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***  3hmu  ***

LOGs for ID: 2610161436481574127

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610161436481574127.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610161436481574127.atom to be opened. Openam> File opened: 2610161436481574127.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 924 First residue number = 4 Last residue number = 463 Number of atoms found = 7104 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 19.159083 +/- 14.504843 From: -13.622000 To: 55.900000 = 26.130907 +/- 13.730296 From: -6.900000 To: 54.636000 = 30.315950 +/- 18.947896 From: -22.500000 To: 74.256000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2927 % Filled. Pdbmat> 2935814 non-zero elements. Pdbmat> 321520 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 90.52 +/- 21.38 Maximum number = 135 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 6.430400E+06 Pdbmat> Larger element = 500.330 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 924 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610161436481574127.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610161436481574127.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610161436481574127.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7104 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 924 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 36 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 35 atoms in block 3 Block first atom: 73 Blocpdb> 43 atoms in block 4 Block first atom: 108 Blocpdb> 37 atoms in block 5 Block first atom: 151 Blocpdb> 34 atoms in block 6 Block first atom: 188 Blocpdb> 38 atoms in block 7 Block first atom: 222 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 260 Blocpdb> 41 atoms in block 9 Block first atom: 302 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 343 Blocpdb> 38 atoms in block 11 Block first atom: 379 Blocpdb> 39 atoms in block 12 Block first atom: 417 Blocpdb> 33 atoms in block 13 Block first atom: 456 Blocpdb> 44 atoms in block 14 Block first atom: 489 Blocpdb> 34 atoms in block 15 Block first atom: 533 Blocpdb> 44 atoms in block 16 Block first atom: 567 Blocpdb> 48 atoms in block 17 Block first atom: 611 Blocpdb> 46 atoms in block 18 Block first atom: 659 Blocpdb> 38 atoms in block 19 Block first atom: 705 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 743 Blocpdb> 40 atoms in block 21 Block first atom: 774 Blocpdb> 32 atoms in block 22 Block first atom: 814 Blocpdb> 44 atoms in block 23 Block first atom: 846 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 890 Blocpdb> 36 atoms in block 25 Block first atom: 918 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 954 Blocpdb> 51 atoms in block 27 Block first atom: 996 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 1047 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 1086 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1125 Blocpdb> 39 atoms in block 31 Block first atom: 1167 Blocpdb> 31 atoms in block 32 Block first atom: 1206 Blocpdb> 27 atoms in block 33 Block first atom: 1237 Blocpdb> 35 atoms in block 34 Block first atom: 1264 Blocpdb> 32 atoms in block 35 Block first atom: 1299 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1331 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1371 Blocpdb> 50 atoms in block 38 Block first atom: 1413 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1463 Blocpdb> 40 atoms in block 40 Block first atom: 1495 Blocpdb> 40 atoms in block 41 Block first atom: 1535 Blocpdb> 40 atoms in block 42 Block first atom: 1575 Blocpdb> 37 atoms in block 43 Block first atom: 1615 Blocpdb> 40 atoms in block 44 Block first atom: 1652 Blocpdb> 38 atoms in block 45 Block first atom: 1692 Blocpdb> 32 atoms in block 46 Block first atom: 1730 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1762 Blocpdb> 38 atoms in block 48 Block first atom: 1792 Blocpdb> 47 atoms in block 49 Block first atom: 1830 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 1877 Blocpdb> 44 atoms in block 51 Block first atom: 1919 Blocpdb> 37 atoms in block 52 Block first atom: 1963 Blocpdb> 33 atoms in block 53 Block first atom: 2000 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2033 Blocpdb> 38 atoms in block 55 Block first atom: 2077 Blocpdb> 38 atoms in block 56 Block first atom: 2115 