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***  AtTPS1_Modelo_sin_Cterminal_sin_NHterminal  ***

LOGs for ID: 261012135337721839

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261012135337721839.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261012135337721839.atom to be opened. Openam> File opened: 261012135337721839.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 718 First residue number = 1 Last residue number = 718 Number of atoms found = 5731 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -8.280992 +/- 23.573490 From: -59.059000 To: 37.177000 = 0.229818 +/- 11.829348 From: -30.186000 To: 29.506000 = 1.282518 +/- 20.288219 From: -44.923000 To: 47.297000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4208 % Filled. Pdbmat> 2100071 non-zero elements. Pdbmat> 229560 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.11 +/- 23.04 Maximum number = 137 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 4.591200E+06 Pdbmat> Larger element = 488.840 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 718 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261012135337721839.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261012135337721839.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261012135337721839.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5731 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 718 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 27 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 33 atoms in block 3 Block first atom: 64 Blocpdb> 29 atoms in block 4 Block first atom: 97 Blocpdb> 32 atoms in block 5 Block first atom: 126 Blocpdb> 34 atoms in block 6 Block first atom: 158 Blocpdb> 28 atoms in block 7 Block first atom: 192 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 220 Blocpdb> 27 atoms in block 9 Block first atom: 243 Blocpdb> 29 atoms in block 10 Block first atom: 270 Blocpdb> 36 atoms in block 11 Block first atom: 299 Blocpdb> 40 atoms in block 12 Block first atom: 335 Blocpdb> 24 atoms in block 13 Block first atom: 375 Blocpdb> 31 atoms in block 14 Block first atom: 399 Blocpdb> 29 atoms in block 15 Block first atom: 430 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 459 Blocpdb> 27 atoms in block 17 Block first atom: 487 Blocpdb> 34 atoms in block 18 Block first atom: 514 Blocpdb> 33 atoms in block 19 Block first atom: 548 Blocpdb> 34 atoms in block 20 Block first atom: 581 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 615 Blocpdb> 36 atoms in block 22 Block first atom: 653 Blocpdb> 30 atoms in block 23 Block first atom: 689 Blocpdb> 37 atoms in block 24 Block first atom: 719 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 756 Blocpdb> 28 atoms in block 26 Block first atom: 797 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 825 Blocpdb> 30 atoms in block 28 Block first atom: 861 Blocpdb> 32 atoms in block 29 Block first atom: 891 Blocpdb> 30 atoms in block 30 Block first atom: 923 Blocpdb> 35 atoms in block 31 Block first atom: 953 Blocpdb> 36 atoms in block 32 Block first atom: 988 Blocpdb> 27 atoms in block 33 Block first atom: 1024 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1051 Blocpdb> 30 atoms in block 35 Block first atom: 1090 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1120 Blocpdb> 40 atoms in block 37 Block first atom: 1154 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1194 Blocpdb> 30 atoms in block 39 Block first atom: 1229 Blocpdb> 38 atoms in block 40 Block first atom: 1259 Blocpdb> 32 atoms in block 41 Block first atom: 1297 Blocpdb> 36 atoms in block 42 Block first atom: 1329 Blocpdb> 32 atoms in block 43 Block first atom: 1365 Blocpdb> 30 atoms in block 44 Block first atom: 1397 Blocpdb> 38 atoms in block 45 Block first atom: 1427 Blocpdb> 28 atoms in block 46 Block first atom: 1465 Blocpdb> 34 atoms in block 47 Block first atom: 1493 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 1527 Blocpdb> 26 atoms in block 49 Block first atom: 1559 Blocpdb> 30 atoms in block 50 Block first atom: 1585 Blocpdb> 37 atoms in block 51 Block first atom: 1615 Blocpdb> 38 atoms in block 52 Block first atom: 1652 Blocpdb> 29 atoms in block 53 Block first atom: 1690 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 1719 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1751 Blocpdb> 27 atoms in block 56 Block first atom: 1780 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1807 Blocpdb> 32 atoms in block 58 Block first atom: 1835 Blocpdb> 30 atoms in block 59 Block first atom: 1867 Blocpdb> 31 atoms in block 60 Block first atom: 1897 Blocpdb> 26 atoms in block 61 Block first atom: 1928 Blocpdb> 38 atoms in block 62 Block first atom: 1954 Blocpdb> 33 atoms in block 63 Block first atom: 1992 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 2025 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2055 Blocpdb> 35 atoms in block 66 Block first atom: 2090 Blocpdb> 36 atoms in block 67 Block first atom: 2125 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 2161 Blocpdb> 27 atoms in block 69 Block first atom: 2192 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 2219 Blocpdb> 29 atoms in block 71 Block first atom: 2254 Blocpdb> 33 atoms in block 72 Block first atom: 2283 Blocpdb> 32 atoms in block 73 Block first atom: 2316 Blocpdb> 37 atoms in block 74 Block first atom: 2348 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2385 Blocpdb> 41 atoms in block 76 Block first atom: 2416 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 2457 