*** Zm A1b DHQ ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610090028133442294.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610090028133442294.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610090028133442294.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 34.750994 +/- 12.591527 From: 6.000000 To: 66.759000
= 38.793982 +/- 12.356535 From: 9.230000 To: 70.366000
= 38.796622 +/- 9.299189 From: 14.234000 To: 63.137000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1252 % Filled.
Pdbmat> 886822 non-zero elements.
Pdbmat> 96879 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.16 +/- 20.83
Maximum number = 130
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.937580E+06
Pdbmat> Larger element = 471.577
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
323 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610090028133442294.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610090028133442294.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610090028133442294.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2511 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 323 residues.
Blocpdb> 11 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 12
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 26
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 49
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 59
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 77
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 87
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 109
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 141
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 158
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 167
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 186
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 204
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 216
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 249
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 266
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 277
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 293
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 325
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 341
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 352
Blocpdb> 20 atoms in block 26
Block first atom: 364
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 384
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 398
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 420
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 434
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 450
Blocpdb> 17 atoms in block 32
Block first atom: 463
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 480
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 497
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 514
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 527
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 542
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 555
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 566
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 587
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 599
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 613
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 628
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 648
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 663
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 678
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 695
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 711
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 728
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 742
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 758
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 770
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 789
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 805
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 821
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 836
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 850
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 861
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 879
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 898
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 916
Blocpdb> 11 atoms in block 62
Block first atom: 929
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 940
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 951
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 964
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 980
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1000
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1022
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1036
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1056
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1074
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1096
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1110
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1125
Blocpdb> 22 atoms in block 75
Block first atom: 1142
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1180
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1195
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1233
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1251
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1266
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1280
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1294
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1308
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1321
Blocpdb> 10 atoms in block 87
Block first atom: 1338
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1348
Blocpdb> 12 atoms in block 89
Block first atom: 1367
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1379
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1395
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1408
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1423
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1437
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1452
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1463
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1481
Blocpdb> 10 atoms in block 98
Block first atom: 1495
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1505
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1520
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1533
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1548
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1560
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1573
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 1588
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1599
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1616
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1631
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1649
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1665
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1683
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1699
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1717
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1735
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1751
Blocpdb> 13 atoms in block 116
Block first atom: 1765
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1778
Blocpdb> 19 atoms in block 118
Block first atom: 1795
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1814
Blocpdb> 17 atoms in block 120
Block first atom: 1834
Blocpdb> 10 atoms in block 121
Block first atom: 1851
Blocpdb> 9 atoms in block 122
Block first atom: 1861
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1870
Blocpdb> 13 atoms in block 124
Block first atom: 1893
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1906
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 1918
Blocpdb> 12 atoms in block 127
Block first atom: 1936
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 1948
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1966
Blocpdb> 10 atoms in block 130
Block first atom: 1978
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1988
Blocpdb> 19 atoms in block 132
Block first atom: 2004
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 2023
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2046
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2062
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2082
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 2097
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2115
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2134
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2146
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2163
Blocpdb> 16 atoms in block 142
Block first atom: 2179
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2195
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2212
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2229
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2244
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2261
Blocpdb> 14 atoms in block 148
Block first atom: 2277
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 2291
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 2309
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 2331
Blocpdb> 16 atoms in block 152
Block first atom: 2350
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2366
Blocpdb> 19 atoms in block 154
Block first atom: 2382
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 2401
Blocpdb> 19 atoms in block 156
Block first atom: 2410
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2429
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2442
Blocpdb> 13 atoms in block 159
Block first atom: 2462
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2475
Blocpdb> 15 atoms in block 161
Block first atom: 2491
Blocpdb> 6 atoms in block 162
Block first atom: 2505
Blocpdb> 162 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 886984 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7533
Prepmat> Matrix trace = 1937580.0000
Prepmat> Last element read: 7533 7533 72.8449
Prepmat> 13204 lines saved.
