***  AtTPS5  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610211919292948916.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610211919292948916.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610211919292948916.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 862
First residue number = 1
Last residue number = 862
Number of atoms found = 6854
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 5.057653 +/- 22.754079 From: -41.734000 To: 69.381000
= 3.408699 +/- 13.410798 From: -28.960000 To: 49.018000
= -6.190609 +/- 23.137182 From: -85.864000 To: 45.392000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.1625 % Filled.
Pdbmat> 2457700 non-zero elements.
Pdbmat> 268559 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.37 +/- 25.80
Maximum number = 133
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 5.371180E+06
Pdbmat> Larger element = 512.556
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
862 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610211919292948916.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610211919292948916.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610211919292948916.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6854 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 862 residues.
Blocpdb> 38 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 42 atoms in block 2
Block first atom: 39
Blocpdb> 31 atoms in block 3
Block first atom: 81
Blocpdb> 46 atoms in block 4
Block first atom: 112
Blocpdb> 44 atoms in block 5
Block first atom: 158
Blocpdb> 47 atoms in block 6
Block first atom: 202
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 249
Blocpdb> 38 atoms in block 8
Block first atom: 279
Blocpdb> 40 atoms in block 9
Block first atom: 317
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 357
Blocpdb> 32 atoms in block 11
Block first atom: 390
Blocpdb> 37 atoms in block 12
Block first atom: 422
Blocpdb> 42 atoms in block 13
Block first atom: 459
Blocpdb> 36 atoms in block 14
Block first atom: 501
Blocpdb> 44 atoms in block 15
Block first atom: 537
Blocpdb> 32 atoms in block 16
Block first atom: 581
Blocpdb> 45 atoms in block 17
Block first atom: 613
Blocpdb> 38 atoms in block 18
Block first atom: 658
Blocpdb> 42 atoms in block 19
Block first atom: 696
Blocpdb> 40 atoms in block 20
Block first atom: 738
Blocpdb> 39 atoms in block 21
Block first atom: 778
Blocpdb> 38 atoms in block 22
Block first atom: 817
Blocpdb> 43 atoms in block 23
Block first atom: 855
Blocpdb> 40 atoms in block 24
Block first atom: 898
Blocpdb> 41 atoms in block 25
Block first atom: 938
Blocpdb> 44 atoms in block 26
Block first atom: 979
Blocpdb> 34 atoms in block 27
Block first atom: 1023
Blocpdb> 43 atoms in block 28
Block first atom: 1057
Blocpdb> 47 atoms in block 29
Block first atom: 1100
Blocpdb> 43 atoms in block 30
Block first atom: 1147
Blocpdb> 50 atoms in block 31
Block first atom: 1190
Blocpdb> 48 atoms in block 32
Block first atom: 1240
Blocpdb> 38 atoms in block 33
Block first atom: 1288
Blocpdb> 31 atoms in block 34
Block first atom: 1326
Blocpdb> 47 atoms in block 35
Block first atom: 1357
Blocpdb> 48 atoms in block 36
Block first atom: 1404
Blocpdb> 38 atoms in block 37
Block first atom: 1452
Blocpdb> 41 atoms in block 38
Block first atom: 1490
Blocpdb> 39 atoms in block 39
Block first atom: 1531
Blocpdb> 37 atoms in block 40
Block first atom: 1570
Blocpdb> 49 atoms in block 41
Block first atom: 1607
Blocpdb> 46 atoms in block 42
Block first atom: 1656
Blocpdb> 40 atoms in block 43
