CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  lig_1.pdb  ***

LOGs for ID: 2610190714592175097

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610190714592175097.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610190714592175097.atom to be opened. Openam> File opened: 2610190714592175097.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1044 First residue number = 8 Last residue number = 387 Number of atoms found = 8187 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -15.362152 +/- 20.853711 From: -75.293000 To: 31.821000 = 32.774800 +/- 50.058119 From: -41.098000 To: 149.676000 = -4.088738 +/- 22.060665 From: -77.957000 To: 70.798000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9100 % Filled. Pdbmat> 2744763 non-zero elements. Pdbmat> 299559 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 73.18 +/- 23.81 Maximum number = 124 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.991180E+06 Pdbmat> Larger element = 475.253 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1044 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610190714592175097.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610190714592175097.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610190714592175097.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8187 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1044 residues. Blocpdb> 48 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 58 atoms in block 2 Block first atom: 49 Blocpdb> 45 atoms in block 3 Block first atom: 107 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 152 Blocpdb> 47 atoms in block 5 Block first atom: 200 Blocpdb> 39 atoms in block 6 Block first atom: 247 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 286 Blocpdb> 45 atoms in block 8 Block first atom: 328 Blocpdb> 45 atoms in block 9 Block first atom: 373 Blocpdb> 42 atoms in block 10 Block first atom: 418 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 460 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 507 Blocpdb> 51 atoms in block 13 Block first atom: 562 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 613 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 659 Blocpdb> 45 atoms in block 16 Block first atom: 706 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 751 Blocpdb> 47 atoms in block 18 Block first atom: 795 Blocpdb> 46 atoms in block 19 Block first atom: 842 Blocpdb> 43 atoms in block 20 Block first atom: 888 Blocpdb> 50 atoms in block 21 Block first atom: 931 Blocpdb> 52 atoms in block 22 Block first atom: 981 Blocpdb> 48 atoms in block 23 Block first atom: 1033 Blocpdb> 44 atoms in block 24 Block first atom: 1081 Blocpdb> 45 atoms in block 25 Block first atom: 1125 Blocpdb> 47 atoms in block 26 Block first atom: 1170 Blocpdb> 44 atoms in block 27 Block first atom: 1217 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1261 Blocpdb> 52 atoms in block 29 Block first atom: 1310 Blocpdb> 46 atoms in block 30 Block first atom: 1362 Blocpdb> 46 atoms in block 31 Block first atom: 1408 Blocpdb> 51 atoms in block 32 Block first atom: 1454 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1505 Blocpdb> 50 atoms in block 34 Block first atom: 1548 Blocpdb> 48 atoms in block 35 Block first atom: 1598 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1646 Blocpdb> 45 atoms in block 37 Block first atom: 1702 Blocpdb> 45 atoms in block 38 Block first atom: 1747 Blocpdb> 58 atoms in block 39 Block first atom: 1792 Blocpdb> 50 atoms in block 40 Block first atom: 1850 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 1900 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1950 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 1994 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2042 Blocpdb> 50 atoms in block 45 Block first atom: 2086 Blocpdb> 45 atoms in block 46 Block first atom: 2136 Blocpdb> 51 atoms in block 47 Block first atom: 2181 Blocpdb> 50 atoms in block 48 Block first atom: 2232 Blocpdb> 42 atoms in block 49 Block first atom: 2282 Blocpdb> 48 atoms in block 50 Block first atom: 2324 Blocpdb> 46 atoms in block 51 Block first atom: 2372 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2418 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2465 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2509 Blocpdb> 58 atoms in block 55 Block first atom: 2559 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 2617 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 2663 Blocpdb> 39 atoms in block 58 Block first atom: 2711 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2750 Blocpdb> 53 atoms in block 60 Block first atom: 2799 Blocpdb> 51 atoms in block 61 Block first atom: 2852 Blocpdb> 53 atoms in block 62 Block first atom: 2903 Blocpdb> 50 atoms in block 63 Block first atom: 2956 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 3006 Blocpdb> 49 atoms in block 65 Block first atom: 3048 Blocpdb> 48 atoms in block 66 Block first atom: 3097 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 3145 Blocpdb> 42 atoms in block 68 Block first atom: 3191 Blocpdb> 53 atoms in