***  ScTPS2  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 261012193707778519.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 261012193707778519.atom to be opened.
Openam> File opened: 261012193707778519.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 896
First residue number = 1
Last residue number = 896
Number of atoms found = 7257
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 2.650920 +/- 18.529497 From: -45.398000 To: 45.233000
= -0.137418 +/- 14.631405 From: -42.840000 To: 44.418000
= -1.830801 +/- 24.003042 From: -56.062000 To: 44.731000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.1438 % Filled.
Pdbmat> 2710705 non-zero elements.
Pdbmat> 296397 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.69 +/- 23.93
Maximum number = 139
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 5.927940E+06
Pdbmat> Larger element = 520.400
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
896 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 261012193707778519.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 261012193707778519.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
261012193707778519.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7257 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 896 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 38 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 49 atoms in block 3
Block first atom: 73
Blocpdb> 37 atoms in block 4
Block first atom: 122
Blocpdb> 43 atoms in block 5
Block first atom: 159
Blocpdb> 38 atoms in block 6
Block first atom: 202
Blocpdb> 39 atoms in block 7
Block first atom: 240
Blocpdb> 42 atoms in block 8
Block first atom: 279
Blocpdb> 32 atoms in block 9
Block first atom: 321
Blocpdb> 36 atoms in block 10
Block first atom: 353
Blocpdb> 46 atoms in block 11
Block first atom: 389
Blocpdb> 41 atoms in block 12
Block first atom: 435
Blocpdb> 47 atoms in block 13
Block first atom: 476
Blocpdb> 36 atoms in block 14
Block first atom: 523
Blocpdb> 42 atoms in block 15
Block first atom: 559
Blocpdb> 47 atoms in block 16
Block first atom: 601
Blocpdb> 41 atoms in block 17
Block first atom: 648
Blocpdb> 42 atoms in block 18
Block first atom: 689
Blocpdb> 39 atoms in block 19
Block first atom: 731
Blocpdb> 44 atoms in block 20
Block first atom: 770
Blocpdb> 38 atoms in block 21
Block first atom: 814
Blocpdb> 37 atoms in block 22
Block first atom: 852
Blocpdb> 44 atoms in block 23
Block first atom: 889
Blocpdb> 37 atoms in block 24
Block first atom: 933
Blocpdb> 38 atoms in block 25
Block first atom: 970
Blocpdb> 35 atoms in block 26
Block first atom: 1008
Blocpdb> 40 atoms in block 27
Block first atom: 1043
Blocpdb> 44 atoms in block 28
Block first atom: 1083
Blocpdb> 43 atoms in block 29
Block first atom: 1127
Blocpdb> 56 atoms in block 30
Block first atom: 1170
Blocpdb> 38 atoms in block 31
Block first atom: 1226
Blocpdb> 49 atoms in block 32
Block first atom: 1264
Blocpdb> 43 atoms in block 33
Block first atom: 1313
Blocpdb> 36 atoms in block 34
Block first atom: 1356
Blocpdb> 49 atoms in block 35
Block first atom: 1392
Blocpdb> 53 atoms in block 36
Block first atom: 1441
Blocpdb> 42 atoms in block 37
Block first atom: 1494
Blocpdb> 43 atoms in block 38
Block first atom: 1536
Blocpdb> 43 atoms in block 39
Block first atom: 1579
Blocpdb> 37 atoms in block 40
Block first atom: 1622
Blocpdb> 52 atoms in block 41
Block first atom: 1659
Blocpdb> 44 atoms in block 42
Block first atom: 1711
Blocpdb> 43 atoms in block 43
Block first atom: 1755
Blocpdb> 44 atoms in block 44
Block first atom: 1798
Blocpdb> 39 atoms in block 45
Block first atom: 1842
Blocpdb> 47 atoms in block 46
Block first atom: 1881
Blocpdb> 39 atoms in block 47
Block first atom: 1928
Blocpdb> 51 atoms in block 48
Block first atom: 1967
Blocpdb> 43 atoms in block 49
Block first atom: 2018
Blocpdb> 42 atoms in block 50
Block first atom: 2061
Blocpdb> 28 atoms in block 51
Block first atom: 2103
Blocpdb> 44 atoms in block 52
Block first atom: 2131
Blocpdb> 43 atoms in block 53
Block first atom: 2175
Blocpdb> 45 atoms in block 54
Block first atom: 2218
Blocpdb> 38 atoms in block 55
Block first atom: 2263
Blocpdb> 36 atoms in block 56