Block first atom: 1702
Blocpdb> 50 atoms in block 44
Block first atom: 1742
Blocpdb> 43 atoms in block 45
Block first atom: 1792
Blocpdb> 44 atoms in block 46
Block first atom: 1835
Blocpdb> 37 atoms in block 47
Block first atom: 1879
Blocpdb> 46 atoms in block 48
Block first atom: 1916
Blocpdb> 40 atoms in block 49
Block first atom: 1962
Blocpdb> 44 atoms in block 50
Block first atom: 2002
Blocpdb> 34 atoms in block 51
Block first atom: 2046
Blocpdb> 39 atoms in block 52
Block first atom: 2080
Blocpdb> 48 atoms in block 53
Block first atom: 2119
Blocpdb> 45 atoms in block 54
Block first atom: 2167
Blocpdb> 35 atoms in block 55
Block first atom: 2212
Blocpdb> 34 atoms in block 56
Block first atom: 2247
Blocpdb> 47 atoms in block 57
Block first atom: 2281
Blocpdb> 31 atoms in block 58
Block first atom: 2328
Blocpdb> 48 atoms in block 59
Block first atom: 2359
Blocpdb> 37 atoms in block 60
Block first atom: 2407
Blocpdb> 34 atoms in block 61
Block first atom: 2444
Blocpdb> 41 atoms in block 62
Block first atom: 2478
Blocpdb> 39 atoms in block 63
Block first atom: 2519
Blocpdb> 39 atoms in block 64
Block first atom: 2558
Blocpdb> 37 atoms in block 65
Block first atom: 2597
Blocpdb> 45 atoms in block 66
Block first atom: 2634
Blocpdb> 45 atoms in block 67
Block first atom: 2679
Blocpdb> 34 atoms in block 68
Block first atom: 2724
Blocpdb> 40 atoms in block 69
Block first atom: 2758
Blocpdb> 38 atoms in block 70
Block first atom: 2798
Blocpdb> 38 atoms in block 71
Block first atom: 2836
Blocpdb> 42 atoms in block 72
Block first atom: 2874
Blocpdb> 42 atoms in block 73
Block first atom: 2916
Blocpdb> 42 atoms in block 74
Block first atom: 2958
Blocpdb> 39 atoms in block 75
Block first atom: 3000
Blocpdb> 36 atoms in block 76
Block first atom: 3039
Blocpdb> 36 atoms in block 77
Block first atom: 3075
Blocpdb> 41 atoms in block 78
Block first atom: 3111
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 3152
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3188
Blocpdb> 40 atoms in block 81
Block first atom: 3230
Blocpdb> 43 atoms in block 82
Block first atom: 3270
Blocpdb> 37 atoms in block 83
Block first atom: 3313
Blocpdb> 39 atoms in block 84
Block first atom: 3350
Blocpdb> 50 atoms in block 85
Block first atom: 3389
Blocpdb> 44 atoms in block 86
Block first atom: 3439
Blocpdb> 34 atoms in block 87
Block first atom: 3483
Blocpdb> 37 atoms in block 88
Block first atom: 3517
Blocpdb> 36 atoms in block 89
Block first atom: 3554
Blocpdb> 48 atoms in block 90
Block first atom: 3590
Blocpdb> 42 atoms in block 91
Block first atom: 3638
Blocpdb> 36 atoms in block 92
Block first atom: 3680
Blocpdb> 36 atoms in block 93
Block first atom: 3716
Blocpdb> 34 atoms in block 94
Block first atom: 3752
Blocpdb> 37 atoms in block 95
Block first atom: 3786
Blocpdb> 37 atoms in block 96
Block first atom: 3823
Blocpdb> 35 atoms in block 97
Block first atom: 3860
Blocpdb> 31 atoms in block 98
Block first atom: 3895
Blocpdb> 39 atoms in block 99
Block first atom: 3926
Blocpdb> 45 atoms in block 100
Block first atom: 3965
Blocpdb> 33 atoms in block 101
Block first atom: 4010
Blocpdb> 41 atoms in block 102
Block first atom: 4043
Blocpdb> 35 atoms in block 103
Block first atom: 4084
Blocpdb> 46 atoms in block 104
Block first atom: 4119
Blocpdb> 48 atoms in block 105
Block first atom: 4165
Blocpdb> 41 atoms in block 106
Block first atom: 4213
Blocpdb> 42 atoms in block 107
Block first atom: 4254
Blocpdb> 47 atoms in block 108
Block first atom: 4296
Blocpdb> 42 atoms in block 109
