CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  AtTPS5  ***

LOGs for ID: 2610211919292948916

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610211919292948916.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610211919292948916.atom to be opened. Openam> File opened: 2610211919292948916.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 862 First residue number = 1 Last residue number = 862 Number of atoms found = 6854 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 5.057653 +/- 22.754079 From: -41.734000 To: 69.381000 = 3.408699 +/- 13.410798 From: -28.960000 To: 49.018000 = -6.190609 +/- 23.137182 From: -85.864000 To: 45.392000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1625 % Filled. Pdbmat> 2457700 non-zero elements. Pdbmat> 268559 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.37 +/- 25.80 Maximum number = 133 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.371180E+06 Pdbmat> Larger element = 512.556 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 862 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610211919292948916.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610211919292948916.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610211919292948916.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6854 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 862 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 42 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 81 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 112 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 158 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 202 Blocpdb> 30 atoms in block 7 Block first atom: 249 Blocpdb> 38 atoms in block 8 Block first atom: 279 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 317 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 357 Blocpdb> 32 atoms in block 11 Block first atom: 390 Blocpdb> 37 atoms in block 12 Block first atom: 422 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 459 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 501 Blocpdb> 44 atoms in block 15 Block first atom: 537 Blocpdb> 32 atoms in block 16 Block first atom: 581 Blocpdb> 45 atoms in block 17 Block first atom: 613 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 658 Blocpdb> 42 atoms in block 19 Block first atom: 696 Blocpdb> 40 atoms in block 20 Block first atom: 738 Blocpdb> 39 atoms in block 21 Block first atom: 778 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 817 Blocpdb> 43 atoms in block 23 Block first atom: 855 Blocpdb> 40 atoms in block 24 Block first atom: 898 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 938 Blocpdb> 44 atoms in block 26 Block first atom: 979 Blocpdb> 34 atoms in block 27 Block first atom: 1023 Blocpdb> 43 atoms in block 28 Block first atom: 1057 Blocpdb> 47 atoms in block 29 Block first atom: 1100 Blocpdb> 43 atoms in block 30 Block first atom: 1147 Blocpdb> 50 atoms in block 31 Block first atom: 1190 Blocpdb> 48 atoms in block 32 Block first atom: 1240 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1288 Blocpdb> 31 atoms in block 34 Block first atom: 1326 Blocpdb> 47 atoms in block 35 Block first atom: 1357 Blocpdb> 48 atoms in block 36 Block first atom: 1404 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1452 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1490 Blocpdb> 39 atoms in block 39 Block first atom: 1531 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1570 Blocpdb> 49 atoms in block 41 Block first atom: 1607 Blocpdb> 46 atoms in block 42 Block first atom: 1656 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1702 Blocpdb> 50 atoms in block 44 Block first atom: 1742 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 1792 Blocpdb> 44 atoms in block 46 Block first atom: 1835 Blocpdb> 37 atoms in block 47 Block first atom: 1879 Blocpdb> 46 atoms in block 48 Block first atom: 1916 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 1962 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 2002 Blocpdb> 34 atoms in block 51 Block first atom: 2046 Blocpdb> 39 atoms in block 52 Block first atom: 2080 Blocpdb> 48 atoms in block 53 Block first atom: 2119 Blocpdb> 45 atoms in block 54 Block first atom: 2167 Blocpdb> 35 atoms in block 55 Block first atom: 2212 Blocpdb> 34 atoms in block 56 Block first atom: 2247 Blocpdb> 47 atoms in block 57 Block first atom: 2281 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 2328 Blocpdb> 48 atoms in block 59 Block first atom: 2359 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 2407 Blocpdb> 34 atoms in block 61 Block first atom: 2444 Blocpdb> 41 atoms in block 62 Block first atom: 2478 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2519 Blocpdb> 39 atoms in block 64 Block first atom: 2558 Blocpdb> 37 atoms in block 65 Block first atom: 2597 Blocpdb> 45 atoms in block 66 Block first atom: 2634 Blocpdb> 45 atoms in block 67 Block first atom: 2679 Blocpdb> 34 atoms in block 68 Block first atom: 2724 Blocpdb> 