Block first atom: 2301
Blocpdb> 38 atoms in block 57
Block first atom: 2337
Blocpdb> 34 atoms in block 58
Block first atom: 2375
Blocpdb> 45 atoms in block 59
Block first atom: 2409
Blocpdb> 33 atoms in block 60
Block first atom: 2454
Blocpdb> 38 atoms in block 61
Block first atom: 2487
Blocpdb> 33 atoms in block 62
Block first atom: 2525
Blocpdb> 38 atoms in block 63
Block first atom: 2558
Blocpdb> 38 atoms in block 64
Block first atom: 2596
Blocpdb> 43 atoms in block 65
Block first atom: 2634
Blocpdb> 38 atoms in block 66
Block first atom: 2677
Blocpdb> 37 atoms in block 67
Block first atom: 2715
Blocpdb> 47 atoms in block 68
Block first atom: 2752
Blocpdb> 39 atoms in block 69
Block first atom: 2799
Blocpdb> 41 atoms in block 70
Block first atom: 2838
Blocpdb> 36 atoms in block 71
Block first atom: 2879
Blocpdb> 42 atoms in block 72
Block first atom: 2915
Blocpdb> 46 atoms in block 73
Block first atom: 2957
Blocpdb> 41 atoms in block 74
Block first atom: 3003
Blocpdb> 49 atoms in block 75
Block first atom: 3044
Blocpdb> 39 atoms in block 76
Block first atom: 3093
Blocpdb> 31 atoms in block 77
Block first atom: 3132
Blocpdb> 40 atoms in block 78
Block first atom: 3163
Blocpdb> 43 atoms in block 79
Block first atom: 3203
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3246
Blocpdb> 38 atoms in block 81
Block first atom: 3288
Blocpdb> 43 atoms in block 82
Block first atom: 3326
Blocpdb> 39 atoms in block 83
Block first atom: 3369
Blocpdb> 39 atoms in block 84
Block first atom: 3408
Blocpdb> 51 atoms in block 85
Block first atom: 3447
Blocpdb> 43 atoms in block 86
Block first atom: 3498
Blocpdb> 41 atoms in block 87
Block first atom: 3541
Blocpdb> 34 atoms in block 88
Block first atom: 3582
Blocpdb> 36 atoms in block 89
Block first atom: 3616
Blocpdb> 39 atoms in block 90
Block first atom: 3652
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 3691
Blocpdb> 42 atoms in block 92
Block first atom: 3727
Blocpdb> 38 atoms in block 93
Block first atom: 3769
Blocpdb> 41 atoms in block 94
Block first atom: 3807
Blocpdb> 39 atoms in block 95
Block first atom: 3848
Blocpdb> 36 atoms in block 96
Block first atom: 3887
Blocpdb> 35 atoms in block 97
Block first atom: 3923
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 3958
Blocpdb> 44 atoms in block 99
Block first atom: 3995
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 4039
Blocpdb> 39 atoms in block 101
Block first atom: 4069
Blocpdb> 38 atoms in block 102
Block first atom: 4108
Blocpdb> 42 atoms in block 103
Block first atom: 4146
Blocpdb> 40 atoms in block 104
Block first atom: 4188
Blocpdb> 47 atoms in block 105
Block first atom: 4228
Blocpdb> 39 atoms in block 106
Block first atom: 4275
Blocpdb> 49 atoms in block 107
Block first atom: 4314
Blocpdb> 37 atoms in block 108
Block first atom: 4363
Blocpdb> 35 atoms in block 109
Block first atom: 4400
Blocpdb> 41 atoms in block 110
Block first atom: 4435
Blocpdb> 42 atoms in block 111
Block first atom: 4476
Blocpdb> 39 atoms in block 112
Block first atom: 4518
Blocpdb> 40 atoms in block 113
Block first atom: 4557
Blocpdb> 44 atoms in block 114
Block first atom: 4597
Blocpdb> 49 atoms in block 115
Block first atom: 4641
Blocpdb> 43 atoms in block 116
Block first atom: 4690
Blocpdb> 37 atoms in block 117
Block first atom: 4733
Blocpdb> 36 atoms in block 118
Block first atom: 4770
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 4806
Blocpdb> 43 atoms in block 120
Block first atom: 4837
Blocpdb> 42 atoms in block 121
Block first atom: 4880
Blocpdb> 36 atoms in block 122
Block first atom: 4922
Blocpdb> 47 atoms in block 123
Block first atom: 4958
Blocpdb> 37 atoms in block 124
Block first atom: 5005
Blocpdb> 45 atoms in block 125
Block first atom: 5042
Blocpdb> 39 atoms in block 126
Block first atom: 5087
Blocpdb> 41 atoms in block 127
Block first atom: 5126
Blocpdb> 32 atoms in block 128
Block first atom: 5167
Blocpdb> 39 atoms in block 129
Block first atom: 5199
Blocpdb> 36 atoms in block 130
Block first atom: 5238
Blocpdb> 46 atoms in block 131
Block first atom: 5274
Blocpdb> 40 atoms in block 132
Block first atom: 5320
Blocpdb> 45 atoms in block 133
Block first atom: 5360
Blocpdb> 42 atoms in block 134