Blocpdb> 41 atoms in block 57 Block first atom: 2153 Blocpdb> 32 atoms in block 58 Block first atom: 2194 Blocpdb> 34 atoms in block 59 Block first atom: 2226 Blocpdb> 30 atoms in block 60 Block first atom: 2260 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 2290 Blocpdb> 34 atoms in block 62 Block first atom: 2327 Blocpdb> 45 atoms in block 63 Block first atom: 2361 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2406 Blocpdb> 34 atoms in block 65 Block first atom: 2451 Blocpdb> 27 atoms in block 66 Block first atom: 2485 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 2512 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 2556 Blocpdb> 42 atoms in block 69 Block first atom: 2599 Blocpdb> 38 atoms in block 70 Block first atom: 2641 Blocpdb> 41 atoms in block 71 Block first atom: 2679 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 2720 Blocpdb> 40 atoms in block 73 Block first atom: 2766 Blocpdb> 33 atoms in block 74 Block first atom: 2806 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2839 Blocpdb> 32 atoms in block 76 Block first atom: 2875 Blocpdb> 39 atoms in block 77 Block first atom: 2907 Blocpdb> 36 atoms in block 78 Block first atom: 2946 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2982 Blocpdb> 35 atoms in block 80 Block first atom: 3020 Blocpdb> 45 atoms in block 81 Block first atom: 3055 Blocpdb> 38 atoms in block 82 Block first atom: 3100 Blocpdb> 45 atoms in block 83 Block first atom: 3138 Blocpdb> 38 atoms in block 84 Block first atom: 3183 Blocpdb> 36 atoms in block 85 Block first atom: 3221 Blocpdb> 37 atoms in block 86 Block first atom: 3257 Blocpdb> 39 atoms in block 87 Block first atom: 3294 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 3333 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 3378 Blocpdb> 37 atoms in block 90 Block first atom: 3420 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 3457 Blocpdb> 40 atoms in block 92 Block first atom: 3496 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 3536 Blocpdb> 36 atoms in block 94 Block first atom: 3570 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 3606 Blocpdb> 35 atoms in block 96 Block first atom: 3642 Blocpdb> 43 atoms in block 97 Block first atom: 3677 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3720 Blocpdb> 34 atoms in block 99 Block first atom: 3757 Blocpdb> 38 atoms in block 100 Block first atom: 3791 Blocpdb> 42 atoms in block 101 Block first atom: 3829 Blocpdb> 41 atoms in block 102 Block first atom: 3871 Blocpdb> 36 atoms in block 103 Block first atom: 3912 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 3948 Blocpdb> 39 atoms in block 105 Block first atom: 3986 Blocpdb> 33 atoms in block 106 Block first atom: 4025 Blocpdb> 44 atoms in block 107 Block first atom: 4058 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 4102 Blocpdb> 44 atoms in block 109 Block first atom: 4136 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4180 Blocpdb> 46 atoms in block 111 Block first atom: 4228 Blocpdb> 38 atoms in block 112 Block first atom: 4274 Blocpdb> 31 atoms in block 113 Block first atom: 4312 Blocpdb> 40 atoms in block 114 Block first atom: 4343 Blocpdb> 32 atoms in block 115 Block first atom: 4383 Blocpdb> 44 atoms in block 116 Block first atom: 4415 Blocpdb> 28 atoms in block 117 Block first atom: 4459 Blocpdb> 36 atoms in block 118 Block first atom: 4487 Blocpdb> 42 atoms in block 119 Block first atom: 4523 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 4565 Blocpdb> 39 atoms in block 121 Block first atom: 4616 Blocpdb> 39 atoms in block 122 Block first atom: 4655 Blocpdb> 42 atoms in block 123 Block first atom: 4694 Blocpdb> 39 atoms in block 124 Block first atom: 4736 Blocpdb> 31 atoms in block 125 Block first atom: 4775 Blocpdb> 27 atoms in block 126 Block first atom: 4806 Blocpdb> 35 atoms in block 127 Block first atom: 4833 Blocpdb> 32 atoms in block 128 Block first atom: 4868 Blocpdb> 40 atoms in block 129 Block first atom: 4900 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 4940 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 4982 Blocpdb> 32 atoms in block 132 Block first atom: 5032 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 5064 Blocpdb> 40 atoms in block 134 Block first atom: 5104 Blocpdb> 40 atoms in block 135 Block first atom: 5144 Blocpdb> 37 atoms in block 136 Block first