***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610211920472949757.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610211920472949757.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610211920472949757.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 862
First residue number = 1
Last residue number = 862
Number of atoms found = 6923
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 4.828306 +/- 23.035203 From: -45.365000 To: 64.618000
= 3.092580 +/- 12.090207 From: -42.898000 To: 40.357000
= -6.980269 +/- 24.626464 From: -94.835000 To: 47.272000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.1637 % Filled.
Pdbmat> 2509875 non-zero elements.
Pdbmat> 274308 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.25 +/- 25.67
Maximum number = 133
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 5.486160E+06
Pdbmat> Larger element = 513.724
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
862 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610211920472949757.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610211920472949757.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610211920472949757.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6923 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 862 residues.
Blocpdb> 36 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 48 atoms in block 2
Block first atom: 37
Blocpdb> 32 atoms in block 3
Block first atom: 85
Blocpdb> 47 atoms in block 4
Block first atom: 117
Blocpdb> 42 atoms in block 5
Block first atom: 164
Blocpdb> 35 atoms in block 6
Block first atom: 206
Blocpdb> 34 atoms in block 7
Block first atom: 241
Blocpdb> 40 atoms in block 8
Block first atom: 275
Blocpdb> 28 atoms in block 9
Block first atom: 315
Blocpdb> 44 atoms in block 10
Block first atom: 343
Blocpdb> 42 atoms in block 11
Block first atom: 387
Blocpdb> 38 atoms in block 12
Block first atom: 429
Blocpdb> 45 atoms in block 13
Block first atom: 467
Blocpdb> 36 atoms in block 14
Block first atom: 512
Blocpdb> 49 atoms in block 15
Block first atom: 548
Blocpdb> 41 atoms in block 16
Block first atom: 597
Blocpdb> 45 atoms in block 17
Block first atom: 638
Blocpdb> 39 atoms in block 18
Block first atom: 683
Blocpdb> 39 atoms in block 19
Block first atom: 722
Blocpdb> 36 atoms in block 20
Block first atom: 761
Blocpdb> 36 atoms in block 21
Block first atom: 797
Blocpdb> 39 atoms in block 22
Block first atom: 833
Blocpdb> 39 atoms in block 23
Block first atom: 872
Blocpdb> 45 atoms in block 24
Block first atom: 911
Blocpdb> 40 atoms in block 25
Block first atom: 956
Blocpdb> 39 atoms in block 26
Block first atom: 996
Blocpdb> 41 atoms in block 27
Block first atom: 1035
Blocpdb> 49 atoms in block 28
Block first atom: 1076
Blocpdb> 45 atoms in block 29
Block first atom: 1125
Blocpdb> 50 atoms in block 30
Block first atom: 1170
Blocpdb> 43 atoms in block 31
Block first atom: 1220
Blocpdb> 34 atoms in block 32
Block first atom: 1263
Blocpdb> 44 atoms in block 33
Block first atom: 1297
Blocpdb> 44 atoms in block 34
Block first atom: 1341
Blocpdb> 41 atoms in block 35
Block first atom: 1385
Blocpdb> 41 atoms in block 36
Block first atom: 1426
Blocpdb> 44 atoms in block 37
Block first atom: 1467
Blocpdb> 39 atoms in block 38
Block first atom: 1511
Blocpdb> 49 atoms in block 39
Block first atom: 1550
Blocpdb> 48 atoms in block 40
Block first atom: 1599
Blocpdb> 38 atoms in block 41
Block first atom: 1647
Blocpdb> 49 atoms in block 42
Block first atom: 1685
Blocpdb> 49 atoms in block 43
