.49 Cos= -0.041 Sum= 0.358 q= -2.6690
Vector: 81 F= 808.44 Cos= -0.022 Sum= 0.359 q= -1.4240
Vector: 82 F= 810.19 Cos= -0.018 Sum= 0.359 q= -1.1955
Vector: 83 F= 816.06 Cos= 0.063 Sum= 0.363 q= 4.1429
Vector: 84 F= 819.24 Cos= -0.037 Sum= 0.364 q= -2.4382
Vector: 85 F= 823.83 Cos= -0.036 Sum= 0.366 q= -2.3759
Vector: 86 F= 827.47 Cos= -0.018 Sum= 0.366 q= -1.2069
Vector: 87 F= 831.73 Cos= -0.044 Sum= 0.368 q= -2.8777
Vector: 88 F= 835.34 Cos= 0.031 Sum= 0.369 q= 2.0137
Vector: 89 F= 838.72 Cos= -0.011 Sum= 0.369 q= -0.7376
Vector: 90 F= 839.21 Cos= 0.023 Sum= 0.370 q= 1.5019
Vector: 91 F= 843.49 Cos= 0.019 Sum= 0.370 q= 1.2648
Vector: 92 F= 853.43 Cos= -0.022 Sum= 0.371 q= -1.4777
Vector: 93 F= 857.63 Cos= 0.014 Sum= 0.371 q= 0.9483
Vector: 94 F= 861.88 Cos= 0.076 Sum= 0.376 q= 4.9701
Vector: 95 F= 864.27 Cos= -0.015 Sum= 0.377 q= -0.9745
Vector: 96 F= 866.52 Cos= -0.014 Sum= 0.377 q= -0.9035
Vector: 97 F= 870.73 Cos= 0.031 Sum= 0.378 q= 2.0291
Vector: 98 F= 875.59 Cos= -0.002 Sum= 0.378 q= -0.1443
Vector: 99 F= 878.55 Cos= -0.043 Sum= 0.380 q= -2.8139
Vector: 100 F= 882.50 Cos= -0.069 Sum= 0.384 q= -4.5193
Vector: 101 F= 886.10 Cos= -0.032 Sum= 0.385 q= -2.1042
Vector: 102 F= 888.69 Cos= -0.020 Sum= 0.386 q= -1.3471
Vector: 103 F= 890.68 Cos= -0.014 Sum= 0.386 q= -0.9236
Vector: 104 F= 894.97 Cos= -0.037 Sum= 0.387 q= -2.4144
Vector: 105 F= 900.42 Cos= 0.000 Sum= 0.387 q= 0.0191
Vector: 106 F= 901.73 Cos= -0.030 Sum= 0.388 q= -1.9635
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 155.851235
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.16 for mode 10 with F= 222.93 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.024 0.068 0.128 0.167 0.199 0.388
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090027463442181 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090027463442181.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 323 2.018 284 1.691
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 323 1.673 312 1.566
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 323 1.353 320 1.322
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 323 1.081 323 1.081
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 323 0.901 323 0.901
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 323 0.871 323 0.871
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 323 1.006 323 1.006
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 323 1.253 319 1.207
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 323 1.560 308 1.384
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 323 1.898 284 1.393
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 323 2.253 267 1.491
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090027463442181 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090027463442181.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 323 1.952 288 1.615
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 323 1.615 309 1.481
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 323 1.304 320 1.273
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 323 1.044 323 1.044
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 323 0.881 323 0.881
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 323 0.871 323 0.871
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 323 1.020 322 1.007
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 323 1.272 318 1.206
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 323 1.578 305 1.349
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 323 1.914 297 1.547
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 323 2.265 275 1.643
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090027463442181 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
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2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090027463442181.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 323 2.176 266 1.498
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 323 1.826 289 1.458
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 323 1.495 311 1.368
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 323 1.199 321 1.176
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 323 0.973 323 0.973
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 323 0.871 323 0.871
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 323 0.936 323 0.936
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 323 1.139 323 1.139
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 323 1.422 316 1.333
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 323 1.746 303 1.492
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 323 2.094 279 1.553
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090027463442181 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
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2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
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2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090027463442181.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 323 2.278 288 1.602
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 323 1.930 302 1.469
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 323 1.598 309 1.298
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 323 1.291 315 1.149
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 323 1.034 322 1.020
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 323 0.871 323 0.871
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 323 0.859 323 0.859
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 323 1.002 320 0.957
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 323 1.248 314 1.086
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 323 1.549 305 1.205
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 323 1.879 298 1.348
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090027463442181 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090027463442181.eigenfacs
2610090027463442181.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090027463442181.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090027463442181.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 323 2.047 300 1.461
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 323 1.740 304 1.312
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 323 1.450 313 1.217
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 323 1.190 320 1.101
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 323 0.984 322 0.958
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 323 0.871 323 0.871
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 323 0.888 323 0.888
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 323 1.028 320 0.962
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 323 1.250 317 1.073
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 323 1.519 315 1.221
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 323 1.814 311 1.374
2610090027463442181.10.pdb
2610090027463442181.11.pdb
2610090027463442181.7.pdb
2610090027463442181.8.pdb
2610090027463442181.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.623s
user 0m12.554s
sys 0m0.066s
rm: cannot remove '2610090027463442181.sdijf': No such file or directory
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