40 atoms in block 69 Block first atom: 2758 Blocpdb> 38 atoms in block 70 Block first atom: 2798 Blocpdb> 38 atoms in block 71 Block first atom: 2836 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 2874 Blocpdb> 42 atoms in block 73 Block first atom: 2916 Blocpdb> 42 atoms in block 74 Block first atom: 2958 Blocpdb> 39 atoms in block 75 Block first atom: 3000 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 3039 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 3075 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 3111 Blocpdb> 36 atoms in block 79 Block first atom: 3152 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3188 Blocpdb> 40 atoms in block 81 Block first atom: 3230 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3270 Blocpdb> 37 atoms in block 83 Block first atom: 3313 Blocpdb> 39 atoms in block 84 Block first atom: 3350 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3389 Blocpdb> 44 atoms in block 86 Block first atom: 3439 Blocpdb> 34 atoms in block 87 Block first atom: 3483 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3517 Blocpdb> 36 atoms in block 89 Block first atom: 3554 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 3590 Blocpdb> 42 atoms in block 91 Block first atom: 3638 Blocpdb> 36 atoms in block 92 Block first atom: 3680 Blocpdb> 36 atoms in block 93 Block first atom: 3716 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 3752 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 3786 Blocpdb> 37 atoms in block 96 Block first atom: 3823 Blocpdb> 35 atoms in block 97 Block first atom: 3860 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 3895 Blocpdb> 39 atoms in block 99 Block first atom: 3926 Blocpdb> 45 atoms in block 100 Block first atom: 3965 Blocpdb> 33 atoms in block 101 Block first atom: 4010 Blocpdb> 41 atoms in block 102 Block first atom: 4043 Blocpdb> 35 atoms in block 103 Block first atom: 4084 Blocpdb> 46 atoms in block 104 Block first atom: 4119 Blocpdb> 48 atoms in block 105 Block first atom: 4165 Blocpdb> 41 atoms in block 106 Block first atom: 4213 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4254 Blocpdb> 47 atoms in block 108 Block first atom: 4296 Blocpdb> 42 atoms in block 109 Block first atom: 4343 Blocpdb> 34 atoms in block 110 Block first atom: 4385 Blocpdb> 48 atoms in block 111 Block first atom: 4419 Blocpdb> 36 atoms in block 112 Block first atom: 4467 Blocpdb> 38 atoms in block 113 Block first atom: 4503 Blocpdb> 38 atoms in block 114 Block first atom: 4541 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 4579 Blocpdb> 40 atoms in block 116 Block first atom: 4620 Blocpdb> 36 atoms in block 117 Block first atom: 4660 Blocpdb> 48 atoms in block 118 Block first atom: 4696 Blocpdb> 40 atoms in block 119 Block first atom: 4744 Blocpdb> 40 atoms in block 120 Block first atom: 4784 Blocpdb> 38 atoms in block 121 Block first atom: 4824 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 4862 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 4898 Blocpdb> 40 atoms in block 124 Block first atom: 4939 Blocpdb> 36 atoms in block 125 Block first atom: 4979 Blocpdb> 40 atoms in block 126 Block first atom: 5015 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5055 Blocpdb> 43 atoms in block 128 Block first atom: 5095 Blocpdb> 45 atoms in block 129 Block first atom: 5138 Blocpdb> 37 atoms in block 130 Block first atom: 5183 Blocpdb> 32 atoms in block 131 Block first atom: 5220 Blocpdb> 40 atoms in block 132 Block first atom: 5252 Blocpdb> 45 atoms in block 133 Block first atom: 5292 Blocpdb> 41 atoms in block 134 Block first atom: 5337 Blocpdb> 36 atoms in block 135 Block first atom: 5378 Blocpdb> 37 atoms in block 136 Block first atom: 5414 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 5451 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 5496 Blocpdb> 43 atoms in block 139 Block first atom: 5538 Blocpdb> 32 atoms in block 140 Block first atom: 5581 Blocpdb> 42 atoms in block 141 Block first atom: 5613 Blocpdb> 41 atoms in block 142 Block first atom: 5655 Blocpdb> 45 atoms in block 143 Block first atom: 5696 Blocpdb> 38 atoms in block 144 Block first atom: 5741 Blocpdb> 35 atoms in block 145 Block first atom: 5779 Blocpdb> 44 atoms in block 146 Block first atom: 5814 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 5858 Blocpdb> 37 atoms in block 148 Block first atom: 5896 Blocpdb> 33 atoms in block 149 Block first atom: 5933 Blocpdb> 42 atoms in block 150 Block first atom: 5966 Blocpdb> 36 atoms in block 151 Block first atom: 6008 Blocpdb> 36 atoms in block 152 Block first atom: 6044 Blocpdb> 40 atoms in block 153 Block first atom: 6080 Blocpdb> 39 atoms in block 154 Block first atom: 6120 Blocpdb> 39 atoms in block 155 Block first atom: 6159 Blocpdb> 43 atoms in block 156 Block first atom: 6198 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 6241 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 6274 Blocpdb> 43 atoms in block 159 Block first atom: 6316 Blocpdb> 36 atoms in block 