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***  OtsA  ***

LOGs for ID: 261012151517738164

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261012151517738164.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261012151517738164.atom to be opened. Openam> File opened: 261012151517738164.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 914 First residue number = 2 Last residue number = 457 Number of atoms found = 7321 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 42.415505 +/- 26.729648 From: -17.685000 To: 96.348000 = 2.204110 +/- 18.744503 From: -43.906000 To: 46.020000 = 77.243886 +/- 13.740990 From: 43.506000 To: 110.265000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1879 % Filled. Pdbmat> 2865261 non-zero elements. Pdbmat> 313535 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.65 +/- 22.42 Maximum number = 132 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 6.270700E+06 Pdbmat> Larger element = 499.269 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 914 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261012151517738164.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261012151517738164.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261012151517738164.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7321 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 914 residues. Blocpdb> 39 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 40 atoms in block 2 Block first atom: 40 Blocpdb> 36 atoms in block 3 Block first atom: 80 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 116 Blocpdb> 28 atoms in block 5 Block first atom: 147 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 175 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 204 Blocpdb> 41 atoms in block 8 Block first atom: 235 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 276 Blocpdb> 38 atoms in block 10 Block first atom: 316 Blocpdb> 40 atoms in block 11 Block first atom: 354 Blocpdb> 38 atoms in block 12 Block first atom: 394 Blocpdb> 43 atoms in block 13 Block first atom: 432 Blocpdb> 40 atoms in block 14 Block first atom: 475 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 515 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 560 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 606 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 648 Blocpdb> 42 atoms in block 19 Block first atom: 693 Blocpdb> 47 atoms in block 20 Block first atom: 735 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 782 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 825 Blocpdb> 38 atoms in block 23 Block first atom: 864 Blocpdb> 39 atoms in block 24 Block first atom: 902 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 941 Blocpdb> 48 atoms in block 26 Block first atom: 982 Blocpdb> 45 atoms in block 27 Block first atom: 1030 Blocpdb> 43 atoms in block 28 Block first atom: 1075 Blocpdb> 42 atoms in block 29 Block first atom: 1118 Blocpdb> 39 atoms in block 30 Block first atom: 1160 Blocpdb> 48 atoms in block 31 Block first atom: 1199 Blocpdb> 39 atoms in block 32 Block first atom: 1247 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1286 Blocpdb> 42 atoms in block 34 Block first atom: 1327 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1369 Blocpdb> 42 atoms in block 36 Block first atom: 1410 Blocpdb> 40 atoms in block 37 Block first atom: 1452 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1492 Blocpdb> 40 atoms in block 39 Block first atom: 1535 Blocpdb> 36 atoms in block 40 Block first atom: 1575 Blocpdb> 39 atoms in block 41 Block first atom: 1611 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1650 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1687 Blocpdb> 43 atoms in block 44 Block first atom: 1727 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 1770 Blocpdb> 37 atoms in block 46 Block first atom: 1813 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 1850 Blocpdb> 29 atoms in block 48 Block first atom: 1890 Blocpdb> 36 atoms in block 49 Block first atom: 1919 Blocpdb> 40 atoms in block 50 Block first atom: 1955 Blocpdb> 41 atoms in block 51 Block first atom: 1995 Blocpdb> 40 atoms in block 52 Block first atom: 2036 Blocpdb> 48 atoms in block 53 Block first atom: 2076 Blocpdb> 34 atoms in block 54 Block first atom: 2124 Blocpdb> 44 atoms in block 55 Block first atom: 2158 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2202 Blocpdb> 46 atoms in block 57 Block first atom: 2244 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2290 Blocpdb> 47 atoms in block 59 Block first atom: 2331 Blocpdb> 36 atoms in block 60 Block first atom: 2378 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 2414 Blocpdb> 48 atoms in block 62 Block first atom: 2447 Blocpdb> 44 atoms in block 63 Block first atom: 2495 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2539 Blocpdb> 37 atoms in block 65 Block first atom: 2576 Blocpdb> 42 atoms in block 66 Block first atom: 2613 Blocpdb> 47 atoms in block 67 Block first atom: 2655 Blocpdb> 46 atoms in block 68 Block first atom: 2702 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 2748 Blocpdb> 51 atoms in block 70 Block first atom: 2792 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2843 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2876 Blocpdb> 36 atoms in block 73 Block first atom: 2916 Blocpdb> 42 atoms in block 74 Block first atom: 2952 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2994 Blocpdb> 31 atoms in block 76 Block first atom: 3028 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 3059 Blocpdb> 34 atoms in block 78 Block first atom: 3095 Blocpdb> 37 