Block first atom: 4343
Blocpdb> 34 atoms in block 110
Block first atom: 4385
Blocpdb> 48 atoms in block 111
Block first atom: 4419
Blocpdb> 36 atoms in block 112
Block first atom: 4467
Blocpdb> 38 atoms in block 113
Block first atom: 4503
Blocpdb> 38 atoms in block 114
Block first atom: 4541
Blocpdb> 41 atoms in block 115
Block first atom: 4579
Blocpdb> 40 atoms in block 116
Block first atom: 4620
Blocpdb> 36 atoms in block 117
Block first atom: 4660
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 4696
Blocpdb> 40 atoms in block 119
Block first atom: 4744
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 4784
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 4824
Blocpdb> 36 atoms in block 122
Block first atom: 4862
Blocpdb> 41 atoms in block 123
Block first atom: 4898
Blocpdb> 40 atoms in block 124
Block first atom: 4939
Blocpdb> 36 atoms in block 125
Block first atom: 4979
Blocpdb> 40 atoms in block 126
Block first atom: 5015
Blocpdb> 40 atoms in block 127
Block first atom: 5055
Blocpdb> 43 atoms in block 128
Block first atom: 5095
Blocpdb> 45 atoms in block 129
Block first atom: 5138
Blocpdb> 37 atoms in block 130
Block first atom: 5183
Blocpdb> 32 atoms in block 131
Block first atom: 5220
Blocpdb> 40 atoms in block 132
Block first atom: 5252
Blocpdb> 45 atoms in block 133
Block first atom: 5292
Blocpdb> 41 atoms in block 134
Block first atom: 5337
Blocpdb> 36 atoms in block 135
Block first atom: 5378
Blocpdb> 37 atoms in block 136
Block first atom: 5414
Blocpdb> 45 atoms in block 137
Block first atom: 5451
Blocpdb> 42 atoms in block 138
Block first atom: 5496
Blocpdb> 43 atoms in block 139
Block first atom: 5538
Blocpdb> 32 atoms in block 140
Block first atom: 5581
Blocpdb> 42 atoms in block 141
Block first atom: 5613
Blocpdb> 41 atoms in block 142
Block first atom: 5655
Blocpdb> 45 atoms in block 143
Block first atom: 5696
Blocpdb> 38 atoms in block 144
Block first atom: 5741
Blocpdb> 35 atoms in block 145
Block first atom: 5779
Blocpdb> 44 atoms in block 146
Block first atom: 5814
Blocpdb> 38 atoms in block 147
Block first atom: 5858
Blocpdb> 37 atoms in block 148
Block first atom: 5896
Blocpdb> 33 atoms in block 149
Block first atom: 5933
Blocpdb> 42 atoms in block 150
Block first atom: 5966
Blocpdb> 36 atoms in block 151
Block first atom: 6008
Blocpdb> 36 atoms in block 152
Block first atom: 6044
Blocpdb> 40 atoms in block 153
Block first atom: 6080
Blocpdb> 39 atoms in block 154
Block first atom: 6120
Blocpdb> 39 atoms in block 155
Block first atom: 6159
Blocpdb> 43 atoms in block 156
Block first atom: 6198
Blocpdb> 33 atoms in block 157
Block first atom: 6241
Blocpdb> 42 atoms in block 158
Block first atom: 6274
Blocpdb> 43 atoms in block 159
Block first atom: 6316
Blocpdb> 36 atoms in block 160
Block first atom: 6359
Blocpdb> 30 atoms in block 161
Block first atom: 6395
Blocpdb> 36 atoms in block 162
Block first atom: 6425
Blocpdb> 36 atoms in block 163
Block first atom: 6461
Blocpdb> 35 atoms in block 164
Block first atom: 6497
Blocpdb> 47 atoms in block 165
Block first atom: 6532
Blocpdb> 36 atoms in block 166
Block first atom: 6579
Blocpdb> 44 atoms in block 167
Block first atom: 6615
Blocpdb> 33 atoms in block 168
Block first atom: 6659
Blocpdb> 34 atoms in block 169
Block first atom: 6692
Blocpdb> 38 atoms in block 170
Block first atom: 6726
Blocpdb> 33 atoms in block 171
Block first atom: 6764
Blocpdb> 38 atoms in block 172
Block first atom: 6797
Blocpdb> 20 atoms in block 173
Block first atom: 6834
Blocpdb> 173 blocks.
