*** apo ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610160951151510307.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610160951151510307.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610160951151510307.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 396
First residue number = 52
Last residue number = 447
Number of atoms found = 3170
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.918361 +/- 8.431395 From: -19.439000 To: 22.747000
= -3.137861 +/- 14.958382 From: -37.846000 To: 30.738000
= 22.496711 +/- 12.513464 From: -5.835000 To: 51.574000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.7579 % Filled.
Pdbmat> 1247259 non-zero elements.
Pdbmat> 136491 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.11 +/- 23.35
Maximum number = 136
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 2.729820E+06
Pdbmat> Larger element = 512.305
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
396 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610160951151510307.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610160951151510307.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610160951151510307.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3170 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 396 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 72
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 92
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 108
Blocpdb> 14 atoms in block 8
Block first atom: 125
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 154
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 168
Blocpdb> 14 atoms in block 12
Block first atom: 183
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 197
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 218
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 232
Blocpdb> 11 atoms in block 16
Block first atom: 247
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 258
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 275
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 11 atoms in block 20
Block first atom: 306
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 317
Blocpdb> 13 atoms in block 22
Block first atom: 325
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 338
Blocpdb> 10 atoms in block 24
Block first atom: 354
Blocpdb> 21 atoms in block 25
Block first atom: 364
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 385
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 399
Blocpdb> 13 atoms in block 28
Block first atom: 418
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 431
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 448
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 463
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 482
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 498
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 506
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 526
Blocpdb> 18 atoms in block 36
Block first atom: 542
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 560
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 583
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 602
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 619
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 635
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 649
Blocpdb> 21 atoms in block 43
Block first atom: 665
Blocpdb> 17 atoms in block 44
Block first atom: 686
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 703
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 718
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 734
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 748
Blocpdb> 15 atoms in block 49
Block first atom: 770
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 785
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 808
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 821
Blocpdb> 13 atoms in block 53
Block first atom: 841
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 854
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 869
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 885
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 898
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 914
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 933
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 953
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 970
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 989
Blocpdb> 9 atoms in block 63
Block first atom: 1003
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1012
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 1027
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 1043
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1059
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1074
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1088
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1105
Blocpdb> 14 atoms in block 71
Block first atom: 1118
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1132
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1149
Blocpdb> 13 atoms in block 74
Block first atom: 1163
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1176
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1190
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1208
Blocpdb> 16 atoms in block 78
Block first atom: 1223
Blocpdb> 13 atoms in block 79
Block first atom: 1239
Blocpdb> 28 atoms in block 80
Block first atom: 1252
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1280
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1295
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1307
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1328
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1343
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1358
Blocpdb> 18 atoms in block 87
Block first atom: 1374
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1392
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1409
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1424
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1440
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1453
