*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610211743312925232.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610211743312925232.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610211743312925232.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2870
First residue number = 1
Last residue number = 1435
Number of atoms found = 22804
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 8.923676 +/- 75.212371 From: -198.782000 To: 113.761000
= 101.805660 +/- 38.206290 From: 18.460000 To: 217.110000
= 16.915153 +/- 24.860592 From: -48.430000 To: 80.919000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.1710 % Filled.
Pdbmat> 8035531 non-zero elements.
Pdbmat> 877773 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.98 +/- 22.44
Maximum number = 130
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.755546E+07
Pdbmat> Larger element = 501.749
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2870 non-zero elements, NRBL set to 15
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610211743312925232.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 15
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610211743312925232.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610211743312925232.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 22804 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 15 residue(s) per block.
Blocpdb> 2870 residues.
Blocpdb> 102 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 133 atoms in block 2
Block first atom: 103
Blocpdb> 131 atoms in block 3
Block first atom: 236
Blocpdb> 111 atoms in block 4
Block first atom: 367
Blocpdb> 111 atoms in block 5
Block first atom: 478
Blocpdb> 124 atoms in block 6
Block first atom: 589
Blocpdb> 123 atoms in block 7
Block first atom: 713
Blocpdb> 115 atoms in block 8
Block first atom: 836
Blocpdb> 114 atoms in block 9
Block first atom: 951
Blocpdb> 118 atoms in block 10
Block first atom: 1065
Blocpdb> 121 atoms in block 11
Block first atom: 1183
Blocpdb> 107 atoms in block 12
Block first atom: 1304
Blocpdb> 112 atoms in block 13
Block first atom: 1411
Blocpdb> 112 atoms in block 14
Block first atom: 1523
Blocpdb> 120 atoms in block 15
Block first atom: 1635
Blocpdb> 108 atoms in block 16
Block first atom: 1755
Blocpdb> 121 atoms in block 17
Block first atom: 1863
Blocpdb> 125 atoms in block 18
Block first atom: 1984
Blocpdb> 121 atoms in block 19
Block first atom: 2109
Blocpdb> 135 atoms in block 20
Block first atom: 2230
Blocpdb> 123 atoms in block 21
Block first atom: 2365
Blocpdb> 119 atoms in block 22
Block first atom: 2488
Blocpdb> 107 atoms in block 23
Block first atom: 2607
Blocpdb> 97 atoms in block 24
Block first atom: 2714
Blocpdb> 109 atoms in block 25
Block first atom: 2811
Blocpdb> 127 atoms in block 26
Block first atom: 2920
Blocpdb> 112 atoms in block 27
Block first atom: 3047
Blocpdb> 117 atoms in block 28
Block first atom: 3159
Blocpdb> 132 atoms in block 29
Block first atom: 3276
Blocpdb> 118 atoms in block 30
Block first atom: 3408
Blocpdb> 124 atoms in block 31
Block first atom: 3526
