CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  MEMBRANE PROTEIN 17-DEC-06 2OAU  ***

LOGs for ID: 2610161437531575363

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610161437531575363.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610161437531575363.atom to be opened. Openam> File opened: 2610161437531575363.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1778 First residue number = 27 Last residue number = 280 Number of atoms found = 13573 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -70.314756 +/- 23.771118 From: -121.738000 To: -15.396000 = 20.430302 +/- 22.523288 From: -31.376000 To: 70.772000 = 62.807837 +/- 23.268197 From: 8.942000 To: 114.067000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6019 % Filled. Pdbmat> 4989794 non-zero elements. Pdbmat> 545464 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.37 +/- 19.42 Maximum number = 126 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 1.090928E+07 Pdbmat> Larger element = 505.845 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1778 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610161437531575363.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610161437531575363.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610161437531575363.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13573 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1778 residues. Blocpdb> 65 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 64 atoms in block 2 Block first atom: 66 Blocpdb> 66 atoms in block 3 Block first atom: 130 Blocpdb> 77 atoms in block 4 Block first atom: 196 Blocpdb> 62 atoms in block 5 Block first atom: 273 Blocpdb> 74 atoms in block 6 Block first atom: 335 Blocpdb> 63 atoms in block 7 Block first atom: 409 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 472 Blocpdb> 53 atoms in block 9 Block first atom: 530 Blocpdb> 58 atoms in block 10 Block first atom: 583 Blocpdb> 60 atoms in block 11 Block first atom: 641 Blocpdb> 77 atoms in block 12 Block first atom: 701 Blocpdb> 59 atoms in block 13 Block first atom: 778 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 837 Blocpdb> 66 atoms in block 15 Block first atom: 906 Blocpdb> 67 atoms in block 16 Block first atom: 972 Blocpdb> 66 atoms in block 17 Block first atom: 1039 Blocpdb> 84 atoms in block 18 Block first atom: 1105 Blocpdb> 66 atoms in block 19 Block first atom: 1189 Blocpdb> 73 atoms in block 20 Block first atom: 1255 Blocpdb> 75 atoms in block 21 Block first atom: 1328 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1403 Blocpdb> 62 atoms in block 23 Block first atom: 1481 Blocpdb> 79 atoms in block 24 Block first atom: 1543 Blocpdb> 76 atoms in block 25 Block first atom: 1622 Blocpdb> 80 atoms in block 26 Block first atom: 1698 Blocpdb> 65 atoms in block 27 Block first atom: 1778 Blocpdb> 79 atoms in block 28 Block first atom: 1843 Blocpdb> 18 atoms in block 29 Block first atom: 1922 Blocpdb> 65 atoms in block 30 Block first atom: 1940 Blocpdb> 64 atoms in block 31 Block first atom: 2005 Blocpdb> 66 atoms in block 32 Block first atom: 2069 Blocpdb> 77 atoms in block 33 Block first atom: 2135 Blocpdb> 62 atoms in block 34 Block first atom: 2212 Blocpdb> 74 atoms in block 35 Block first atom: 2274 Blocpdb> 63 atoms in block 36 Block first atom: 2348 Blocpdb> 58 atoms in block 37 Block first atom: 2411 Blocpdb> 53 atoms in block 38 Block first atom: 2469 Blocpdb> 58 atoms in block 39 Block first atom: 2522 Blocpdb> 60 atoms in block 40 Block first atom: 2580 Blocpdb> 77 atoms in block 41 Block first atom: 2640 Blocpdb> 59 atoms in block 42 Block first atom: 2717 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 2776 Blocpdb> 66 atoms in block 44 Block first atom: 2845 Blocpdb> 67 atoms in block 45 Block first atom: 2911 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 2978 Blocpdb> 84 atoms in block 47 Block first atom: 3044 Blocpdb> 66 atoms in block 48 Block first atom: 3128 Blocpdb> 73 atoms in block 49 Block first atom: 3194 Blocpdb> 75 atoms in block 50 Block first atom: 3267 Blocpdb> 78 atoms in block 51 Block first atom: 3342 