Block first atom: 5405
Blocpdb> 44 atoms in block 135
Block first atom: 5447
Blocpdb> 39 atoms in block 136
Block first atom: 5491
Blocpdb> 38 atoms in block 137
Block first atom: 5530
Blocpdb> 41 atoms in block 138
Block first atom: 5568
Blocpdb> 51 atoms in block 139
Block first atom: 5609
Blocpdb> 43 atoms in block 140
Block first atom: 5660
Blocpdb> 41 atoms in block 141
Block first atom: 5703
Blocpdb> 41 atoms in block 142
Block first atom: 5744
Blocpdb> 43 atoms in block 143
Block first atom: 5785
Blocpdb> 40 atoms in block 144
Block first atom: 5828
Blocpdb> 43 atoms in block 145
Block first atom: 5868
Blocpdb> 34 atoms in block 146
Block first atom: 5911
Blocpdb> 43 atoms in block 147
Block first atom: 5945
Blocpdb> 44 atoms in block 148
Block first atom: 5988
Blocpdb> 37 atoms in block 149
Block first atom: 6032
Blocpdb> 49 atoms in block 150
Block first atom: 6069
Blocpdb> 42 atoms in block 151
Block first atom: 6118
Blocpdb> 40 atoms in block 152
Block first atom: 6160
Blocpdb> 36 atoms in block 153
Block first atom: 6200
Blocpdb> 41 atoms in block 154
Block first atom: 6236
Blocpdb> 43 atoms in block 155
Block first atom: 6277
Blocpdb> 33 atoms in block 156
Block first atom: 6320
Blocpdb> 42 atoms in block 157
Block first atom: 6353
Blocpdb> 47 atoms in block 158
Block first atom: 6395
Blocpdb> 40 atoms in block 159
Block first atom: 6442
Blocpdb> 45 atoms in block 160
Block first atom: 6482
Blocpdb> 45 atoms in block 161
Block first atom: 6527
Blocpdb> 49 atoms in block 162
Block first atom: 6572
Blocpdb> 39 atoms in block 163
Block first atom: 6621
Blocpdb> 40 atoms in block 164
Block first atom: 6660
Blocpdb> 30 atoms in block 165
Block first atom: 6700
Blocpdb> 37 atoms in block 166
Block first atom: 6730
Blocpdb> 38 atoms in block 167
Block first atom: 6767
Blocpdb> 40 atoms in block 168
Block first atom: 6805
Blocpdb> 36 atoms in block 169
Block first atom: 6845
Blocpdb> 34 atoms in block 170
Block first atom: 6881
Blocpdb> 40 atoms in block 171
Block first atom: 6915
Blocpdb> 31 atoms in block 172
Block first atom: 6955
Blocpdb> 37 atoms in block 173
Block first atom: 6986
Blocpdb> 40 atoms in block 174
Block first atom: 7023
Blocpdb> 38 atoms in block 175
Block first atom: 7063
Blocpdb> 34 atoms in block 176
Block first atom: 7101
Blocpdb> 41 atoms in block 177
Block first atom: 7135
Blocpdb> 37 atoms in block 178
Block first atom: 7176
Blocpdb> 37 atoms in block 179
Block first atom: 7213
Blocpdb> 8 atoms in block 180
Block first atom: 7249
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 56 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2710885 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 21771
Prepmat> Matrix trace = 5927940.0000
Prepmat> Last element read: 21771 21771 79.4154
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14693 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7257
RTB> Total mass = 7257.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7257
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 201727.9569
RTB> 54792 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54792
Diagstd> Projected matrix trace = 201727.9569
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 201727.9569
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0312915 0.0861685 0.2276377 0.3337724
0.5043956 0.6332697 0.6813043 0.9027907 0.9120456
0.9839878 1.1501538 1.2847269 1.6835519 1.8437842
1.9662488 2.4097198 2.5378039 2.8335167 3.4798006
3.6057391 4.1998870 4.3107521 4.7885422 5.3522890
5.7383479 6.4195901 7.0104607 7.5567107 8.2159730
8.3711449 8.7590518 8.9944216 9.2743728 9.7317344
10.2112545 10.4246633 10.7003852 11.3309945 11.5738362
12.1443708 12.4796275 12.8455475 13.0726360 13.4673143
13.7814019 14.1500184 14.5462622 14.7057654 15.0852686
15.8735738 16.5670243 16.7191614 17.3156276 17.7118867
18.3770084 18.8119695 19.2573371 19.8857856 20.0808491
20.7199666 21.2623825 21.9588602 22.5524023 23.0665625
23.4159941 23.5669559 23.6800440 24.3154174 24.7535434
25.3052183 25.6838258 26.2891307 26.4820725 26.8508661
27.0291850 27.2452813 27.4738430 27.7062031 28.1341999
28.4262922 28.5680922 28.9972060 29.2493501 29.4505017
29.7983883 29.9622913 30.8455023 31.0460890 31.1244705