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1465
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 1482
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1493
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1510
Blocpdb> 12 atoms in block 97
Block first atom: 1525
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1537
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 1553
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 1572
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1594
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1610
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1626
Blocpdb> 17 atoms in block 104
Block first atom: 1642
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 1659
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 1680
Blocpdb> 17 atoms in block 107
Block first atom: 1692
Blocpdb> 15 atoms in block 108
Block first atom: 1709
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1724
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1740
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1760
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 1776
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1792
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1807
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 1823
Blocpdb> 14 atoms in block 116
Block first atom: 1834
Blocpdb> 13 atoms in block 117
Block first atom: 1848
Blocpdb> 16 atoms in block 118
Block first atom: 1861
Blocpdb> 13 atoms in block 119
Block first atom: 1877
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 1890
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1912
Blocpdb> 17 atoms in block 122
Block first atom: 1928
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1945
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1960
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 1976
Blocpdb> 16 atoms in block 126
Block first atom: 1991
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 2007
Blocpdb> 15 atoms in block 128
Block first atom: 2023
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 2038
Blocpdb> 15 atoms in block 130
Block first atom: 2053
Blocpdb> 14 atoms in block 131
Block first atom: 2068
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2082
Blocpdb> 10 atoms in block 133
Block first atom: 2098
Blocpdb> 13 atoms in block 134
Block first atom: 2108
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 2121
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 2138
Blocpdb> 11 atoms in block 137
Block first atom: 2157
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 2168
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2182
Blocpdb> 21 atoms in block 140
Block first atom: 2198
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2219
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2235
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2252
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2265
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2282
Blocpdb> 14 atoms in block 146
Block first atom: 2300
Blocpdb> 20 atoms in block 147
Block first atom: 2314
Blocpdb> 16 atoms in block 148
Block first atom: 2334
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 2350
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 2372
Blocpdb> 14 atoms in block 151
Block first atom: 2384
Blocpdb> 11 atoms in block 152
Block first atom: 2398
Blocpdb> 18 atoms in block 153
Block first atom: 2409
Blocpdb> 19 atoms in block 154
Block first atom: 2427
Blocpdb> 16 atoms in block 155
Block first atom: 2446
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 2462
Blocpdb> 20 atoms in block 157
Block first atom: 2482
Blocpdb> 15 atoms in block 158
Block first atom: 2502
Blocpdb> 16 atoms in block 159
Block first atom: 2517
Blocpdb> 15 atoms in block 160
Block first atom: 2533
Blocpdb> 16 atoms in block 161
Block first atom: 2548
Blocpdb> 13 atoms in block 162
Block first atom: 2564
Blocpdb> 18 atoms in block 163
Block first atom: 2577
Blocpdb> 15 atoms in block 164
Block first atom: 2595
Blocpdb> 11 atoms in block 165
Block first atom: 2610
Blocpdb> 13 atoms in block 166
Block first atom: 2621
Blocpdb> 13 atoms in block 167
Block first atom: 2634
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2647
Blocpdb> 21 atoms in block 169
Block first atom: 2663
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2684
Blocpdb> 16 atoms in block 171
Block first atom: 2699
Blocpdb> 16 atoms in block 172
Block first atom: 2715
Blocpdb> 14 atoms in block 173
Block first atom: 2731
Blocpdb> 22 atoms in block 174
Block first atom: 2745
Blocpdb> 25 atoms in block 175
Block first atom: 2767
Blocpdb> 20 atoms in block 176
Block first atom: 2792
Blocpdb> 11 atoms in block 177
Block first atom: 2812
Blocpdb> 19 atoms in block 178
Block first atom: 2823
Blocpdb> 12 atoms in block 179
Block first atom: 2842
Blocpdb> 15 atoms in block 180
Block first atom: 2854
Blocpdb> 20 atoms in block 181
Block first atom: 2869
Blocpdb> 10 atoms in block 182
Block first atom: 2889
Blocpdb> 15 atoms in block 183
Block first atom: 2899
Blocpdb> 14 atoms in block 184
Block first atom: 2914
Blocpdb> 19 atoms in block 185
Block first atom: 2928
Blocpdb> 14 atoms in block 186
Block first atom: 2947
Blocpdb> 18 atoms in block 187
Block first atom: 2961
Blocpdb> 16 atoms in block 188
Block first atom: 2979
Blocpdb> 17 atoms in block 189
Block first atom: 2995
Blocpdb> 16 atoms in block 190
Block first atom: 3012
Blocpdb> 16 atoms in block 191
Block first atom: 3028
Blocpdb> 20 atoms in block 192
Block first atom: 3044
Blocpdb> 16 atoms in block 193
Block first atom: 3064
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 3080
Blocpdb> 14 atoms in block 195
Block first atom: 3102
Blocpdb> 18 atoms in block 196
Block first atom: 3116
Blocpdb> 17 atoms in block 197
Block first atom: 3134
Blocpdb> 20 atoms in block 198
Block first atom: 3150
Blocpdb> 198 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1247457 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9510
Prepmat> Matrix trace = 2729820.0000
Prepmat> Last element read: 9510 9510 200.4678
Prepmat> 19702 lines saved.