atom: 5184 Blocpdb> 40 atoms in block 137 Block first atom: 5221 Blocpdb> 38 atoms in block 138 Block first atom: 5261 Blocpdb> 32 atoms in block 139 Block first atom: 5299 Blocpdb> 30 atoms in block 140 Block first atom: 5331 Blocpdb> 38 atoms in block 141 Block first atom: 5361 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 5399 Blocpdb> 42 atoms in block 143 Block first atom: 5446 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 5488 Blocpdb> 37 atoms in block 145 Block first atom: 5532 Blocpdb> 33 atoms in block 146 Block first atom: 5569 Blocpdb> 44 atoms in block 147 Block first atom: 5602 Blocpdb> 38 atoms in block 148 Block first atom: 5646 Blocpdb> 38 atoms in block 149 Block first atom: 5684 Blocpdb> 41 atoms in block 150 Block first atom: 5722 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 5763 Blocpdb> 34 atoms in block 152 Block first atom: 5795 Blocpdb> 30 atoms in block 153 Block first atom: 5829 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 5859 Blocpdb> 34 atoms in block 155 Block first atom: 5896 Blocpdb> 45 atoms in block 156 Block first atom: 5930 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 5975 Blocpdb> 34 atoms in block 158 Block first atom: 6020 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 6054 Blocpdb> 44 atoms in block 160 Block first atom: 6081 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 6125 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 6168 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 6210 Blocpdb> 41 atoms in block 164 Block first atom: 6248 Blocpdb> 46 atoms in block 165 Block first atom: 6289 Blocpdb> 40 atoms in block 166 Block first atom: 6335 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 6375 Blocpdb> 36 atoms in block 168 Block first atom: 6408 Blocpdb> 32 atoms in block 169 Block first atom: 6444 Blocpdb> 39 atoms in block 170 Block first atom: 6476 Blocpdb> 36 atoms in block 171 Block first atom: 6515 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 6551 Blocpdb> 35 atoms in block 173 Block first atom: 6589 Blocpdb> 45 atoms in block 174 Block first atom: 6624 Blocpdb> 38 atoms in block 175 Block first atom: 6669 Blocpdb> 45 atoms in block 176 Block first atom: 6707 Blocpdb> 38 atoms in block 177 Block first atom: 6752 Blocpdb> 36 atoms in block 178 Block first atom: 6790 Blocpdb> 37 atoms in block 179 Block first atom: 6826 Blocpdb> 39 atoms in block 180 Block first atom: 6863 Blocpdb> 45 atoms in block 181 Block first atom: 6902 Blocpdb> 42 atoms in block 182 Block first atom: 6947 Blocpdb> 37 atoms in block 183 Block first atom: 6989 Blocpdb> 39 atoms in block 184 Block first atom: 7026 Blocpdb> 40 atoms in block 185 Block first atom: 7064 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 27 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2935999 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21312 Prepmat> Matrix trace = 6430400.0000 Prepmat> Last element read: 21312 21312 158.9765 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15265 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7104 RTB> Total mass = 7104.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7104 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 247254.6929 RTB> 67065 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67065 Diagstd> Projected matrix trace = 247254.6929 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 247254.6929 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.8090947 2.2312407 3.1010843 4.1767152 5.2297445 6.7205355 6.7891044 8.0782113 8.5407194 9.4881072 9.8282510 10.1757670 10.4995562 11.2382215 12.2142748 12.6492761 13.5687563 14.5732158 14.9284743 15.5449345 16.3293644 16.9316818 17.5209960 17.9614488 19.4067507 19.6277590 20.7416934 21.4688859 21.8022330 22.7663484 22.9096306 23.6030213 24.0799032 24.7599016 25.9501029 26.4327097 27.6210268 28.2006187 28.9922136 29.5537004 29.6097027 30.5539423 31.6796549 32.2892530 32.7035167 34.1106324 34.4926584 34.9157052 35.2435979 36.0745341 36.3747855 37.2547708 37.6413048 38.0914174 39.0251166 39.6360781 39.9461122 40.9491043 41.0805179 42.0808110 42.9730518 43.3489965 44.5560274 45.2702060 45.5434002 45.9456315 46.2471661 47.1061926 47.5425547 48.1929374 48.4719962 48.9085989 49.4989382 50.1806318 50.6743435 51.2074106 51.8743124 52.0272120 52.7027051 53.3508424 54.1078251 54.5555562 54.7989692 