*** AtTPS7 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610211919542949039.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610211919542949039.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610211919542949039.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 851
First residue number = 1
Last residue number = 851
Number of atoms found = 6794
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 5.148256 +/- 20.941809 From: -37.866000 To: 57.222000
= 4.557409 +/- 16.236050 From: -34.001000 To: 56.601000
= -4.447253 +/- 22.147819 From: -57.388000 To: 47.436000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.1822 % Filled.
Pdbmat> 2455756 non-zero elements.
Pdbmat> 268378 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.00 +/- 25.67
Maximum number = 134
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 5.367560E+06
Pdbmat> Larger element = 501.458
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
851 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610211919542949039.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610211919542949039.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610211919542949039.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6794 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 851 residues.
Blocpdb> 39 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 43 atoms in block 2
Block first atom: 40
Blocpdb> 31 atoms in block 3
Block first atom: 83
Blocpdb> 41 atoms in block 4
Block first atom: 114
Blocpdb> 46 atoms in block 5
Block first atom: 155
Blocpdb> 44 atoms in block 6
Block first atom: 201
Blocpdb> 33 atoms in block 7
Block first atom: 245
Blocpdb> 41 atoms in block 8
Block first atom: 278
Blocpdb> 39 atoms in block 9
Block first atom: 319
Blocpdb> 37 atoms in block 10
Block first atom: 358
Blocpdb> 35 atoms in block 11
Block first atom: 395
Blocpdb> 38 atoms in block 12
Block first atom: 430
Blocpdb> 36 atoms in block 13
Block first atom: 468
Blocpdb> 42 atoms in block 14
Block first atom: 504
Blocpdb> 43 atoms in block 15
Block first atom: 546
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 589
Blocpdb> 48 atoms in block 17
Block first atom: 627
Blocpdb> 42 atoms in block 18
Block first atom: 675
Blocpdb> 38 atoms in block 19
Block first atom: 717
Blocpdb> 40 atoms in block 20
Block first atom: 755
Blocpdb> 44 atoms in block 21
Block first atom: 795
Blocpdb> 31 atoms in block 22
Block first atom: 839
Blocpdb> 37 atoms in block 23
Block first atom: 870
Blocpdb> 41 atoms in block 24
Block first atom: 907
Blocpdb> 38 atoms in block 25
Block first atom: 948
Blocpdb> 43 atoms in block 26
Block first atom: 986
Blocpdb> 43 atoms in block 27
Block first atom: 1029
Blocpdb> 39 atoms in block 28
Block first atom: 1072
Blocpdb> 46 atoms in block 29
Block first atom: 1111
Blocpdb> 41 atoms in block 30
Block first atom: 1157
Blocpdb> 46 atoms in block 31
Block first atom: 1198
Blocpdb> 49 atoms in block 32
Block first atom: 1244
Blocpdb> 37 atoms in block 33
Block first atom: 1293
Blocpdb> 40 atoms in block 34
Block first atom: 1330
Blocpdb> 47 atoms in block 35
Block first atom: 1370
Blocpdb> 38 atoms in block 36
Block first atom: 1417
Blocpdb> 43 atoms in block 37
Block first atom: 1455
Blocpdb> 44 atoms in block 38
Block first atom: 1498
Blocpdb> 39 atoms in block 39
Block first atom: 1542
Blocpdb> 42 atoms in block 40
Block first atom: 1581
Blocpdb> 52 atoms in block 41
Block first atom: 1623
Blocpdb> 41 atoms in block 42