160 Block first atom: 6359 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 6395 Blocpdb> 36 atoms in block 162 Block first atom: 6425 Blocpdb> 36 atoms in block 163 Block first atom: 6461 Blocpdb> 35 atoms in block 164 Block first atom: 6497 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 6532 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 6579 Blocpdb> 44 atoms in block 167 Block first atom: 6615 Blocpdb> 33 atoms in block 168 Block first atom: 6659 Blocpdb> 34 atoms in block 169 Block first atom: 6692 Blocpdb> 38 atoms in block 170 Block first atom: 6726 Blocpdb> 33 atoms in block 171 Block first atom: 6764 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 6797 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 6834 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 50 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2457873 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20562 Prepmat> Matrix trace = 5371180.0000 Prepmat> Last element read: 20562 20562 36.5068 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 13589 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6854 RTB> Total mass = 6854.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6854 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 182754.5556 RTB> 50037 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50037 Diagstd> Projected matrix trace = 182754.5556 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 182754.5556 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0005472 0.0011839 0.0058239 0.0096912 0.0196632 0.0236392 0.0303972 0.0354603 0.0663161 0.0783149 0.1068971 0.1627265 0.1682772 0.2128037 0.2185621 0.2561473 0.2847458 0.3804451 0.4337533 0.5389534 0.5467712 0.6536065 0.7506362 0.7528405 0.7715913 1.0458081 1.5331757 1.5721371 1.6669322 1.6961335 1.8026870 1.9336470 2.0381323 2.2901106 2.5760007 2.6640794 2.7471595 2.8455923 3.2607935 3.3422122 3.7995124 4.1302230 4.1960380 4.2564836 4.4095894 4.9093733 4.9785578 5.4269790 5.7444500 5.9456120 6.0697639 6.4917231 6.5710993 6.8117241 7.2285961 7.4011675 7.5377098 8.2920187 8.3254130 8.7502141 9.0131381 9.4031580 9.5860110 9.9168848 10.0918650 10.4932855 10.8182398 11.6829549 11.9408740 11.9596118 12.9191140 12.9875127 13.2947815 13.5122682 13.5248600 13.9333066 14.7233113 15.2214825 15.3380644 15.5987472 15.7268592 16.4034092 16.5932295 16.6449878 17.6574699 17.9289509 18.2598092 18.6059840 19.4543745 19.6219880 20.1641866 20.2366312 21.2314997 21.5510429 21.9085726 22.3326160 23.0269410 23.1856367 23.7484159 23.9252314 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034336 0.0034336 0.0034337 0.0034345 0.0034349 2.5401985 3.7363473 8.2870661 10.6901747 15.2272711 16.6959674 18.9326903 20.4487429 27.9643604 30.3890815 35.5040743 43.8050808 44.5459173 50.0939057 50.7671431 54.9591675 57.9460693 66.9794016 71.5182177 79.7206572 80.2967712 87.7917013 94.0827535 94.2207929 95.3869459 111.0506969 134.4594236 136.1571607 140.2020113 141.4247090 145.7993026 151.0024090 155.0284706 164.3325161 174.2883146 177.2429062 179.9853739 183.1815045 196.0906678 198.5236692 211.6699518 220.6896837 222.4410757 224.0375234 228.0312445 240.6070284 242.2964525 252.9731057 260.2672411 264.7851130 267.5353525 276.6784123 278.3647861 283.4156354 291.9592637 295.4237430 298.1363891 312.6982261 313.3272556 321.2215109 326.0117809 332.9907330 336.2127991 341.9659884 344.9697365 351.7637036 357.1688550 371.1689425 375.2436387 375.5379425 390.3117676 391.3436340 395.9459288 399.1713918 399.3573380 405.3427194 416.6755603 423.6661404 425.2854838 428.8842923 430.6418965 439.8072051 442.3446099 443.0339639 456.3095077 459.8039727 464.0271571 468.4050853 478.9651510 481.0240416 487.6246302 488.4997988 500.3634942 504.1147746 508.2791812 513.1745140 521.0907989 522.8833264 529.1911870 531.1575433 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6854 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4720E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1839E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8239E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6912E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9663E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3639E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0397E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5460E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6316E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8315E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2847 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.667 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.038 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.576 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.664 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.744 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.750 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.013 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.586 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.917 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 0.99994 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99996 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 123372 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 0.99994 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99996 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610211919292948916.