Blocpdb> 62 atoms in block 52 Block first atom: 3420 Blocpdb> 79 atoms in block 53 Block first atom: 3482 Blocpdb> 76 atoms in block 54 Block first atom: 3561 Blocpdb> 80 atoms in block 55 Block first atom: 3637 Blocpdb> 65 atoms in block 56 Block first atom: 3717 Blocpdb> 79 atoms in block 57 Block first atom: 3782 Blocpdb> 18 atoms in block 58 Block first atom: 3861 Blocpdb> 65 atoms in block 59 Block first atom: 3879 Blocpdb> 64 atoms in block 60 Block first atom: 3944 Blocpdb> 66 atoms in block 61 Block first atom: 4008 Blocpdb> 77 atoms in block 62 Block first atom: 4074 Blocpdb> 62 atoms in block 63 Block first atom: 4151 Blocpdb> 74 atoms in block 64 Block first atom: 4213 Blocpdb> 63 atoms in block 65 Block first atom: 4287 Blocpdb> 58 atoms in block 66 Block first atom: 4350 Blocpdb> 53 atoms in block 67 Block first atom: 4408 Blocpdb> 58 atoms in block 68 Block first atom: 4461 Blocpdb> 60 atoms in block 69 Block first atom: 4519 Blocpdb> 77 atoms in block 70 Block first atom: 4579 Blocpdb> 59 atoms in block 71 Block first atom: 4656 Blocpdb> 69 atoms in block 72 Block first atom: 4715 Blocpdb> 66 atoms in block 73 Block first atom: 4784 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 4850 Blocpdb> 66 atoms in block 75 Block first atom: 4917 Blocpdb> 84 atoms in block 76 Block first atom: 4983 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 5067 Blocpdb> 73 atoms in block 78 Block first atom: 5133 Blocpdb> 75 atoms in block 79 Block first atom: 5206 Blocpdb> 78 atoms in block 80 Block first atom: 5281 Blocpdb> 62 atoms in block 81 Block first atom: 5359 Blocpdb> 79 atoms in block 82 Block first atom: 5421 Blocpdb> 76 atoms in block 83 Block first atom: 5500 Blocpdb> 80 atoms in block 84 Block first atom: 5576 Blocpdb> 65 atoms in block 85 Block first atom: 5656 Blocpdb> 79 atoms in block 86 Block first atom: 5721 Blocpdb> 18 atoms in block 87 Block first atom: 5800 Blocpdb> 65 atoms in block 88 Block first atom: 5818 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 5883 Blocpdb> 66 atoms in block 90 Block first atom: 5947 Blocpdb> 77 atoms in block 91 Block first atom: 6013 Blocpdb> 62 atoms in block 92 Block first atom: 6090 Blocpdb> 74 atoms in block 93 Block first atom: 6152 Blocpdb> 63 atoms in block 94 Block first atom: 6226 Blocpdb> 58 atoms in block 95 Block first atom: 6289 Blocpdb> 53 atoms in block 96 Block first atom: 6347 Blocpdb> 58 atoms in block 97 Block first atom: 6400 Blocpdb> 60 atoms in block 98 Block first atom: 6458 Blocpdb> 77 atoms in block 99 Block first atom: 6518 Blocpdb> 59 atoms in block 100 Block first atom: 6595 Blocpdb> 69 atoms in block 101 Block first atom: 6654 Blocpdb> 66 atoms in block 102 Block first atom: 6723 Blocpdb> 67 atoms in block 103 Block first atom: 6789 Blocpdb> 66 atoms in block 104 Block first atom: 6856 Blocpdb> 84 atoms in block 105 Block first atom: 6922 Blocpdb> 66 atoms in block 106 Block first atom: 7006 Blocpdb> 73 atoms in block 107 Block first atom: 7072 Blocpdb> 75 atoms in block 108 Block first atom: 7145 Blocpdb> 78 atoms in block 109 Block first atom: 7220 Blocpdb> 62 atoms in block 110 Block first atom: 7298 Blocpdb> 79 atoms in block 111 Block first atom: 7360 Blocpdb> 76 atoms in block 112 Block first atom: 7439 Blocpdb> 80 atoms in block 113 Block first atom: 7515 Blocpdb> 65 atoms in block 114 Block first atom: 7595 Blocpdb> 79 atoms in block 115 Block first atom: 7660 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 7739 Blocpdb> 65 atoms in block 117 Block first atom: 7757 Blocpdb> 64 atoms in block 118 Block first atom: 7822 Blocpdb> 66 atoms in block 119 Block first atom: 7886 Blocpdb> 77 atoms in block 120 Block first atom: 7952 Blocpdb> 62 atoms in block 121 Block first atom: 8029 Blocpdb> 74 atoms in block 122 Block first atom: 8091 Blocpdb> 63 atoms in block 123 Block first atom: 8165 Blocpdb> 58 atoms in block 124 Block first atom: 8228 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 8286 Blocpdb> 58 atoms in block 126 Block first atom: 8339 Blocpdb> 60 atoms in block 127 Block first atom: 8397 Blocpdb> 77 atoms in block 128 