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***  AtTPS1  ***

LOGs for ID: 261012134737719107

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261012134737719107.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261012134737719107.atom to be opened. Openam> File opened: 261012134737719107.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 942 First residue number = 1 Last residue number = 942 Number of atoms found = 7462 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -11.128937 +/- 25.389382 From: -84.248000 To: 45.807000 = 5.685953 +/- 16.507586 From: -30.188000 To: 60.378000 = 3.589525 +/- 20.629689 From: -44.922000 To: 56.460000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0076 % Filled. Pdbmat> 2524838 non-zero elements. Pdbmat> 275609 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 73.87 +/- 27.49 Maximum number = 137 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.512180E+06 Pdbmat> Larger element = 488.938 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 942 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261012134737719107.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261012134737719107.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261012134737719107.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7462 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 942 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 39 atoms in block 3 Block first atom: 75 Blocpdb> 44 atoms in block 4 Block first atom: 114 Blocpdb> 46 atoms in block 5 Block first atom: 158 Blocpdb> 46 atoms in block 6 Block first atom: 204 Blocpdb> 45 atoms in block 7 Block first atom: 250 Blocpdb> 39 atoms in block 8 Block first atom: 295 Blocpdb> 30 atoms in block 9 Block first atom: 334 Blocpdb> 38 atoms in block 10 Block first atom: 364 Blocpdb> 43 atoms in block 11 Block first atom: 402 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 445 Blocpdb> 48 atoms in block 13 Block first atom: 478 Blocpdb> 42 atoms in block 14 Block first atom: 526 Blocpdb> 28 atoms in block 15 Block first atom: 568 Blocpdb> 36 atoms in block 16 Block first atom: 596 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 632 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 676 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 721 Blocpdb> 38 atoms in block 20 Block first atom: 768 Blocpdb> 33 atoms in block 21 Block first atom: 806 Blocpdb> 42 atoms in block 22 Block first atom: 839 Blocpdb> 42 atoms in block 23 Block first atom: 881 Blocpdb> 32 atoms in block 24 Block first atom: 923 Blocpdb> 30 atoms in block 25 Block first atom: 955 Blocpdb> 36 atoms in block 26 Block first atom: 985 Blocpdb> 45 atoms in block 27 Block first atom: 1021 Blocpdb> 45 atoms in block 28 Block first atom: 1066 Blocpdb> 33 atoms in block 29 Block first atom: 1111 Blocpdb> 37 atoms in block 30 Block first atom: 1144 Blocpdb> 37 atoms in block 31 Block first atom: 1181 Blocpdb> 36 atoms in block 32 Block first atom: 1218 Blocpdb> 39 atoms in block 33 Block first atom: 1254 Blocpdb> 45 atoms in block 34 Block first atom: 1293 Blocpdb> 46 atoms in block 35 Block first atom: 1338 Blocpdb> 42 atoms in block 36 Block first atom: 1384 Blocpdb> 46 atoms in block 37 Block first atom: 1426 Blocpdb> 48 atoms in block 38 Block first atom: 1472 Blocpdb> 36 atoms in block 39 Block first atom: 1520 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1556 Blocpdb> 42 atoms in block 41 Block first atom: 1597 Blocpdb> 40 atoms in block 42 Block first atom: 1639 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1679 Blocpdb> 41 atoms in block 44 Block first atom: 1719 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1760 Blocpdb> 44 atoms in block 46 Block first atom: 1799 Blocpdb> 42 atoms in block 47 Block first atom: 1843 Blocpdb> 48 atoms in block 48 Block first atom: 1885 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 1933 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 1976 Blocpdb> 40 atoms in block 51 Block first atom: 2020 Blocpdb> 44 atoms in block 52 Block first atom: 2060 Blocpdb> 42 atoms in block 53 Block first atom: 2104 Blocpdb> 39 atoms in block 54 Block first atom: 2146 Blocpdb> 39 atoms in block 55 Block first atom: 2185 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2224 Blocpdb> 37 atoms in block 57 Block first atom: 2266 Blocpdb> 32 atoms in block 58 Block first atom: 2303 Blocpdb> 48 atoms in block 59 Block first atom: 2335 Blocpdb> 49 atoms in block 60 Block first atom: 2383 Blocpdb> 31 atoms in block 61 Block first atom: 2432 Blocpdb> 39 atoms in block 62 Block first atom: 2463 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2502 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2538 Blocpdb> 41 atoms in block 65 Block first atom: 2575 Blocpdb> 35 atoms in block 66 Block first atom: 2616 Blocpdb> 34 atoms in block 67 Block first atom: 2651 Blocpdb> 49 atoms in block 68 Block first atom: 2685 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 2734 Blocpdb> 43 atoms