atoms in block 79 Block first atom: 3129 Blocpdb> 34 atoms in block 80 Block first atom: 3166 Blocpdb> 46 atoms in block 81 Block first atom: 3200 Blocpdb> 34 atoms in block 82 Block first atom: 3246 Blocpdb> 37 atoms in block 83 Block first atom: 3280 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3317 Blocpdb> 39 atoms in block 85 Block first atom: 3354 Blocpdb> 43 atoms in block 86 Block first atom: 3393 Blocpdb> 38 atoms in block 87 Block first atom: 3436 Blocpdb> 41 atoms in block 88 Block first atom: 3474 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3515 Blocpdb> 41 atoms in block 90 Block first atom: 3563 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 3604 Blocpdb> 23 atoms in block 92 Block first atom: 3644 Blocpdb> 39 atoms in block 93 Block first atom: 3667 Blocpdb> 40 atoms in block 94 Block first atom: 3706 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 3746 Blocpdb> 31 atoms in block 96 Block first atom: 3782 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 3813 Blocpdb> 29 atoms in block 98 Block first atom: 3841 Blocpdb> 31 atoms in block 99 Block first atom: 3870 Blocpdb> 41 atoms in block 100 Block first atom: 3901 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 3942 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 3982 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 4020 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 4060 Blocpdb> 43 atoms in block 105 Block first atom: 4098 Blocpdb> 40 atoms in block 106 Block first atom: 4141 Blocpdb> 45 atoms in block 107 Block first atom: 4181 Blocpdb> 46 atoms in block 108 Block first atom: 4226 Blocpdb> 42 atoms in block 109 Block first atom: 4272 Blocpdb> 45 atoms in block 110 Block first atom: 4314 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 4359 Blocpdb> 47 atoms in block 112 Block first atom: 4401 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 4448 Blocpdb> 39 atoms in block 114 Block first atom: 4491 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4530 Blocpdb> 39 atoms in block 116 Block first atom: 4568 Blocpdb> 41 atoms in block 117 Block first atom: 4607 Blocpdb> 48 atoms in block 118 Block first atom: 4648 Blocpdb> 45 atoms in block 119 Block first atom: 4696 Blocpdb> 43 atoms in block 120 Block first atom: 4741 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 4784 Blocpdb> 39 atoms in block 122 Block first atom: 4826 Blocpdb> 48 atoms in block 123 Block first atom: 4865 Blocpdb> 39 atoms in block 124 Block first atom: 4913 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 4952 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 4993 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 5035 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 5076 Blocpdb> 40 atoms in block 129 Block first atom: 5118 Blocpdb> 43 atoms in block 130 Block first atom: 5158 Blocpdb> 40 atoms in block 131 Block first atom: 5201 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 5241 Blocpdb> 39 atoms in block 133 Block first atom: 5277 Blocpdb> 37 atoms in block 134 Block first atom: 5316 Blocpdb> 40 atoms in block 135 Block first atom: 5353 Blocpdb> 43 atoms in block 136 Block first atom: 5393 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 5436 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5479 Blocpdb> 40 atoms in block 139 Block first atom: 5516 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 5556 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 5585 Blocpdb> 40 atoms in block 142 Block first atom: 5621 Blocpdb> 41 atoms in block 143 Block first atom: 5661 Blocpdb> 40 atoms in block 144 Block first atom: 5702 Blocpdb> 48 atoms in block 145 Block first atom: 5742 Blocpdb> 34 atoms in block 146 Block first atom: 5790 Blocpdb> 44 atoms in block 147 Block first atom: 5824 Blocpdb> 42 atoms in block 148 Block first atom: 5868 Blocpdb> 46 atoms in block 149 Block first atom: 5910 Blocpdb> 41 atoms in block 150 Block first atom: 5956 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 5997 Blocpdb> 36 atoms in block 152 Block first atom: 6044 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 6080 Blocpdb> 48 atoms in block 154 Block first atom: 6113 Blocpdb> 44 atoms in block 155 Block first atom: 6161 Blocpdb> 37 atoms in block 156 Block first atom: 6205 Blocpdb> 37 atoms in block 157 Block first atom: 6242 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 6279 Blocpdb> 47 atoms in block 159 Block first atom: 6321 Blocpdb> 46 atoms in block 160 Block first atom: 6368 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 6414 Blocpdb> 51 atoms in block 162 Block first atom: 6458 Blocpdb> 33 atoms in block 163 Block first atom: 6509 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 6542 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 6582 Blocpdb> 42 atoms in block 166 Block first atom: 6618 Blocpdb> 34 atoms in block 167 Block first atom: 6660 Blocpdb> 31 atoms in block 168 Block first atom: 6694 Blocpdb> 36 atoms in block 169 Block first atom: 6725 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 6761 Blocpdb> 37 atoms in block 171 Block first atom: 6795 Blocpdb> 34 atoms in block 172 Block first atom: 6832 Blocpdb> 46 atoms in block 173 Block first atom: 6866 Blocpdb> 34 atoms in block 174 Block first atom: 6912 Blocpdb> 37 atoms in block 175 Block first atom: 6946 Blocpdb> 37 atoms in block 176 Block first atom: 6983 Blocpdb> 39 atoms in block 177 Block first atom: 7020 Blocpdb> 43 atoms in block 178 Block first atom: 7059 Blocpdb> 38 atoms in block 179 Block first atom: 7102 Blocpdb> 41 atoms in block 180 Block first atom: 7140 Blocpdb> 48 atoms in block 181 Block first atom: 7181 Blocpdb> 41 atoms in block 182 Block first atom: 7229 Blocpdb> 40 atoms in block 183 Block first atom: 7270 Blocpdb> 12 atoms in block 184 Block first atom: 7309 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2865445 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21963 Prepmat> Matrix trace = 6270700.0000 Prepmat> Last element read: 21963 21963 118.3566 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15302 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7321 RTB> Total mass = 7321.