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* TPP_E.coli_OtsB *

LOGs for ID: 261012193747778604

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 261012193747778604.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 261012193747778604.atom to be opened.

 Openam> File opened: 261012193747778604.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    266
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    266
            Number of atoms found    =   2054
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.228019 +/-    12.102861 From:   -36.595000 To:    28.065000
 =    -1.100649 +/-     8.285873 From:   -20.128000 To:    24.105000
 =     1.764716 +/-    15.340252 From:   -27.932000 To:    39.660000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.8293 % Filled.
 Pdbmat>       727121  non-zero elements.
 Pdbmat>        79433 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     77.34 +/-     23.35
         Maximum number =    128
         Minimum number =     15

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.588660E+06
 Pdbmat> Larger element =  512.210    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
266 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 261012193747778604.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 261012193747778604.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 261012193747778604.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2054 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   266 residues.
 Blocpdb>    15 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     16
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     47
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     63
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     79
 Blocpdb>    14 atoms in block      7
 Block first atom:     93
 Blocpdb>    17 atoms in block      8
 Block first atom:    107
 Blocpdb>    25 atoms in block      9
 Block first atom:    124
 Blocpdb>    19 atoms in block     10
 Block first atom:    149
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:    168
 Blocpdb>    11 atoms in block     12
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    13 atoms in block     13
 Block first atom:    195
 Blocpdb>    17 atoms in block     14
 Block first atom:    208
 Blocpdb>    16 atoms in block     15
 Block first atom:    225
 Blocpdb>    17 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    258
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    275
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    289
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    303
 Blocpdb>    16 atoms in block     21
 Block first atom:    319
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    335
 Blocpdb>    17 atoms in block     23
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    365
 Blocpdb>    12 atoms in block     25
 Block first atom:    381
 Blocpdb>    11 atoms in block     26
 Block first atom:    393
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    404
 Blocpdb>    13 atoms in block     28
 Block first atom:    416
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    429
 Blocpdb>    14 atoms in block     30
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    15 atoms in block     31
 Block first atom:    456
 Blocpdb>    14 atoms in block     32
 Block first atom:    471
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    501
 Blocpdb>    13 atoms in block     35
 Block first atom:    517
 Blocpdb>    14 atoms in block     36
 Block first atom:    530
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    544
 Blocpdb>    22 atoms in block     38
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    15 atoms in block     39
 Block first atom:    585
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    600
 Blocpdb>    17 atoms in block     41
 Block first atom:    609
 Blocpdb>     9 atoms in block     42
 Block first atom:    626
 Blocpdb>    20 atoms in block     43
 Block first atom:    635
 Blocpdb>    19 atoms in block     44
 Block first atom:    655
 Blocpdb>    16 atoms in block     45
 Block first atom:    674
 Blocpdb>    13 atoms in block     46
 Block first atom:    690
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    15 atoms in block     48
 Block first atom:    720
 Blocpdb>    18 atoms in block     49
 Block first atom:    735
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    753
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    768
 Blocpdb>    16 atoms in block     52
 Block first atom:    781
 Blocpdb>    16 atoms in block     53
 Block first atom:    797
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    813
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    826
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    843
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    875
 Blocpdb>    19 atoms in block     59
 Block first atom:    889
 Blocpdb>     9 atoms in block     60
 Block first atom:    908
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    917
 Blocpdb>    16 atoms in block     62
 Block first atom:    934
 Blocpdb>    13 atoms in block     63
 Block first atom:    950
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:    992
 Blocpdb>    23 atoms in block     67
 Block first atom:   1010
 Blocpdb>    14 atoms in block     68
 Block first atom:   1033
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1047
 Blocpdb>    19 atoms in block     70
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    13 atoms in block     71
 Block first atom:   1082
 Blocpdb>    16 atoms in block     72
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1111
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1126
 Blocpdb>    19 atoms in block     75
 Block first atom:   1140
 Blocpdb>    16 atoms in block     76
 Block first atom:   1159
 Blocpdb>    22 atoms in block     77
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    16 atoms in block     78
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    13 atoms in block     79
 Block first atom:   1213
 Blocpdb>    17 atoms in block     80
 Block first atom:   1226
 Blocpdb>    13 atoms in block     81
 Block first atom:   1243
 Blocpdb>    15 atoms in block     82
 Block first atom:   1256
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1271
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1285
 Blocpdb>    16 atoms in block     85
 Block first atom:   1302
 Blocpdb>    15 atoms in block     86
 Block first atom:   1318
 Blocpdb>    13 atoms in block     87
 Block first atom:   1333
 Blocpdb>    13 atoms in block     88
 Block first atom:   1346
 Blocpdb>    14 atoms in block     89
 Block first atom:   1359
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1373
 Blocpdb>    16 atoms in block     91
 Block first atom:   1386
 Blocpdb>    17 atoms in block     92
 Block first atom:   1402
 Blocpdb>    14 atoms in block     93
 Block first atom:   1419
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1433
 Blocpdb>    12 atoms in block     95
 Block first atom:   1451
 Blocpdb>    18 atoms in block     96
 Block first atom:   1463
 Blocpdb>    14 atoms in block     97
 Block first atom:   1481
 Blocpdb>    19 atoms in block     98
 Block first atom:   1495
 Blocpdb>    12 atoms in block     99
 Block first atom:   1514
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1526
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1542
 Blocpdb>    15 atoms in block    102
 Block first atom:   1557
 Blocpdb>    15 atoms in block    103
 Block first atom:   1572
 Blocpdb>    10 atoms in block    104
 Block first atom:   1587
 Blocpdb>    15 atoms in block    105
 Block first atom:   1597
 Blocpdb>    19 atoms in block    106
 Block first atom:   1612
 Blocpdb>     8 atoms in block    107
 Block first atom:   1631
 Blocpdb>    14 atoms in block    108
 Block first atom:   1639
 Blocpdb>    16 atoms in block    109
 Block first atom:   1653
 Blocpdb>    12 atoms in block    110
 Block first atom:   1669
 Blocpdb>    11 atoms in block    111
 Block first atom:   1681
 Blocpdb>    12 atoms in block    112
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    14 atoms in block    113
 Block first atom:   1704
 Blocpdb>    20 atoms in block    114
 Block first atom:   1718
 Blocpdb>    19 atoms in block    115
 Block first atom:   1738
 Blocpdb>     9 atoms in block    116
 Block first atom:   1757
 Blocpdb>    14 atoms in block    117
 Block first atom:   1766
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1780
 Blocpdb>    20 atoms in block    119
 Block first atom:   1795
 Blocpdb>    22 atoms in block    120
 Block first atom:   1815
 Blocpdb>    17 atoms in block    121
 Block first atom:   1837
 Blocpdb>    15 atoms in block    122
 Block first atom:   1854
 Blocpdb>    12 atoms in block    123
 Block first atom:   1869
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1881
 Blocpdb>    18 atoms in block    125
 Block first atom:   1898
 Blocpdb>    20 atoms in block    126
 Block first atom:   1916
 Blocpdb>    16 atoms in block    127
 Block first atom:   1936
 Blocpdb>    17 atoms in block    128
 Block first atom:   1952
 Blocpdb>    16 atoms in block    129
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    21 atoms in block    130
 Block first atom:   1985
 Blocpdb>    17 atoms in block    131
 Block first atom:   2006
 Blocpdb>    17 atoms in block    132
 Block first atom:   2023
 Blocpdb>    15 atoms in block    133
 Block first atom:   2039