in block 70 Block first atom: 2770 Blocpdb> 43 atoms in block 71 Block first atom: 2813 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2856 Blocpdb> 43 atoms in block 73 Block first atom: 2896 Blocpdb> 38 atoms in block 74 Block first atom: 2939 Blocpdb> 37 atoms in block 75 Block first atom: 2977 Blocpdb> 41 atoms in block 76 Block first atom: 3014 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 3055 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3097 Blocpdb> 46 atoms in block 79 Block first atom: 3142 Blocpdb> 39 atoms in block 80 Block first atom: 3188 Blocpdb> 36 atoms in block 81 Block first atom: 3227 Blocpdb> 40 atoms in block 82 Block first atom: 3263 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 3303 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3349 Blocpdb> 38 atoms in block 85 Block first atom: 3386 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3424 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3466 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3503 Blocpdb> 43 atoms in block 89 Block first atom: 3540 Blocpdb> 42 atoms in block 90 Block first atom: 3583 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 3625 Blocpdb> 34 atoms in block 92 Block first atom: 3664 Blocpdb> 33 atoms in block 93 Block first atom: 3698 Blocpdb> 39 atoms in block 94 Block first atom: 3731 Blocpdb> 41 atoms in block 95 Block first atom: 3770 Blocpdb> 38 atoms in block 96 Block first atom: 3811 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 3849 Blocpdb> 35 atoms in block 98 Block first atom: 3890 Blocpdb> 35 atoms in block 99 Block first atom: 3925 Blocpdb> 33 atoms in block 100 Block first atom: 3960 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 3993 Blocpdb> 44 atoms in block 102 Block first atom: 4019 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 4063 Blocpdb> 28 atoms in block 104 Block first atom: 4102 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 4130 Blocpdb> 41 atoms in block 106 Block first atom: 4168 Blocpdb> 50 atoms in block 107 Block first atom: 4209 Blocpdb> 49 atoms in block 108 Block first atom: 4259 Blocpdb> 40 atoms in block 109 Block first atom: 4308 Blocpdb> 42 atoms in block 110 Block first atom: 4348 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 4390 Blocpdb> 40 atoms in block 112 Block first atom: 4430 Blocpdb> 38 atoms in block 113 Block first atom: 4470 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 4508 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4550 Blocpdb> 39 atoms in block 116 Block first atom: 4588 Blocpdb> 46 atoms in block 117 Block first atom: 4627 Blocpdb> 42 atoms in block 118 Block first atom: 4673 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 4715 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 4751 Blocpdb> 38 atoms in block 121 Block first atom: 4790 Blocpdb> 43 atoms in block 122 Block first atom: 4828 Blocpdb> 38 atoms in block 123 Block first atom: 4871 Blocpdb> 41 atoms in block 124 Block first atom: 4909 Blocpdb> 42 atoms in block 125 Block first atom: 4950 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 4992 Blocpdb> 33 atoms in block 127 Block first atom: 5029 Blocpdb> 35 atoms in block 128 Block first atom: 5062 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 5097 Blocpdb> 36 atoms in block 130 Block first atom: 5129 Blocpdb> 44 atoms in block 131 Block first atom: 5165 Blocpdb> 41 atoms in block 132 Block first atom: 5209 Blocpdb> 41 atoms in block 133 Block first atom: 5250 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 5291 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 5330 Blocpdb> 45 atoms in block 136 Block first atom: 5368 Blocpdb> 42 atoms in block 137 Block first atom: 5413 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 5455 Blocpdb> 40 atoms in block 139 Block first atom: 5501 Blocpdb> 50 atoms in block 140 Block first atom: 5541 Blocpdb> 41 atoms in block 141 Block first atom: 5591 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 5632 Blocpdb> 39 atoms in block 143 Block first atom: 5679 Blocpdb> 50 atoms in block 144 Block first atom: 5718 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 5768 Blocpdb> 43 atoms in block 146 Block first atom: 5810 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 5853 Blocpdb> 49 atoms in block 148 Block first atom: 5894 Blocpdb> 32 atoms in block 149 Block first atom: 5943 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 5975 Blocpdb> 33 atoms in block 151 Block first atom: 6009 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6042 Blocpdb> 34 atoms in block 153 Block first atom: 6082 Blocpdb> 30 atoms in block 154 Block first atom: 6116 Blocpdb> 43 atoms in block 155 Block first atom: 6146 Blocpdb> 38 atoms in block 156 Block first atom: 6189 Blocpdb> 36 atoms in block 157 Block first atom: 6227 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 6263 Blocpdb> 33 atoms in block 159 Block first atom: 6305 Blocpdb> 42 atoms in block 160 Block first atom: 6338 