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LOGs for ID: 2610210815212830177

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610210815212830177.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610210815212830177.atom to be opened. Openam> File opened: 2610210815212830177.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 214 First residue number = 1 Last residue number = 214 Number of atoms found = 1656 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -2.580464 +/- 8.028547 From: -21.395000 To: 16.680000 = -8.296129 +/- 12.823352 From: -32.775000 To: 23.232000 = -13.353462 +/- 12.452553 From: -37.175000 To: 16.117000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.6015 % Filled. Pdbmat> 567967 non-zero elements. Pdbmat> 62014 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 74.90 +/- 19.54 Maximum number = 124 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 1.240280E+06 Pdbmat> Larger element = 475.594 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 214 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610210815212830177.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610210815212830177.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610210815212830177.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1656 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 214 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 9 atoms in block 4 Block first atom: 52 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 61 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 72 Blocpdb> 13 atoms in block 7 Block first atom: 81 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 94 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 110 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 124 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 143 Blocpdb> 21 atoms in block 12 Block first atom: 160 Blocpdb> 12 atoms in block 13 Block first atom: 181 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 193 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 209 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 223 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 234 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 250 Blocpdb> 10 atoms in block 19 Block first atom: 269 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 279 Blocpdb> 10 atoms in block 21 Block first atom: 295 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 305 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 320 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 332 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 350 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 364 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 380 Blocpdb> 9 atoms in block 28 Block first atom: 396 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 405 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 422 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 436 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 453 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 468 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 481 Blocpdb> 18 atoms in block 35 Block first atom: 496 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 514 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 533 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 547 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 564 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 581 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 593 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 612 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 628 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 643 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 661 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 676 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 692 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 705 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 718 Blocpdb> 9 atoms in block 50 Block first atom: 736 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 745 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 761 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 776 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 795 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 812 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 831 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 845 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 862 Blocpdb> 15 atoms in block 59 Block first atom: 878 Blocpdb> 19 atoms in block 60 Block first atom: 893 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 912 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 923 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 945 Blocpdb> 12 atoms in block 64 Block first atom: 962 Blocpdb> 10 atoms in block 65 Block first atom: 974 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 984 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1002 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1024 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1040 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1059 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1073 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1089 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1102 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1119 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 1134 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1145 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1163 Blocpdb> 18 atoms in block 78 Block first atom: 1178 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1196 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1213 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1230 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1248 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1262 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1282 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1301 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1317 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1339 Blocpdb> 12 atoms in block 88 Block first atom: 1356 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1368 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 1383 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 1395 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1419 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1434 Blocpdb> 14 atoms in block 94 Block first atom: 1448 Blocpdb> 12 atoms in block 95 Block first atom: 1462 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1474 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1490 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1507 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1523 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1535 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1551 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1565 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 1579 Blocpdb> 13 atoms in block 104 Block first atom: 1597 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1610 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1627 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1643 Blocpdb> 107 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 568074 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4968 Prepmat> Matrix trace = 1240280.0000 Prepmat> Last element read: 4968 4968 132.6916 Prepmat> 5779 lines saved. Prepmat> 4788 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1656 RTB> Total mass = 1656.