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***  holo-lig  ***

LOGs for ID: 2610160951531510387

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610160951531510387.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610160951531510387.atom to be opened. Openam> File opened: 2610160951531510387.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 397 First residue number = 52 Last residue number = 2 Number of atoms found = 3170 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.146599 +/- 8.568832 From: -19.666000 To: 22.573000 = 1.276310 +/- 14.511608 From: -29.745000 To: 34.849000 = 22.116052 +/- 12.245639 From: -6.355000 To: 50.179000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'BGC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'GLC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 2 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8041 % Filled. Pdbmat> 1268162 non-zero elements. Pdbmat> 138823 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.59 +/- 23.40 Maximum number = 141 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.776460E+06 Pdbmat> Larger element = 519.899 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 397 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610160951531510387.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610160951531510387.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610160951531510387.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3170 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 397 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 52 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 71 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 91 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 107 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 124 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 138 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 153 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 167 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 182 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 196 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 217 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 231 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 246 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 257 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 274 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 290 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 305 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 316 Blocpdb> 13 atoms in block 22 Block first atom: 324 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 337 Blocpdb> 10 atoms in block 24 Block first atom: 353 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 363 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 379 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 393 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 417 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 427 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 444 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 459 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 478 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 494 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 502 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 519 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 535 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 553 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 576 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 612 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 628 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 642 Blocpdb> 21 atoms in block 43 Block first atom: 658 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 679 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 696 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 14 atoms in block 47 Block first atom: 727 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 741 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 757 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 772 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 789 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 802 Blocpdb> 13 atoms in block 53 Block first atom: 822 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 835 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 850 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 866 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 879 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 895 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 914 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 934 Blocpdb> 19 atoms in block 61 Block first atom: 951 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 970 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 984 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 993 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1008 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1024 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1040 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1055 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1069 Blocpdb> 13 atoms in block 70 Block first atom: 1086 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1099 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1113 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1130 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1150 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1163 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1177 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1195 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1210 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1226 Blocpdb> 28 atoms in block 80 Block first atom: 1239 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1267 Blocpdb> 12 atoms in block 82 Block first atom: 1282 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1294 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1315 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1330 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1345 Blocpdb> 18 atoms in block 87 Block first atom: 1361 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1379 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1396 