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***  ScTPS2  ***

LOGs for ID: 261012193707778519

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261012193707778519.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261012193707778519.atom to be opened. Openam> File opened: 261012193707778519.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 896 First residue number = 1 Last residue number = 896 Number of atoms found = 7257 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.650920 +/- 18.529497 From: -45.398000 To: 45.233000 = -0.137418 +/- 14.631405 From: -42.840000 To: 44.418000 = -1.830801 +/- 24.003042 From: -56.062000 To: 44.731000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1438 % Filled. Pdbmat> 2710705 non-zero elements. Pdbmat> 296397 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.69 +/- 23.93 Maximum number = 139 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 5.927940E+06 Pdbmat> Larger element = 520.400 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 896 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261012193707778519.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261012193707778519.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261012193707778519.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7257 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 896 residues. Blocpdb> 34 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 35 Blocpdb> 49 atoms in block 3 Block first atom: 73 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 122 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 159 Blocpdb> 38 atoms in block 6 Block first atom: 202 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 240 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 279 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 321 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 353 Blocpdb> 46 atoms in block 11 Block first atom: 389 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 435 Blocpdb> 47 atoms in block 13 Block first atom: 476 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 523 Blocpdb> 42 atoms in block 15 Block first atom: 559 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 601 Blocpdb> 41 atoms in block 17 Block first atom: 648 Blocpdb> 42 atoms in block 18 Block first atom: 689 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 731 Blocpdb> 44 atoms in block 20 Block first atom: 770 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 814 Blocpdb> 37 atoms in block 22 Block first atom: 852 Blocpdb> 44 atoms in block 23 Block first atom: 889 Blocpdb> 37 atoms in block 24 Block first atom: 933 Blocpdb> 38 atoms in block 25 Block first atom: 970 Blocpdb> 35 atoms in block 26 Block first atom: 1008 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1043 Blocpdb> 44 atoms in block 28 Block first atom: 1083 Blocpdb> 43 atoms in block 29 Block first atom: 1127 Blocpdb> 56 atoms in block 30 Block first atom: 1170 Blocpdb> 38 atoms in block 31 Block first atom: 1226 Blocpdb> 49 atoms in block 32 Block first atom: 1264 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1313 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1356 Blocpdb> 49 atoms in block 35 Block first atom: 1392 Blocpdb> 53 atoms in block 36 Block first atom: 1441 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1494 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1536 Blocpdb> 43 atoms in block 39 Block first atom: 1579 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1622 Blocpdb> 52 atoms in block 41 Block first atom: 1659 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1711 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1755 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1798 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1842 Blocpdb> 47 atoms in block 46 Block first atom: 1881 Blocpdb> 39 atoms in block 47 Block first atom: 1928 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 1967 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 2018 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 2061 Blocpdb> 28 atoms in block 51 Block first atom: 2103 Blocpdb> 44 atoms in block 52 Block first atom: 2131 Blocpdb> 43 atoms in block 53 Block first atom: 2175 Blocpdb> 45 atoms in block 54 Block first atom: 2218 Blocpdb> 38 atoms in block 55 Block first atom: 2263 Blocpdb> 36 atoms in block 56 Block first atom: 2301 Blocpdb> 38 atoms in block 57 Block first atom: 2337 Blocpdb> 34 atoms in block 58 Block first atom: 2375 Blocpdb> 45 atoms in block 59 Block first atom: 2409 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 2454 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2487 Blocpdb> 33 atoms in block 62 Block first atom: 2525 Blocpdb> 38 atoms in block 63 Block first atom: 2558 Blocpdb> 38 atoms in block 64 Block first atom: 2596 Blocpdb> 43 atoms in block 65 Block first atom: 2634 Blocpdb> 38 atoms in block 66 Block first atom: 2677 Blocpdb> 37 atoms in block 67 Block first atom: 2715 Blocpdb> 47 atoms in block 68 Block first atom: 2752 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 2799 Blocpdb> 41 atoms in block 70 Block first atom: 2838 Blocpdb> 36 atoms in block 71 Block first atom: 2879 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 2915 Blocpdb> 46 atoms in block 73 Block first atom: 2957 Blocpdb> 41 atoms in block 74 Block first atom: 3003 Blocpdb> 49 atoms in block 75 Block first atom: 3044 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 3093 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 3132 Blocpdb> 40 atoms in block 78 Block first atom: 3163 Blocpdb> 43 atoms in