Blocpdb> 115 atoms in block 32
Block first atom: 3650
Blocpdb> 123 atoms in block 33
Block first atom: 3765
Blocpdb> 113 atoms in block 34
Block first atom: 3888
Blocpdb> 112 atoms in block 35
Block first atom: 4001
Blocpdb> 109 atoms in block 36
Block first atom: 4113
Blocpdb> 131 atoms in block 37
Block first atom: 4222
Blocpdb> 101 atoms in block 38
Block first atom: 4353
Blocpdb> 112 atoms in block 39
Block first atom: 4454
Blocpdb> 118 atoms in block 40
Block first atom: 4566
Blocpdb> 117 atoms in block 41
Block first atom: 4684
Blocpdb> 120 atoms in block 42
Block first atom: 4801
Blocpdb> 115 atoms in block 43
Block first atom: 4921
Blocpdb> 129 atoms in block 44
Block first atom: 5036
Blocpdb> 139 atoms in block 45
Block first atom: 5165
Blocpdb> 113 atoms in block 46
Block first atom: 5304
Blocpdb> 112 atoms in block 47
Block first atom: 5417
Blocpdb> 128 atoms in block 48
Block first atom: 5529
Blocpdb> 124 atoms in block 49
Block first atom: 5657
Blocpdb> 113 atoms in block 50
Block first atom: 5781
Blocpdb> 127 atoms in block 51
Block first atom: 5894
Blocpdb> 125 atoms in block 52
Block first atom: 6021
Blocpdb> 131 atoms in block 53
Block first atom: 6146
Blocpdb> 131 atoms in block 54
Block first atom: 6277
Blocpdb> 131 atoms in block 55
Block first atom: 6408
Blocpdb> 127 atoms in block 56
Block first atom: 6539
Blocpdb> 118 atoms in block 57
Block first atom: 6666
Blocpdb> 121 atoms in block 58
Block first atom: 6784
Blocpdb> 114 atoms in block 59
Block first atom: 6905
Blocpdb> 122 atoms in block 60
Block first atom: 7019
Blocpdb> 120 atoms in block 61
Block first atom: 7141
Blocpdb> 132 atoms in block 62
Block first atom: 7261
Blocpdb> 126 atoms in block 63
Block first atom: 7393
Blocpdb> 112 atoms in block 64
Block first atom: 7519
Blocpdb> 117 atoms in block 65
Block first atom: 7631
Blocpdb> 140 atoms in block 66
Block first atom: 7748
Blocpdb> 143 atoms in block 67
Block first atom: 7888
Blocpdb> 130 atoms in block 68
Block first atom: 8031
Blocpdb> 112 atoms in block 69
Block first atom: 8161
Blocpdb> 115 atoms in block 70
Block first atom: 8273
Blocpdb> 118 atoms in block 71
Block first atom: 8388
Blocpdb> 112 atoms in block 72
Block first atom: 8506
Blocpdb> 112 atoms in block 73
Block first atom: 8618
Blocpdb> 120 atoms in block 74
Block first atom: 8730
Blocpdb> 126 atoms in block 75
Block first atom: 8850
Blocpdb> 110 atoms in block 76
Block first atom: 8976
Blocpdb> 113 atoms in block 77
Block first atom: 9086
Blocpdb> 134 atoms in block 78
Block first atom: 9199
Blocpdb> 112 atoms in block 79
Block first atom: 9333
Blocpdb> 110 atoms in block 80
Block first atom: 9445
Blocpdb> 116 atoms in block 81
Block first atom: 9555
Blocpdb> 108 atoms in block 82
Block first atom: 9671
Blocpdb> 108 atoms in block 83
Block first atom: 9779
Blocpdb> 127 atoms in block 84
Block first atom: 9887
Blocpdb> 110 atoms in block 85
Block first atom: 10014
Blocpdb> 125 atoms in block 86
Block first atom: 10124
Blocpdb> 114 atoms in block 87
Block first atom: 10249
Blocpdb> 123 atoms in block 88
Block first atom: 10363