Prepmat> 11489 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2511
RTB> Total mass = 2511.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2511
RTB> Number of blocks = 162
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 210901.7742
RTB> 59274 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 972
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59274
Diagstd> Projected matrix trace = 210901.7742
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 972 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 210901.7742
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.4716670 2.7829713 3.8591301 4.8931372
6.4013818 7.7501155 8.1597097 8.6835614 8.9026058
9.4783175 10.2143528 11.3333525 12.5465672 12.9491364
13.5453530 13.9710143 14.9042899 16.0010312 16.6575137
17.3741399 17.5985552 18.1511553 18.9379359 19.5783738
20.5287762 21.2578467 22.6941947 23.2929855 23.9206715
24.5693039 25.4288628 25.7170608 26.0623739 26.8825605
27.7313500 27.9153757 28.3293469 28.5812353 29.4762725
29.5806166 30.9139985 31.3977907 31.9511763 32.9108508
33.5607056 34.0871568 34.4730551 35.4658083 35.9716020
36.6499381 37.0083383 37.9220678 38.4428349 39.3959051
40.0488546 40.2327172 41.0311042 41.3816063 42.7447170
43.2600264 43.7446545 44.1749213 44.6910951 45.6134477
46.5580066 47.0038965 47.4185275 48.1007415 48.8518048
49.0170342 49.9776601 50.2523709 50.9076392 52.6030201
52.8343684 54.1760873 54.6983801 54.9912880 55.6464479
56.5196585 57.0803207 57.2805502 57.5971299 57.9719719
58.6520100 59.5176685 60.2168985 60.4052945 61.0099803
61.8526689 62.4130387 62.9987767 63.0202317 64.4808929
64.7484859 65.0831765 66.0286493 66.2237361 66.7385435
67.1491590
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034338 0.0034341 0.0034341 0.0034342 0.0034344
0.0034345 170.7223041 181.1547171 213.3241324 240.2088357
274.7464860 302.3078106 310.1934577 319.9957572 324.0065967
334.3188823 347.0569188 365.5733077 384.6429162 390.7650224
399.6597793 405.8908385 419.2286218 434.3794456 443.2006307
452.6337535 455.5476262 462.6445141 472.5650530 480.4891538
492.0132635 500.6738574 517.3121377 524.0923960 531.1069241
538.2595030 547.5940862 550.6884222 554.3732497 563.0287818
571.8482365 573.7424970 577.9809989 580.5448513 589.5648213
590.6074105 603.7718645 608.4779223 613.8167081 622.9667041
629.0871607 634.0020610 637.5807073 646.6960549 651.2911396
657.4033353 660.6098926 668.7153395 673.2912701 681.5862516
687.2113598 688.7870331 695.5876821 698.5523411 709.9642869
714.2309579 718.2204652 721.7439841 725.9484442 733.4013927
740.9560853 744.4957298 747.7721948 753.1321132 758.9891837
760.2716491 767.6853266 769.7922924 774.7949103 787.5907735
789.3207873 799.2802803 803.1238304 805.2713094 810.0540611
816.3850531 820.4242385 821.8619433 824.1299581 826.8073276
831.6426053 837.7573279 842.6640611 843.9812209 848.1950287
854.0327048 857.8926439 861.9088472 862.0556012 871.9885890
873.7960735 876.0515271 882.3918472 883.6944335 887.1225983
889.8474686
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2511
Rtb_to_modes> Number of blocs = 162
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.472
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.783
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.859
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.893
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.160
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.478
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.15
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 972 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003
1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00004 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 45198 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003
