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***  AtTPS8  ***

LOGs for ID: 2610211920142949252

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610211920142949252.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610211920142949252.atom to be opened. Openam> File opened: 2610211920142949252.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1562 First residue number = 57 Last residue number = 837 Number of atoms found = 12600 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 112.513115 +/- 23.340765 From: 58.117000 To: 166.469000 = 112.518241 +/- 21.112587 From: 61.831000 To: 164.195000 = 115.731917 +/- 20.702149 From: 72.523000 To: 164.839000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6388 % Filled. Pdbmat> 4563523 non-zero elements. Pdbmat> 498747 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.17 +/- 19.97 Maximum number = 128 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 9.974940E+06 Pdbmat> Larger element = 495.342 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1562 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610211920142949252.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610211920142949252.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610211920142949252.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12600 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1562 residues. Blocpdb> 65 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 66 atoms in block 2 Block first atom: 66 Blocpdb> 62 atoms in block 3 Block first atom: 132 Blocpdb> 72 atoms in block 4 Block first atom: 194 Blocpdb> 68 atoms in block 5 Block first atom: 266 Blocpdb> 68 atoms in block 6 Block first atom: 334 Blocpdb> 56 atoms in block 7 Block first atom: 402 Blocpdb> 67 atoms in block 8 Block first atom: 458 Blocpdb> 69 atoms in block 9 Block first atom: 525 Blocpdb> 58 atoms in block 10 Block first atom: 594 Blocpdb> 75 atoms in block 11 Block first atom: 652 Blocpdb> 65 atoms in block 12 Block first atom: 727 Blocpdb> 78 atoms in block 13 Block first atom: 792 Blocpdb> 63 atoms in block 14 Block first atom: 870 Blocpdb> 83 atoms in block 15 Block first atom: 933 Blocpdb> 60 atoms in block 16 Block first atom: 1016 Blocpdb> 67 atoms in block 17 Block first atom: 1076 Blocpdb> 67 atoms in block 18 Block first atom: 1143 Blocpdb> 77 atoms in block 19 Block first atom: 1210 Blocpdb> 68 atoms in block 20 Block first atom: 1287 Blocpdb> 70 atoms in block 21 Block first atom: 1355 Blocpdb> 71 atoms in block 22 Block first atom: 1425 Blocpdb> 67 atoms in block 23 Block first atom: 1496 Blocpdb> 69 atoms in block 24 Block first atom: 1563 Blocpdb> 58 atoms in block 25 Block first atom: 1632 Blocpdb> 68 atoms in block 26 Block first atom: 1690 Blocpdb> 64 atoms in block 27 Block first atom: 1758 Blocpdb> 68 atoms in block 28 Block first atom: 1822 Blocpdb> 60 atoms in block 29 Block first atom: 1890 Blocpdb> 72 atoms in block 30 Block first atom: 1950 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 2022 Blocpdb> 63 atoms in block 32 Block first atom: 2080 Blocpdb> 53 atoms in block 33 Block first atom: 2143 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2196 Blocpdb> 65 atoms in block 35 Block first atom: 2265 Blocpdb> 63 atoms in block 36 Block first atom: 2330 Blocpdb> 60 atoms in block 37 Block first atom: 2393 Blocpdb> 67 atoms in block 38 Block first atom: 2453 Blocpdb> 73 atoms in block 39 Block first atom: 2520 Blocpdb> 61 atoms in block 40 Block first atom: 2593 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 2654 Blocpdb> 71 atoms in block 42 Block first atom: 2710 Blocpdb> 68 atoms in block 43 Block first atom: 2781 Blocpdb> 69 atoms in block 44 Block first atom: 2849 Blocpdb> 65 atoms in block 45 Block first atom: 2918 Blocpdb> 61 atoms in block 46 Block first atom: 2983 Blocpdb> 59 atoms in block 47 Block first atom: 3044 Blocpdb> 58 atoms in block 