***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610210815212830177.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610210815212830177.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610210815212830177.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -2.580464 +/- 8.028547 From: -21.395000 To: 16.680000
= -8.296129 +/- 12.823352 From: -32.775000 To: 23.232000
= -13.353462 +/- 12.452553 From: -37.175000 To: 16.117000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6015 % Filled.
Pdbmat> 567967 non-zero elements.
Pdbmat> 62014 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 74.90 +/- 19.54
Maximum number = 124
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 1.240280E+06
Pdbmat> Larger element = 475.594
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
214 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610210815212830177.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610210815212830177.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610210815212830177.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1656 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 214 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 36
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 72
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 81
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 94
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 110
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 143
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 160
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 181
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 193
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 209
Blocpdb> 11 atoms in block 16
Block first atom: 223
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 250
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 269
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 279
Blocpdb> 10 atoms in block 21
Block first atom: 295
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 305
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 320
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 332
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 350
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 364
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 380
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 396
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 405
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 422
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 436
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 453
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 468
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 481
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 496
Blocpdb> 19 atoms in block 36
Block first atom: 514
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 533
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 547
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 564
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 581
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 593
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 612
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 628
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 643
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 661
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 676
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 692
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 705
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 718
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 736
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 745
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 761
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 776
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 795
Blocpdb> 19 atoms in block 55
Block first atom: 812
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 831
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 845
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 862
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 878
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 893
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 912
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 923
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 945
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 962
Blocpdb> 10 atoms in block 65
Block first atom: 974
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 984
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1002
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1024
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1040
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1059
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1073
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1089
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1102
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1134
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1145
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1163
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1178
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1196
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1230
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1248
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1262
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1282
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1301
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1317
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1339
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1356
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1368
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1383
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 1395
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1419
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1434
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1448
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1462
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1474
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1490
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1507
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1523
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1535
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1551
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1565
Blocpdb> 18 atoms in block 103
Block first atom: 1579
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1597
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1610
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1627
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1643
Blocpdb> 107 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 568074 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4968
Prepmat> Matrix trace = 1240280.0000
Prepmat> Last element read: 4968 4968 132.6916
Prepmat> 5779 lines saved.
Prepmat> 4788 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1656
RTB> Total mass = 1656.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1656
RTB> Number of blocks = 107
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 132205.7882
RTB> 34035 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 642
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34035
Diagstd> Projected matrix trace = 132205.7882
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 642 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 132205.7882
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2092891 0.5590755 1.1106478 2.0670160
2.5526125 4.1302674 4.7763384 6.2990683 7.4381227