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 2488 Blocpdb> 32 atoms in block 79 Block first atom: 2518 Blocpdb> 29 atoms in block 80 Block first atom: 2550 Blocpdb> 39 atoms in block 81 Block first atom: 2579 Blocpdb> 30 atoms in block 82 Block first atom: 2618 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 2648 Blocpdb> 30 atoms in block 84 Block first atom: 2682 Blocpdb> 34 atoms in block 85 Block first atom: 2712 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 2746 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2772 Blocpdb> 36 atoms in block 88 Block first atom: 2799 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 2835 Blocpdb> 34 atoms in block 90 Block first atom: 2868 Blocpdb> 31 atoms in block 91 Block first atom: 2902 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2933 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2960 Blocpdb> 32 atoms in block 94 Block first atom: 2987 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 3019 Blocpdb> 33 atoms in block 96 Block first atom: 3047 Blocpdb> 32 atoms in block 97 Block first atom: 3080 Blocpdb> 29 atoms in block 98 Block first atom: 3112 Blocpdb> 29 atoms in block 99 Block first atom: 3141 Blocpdb> 30 atoms in block 100 Block first atom: 3170 Blocpdb> 29 atoms in block 101 Block first atom: 3200 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 3229 Blocpdb> 21 atoms in block 103 Block first atom: 3254 Blocpdb> 28 atoms in block 104 Block first atom: 3275 Blocpdb> 37 atoms in block 105 Block first atom: 3303 Blocpdb> 31 atoms in block 106 Block first atom: 3340 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 3371 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 3395 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 3421 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 3449 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 3487 Blocpdb> 39 atoms in block 112 Block first atom: 3528 Blocpdb> 33 atoms in block 113 Block first atom: 3567 Blocpdb> 31 atoms in block 114 Block first atom: 3600 Blocpdb> 37 atoms in block 115 Block first atom: 3631 Blocpdb> 31 atoms in block 116 Block first atom: 3668 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3699 Blocpdb> 31 atoms in block 118 Block first atom: 3732 Blocpdb> 33 atoms in block 119 Block first atom: 3763 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3796 Blocpdb> 31 atoms in block 121 Block first atom: 3826 Blocpdb> 34 atoms in block 122 Block first atom: 3857 Blocpdb> 33 atoms in block 123 Block first atom: 3891 Blocpdb> 33 atoms in block 124 Block first atom: 3924 Blocpdb> 35 atoms in block 125 Block first atom: 3957 Blocpdb> 28 atoms in block 126 Block first atom: 3992 Blocpdb> 31 atoms in block 127 Block first atom: 4020 Blocpdb> 31 atoms in block 128 Block first atom: 4051 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 4082 Blocpdb> 30 atoms in block 130 Block first atom: 4114 Blocpdb> 34 atoms in block 131 Block first atom: 4144 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4178 Blocpdb> 33 atoms in block 133 Block first atom: 4211 Blocpdb> 30 atoms in block 134 Block first atom: 4244 Blocpdb> 29 atoms in block 135 Block first atom: 4274 Blocpdb> 28 atoms in block 136 Block first atom: 4303 Blocpdb> 27 atoms in block 137 Block first atom: 4331 Blocpdb> 30 atoms in block 138 Block first atom: 4358 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 4388 Blocpdb> 32 atoms in block 140 Block first atom: 4410 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 4442 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4478 Blocpdb> 35 atoms in block 143 Block first atom: 4511 Blocpdb> 26 atoms in block 144 Block first atom: 4546 Blocpdb> 38 atoms in block 145 Block first atom: 4572 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 4610 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 4637 Blocpdb> 31 atoms in block 148 Block first atom: 4675 Blocpdb> 34 atoms in block 149 Block first atom: 4706 Blocpdb> 38 atoms in block 150 Block first atom: 4740 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 4778 Blocpdb> 39 atoms in block 152 Block first atom: 4810 Blocpdb> 38 atoms in block 153 Block first atom: 4849 Blocpdb> 31 atoms in block 154 Block first atom: 4887 Blocpdb> 37 atoms in block 155 Block first atom: 4918 Blocpdb> 32 atoms in block 156 Block first atom: 4955 Blocpdb> 38 atoms in block 157 Block first atom: 4987 Blocpdb> 38 atoms in block 158 Block first atom: 5025 Blocpdb> 36 atoms in block 159 Block first atom: 5063 Blocpdb> 32 atoms in block 160 Block first atom: 5099 Blocpdb> 32 atoms in block 161 Block first atom: 5131 Blocpdb> 35 atoms in block 162 Block first atom: 5163 Blocpdb> 32 atoms in block 163 Block first atom: 5198 Blocpdb> 27 atoms in block 164 Block first atom: 5230 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 5257 Blocpdb> 26 atoms in block 166 Block first atom: 5285 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5311 Blocpdb> 30 atoms in block 168 Block first atom: 5344 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 5374 Blocpdb> 22 atoms in block 170 Block first atom: 5401 Blocpdb> 35 atoms in block 171 Block first atom: 5423 Blocpdb> 28 atoms in block 172 Block first atom: 5458 Blocpdb> 31 atoms in block 173 Block first atom: 5486 Blocpdb> 29 atoms in block 174 Block first atom: 5517 Blocpdb> 35 atoms in block 175 Block first atom: 5546 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 5581 Blocpdb> 33 atoms in block 177 Block first atom: 5607 Blocpdb> 34 atoms in block 178 Block first atom: 5640 Blocpdb> 37 atoms in block 179 Block first atom: 5674 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 5710 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2100251 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17193 Prepmat> Matrix trace = 4591200.0000 Prepmat> Last element read: 17193 17193 43.5451 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14663 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5731 RTB> Total mass = 5731.