 Blocpdb>   133 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       727254 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6162

 Prepmat> Matrix trace    =    1588660.0000
 Prepmat> Last element read:    6162   6162        54.0946
 Prepmat>         8912 lines saved.
 Prepmat>         7534 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2054
 RTB> Total mass =        2054.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2054
 RTB> Number of blocks =   133
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  173200.1594
 RTB>     47577 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      798
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    47577
 Diagstd> Projected matrix trace =  173200.1594

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    798 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 173200.1594
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.2185640      0.2954706      0.9797338      1.1072102
      1.6059779      1.9882828      3.0401443      3.5511940      5.2257051
      5.6698620      6.3249434      7.5149732      8.8079106      9.7439669
     10.3081799     10.9152630     11.6711514     12.2701314     14.1100821
     16.0933967     17.1400700     17.5741943     18.0506127     19.4539368
     20.0109084     20.6382295     21.5184603     22.3252868     23.0509550
     25.0104616     25.9443752     26.7030650     26.9094902     27.2896170
     27.8276648     30.5333608     30.9635148     31.6114018     32.2763438
     32.6411567     32.9030926     33.4158759     34.2793536     34.5614387
     34.7913223     35.9669521     36.9002357     37.8639001     38.2289474
     38.6683537     39.1063427     40.0123718     41.2187228     41.5965868
     41.7838690     42.7454831     43.4220505     44.5481237     45.3570467
     45.3945623     46.3047439     47.5110807     48.0038476     48.9033899
     49.6024010     50.4307838     51.3768635     51.6043327     52.0642066
     53.2460934     54.4686700     54.8657951     55.6715533     56.4237324
     57.0755321     58.1766673     58.8485498     59.9698419     60.3088021
     60.3892980     60.7194674     61.6543872     62.0361567     62.4879549
     63.0078085     64.2330637     64.8705316     65.1690782     65.8522501
     66.0525573     66.9926010     67.2059020     68.2935659     68.8529065
     69.0831475     69.8749669     70.7073858     71.5000846     71.6960014
     72.7886814