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 6380 Blocpdb> 45 atoms in block 162 Block first atom: 6424 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 6469 Blocpdb> 33 atoms in block 164 Block first atom: 6507 Blocpdb> 41 atoms in block 165 Block first atom: 6540 Blocpdb> 29 atoms in block 166 Block first atom: 6581 Blocpdb> 31 atoms in block 167 Block first atom: 6610 Blocpdb> 44 atoms in block 168 Block first atom: 6641 Blocpdb> 38 atoms in block 169 Block first atom: 6685 Blocpdb> 39 atoms in block 170 Block first atom: 6723 Blocpdb> 31 atoms in block 171 Block first atom: 6762 Blocpdb> 32 atoms in block 172 Block first atom: 6793 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 6825 Blocpdb> 38 atoms in block 174 Block first atom: 6866 Blocpdb> 43 atoms in block 175 Block first atom: 6904 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 6947 Blocpdb> 36 atoms in block 177 Block first atom: 6980 Blocpdb> 41 atoms in block 178 Block first atom: 7016 Blocpdb> 39 atoms in block 179 Block first atom: 7057 Blocpdb> 45 atoms in block 180 Block first atom: 7096 Blocpdb> 38 atoms in block 181 Block first atom: 7141 Blocpdb> 40 atoms in block 182 Block first atom: 7179 Blocpdb> 40 atoms in block 183 Block first atom: 7219 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 7259 Blocpdb> 33 atoms in block 185 Block first atom: 7302 Blocpdb> 36 atoms in block 186 Block first atom: 7335 Blocpdb> 45 atoms in block 187 Block first atom: 7371 Blocpdb> 33 atoms in block 188 Block first atom: 7416 Blocpdb> 14 atoms in block 189 Block first atom: 7448 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 50 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2525027 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22386 Prepmat> Matrix trace = 5512180.0000 Prepmat> Last element read: 22386 22386 59.1402 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 16462 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7462 RTB> Total mass = 7462.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7462 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 182422.4596 RTB> 50913 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50913 Diagstd> Projected matrix trace = 182422.4596 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 182422.4596 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0003119 0.0011587 0.0016036 0.0037048 0.0055138 0.0106487 0.0126805 0.0242722 0.0300339 0.0349870 0.0455168 0.0510054 0.0568247 0.0711403 0.0903309 0.1138572 0.1650586 0.1738822 0.1804018 0.1928304 0.2249789 0.2285928 0.2335493 0.2623021 0.2896361 0.3457144 0.4388036 0.4567320 0.5110917 0.5183092 0.5435004 0.5955785 0.6320219 0.7060937 0.7655064 0.8352831 0.8869745 0.9002200 0.9150092 0.9471663 1.1400148 1.1621731 1.1775767 1.2668326 1.2836497 1.4426135 1.5707453 1.6226222 1.6683543 1.7602085 1.7940843 1.8450759 1.8883250 2.1371039 2.1554983 2.2887262 2.3423505 2.4220644 2.5098754 2.6194742 2.7094661 2.7357567 2.8926836 2.9928783 3.2498741 3.3365074 3.5643253 3.6900363 3.6988182 3.7708934 3.9859410 4.1929187 4.3325476 4.6342181 4.7525863 4.8416646 4.9839728 5.0435436 5.0682348 5.2056486 5.2796008 5.6280388 5.6620068 5.7341167 5.8444779 6.1009594 6.1433868 6.2778368 6.5706824 6.7180899 7.0122574 7.0654896 7.3653416 7.4841477 7.6192660 7.8453309 8.2104032 8.3922941 8.5960847 8.6693643 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034328 0.0034336 0.0034338 0.0034344 0.0034345 1.9176964 3.6964227 4.3485298 6.6096233 8.0634175 11.2058129 12.2282047 16.9180393 18.8191879 20.3118153 23.1676038 24.5246703 25.8859355 28.9636349 32.6372343 36.6416889 44.1178484 45.2817156 46.1228109 47.6851390 51.5069923 51.9190228 52.4788797 55.6155443 58.4415384 63.8489899 71.9333652 73.3881588 77.6326989 78.1789323 80.0562478 83.8040092 86.3299218 91.2486509 95.0100817 99.2457985 102.2706112 103.0314034 103.8742779 105.6837972 115.9446001 117.0659758 117.8392270 122.2235497 123.0321294 130.4278314 136.0968795 138.3260516 140.2618068 144.0712531 145.4509962 147.5035238 149.2222728 158.7479409 159.4296593 164.2828404 166.1962493 169.0005532 172.0368018 175.7528352 178.7463321 179.6114483 184.6910060 187.8623749 195.7620698 198.3541663 205.0142016 208.5982214 208.8462948 210.8712680 216.8007171 222.3583796 226.0304522 233.7671667 236.7338101 238.9420759 242.4281869 243.8726918 244.4689137 247.7608632 249.5145187 257.6165857 258.3928383 260.0330463 262.5234724 268.2219696 269.1529904 272.0823006 278.3559554 281.4609733 287.5571722 288.6465776 294.7078662 297.0752395 299.7449309 304.1591696 311.1555298 314.5832737 318.3798860 319.7340633 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7462 