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7321 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 219883.1462 RTB> 59088 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59088 Diagstd> Projected matrix trace = 219883.1462 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 219883.1462 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3269567 0.3928695 0.5071734 1.2387744 2.1943776 3.1984963 3.5231231 4.6982083 5.0008264 6.1015997 6.8139185 7.0835303 7.5738867 8.9032633 9.5650576 10.3435774 11.2497461 11.9703973 12.1776972 12.5794968 13.0441892 13.5301629 14.1841509 14.8207020 15.2358487 15.3780523 16.0474213 16.3718968 17.3961997 18.1145873 18.4322381 18.8787556 19.5823440 19.7576946 20.2301855 20.4325121 21.0476674 21.3730738 22.2326911 22.5317725 23.0911177 23.7372291 23.8936865 24.3258954 24.5377045 25.1238913 25.4170610 26.2433744 26.4088666 26.9107079 27.6467819 27.8132481 28.3374578 28.4167680 29.2697838 29.6132997 29.9735676 30.8885800 31.2916035 31.8119999 32.6979946 32.9646598 33.3819443 33.4473750 33.9526066 34.5880814 35.1554165 35.5157455 35.5824992 35.9988269 36.7309622 37.3487208 37.5876270 38.3336915 38.6836271 39.0789134 39.5029569 39.7081362 40.1563817 40.6692813 40.8654616 41.1469907 41.9504633 42.6505002 42.8548456 43.5158848 43.9579187 44.1752731 44.5647213 44.7518959 45.1171807 45.3321363 45.3905332 46.2098513 46.5394123 46.7986109 47.5470205 47.7578025 48.4157424 48.7794322 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034308 0.0034329 0.0034334 0.0034335 0.0034345 0.0034352 62.0926790 68.0643101 77.3345385 120.8624499 160.8610738 194.2084891 203.8258158 235.3755867 242.8377338 268.2360446 283.4612821 289.0148504 298.8509790 324.0185614 335.8451456 349.2453761 364.2223907 375.7072395 378.9464707 385.1473502 392.1966006 399.4356221 408.9751798 418.0513867 423.8660245 425.8395037 435.0086645 439.3845472 452.9210158 462.1782489 466.2129316 471.8261018 480.5378691 482.6845677 488.4219940 490.8583270 498.1925936 502.0289627 512.0251543 515.4576138 521.8164406 529.0665339 530.8072683 535.5865941 537.9132553 544.3005000 547.4669998 556.2949510 558.0462081 563.3234642 570.9756316 572.6920248 578.0637335 578.8721035 587.4961666 590.9335958 594.5173038 603.5235925 607.4481164 612.4783847 620.9488668 623.4757688 627.4095062 628.0240853 632.7495446 638.6435299 643.8599385 647.1511804 647.7590726 651.5375564 658.1296132 663.6409038 665.7600557 672.3348170 675.3966066 678.8385856 682.5116714 684.2818674 688.1332881 692.5139549 694.1822182 696.5692834 703.3373180 709.1814132 710.8782845 716.3399783 719.9690728 721.7468578 724.9213289 726.4420905 729.4008361 731.1363448 731.6071185 738.1804949 740.8081093 742.8681890 748.7846523 750.4425453 755.5941344 758.4267643 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7321 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.239 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.523 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.574 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.903 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.78 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 131778 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012151517738164.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012151517738164.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261012151517738164.atom Openam> file on opening on unit 11: 261012151517738164.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 914 First residue number = 2 Last residue number = 457 Number of atoms found = 7321 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.239 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.574 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.903 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.78 Bfactors> 106 vectors, 21963 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.327000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.263 for 914 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.029 +/- 0.02 Bfactors> = 0.892 +/- 0.09 Bfactors> Shiftng-fct= 0.864 Bfactors> Scaling-fct= 4.642 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012151517738164.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012151517738164.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.4 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perturbed structure for DQ=-100 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 261012151517738164 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 261012151517738164 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012151517738164.eigenfacs 261012151517738164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261012151517738164.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 261012151517738164.10.pdb 261012151517738164.11.pdb 261012151517738164.7.pdb 261012151517738164.8.pdb 261012151517738164.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m46.546s user 0m46.196s sys 0m0.310s rm: cannot remove '261012151517738164.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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