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1411 Blocpdb> 13 atoms in block 91 Block first atom: 1427 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1440 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1452 Blocpdb> 11 atoms in block 94 Block first atom: 1469 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1480 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1497 Blocpdb> 12 atoms in block 97 Block first atom: 1512 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1524 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1540 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1559 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1581 Blocpdb> 16 atoms in block 102 Block first atom: 1597 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1613 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1629 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 1646 Blocpdb> 12 atoms in block 106 Block first atom: 1667 Blocpdb> 17 atoms in block 107 Block first atom: 1679 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1696 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1711 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1727 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1747 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1763 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1779 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1794 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 1810 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 1821 Blocpdb> 13 atoms in block 117 Block first atom: 1835 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1848 Blocpdb> 13 atoms in block 119 Block first atom: 1864 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 1877 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1899 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 1915 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1932 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1947 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1963 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 1978 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1994 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 2010 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 2025 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 2040 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 2055 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2069 Blocpdb> 10 atoms in block 133 Block first atom: 2085 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2095 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2108 Blocpdb> 19 atoms in block 136 Block first atom: 2125 Blocpdb> 11 atoms in block 137 Block first atom: 2144 Blocpdb> 14 atoms in block 138 Block first atom: 2155 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2169 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 2185 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2206 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2222 Blocpdb> 13 atoms in block 143 Block first atom: 2239 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 2252 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2269 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2287 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2301 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2321 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 2337 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 2359 Blocpdb> 14 atoms in block 151 Block first atom: 2371 Blocpdb> 11 atoms in block 152 Block first atom: 2385 Blocpdb> 18 atoms in block 153 Block first atom: 2396 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 2414 Blocpdb> 16 atoms in block 155 Block first atom: 2433 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 2449 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 2469 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 2489 Blocpdb> 16 atoms in block 159 Block first atom: 2504 Blocpdb> 15 atoms in block 160 Block first atom: 2520 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2535 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2551 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 2564 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2588 Blocpdb> 11 atoms in block 165 Block first atom: 2603 Blocpdb> 13 atoms in block 166 Block first atom: 2614 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2627 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2640 Blocpdb> 21 atoms in block 169 Block first atom: 2656 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2677 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2692 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2708 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2724 Blocpdb> 22 atoms in block 174 Block first atom: 2738 Blocpdb> 25 atoms in block 175 Block first atom: 2760 Blocpdb> 20 atoms in block 176 Block first atom: 2785 Blocpdb> 11 atoms in block 177 Block first atom: 2805 Blocpdb> 13 atoms in block 178 Block first atom: 2816 Blocpdb> 12 atoms in block 179 Block first atom: 2829 Blocpdb> 15 atoms in block 180 Block first atom: 2841 Blocpdb> 20 atoms in block 181 Block first atom: 2856 Blocpdb> 10 atoms in block 182 Block first atom: 2876 Blocpdb> 15 atoms in block 183 Block first atom: 2886 Blocpdb> 14 atoms in block 184 Block first atom: 2901 Blocpdb> 19 atoms in block 185 Block first atom: 2915 Blocpdb> 14 atoms in block 186 Block first atom: 2934 Blocpdb> 18 atoms in block 187 Block first atom: 2948 Blocpdb> 16 atoms in block 188 Block first atom: 2966 Blocpdb> 17 atoms in block 189 Block first atom: 2982 Blocpdb> 16 atoms in block 190 Block first atom: 2999 Blocpdb> 16 atoms in block 191 Block first atom: 3015 Blocpdb> 20 atoms in block 192 Block first atom: 3031 Blocpdb> 16 atoms in block 193 Block first atom: 3051 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 3067 Blocpdb> 14 atoms in block 195 Block first atom: 3089 Blocpdb> 18 atoms in block 196 Block first atom: 3103 Blocpdb> 17 atoms in block 197 Block first atom: 3121 Blocpdb> 10 atoms in block 198 Block first atom: 3138 Blocpdb> 23 atoms in block 199 Block first atom: 3147 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1268361 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9510 Prepmat> Matrix trace = 2776460.0000 Prepmat> Last element read: 9510 9510 419.0498 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 17575 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3170 RTB> Total mass = 3170.