32.2438536 32.6071887 32.9456596 33.1557086 33.7349135
34.1933094 34.8527314 35.0748805 35.3166689 36.1482872
36.4770360
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034328 0.0034333 0.0034341 0.0034353
0.0034361 19.2091707 31.8764165 51.8104530 62.7365286
77.1224702 86.4151024 89.6325705 103.1784073 103.7059207
107.7184606 116.4590496 123.0837428 140.8992018 147.4518851
152.2700576 168.5693265 172.9913205 182.7924144 202.5687558
206.2017908 222.5430736 225.4611959 237.6276323 251.2262739
260.1289676 275.1369575 287.5203309 298.5119211 311.2610527
314.1866370 321.3836870 325.6731100 330.7025593 338.7586587
347.0042797 350.6116151 355.2180184 365.5352765 369.4315192
378.4275880 383.6154509 389.1988875 392.6240193 398.5068377
403.1270861 408.4828077 414.1627033 416.4272076 421.7662307
432.6459454 441.9951817 444.0199926 451.8709250 457.0120940
465.5139362 470.9907886 476.5334562 484.2466856 486.6159234
494.2990844 500.7272696 508.8621831 515.6935327 521.5389155
525.4744210 527.1655544 528.4288651 535.4712331 540.2738751
546.2611621 550.3324709 556.7797000 558.8191308 562.6967801
564.5621467 566.8144696 569.1870184 571.5889006 575.9868450
578.9691033 580.4113547 584.7542100 587.2910607 589.3070394
592.7774410 594.4054613 603.1026046 605.0603992 605.8237095
616.6216241 620.0860464 623.2960634 625.2798552 630.7177897
634.9884824 641.0821573 643.1220209 645.3348918 652.8886856
655.8507978
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7257
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1292E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6168E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2276
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5044
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6333
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6813
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9028
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9120
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9840
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.150
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.285
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.966
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.410
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.538
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.834
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.606
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.789
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.352
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.420
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.010
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.557
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.216
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.371
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.759
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.994
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.732
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 0.99999
0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998
1.00003 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 0.99993 1.00003
0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 130626 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 0.99999
0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998
1.00003 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00000 1.00001 0.99999 0.99993 1.00003
0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 261012193707778519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
261012193707778519.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 261012193707778519.atom
Openam> file on opening on unit 11:
261012193707778519.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 896
First residue number = 1
Last residue number = 896
Number of atoms found = 7257
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1292E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6168E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5044
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6333
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6813