55.3622783 55.6033146 56.5178339 56.9437599 57.2011463 58.0034582 58.3082387 58.5789128 59.1083348 59.1970388 60.2903004 60.8334080 61.2162743 62.1630705 62.2804477 62.8550804 62.9070566 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034323 0.0034337 0.0034341 0.0034348 0.0034364 146.0581966 162.2065887 191.2282567 221.9283139 248.3336173 281.5121989 282.9446737 308.6404791 317.3529262 334.4914886 340.4343694 346.4007765 351.8687928 364.0357821 379.5151562 386.2140917 400.0048911 414.5462386 419.5686139 428.1438685 438.8134398 446.8330924 454.5426876 460.2205026 478.3785455 481.0947738 494.5581752 503.1529620 507.0441403 518.1338539 519.7617593 527.5687704 532.8716912 540.3432583 553.1779013 558.2980661 570.7096155 576.6663347 584.7038698 590.3386441 590.8977053 600.2454927 611.2030338 617.0555728 621.0012990 634.2203392 637.7619629 641.6610671 644.6669403 652.2223036 654.9309293 662.8056902 666.2352623 670.2068266 678.3711735 683.6607044 686.3292992 694.8922747 696.0064038 704.4291687 711.8580142 714.9650371 724.8506147 730.6367547 732.8380422 736.0670764 738.4784784 745.3054243 748.7494864 753.8535409 756.0329663 759.4302482 763.9997591 769.2426277 773.0175354 777.0727654 782.1165156 783.2683120 788.3366795 793.1693452 798.7765729 802.0746201 803.8619548 807.9830637 809.7400515 816.3718758 819.4422459 821.2921019 827.0318285 829.2018108 831.1242115 834.8715133 835.4977245 843.1774905 846.9667359 849.6278259 856.1729630 856.9809011 860.9253052 861.2811909 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7104 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.809 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.231 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.177 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.230 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.488 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.91 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 127872 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610161436481574127.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610161436481574127.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610161436481574127.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610161436481574127.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 924 First residue number = 4 Last residue number = 463 Number of atoms found = 7104 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.809 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.231 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.177 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.91 Bfactors> 106 vectors, 21312 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.809000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.686 for 924 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.011 +/- 0.01 Bfactors> = 11.804 +/- 4.44 Bfactors> Shiftng-fct= 11.792 Bfactors> Scaling-fct= 344.581 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610161436481574127.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610161436481574127.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9 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Chkmod> That is: 7104 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161436481574127 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom making animated gifs 11 models are in 2610161436481574127.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161436481574127.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161436481574127.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161436481574127 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161436481574127.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161436481574127 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161436481574127.eigenfacs 2610161436481574127.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161436481574127.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161436481574127.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610161436481574127.10.pdb 2610161436481574127.11.pdb 2610161436481574127.7.pdb 2610161436481574127.8.pdb 2610161436481574127.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m43.295s user 0m43.045s sys 0m0.234s rm: cannot remove '2610161436481574127.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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