Block first atom: 8457 Blocpdb> 59 atoms in block 129 Block first atom: 8534 Blocpdb> 69 atoms in block 130 Block first atom: 8593 Blocpdb> 66 atoms in block 131 Block first atom: 8662 Blocpdb> 67 atoms in block 132 Block first atom: 8728 Blocpdb> 66 atoms in block 133 Block first atom: 8795 Blocpdb> 84 atoms in block 134 Block first atom: 8861 Blocpdb> 66 atoms in block 135 Block first atom: 8945 Blocpdb> 73 atoms in block 136 Block first atom: 9011 Blocpdb> 75 atoms in block 137 Block first atom: 9084 Blocpdb> 78 atoms in block 138 Block first atom: 9159 Blocpdb> 62 atoms in block 139 Block first atom: 9237 Blocpdb> 79 atoms in block 140 Block first atom: 9299 Blocpdb> 76 atoms in block 141 Block first atom: 9378 Blocpdb> 80 atoms in block 142 Block first atom: 9454 Blocpdb> 65 atoms in block 143 Block first atom: 9534 Blocpdb> 79 atoms in block 144 Block first atom: 9599 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 9678 Blocpdb> 65 atoms in block 146 Block first atom: 9696 Blocpdb> 64 atoms in block 147 Block first atom: 9761 Blocpdb> 66 atoms in block 148 Block first atom: 9825 Blocpdb> 77 atoms in block 149 Block first atom: 9891 Blocpdb> 62 atoms in block 150 Block first atom: 9968 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 10030 Blocpdb> 63 atoms in block 152 Block first atom: 10104 Blocpdb> 58 atoms in block 153 Block first atom: 10167 Blocpdb> 53 atoms in block 154 Block first atom: 10225 Blocpdb> 58 atoms in block 155 Block first atom: 10278 Blocpdb> 60 atoms in block 156 Block first atom: 10336 Blocpdb> 77 atoms in block 157 Block first atom: 10396 Blocpdb> 59 atoms in block 158 Block first atom: 10473 Blocpdb> 69 atoms in block 159 Block first atom: 10532 Blocpdb> 66 atoms in block 160 Block first atom: 10601 Blocpdb> 67 atoms in block 161 Block first atom: 10667 Blocpdb> 66 atoms in block 162 Block first atom: 10734 Blocpdb> 84 atoms in block 163 Block first atom: 10800 Blocpdb> 66 atoms in block 164 Block first atom: 10884 Blocpdb> 73 atoms in block 165 Block first atom: 10950 Blocpdb> 75 atoms in block 166 Block first atom: 11023 Blocpdb> 78 atoms in block 167 Block first atom: 11098 Blocpdb> 62 atoms in block 168 Block first atom: 11176 Blocpdb> 79 atoms in block 169 Block first atom: 11238 Blocpdb> 76 atoms in block 170 Block first atom: 11317 Blocpdb> 80 atoms in block 171 Block first atom: 11393 Blocpdb> 65 atoms in block 172 Block first atom: 11473 Blocpdb> 79 atoms in block 173 Block first atom: 11538 Blocpdb> 18 atoms in block 174 Block first atom: 11617 Blocpdb> 65 atoms in block 175 Block first atom: 11635 Blocpdb> 64 atoms in block 176 Block first atom: 11700 Blocpdb> 66 atoms in block 177 Block first atom: 11764 Blocpdb> 77 atoms in block 178 Block first atom: 11830 Blocpdb> 62 atoms in block 179 Block first atom: 11907 Blocpdb> 74 atoms in block 180 Block first atom: 11969 Blocpdb> 63 atoms in block 181 Block first atom: 12043 Blocpdb> 58 atoms in block 182 Block first atom: 12106 Blocpdb> 53 atoms in block 183 Block first atom: 12164 Blocpdb> 58 atoms in block 184 Block first atom: 12217 Blocpdb> 60 atoms in block 185 Block first atom: 12275 Blocpdb> 77 atoms in block 186 Block first atom: 12335 Blocpdb> 59 atoms in block 187 Block first atom: 12412 Blocpdb> 69 atoms in block 188 Block first atom: 12471 Blocpdb> 66 atoms in block 189 Block first atom: 12540 Blocpdb> 67 atoms in block 190 Block first atom: 12606 Blocpdb> 66 atoms in block 191 Block first atom: 12673 Blocpdb> 84 atoms in block 192 Block first atom: 12739 Blocpdb> 66 atoms in block 193 Block first atom: 12823 Blocpdb> 73 atoms in block 194 Block first atom: 12889 Blocpdb> 75 atoms in block 195 Block first atom: 12962 Blocpdb> 78 atoms in block 196 Block first atom: 13037 Blocpdb> 62 atoms in block 197 Block first atom: 13115 Blocpdb> 79 atoms in block 198 Block first atom: 13177 Blocpdb> 76 atoms in block 199 Block first atom: 13256 Blocpdb> 80 atoms in block 200 Block first atom: 13332 Blocpdb> 65 atoms in block 201 Block first atom: 13412 Blocpdb> 79 atoms in block 202 Block first atom: 13477 Blocpdb> 18 atoms in block 203 Block first atom: 13555 Blocpdb> 203 blocks. Blocpdb> At most, 84 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4989997 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 40719 Prepmat> Matrix trace = 10909280.0000 Prepmat> Last element read: 40719 40719 64.7830 Prepmat> 20707 lines saved. Prepmat> 19317 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13573 RTB> Total mass = 13573.