Block first atom: 1675
Blocpdb> 44 atoms in block 43
Block first atom: 1716
Blocpdb> 52 atoms in block 44
Block first atom: 1760
Blocpdb> 42 atoms in block 45
Block first atom: 1812
Blocpdb> 42 atoms in block 46
Block first atom: 1854
Blocpdb> 39 atoms in block 47
Block first atom: 1896
Blocpdb> 45 atoms in block 48
Block first atom: 1935
Blocpdb> 43 atoms in block 49
Block first atom: 1980
Blocpdb> 38 atoms in block 50
Block first atom: 2023
Blocpdb> 38 atoms in block 51
Block first atom: 2061
Blocpdb> 40 atoms in block 52
Block first atom: 2099
Blocpdb> 47 atoms in block 53
Block first atom: 2139
Blocpdb> 42 atoms in block 54
Block first atom: 2186
Blocpdb> 39 atoms in block 55
Block first atom: 2228
Blocpdb> 42 atoms in block 56
Block first atom: 2267
Blocpdb> 42 atoms in block 57
Block first atom: 2309
Blocpdb> 41 atoms in block 58
Block first atom: 2351
Blocpdb> 41 atoms in block 59
Block first atom: 2392
Blocpdb> 37 atoms in block 60
Block first atom: 2433
Blocpdb> 34 atoms in block 61
Block first atom: 2470
Blocpdb> 40 atoms in block 62
Block first atom: 2504
Blocpdb> 44 atoms in block 63
Block first atom: 2544
Blocpdb> 37 atoms in block 64
Block first atom: 2588
Blocpdb> 41 atoms in block 65
Block first atom: 2625
Blocpdb> 50 atoms in block 66
Block first atom: 2666
Blocpdb> 35 atoms in block 67
Block first atom: 2716
Blocpdb> 36 atoms in block 68
Block first atom: 2751
Blocpdb> 44 atoms in block 69
Block first atom: 2787
Blocpdb> 37 atoms in block 70
Block first atom: 2831
Blocpdb> 38 atoms in block 71
Block first atom: 2868
Blocpdb> 45 atoms in block 72
Block first atom: 2906
Blocpdb> 50 atoms in block 73
Block first atom: 2951
Blocpdb> 35 atoms in block 74
Block first atom: 3001
Blocpdb> 39 atoms in block 75
Block first atom: 3036
Blocpdb> 36 atoms in block 76
Block first atom: 3075
Blocpdb> 36 atoms in block 77
Block first atom: 3111
Blocpdb> 41 atoms in block 78
Block first atom: 3147
Blocpdb> 38 atoms in block 79
Block first atom: 3188
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3226
Blocpdb> 40 atoms in block 81
Block first atom: 3268
Blocpdb> 40 atoms in block 82
Block first atom: 3308
Blocpdb> 43 atoms in block 83
Block first atom: 3348
Blocpdb> 36 atoms in block 84
Block first atom: 3391
Blocpdb> 42 atoms in block 85
Block first atom: 3427
Blocpdb> 44 atoms in block 86
Block first atom: 3469
Blocpdb> 34 atoms in block 87
Block first atom: 3513
Blocpdb> 35 atoms in block 88
Block first atom: 3547
Blocpdb> 38 atoms in block 89
Block first atom: 3582
Blocpdb> 48 atoms in block 90
Block first atom: 3620
Blocpdb> 38 atoms in block 91
Block first atom: 3668
Blocpdb> 33 atoms in block 92
Block first atom: 3706
Blocpdb> 36 atoms in block 93
Block first atom: 3739
Blocpdb> 40 atoms in block 94
Block first atom: 3775
Blocpdb> 38 atoms in block 95
Block first atom: 3815
Blocpdb> 31 atoms in block 96
Block first atom: 3853
Blocpdb> 29 atoms in block 97
Block first atom: 3884
Blocpdb> 41 atoms in block 98
Block first atom: 3913
Blocpdb> 43 atoms in block 99
Block first atom: 3954
Blocpdb> 33 atoms in block 100
Block first atom: 3997
Blocpdb> 36 atoms in block 101
Block first atom: 4030
Blocpdb> 36 atoms in block 102
Block first atom: 4066
Blocpdb> 47 atoms in block 103
Block first atom: 4102
Blocpdb> 50 atoms in block 104
Block first atom: 4149
Blocpdb> 42 atoms in block 105
Block first atom: 4199
Blocpdb> 46 atoms in block 106
Block first atom: 4241
Blocpdb> 42 atoms in block 107
Block first atom: 4287
