CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  ChTPS  ***

LOGs for ID: 261012151453737839

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261012151453737839.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261012151453737839.atom to be opened. Openam> File opened: 261012151453737839.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 733 First residue number = 1 Last residue number = 733 Number of atoms found = 5969 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -3.428335 +/- 18.189757 From: -45.935000 To: 36.090000 = -0.911794 +/- 14.877014 From: -39.359000 To: 40.429000 = 3.075093 +/- 22.204741 From: -42.682000 To: 47.935000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4294 % Filled. Pdbmat> 2291955 non-zero elements. Pdbmat> 250719 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.01 +/- 23.26 Maximum number = 143 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 5.014380E+06 Pdbmat> Larger element = 503.272 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 733 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261012151453737839.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261012151453737839.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261012151453737839.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5969 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 733 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 36 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 32 atoms in block 3 Block first atom: 70 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 102 Blocpdb> 34 atoms in block 5 Block first atom: 139 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 173 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 201 Blocpdb> 32 atoms in block 8 Block first atom: 236 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 268 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 291 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 318 Blocpdb> 28 atoms in block 12 Block first atom: 346 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 374 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 406 Blocpdb> 41 atoms in block 15 Block first atom: 442 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 483 Blocpdb> 34 atoms in block 17 Block first atom: 511 Blocpdb> 29 atoms in block 18 Block first atom: 545 Blocpdb> 33 atoms in block 19 Block first atom: 574 Blocpdb> 34 atoms in block 20 Block first atom: 607 Blocpdb> 32 atoms in block 21 Block first atom: 641 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 673 Blocpdb> 29 atoms in block 23 Block first atom: 703 Blocpdb> 37 atoms in block 24 Block first atom: 732 Blocpdb> 31 atoms in block 25 Block first atom: 769 Blocpdb> 36 atoms in block 26 Block first atom: 800 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 836 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 872 Blocpdb> 32 atoms in block 29 Block first atom: 911 Blocpdb> 38 atoms in block 30 Block first atom: 943 Blocpdb> 33 atoms in block 31 Block first atom: 981 Blocpdb> 31 atoms in block 32 Block first atom: 1014 Blocpdb> 32 atoms in block 33 Block first atom: 1045 Blocpdb> 30 atoms in block 34 Block first atom: 1077 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1107 Blocpdb> 27 atoms in block 36 Block first atom: 1144 Blocpdb> 39 atoms in block 37 Block first atom: 1171 Blocpdb> 37 atoms in block 38 Block first atom: 1210 Blocpdb> 27 atoms in block 39 Block first atom: 1247 Blocpdb> 33 atoms in block 40 Block first atom: 1274 Blocpdb> 32 atoms in block 41 Block first atom: 1307 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 1339 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1362 Blocpdb> 31 atoms in block 44 Block first atom: 1405 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1436 Blocpdb> 38 atoms in block 46 Block first atom: 1471 Blocpdb> 39 atoms in block 47 Block first atom: 1509 Blocpdb> 33 atoms in block 48 Block first atom: 1548 Blocpdb> 29 atoms in block 49 Block first atom: 1581 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1610 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1635 Blocpdb> 33 atoms in block 52 Block first atom: 1665 Blocpdb> 39 atoms in block 53 Block first atom: 1698 Blocpdb> 36 atoms in block 54 Block first atom: 1737 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1773 Blocpdb> 32 atoms in block 56 Block first atom: 1807 Blocpdb> 30 atoms in block 57 Block first atom: 1839 Blocpdb> 30 atoms in block 58 Block first atom: 1869 Blocpdb> 34 atoms in block 59 Block first atom: 1899 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 1933 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1966 Blocpdb> 34 atoms in block 62 Block first atom: 1999 Blocpdb> 37 atoms in block 63 Block first atom: 2033 