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LOGs for ID: 2610201159422660167

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610201159422660167.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610201159422660167.atom to be opened. Openam> File opened: 2610201159422660167.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 938 First residue number = 1 Last residue number = 327 Number of atoms found = 7503 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 17.696445 +/- 20.226515 From: -32.229000 To: 60.307000 = 82.823659 +/- 28.178325 From: 19.409000 To: 133.996000 = 29.760933 +/- 22.103240 From: -16.993000 To: 77.742000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1414 % Filled. Pdbmat> 2891702 non-zero elements. Pdbmat> 316361 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.33 +/- 21.92 Maximum number = 130 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 6.327220E+06 Pdbmat> Larger element = 501.346 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 938 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610201159422660167.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610201159422660167.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610201159422660167.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7503 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 938 residues. Blocpdb> 39 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 37 atoms in block 2 Block first atom: 40 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 77 Blocpdb> 39 atoms in block 4 Block first atom: 114 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 153 Blocpdb> 41 atoms in block 6 Block first atom: 188 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 229 Blocpdb> 40 atoms in block 8 Block first atom: 271 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 311 Blocpdb> 32 atoms in block 10 Block first atom: 351 Blocpdb> 39 atoms in block 11 Block first atom: 383 Blocpdb> 40 atoms in block 12 Block first atom: 422 Blocpdb> 48 atoms in block 13 Block first atom: 462 Blocpdb> 32 atoms in block 14 Block first atom: 510 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 542 Blocpdb> 38 atoms in block 16 Block first atom: 575 Blocpdb> 35 atoms in block 17 Block first atom: 613 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 648 Blocpdb> 38 atoms in block 19 Block first atom: 698 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 736 Blocpdb> 38 atoms in block 21 Block first atom: 782 Blocpdb> 45 atoms in block 22 Block first atom: 820 Blocpdb> 39 atoms in block 23 Block first atom: 865 Blocpdb> 37 atoms in block 24 Block first atom: 904 Blocpdb> 36 atoms in block 25 Block first atom: 941 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 977 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 986 Blocpdb> 37 atoms in block 28 Block first atom: 1018 Blocpdb> 34 atoms in block 29 Block first atom: 1055 Blocpdb> 38 atoms in block 30 Block first atom: 1089 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1127 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1171 Blocpdb> 42 atoms in block 33 Block first atom: 1209 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1251 Blocpdb> 39 atoms in block 35 Block first atom: 1290 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1329 Blocpdb> 45 atoms in block 37 Block first atom: 1363 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1408 Blocpdb> 39 atoms in block 39 Block first atom: 1451 Blocpdb> 42 atoms in block 40 Block first atom: 1490 Blocpdb> 53 atoms in block 41 Block first atom: 1532 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1585 Blocpdb> 30 atoms in block 43 Block first atom: 1615 Blocpdb> 43 atoms in block 44 Block first atom: 1645 Blocpdb> 44 atoms in block 45 Block first atom: 1688 Blocpdb> 40 atoms in block 46 Block first atom: 1732 Blocpdb> 44 atoms in block 47 Block first atom: 1772 Blocpdb> 48 atoms in block 48 Block first atom: 1816 Blocpdb> 35 atoms in block 49 Block first atom: 1864 Blocpdb> 45 atoms in block 50 Block first atom: 1899 Blocpdb> 42 atoms in block 51 Block first atom: 1944 Blocpdb> 42 atoms in block 52 Block first atom: 1986 Blocpdb> 37 atoms in block 53 Block first atom: 2028 Blocpdb> 43 atoms in block 54 Block first atom: 2065 Blocpdb> 47 atoms in block 55 Block first atom: 2108 Blocpdb> 39 atoms in block 56 Block first atom: 2155 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2194 Blocpdb> 43 atoms in block 58 Block first atom: 2236 Blocpdb> 42 atoms in block 59 Block first atom: 2279 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 2321 Blocpdb> 41 atoms in block 61 Block first atom: 2363 