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***  DNA polimerase com DNA  ***

LOGs for ID: 2610141417151088793

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610141417151088793.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610141417151088793.atom to be opened. Openam> File opened: 2610141417151088793.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 356 First residue number = 7 Last residue number = 5 Number of atoms found = 3181 Mean number per residue = 8.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 13.883023 +/- 14.901296 From: -18.512000 To: 47.094000 = 0.644658 +/- 11.700853 From: -29.360000 To: 35.276000 = 12.373034 +/- 13.119173 From: -23.178000 To: 42.164000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 30 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.4867 % Filled. Pdbmat> 1132426 non-zero elements. Pdbmat> 123725 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 77.79 +/- 22.14 Maximum number = 124 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 2.474500E+06 Pdbmat> Larger element = 491.571 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 356 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610141417151088793.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610141417151088793.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610141417151088793.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3181 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 356 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 8 atoms in block 4 Block first atom: 41 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 49 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 64 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 80 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 95 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 112 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 125 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 145 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 162 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 175 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 189 Blocpdb> 21 atoms in block 15 Block first atom: 207 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 228 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 241 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 264 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 278 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 289 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 304 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 318 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 337 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 356 Blocpdb> 10 atoms in block 25 Block first atom: 373 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 383 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 397 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 411 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 428 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 439 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 450 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 466 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 479 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 497 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 513 Blocpdb> 13 atoms in block 36 Block first atom: 533 Blocpdb> 11 atoms in block 37 Block first atom: 546 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 557 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 574 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 594 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 611 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 628 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 648 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 664 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 677 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 689 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 705 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 724 Blocpdb> 13 atoms in block 49 Block first atom: 742 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 755 Blocpdb> 11 atoms in block 51 Block first atom: 767 Blocpdb> 11 atoms in block 52 Block first atom: 778 Blocpdb> 16 atoms in block 53 Block first atom: 789 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 805 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 825 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 840 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 853 Blocpdb> 15 atoms in block 58 Block first atom: 870 Blocpdb> 17 atoms in block 59 Block first atom: 885 Blocpdb> 19 atoms in block 60 Block first atom: 902 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 921 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 938 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 955 Blocpdb> 18 atoms in block 64 Block first atom: 972 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 990 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1009 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1028 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1040 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1061 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1076 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1095 Blocpdb> 19 atoms in block 72 Block first atom: 1113 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1132 Blocpdb> 18 atoms in block 74 Block first atom: 1150 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1168 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1184 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1201 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1218 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1233 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1249 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1265 Blocpdb> 15 atoms in block 82 Block first atom: 1283 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1298 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1313 Blocpdb> 12 atoms in block 85 Block first atom: 1333 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1345 Blocpdb> 10 atoms in block 87 Block first atom: 1358 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1368 