Prepmat> 17436 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3170
RTB> Total mass = 3170.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3170
RTB> Number of blocks = 198
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 288228.0724
RTB> 78570 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1188
Diagstd> Nb of non-zero elements: 78570
Diagstd> Projected matrix trace = 288228.0724
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1188 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 288228.0724
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.4111902 2.0411359 3.7492591 5.9210188
6.2713671 6.9878542 7.5068008 8.4158343 9.0287046
9.8367028 11.3902478 13.1277677 13.7834115 15.1039715
15.4880922 16.5240158 16.8181772 17.7533239 18.1850439
18.4189092 19.8147255 20.8097903 21.1208712 21.4026187
21.7456331 22.2858940 22.6346468 22.9688307 24.7121041
25.0561808 25.6023209 26.3467448 27.2737473 27.8673206
28.3799694 28.6668024 29.1298919 29.8541837 30.4679373
31.0189434 31.7940162 32.8717702 33.1952719 33.8306043
34.7049049 35.0882293 35.1150345 35.3916004 35.9790135
36.3883674 36.7240287 36.9257715 37.6346101 38.2923125
38.7991937 39.5765938 40.0027151 41.0780111 41.8072692
42.0042818 42.5643358 43.4684357 44.4028295 45.1285164
45.7197746 46.2313890 46.5461752 47.0366021 47.5876507
48.3780771 48.4715976 48.8805974 49.6528701 50.0811176
50.4008289 50.6782795 51.4639844 52.2348886 52.8588502
53.6222442 54.0175687 54.3847631 55.0567002 55.3016444
56.3654998 56.6328802 57.0673280 57.2475211 58.0039486
58.4162407 59.3578679 60.0041483 60.4545847 61.1630929
61.7785081 61.8299720 63.0954517 63.3499191 63.9325280
64.6138946
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034328 0.0034341 0.0034342 0.0034345
0.0034361 128.9995079 155.1426643 210.2654933 264.2369203
271.9420661 287.0563767 297.5244940 315.0241639 326.2931840
340.5807174 366.4897783 393.4510618 403.1564769 422.0276052
427.3603664 441.4210918 445.3328598 457.5463752 463.0761965
466.0443354 483.3807043 495.3693506 499.0581984 502.3758308
506.3855548 512.6374279 516.6329981 520.4328764 539.8214561
543.5665426 549.4585659 557.3894733 567.1104979 573.2484477
578.4971743 581.4132262 586.0905469 593.3321487 599.4000939
604.7958195 612.3052400 622.5967174 625.6528040 631.6116883
639.7211502 643.2443888 643.4900413 646.0191335 651.3582312
655.0531898 658.0674945 659.8725604 666.1760126 671.9718458
676.4047212 683.1475058 686.8153844 695.9851677 702.1359026
703.7883314 708.4646917 715.9493281 723.6034073 729.4924618
734.2556900 738.3525024 740.8619328 744.7546964 749.1045120
755.3001686 756.0298575 759.2128201 765.1867809 768.4794994
770.9285329 773.0475563 779.0170871 784.8300382 789.5036390
795.1842569 798.1100818 800.8181374 805.7501026 807.5404821
815.2709384 817.2023462 820.3308603 821.6249580 827.0353250
829.9694039 836.6319136 841.1741504 844.3254911 849.2586904
853.5205627 853.8759964 862.5699161 864.3075616 868.2728455
872.8874304
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3170
Rtb_to_modes> Number of blocs = 198
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.59
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.65
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.30
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.61
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 57060 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
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1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
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1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610160951151510307.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610160951151510307.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610160951151510307.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610160951151510307.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 396
First residue number = 52
Last residue number = 447
Number of atoms found = 3170
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.041
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.921
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.507
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.416
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.837
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.75
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61
Bfactors> 106 vectors, 9510 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.411000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.349 for 403 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.024 +/- 0.04
Bfactors> = 24.866 +/- 6.73
Bfactors> Shiftng-fct= 24.842
Bfactors> Scaling-fct= 173.677
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610160951151510307.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610160951151510307.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8
Chkmod> 106 vectors, 9510 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3170 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7414
0.0034 0.8658
0.0034 0.7248
0.0034 0.8965
0.0034 0.6805
0.0034 0.9604
128.9853 0.7111
155.1308 0.6333
210.2492 0.5838
264.2252 0.1114
271.9224 0.2701
287.0470 0.5159
297.5157 0.5653
315.0137 0.5219
326.2845 0.2635
340.5712 0.1728
366.4701 0.1902
393.4676 0.1751
403.0893 0.3373
421.9540 0.4209
427.3683 0.1407
441.3485 0.2631
445.3379 0.2179
457.4839 0.2395
463.1194 0.2662
466.0381 0.2333
483.3023 0.0618
495.3506 0.2687
499.0265 0.2447
502.3235 0.4104
506.4147 0.2893
512.6626 0.4375
516.5578 0.2940
520.4238 0.3181
539.7753 0.4553
543.5846 0.3956
549.4101 0.3577
557.4000 0.3647
567.0472 0.2874
573.2514 0.3275
578.4727 0.4340
581.4207 0.4462
586.0665 0.2890
593.2651 0.3776
599.3947 0.4414
604.7802 0.4629
612.2403 0.4389
622.5532 0.3757
625.6705 0.2791
631.5789 0.3931
639.6485 0.3397
643.2330 0.3235
643.5079 0.2004
645.9768 0.3354
651.3392 0.5436
655.0398 0.3536
658.0032 0.4203
659.8820 0.3609
666.1066 0.3102
671.9227 0.3704
676.3827 0.4288
683.1476 0.3993
686.7626 0.3851
695.9721 0.3364
702.1287 0.3624
703.7222 0.4639
708.3982 0.3118
715.9315 0.4802
723.5493 0.4647
729.4731 0.4835
734.2260 0.3504
738.3097 0.2985
740.8606 0.3864
744.7496 0.2129
749.0908 0.2757
755.2828 0.4428
755.9849 0.3673
759.1756 0.3609
765.1318 0.3177
768.4379 0.3915
770.8891 0.2799
773.0275 0.4591
778.9535 0.3491
784.7596 0.3949
789.4783 0.3759
795.1335 0.4418
798.0938 0.4723
800.7487 0.4150
805.7397 0.3567
807.4938 0.2174
815.2685 0.3454
817.1465 0.4179
820.3148 0.4830
821.6075 0.5094
826.9717 0.4021
829.9605 0.4848
836.6110 0.4488
841.1090 0.3699
844.2572 0.4222
849.2008 0.4589