Blocpdb> 36 atoms in block 62 Block first atom: 2404 Blocpdb> 38 atoms in block 63 Block first atom: 2440 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 2478 Blocpdb> 39 atoms in block 65 Block first atom: 2495 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 2534 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2571 Blocpdb> 45 atoms in block 68 Block first atom: 2611 Blocpdb> 35 atoms in block 69 Block first atom: 2656 Blocpdb> 40 atoms in block 70 Block first atom: 2691 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 2731 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2773 Blocpdb> 40 atoms in block 73 Block first atom: 2813 Blocpdb> 35 atoms in block 74 Block first atom: 2853 Blocpdb> 41 atoms in block 75 Block first atom: 2888 Blocpdb> 40 atoms in block 76 Block first atom: 2929 Blocpdb> 44 atoms in block 77 Block first atom: 2969 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 3013 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 3044 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 3077 Blocpdb> 34 atoms in block 81 Block first atom: 3115 Blocpdb> 50 atoms in block 82 Block first atom: 3149 Blocpdb> 35 atoms in block 83 Block first atom: 3199 Blocpdb> 46 atoms in block 84 Block first atom: 3234 Blocpdb> 38 atoms in block 85 Block first atom: 3280 Blocpdb> 45 atoms in block 86 Block first atom: 3318 Blocpdb> 39 atoms in block 87 Block first atom: 3363 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3402 Blocpdb> 36 atoms in block 89 Block first atom: 3439 Blocpdb> 9 atoms in block 90 Block first atom: 3475 Blocpdb> 33 atoms in block 91 Block first atom: 3484 Blocpdb> 41 atoms in block 92 Block first atom: 3517 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 3558 Blocpdb> 40 atoms in block 94 Block first atom: 3592 Blocpdb> 42 atoms in block 95 Block first atom: 3632 Blocpdb> 38 atoms in block 96 Block first atom: 3674 Blocpdb> 43 atoms in block 97 Block first atom: 3712 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3755 Blocpdb> 41 atoms in block 99 Block first atom: 3792 Blocpdb> 36 atoms in block 100 Block first atom: 3833 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 3869 Blocpdb> 46 atoms in block 102 Block first atom: 3908 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 3954 Blocpdb> 43 atoms in block 104 Block first atom: 3993 Blocpdb> 48 atoms in block 105 Block first atom: 4036 Blocpdb> 42 atoms in block 106 Block first atom: 4084 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 4126 Blocpdb> 45 atoms in block 108 Block first atom: 4145 Blocpdb> 40 atoms in block 109 Block first atom: 4190 Blocpdb> 45 atoms in block 110 Block first atom: 4230 Blocpdb> 39 atoms in block 111 Block first atom: 4275 Blocpdb> 44 atoms in block 112 Block first atom: 4314 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 4358 Blocpdb> 39 atoms in block 114 Block first atom: 4401 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 4440 Blocpdb> 39 atoms in block 116 Block first atom: 4488 Blocpdb> 36 atoms in block 117 Block first atom: 4527 Blocpdb> 46 atoms in block 118 Block first atom: 4563 Blocpdb> 48 atoms in block 119 Block first atom: 4609 Blocpdb> 42 atoms in block 120 Block first atom: 4657 Blocpdb> 39 atoms in block 121 Block first atom: 4699 Blocpdb> 40 atoms in block 122 Block first atom: 4738 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 4778 Blocpdb> 44 atoms in block 124 Block first atom: 4822 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 4866 Blocpdb> 41 atoms in block 126 Block first atom: 4907 Blocpdb> 33 atoms in block 127 Block first atom: 4948 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 4981 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5014 Blocpdb> 37 atoms in block 130 Block first atom: 5053 Blocpdb> 40 atoms in block 131 Block first atom: 5090 Blocpdb> 41 atoms in block 132 Block first atom: 5130 Blocpdb> 35 atoms in block 133 Block first atom: 5171 Blocpdb> 42 atoms in block 134 Block first atom: 5206 Blocpdb> 42 atoms in block 135 Block first atom: 5248 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 5290 Blocpdb> 40 atoms in block 137 Block first atom: 5330 Blocpdb> 33 atoms in block 138 Block first atom: 5370 Blocpdb> 41 atoms in block 139 Block first atom: 5403 Blocpdb> 40 atoms in block 140 Block first atom: 5444 Blocpdb> 47 atoms in block 141 Block first atom: 5484 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 5531 Blocpdb> 33 atoms in block 143 Block first atom: 5561 Blocpdb> 38 atoms in block 144 Block first atom: 5594 Blocpdb> 31 atoms in block 145 Block first atom: 5632 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 