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2070 Blocpdb> 26 atoms in block 65 Block first atom: 2107 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 2133 Blocpdb> 37 atoms in block 67 Block first atom: 2170 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 2207 Blocpdb> 31 atoms in block 69 Block first atom: 2238 Blocpdb> 32 atoms in block 70 Block first atom: 2269 Blocpdb> 35 atoms in block 71 Block first atom: 2301 Blocpdb> 31 atoms in block 72 Block first atom: 2336 Blocpdb> 37 atoms in block 73 Block first atom: 2367 Blocpdb> 31 atoms in block 74 Block first atom: 2404 Blocpdb> 40 atoms in block 75 Block first atom: 2435 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 2475 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 2511 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2551 Blocpdb> 30 atoms in block 79 Block first atom: 2584 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 2614 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 2645 Blocpdb> 35 atoms in block 82 Block first atom: 2677 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 2712 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 2748 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2779 Blocpdb> 33 atoms in block 86 Block first atom: 2809 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 2842 Blocpdb> 39 atoms in block 88 Block first atom: 2865 Blocpdb> 40 atoms in block 89 Block first atom: 2904 Blocpdb> 31 atoms in block 90 Block first atom: 2944 Blocpdb> 37 atoms in block 91 Block first atom: 2975 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 3012 Blocpdb> 28 atoms in block 93 Block first atom: 3041 Blocpdb> 28 atoms in block 94 Block first atom: 3069 Blocpdb> 33 atoms in block 95 Block first atom: 3097 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 3130 Blocpdb> 29 atoms in block 97 Block first atom: 3158 Blocpdb> 32 atoms in block 98 Block first atom: 3187 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 3219 Blocpdb> 29 atoms in block 100 Block first atom: 3252 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3281 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 3311 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 3337 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 3365 Blocpdb> 32 atoms in block 105 Block first atom: 3390 Blocpdb> 31 atoms in block 106 Block first atom: 3422 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 3453 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 3484 Blocpdb> 29 atoms in block 109 Block first atom: 3510 Blocpdb> 34 atoms in block 110 Block first atom: 3539 Blocpdb> 34 atoms in block 111 Block first atom: 3573 Blocpdb> 36 atoms in block 112 Block first atom: 3607 Blocpdb> 36 atoms in block 113 Block first atom: 3643 Blocpdb> 38 atoms in block 114 Block first atom: 3679 Blocpdb> 36 atoms in block 115 Block first atom: 3717 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 3753 Blocpdb> 37 atoms in block 117 Block first atom: 3791 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3828 Blocpdb> 35 atoms in block 119 Block first atom: 3860 Blocpdb> 37 atoms in block 120 Block first atom: 3895 Blocpdb> 34 atoms in block 121 Block first atom: 3932 Blocpdb> 32 atoms in block 122 Block first atom: 3966 Blocpdb> 34 atoms in block 123 Block first atom: 3998 Blocpdb> 37 atoms in block 124 Block first atom: 4032 Blocpdb> 29 atoms in block 125 Block first atom: 4069 Blocpdb> 41 atoms in block 126 Block first atom: 4098 Blocpdb> 36 atoms in block 127 Block first atom: 4139 Blocpdb> 27 atoms in block 128 Block first atom: 4175 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 4202 Blocpdb> 28 atoms in block 130 Block first atom: 4230 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 4258 Blocpdb> 25 atoms in block 132 Block first atom: 4286 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 4311 Blocpdb> 32 atoms in block 134 Block first atom: 4341 Blocpdb> 33 atoms in block 135 Block first atom: 4373 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 4406 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 4433 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 4459 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 4496 Blocpdb> 34 atoms in block 140 Block first atom: 4535 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4569 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 4600 Blocpdb> 28 atoms in block 143 Block first atom: 4630 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 4658 Blocpdb> 40 atoms in block 145 Block first atom: 4688 Blocpdb> 37 atoms in block 146 Block first atom: 4728 Blocpdb> 37 atoms in block 147 Block first atom: 4765 Blocpdb> 40 atoms in block 148 Block first atom: 4802 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4842 Blocpdb> 41 atoms in block 150 Block first