block 69 Block first atom: 3233 Blocpdb> 51 atoms in block 70 Block first atom: 3286 Blocpdb> 47 atoms in block 71 Block first atom: 3337 Blocpdb> 47 atoms in block 72 Block first atom: 3384 Blocpdb> 53 atoms in block 73 Block first atom: 3431 Blocpdb> 53 atoms in block 74 Block first atom: 3484 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 3537 Blocpdb> 44 atoms in block 76 Block first atom: 3581 Blocpdb> 45 atoms in block 77 Block first atom: 3625 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 3670 Blocpdb> 52 atoms in block 79 Block first atom: 3711 Blocpdb> 47 atoms in block 80 Block first atom: 3763 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3810 Blocpdb> 51 atoms in block 82 Block first atom: 3864 Blocpdb> 43 atoms in block 83 Block first atom: 3915 Blocpdb> 46 atoms in block 84 Block first atom: 3958 Blocpdb> 44 atoms in block 85 Block first atom: 4004 Blocpdb> 50 atoms in block 86 Block first atom: 4048 Blocpdb> 53 atoms in block 87 Block first atom: 4098 Blocpdb> 52 atoms in block 88 Block first atom: 4151 Blocpdb> 40 atoms in block 89 Block first atom: 4203 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 4243 Blocpdb> 51 atoms in block 91 Block first atom: 4290 Blocpdb> 46 atoms in block 92 Block first atom: 4341 Blocpdb> 44 atoms in block 93 Block first atom: 4387 Blocpdb> 52 atoms in block 94 Block first atom: 4431 Blocpdb> 43 atoms in block 95 Block first atom: 4483 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 4526 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4569 Blocpdb> 47 atoms in block 98 Block first atom: 4610 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 4657 Blocpdb> 44 atoms in block 100 Block first atom: 4703 Blocpdb> 54 atoms in block 101 Block first atom: 4747 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 4801 Blocpdb> 57 atoms in block 103 Block first atom: 4846 Blocpdb> 60 atoms in block 104 Block first atom: 4903 Blocpdb> 50 atoms in block 105 Block first atom: 4963 Blocpdb> 52 atoms in block 106 Block first atom: 5013 Blocpdb> 45 atoms in block 107 Block first atom: 5065 Blocpdb> 49 atoms in block 108 Block first atom: 5110 Blocpdb> 49 atoms in block 109 Block first atom: 5159 Blocpdb> 54 atoms in block 110 Block first atom: 5208 Blocpdb> 50 atoms in block 111 Block first atom: 5262 Blocpdb> 45 atoms in block 112 Block first atom: 5312 Blocpdb> 52 atoms in block 113 Block first atom: 5357 Blocpdb> 48 atoms in block 114 Block first atom: 5409 Blocpdb> 54 atoms in block 115 Block first atom: 5457 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5511 Blocpdb> 49 atoms in block 117 Block first atom: 5558 Blocpdb> 51 atoms in block 118 Block first atom: 5607 Blocpdb> 56 atoms in block 119 Block first atom: 5658 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 5714 Blocpdb> 57 atoms in block 121 Block first atom: 5766 Blocpdb> 52 atoms in block 122 Block first atom: 5823 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 5875 Blocpdb> 47 atoms in block 124 Block first atom: 5919 Blocpdb> 49 atoms in block 125 Block first atom: 5966 Blocpdb> 54 atoms in block 126 Block first atom: 6015 Blocpdb> 47 atoms in block 127 Block first atom: 6069 Blocpdb> 57 atoms in block 128 Block first atom: 6116 Blocpdb> 53 atoms in block 129 Block first atom: 6173 Blocpdb> 58 atoms in block 130 Block first atom: 6226 Blocpdb> 43 atoms in block 131 Block first atom: 6284 Blocpdb> 54 atoms in block 132 Block first atom: 6327 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 6381 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 6431 Blocpdb> 35 atoms in block 135 Block first atom: 6470 Blocpdb> 46 atoms in block 136 Block first atom: 6505 Blocpdb> 47 atoms in block 137 Block first atom: 6551 Blocpdb> 50 atoms in block 138 Block first atom: 6598 Blocpdb> 42 atoms in block 139 Block first atom: 6648 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 6690 Blocpdb> 52 atoms in block 141 Block first atom: 6729 Blocpdb> 51 atoms in block 142 Block first atom: 6781 Blocpdb> 37 atoms in block 143 Block first atom: 6832 Blocpdb> 37 atoms in block 144 Block first atom: 6869 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 6906 Blocpdb> 52 atoms in block 146 Block first atom: 6928 Blocpdb> 45 atoms in block 147 Block first atom: 6980 Blocpdb> 53 atoms in block 148 Block first atom: 7025 Blocpdb> 42 atoms in block 149 Block first atom: 7078 Blocpdb> 45 atoms in block 150 Block first atom: 7120 Blocpdb> 46 atoms in block 151 Block first atom: 7165 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 7211 Blocpdb> 40 atoms in block 153 Block first atom: 7254 Blocpdb> 46 atoms in block 154 Block first atom: 7294 Blocpdb> 46 atoms in block 155 Block first atom: 7340 Blocpdb> 46 atoms in block 156 Block first atom: 7386 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 7432 Blocpdb> 44 atoms in block 158 Block first atom: 7481 Blocpdb> 42 atoms in block 159 Block first atom: 7525 Blocpdb> 45 atoms in block 160 Block first atom: 7567 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 7612 Blocpdb> 38 atoms in block 162 Block