Blocpdb> 45 atoms in block 108
Block first atom: 4329
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 4374
Blocpdb> 46 atoms in block 110
Block first atom: 4413
Blocpdb> 38 atoms in block 111
Block first atom: 4459
Blocpdb> 43 atoms in block 112
Block first atom: 4497
Blocpdb> 35 atoms in block 113
Block first atom: 4540
Blocpdb> 46 atoms in block 114
Block first atom: 4575
Blocpdb> 35 atoms in block 115
Block first atom: 4621
Blocpdb> 41 atoms in block 116
Block first atom: 4656
Blocpdb> 40 atoms in block 117
Block first atom: 4697
Blocpdb> 40 atoms in block 118
Block first atom: 4737
Blocpdb> 39 atoms in block 119
Block first atom: 4777
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 4816
Blocpdb> 36 atoms in block 121
Block first atom: 4856
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 4892
Blocpdb> 43 atoms in block 123
Block first atom: 4930
Blocpdb> 36 atoms in block 124
Block first atom: 4973
Blocpdb> 40 atoms in block 125
Block first atom: 5009
Blocpdb> 36 atoms in block 126
Block first atom: 5049
Blocpdb> 41 atoms in block 127
Block first atom: 5085
Blocpdb> 48 atoms in block 128
Block first atom: 5126
Blocpdb> 38 atoms in block 129
Block first atom: 5174
Blocpdb> 30 atoms in block 130
Block first atom: 5212
Blocpdb> 46 atoms in block 131
Block first atom: 5242
Blocpdb> 41 atoms in block 132
Block first atom: 5288
Blocpdb> 47 atoms in block 133
Block first atom: 5329
Blocpdb> 32 atoms in block 134
Block first atom: 5376
Blocpdb> 43 atoms in block 135
Block first atom: 5408
Blocpdb> 41 atoms in block 136
Block first atom: 5451
Blocpdb> 40 atoms in block 137
Block first atom: 5492
Blocpdb> 41 atoms in block 138
Block first atom: 5532
Blocpdb> 32 atoms in block 139
Block first atom: 5573
Blocpdb> 41 atoms in block 140
Block first atom: 5605
Blocpdb> 43 atoms in block 141
Block first atom: 5646
Blocpdb> 44 atoms in block 142
Block first atom: 5689
Blocpdb> 32 atoms in block 143
Block first atom: 5733
Blocpdb> 40 atoms in block 144
Block first atom: 5765
Blocpdb> 43 atoms in block 145
Block first atom: 5805
Blocpdb> 35 atoms in block 146
Block first atom: 5848
Blocpdb> 36 atoms in block 147
Block first atom: 5883
Blocpdb> 36 atoms in block 148
Block first atom: 5919
Blocpdb> 43 atoms in block 149
Block first atom: 5955
Blocpdb> 36 atoms in block 150
Block first atom: 5998
Blocpdb> 32 atoms in block 151
Block first atom: 6034
Blocpdb> 43 atoms in block 152
Block first atom: 6066
Blocpdb> 29 atoms in block 153
Block first atom: 6109
Blocpdb> 36 atoms in block 154
Block first atom: 6138
Blocpdb> 40 atoms in block 155
Block first atom: 6174
Blocpdb> 39 atoms in block 156
Block first atom: 6214
Blocpdb> 39 atoms in block 157
Block first atom: 6253
Blocpdb> 37 atoms in block 158
Block first atom: 6292
Blocpdb> 36 atoms in block 159
Block first atom: 6329
Blocpdb> 41 atoms in block 160
Block first atom: 6365
Blocpdb> 39 atoms in block 161
Block first atom: 6406
Blocpdb> 29 atoms in block 162
Block first atom: 6445
Blocpdb> 40 atoms in block 163
Block first atom: 6474
Blocpdb> 46 atoms in block 164
Block first atom: 6514
Blocpdb> 39 atoms in block 165
Block first atom: 6560
Blocpdb> 36 atoms in block 166
Block first atom: 6599
Blocpdb> 37 atoms in block 167
Block first atom: 6635
Blocpdb> 31 atoms in block 168
Block first atom: 6672
Blocpdb> 44 atoms in block 169
Block first atom: 6703
Blocpdb> 39 atoms in block 170
Block first atom: 6747
Blocpdb> 9 atoms in block 171
Block first atom: 6785
Blocpdb> 171 blocks.