48 Block first atom: 3103 Blocpdb> 71 atoms in block 49 Block first atom: 3161 Blocpdb> 63 atoms in block 50 Block first atom: 3232 Blocpdb> 56 atoms in block 51 Block first atom: 3295 Blocpdb> 59 atoms in block 52 Block first atom: 3351 Blocpdb> 57 atoms in block 53 Block first atom: 3410 Blocpdb> 55 atoms in block 54 Block first atom: 3467 Blocpdb> 64 atoms in block 55 Block first atom: 3522 Blocpdb> 52 atoms in block 56 Block first atom: 3586 Blocpdb> 65 atoms in block 57 Block first atom: 3638 Blocpdb> 78 atoms in block 58 Block first atom: 3703 Blocpdb> 68 atoms in block 59 Block first atom: 3781 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 3849 Blocpdb> 67 atoms in block 61 Block first atom: 3918 Blocpdb> 76 atoms in block 62 Block first atom: 3985 Blocpdb> 54 atoms in block 63 Block first atom: 4061 Blocpdb> 59 atoms in block 64 Block first atom: 4115 Blocpdb> 71 atoms in block 65 Block first atom: 4174 Blocpdb> 68 atoms in block 66 Block first atom: 4245 Blocpdb> 71 atoms in block 67 Block first atom: 4313 Blocpdb> 62 atoms in block 68 Block first atom: 4384 Blocpdb> 57 atoms in block 69 Block first atom: 4446 Blocpdb> 61 atoms in block 70 Block first atom: 4503 Blocpdb> 59 atoms in block 71 Block first atom: 4564 Blocpdb> 61 atoms in block 72 Block first atom: 4623 Blocpdb> 66 atoms in block 73 Block first atom: 4684 Blocpdb> 56 atoms in block 74 Block first atom: 4750 Blocpdb> 64 atoms in block 75 Block first atom: 4806 Blocpdb> 74 atoms in block 76 Block first atom: 4870 Blocpdb> 68 atoms in block 77 Block first atom: 4944 Blocpdb> 70 atoms in block 78 Block first atom: 5012 Blocpdb> 68 atoms in block 79 Block first atom: 5082 Blocpdb> 54 atoms in block 80 Block first atom: 5150 Blocpdb> 64 atoms in block 81 Block first atom: 5204 Blocpdb> 71 atoms in block 82 Block first atom: 5268 Blocpdb> 58 atoms in block 83 Block first atom: 5339 Blocpdb> 66 atoms in block 84 Block first atom: 5397 Blocpdb> 58 atoms in block 85 Block first atom: 5463 Blocpdb> 65 atoms in block 86 Block first atom: 5521 Blocpdb> 58 atoms in block 87 Block first atom: 5586 Blocpdb> 56 atoms in block 88 Block first atom: 5644 Blocpdb> 67 atoms in block 89 Block first atom: 5700 Blocpdb> 61 atoms in block 90 Block first atom: 5767 Blocpdb> 62 atoms in block 91 Block first atom: 5828 Blocpdb> 64 atoms in block 92 Block first atom: 5890 Blocpdb> 61 atoms in block 93 Block first atom: 5954 Blocpdb> 61 atoms in block 94 Block first atom: 6015 Blocpdb> 60 atoms in block 95 Block first atom: 6076 Blocpdb> 70 atoms in block 96 Block first atom: 6136 Blocpdb> 64 atoms in block 97 Block first atom: 6206 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 6270 Blocpdb> 65 atoms in block 99 Block first atom: 6301 Blocpdb> 66 atoms in block 100 Block first atom: 6366 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 6432 Blocpdb> 72 atoms in block 102 Block first atom: 6494 Blocpdb> 68 atoms in block 103 Block first atom: 6566 Blocpdb> 68 atoms in block 104 Block first atom: 6634 Blocpdb> 56 atoms in block 105 Block first atom: 6702 Blocpdb> 67 atoms in block 106 Block first atom: 6758 Blocpdb> 69 atoms in block 107 Block first atom: 6825 Blocpdb> 58 atoms in block 108 Block first atom: 6894 Blocpdb> 75 atoms in block 109 Block first atom: 6952 Blocpdb> 65 atoms in block 110 Block first atom: 7027 Blocpdb> 78 atoms in block 111 Block first atom: 7092 Blocpdb> 63 atoms in block 112 Block first atom: 7170 Blocpdb> 83 atoms in block 113 Block first atom: 7233 Blocpdb> 60 atoms in block 114 Block first atom: 7316 Blocpdb> 67 atoms in block 115 Block first atom: 7376 Blocpdb> 67 atoms in block 116 Block first atom: 7443 Blocpdb> 77 atoms in block 117 Block first atom: 7510 Blocpdb> 68 atoms in block 118 Block first atom: 7587 Blocpdb> 70 atoms in block 119 Block first atom: 7655 Blocpdb> 71 atoms in block 120 Block first atom: 7725 Blocpdb> 67 atoms