first atom: 7645 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7683 Blocpdb> 49 atoms in block 164 Block first atom: 7725 Blocpdb> 34 atoms in block 165 Block first atom: 7774 Blocpdb> 41 atoms in block 166 Block first atom: 7808 Blocpdb> 38 atoms in block 167 Block first atom: 7849 Blocpdb> 34 atoms in block 168 Block first atom: 7887 Blocpdb> 43 atoms in block 169 Block first atom: 7921 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 7964 Blocpdb> 41 atoms in block 171 Block first atom: 8004 Blocpdb> 33 atoms in block 172 Block first atom: 8045 Blocpdb> 44 atoms in block 173 Block first atom: 8078 Blocpdb> 41 atoms in block 174 Block first atom: 8122 Blocpdb> 25 atoms in block 175 Block first atom: 8162 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 60 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 22 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2744938 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 24561 Prepmat> Matrix trace = 5991180.0000 Prepmat> Last element read: 24561 24561 26.7852 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 14273 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8187 RTB> Total mass = 8187.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8187 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 158959.0898 RTB> 37947 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 37947 Diagstd> Projected matrix trace = 158959.0898 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 158959.0898 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0010024 0.0019317 0.0071670 0.0094826 0.0106560 0.0182033 0.0194751 0.0345625 0.0405074 0.0476873 0.0632243 0.0772523 0.0904942 0.1311176 0.1540868 0.1919004 0.2212528 0.2414146 0.3180085 0.3946881 0.4259430 0.4652689 0.5625570 0.5899501 0.6678670 0.7175912 0.7459493 0.8959517 0.9613485 1.1123206 1.1875582 1.4738687 1.5385895 1.6121343 1.6575992 1.9108899 2.0002553 2.3590658 2.4275421 2.5372273 2.6253995 2.7881101 3.0490517 3.3138308 3.5324835 3.7328931 3.8310407 4.2676677 4.4624138 4.6051460 4.9239862 5.1081199 5.4101477 5.5312264 5.6972917 5.7688020 6.0820442 6.2797111 6.5542738 7.0446027 7.2779498 7.5310078 7.6370548 7.9192718 8.3284399 8.6118064 8.8460506 9.0011482 9.2781340 9.3569053 9.6062487 9.9088240 10.0913824 10.3170898 10.6396802 10.7389031 11.0542956 11.4814105 11.7776195 12.1482036 12.2056548 12.6551873 12.7723457 12.8559086 13.2395391 13.3704629 13.6932381 14.1389075 14.3175897 14.6692215 14.7451570 14.9262555 15.4428926 15.6906515 15.9848979 16.1083774 16.5982625 17.0534253 17.1328355 17.2521703 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034339 0.0034342 0.0034346 0.0034346 0.0034358 3.4380213 4.7727467 9.1931228 10.5744677 11.2096541 14.6511163 15.1542813 20.1881999 21.8555730 23.7135580 27.3046852 30.1822062 32.6667214 39.3211174 42.6263293 47.5700078 51.0786760 53.3552373 61.2371007 68.2216631 70.8713996 74.0708435 81.4476501 83.4070790 88.7442628 91.9885652 93.7885760 102.7868579 106.4720736 114.5276288 118.3375908 131.8331670 134.6966084 137.8782896 139.8089725 150.1112066 153.5811776 166.7881938 169.1915475 172.9716648 175.9515039 181.3218900 189.6171747 197.6789604 204.0964040 209.8060740 212.5463546 224.3316641 229.3930211 233.0327606 240.9648480 245.4289687 252.5805125 255.3912396 259.1967245 260.8183229 267.8058542 272.1229133 278.0081766 288.2196142 292.9542528 298.0038176 300.0946370 305.5891320 313.3842087 318.6709008 322.9758055 325.7948664 330.7696090 332.1707576 336.5675125 341.8269791 344.9614874 348.7979198 354.2089793 355.8567777 361.0445690 367.9534703 372.6696621 378.4872996 379.3812140 386.3043240 388.0883559 389.3558178 395.1224562 397.0713034 401.8355536 408.3224019 410.8944129 415.9094743 416.9845657 419.5374328 426.7363183 430.1458816 434.1604043 435.8340715 442.4116905 448.4366422 449.4795148 451.0421706 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8187 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0024E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9317E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1670E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4826E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0656E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8203E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9475E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4562E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0507E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7687E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3224E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7252E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0494E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3180 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.474 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.000 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.537 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.733 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00005 0.99997 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 147366 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00005 0.99997 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610190714592175097.