atom: 4871 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 4912 Blocpdb> 26 atoms in block 152 Block first atom: 4944 Blocpdb> 34 atoms in block 153 Block first atom: 4970 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 5004 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 5031 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 5072 Blocpdb> 35 atoms in block 157 Block first atom: 5107 Blocpdb> 35 atoms in block 158 Block first atom: 5142 Blocpdb> 39 atoms in block 159 Block first atom: 5177 Blocpdb> 35 atoms in block 160 Block first atom: 5216 Blocpdb> 28 atoms in block 161 Block first atom: 5251 Blocpdb> 31 atoms in block 162 Block first atom: 5279 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 5310 Blocpdb> 29 atoms in block 164 Block first atom: 5339 Blocpdb> 32 atoms in block 165 Block first atom: 5368 Blocpdb> 30 atoms in block 166 Block first atom: 5400 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 5430 Blocpdb> 29 atoms in block 168 Block first atom: 5458 Blocpdb> 31 atoms in block 169 Block first atom: 5487 Blocpdb> 36 atoms in block 170 Block first atom: 5518 Blocpdb> 35 atoms in block 171 Block first atom: 5554 Blocpdb> 26 atoms in block 172 Block first atom: 5589 Blocpdb> 34 atoms in block 173 Block first atom: 5615 Blocpdb> 36 atoms in block 174 Block first atom: 5649 Blocpdb> 29 atoms in block 175 Block first atom: 5685 Blocpdb> 29 atoms in block 176 Block first atom: 5714 Blocpdb> 31 atoms in block 177 Block first atom: 5743 Blocpdb> 28 atoms in block 178 Block first atom: 5774 Blocpdb> 26 atoms in block 179 Block first atom: 5802 Blocpdb> 35 atoms in block 180 Block first atom: 5828 Blocpdb> 34 atoms in block 181 Block first atom: 5863 Blocpdb> 30 atoms in block 182 Block first atom: 5897 Blocpdb> 34 atoms in block 183 Block first atom: 5927 Blocpdb> 9 atoms in block 184 Block first atom: 5960 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 43 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2292139 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17907 Prepmat> Matrix trace = 5014380.0000 Prepmat> Last element read: 17907 17907 162.1525 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15274 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5969 RTB> Total mass = 5969.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5969 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 228152.1483 RTB> 60096 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60096 Diagstd> Projected matrix trace = 228152.1483 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 228152.1483 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1296465 0.2641689 0.5107929 1.4048337 1.7371377 1.9750015 2.1449885 2.2444213 2.5456671 3.4670244 4.0744602 4.5472132 4.7969500 5.7256593 6.4873356 7.0533180 7.6481994 8.3929996 9.4756994 9.8641296 10.6472474 11.4624405 12.0794174 12.3650121 13.1151584 13.2299979 13.6726009 14.1124510 15.0606323 15.1901210 16.2016514 16.7943806 17.1769372 18.4077632 18.5476305 18.7840532 19.6363796 20.2967482 20.8965219 21.7332935 22.0849716 22.3063280 22.8841814 23.2834238 23.4860484 23.9496532 24.8304863 25.2321494 25.8411347 26.1528453 26.8362313 27.0440282 27.7447305 29.0032888 29.4841594 29.7870281 29.9631314 30.7438296 30.9425158 31.2703075 31.5883932 32.5063952 33.2300714 33.3988578 34.1494579 34.4451856 34.8582373 35.1780653 35.7730679 36.1280601 36.3725515 37.0130015 37.1458267 37.4516000 38.4550471 39.0947631 39.5371638 39.5474142 39.8489219 40.3081751 40.7449837 41.3153239 41.9139146 42.2855374 42.5302673 43.1979930 44.1061258 44.4017371 44.7657912 45.3974451 45.5943873 46.1166022 46.4500028 46.8612776 47.3996467 47.7293110 47.9336005 48.2824132 48.7539574 49.3611322 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034331 0.0034334 0.0034335 0.0034339 0.0034344 39.0999022 55.8131002 77.6100073 128.7086521 143.1239814 152.6085950 159.0405110 162.6849853 173.2591129 202.1965459 219.1948374 231.5623459 237.8361546 259.8412116 276.5848985 288.3978457 300.3135184 314.5964956 334.2727064 341.0551914 354.3349187 367.6493708 377.4142327 381.8497869 393.2620601 394.9800570 401.5326356 407.9401987 421.4216893 423.2294663 437.0940771 445.0176911 450.0576456 465.9033040 467.6699850 470.6411922 481.2004117 489.2248542 496.4005836 506.2418591 510.3213081 512.8723927 519.4729899 523.9848156 526.2598722 531.4285647 541.1129065 545.4719266 552.0152427 555.3346250 562.5434130 564.7171410 571.9861795 584.8155391 589.6436907 592.6644370 594.4137943 602.1078131 604.0502818 607.2413765 610.3220324 619.1269172 625.9806630 627.5684295 634.5811792 637.3229308 641.1327932 644.0673080 649.4913536 652.7059945 654.9108177 660.6515112 661.8358599 664.5542940 673.3982049 678.9762340 682.8071124 682.8956186 685.4938591 689.4326525 693.1581826 697.9926687 703.0308651 706.1406413 708.1811074 713.7186828 721.1817633 723.5945063 726.5548607 731.6628192 733.2481438 737.4353138 740.0961632 743.3653997 747.6233077 750.2186615 751.8224779 754.5530248 758.2286962 762.9355229 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5969 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1296 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.405 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.864 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 107442 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012151453737839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012151453737839.