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3170 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 296456.7805 RTB> 80715 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80715 Diagstd> Projected matrix trace = 296456.7805 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 296456.7805 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.7296860 3.2169174 4.8052903 7.4674901 8.5470632 9.0664443 9.7163450 10.2025834 10.5457095 12.2335743 13.8814829 14.8858550 15.9990303 16.4545880 17.1163257 17.8622261 18.2725959 19.4968511 20.3656589 21.1852086 22.1576619 22.4353862 22.8370430 23.3409099 23.7854565 25.2492207 26.2276773 26.7860093 27.0606204 27.8464722 28.8536016 29.0688883 30.1153962 30.5740392 30.9179660 31.5460724 32.6382769 32.7477371 33.3356131 33.7140981 33.9603929 34.9209434 35.7057449 36.1010205 36.4350293 36.9119819 37.6646983 38.2894296 39.1075439 39.6869449 40.0875027 40.6106066 41.0037959 41.8712074 42.5102918 43.0691094 43.4451122 44.4478840 44.6093603 44.8525107 46.1861990 46.6108702 47.3561627 48.1391610 48.5264153 48.8546828 49.7851461 50.2355831 51.0185869 51.4098759 52.5186311 52.8280715 53.4266387 54.3607323 54.9163703 55.0948737 55.6884354 56.2763819 56.8565862 57.6758282 57.8171506 58.3698547 59.3001832 59.6550214 59.9921448 60.7565751 60.9705596 61.7578078 62.0744965 63.1211850 63.2438603 63.9217767 65.1150895 65.6137040 65.9519113 66.6181718 67.6798889 68.5132328 68.8685588 69.1823699 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034318 0.0034319 0.0034327 0.0034332 0.0034369 179.4120576 194.7669372 238.0428238 296.7444522 317.4707648 326.9744207 338.4907014 346.8569153 352.6413063 379.8148682 404.5881987 418.9692719 434.3522846 440.4927727 449.2628952 458.9475667 464.1895995 479.4877511 490.0546484 499.8177245 511.1604528 514.3539210 518.9376909 524.6312688 529.6037187 545.6564200 556.1285562 562.0167869 564.8903490 573.0339754 583.3044577 585.4765324 595.9222089 600.4428659 603.8106068 609.9130531 620.3815757 621.4210031 626.9739605 630.5231743 632.8220933 641.7091981 648.8799119 652.4616939 655.4730526 659.7493370 666.4422578 671.9465502 679.0872104 684.0992499 687.5428677 692.0142199 695.3561688 702.6726060 708.0147792 712.6531778 715.7572275 723.9704255 725.2843028 727.2582546 737.9915542 741.3766197 747.2802977 753.4328277 756.4572433 759.0115404 766.2053378 769.6637000 775.6387416 778.6074558 786.9587693 789.2737492 793.7325781 800.6411907 804.7225893 806.0293875 810.3596130 814.6261821 818.8147744 824.6927944 825.7025439 829.6398158 836.2252901 838.7234451 841.0900097 846.4317050 847.9209596 853.3775550 855.5627804 862.7457962 863.5837579 868.1998353 876.2662829 879.6148601 881.8789439 886.3222163 893.3571110 898.8402467 901.1680331 903.2188606 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3170 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9879E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.730 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.066 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.18 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 57060 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610160951531510387.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610160951531510387.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610160951531510387.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610160951531510387.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 397 First residue number = 52 Last residue number = 2 Number of atoms found = 3170 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9879E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.730 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.066 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.18 Bfactors> 106 vectors, 9510 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.730000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.627 for 399 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.02 Bfactors> = 29.537 +/- 6.92 Bfactors> Shiftng-fct= 29.519 Bfactors> Scaling-fct= 446.542 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610160951531510387.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610160951531510387.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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Chkmod> That is: 3170 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8608 0.0034 0.8637 0.0034 0.8638 0.0034 0.8010 0.0034 0.8080 0.0034 0.7181 179.4147 0.6955 194.7611 0.6293 238.0254 0.6258 296.7220 0.3458 317.4560 0.3987 326.9524 0.0908 338.4702 0.4199 346.7981 0.7031 352.6979 0.5093 379.7431 0.4476 404.5492 0.2040 419.0096 0.0909 434.3468 0.2950 440.4125 0.4503 449.2918 0.4034 458.8993 0.3388 464.1367 0.3980 479.5059 0.2627 490.0858 0.3885 499.8528 0.3424 511.1655 0.4666 514.3847 0.2668 518.9490 0.3700 524.5985 0.2703 529.6316 0.4275 545.6414 0.3673 556.1293 0.4288 562.0345 0.3056 564.8596 0.3409 573.0457 0.3630 583.2430 0.4814 585.4626 0.5039 595.9422 0.4528 600.3774 0.3805 603.8045 0.3168 609.9248 0.4873 620.3713 0.4123 621.4158 0.2969 626.9883 0.4356 630.4578 0.4444 632.7913 0.3023 641.6730 0.4083 648.8907 0.2836 652.4245 0.5162 655.4896 0.5104 659.7033 0.2351 666.3721 0.4130 671.9227 0.4071 679.0794 0.3136 684.0962 0.3052 687.5348 0.3159 691.9793 0.3715 695.2941 0.4805 702.6323 0.3556 707.9820 0.4076 712.6300 0.3670 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DQ=-80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom making animated gifs 11 models are in 2610160951531510387.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951531510387 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom making animated gifs 11 models are in 2610160951531510387.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951531510387 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom making animated gifs 11 models are in 2610160951531510387.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610160951531510387.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610160951531510387 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610160951531510387.eigenfacs 2610160951531510387.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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