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610190714592175097.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610190714592175097.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610190714592175097.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1044 First residue number = 8 Last residue number = 387 Number of atoms found = 8187 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0024E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1670E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4826E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0656E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8203E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9475E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4562E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0507E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7687E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3224E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7252E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0494E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3180 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.474 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.000 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.733 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Bfactors> 106 vectors, 24561 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001002 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 3.786 +/- 6.03 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -3.786 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610190714592175097.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610190714592175097.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Chkmod> 106 vectors, 24561 coordinates in file. Chkmod> That is: 8187 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 41 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8112 0.0034 0.9046 0.0034 0.6829 0.0034 0.9952 0.0034 0.6323 0.0034 0.8590 3.4379 0.3042 4.7725 0.5604 9.1927 0.2515 10.5740 0.2028 11.2092 0.3085 14.6504 0.0593 15.1536 0.4766 20.1872 0.0947 21.8545 0.4234 23.7125 0.1733 27.3035 0.1853 30.1809 0.0994 32.6653 0.3046 39.3168 0.3961 42.6263 0.4714 47.5679 0.0235 51.0819 0.1234 53.3513 0.4087 61.2337 0.6640 68.2198 0.2939 70.8648 0.2573 74.0701 0.2899 81.4473 0.4277 83.4070 0.1207 88.7426 0.3950 91.9852 0.1949 93.7814 0.1694 102.7852 0.2417 106.4648 0.3152 114.5062 0.2584 118.3545 0.3291 131.8334 0.3864 134.7088 0.2421 137.8666 0.3065 139.8199 0.0283 150.1091 0.3458 153.5648 0.5156 166.7787 0.3513 169.2002 0.2620 172.9565 0.2495 175.9306 0.0718 181.3105 0.2054 189.6074 0.2345 197.6755 0.4458 204.0737 0.3343 209.8001 0.1489 212.5361 0.2155 224.3308 0.3346 229.3725 0.2147 233.0191 0.1246 240.9548 0.1888 245.4156 0.4661 252.5662 0.4442 255.3751 0.3833 259.1790 0.1605 260.8116 0.2687 267.7934 0.1018 272.1175 0.5570 277.9904 0.4934 288.2154 0.1584 292.9427 0.2008 297.9909 0.2874 300.0807 0.2890 305.5708 0.4070 313.3625 0.3932 318.6608 0.4246 322.9610 0.4009 325.7782 0.4366 330.7530 0.1906 332.1582 0.2158 336.5487 0.1907 341.8153 0.2469 344.9231 0.2921 348.8321 0.3331 354.1991 0.1119 355.8597 0.2450 360.9589 0.1797 367.9151 0.1301 372.6913 0.2038 378.4990 0.2433 379.4324 0.2205 386.3612 0.0952 388.0361 0.2583 389.4011 0.2565 395.1124 0.1332 397.0474 0.2347 401.7708 0.1906 408.3206 0.3187 410.9114 0.3895 415.9027 0.0474 417.0351 0.0972 419.5720 0.1094 426.6780 0.3478 430.1185 0.3750 434.0753 0.3992 435.8373 0.3045 442.4159 0.3663 448.3724 0.2405 449.4230 0.2553 450.9944 0.1971 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610190714592175097 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom making animated gifs 11 models are in 2610190714592175097.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610190714592175097 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom making animated gifs 11 models are in 2610190714592175097.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610190714592175097 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom making animated gifs 11 models are in 2610190714592175097.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610190714592175097 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom making animated gifs 11 models are in 2610190714592175097.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610190714592175097 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610190714592175097.eigenfacs 2610190714592175097.atom making animated gifs 11 models are in 2610190714592175097.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610190714592175097.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610190714592175097.10.pdb 2610190714592175097.11.pdb 2610190714592175097.7.pdb 2610190714592175097.8.pdb 2610190714592175097.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m45.957s user 0m45.488s sys 0m0.441s rm: cannot remove '2610190714592175097.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.