Blocpdb> 125 atoms in block 89
Block first atom: 10486
Blocpdb> 102 atoms in block 90
Block first atom: 10611
Blocpdb> 120 atoms in block 91
Block first atom: 10713
Blocpdb> 138 atoms in block 92
Block first atom: 10833
Blocpdb> 116 atoms in block 93
Block first atom: 10971
Blocpdb> 121 atoms in block 94
Block first atom: 11087
Blocpdb> 117 atoms in block 95
Block first atom: 11208
Blocpdb> 78 atoms in block 96
Block first atom: 11325
Blocpdb> 102 atoms in block 97
Block first atom: 11403
Blocpdb> 133 atoms in block 98
Block first atom: 11505
Blocpdb> 131 atoms in block 99
Block first atom: 11638
Blocpdb> 111 atoms in block 100
Block first atom: 11769
Blocpdb> 111 atoms in block 101
Block first atom: 11880
Blocpdb> 124 atoms in block 102
Block first atom: 11991
Blocpdb> 123 atoms in block 103
Block first atom: 12115
Blocpdb> 115 atoms in block 104
Block first atom: 12238
Blocpdb> 114 atoms in block 105
Block first atom: 12353
Blocpdb> 118 atoms in block 106
Block first atom: 12467
Blocpdb> 121 atoms in block 107
Block first atom: 12585
Blocpdb> 107 atoms in block 108
Block first atom: 12706
Blocpdb> 112 atoms in block 109
Block first atom: 12813
Blocpdb> 112 atoms in block 110
Block first atom: 12925
Blocpdb> 120 atoms in block 111
Block first atom: 13037
Blocpdb> 108 atoms in block 112
Block first atom: 13157
Blocpdb> 121 atoms in block 113
Block first atom: 13265
Blocpdb> 125 atoms in block 114
Block first atom: 13386
Blocpdb> 121 atoms in block 115
Block first atom: 13511
Blocpdb> 135 atoms in block 116
Block first atom: 13632
Blocpdb> 123 atoms in block 117
Block first atom: 13767
Blocpdb> 119 atoms in block 118
Block first atom: 13890
Blocpdb> 107 atoms in block 119
Block first atom: 14009
Blocpdb> 97 atoms in block 120
Block first atom: 14116
Blocpdb> 109 atoms in block 121
Block first atom: 14213
Blocpdb> 127 atoms in block 122
Block first atom: 14322
Blocpdb> 112 atoms in block 123
Block first atom: 14449
Blocpdb> 117 atoms in block 124
Block first atom: 14561
Blocpdb> 132 atoms in block 125
Block first atom: 14678
Blocpdb> 118 atoms in block 126
Block first atom: 14810
Blocpdb> 124 atoms in block 127
Block first atom: 14928
Blocpdb> 115 atoms in block 128
Block first atom: 15052
Blocpdb> 123 atoms in block 129
Block first atom: 15167
Blocpdb> 113 atoms in block 130
Block first atom: 15290
Blocpdb> 112 atoms in block 131
Block first atom: 15403
Blocpdb> 109 atoms in block 132
Block first atom: 15515
Blocpdb> 131 atoms in block 133
Block first atom: 15624
Blocpdb> 101 atoms in block 134
Block first atom: 15755
Blocpdb> 112 atoms in block 135
Block first atom: 15856
Blocpdb> 118 atoms in block 136
Block first atom: 15968
Blocpdb> 117 atoms in block 137
Block first atom: 16086
Blocpdb> 120 atoms in block 138
Block first atom: 16203
Blocpdb> 115 atoms in block 139
Block first atom: 16323
Blocpdb> 129 atoms in block 140
Block first atom: 16438
Blocpdb> 139 atoms in block 141
Block first atom: 16567
Blocpdb> 113 atoms in block 142
Block first atom: 16706
Blocpdb> 112 atoms in block 143
Block first atom: 16819