Block first atom: 1734
Blocpdb> 39 atoms in block 44
Block first atom: 1783
Blocpdb> 41 atoms in block 45
Block first atom: 1822
Blocpdb> 41 atoms in block 46
Block first atom: 1863
Blocpdb> 40 atoms in block 47
Block first atom: 1904
Blocpdb> 44 atoms in block 48
Block first atom: 1944
Blocpdb> 40 atoms in block 49
Block first atom: 1988
Blocpdb> 33 atoms in block 50
Block first atom: 2028
Blocpdb> 47 atoms in block 51
Block first atom: 2061
Blocpdb> 49 atoms in block 52
Block first atom: 2108
Blocpdb> 32 atoms in block 53
Block first atom: 2157
Blocpdb> 39 atoms in block 54
Block first atom: 2189
Blocpdb> 44 atoms in block 55
Block first atom: 2228
Blocpdb> 39 atoms in block 56
Block first atom: 2272
Blocpdb> 44 atoms in block 57
Block first atom: 2311
Blocpdb> 39 atoms in block 58
Block first atom: 2355
Blocpdb> 39 atoms in block 59
Block first atom: 2394
Blocpdb> 34 atoms in block 60
Block first atom: 2433
Blocpdb> 40 atoms in block 61
Block first atom: 2467
Blocpdb> 38 atoms in block 62
Block first atom: 2507
Blocpdb> 37 atoms in block 63
Block first atom: 2545
Blocpdb> 48 atoms in block 64
Block first atom: 2582
Blocpdb> 43 atoms in block 65
Block first atom: 2630
Blocpdb> 35 atoms in block 66
Block first atom: 2673
Blocpdb> 39 atoms in block 67
Block first atom: 2708
Blocpdb> 40 atoms in block 68
Block first atom: 2747
Blocpdb> 48 atoms in block 69
Block first atom: 2787
Blocpdb> 34 atoms in block 70
Block first atom: 2835
Blocpdb> 43 atoms in block 71
Block first atom: 2869
Blocpdb> 41 atoms in block 72
Block first atom: 2912
Blocpdb> 38 atoms in block 73
Block first atom: 2953
Blocpdb> 35 atoms in block 74
Block first atom: 2991
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 3026
Blocpdb> 39 atoms in block 76
Block first atom: 3062
Blocpdb> 43 atoms in block 77
Block first atom: 3101
Blocpdb> 38 atoms in block 78
Block first atom: 3144
Blocpdb> 42 atoms in block 79
Block first atom: 3182
Blocpdb> 30 atoms in block 80
Block first atom: 3224
Blocpdb> 43 atoms in block 81
Block first atom: 3254
Blocpdb> 38 atoms in block 82
Block first atom: 3297
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 3335
Blocpdb> 45 atoms in block 84
Block first atom: 3371
Blocpdb> 34 atoms in block 85
Block first atom: 3416
Blocpdb> 34 atoms in block 86
Block first atom: 3450
Blocpdb> 38 atoms in block 87
Block first atom: 3484
Blocpdb> 42 atoms in block 88
Block first atom: 3522
Blocpdb> 42 atoms in block 89
Block first atom: 3564
Blocpdb> 37 atoms in block 90
Block first atom: 3606
Blocpdb> 31 atoms in block 91
Block first atom: 3643
Blocpdb> 36 atoms in block 92
Block first atom: 3674
Blocpdb> 43 atoms in block 93
Block first atom: 3710
Blocpdb> 36 atoms in block 94
Block first atom: 3753
Blocpdb> 38 atoms in block 95
Block first atom: 3789
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 3827
Blocpdb> 34 atoms in block 97
Block first atom: 3860
Blocpdb> 44 atoms in block 98
Block first atom: 3894
Blocpdb> 35 atoms in block 99
Block first atom: 3938
Blocpdb> 33 atoms in block 100
Block first atom: 3973
Blocpdb> 34 atoms in block 101
Block first atom: 4006
Blocpdb> 43 atoms in block 102
Block first atom: 4040
Blocpdb> 47 atoms in block 103
Block first atom: 4083
Blocpdb> 49 atoms in block 104
Block first atom: 4130
Blocpdb> 37 atoms in block 105
Block first atom: 4179
Blocpdb> 47 atoms in block 106
Block first atom: 4216
Blocpdb> 43 atoms in block 107
Block first atom: 4263
Blocpdb> 39 atoms in block 108
Block first atom: 4306
Blocpdb> 47 atoms in block 109