853.4942 0.4349
853.8395 0.3967
862.5640 0.4129
864.2710 0.3067
868.2184 0.3684
872.8237 0.4678
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610160951151510307.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610160951151510307.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610160951151510307.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610160951151510307.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610160951151510307.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610160951151510307.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8
Projmod> 106 vectors, 9510 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 396
First residue number = 52
Last residue number = 447
Number of atoms found = 3170
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 785
First residue number = 52
Last residue number = 442
Number of atoms found = 6234
Mean number per residue = 7.9
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 3161 of first conformer: HIS 447 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951151510307 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
making animated gifs
11 models are in 2610160951151510307.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610160951151510307.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610160951151510307.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 395 3.310 280 1.325
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 395 2.963 294 1.651
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 395 2.619 315 1.587
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 395 2.278 338 1.736
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 395 1.945 363 1.597
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 395 1.621 381 1.418
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 395 1.315 388 1.157
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 395 1.042 391 0.903
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 395 0.836 391 0.686
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 395 0.754 391 0.614
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 395 0.833 392 0.741
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951151510307 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 395 2.295 329 1.653
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 395 2.058 355 1.609
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 395 1.859 366 1.514
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 395 1.711 376 1.457
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 395 1.628 381 1.427
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 395 1.621 381 1.418
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 395 1.689 380 1.477
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 395 1.825 366 1.490
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 395 2.015 349 1.528
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 395 2.245 332 1.584
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 395 2.505 315 1.713
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951151510307 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 395 2.481 306 1.513
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 395 2.222 321 1.474
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 395 1.994 342 1.470
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 395 1.809 364 1.469
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 395 1.680 379 1.464
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 395 1.621 381 1.418
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 395 1.640 379 1.415
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 395 1.734 375 1.459
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 395 1.892 365 1.532
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 395 2.100 353 1.625
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 395 2.344 335 1.725
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951151510307 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610160951151510307.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 395 2.272 378 1.797
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 395 1.965 386 1.689
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 395 1.720 387 1.577
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 395 1.566 386 1.492
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 395 1.530 386 1.450
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 395 1.621 381 1.418
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 395 1.819 371 1.369
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 395 2.094 365 1.359
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 395 2.420 359 1.367
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 395 2.780 355 1.418
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 395 3.161 350 1.478
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951151510307 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610160951151510307.eigenfacs
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2610160951151510307.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610160951151510307.eigenfacs
2610160951151510307.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610160951151510307.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2610160951151510307.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610160951151510307.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610160951151510307.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 395 2.411 343 1.813
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 395 2.119 355 1.699
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 395 1.874 366 1.604
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 395 1.696 372 1.512
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 395 1.606 380 1.472
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 395 1.621 381 1.418
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 395 1.736 380 1.399
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 395 1.935 377 1.422
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 395 2.195 370 1.461
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 395 2.496 363 1.543
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 395 2.826 349 1.613
2610160951151510307.10.pdb
2610160951151510307.11.pdb
2610160951151510307.7.pdb
2610160951151510307.8.pdb
2610160951151510307.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m33.380s
user 0m33.154s
sys 0m0.201s
rm: cannot remove '2610160951151510307.sdijf': No such file or directory
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