Blocpdb> At most, 52 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2455927 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 20382
Prepmat> Matrix trace = 5367560.0000
Prepmat> Last element read: 20382 20382 46.5096
Prepmat> 14707 lines saved.
Prepmat> 13262 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6794
RTB> Total mass = 6794.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6794
RTB> Number of blocks = 171
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 184495.3543
RTB> 49419 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1026
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49419
Diagstd> Projected matrix trace = 184495.3543
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1026 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 184495.3543
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0056499 0.0094710 0.0122837 0.0199862
0.0535213 0.0755390 0.0811047 0.1021316 0.1039882
0.1381991 0.1681420 0.1924705 0.2625069 0.3324249
0.3789295 0.5038830 0.5290421 0.5363818 0.7322391
0.8143182 0.9833353 1.0540885 1.1631172 1.2781170
1.4084215 1.7370169 1.8871919 2.0341385 2.0910715
2.1903743 2.3583695 2.4343782 2.7714332 3.1193343
3.5313811 3.7987076 3.9112078 4.4767915 4.5229985
5.1839765 5.2293440 5.4615926 5.6551609 5.9515874
6.1323046 6.4089157 6.6465280 7.6717134 7.8120409
8.0528296 8.3027268 8.7133465 9.2855200 9.7002717
9.9046228 10.2695974 10.5235551 10.9373962 11.0881193
11.8807676 12.1260701 12.8621202 12.9904318 13.8744405
14.3535726 14.4734033 14.8497875 15.5633301 16.1331287
16.4990941 16.6359897 16.8502616 17.2176953 17.8509907
18.3662377 19.0340033 19.2275302 19.3730931 19.7030027
20.0407940 20.4840431 20.8312074 20.9831172 21.4166140
22.3259598 22.5835452 22.9005368 22.9607828 23.6968622
23.9691590 24.2230760 24.2908166 25.3173824 25.7796155
26.0987057 26.2908266 26.6789809 27.1507716 27.5059238
27.7128021
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034310 0.0034326 0.0034337 0.0034339 0.0034341
0.0034344 8.1623600 10.5680236 12.0353862 15.3518317
25.1222551 29.8456321 30.9256086 34.7036680 35.0176755
40.3689843 44.5280263 47.6406141 55.6372512 62.6097597
66.8458585 77.0832739 78.9842313 79.5302428 92.9226805
97.9923914 107.6827420 111.4894628 117.1135158 122.7666990
128.8729024 143.1190013 149.1774971 154.8765062 157.0289486
160.7142731 166.7635793 169.4296093 180.7787967 191.7901235
204.0645543 211.6475345 214.7586811 229.7622716 230.9449678
247.2445867 248.3241082 253.7785605 258.2365819 264.9181336
268.9101149 274.9081145 279.9578821 300.7748127 303.5131647
308.1552236 312.9000647 320.5440889 330.9012409 338.2106122
341.7545068 347.9941874 352.2706981 359.1304687 361.5965053
374.2980204 378.1423481 389.4498696 391.3876100 404.4855577
411.4104190 413.1241772 418.4613963 428.3971221 436.1687824
441.0880881 442.9141969 445.7574431 450.5912868 458.8032043
465.3774988 473.7621380 476.1645193 477.9635335 482.0160385
486.1303568 491.4769120 495.6241977 497.4280637 502.5400573
513.0980327 516.0494743 519.6585912 520.3416932 528.6164837
531.6449327 534.4535007 535.2002871 546.3924390 551.3577689
554.7595219 556.7976585 560.8928424 565.8305195 569.5192370
571.6569663
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6794
Rtb_to_modes> Number of blocs = 171
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9829E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6499E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4710E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2284E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9986E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3521E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5539E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1105E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1021
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1040
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1382
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1681
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1925
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2625
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3324
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3789
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5039
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5364
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7322
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8143
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9833
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.054
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.278
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.408
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.737
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.887
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.034
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.434
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.771
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.531
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.799
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.911
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.477
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.184
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.229
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.462
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.655
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.952
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.132
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.409
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.647
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.672
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.812
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.303
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.713
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.286
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.905
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 0.99992 1.00002 1.00001
1.00005 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00004 0.99997 0.99996
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
1.00004 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997
1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00000
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
0.99999 0.99994 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 122292 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 0.99992 1.00002 1.00001