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1656 RTB> Number of blocks = 107 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 132205.7882 RTB> 34035 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 642 Diagstd> Nb of non-zero elements: 34035 Diagstd> Projected matrix trace = 132205.7882 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 642 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 132205.7882 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2092891 0.5590755 1.1106478 2.0670160 2.5526125 4.1302674 4.7763384 6.2990683 7.4381227 9.7666774 10.2865229 11.7569299 12.2703590 12.9409333 13.6872799 14.8944599 16.5271321 18.3793340 19.4801025 20.0925927 21.3084497 21.8415198 23.1975883 24.6287739 24.9049883 26.7914457 26.9558615 27.8002139 28.8300480 29.7156127 30.2608971 31.6255060 33.0158997 33.9789003 35.4128848 36.3179256 37.3384746 37.6709797 38.6541247 39.6652190 41.1517016 43.2134901 44.2778815 45.0954339 46.3325894 47.9649449 48.7620287 49.4648540 49.9129207 50.6047357 51.0106513 52.4593330 52.7186982 53.3875351 54.4913579 54.9699041 56.2622281 57.0755810 57.7563378 58.4625643 59.7233164 60.2140464 60.8492272 62.1343526 62.5272120 63.1159247 64.6399077 65.4210040 66.5297029 67.0638459 69.3792203 69.9830800 70.2007942 70.7764253 71.8899413 73.0179297 73.8806888 74.1019613 74.5791876 75.0647627 76.1914393 77.0446707 77.5600084 78.4734373 79.0156967 79.6800711 80.4159526 80.7312025 81.1246953 81.4435458 82.0299566 83.1169474 84.6254340 84.8529465 85.2775030 87.1362587 87.6287373 88.3294375 88.7240368 88.9700637 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034324 0.0034331 0.0034337 0.0034341 0.0034342 49.6785118 81.1952305 114.4414783 156.1231126 173.4953044 220.6908681 237.3246356 272.5420008 296.1603734 339.3662900 348.2808358 372.3421857 380.3854663 390.6412302 401.7481213 419.0903496 441.4627146 465.5433911 479.2817579 486.7581941 501.2694155 507.5007721 523.0180759 538.9105386 541.9240833 562.0738163 563.7958675 572.5578175 583.0663295 591.9535438 597.3600566 610.6804562 623.9601424 632.9945048 646.2133616 654.4188460 663.5498667 666.4978271 675.1390087 683.9119758 696.6091572 713.8466926 722.5845924 729.2250269 739.1601864 752.0682515 758.2914569 763.7366752 767.1879483 772.4864327 775.5784163 786.5143713 788.4562841 793.4420544 801.6025602 805.1147254 814.5237344 820.3901754 825.2681875 830.2984181 839.2034066 842.6441050 847.0768518 855.9751745 858.6769650 862.7098470 873.0631221 878.3222462 885.7335030 889.2820123 904.5029504 908.4307079 909.8426541 913.5652937 920.7237477 927.9189366 933.3848513 934.7815491 937.7867763 940.8347251 947.8691076 953.1616975 956.3441466 961.9591241 965.2770198 969.3266136 973.7924109 975.6992943 978.0742369 979.9944516 983.5162077 990.0111201 998.9545623 1000.2964885 1002.7958266 1013.6656617 1016.5261544 1020.5822546 1022.8593674 1024.2765524 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1656 Rtb_to_modes> Number of blocs = 107 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> 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Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610210815212830177.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610210815212830177.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610210815212830177.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610210815212830177.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 214 First residue number = 1 Last residue number = 214 Number of atoms found = 1656 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.111 Rdmodfacs> Numero du 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vecteur en lecture: 41.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.97 Bfactors> 106 vectors, 4968 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.209300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.794 for 214 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.102 +/- 0.11 Bfactors> = 38.071 +/- 19.20 Bfactors> Shiftng-fct= 37.969 Bfactors> Scaling-fct= 178.980 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610210815212830177.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610210815212830177.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Chkmod> 106 vectors, 4968 coordinates in file. Chkmod> That is: 1656 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 34 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8949 0.0034 0.8371 0.0034 0.8075 0.0034 0.9390 0.0034 0.8250 0.0034 0.7493 49.6777 0.4817 81.1935 0.5358 114.4547 0.4091 156.1158 0.4935 173.5010 0.4909 220.6743 0.6118 237.3060 0.2685 272.5288 0.7326 296.1452 0.5872 339.3573 0.4706 348.3247 0.4247 372.3748 0.4671 380.3636 0.5961 390.6104 0.4406 401.7708 0.3326 419.0096 0.6638 441.4821 0.5360 465.5318 0.5248 479.2599 0.6515 486.7059 0.6347 501.2661 0.5655 507.4613 0.2738 523.0228 0.3269 538.9008 0.6119 541.8465 0.3249 562.0345 0.4119 563.8149 0.3883 572.5310 0.3398 583.0408 0.5018 591.9718 0.5390 597.3256 0.2592 610.6976 0.4922 623.9721 0.3829 632.9776 0.3819 646.1593 0.5634 654.4094 0.5185 663.5349 0.3466 666.4605 0.3329 675.0740 0.4328 683.9238 0.5363 696.5649 0.5124 713.7872 0.3775 722.5709 0.3214 729.2306 0.6346 739.1078 0.4689 751.9972 0.4779 758.2431 0.5401 763.6664 0.4481 767.1326 0.4444 772.4171 0.4954 775.5402 0.6388 786.4856 0.3711 788.4322 0.4264 793.4263 0.4020 801.5582 0.3731 805.0809 0.3396 814.4726 0.5425 820.3867 0.4239 825.2589 0.3529 830.2446 0.4298 839.1441 0.4941 842.5796 0.5748 847.0459 0.5782 855.9084 0.5532 858.6592 0.3381 862.7007 0.4101 873.0263 0.4189 878.2778 0.4042 885.6975 0.4018 889.2183 0.4811 904.4692 0.5846 908.3717 0.4185 909.7985 0.3136 913.5491 0.5422 920.6846 0.3964 927.8923 0.5418 933.3404 0.4779 934.7291 0.4935 937.7516 0.5333 940.7645 0.3975 947.8195 0.4938 953.0919 0.4678 956.3030 0.4581 961.8968 0.4026 965.2619 0.5205 969.2846 0.2936 973.7751 0.3410 975.6501 0.4737 978.0039 0.5336 979.9311 0.4501 983.4742 0.4754 989.9868 0.2790 998.9386 0.6284 1000.2362 0.4003 1002.7675 0.5390 1013.6439 0.3690 1016.4898 0.5604 1020.5417 0.4554 1022.7922 0.5194 1024.2322 0.4812 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610210815212830177 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610210815212830177.eigenfacs 2610210815212830177.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610210815212830177.eigenfacs 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