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13573 RTB> Number of blocks = 203 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 186132.1702 RTB> 46959 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1218 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46959 Diagstd> Projected matrix trace = 186132.1702 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1218 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 186132.1702 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2873152 0.3798601 0.3981287 0.5702248 0.7517988 0.8918823 0.9257909 1.2117528 1.5329678 1.6152755 1.7823319 1.8490522 1.9178477 2.0599861 2.1501980 2.4186748 2.5171532 2.6878984 3.0437318 3.1351398 3.1876006 3.5371526 3.6681070 3.9758345 4.1638378 4.2465746 4.5055654 4.7068266 4.7718019 4.9638982 5.1753227 5.3564220 5.4630943 5.6087308 5.7889698 5.8632671 5.9209972 6.0581750 6.2631868 6.4466929 6.7574612 7.0202019 7.4191257 7.5353814 7.8016482 7.9936956 8.0977340 8.4360126 8.5773695 8.6415857 8.7777331 9.0694237 9.4518465 9.5022744 10.0181184 10.1805479 10.4192063 10.6014091 10.7498756 10.9444203 11.1309637 11.4539742 11.5479681 11.6825512 12.0579676 12.2542314 12.4445090 12.6592656 12.7906603 12.8684402 13.0488216 13.2582244 13.5626048 13.7154414 14.0504620 14.2778072 14.5969031 14.9612259 15.0971948 15.2125025 15.7355184 16.0223323 16.0672407 16.5490091 16.5781982 16.8467706 17.0905838 17.5416594 17.6017558 17.7768157 18.1632264 18.3367664 18.5146615 18.7393508 18.7632352 19.2446670 19.5279852 19.9093258 20.1692925 20.4790464 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034335 0.0034338 0.0034342 0.0034342 0.0034349 58.2069100 66.9278834 68.5183695 82.0008460 94.1555845 102.5531600 104.4844659 119.5369835 134.4503067 138.0125492 144.9738177 147.6623804 150.3842436 155.8573984 159.2335255 168.8822560 172.2860446 178.0334899 189.4516834 192.2754045 193.8774207 204.2312428 207.9774631 216.5256903 221.5859295 223.7765932 230.4994695 235.5913704 237.2119068 241.9394629 247.0381346 251.3232521 253.8134471 257.1743071 261.2738374 262.9451227 264.2364387 267.2798297 271.7646491 275.7171447 282.2845196 287.7200190 295.7819338 298.0903386 303.3112105 307.0217089 309.0132024 315.4015988 318.0331134 319.2214016 321.7262269 327.0281418 333.8517146 334.7411191 343.7069874 346.4821423 350.5198354 353.5713579 356.0385296 359.2457690 362.2944354 367.5135708 369.0184394 371.1625306 377.0789914 380.1354028 383.0753121 386.3665641 388.3665015 389.5455389 392.2662346 395.4011821 399.9142085 402.1612065 407.0432736 410.3231661 414.8830028 420.0286069 421.9329186 423.5411495 430.7604359 434.6684786 435.2772105 441.7548011 442.1442124 445.7112657 448.9249356 454.8106419 455.5890490 457.8489953 462.7983247 465.0039659 467.2541510 470.0808404 470.3803181 476.3766666 479.8704412 484.5332186 487.6863633 491.4169643 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13573 Rtb_to_modes> Number of blocs = 203 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3799 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9258 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.615 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.537 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.020 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.452 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 244314 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610161437531575363.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610161437531575363.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610161437531575363.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610161437531575363.