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1390 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1405 Blocpdb> 12 atoms in block 91 Block first atom: 1419 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1431 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1443 Blocpdb> 15 atoms in block 94 Block first atom: 1459 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1474 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1489 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1506 Blocpdb> 13 atoms in block 98 Block first atom: 1523 Blocpdb> 11 atoms in block 99 Block first atom: 1536 Blocpdb> 12 atoms in block 100 Block first atom: 1547 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1559 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1576 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1594 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1610 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1626 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 1643 Blocpdb> 17 atoms in block 107 Block first atom: 1661 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1678 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1697 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1712 Blocpdb> 15 atoms in block 111 Block first atom: 1727 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1742 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 1755 Blocpdb> 19 atoms in block 114 Block first atom: 1771 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 1790 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1801 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1816 Blocpdb> 11 atoms in block 118 Block first atom: 1831 Blocpdb> 10 atoms in block 119 Block first atom: 1842 Blocpdb> 14 atoms in block 120 Block first atom: 1852 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 1866 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 1887 Blocpdb> 22 atoms in block 123 Block first atom: 1904 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1926 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 1942 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 1961 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1977 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 1993 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2010 Blocpdb> 10 atoms in block 130 Block first atom: 2034 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2044 Blocpdb> 23 atoms in block 132 Block first atom: 2059 Blocpdb> 11 atoms in block 133 Block first atom: 2082 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2093 Blocpdb> 19 atoms in block 135 Block first atom: 2107 Blocpdb> 17 atoms in block 136 Block first atom: 2126 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2143 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2159 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2175 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2190 Blocpdb> 9 atoms in block 141 Block first atom: 2207 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 2216 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2234 Blocpdb> 21 atoms in block 144 Block first atom: 2250 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2271 Blocpdb> 18 atoms in block 146 Block first atom: 2286 Blocpdb> 12 atoms in block 147 Block first atom: 2304 Blocpdb> 14 atoms in block 148 Block first atom: 2316 Blocpdb> 11 atoms in block 149 Block first atom: 2330 Blocpdb> 9 atoms in block 150 Block first atom: 2341 Blocpdb> 16 atoms in block 151 Block first atom: 2350 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2366 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2381 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2396 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 2411 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 2428 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 2447 Blocpdb> 17 atoms in block 158 Block first atom: 2467 Blocpdb> 17 atoms in block 159 Block first atom: 2484 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 2501 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2521 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2537 Blocpdb> 16 atoms in block 163 Block first atom: 2556 Blocpdb> 35 atoms in block 164 Block first atom: 2572 Blocpdb> 43 atoms in block 165 Block first atom: 2607 Blocpdb> 19 atoms in block 166 Block first atom: 2650 Blocpdb> 39 atoms in block 167 Block first atom: 2669 Blocpdb> 41 atoms in block 168 Block first atom: 2708 Blocpdb> 41 atoms in block 169 Block first atom: 2749 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 2790 Blocpdb> 41 atoms in block 171 Block first atom: 2830 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 2871 Blocpdb> 42 atoms in block 173 Block first atom: 2909 Blocpdb> 41 atoms in block 174 Block first atom: 2951 Blocpdb> 41 atoms in block 175 Block first atom: 2992 Blocpdb> 43 atoms in block 176 Block first atom: 3033 Blocpdb> 43 atoms in block 177 Block first atom: 3076 Blocpdb> 41 atoms in block 178 Block first atom: 3119 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 3159 Blocpdb> 179 blocks. Blocpdb> At most, 43 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1132605 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9543 Prepmat> Matrix trace = 2474500.0000 Prepmat> Last element read: 9543 9543 215.8588 Prepmat> 16111 lines saved. Prepmat> 14368 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3181 RTB> Total mass = 3181.