1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 1.00004 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090028133442294.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090028133442294.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610090028133442294.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090028133442294.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.472
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.783
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.859
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.160
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.478
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.15
Bfactors> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.472000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.025 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.025
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610090028133442294.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090028133442294.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.8
Chkmod> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2511 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9089
0.0034 0.9866
0.0034 0.9396
0.0034 0.7633
0.0034 0.7115
0.0034 0.7659
170.7265 0.4861
181.1479 0.5613
213.3114 0.5674
240.1952 0.3694
274.7265 0.2111
302.2926 0.4877
310.1857 0.2758
319.9901 0.2559
323.9999 0.4362
334.2989 0.5522
346.9681 0.3415
365.5035 0.4396
384.6790 0.4440
390.7613 0.3665
399.7112 0.2012
405.8587 0.4479
419.1503 0.2896
434.3468 0.5188
443.2147 0.3479
452.5604 0.5619
455.5468 0.4151
462.6099 0.3529
472.5705 0.3323
480.4885 0.4568
492.0068 0.6460
500.6777 0.6002
517.2421 0.4659
524.0363 0.2461
531.0767 0.3856
538.2440 0.4461
547.5828 0.4906
550.6962 0.1762
554.3242 0.5327
562.9778 0.2797
571.8098 0.5036
573.7654 0.4435
577.9628 0.4813
580.5074 0.4578
589.5768 0.4929
590.5759 0.4908
603.7069 0.4318
608.4732 0.4088
613.7791 0.4068
622.9319 0.4026
629.0535 0.3671
634.0013 0.3728
637.5251 0.3348
646.7065 0.2123
651.2487 0.5394
657.3757 0.4847
660.5964 0.5368
668.6684 0.4858
673.2375 0.4345
681.5924 0.5151
687.1917 0.4064
688.7342 0.2680
695.5485 0.5356
698.5088 0.4274
709.8946 0.4894
714.2001 0.4295
718.1514 0.4137
721.6728 0.4324
725.9084 0.4695
733.3422 0.4739
740.9401 0.4192
744.4329 0.5261
747.7517 0.5573
753.0940 0.4995
758.9426 0.4263
760.2620 0.4764
767.6703 0.3597
769.7411 0.4696
774.7796 0.3577
787.5344 0.4954
789.2543 0.5120
799.2748 0.5475
803.1012 0.4556
805.2273 0.3030
810.0451 0.3294
816.3525 0.4059
820.3867 0.3540
821.8227 0.4474
824.1151 0.2541
826.7578 0.4060
831.5927 0.4168
837.7378 0.5024
842.6496 0.3077
843.9779 0.4656
848.1588 0.4497
853.9776 0.4509
857.8349 0.4245
861.8802 0.5087
862.0170 0.5307
871.9451 0.4585
873.7688 0.4781
875.9925 0.2494
882.3630 0.5244
883.6316 0.3857
887.0942 0.3837
889.8148 0.3985
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610090028133442294.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610090028133442294.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610090028133442294.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610090028133442294.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610090028133442294.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610090028133442294.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.8
Projmod> 106 vectors, 7533 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 323
First residue number = 1
Last residue number = 323
Number of atoms found = 2511
Mean number per residue = 7.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2511 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.31
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.003 Sum= 0.000 q= -0.1902
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.006 Sum= 0.000 q= 0.3821
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.051 Sum= 0.003 q= -3.3226