in block 121 Block first atom: 7796 Blocpdb> 69 atoms in block 122 Block first atom: 7863 Blocpdb> 58 atoms in block 123 Block first atom: 7932 Blocpdb> 68 atoms in block 124 Block first atom: 7990 Blocpdb> 64 atoms in block 125 Block first atom: 8058 Blocpdb> 68 atoms in block 126 Block first atom: 8122 Blocpdb> 60 atoms in block 127 Block first atom: 8190 Blocpdb> 72 atoms in block 128 Block first atom: 8250 Blocpdb> 58 atoms in block 129 Block first atom: 8322 Blocpdb> 63 atoms in block 130 Block first atom: 8380 Blocpdb> 53 atoms in block 131 Block first atom: 8443 Blocpdb> 69 atoms in block 132 Block first atom: 8496 Blocpdb> 65 atoms in block 133 Block first atom: 8565 Blocpdb> 63 atoms in block 134 Block first atom: 8630 Blocpdb> 60 atoms in block 135 Block first atom: 8693 Blocpdb> 67 atoms in block 136 Block first atom: 8753 Blocpdb> 73 atoms in block 137 Block first atom: 8820 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 8893 Blocpdb> 56 atoms in block 139 Block first atom: 8954 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 9010 Blocpdb> 68 atoms in block 141 Block first atom: 9081 Blocpdb> 69 atoms in block 142 Block first atom: 9149 Blocpdb> 65 atoms in block 143 Block first atom: 9218 Blocpdb> 61 atoms in block 144 Block first atom: 9283 Blocpdb> 59 atoms in block 145 Block first atom: 9344 Blocpdb> 58 atoms in block 146 Block first atom: 9403 Blocpdb> 71 atoms in block 147 Block first atom: 9461 Blocpdb> 63 atoms in block 148 Block first atom: 9532 Blocpdb> 56 atoms in block 149 Block first atom: 9595 Blocpdb> 59 atoms in block 150 Block first atom: 9651 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 9710 Blocpdb> 55 atoms in block 152 Block first atom: 9767 Blocpdb> 64 atoms in block 153 Block first atom: 9822 Blocpdb> 52 atoms in block 154 Block first atom: 9886 Blocpdb> 65 atoms in block 155 Block first atom: 9938 Blocpdb> 78 atoms in block 156 Block first atom: 10003 Blocpdb> 68 atoms in block 157 Block first atom: 10081 Blocpdb> 69 atoms in block 158 Block first atom: 10149 Blocpdb> 67 atoms in block 159 Block first atom: 10218 Blocpdb> 76 atoms in block 160 Block first atom: 10285 Blocpdb> 54 atoms in block 161 Block first atom: 10361 Blocpdb> 59 atoms in block 162 Block first atom: 10415 Blocpdb> 71 atoms in block 163 Block first atom: 10474 Blocpdb> 68 atoms in block 164 Block first atom: 10545 Blocpdb> 71 atoms in block 165 Block first atom: 10613 Blocpdb> 62 atoms in block 166 Block first atom: 10684 Blocpdb> 57 atoms in block 167 Block first atom: 10746 Blocpdb> 61 atoms in block 168 Block first atom: 10803 Blocpdb> 59 atoms in block 169 Block first atom: 10864 Blocpdb> 61 atoms in block 170 Block first atom: 10923 Blocpdb> 66 atoms in block 171 Block first atom: 10984 Blocpdb> 56 atoms in block 172 Block first atom: 11050 Blocpdb> 64 atoms in block 173 Block first atom: 11106 Blocpdb> 74 atoms in block 174 Block first atom: 11170 Blocpdb> 68 atoms in block 175 Block first atom: 11244 Blocpdb> 70 atoms in block 176 Block first atom: 11312 Blocpdb> 68 atoms in block 177 Block first atom: 11382 Blocpdb> 54 atoms in block 178 Block first atom: 11450 Blocpdb> 64 atoms in block 179 Block first atom: 11504 Blocpdb> 71 atoms in block 180 Block first atom: 11568 Blocpdb> 58 atoms in block 181 Block first atom: 11639 Blocpdb> 66 atoms in block 182 Block first atom: 11697 Blocpdb> 58 atoms in block 183 Block first atom: 11763 Blocpdb> 65 atoms in block 184 Block first atom: 11821 Blocpdb> 58 atoms in block 185 Block first atom: 11886 Blocpdb> 56 atoms in block 186 Block first atom: 11944 Blocpdb> 67 atoms in block 187 Block first atom: 12000 Blocpdb> 61 atoms in block 188 Block first atom: 12067 Blocpdb> 62 atoms in block 189 Block first atom: 12128 Blocpdb> 64 atoms in block 190 Block first atom: 12190 Blocpdb> 61 atoms in block 191 Block first atom: 12254 Blocpdb> 61 atoms in block 192 