Blocpdb> 128 atoms in block 144
Block first atom: 16931
Blocpdb> 124 atoms in block 145
Block first atom: 17059
Blocpdb> 113 atoms in block 146
Block first atom: 17183
Blocpdb> 127 atoms in block 147
Block first atom: 17296
Blocpdb> 125 atoms in block 148
Block first atom: 17423
Blocpdb> 131 atoms in block 149
Block first atom: 17548
Blocpdb> 131 atoms in block 150
Block first atom: 17679
Blocpdb> 131 atoms in block 151
Block first atom: 17810
Blocpdb> 127 atoms in block 152
Block first atom: 17941
Blocpdb> 118 atoms in block 153
Block first atom: 18068
Blocpdb> 121 atoms in block 154
Block first atom: 18186
Blocpdb> 114 atoms in block 155
Block first atom: 18307
Blocpdb> 122 atoms in block 156
Block first atom: 18421
Blocpdb> 120 atoms in block 157
Block first atom: 18543
Blocpdb> 132 atoms in block 158
Block first atom: 18663
Blocpdb> 126 atoms in block 159
Block first atom: 18795
Blocpdb> 112 atoms in block 160
Block first atom: 18921
Blocpdb> 117 atoms in block 161
Block first atom: 19033
Blocpdb> 140 atoms in block 162
Block first atom: 19150
Blocpdb> 143 atoms in block 163
Block first atom: 19290
Blocpdb> 130 atoms in block 164
Block first atom: 19433
Blocpdb> 112 atoms in block 165
Block first atom: 19563
Blocpdb> 115 atoms in block 166
Block first atom: 19675
Blocpdb> 118 atoms in block 167
Block first atom: 19790
Blocpdb> 112 atoms in block 168
Block first atom: 19908
Blocpdb> 112 atoms in block 169
Block first atom: 20020
Blocpdb> 120 atoms in block 170
Block first atom: 20132
Blocpdb> 126 atoms in block 171
Block first atom: 20252
Blocpdb> 110 atoms in block 172
Block first atom: 20378
Blocpdb> 113 atoms in block 173
Block first atom: 20488
Blocpdb> 134 atoms in block 174
Block first atom: 20601
Blocpdb> 112 atoms in block 175
Block first atom: 20735
Blocpdb> 110 atoms in block 176
Block first atom: 20847
Blocpdb> 116 atoms in block 177
Block first atom: 20957
Blocpdb> 108 atoms in block 178
Block first atom: 21073
Blocpdb> 108 atoms in block 179
Block first atom: 21181
Blocpdb> 127 atoms in block 180
Block first atom: 21289
Blocpdb> 110 atoms in block 181
Block first atom: 21416
Blocpdb> 125 atoms in block 182
Block first atom: 21526
Blocpdb> 114 atoms in block 183
Block first atom: 21651
Blocpdb> 123 atoms in block 184
Block first atom: 21765
Blocpdb> 125 atoms in block 185
Block first atom: 21888
Blocpdb> 102 atoms in block 186
Block first atom: 22013
Blocpdb> 120 atoms in block 187
Block first atom: 22115
Blocpdb> 138 atoms in block 188
Block first atom: 22235
Blocpdb> 116 atoms in block 189
Block first atom: 22373
Blocpdb> 121 atoms in block 190
Block first atom: 22489
Blocpdb> 117 atoms in block 191
Block first atom: 22610
Blocpdb> 78 atoms in block 192
Block first atom: 22726
Blocpdb> 192 blocks.
Blocpdb> At most, 143 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 78 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 8035723 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 68412
Prepmat> Matrix trace = 17555460.0001
Prepmat> Last element read: 68412 68412 307.1652
Prepmat> 18529 lines saved.