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5731 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 209904.0446 RTB> 55872 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55872 Diagstd> Projected matrix trace = 209904.0446 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 209904.0446 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0636003 0.1125903 0.1502879 0.4965104 0.9918069 1.2929084 1.7174198 1.8756154 2.0737345 2.5049197 3.5954575 3.8615212 4.0092413 4.0707262 4.1204362 4.5508579 5.5529374 6.2954571 6.4231760 6.6622052 6.7746796 7.6320763 7.7295310 8.1176290 8.4893274 8.5912513 9.4277422 9.6829888 10.1742592 10.5194078 10.8949004 11.3828350 11.8668988 12.0553303 12.4845725 12.7104084 13.4270853 13.4764517 14.3682379 14.6924720 15.0308331 15.3609198 15.5411477 16.7871661 17.0422221 17.3765661 17.9968053 18.1015160 18.9584774 19.6526400 19.9361213 20.2737271 20.4923650 20.7079728 20.9778892 21.2384539 21.8879609 22.2491816 22.6642262 23.0429637 23.6340561 24.1893642 24.5691415 24.7986324 25.1542275 25.2261973 25.4619768 26.2612730 26.5176613 26.9506671 27.3179780 28.0543282 28.5988947 28.8469694 29.2822322 29.3077687 29.9102574 30.3940042 31.1583250 31.6875887 32.0219297 32.4336643 33.3396631 33.6305374 33.8855482 34.3530216 34.7917038 35.0391397 35.6212766 36.3362310 36.4987349 36.8371500 37.6058223 38.2359492 38.5754855 38.8714511 38.9784375 39.2039734 39.8649883 39.9689463 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034315 0.0034316 0.0034334 0.0034338 0.0034339 0.0034348 27.3857715 36.4372582 42.0975981 76.5172693 108.1455961 123.4750348 142.3093761 148.7192462 156.3766310 171.8668779 205.9075925 213.3902117 217.4334601 219.0943756 220.4280584 231.6551266 255.8919765 272.4638669 275.2137895 280.2878573 282.6439283 299.9968058 301.9060740 309.3925696 316.3966825 318.2903653 333.4257443 337.9091839 346.3751122 352.2012774 358.4321132 366.3705026 374.0794924 377.0377515 383.6914470 387.1462285 397.9111915 398.6420062 411.6205369 416.2389493 421.0045665 425.6022261 428.0917169 444.9220958 448.2893181 452.6653566 460.6732441 462.0114667 472.8212732 481.3996052 484.8591701 488.9473298 491.5767359 494.1560006 497.3660924 500.4454317 508.0400295 512.2150098 516.9704606 521.2720606 527.9154979 534.0814660 538.2577242 540.7657106 544.6290125 545.4075865 547.9505144 556.4846220 559.1944980 563.7415434 567.5701617 575.1686642 580.7241739 583.2374163 587.6210840 587.8772552 593.8891010 598.6724043 606.1531019 611.2795631 614.4959570 618.4339013 627.0120453 629.7413109 632.1243761 636.4697262 640.5206403 642.7942716 648.1119368 654.5837490 656.0458399 659.0802404 665.9211757 671.4771192 674.4518974 677.0342773 677.9653424 679.9239248 685.6320346 686.5254316 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5731 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9856E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3600E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4965 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.505 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.862 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.551 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.730 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.118 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00004 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 103158 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00004 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012135337721839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012135337721839.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261012135337721839.atom Openam> file on opening on unit 11: 261012135337721839.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 718 First residue number = 1 Last residue number = 718 Number of atoms found = 5731 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9856E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3600E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4965 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.505 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.862 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.551 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.730 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.118 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Bfactors> 106 vectors, 17193 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.063600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.404 for 718 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.113 +/- 0.09 Bfactors> = 0.881 +/- 0.10 Bfactors> Shiftng-fct= 0.768 Bfactors> Scaling-fct= 1.198 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012135337721839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012135337721839.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 261012135337721839 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012135337721839.eigenfacs 261012135337721839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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