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034332      0.0034335      0.0034337      0.0034338
      0.0034352     50.7673563     59.0272337    107.4853626    114.2642353
    137.6147723    153.1208597    189.3400034    204.6362074    248.2376957
    258.5720183    273.1011954    297.6864021    322.2787940    338.9714967
    348.6472754    358.7669119    370.9813959    380.3819378    407.9059597
    435.6313632    449.5744020    455.2322194    461.3613978    478.9597635
    485.7677535    493.3231530    503.7335493    513.0902986    521.3624416
    543.0704017    553.1168499    561.1459553    563.3107185    567.2754653
    572.8404301    600.0432924    604.2552143    610.5442668    616.9322117
    620.4089442    622.8932725    627.7282948    635.7869251    638.3975129
    640.5171286    651.2490436    659.6443548    668.2022798    671.4156354
    675.2632604    679.0767806    686.8982784    697.1761882    700.3645061
    701.9393767    709.9706491    715.5672311    724.7863217    731.3372003
    731.6395886    738.9380391    748.5016032    752.3731780    759.3898055
    764.7977995    771.1575933    778.3574278    780.0785991    783.5467394
    792.3903084    801.4356658    804.3519501    810.2367725    815.6919676
    820.3898237    828.2657433    833.0348350    840.9336523    843.3068564
    843.8694617    846.1731818    852.6627157    855.2985237    858.4073665
    861.9706284    870.3112525    874.6192039    876.6294755    881.2123795
    882.5515835    888.8095250    890.2233623    897.3981610    901.0656196
    902.5709231    907.7287435    913.1196118    918.2238272    919.4809753
    926.4611371

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2054
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    133

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9912E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2186    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2955    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9797    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.107    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.606    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.988    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.040    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.551    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.226    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.670    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.325    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.515    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.808    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.744    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.79    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    798 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996
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 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
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 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
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 1.00006 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997
 0.99997

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    36972 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99997
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 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
 0.99999 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00006 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997
 0.99997

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 261012193747778604.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 261012193747778604.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 261012193747778604.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 261012193747778604.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    266
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    266
            Number of atoms found    =   2054
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9912E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9971E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2186    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2955    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9797    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.107    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.606    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.988    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.040    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.551    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.226    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.670    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.325    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.515    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.808    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.744    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.79    

 Bfactors>  106 vectors,   6162 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.218600
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.724 for    266 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.099 +/-   0.28
 Bfactors> =      0.920 +/-   0.09
 Bfactors> Shiftng-fct=      0.821
 Bfactors> Scaling-fct=      0.332

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 261012193747778604.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 261012193747778604.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4350E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   50.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   59.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   107.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   114.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   137.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   153.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   189.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   204.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   248.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   258.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   273.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   297.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   322.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   339.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   348.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   913.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   918.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.4    

 Chkmod>  106 vectors,   6162 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2054 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector   101 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.6634
      0.0034      0.7369
      0.0034      0.7498
      0.0034      0.9229
      0.0034      0.8397
      0.0034      0.9724
     50.7694      0.1293
     59.0276      0.1610
    107.4789      0.5196
    114.2485      0.6243
    137.6098      0.0815
    153.1034      0.4826
    189.3274      0.2030
    204.6218      0.2104
    248.2340      0.5956
    258.5641      0.4164
    273.0907      0.3060
    297.6742      0.3290
    322.2666      0.5165
    338.9575      0.0773
    348.6631      0.2007
    358.8293      0.2362
    370.9472      0.1060
    380.3636      0.2079
    407.8873      0.3665
    435.5667      0.2955
    449.5542      0.3746
    455.1584      0.3495
    461.3338      0.2958
    478.8907      0.2468
    485.7359      0.3243
    493.3231      0.5200
    503.7299      0.2872
    513.1224      0.3959
    521.3293      0.2534
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    627.7401      0.3199
    635.7656      0.2545
    638.3568      0.5736
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    919.4671      0.4221
    926.4298      0.4504
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 261012193747778604 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
261012193747778604.eigenfacs
261012193747778604.atom
making animated gifs
11 models are in 261012193747778604.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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261012193747778604.11.pdb
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261012193747778604.8.pdb
261012193747778604.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m9.641s
user	0m9.552s
sys	0m0.088s
rm: cannot remove '261012193747778604.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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