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.041 Sum= 0.004 q= 2.6728
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.004 Sum= 0.004 q= 0.2748
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.014 Sum= 0.005 q= 0.9089
Vector: 7 F= 170.73 Cos= 0.185 Sum= 0.039 q= 12.1102
Vector: 8 F= 181.15 Cos= 0.040 Sum= 0.040 q= 2.6363
Vector: 9 F= 213.31 Cos= 0.320 Sum= 0.143 q= 20.9582
Vector: 10 F= 240.20 Cos= 0.134 Sum= 0.161 q= 8.7662
Vector: 11 F= 274.73 Cos= -0.055 Sum= 0.164 q= -3.5988
Vector: 12 F= 302.29 Cos= 0.157 Sum= 0.189 q= 10.2669
Vector: 13 F= 310.19 Cos= 0.019 Sum= 0.189 q= 1.2174
Vector: 14 F= 319.99 Cos= -0.007 Sum= 0.189 q= -0.4315
Vector: 15 F= 324.00 Cos= -0.063 Sum= 0.193 q= -4.1164
Vector: 16 F= 334.30 Cos= -0.048 Sum= 0.195 q= -3.1265
Vector: 17 F= 346.97 Cos= -0.112 Sum= 0.208 q= -7.3137
Vector: 18 F= 365.50 Cos= -0.046 Sum= 0.210 q= -2.9836
Vector: 19 F= 384.68 Cos= 0.090 Sum= 0.218 q= 5.8687
Vector: 20 F= 390.76 Cos= -0.032 Sum= 0.219 q= -2.0823
Vector: 21 F= 399.71 Cos= -0.068 Sum= 0.224 q= -4.4566
Vector: 22 F= 405.86 Cos= -0.005 Sum= 0.224 q= -0.3498
Vector: 23 F= 419.15 Cos= -0.036 Sum= 0.225 q= -2.3741
Vector: 24 F= 434.35 Cos= 0.021 Sum= 0.225 q= 1.3867
Vector: 25 F= 443.21 Cos= -0.064 Sum= 0.230 q= -4.1548
Vector: 26 F= 452.56 Cos= 0.058 Sum= 0.233 q= 3.8190
Vector: 27 F= 455.55 Cos= -0.001 Sum= 0.233 q= -0.0684
Vector: 28 F= 462.61 Cos= -0.025 Sum= 0.234 q= -1.6169
Vector: 29 F= 472.57 Cos= 0.021 Sum= 0.234 q= 1.3830
Vector: 30 F= 480.49 Cos= 0.052 Sum= 0.237 q= 3.4014
Vector: 31 F= 492.01 Cos= -0.106 Sum= 0.248 q= -6.9376
Vector: 32 F= 500.68 Cos= 0.090 Sum= 0.256 q= 5.9029
Vector: 33 F= 517.24 Cos= -0.071 Sum= 0.261 q= -4.6650
Vector: 34 F= 524.04 Cos= 0.083 Sum= 0.268 q= 5.4500
Vector: 35 F= 531.08 Cos= -0.068 Sum= 0.273 q= -4.4690
Vector: 36 F= 538.24 Cos= -0.060 Sum= 0.276 q= -3.9344
Vector: 37 F= 547.58 Cos= 0.032 Sum= 0.277 q= 2.1173
Vector: 38 F= 550.70 Cos= -0.035 Sum= 0.279 q= -2.2586
Vector: 39 F= 554.32 Cos= -0.019 Sum= 0.279 q= -1.2288
Vector: 40 F= 562.98 Cos= 0.052 Sum= 0.282 q= 3.4170
Vector: 41 F= 571.81 Cos= 0.007 Sum= 0.282 q= 0.4420
Vector: 42 F= 573.77 Cos= 0.032 Sum= 0.283 q= 2.0768
Vector: 43 F= 577.96 Cos= -0.064 Sum= 0.287 q= -4.1881
Vector: 44 F= 580.51 Cos= 0.051 Sum= 0.290 q= 3.3574
Vector: 45 F= 589.58 Cos= 0.038 Sum= 0.291 q= 2.4911
Vector: 46 F= 590.58 Cos= -0.020 Sum= 0.291 q= -1.3240
Vector: 47 F= 603.71 Cos= 0.068 Sum= 0.296 q= 4.4386
Vector: 48 F= 608.47 Cos= 0.038 Sum= 0.297 q= 2.4826
Vector: 49 F= 613.78 Cos= -0.051 Sum= 0.300 q= -3.3097
Vector: 50 F= 622.93 Cos= -0.014 Sum= 0.300 q= -0.9381
Vector: 51 F= 629.05 Cos= 0.055 Sum= 0.303 q= 3.6217
Vector: 52 F= 634.00 Cos= -0.010 Sum= 0.303 q= -0.6554
Vector: 53 F= 637.53 Cos= 0.039 Sum= 0.305 q= 2.5711
Vector: 54 F= 646.71 Cos= -0.034 Sum= 0.306 q= -2.2360
Vector: 55 F= 651.25 Cos= -0.015 Sum= 0.306 q= -0.9922
Vector: 56 F= 657.38 Cos= 0.062 Sum= 0.310 q= 4.0247
Vector: 57 F= 660.60 Cos= 0.010 Sum= 0.310 q= 0.6619
Vector: 58 F= 668.67 Cos= -0.102 Sum= 0.321 q= -6.6461
Vector: 59 F= 673.24 Cos= -0.028 Sum= 0.321 q= -1.8149
Vector: 60 F= 681.59 Cos= 0.044 Sum= 0.323 q= 2.9086
Vector: 61 F= 687.19 Cos= 0.030 Sum= 0.324 q= 1.9390
Vector: 62 F= 688.73 Cos= 0.096 Sum= 0.333 q= 6.2771
Vector: 63 F= 695.55 Cos= 0.023 Sum= 0.334 q= 1.4754
Vector: 64 F= 698.51 Cos= 0.022 Sum= 0.334 q= 1.4613
Vector: 65 F= 709.89 Cos= -0.049 Sum= 0.337 q= -3.2125
Vector: 66 F= 714.20 Cos= -0.044 Sum= 0.339 q= -2.9019
Vector: 67 F= 718.15 Cos= -0.011 Sum= 0.339 q= -0.7347
Vector: 68 F= 721.67 Cos= 0.031 Sum= 0.340 q= 2.0170
Vector: 69 F= 725.91 Cos= 0.002 Sum= 0.340 q= 0.1194
Vector: 70 F= 733.34 Cos= -0.053 Sum= 0.343 q= -3.4453
Vector: 71 F= 740.94 Cos= 0.029 Sum= 0.343 q= 1.9064
Vector: 72 F= 744.43 Cos= 0.050 Sum= 0.346 q= 3.2620