Block first atom: 12315 Blocpdb> 60 atoms in block 193 Block first atom: 12376 Blocpdb> 70 atoms in block 194 Block first atom: 12436 Blocpdb> 64 atoms in block 195 Block first atom: 12506 Blocpdb> 31 atoms in block 196 Block first atom: 12569 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 83 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 31 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4563719 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 37800 Prepmat> Matrix trace = 9974940.0000 Prepmat> Last element read: 37800 37800 182.8361 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17772 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12600 RTB> Total mass = 12600.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12600 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 182540.0492 RTB> 52284 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52284 Diagstd> Projected matrix trace = 182540.0492 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 182540.0492 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2909604 0.5696533 0.6631506 1.0239725 1.0279888 1.3948615 1.5472494 1.9334803 2.0360348 2.2048749 2.3837547 2.5276912 2.6545482 2.9227064 3.0433175 3.5732626 3.9338310 4.3269753 4.3928460 4.8462123 4.9523957 5.7602122 5.9495989 6.2044604 6.2467644 6.4455689 6.9847149 7.0993588 8.2169275 8.2797759 8.4404041 9.0307475 9.2898892 9.3919930 10.1508182 10.3874181 10.5437697 10.8435436 11.8572140 12.1092606 12.2493380 12.6646451 12.9774382 13.3780091 13.8329578 13.9518755 14.2545124 14.2786356 14.8013167 14.9669564 15.1813825 15.9175346 16.4181509 16.6757790 17.0048389 17.0759410 17.2497417 17.6131580 17.8171786 18.1235486 18.7983513 19.1362036 19.4577719 20.1256892 20.5749223 20.5975781 21.0309477 21.5372932 21.6976973 22.0913628 22.2137647 22.3178052 22.5627471 22.8189353 23.1074972 23.6202102 24.2588504 24.4307830 24.7250605 24.7522734 25.3072135 25.4890473 25.7924975 26.6687673 27.0852239 27.1948626 27.6402106 27.6859237 28.1622244 28.4295749 28.5466059 28.8568710 29.0141438 29.5708859 29.8219014 29.9594217 30.0266948 30.3159480 30.5657117 31.0246502 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034334 0.0034336 0.0034341 0.0034343 0.0034345 58.5749914 81.9597421 88.4303532 109.8852593 110.1005472 128.2510212 135.0751457 150.9958989 154.9486795 161.2453697 167.6586862 172.6463059 176.9255621 185.6469734 189.4387897 205.2710701 215.3788872 225.8850490 227.5979090 239.0542664 241.6589854 260.6240696 264.8738755 270.4875560 271.4081246 275.6931067 286.9918893 289.3375781 311.2791334 312.4672978 315.4836819 326.3300962 330.9790826 332.7929828 345.9758654 349.9847218 352.6088717 357.5863192 373.9268148 377.8801627 380.0594966 386.4486487 391.1918195 397.1833398 403.8804259 405.6127297 409.9883003 410.3350697 417.7778934 420.1090397 423.1077119 433.2446231 440.0047874 443.4435538 447.7973732 448.7325802 451.0104229 455.7365868 458.3684819 462.2925540 470.8202794 475.0323336 479.0069717 487.1589223 492.5659449 492.8370617 497.9946788 503.9539350 505.8271114 510.3951448 511.8071683 513.0043186 515.8117941 518.7319144 522.0014803 527.7608368 534.8480152 536.7400138 539.9629510 540.2600156 546.2826968 548.2417212 551.4955071 560.7854680 565.1470896 566.2897682 570.9077706 571.3796767 576.2736443 579.0025322 580.1930469 583.3375048 584.9249677 590.5102602 593.0112672 594.3769971 595.0439516 597.9031712 600.3610887 604.8514515 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12600 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.573 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.327 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.440 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.031 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 226800 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610211920142949252.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610211920142949252.