5663 Blocpdb> 35 atoms in block 147 Block first atom: 5713 Blocpdb> 46 atoms in block 148 Block first atom: 5748 Blocpdb> 38 atoms in block 149 Block first atom: 5794 Blocpdb> 45 atoms in block 150 Block first atom: 5832 Blocpdb> 39 atoms in block 151 Block first atom: 5877 Blocpdb> 37 atoms in block 152 Block first atom: 5916 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 5953 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 5989 Blocpdb> 40 atoms in block 155 Block first atom: 6026 Blocpdb> 32 atoms in block 156 Block first atom: 6066 Blocpdb> 35 atoms in block 157 Block first atom: 6098 Blocpdb> 38 atoms in block 158 Block first atom: 6133 Blocpdb> 42 atoms in block 159 Block first atom: 6171 Blocpdb> 43 atoms in block 160 Block first atom: 6213 Blocpdb> 39 atoms in block 161 Block first atom: 6256 Blocpdb> 37 atoms in block 162 Block first atom: 6295 Blocpdb> 37 atoms in block 163 Block first atom: 6332 Blocpdb> 29 atoms in block 164 Block first atom: 6369 Blocpdb> 43 atoms in block 165 Block first atom: 6398 Blocpdb> 44 atoms in block 166 Block first atom: 6441 Blocpdb> 43 atoms in block 167 Block first atom: 6485 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6528 Blocpdb> 53 atoms in block 169 Block first atom: 6566 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 6619 Blocpdb> 40 atoms in block 171 Block first atom: 6633 Blocpdb> 39 atoms in block 172 Block first atom: 6673 Blocpdb> 43 atoms in block 173 Block first atom: 6712 Blocpdb> 39 atoms in block 174 Block first atom: 6755 Blocpdb> 46 atoms in block 175 Block first atom: 6794 Blocpdb> 48 atoms in block 176 Block first atom: 6840 Blocpdb> 38 atoms in block 177 Block first atom: 6888 Blocpdb> 41 atoms in block 178 Block first atom: 6926 Blocpdb> 40 atoms in block 179 Block first atom: 6967 Blocpdb> 41 atoms in block 180 Block first atom: 7007 Blocpdb> 40 atoms in block 181 Block first atom: 7048 Blocpdb> 39 atoms in block 182 Block first atom: 7088 Blocpdb> 49 atoms in block 183 Block first atom: 7127 Blocpdb> 36 atoms in block 184 Block first atom: 7176 Blocpdb> 42 atoms in block 185 Block first atom: 7212 Blocpdb> 42 atoms in block 186 Block first atom: 7254 Blocpdb> 43 atoms in block 187 Block first atom: 7296 Blocpdb> 39 atoms in block 188 Block first atom: 7339 Blocpdb> 44 atoms in block 189 Block first atom: 7378 Blocpdb> 36 atoms in block 190 Block first atom: 7422 Blocpdb> 38 atoms in block 191 Block first atom: 7458 Blocpdb> 8 atoms in block 192 Block first atom: 7495 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2891894 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22509 Prepmat> Matrix trace = 6327220.0000 Prepmat> Last element read: 22509 22509 153.9273 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16862 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7503 RTB> Total mass = 7503.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7503 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 223719.1464 RTB> 57096 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57096 Diagstd> Projected matrix trace = 223719.1464 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 223719.1464 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1226871 0.1393202 0.1773853 0.2681834 0.2850433 0.3640298 0.8354950 1.0826388 1.1234222 1.8240778 1.9104140 2.3296588 2.7723503 3.6506780 4.2047977 4.4510797 5.6571837 5.9152606 6.2826705 6.7276970 7.2553330 8.7501110 9.0399123 9.2006275 10.2584948 10.4725289 11.0479835 11.8297540 12.4660185 12.6247071 13.1934250 14.6086799 14.7518954 15.6040368 16.2301710 16.3768466 17.0948195 17.3687089 17.8296369 18.2314633 19.6898158 20.0457811 20.6832210 22.0527893 22.4250970 22.9579284 23.6643816 24.3696753 24.8388112 25.1293844 25.6195250 25.9667608 26.8442678 27.2653224 27.5046290 27.9960343 29.2264847 29.3343727 29.9637202 30.6641148 30.9591893 31.3656530 32.1645531 32.7259212 33.1467892 33.8833978 34.3909239 34.9239831 35.1244189 35.4414156 36.0656133 36.4842535 36.6358524 37.0085759 37.3895367 37.6977386 38.1127890 38.3352084 38.7568502 39.0411215 39.3757134 39.9697004 40.2325085 40.9532428 41.1575454 41.8471353 42.2320955 42.4301031 42.7309925 43.1828351 43.5299973 43.6994856 44.2848557 44.7950026 44.8381240 44.8942744 44.9429970 45.3208457 45.5370841 45.9094946 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034333 0.0034335 0.0034339 0.0034346 0.0034350 38.0359881 40.5323982 45.7355674 56.2355865 57.9763284 65.5184680 99.2583878 112.9892391 115.0977337 146.6617831 150.0925118 165.7453848 180.8087036 207.4827736 222.6731405 229.1015167 258.2827622 264.1084037 272.1870273 281.6621518 292.4987105 321.2196186 