Vector: 73 F= 747.75 Cos= 0.039 Sum= 0.347 q= 2.5799
Vector: 74 F= 753.09 Cos= 0.060 Sum= 0.351 q= 3.9489
Vector: 75 F= 758.94 Cos= -0.013 Sum= 0.351 q= -0.8697
Vector: 76 F= 760.26 Cos= 0.002 Sum= 0.351 q= 0.1465
Vector: 77 F= 767.67 Cos= -0.026 Sum= 0.352 q= -1.7060
Vector: 78 F= 769.74 Cos= -0.072 Sum= 0.357 q= -4.7081
Vector: 79 F= 774.78 Cos= 0.033 Sum= 0.358 q= 2.1763
Vector: 80 F= 787.53 Cos= -0.092 Sum= 0.367 q= -5.9888
Vector: 81 F= 789.25 Cos= -0.021 Sum= 0.367 q= -1.3774
Vector: 82 F= 799.27 Cos= 0.020 Sum= 0.368 q= 1.2816
Vector: 83 F= 803.10 Cos= -0.039 Sum= 0.369 q= -2.5231
Vector: 84 F= 805.23 Cos= -0.044 Sum= 0.371 q= -2.8541
Vector: 85 F= 810.05 Cos= 0.040 Sum= 0.373 q= 2.6228
Vector: 86 F= 816.35 Cos= -0.008 Sum= 0.373 q= -0.5344
Vector: 87 F= 820.39 Cos= -0.048 Sum= 0.375 q= -3.1391
Vector: 88 F= 821.82 Cos= 0.013 Sum= 0.375 q= 0.8694
Vector: 89 F= 824.12 Cos= 0.006 Sum= 0.375 q= 0.4147
Vector: 90 F= 826.76 Cos= -0.050 Sum= 0.378 q= -3.2880
Vector: 91 F= 831.59 Cos= 0.063 Sum= 0.382 q= 4.1271
Vector: 92 F= 837.74 Cos= 0.033 Sum= 0.383 q= 2.1382
Vector: 93 F= 842.65 Cos= -0.038 Sum= 0.384 q= -2.5033
Vector: 94 F= 843.98 Cos= -0.003 Sum= 0.384 q= -0.1685
Vector: 95 F= 848.16 Cos= 0.005 Sum= 0.384 q= 0.3530
Vector: 96 F= 853.98 Cos= 0.046 Sum= 0.386 q= 3.0394
Vector: 97 F= 857.83 Cos= -0.029 Sum= 0.387 q= -1.8948
Vector: 98 F= 861.88 Cos= -0.055 Sum= 0.390 q= -3.5926
Vector: 99 F= 862.02 Cos= -0.016 Sum= 0.390 q= -1.0162
Vector: 100 F= 871.95 Cos= -0.049 Sum= 0.393 q= -3.2240
Vector: 101 F= 873.77 Cos= 0.032 Sum= 0.394 q= 2.1167
Vector: 102 F= 875.99 Cos= -0.012 Sum= 0.394 q= -0.7908
Vector: 103 F= 882.36 Cos= 0.001 Sum= 0.394 q= 0.0836
Vector: 104 F= 883.63 Cos= 0.019 Sum= 0.394 q= 1.2586
Vector: 105 F= 887.09 Cos= 0.008 Sum= 0.394 q= 0.4924
Vector: 106 F= 889.81 Cos= 0.013 Sum= 0.395 q= 0.8361
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003434
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 170.726474
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.32 for mode 9 with F= 213.31 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.103 0.162 0.203 0.231 0.254 0.395
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090028133442294 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
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2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 323 2.358 263 1.472
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 323 1.998 278 1.362
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 323 1.654 299 1.350
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 323 1.339 315 1.243
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 323 1.078 321 1.050
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 323 0.918 322 0.904
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 323 0.915 323 0.915
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 323 1.069 323 1.069
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 323 1.327 321 1.304
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 323 1.641 307 1.487
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 323 1.984 280 1.536
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090028133442294 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090028133442294.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 323 2.168 275 1.781
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 323 1.825 304 1.674
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 323 1.503 321 1.472
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 323 1.219 321 1.197
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 323 1.007 323 1.007
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 323 0.918 322 0.904
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 323 0.985 321 0.945