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610211920142949252.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610211920142949252.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1562 First residue number = 57 Last residue number = 837 Number of atoms found = 12600 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.573 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.440 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.031 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02 Bfactors> 106 vectors, 37800 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.291000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.335 for 1562 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.024 +/- 0.02 Bfactors> = 0.895 +/- 0.07 Bfactors> Shiftng-fct= 0.871 Bfactors> Scaling-fct= 3.190 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610211920142949252.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610211920142949252.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1 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vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8 Chkmod> 106 vectors, 37800 coordinates in file. Chkmod> That is: 12600 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 73 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8932 0.0034 0.7969 0.0034 0.8782 0.0034 0.7958 0.0034 0.7987 0.0034 0.6710 58.5765 0.3649 81.9596 0.5635 88.4299 0.5734 109.8820 0.4326 110.0964 0.5607 128.2519 0.4656 135.0585 0.6245 150.9707 0.3639 154.9407 0.6094 161.2430 0.4956 167.6601 0.5747 172.6494 0.5111 176.9330 0.5408 185.6483 0.6028 189.4208 0.5388 205.2547 0.6782 215.3743 0.5360 225.8760 0.4802 227.5921 0.4240 239.0388 0.3983 241.6390 0.5542 260.6081 0.4136 264.8714 0.2570 270.4659 0.1911 271.4016 0.2529 275.6905 0.2915 286.9854 0.6194 289.3178 0.3630 311.2671 0.5545 312.4581 0.5834 315.4626 0.5637 326.3207 0.7173 330.9668 0.4814 332.7788 0.3815 345.9471 0.5620 350.0132 0.5077 352.5307 0.3634 357.5125 0.2053 373.9547 0.3843 377.8755 0.4687 380.0535 0.4914 386.3612 0.6411 391.2136 0.4187 397.1958 0.3335 403.8199 0.4077 405.5681 0.3133 409.9058 0.4641 410.3371 0.4011 417.7414 0.2599 420.1337 0.3830 423.0703 0.4825 433.2596 0.5255 440.0107 0.5023 443.4806 0.5297 447.7144 0.2886 448.7666 0.3148 450.9944 0.4260 455.6762 0.4923 458.3851 0.5185 462.2275 0.4149 470.8207 0.3282 475.0591 0.4709 479.0138 0.3352 487.1902 0.3206 492.4859 0.4822 492.8449 0.5144 497.9621 0.2884 503.9640 0.4405 505.8322 0.3859 510.3575 0.3372 511.7418 0.4027 513.0075 0.3922 515.7583 0.2865 518.7217 0.2972 522.0073 0.4629 527.7358 0.5513 534.8377 0.2781 536.7084 0.2915 539.9937 0.5253 540.2120 0.5471 546.2893 0.4078 548.2284 0.4456 551.4451 0.5866 560.7744 0.5174 565.1727 0.2773 566.2148 0.4003 570.8811 0.5901 571.3972 0.2867 576.2261 0.4446 578.9820 0.4446 580.2026 0.4497 583.3441 0.3264 584.8581 0.3542 590.4761 0.4072 592.9669 0.3698 594.3572 0.5045 595.0512 0.4907 597.9175 0.4882 600.3774 0.4214 604.7802 0.4150 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920142949252 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom making animated gifs 11 models are in 2610211920142949252.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920142949252 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom making animated gifs 11 models are in 2610211920142949252.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920142949252 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom making animated gifs 11 models are in 2610211920142949252.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610211920142949252.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920142949252 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610211920142949252.eigenfacs 2610211920142949252.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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