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9120
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9840
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.150
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.966
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.410
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.834
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.789
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.352
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.420
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.010
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.557
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.371
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.759
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.994
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.732
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48
Bfactors> 106 vectors, 21771 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.031292
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.302 for 896 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.152 +/- 1.40
Bfactors> = 0.883 +/- 0.13
Bfactors> Shiftng-fct= 0.731
Bfactors> Scaling-fct= 0.095
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 261012193707778519.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
261012193707778519.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Chkmod> 106 vectors, 21771 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7257 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 84 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9748
0.0034 0.8794
0.0034 0.7148
0.0034 0.7435
0.0034 0.7426
0.0034 0.9500
19.2085 0.0071
31.8750 0.0077
51.8039 0.3270
62.7364 0.3842
77.1195 0.6271
86.4135 0.1081
89.6284 0.0233
103.1745 0.0569
103.6989 0.0295
107.7145 0.6058
116.4463 0.0949
123.0915 0.2262
140.9119 0.0752
147.4542 0.5216
152.2539 0.0133
168.5719 0.4856
172.9906 0.3191
182.8002 0.5088
202.5659 0.5552
206.2004 0.0759
222.5365 0.5565
225.4580 0.1705
237.6288 0.0901
251.2087 0.2641
260.1099 0.1509
275.1339 0.4410
287.4985 0.5803
298.5048 0.3263
311.2482 0.4728
314.1704 0.3021
321.3689 0.0291
325.6515 0.3241
330.6817 0.2871
338.7487 0.2547
346.9681 0.2806
350.5181 0.4142
355.1964 0.2641
365.5035 0.2234
369.3544 0.1196
378.3432 0.3865
383.6047 0.2130
389.2496 0.2161
392.5676 0.1842
398.5295 0.3176
403.0893 0.2491
408.4650 0.3000
414.1981 0.1248
416.4693 0.1519
421.8143 0.3378
432.5787 0.2163
442.0159 0.2112
444.0121 0.2179
451.9086 0.2458
456.9681 0.2370
465.5318 0.1994
470.9459 0.4488
476.5459 0.2397
484.2772 0.3997
486.5847 0.2527
494.2783 0.2533
500.6777 0.2148
508.8535 0.4461
515.6439 0.2111
521.5554 0.4362
525.4968 0.3948
527.1770 0.2633
528.4057 0.2541
535.4987 0.3316
540.2120 0.3811
546.2893 0.3355
550.2679 0.3754
556.7650 0.2886
558.7733 0.4282
562.6635 0.1610
564.5464 0.3629
566.8392 0.2313
569.1228 0.0778
571.6035 0.1142
575.9191 0.5695
578.9820 0.2266
580.4058 0.3289
584.7573 0.4869
587.2724 0.4002
589.2767 0.3577
592.7680 0.4767
594.3572 0.3840
603.1207 0.1386
605.0725 0.3138
605.7542 0.2089
616.5583 0.4327
620.0862 0.3079
623.3104 0.5148
625.2935 0.3500
630.6448 0.3581
634.9305 0.4330
641.0295 0.5076
643.0497 0.5244
645.3376 0.3571
652.8761 0.5118
655.8493 0.2824
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193707778519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193707778519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193707778519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193707778519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193707778519 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193707778519.eigenfacs
261012193707778519.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193707778519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 261012193707778519.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
261012193707778519.10.pdb
261012193707778519.11.pdb
261012193707778519.7.pdb
261012193707778519.8.pdb
261012193707778519.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m38.942s
user 0m38.597s
sys 0m0.329s
rm: cannot remove '261012193707778519.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|