9.7666774 10.2865229 11.7569299 12.2703590 12.9409333
13.6872799 14.8944599 16.5271321 18.3793340 19.4801025
20.0925927 21.3084497 21.8415198 23.1975883 24.6287739
24.9049883 26.7914457 26.9558615 27.8002139 28.8300480
29.7156127 30.2608971 31.6255060 33.0158997 33.9789003
35.4128848 36.3179256 37.3384746 37.6709797 38.6541247
39.6652190 41.1517016 43.2134901 44.2778815 45.0954339
46.3325894 47.9649449 48.7620287 49.4648540 49.9129207
50.6047357 51.0106513 52.4593330 52.7186982 53.3875351
54.4913579 54.9699041 56.2622281 57.0755810 57.7563378
58.4625643 59.7233164 60.2140464 60.8492272 62.1343526
62.5272120 63.1159247 64.6399077 65.4210040 66.5297029
67.0638459 69.3792203 69.9830800 70.2007942 70.7764253
71.8899413 73.0179297 73.8806888 74.1019613 74.5791876
75.0647627 76.1914393 77.0446707 77.5600084 78.4734373
79.0156967 79.6800711 80.4159526 80.7312025 81.1246953
81.4435458 82.0299566 83.1169474 84.6254340 84.8529465
85.2775030 87.1362587 87.6287373 88.3294375 88.7240368
88.9700637
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034324 0.0034331 0.0034337 0.0034341
0.0034342 49.6785118 81.1952305 114.4414783 156.1231126
173.4953044 220.6908681 237.3246356 272.5420008 296.1603734
339.3662900 348.2808358 372.3421857 380.3854663 390.6412302
401.7481213 419.0903496 441.4627146 465.5433911 479.2817579
486.7581941 501.2694155 507.5007721 523.0180759 538.9105386
541.9240833 562.0738163 563.7958675 572.5578175 583.0663295
591.9535438 597.3600566 610.6804562 623.9601424 632.9945048
646.2133616 654.4188460 663.5498667 666.4978271 675.1390087
683.9119758 696.6091572 713.8466926 722.5845924 729.2250269
739.1601864 752.0682515 758.2914569 763.7366752 767.1879483
772.4864327 775.5784163 786.5143713 788.4562841 793.4420544
801.6025602 805.1147254 814.5237344 820.3901754 825.2681875
830.2984181 839.2034066 842.6441050 847.0768518 855.9751745
858.6769650 862.7098470 873.0631221 878.3222462 885.7335030
889.2820123 904.5029504 908.4307079 909.8426541 913.5652937
920.7237477 927.9189366 933.3848513 934.7815491 937.7867763
940.8347251 947.8691076 953.1616975 956.3441466 961.9591241
965.2770198 969.3266136 973.7924109 975.6992943 978.0742369
979.9944516 983.5162077 990.0111201 998.9545623 1000.2964885
1002.7958266 1013.6656617 1016.5261544 1020.5822546 1022.8593674
1024.2765524
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1656
Rtb_to_modes> Number of blocs = 107
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2093
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.111
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.553
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.776
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.299
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.438
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.767
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.97
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 642 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99997 0.99995 0.99999
0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999
0.99994 1.00002 1.00001 0.99995 0.99999
1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00003
1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00000
1.00004 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003
1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003
0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 29808 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99997 0.99995 0.99999
0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999
0.99994 1.00002 1.00001 0.99995 0.99999
1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00003
1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00000
1.00004 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003
1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003
0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610210815212830177.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610210815212830177.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610210815212830177.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610210815212830177.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2093
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.553
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.776
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.438
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.97
Bfactors> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.209300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.794 for 214 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.102 +/- 0.11
Bfactors> = 38.071 +/- 19.20
Bfactors> Shiftng-fct= 37.969
Bfactors> Scaling-fct= 178.980
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610210815212830177.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610210815212830177.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Chkmod> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1656 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 34 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8949
0.0034 0.8371
0.0034 0.8075
0.0034 0.9390
0.0034 0.8250
0.0034 0.7493
49.6777 0.4817
81.1935 0.5358
114.4547 0.4091
156.1158 0.4935
173.5010 0.4909
220.6743 0.6118
237.3060 0.2685
272.5288 0.7326
296.1452 0.5872
339.3573 0.4706
348.3247 0.4247
372.3748 0.4671
380.3636 0.5961
390.6104 0.4406
401.7708 0.3326
419.0096 0.6638
441.4821 0.5360
465.5318 0.5248
479.2599 0.6515
486.7059 0.6347
501.2661 0.5655
507.4613 0.2738
523.0228 0.3269
538.9008 0.6119
541.8465 0.3249
562.0345 0.4119
563.8149 0.3883
572.5310 0.3398
583.0408 0.5018
591.9718 0.5390
597.3256 0.2592
610.6976 0.4922
623.9721 0.3829
632.9776 0.3819
646.1593 0.5634
654.4094 0.5185
663.5349 0.3466
666.4605 0.3329
675.0740 0.4328
683.9238 0.5363
696.5649 0.5124
713.7872 0.3775
722.5709 0.3214
729.2306 0.6346
739.1078 0.4689
751.9972 0.4779
758.2431 0.5401
763.6664 0.4481
767.1326 0.4444
772.4171 0.4954
775.5402 0.6388
786.4856 0.3711
788.4322 0.4264
793.4263 0.4020
801.5582 0.3731
805.0809 0.3396
814.4726 0.5425
820.3867 0.4239
825.2589 0.3529
830.2446 0.4298
839.1441 0.4941
842.5796 0.5748
847.0459 0.5782
855.9084 0.5532
858.6592 0.3381
862.7007 0.4101
873.0263 0.4189
878.2778 0.4042
885.6975 0.4018
889.2183 0.4811
904.4692 0.5846
908.3717 0.4185
909.7985 0.3136
913.5491 0.5422
920.6846 0.3964
927.8923 0.5418
933.3404 0.4779
934.7291 0.4935
937.7516 0.5333
940.7645 0.3975
947.8195 0.4938
953.0919 0.4678
956.3030 0.4581
961.8968 0.4026
965.2619 0.5205
969.2846 0.2936
973.7751 0.3410
975.6501 0.4737
978.0039 0.5336
979.9311 0.4501
983.4742 0.4754
989.9868 0.2790
998.9386 0.6284
1000.2362 0.4003
1002.7675 0.5390
1013.6439 0.3690
1016.4898 0.5604
1020.5417 0.4554
1022.7922 0.5194
1024.2322 0.4812
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
making animated gifs
11 models are in 2610210815212830177.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
making animated gifs
11 models are in 2610210815212830177.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
making animated gifs
11 models are in 2610210815212830177.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
making animated gifs
11 models are in 2610210815212830177.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610210815212830177.eigenfacs
2610210815212830177.atom
making animated gifs
11 models are in 2610210815212830177.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610210815212830177.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610210815212830177.10.pdb
2610210815212830177.11.pdb
2610210815212830177.7.pdb
2610210815212830177.8.pdb
2610210815212830177.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m5.055s
user 0m4.984s
sys 0m0.070s
rm: cannot remove '2610210815212830177.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|