block 79 Block first atom: 3203 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3246 Blocpdb> 38 atoms in block 81 Block first atom: 3288 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3326 Blocpdb> 39 atoms in block 83 Block first atom: 3369 Blocpdb> 39 atoms in block 84 Block first atom: 3408 Blocpdb> 51 atoms in block 85 Block first atom: 3447 Blocpdb> 43 atoms in block 86 Block first atom: 3498 Blocpdb> 41 atoms in block 87 Block first atom: 3541 Blocpdb> 34 atoms in block 88 Block first atom: 3582 Blocpdb> 36 atoms in block 89 Block first atom: 3616 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 3652 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 3691 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 3727 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 3769 Blocpdb> 41 atoms in block 94 Block first atom: 3807 Blocpdb> 39 atoms in block 95 Block first atom: 3848 Blocpdb> 36 atoms in block 96 Block first atom: 3887 Blocpdb> 35 atoms in block 97 Block first atom: 3923 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3958 Blocpdb> 44 atoms in block 99 Block first atom: 3995 Blocpdb> 30 atoms in block 100 Block first atom: 4039 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 4069 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 4108 Blocpdb> 42 atoms in block 103 Block first atom: 4146 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 4188 Blocpdb> 47 atoms in block 105 Block first atom: 4228 Blocpdb> 39 atoms in block 106 Block first atom: 4275 Blocpdb> 49 atoms in block 107 Block first atom: 4314 Blocpdb> 37 atoms in block 108 Block first atom: 4363 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 4400 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 4435 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 4476 Blocpdb> 39 atoms in block 112 Block first atom: 4518 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 4557 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 4597 Blocpdb> 49 atoms in block 115 Block first atom: 4641 Blocpdb> 43 atoms in block 116 Block first atom: 4690 Blocpdb> 37 atoms in block 117 Block first atom: 4733 Blocpdb> 36 atoms in block 118 Block first atom: 4770 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 4806 Blocpdb> 43 atoms in block 120 Block first atom: 4837 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 4880 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 4922 Blocpdb> 47 atoms in block 123 Block first atom: 4958 Blocpdb> 37 atoms in block 124 Block first atom: 5005 Blocpdb> 45 atoms in block 125 Block first atom: 5042 Blocpdb> 39 atoms in block 126 Block first atom: 5087 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 5126 Blocpdb> 32 atoms in block 128 Block first atom: 5167 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5199 Blocpdb> 36 atoms in block 130 Block first atom: 5238 Blocpdb> 46 atoms in block 131 Block first atom: 5274 Blocpdb> 40 atoms in block 132 Block first atom: 5320 Blocpdb> 45 atoms in block 133 Block first atom: 5360 Blocpdb> 42 atoms in block 134 Block first atom: 5405 Blocpdb> 44 atoms in block 135 Block first atom: 5447 Blocpdb> 39 atoms in block 136 Block first atom: 5491 Blocpdb> 38 atoms in block 137 Block first atom: 5530 Blocpdb> 41 atoms in block 138 Block first atom: 5568 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 5609 Blocpdb> 43 atoms in block 140 Block first atom: 5660 Blocpdb> 41 atoms in block 141 Block first atom: 5703 Blocpdb> 41 atoms in block 142 Block first atom: 5744 Blocpdb> 43 atoms in block 143 Block first atom: 5785 Blocpdb> 40 atoms in block 144 Block first atom: 5828 Blocpdb> 43 atoms in block 145 Block first atom: 5868 Blocpdb> 34 atoms in block 146 Block first atom: 5911 Blocpdb> 43 atoms in block 147 Block first atom: 5945 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 5988 Blocpdb> 37 atoms in block 149 Block first atom: 6032 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 6069 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 6118 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6160 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 6200 Blocpdb> 41 atoms in block 154 Block first atom: 6236 Blocpdb> 43 atoms in block 155 Block first atom: 6277 Blocpdb> 33 atoms in block 156 Block first atom: 6320 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 6353 Blocpdb> 47 atoms in block 158 Block first atom: 6395 Blocpdb> 40 atoms in block 159 Block first atom: 6442 Blocpdb> 45 atoms in block 160 Block first atom: 6482 Blocpdb> 45 atoms in block 161 Block first atom: 6527 Blocpdb> 49 atoms in block 162 Block first atom: 6572 Blocpdb> 39 atoms in block 163 Block first atom: 6621 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 6660 Blocpdb> 30 atoms in block 165 Block first atom: 6700 Blocpdb> 37 atoms in block 166 Block first atom: 6730 Blocpdb> 38 atoms in block 167 Block first atom: 6767 Blocpdb> 40 atoms in block 168 Block first atom: 6805 Blocpdb> 36 atoms in block 169 Block first atom: 6845 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 6881 Blocpdb> 40 atoms in block 171 Block first atom: 6915 Blocpdb> 31 atoms in block 172 Block first atom: 6955 Blocpdb> 37 atoms in block 173 Block first atom: 6986 Blocpdb> 40 atoms in block 174 Block first atom: 7023 Blocpdb> 38 atoms in block 175 Block first atom: 7063 Blocpdb> 34 atoms in block 176 Block first atom: 7101 Blocpdb> 41 atoms in block 177 Block first atom: 7135 Blocpdb> 37 atoms in block 178 Block first atom: 7176 Blocpdb> 37 atoms in block 179 Block first atom: 7213 Blocpdb> 8 atoms in block 180 Block first atom: 7249 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 56 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2710885 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21771 Prepmat> Matrix trace = 5927940.0000 Prepmat> Last element read: 21771 21771 79.4154 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14693 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7257 RTB> Total mass = 7257.