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610211919292948916.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610211919292948916.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610211919292948916.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 862 First residue number = 1 Last residue number = 862 Number of atoms found = 6854 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4720E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1839E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8239E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6912E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9663E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3639E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0397E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5460E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6316E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8315E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2847 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.667 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.038 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.576 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.664 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.750 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.013 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.586 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.917 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Bfactors> 106 vectors, 20562 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000547 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.423 for 862 C-alpha atoms. Bfactors> = 7.162 +/- 51.74 Bfactors> = 0.858 +/- 0.18 Bfactors> Shiftng-fct= -6.305 Bfactors> Scaling-fct= 0.004 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610211919292948916.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610211919292948916.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2 Chkmod> 106 vectors, 20562 coordinates in file. Chkmod> That is: 6854 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 68 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9500 0.0034 0.8758 0.0034 0.6369 0.0034 0.6551 0.0034 0.6527 0.0034 0.6862 2.5401 0.0261 3.7362 0.0217 8.2867 0.0476 10.6897 0.0369 15.2266 0.0196 16.6952 0.0425 18.9318 0.0196 20.4478 0.0203 27.9631 0.0587 30.3878 0.0508 35.5030 0.0576 43.7996 0.2428 44.5470 0.2272 50.0913 0.0613 50.7694 0.0612 54.9517 0.0152 57.9389 0.5289 66.9726 0.0559 71.5190 0.0310 79.7207 0.2584 80.2954 0.2736 87.7875 0.0439 94.0764 0.0600 94.2142 0.0638 95.3834 0.0540 111.0561 0.0489 134.4459 0.0680 136.1454 0.2478 140.1988 0.2090 141.4131 0.1034 145.8057 0.3348 151.0097 0.6527 155.0168 0.0484 164.3215 0.1302 174.2808 0.1688 177.2327 0.1646 179.9724 0.0238 183.1868 0.5441 196.0885 0.0321 198.5088 0.4227 211.6744 0.1208 220.6743 0.1142 222.4305 0.0210 224.0152 0.0338 228.0321 0.1604 240.5876 0.1728 242.2968 0.0143 252.9627 0.1922 260.2459 0.1375 264.7824 0.2388 267.5291 0.3772 276.6724 0.1015 278.3507 0.1051 283.4092 0.0575 291.9549 0.2494 295.4077 0.3462 298.1293 0.1639 312.6844 0.0652 313.3060 0.4828 321.2038 0.4450 325.9953 0.3019 332.9736 0.0493 336.1982 0.4153 341.9533 0.3010 344.9231 0.0921 351.6935 0.2591 357.1826 0.1760 371.1061 0.2573 375.2138 0.0727 375.5279 0.1770 390.3084 0.3172 391.3643 0.0543 395.8577 0.2800 399.1208 0.0638 399.2684 0.2709 405.2772 0.3484 416.6108 0.0900 423.6273 0.2543 425.2941 0.4541 428.8831 0.3351 430.6664 0.1264 439.7426 0.2335 442.2826 0.0240 442.9486 0.0219 456.3226 0.0391 459.7977 0.0340 464.0097 0.5474 468.4355 0.2713 478.8907 0.3975 480.9790 0.3306 487.5531 0.0774 488.5195 0.0939 500.3243 0.2790 504.0809 0.3891 508.2739 0.2904 513.1224 0.4947 521.1030 0.3573 522.9101 0.5298 529.1861 0.3160 531.1877 0.0657 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom making animated gifs 11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom making animated gifs 11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom making animated gifs 11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom making animated gifs 11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211919292948916.eigenfacs 2610211919292948916.atom making animated gifs 11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610211919292948916.10.pdb 2610211919292948916.11.pdb 2610211919292948916.7.pdb 2610211919292948916.8.pdb 2610211919292948916.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m41.905s user 0m41.473s sys 0m0.417s rm: cannot remove '2610211919292948916.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.