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261012151453737839.atom Openam> file on opening on unit 11: 261012151453737839.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 733 First residue number = 1 Last residue number = 733 Number of atoms found = 5969 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.405 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.244 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.864 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36 Bfactors> 106 vectors, 17907 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.129600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.430 for 733 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.053 +/- 0.05 Bfactors> = 0.898 +/- 0.10 Bfactors> Shiftng-fct= 0.844 Bfactors> Scaling-fct= 2.058 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012151453737839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012151453737839.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.9 Chkmod> 106 vectors, 17907 coordinates in file. Chkmod> That is: 5969 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8681 0.0034 0.7220 0.0034 0.8162 0.0034 0.7296 0.0034 0.8991 0.0034 0.8677 39.0912 0.6962 55.8140 0.5258 77.6072 0.7498 128.7107 0.2148 143.1122 0.6548 152.6020 0.3743 159.0341 0.0472 162.6627 0.4300 173.2630 0.2595 202.1872 0.4028 219.1730 0.1288 231.5470 0.3533 237.8272 0.4170 259.8378 0.3146 276.5659 0.3075 288.3790 0.5090 300.2967 0.5186 314.5830 0.3713 334.2637 0.0283 341.0383 0.4353 354.3655 0.4868 367.5944 0.3701 377.4071 0.5217 381.9104 0.3993 393.3178 0.0999 394.9631 0.5136 401.4772 0.5270 407.8873 0.5709 421.3948 0.4825 423.2096 0.2680 437.0530 0.2448 444.9405 0.3712 450.0784 0.2542 465.9116 0.4070 467.6798 0.2139 470.5702 0.2166 481.2241 0.2991 489.2430 0.3767 496.4206 0.5019 506.1818 0.4624 510.2420 0.2983 512.8926 0.3317 519.4032 0.4511 523.9238 0.3598 526.2815 0.3775 531.4096 0.1638 541.0844 0.2706 545.4253 0.4122 551.9794 0.3928 555.2806 0.4497 562.5588 0.2743 564.6508 0.4744 571.9129 0.3761 584.7573 0.5061 589.5768 0.5273 592.6686 0.5461 594.3572 0.3913 602.0445 0.4436 603.9998 0.3028 607.2123 0.2237 610.3114 0.3177 619.1347 0.5270 625.9531 0.4063 627.5522 0.5027 634.5590 0.4836 637.3401 0.3780 641.1215 0.4823 644.0574 0.3658 649.4356 0.4600 652.6955 0.3259 654.8597 0.5624 660.5964 0.5455 661.8446 0.3818 664.5116 0.5122 673.4127 0.4942 678.9057 0.5305 682.8023 0.2791 682.8886 0.5576 685.4737 0.5316 689.4187 0.3865 693.0860 0.4428 698.0022 0.3035 702.9679 0.5165 706.1476 0.3241 708.1485 0.3999 713.7046 0.4553 721.1825 0.4772 723.5493 0.2889 726.5578 0.4137 731.6520 0.4708 733.1814 0.4588 737.4308 0.4476 740.0644 0.4180 743.3234 0.4920 747.5940 0.4133 750.1919 0.5223 751.7620 0.4640 754.5018 0.4959 758.1654 0.4395 762.8940 0.4481 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151453737839 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom making animated gifs 11 models are in 261012151453737839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151453737839 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom making animated gifs 11 models are in 261012151453737839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151453737839 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom making animated gifs 11 models are in 261012151453737839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151453737839 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom making animated gifs 11 models are in 261012151453737839.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151453737839 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261012151453737839.eigenfacs 261012151453737839.atom making animated gifs 11 models are in 261012151453737839.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151453737839.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 261012151453737839.10.pdb 261012151453737839.11.pdb 261012151453737839.7.pdb 261012151453737839.8.pdb 261012151453737839.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m37.201s user 0m36.921s sys 0m0.246s rm: cannot remove '261012151453737839.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.