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7257 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 201727.9569 RTB> 54792 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54792 Diagstd> Projected matrix trace = 201727.9569 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 201727.9569 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0312915 0.0861685 0.2276377 0.3337724 0.5043956 0.6332697 0.6813043 0.9027907 0.9120456 0.9839878 1.1501538 1.2847269 1.6835519 1.8437842 1.9662488 2.4097198 2.5378039 2.8335167 3.4798006 3.6057391 4.1998870 4.3107521 4.7885422 5.3522890 5.7383479 6.4195901 7.0104607 7.5567107 8.2159730 8.3711449 8.7590518 8.9944216 9.2743728 9.7317344 10.2112545 10.4246633 10.7003852 11.3309945 11.5738362 12.1443708 12.4796275 12.8455475 13.0726360 13.4673143 13.7814019 14.1500184 14.5462622 14.7057654 15.0852686 15.8735738 16.5670243 16.7191614 17.3156276 17.7118867 18.3770084 18.8119695 19.2573371 19.8857856 20.0808491 20.7199666 21.2623825 21.9588602 22.5524023 23.0665625 23.4159941 23.5669559 23.6800440 24.3154174 24.7535434 25.3052183 25.6838258 26.2891307 26.4820725 26.8508661 27.0291850 27.2452813 27.4738430 27.7062031 28.1341999 28.4262922 28.5680922 28.9972060 29.2493501 29.4505017 29.7983883 29.9622913 30.8455023 31.0460890 31.1244705 32.2438536 32.6071887 32.9456596 33.1557086 33.7349135 34.1933094 34.8527314 35.0748805 35.3166689 36.1482872 36.4770360 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034328 0.0034333 0.0034341 0.0034353 0.0034361 19.2091707 31.8764165 51.8104530 62.7365286 77.1224702 86.4151024 89.6325705 103.1784073 103.7059207 107.7184606 116.4590496 123.0837428 140.8992018 147.4518851 152.2700576 168.5693265 172.9913205 182.7924144 202.5687558 206.2017908 222.5430736 225.4611959 237.6276323 251.2262739 260.1289676 275.1369575 287.5203309 298.5119211 311.2610527 314.1866370 321.3836870 325.6731100 330.7025593 338.7586587 347.0042797 350.6116151 355.2180184 365.5352765 369.4315192 378.4275880 383.6154509 389.1988875 392.6240193 398.5068377 403.1270861 408.4828077 414.1627033 416.4272076 421.7662307 432.6459454 441.9951817 444.0199926 451.8709250 457.0120940 465.5139362 470.9907886 476.5334562 484.2466856 486.6159234 494.2990844 500.7272696 508.8621831 515.6935327 521.5389155 525.4744210 527.1655544 528.4288651 535.4712331 540.2738751 546.2611621 550.3324709 556.7797000 558.8191308 562.6967801 564.5621467 566.8144696 569.1870184 571.5889006 575.9868450 578.9691033 580.4113547 584.7542100 587.2910607 589.3070394 592.7774410 594.4054613 603.1026046 605.0603992 605.8237095 616.6216241 620.0860464 623.2960634 625.2798552 630.7177897 634.9884824 641.0821573 643.1220209 645.3348918 652.8886856 655.8507978 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7257 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1292E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6168E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6813 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.966 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.200 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.420 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.371 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.759 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998 1.00003 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 0.99993 1.00003 0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 130626 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998 1.00003 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 0.99993 1.00003 0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012193707778519.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012193707778519.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261012193707778519.atom Openam> file on opening on unit 11: 261012193707778519.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 896 First residue number = 1 Last residue number = 896 Number of atoms found = 7257 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1292E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6168E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6813 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.966 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.200 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.371 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.759 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Bfactors> 106 vectors, 21771 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.031292 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.302 for 896 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.152 +/- 1.40 Bfactors> = 0.883 +/- 0.13 Bfactors> Shiftng-fct= 0.731 Bfactors> Scaling-fct= 0.095 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261012193707778519.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261012193707778519.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 7257 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 84 is: 0.9998 (instead of 1.0000). 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261012193707778519.eigenfacs 261012193707778519.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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