Prepmat> 17215 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 22804
RTB> Total mass = 22804.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 22804
RTB> Number of blocks = 192
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 145262.5967
RTB> 44388 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1152
Diagstd> Nb of non-zero elements: 44388
Diagstd> Projected matrix trace = 145262.5967
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1152 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 145262.5967
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0006490 0.0010478 0.0032829 0.0047345
0.0100084 0.0168507 0.0388771 0.0597243 0.0737212
0.1510247 0.2093440 0.2553545 0.3668947 0.3849340
0.5045965 0.5140105 0.5947366 0.7010162 0.7652754
0.8472284 0.9042544 1.0546566 1.1822827 1.2200415
1.2741208 1.3976100 1.5132239 1.6373062 1.7310775
1.8854081 1.9837282 2.1895007 2.2436800 2.5229202
2.5825161 2.6179449 2.8408743 2.9492474 3.0808820
3.1922038 3.2253555 3.5355195 3.7216618 3.8460207
3.9135437 4.0314233 4.2578472 4.3901637 4.5128259
4.7299533 5.0033016 5.0248057 5.1502961 5.3897021
5.7074338 5.9025691 6.0646804 6.1748076 6.3855653
6.6489324 6.8668824 6.9030316 6.9902551 7.5006365
7.8075399 8.0661787 8.2322347 8.4989129 8.6683111
8.7568674 8.8383801 8.9542687 9.0851309 9.3475485
9.5665095 9.8042461 10.4305609 10.6736056 10.8036117
10.8674351 11.1274775 11.4486299 11.6110265 11.7709234
12.1431130 12.4192901 12.5306681 12.7188085 13.2209655
13.3055534 13.4778407 13.8248833 14.0172789 14.0796807
14.2110596 14.5730991 14.8581748 14.8798646 14.9969832
15.3855844
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034337 0.0034338 0.0034341 0.0034342
0.0034342 2.7663277 3.5150277 6.2219254 7.4719249
10.8636941 14.0962631 21.4112565 26.5381662 29.4843368
42.2006612 49.6850328 54.8740578 65.7757771 67.3733952
77.1378250 77.8540622 83.7447509 90.9199755 94.9957480
99.9529328 103.2620150 111.5195003 118.0744528 119.9451178
122.5746300 128.3773104 133.5816716 138.9505377 142.8741112
149.1069761 152.9453805 160.6822201 162.6581157 172.4832944
174.5085847 175.7015259 183.0295813 186.4879960 190.6043530
194.0173573 195.0222113 204.1840890 209.4902093 212.9614969
214.8227994 218.0341297 224.0734071 227.5284121 230.6851148
236.1694444 242.8978216 243.4192476 246.4401026 252.1027953
259.4273281 263.8249229 267.4232965 269.8404144 274.4068535
280.0085146 284.5608087 285.3088290 287.1056859 297.4023117
303.4257169 308.4105321 311.5689367 316.5752587 319.7146411
321.3436092 322.8357479 324.9453612 327.3112063 332.0046324
335.8706339 340.0183715 350.7107771 354.7732419 356.9272973
357.9800370 362.2376952 367.4278227 370.0245918 372.5637084
378.4079908 382.6869626 384.3991281 387.2741368 394.8452028
396.1063007 398.6625499 403.7625335 406.5623303 407.4662884
409.3629280 414.5445782 418.5795547 418.8849619 420.5302423
425.9437776
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 22804
Rtb_to_modes> Number of blocs = 192
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4896E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0478E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2829E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7345E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6851E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8877E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3721E-02
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1510
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2093
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2554
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3849
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7010
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8472
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.182
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.220
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.637
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.731
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.885
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.244
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.841
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.081
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.225
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.722
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.846
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.031
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.730
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.003
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.025
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.150
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.707
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.065
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.386
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.867
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.990
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.808
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.232
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.499
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.757
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.954
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.085
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.348
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.567
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.804
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99994 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 1.00005 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998
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1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 410472 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99994 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 1.00005 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998
0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211743312925232.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211743312925232.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610211743312925232.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610211743312925232.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2870
First residue number = 1
Last residue number = 1435
Number of atoms found = 22804
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4896E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0478E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2829E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6851E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8877E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9724E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3721E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1510
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2093
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39
Bfactors> 106 vectors, 68412 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000649
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.025 for 2870 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.235 +/- 3.63
Bfactors> = 0.666 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= -1.570
Bfactors> Scaling-fct= 0.048
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211743312925232.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211743312925232.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.515
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.222
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.472
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.48
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.20
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.88
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0
Chkmod> 106 vectors, 68412 coordinates in file.
Chkmod> That is: 22804 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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MODEL 7 will be plotted
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getting mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2610211743312925232.11.pdb
2610211743312925232.7.pdb
2610211743312925232.8.pdb
2610211743312925232.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 8m2.658s
user 8m0.534s
sys 0m1.936s
rm: cannot remove '2610211743312925232.sdijf': No such file or directory
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