Blocpdb> At most, 50 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2457873 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 20562
Prepmat> Matrix trace = 5371180.0000
Prepmat> Last element read: 20562 20562 36.5068
Prepmat> 15052 lines saved.
Prepmat> 13589 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6854
RTB> Total mass = 6854.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6854
RTB> Number of blocks = 173
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 182754.5556
RTB> 50037 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1038
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50037
Diagstd> Projected matrix trace = 182754.5556
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1038 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 182754.5556
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0005472 0.0011839 0.0058239 0.0096912
0.0196632 0.0236392 0.0303972 0.0354603 0.0663161
0.0783149 0.1068971 0.1627265 0.1682772 0.2128037
0.2185621 0.2561473 0.2847458 0.3804451 0.4337533
0.5389534 0.5467712 0.6536065 0.7506362 0.7528405
0.7715913 1.0458081 1.5331757 1.5721371 1.6669322
1.6961335 1.8026870 1.9336470 2.0381323 2.2901106
2.5760007 2.6640794 2.7471595 2.8455923 3.2607935
3.3422122 3.7995124 4.1302230 4.1960380 4.2564836
4.4095894 4.9093733 4.9785578 5.4269790 5.7444500
5.9456120 6.0697639 6.4917231 6.5710993 6.8117241
7.2285961 7.4011675 7.5377098 8.2920187 8.3254130
8.7502141 9.0131381 9.4031580 9.5860110 9.9168848
10.0918650 10.4932855 10.8182398 11.6829549 11.9408740
11.9596118 12.9191140 12.9875127 13.2947815 13.5122682
13.5248600 13.9333066 14.7233113 15.2214825 15.3380644
15.5987472 15.7268592 16.4034092 16.5932295 16.6449878
17.6574699 17.9289509 18.2598092 18.6059840 19.4543745
19.6219880 20.1641866 20.2366312 21.2314997 21.5510429
21.9085726 22.3326160 23.0269410 23.1856367 23.7484159
23.9252314
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034336 0.0034336 0.0034337 0.0034345
0.0034349 2.5401985 3.7363473 8.2870661 10.6901747
15.2272711 16.6959674 18.9326903 20.4487429 27.9643604
30.3890815 35.5040743 43.8050808 44.5459173 50.0939057
50.7671431 54.9591675 57.9460693 66.9794016 71.5182177
79.7206572 80.2967712 87.7917013 94.0827535 94.2207929
95.3869459 111.0506969 134.4594236 136.1571607 140.2020113
141.4247090 145.7993026 151.0024090 155.0284706 164.3325161
174.2883146 177.2429062 179.9853739 183.1815045 196.0906678
198.5236692 211.6699518 220.6896837 222.4410757 224.0375234
228.0312445 240.6070284 242.2964525 252.9731057 260.2672411
264.7851130 267.5353525 276.6784123 278.3647861 283.4156354
291.9592637 295.4237430 298.1363891 312.6982261 313.3272556
321.2215109 326.0117809 332.9907330 336.2127991 341.9659884
344.9697365 351.7637036 357.1688550 371.1689425 375.2436387
375.5379425 390.3117676 391.3436340 395.9459288 399.1713918
399.3573380 405.3427194 416.6755603 423.6661404 425.2854838
428.8842923 430.6418965 439.8072051 442.3446099 443.0339639
456.3095077 459.8039727 464.0271571 468.4050853 478.9651510
481.0240416 487.6246302 488.4997988 500.3634942 504.1147746
508.2791812 513.1745140 521.0907989 522.8833264 529.1911870
531.1575433
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6854
Rtb_to_modes> Number of blocs = 173
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4720E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1839E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8239E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6912E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9663E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3639E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0397E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5460E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6316E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8315E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1069
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2186
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2847
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3804
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7528
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7716
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.533
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.572
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.696
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.038
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.576
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.664
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.747
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.846
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.261
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.342
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.800
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.196
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.410
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.909
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.979
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.427
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.744
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.946
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.492
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.812
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.229
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.325
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.013
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.586
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999
1.00000 0.99994 0.99999 1.00002 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00004
1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002
1.00000 0.99996 0.99995 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 123372 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999
1.00000 0.99994 0.99999 1.00002 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00004
1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002
1.00000 0.99996 0.99995 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998
0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211919292948916.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211919292948916.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610211919292948916.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610211919292948916.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 862
First residue number = 1
Last residue number = 862
Number of atoms found = 6854
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4720E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1839E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8239E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6912E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9663E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3639E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0397E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5460E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6316E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8315E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1069
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2186
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2847
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3804
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7528
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7716
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.696
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.038
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.576
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.664
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.747
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.846
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.196
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.410
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.909
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.979
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.427
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.492
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.812
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.229
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.586
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.917
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93
Bfactors> 106 vectors, 20562 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000547
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.423 for 862 C-alpha atoms.