Block first atom: 4345
Blocpdb> 49 atoms in block 110
Block first atom: 4392
Blocpdb> 34 atoms in block 111
Block first atom: 4441
Blocpdb> 45 atoms in block 112
Block first atom: 4475
Blocpdb> 36 atoms in block 113
Block first atom: 4520
Blocpdb> 47 atoms in block 114
Block first atom: 4556
Blocpdb> 35 atoms in block 115
Block first atom: 4603
Blocpdb> 46 atoms in block 116
Block first atom: 4638
Blocpdb> 37 atoms in block 117
Block first atom: 4684
Blocpdb> 44 atoms in block 118
Block first atom: 4721
Blocpdb> 35 atoms in block 119
Block first atom: 4765
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 4800
Blocpdb> 41 atoms in block 121
Block first atom: 4840
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 4881
Blocpdb> 43 atoms in block 123
Block first atom: 4919
Blocpdb> 35 atoms in block 124
Block first atom: 4962
Blocpdb> 42 atoms in block 125
Block first atom: 4997
Blocpdb> 32 atoms in block 126
Block first atom: 5039
Blocpdb> 38 atoms in block 127
Block first atom: 5071
Blocpdb> 48 atoms in block 128
Block first atom: 5109
Blocpdb> 33 atoms in block 129
Block first atom: 5157
Blocpdb> 38 atoms in block 130
Block first atom: 5190
Blocpdb> 45 atoms in block 131
Block first atom: 5228
Blocpdb> 42 atoms in block 132
Block first atom: 5273
Blocpdb> 43 atoms in block 133
Block first atom: 5315
Blocpdb> 37 atoms in block 134
Block first atom: 5358
Blocpdb> 46 atoms in block 135
Block first atom: 5395
Blocpdb> 36 atoms in block 136
Block first atom: 5441
Blocpdb> 46 atoms in block 137
Block first atom: 5477
Blocpdb> 33 atoms in block 138
Block first atom: 5523
Blocpdb> 43 atoms in block 139
Block first atom: 5556
Blocpdb> 37 atoms in block 140
Block first atom: 5599
Blocpdb> 50 atoms in block 141
Block first atom: 5636
Blocpdb> 38 atoms in block 142
Block first atom: 5686
Blocpdb> 44 atoms in block 143
Block first atom: 5724
Blocpdb> 39 atoms in block 144
Block first atom: 5768
Blocpdb> 41 atoms in block 145
Block first atom: 5807
Blocpdb> 39 atoms in block 146
Block first atom: 5848
Blocpdb> 37 atoms in block 147
Block first atom: 5887
Blocpdb> 42 atoms in block 148
Block first atom: 5924
Blocpdb> 39 atoms in block 149
Block first atom: 5966
Blocpdb> 35 atoms in block 150
Block first atom: 6005
Blocpdb> 36 atoms in block 151
Block first atom: 6040
Blocpdb> 38 atoms in block 152
Block first atom: 6076
Blocpdb> 43 atoms in block 153
Block first atom: 6114
Blocpdb> 39 atoms in block 154
Block first atom: 6157
Blocpdb> 41 atoms in block 155
Block first atom: 6196
Blocpdb> 37 atoms in block 156
Block first atom: 6237
Blocpdb> 44 atoms in block 157
Block first atom: 6274
Blocpdb> 38 atoms in block 158
Block first atom: 6318
Blocpdb> 40 atoms in block 159
Block first atom: 6356
Blocpdb> 35 atoms in block 160
Block first atom: 6396
Blocpdb> 38 atoms in block 161
Block first atom: 6431
Blocpdb> 36 atoms in block 162
Block first atom: 6469
Blocpdb> 36 atoms in block 163
Block first atom: 6505
Blocpdb> 48 atoms in block 164
Block first atom: 6541
Blocpdb> 35 atoms in block 165
Block first atom: 6589
Blocpdb> 48 atoms in block 166
Block first atom: 6624
Blocpdb> 30 atoms in block 167
Block first atom: 6672
Blocpdb> 37 atoms in block 168
Block first atom: 6702
Blocpdb> 45 atoms in block 169
Block first atom: 6739
Blocpdb> 42 atoms in block 170
Block first atom: 6784
Blocpdb> 44 atoms in block 171
Block first atom: 6826
Blocpdb> 39 atoms in block 172
Block first atom: 6870
Blocpdb> 15 atoms in block 173
Block first atom: 6908
Blocpdb> 173 blocks.