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1778 First residue number = 27 Last residue number = 280 Number of atoms found = 13573 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3799 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9258 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.615 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.020 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.452 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48 Bfactors> 106 vectors, 40719 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.287300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.621 for 1778 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.032 +/- 0.06 Bfactors> = 117.382 +/- 58.16 Bfactors> Shiftng-fct= 117.350 Bfactors> Scaling-fct= 940.796 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610161437531575363.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610161437531575363.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4 Chkmod> 106 vectors, 40719 coordinates in file. Chkmod> That is: 13573 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7780 0.0034 0.8066 0.0034 0.9001 0.0034 0.8522 0.0034 0.7638 0.0034 0.9394 58.2029 0.0765 66.9285 0.0841 68.5130 0.1131 81.9955 0.0737 94.1516 0.5339 102.5498 0.3411 104.4805 0.6281 119.5440 0.1538 134.4459 0.1446 137.9949 0.2397 144.9541 0.2464 147.6540 0.3577 150.3838 0.2546 155.8512 0.3272 159.2194 0.2571 168.8864 0.5617 172.2734 0.2167 178.0292 0.5278 189.4519 0.6397 192.2629 0.5954 193.8812 0.3162 204.2181 0.3900 207.9655 0.5534 216.5209 0.2729 221.5807 0.3981 223.7782 0.3403 230.5007 0.5003 235.5856 0.3675 237.2066 0.7092 241.9316 0.4998 247.0198 0.5817 251.3026 0.6423 253.8004 0.5090 257.1694 0.5734 261.2633 0.4104 262.9278 0.4058 264.2252 0.5634 267.2645 0.5670 271.7489 0.4542 275.7119 0.4817 282.2628 0.3434 287.7035 0.5938 295.7667 0.4236 298.0700 0.2646 303.3050 0.6396 307.0144 0.5812 309.0050 0.2553 315.3878 0.4724 318.0126 0.5347 319.2154 0.6054 321.7173 0.5938 327.0065 0.6098 333.8401 0.4404 334.7219 0.3016 343.7245 0.4261 346.4579 0.4868 350.5181 0.3004 353.5327 0.4707 356.0253 0.5839 359.1578 0.4671 362.2632 0.4241 367.4340 0.5933 369.0351 0.5510 371.1061 0.5425 377.0946 0.5820 380.0535 0.5836 382.9895 0.4133 386.3612 0.5201 388.3398 0.5885 389.5524 0.5447 392.2671 0.5365 395.4107 0.5306 399.8586 0.5451 402.2108 0.3742 407.0191 0.5970 410.3371 0.6040 414.9092 0.4435 419.9934 0.2637 421.9540 0.5374 423.4881 0.5713 430.8033 0.5623 434.6182 0.5826 435.2959 0.4217 441.7491 0.4821 442.1493 0.5060 445.7348 0.4801 448.8980 0.5737 454.7696 0.5205 455.5468 0.5346 457.8703 0.5069 462.7374 0.3342 465.0250 0.5588 467.1753 0.5109 470.0688 0.4567 470.3196 0.3805 476.2985 0.3674 479.8746 0.3098 484.5206 0.3022 487.6740 0.4762 491.4073 0.5577 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161437531575363 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom making animated gifs 11 models are in 2610161437531575363.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161437531575363 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom making animated gifs 11 models are in 2610161437531575363.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161437531575363 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom making animated gifs 11 models are in 2610161437531575363.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161437531575363 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom making animated gifs 11 models are in 2610161437531575363.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610161437531575363 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610161437531575363.eigenfacs 2610161437531575363.atom making animated gifs 11 models are in 2610161437531575363.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610161437531575363.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610161437531575363.10.pdb 2610161437531575363.11.pdb 2610161437531575363.7.pdb 2610161437531575363.8.pdb 2610161437531575363.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m10.065s user 2m9.395s sys 0m0.588s rm: cannot remove '2610161437531575363.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.