Bfactors> = 7.162 +/- 51.74
Bfactors> = 0.858 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= -6.305
Bfactors> Scaling-fct= 0.004
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211919292948916.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211919292948916.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.540
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.287
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2
Chkmod> 106 vectors, 20562 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6854 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 68 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9500
0.0034 0.8758
0.0034 0.6369
0.0034 0.6551
0.0034 0.6527
0.0034 0.6862
2.5401 0.0261
3.7362 0.0217
8.2867 0.0476
10.6897 0.0369
15.2266 0.0196
16.6952 0.0425
18.9318 0.0196
20.4478 0.0203
27.9631 0.0587
30.3878 0.0508
35.5030 0.0576
43.7996 0.2428
44.5470 0.2272
50.0913 0.0613
50.7694 0.0612
54.9517 0.0152
57.9389 0.5289
66.9726 0.0559
71.5190 0.0310
79.7207 0.2584
80.2954 0.2736
87.7875 0.0439
94.0764 0.0600
94.2142 0.0638
95.3834 0.0540
111.0561 0.0489
134.4459 0.0680
136.1454 0.2478
140.1988 0.2090
141.4131 0.1034
145.8057 0.3348
151.0097 0.6527
155.0168 0.0484
164.3215 0.1302
174.2808 0.1688
177.2327 0.1646
179.9724 0.0238
183.1868 0.5441
196.0885 0.0321
198.5088 0.4227
211.6744 0.1208
220.6743 0.1142
222.4305 0.0210
224.0152 0.0338
228.0321 0.1604
240.5876 0.1728
242.2968 0.0143
252.9627 0.1922
260.2459 0.1375
264.7824 0.2388
267.5291 0.3772
276.6724 0.1015
278.3507 0.1051
283.4092 0.0575
291.9549 0.2494
295.4077 0.3462
298.1293 0.1639
312.6844 0.0652
313.3060 0.4828
321.2038 0.4450
325.9953 0.3019
332.9736 0.0493
336.1982 0.4153
341.9533 0.3010
344.9231 0.0921
351.6935 0.2591
357.1826 0.1760
371.1061 0.2573
375.2138 0.0727
375.5279 0.1770
390.3084 0.3172
391.3643 0.0543
395.8577 0.2800
399.1208 0.0638
399.2684 0.2709
405.2772 0.3484
416.6108 0.0900
423.6273 0.2543
425.2941 0.4541
428.8831 0.3351
430.6664 0.1264
439.7426 0.2335
442.2826 0.0240
442.9486 0.0219
456.3226 0.0391
459.7977 0.0340
464.0097 0.5474
468.4355 0.2713
478.8907 0.3975
480.9790 0.3306
487.5531 0.0774
488.5195 0.0939
500.3243 0.2790
504.0809 0.3891
508.2739 0.2904
513.1224 0.4947
521.1030 0.3573
522.9101 0.5298
529.1861 0.3160
531.1877 0.0657
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919292948916 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919292948916.eigenfacs
2610211919292948916.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919292948916.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610211919292948916.10.pdb
2610211919292948916.11.pdb
2610211919292948916.7.pdb
2610211919292948916.8.pdb
2610211919292948916.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m41.905s
user 0m41.473s
sys 0m0.417s
rm: cannot remove '2610211919292948916.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|