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3181 RTB> Number of blocks = 179 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 227438.5671 RTB> 60027 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1074 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60027 Diagstd> Projected matrix trace = 227438.5671 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1074 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 227438.5671 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1920237 0.5511674 0.8208697 0.9293190 1.0862952 1.3302976 1.5983178 2.3733679 2.8348628 3.0438140 3.1534466 3.5073423 3.7424205 3.9476892 4.4142494 4.7187428 5.4266199 6.0422012 6.8523365 7.2283203 7.4864796 7.8426060 9.0052430 9.1680563 9.7234364 9.9068534 10.7191127 11.3156892 11.8493006 13.1669407 13.4346642 13.7202903 13.9352080 14.4809417 15.1066363 15.6862657 16.3290214 17.0995816 17.9356283 18.3764427 18.9985027 19.6605098 21.1256459 21.4804880 21.8877056 22.6070686 22.7563075 23.4296448 23.9711458 25.1747217 26.1558596 26.7283529 26.7942679 27.1511413 27.3084189 27.7140571 27.8753036 28.4323267 29.0109536 29.8620838 30.4355131 30.8796223 31.2547905 31.7344683 32.3938076 33.1930184 33.8592045 34.1331715 35.0030343 35.6181778 36.2153414 36.6129939 37.0780697 37.2991288 37.7108745 37.8902167 39.0798255 39.6136658 40.0114128 40.3799370 41.1501694 42.0145786 42.1473264 42.3175839 42.7023688 43.4005063 43.7961013 43.8962563 44.5990751 45.2216027 45.3845249 45.9291305 46.1522095 46.9017679 47.1994184 48.0172109 48.1581180 48.6239304 48.6847456 49.1853914 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034306 0.0034327 0.0034328 0.0034333 0.0034340 0.0034346 47.5852835 80.6189353 98.3857952 104.6833686 113.1798730 125.2476786 137.2861882 167.2930156 182.8358280 189.4542428 192.8359574 203.3688132 210.0736454 215.7579250 228.1517016 235.8894042 252.9647339 266.9272247 284.2592610 291.9536947 297.1215165 304.1063429 325.8689629 328.8015958 338.6142016 341.7929870 355.5287274 365.2883199 373.8020152 394.0376494 398.0234767 402.2322890 405.3703768 413.2317509 422.0648322 430.0857600 438.8088316 449.0430950 459.8895885 465.5067709 473.3201225 481.4959826 499.1146045 503.2889000 508.0370665 516.3181666 518.0195821 525.6275647 531.6669652 544.8508329 555.3666278 561.4115959 562.1034206 565.8343719 567.4708506 571.6699106 573.3305491 579.0305535 584.8928094 593.4106485 599.0810666 603.4360751 607.0906950 611.7315696 618.0537977 625.6315669 631.8786117 634.4298406 642.4630084 648.0837450 653.4939514 657.0719109 661.2319628 663.2001633 666.8506550 668.4344499 678.8465082 683.4673880 686.8900470 690.0460888 696.5961884 703.8745883 704.9856799 706.4081680 709.6125112 715.3896923 718.6426800 719.4639234 725.2006862 730.2444337 731.5586958 735.9348884 737.7199511 743.6864813 746.0425607 752.4778934 753.5811624 757.2169219 757.6903092 761.5761700 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3181 Rtb_to_modes> Number of blocs = 179 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9805E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.373 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.835 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.168 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.907 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1074 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 57258 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 1.00005 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610141417151088793.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610141417151088793.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610141417151088793.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610141417151088793.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 356 First residue number = 7 Last residue number = 5 Number of atoms found = 3181 Mean number per residue = 8.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9805E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.373 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.835 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.168 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.907 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19 Bfactors> 106 vectors, 9543 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.192000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.616 for 326 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.074 +/- 0.09 Bfactors> = 36.162 +/- 15.01 Bfactors> Shiftng-fct= 36.088 Bfactors> Scaling-fct= 161.076 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610141417151088793.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610141417151088793.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6 Chkmod> 106 vectors, 9543 coordinates in file. Chkmod> That is: 3181 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 61 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7499 0.0034 0.7060 0.0034 0.8306 0.0034 0.8346 0.0034 0.7113 0.0034 0.8589 47.5803 0.5754 80.6179 0.3954 98.3834 0.3550 104.6778 0.2953 113.1596 0.2610 125.2283 0.5204 137.2666 0.4484 167.2729 0.2832 182.8324 0.2884 189.4519 0.1945 192.8140 0.1594 203.3502 0.2063 210.0528 0.2161 215.7572 0.0539 228.1355 0.3621 235.8857 0.3127 252.9627 0.3926 266.9113 0.5071 284.2401 0.4019 291.9347 0.2651 297.0992 0.2416 304.1009 0.5332 325.8506 0.3021 328.7865 0.3078 338.5921 0.3447 341.7808 0.0614 355.5282 0.4904 365.3422 0.4368 373.7970 0.4854 394.0665 0.3576 397.9373 0.4159 402.2108 0.2798 405.4227 0.4081 413.2006 0.3822 422.0937 0.3648 430.1185 0.4624 438.8031 0.4424 449.0293 0.0960 459.9259 0.4979 465.5318 0.5158 473.3185 0.4043 481.4691 0.4625 499.1446 0.1881 503.2616 0.4909 508.0419 0.5116 516.3295 0.5308 518.0394 0.3166 525.6090 0.4363 531.6314 0.3356 544.7763 0.3886 555.3867 0.3746 561.4048 0.3361 562.0345 0.3330 565.7982 0.3047 567.4629 0.3244 571.6035 0.3478 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DQ=-80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom making animated gifs 11 models are in 2610141417151088793.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610141417151088793 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610141417151088793.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610141417151088793 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom making animated gifs 11 models are in 2610141417151088793.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610141417151088793 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610141417151088793 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610141417151088793.eigenfacs 2610141417151088793.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610141417151088793.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610141417151088793.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610141417151088793.10.pdb 2610141417151088793.11.pdb 2610141417151088793.7.pdb 2610141417151088793.8.pdb 2610141417151088793.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.884s user 0m22.736s sys 0m0.131s rm: cannot remove '2610141417151088793.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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