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 323 1.182 318 1.086
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 323 1.458 312 1.251
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 323 1.775 303 1.439
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 323 2.116 280 1.490
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090028133442294 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090028133442294.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090028133442294.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 323 2.525 263 1.600
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 323 2.158 271 1.437
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 323 1.801 295 1.425
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 323 1.462 312 1.313
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 323 1.156 320 1.111
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 323 0.918 322 0.904
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 323 0.810 323 0.810
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 323 0.881 323 0.881
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 323 1.097 323 1.097
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 323 1.392 318 1.340
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 323 1.725 301 1.504
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090028133442294 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090028133442294.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 323 2.206 277 1.409
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 323 1.871 292 1.353
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 323 1.554 306 1.277
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 323 1.269 316 1.142
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 323 1.042 319 0.983
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 323 0.918 322 0.904
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 323 0.939 323 0.939
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 323 1.095 323 1.095
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 323 1.341 319 1.275
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 323 1.637 306 1.415
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 323 1.960 293 1.558
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610090028133442294 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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2610090028133442294.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610090028133442294.eigenfacs
2610090028133442294.atom
making animated gifs
11 models are in 2610090028133442294.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610090028133442294.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 323 2.022 287 1.314
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 323 1.701 304 1.304
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 323 1.405 311 1.176
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 323 1.151 319 1.078
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 323 0.974 322 0.960
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 323 0.918 322 0.904
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 323 1.005 321 0.973
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 323 1.203 317 1.066
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 323 1.468 309 1.137
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 323 1.771 303 1.220
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 323 2.095 295 1.298
2610090028133442294.10.pdb
2610090028133442294.11.pdb
2610090028133442294.7.pdb
2610090028133442294.8.pdb
2610090028133442294.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.467s
user 0m12.389s
sys 0m0.075s
rm: cannot remove '2610090028133442294.sdijf': No such file or directory
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