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1187E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1587E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6036E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7048E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5138E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0649E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2680E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4272E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0034E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4987E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5517E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1005E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6825E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1140E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0331E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1739 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7061 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8870 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.178 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.443 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.888 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.619 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.709 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.893 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.337 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.699 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.619 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.669 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00003 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 1.00005 1.00004 1.00000 0.99995 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00003 1.00005 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 0.99998 1.00001 1.00004 0.99996 1.00005 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 134316 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00003 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 1.00005 1.00004 1.00000 0.99995 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00003 1.00005 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 0.99998 1.00001 1.00004 0.99996 1.00005 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012134737719107.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012134737719107.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261012134737719107.atom Openam> file on opening on unit 11: 261012134737719107.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 942 First residue number = 1 Last residue number = 942 Number of atoms found = 7462 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1187E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1587E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6036E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7048E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5138E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0649E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2680E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4272E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0034E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4987E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5517E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1005E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6825E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1140E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0331E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1739 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8870 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.178 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.443 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.888 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.619 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.893 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.337 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.699 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.619 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.669 Bfactors> 106 vectors, 22386 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000312 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.410 for 942 C-alpha atoms. Bfactors> = 12.101 +/- 50.81 Bfactors> = 0.778 +/- 0.23 Bfactors> Shiftng-fct= -11.323 Bfactors> Scaling-fct= 0.005 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012134737719107.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012134737719107.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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Chkmod> That is: 7462 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 57 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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261012134737719107 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012134737719107.eigenfacs 261012134737719107.atom making animated gifs 11 models are in 261012134737719107.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012134737719107.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012134737719107.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making 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