326.4956419 329.3851416 347.8060256 351.4156221 360.9414755 373.4935761 383.4062281 385.8388340 394.4337388 415.0503329 417.0798350 428.9570032 437.4786148 439.4509635 448.9805623 452.5630045 458.5287066 463.6668472 481.8547081 486.1908395 493.8605844 509.9493516 514.2359631 520.3093483 528.2540803 536.0683311 541.2036081 544.3599993 549.6431460 553.3554212 562.6276367 567.0229006 569.5058320 574.5707833 587.0614620 588.1440168 594.4196347 601.3267122 604.2130066 608.1664342 615.8628973 621.2139793 625.1957444 632.1043186 636.8207436 641.7371259 643.5760210 646.4736243 652.1416552 655.9156790 657.2769927 660.6120131 664.0034290 666.7345019 670.3948136 672.3481198 676.0355235 678.5102656 681.4115618 686.5319079 688.7852463 694.9273884 696.6586170 702.4705905 705.6942777 707.3466868 709.8502999 713.5934518 716.4561256 717.8495672 722.6414973 726.7918744 727.1416090 727.5967635 727.9914772 731.0452895 732.7872248 735.7775562 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7503 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1774 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.657 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.283 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.728 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.040 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.91 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 135054 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610201159422660167.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610201159422660167.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610201159422660167.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610201159422660167.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 938 First residue number = 1 Last residue number = 327 Number of atoms found = 7503 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1774 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.657 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.283 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.728 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.040 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91 Bfactors> 106 vectors, 22509 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.122700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.464 for 939 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.082 +/- 0.06 Bfactors> = 31.353 +/- 9.73 Bfactors> Shiftng-fct= 31.270 Bfactors> Scaling-fct= 174.231 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610201159422660167.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610201159422660167.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2 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vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8 Chkmod> 106 vectors, 22509 coordinates in file. Chkmod> That is: 7503 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7486 0.0034 0.7049 0.0034 0.7313 0.0034 0.9224 0.0034 0.9014 0.0034 0.9720 38.0364 0.6094 40.5277 0.6499 45.7355 0.7727 56.2349 0.5369 57.9694 0.6236 65.5130 0.6265 99.2544 0.6618 113.0032 0.6637 115.0712 0.6828 146.6524 0.6835 150.0698 0.6659 165.7504 0.0047 180.7895 0.8553 207.4830 0.6029 222.6689 0.4407 229.0896 0.3882 258.2675 0.0075 264.0912 0.6575 272.1825 0.3814 281.6564 0.5701 292.4794 0.0055 321.2038 0.5024 326.4832 0.5250 329.3777 0.3839 347.8166 0.1580 351.3581 0.2378 360.9589 0.3794 373.4814 0.0225 383.4510 0.4688 385.7503 0.5368 394.3656 0.4960 415.0513 0.4305 417.0351 0.5150 428.8831 0.4567 437.4575 0.5711 439.4744 0.5469 448.8980 0.6163 452.5604 0.4878 458.5137 0.4917 463.6283 0.4096 481.8363 0.5544 486.2211 0.6039 493.8009 0.6007 509.8952 0.2373 514.2701 0.3058 520.3105 0.2875 528.1825 0.3907 536.0489 0.1734 541.1933 0.5951 544.3433 0.3889 549.6246 0.4553 553.3662 0.4329 562.5588 0.4548 567.0472 0.3335 569.4335 0.0952 574.5868 0.2549 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DQ=-80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom making animated gifs 11 models are in 2610201159422660167.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610201159422660167 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom making animated gifs 11 models are in 2610201159422660167.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610201159422660167 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610201159422660167.eigenfacs 2610201159422660167.atom making animated gifs 11 models are in 2610201159422660167.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610201159422660167.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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