1.00005 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00004 0.99997 0.99996
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
1.00004 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997
1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00000
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
0.99999 0.99994 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211919542949039.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211919542949039.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610211919542949039.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610211919542949039.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 851
First residue number = 1
Last residue number = 851
Number of atoms found = 6794
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9829E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6499E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4710E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2284E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9986E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3521E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5539E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1105E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1021
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1040
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1681
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1925
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2625
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3324
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3789
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5364
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8143
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9833
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.054
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.408
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.887
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.434
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.771
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.799
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.477
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.523
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.184
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.229
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.462
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.952
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.132
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.409
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.647
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.672
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.812
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.053
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.286
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.905
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71
Bfactors> 106 vectors, 20382 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.005650
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.681 for 851 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.120 +/- 4.96
Bfactors> = 0.870 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= -0.250
Bfactors> Scaling-fct= 0.036
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211919542949039.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211919542949039.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.162
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6
Chkmod> 106 vectors, 20382 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6794 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6692
0.0034 0.8113
0.0034 0.8418
0.0034 0.7794
0.0034 0.8779
0.0034 0.9278
8.1620 0.0383
10.5676 0.0495
12.0350 0.0783
15.3511 0.0367
25.1211 0.0585
29.8444 0.0146
30.9243 0.0600
34.6968 0.0375
35.0182 0.0522
40.3674 0.0605
44.5205 0.0570
47.6422 0.6474
55.6341 0.5255
62.6047 0.0427
66.8404 0.0625
77.0813 0.0502
78.9777 0.0334
79.5282 0.6591
92.9162 0.0396
97.9871 0.0284
107.6762 0.0611
111.4800 0.0794
117.1026 0.0218
122.7558 0.0255
128.8481 0.0699
143.1122 0.6030
149.1635 0.0399
154.8646 0.7580
157.0195 0.0381
160.6936 0.3689
166.7434 0.0563
169.4092 0.5424
180.7569 0.0388
191.7716 0.4745
204.0448 0.6477
211.6466 0.0541
214.7438 0.0333
229.7578 0.1839
230.9351 0.2445
247.2345 0.1278
248.3053 0.1784
253.7771 0.3028
258.2218 0.0523
264.9159 0.1963
268.8919 0.0187
274.8981 0.3271
279.9558 0.3259
300.7675 0.2620
303.4993 0.0423
308.1453 0.1180
312.8918 0.2091
320.5240 0.5541
330.8956 0.1263
338.1914 0.1258
341.7463 0.2315
347.9861 0.2458
352.1961 0.4566
359.1578 0.0898
361.6116 0.3743
374.2699 0.1671
378.1874 0.3487
389.4011 0.3663
391.3643 0.1990
404.4035 0.2675
411.3416 0.1413
413.0579 0.2232
418.4464 0.2392
428.3329 0.3184
436.1078 0.0253
441.0813 0.3015
442.9486 0.0817
445.7348 0.2461
450.6021 0.1898
458.7708 0.2808
465.4052 0.0277
473.6920 0.1135
476.1747 0.2294
477.9049 0.3439
481.9586 0.0731
486.0999 0.2771
491.4073 0.1804
495.5886 0.2976
497.3698 0.4626
502.5582 0.1627
513.1224 0.1788
515.9868 0.3620
519.6302 0.0499
520.3105 0.2845
528.6288 0.4256
531.6314 0.3471
534.3966 0.0335
535.1683 0.4589
546.3972 0.4409
551.3382 0.2319
554.7495 0.4290
556.7650 0.3600
560.8795 0.2473
565.7982 0.0377
569.5370 0.3436
571.6035 0.3186
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919542949039 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919542949039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919542949039 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919542949039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919542949039 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919542949039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919542949039 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919542949039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211919542949039 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211919542949039.eigenfacs
2610211919542949039.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211919542949039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211919542949039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610211919542949039.10.pdb
2610211919542949039.11.pdb
2610211919542949039.7.pdb
2610211919542949039.8.pdb
2610211919542949039.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m41.559s
user 0m41.162s
sys 0m0.342s
rm: cannot remove '2610211919542949039.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