Blocpdb> At most, 50 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2510048 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 20769
Prepmat> Matrix trace = 5486160.0000
Prepmat> Last element read: 20769 20769 8.2782
Prepmat> 15052 lines saved.
Prepmat> 13583 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6923
RTB> Total mass = 6923.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6923
RTB> Number of blocks = 173
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 185858.4749
RTB> 50253 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1038
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50253
Diagstd> Projected matrix trace = 185858.4749
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1038 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 185858.4749
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0206776 0.0250972 0.0392590 0.0586709
0.0772659 0.1043040 0.1240065 0.1249584 0.1742201
0.2062969 0.2310278 0.2623234 0.3106495 0.4454273
0.4679680 0.5698799 0.6088212 0.8340485 1.0151010
1.1363205 1.3147526 1.5058435 1.6017083 1.7758869
1.9391012 2.0898871 2.1803252 2.2366885 2.4097266
2.5795175 2.6797005 2.7463303 2.8259781 2.9883080
3.4782121 3.5578520 3.7426536 3.8508520 3.9015163
4.2118308 4.3635894 4.5633871 4.9271437 5.2158796
5.4913703 6.4120420 6.7927085 6.9945593 7.1053132
7.9991041 8.1628102 8.4288539 8.6007450 8.8311134
8.9745601 9.0389647 9.3313554 9.5407786 9.9595187
10.1496543 10.3724532 10.9582199 11.4096738 11.8085446
12.5155905 12.8924815 13.3460687 13.8040342 14.3848701
14.6693800 14.7040268 15.4941407 16.1854824 16.4167809
16.9384793 17.1833413 17.7722447 18.2347861 18.7389429
19.3350436 19.4728192 19.7924543 19.8664253 20.2168576
20.7259109 20.8269926 20.8988186 21.7090835 22.5260627
23.0462742 23.6009098 23.8353598 23.8614288 24.5951938
24.7128538 24.9636365 25.4006952 25.6398291 26.2441383
26.3976068
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034340 0.0034344 0.0034344 0.0034345
0.0034351 15.6151120 17.2031367 21.5161699 26.3030831
30.1848554 35.0708109 38.2399591 38.3864583 45.3256915
49.3221067 52.1948187 55.6178023 60.5244172 72.4742418
74.2853843 81.9760438 84.7305757 99.1724225 109.4082105
115.7565848 124.5137479 133.2555151 137.4317224 144.7114612
151.2152243 156.9844720 160.3451832 162.4044901 168.5695634
174.4072428 177.7617892 179.9582095 182.5490916 187.7188821
202.5225144 204.8279507 210.0801874 213.0952144 214.4924421
222.8592876 226.8387353 231.9738000 241.0420950 248.0042126
254.4694458 274.9751566 283.0197681 287.1940638 289.4588905
307.1255558 310.2523863 315.2677470 318.4661789 322.7030054
325.3133347 326.4785293 331.7169361 335.4186369 342.7002782
345.9560306 349.7325249 359.4721804 366.8021681 373.1586101
384.1677937 389.9092499 396.7089136 403.4579644 411.8587074
415.9117217 416.4025909 427.4438063 436.8759159 439.9864291
446.9227777 450.1415365 457.7901275 463.7090981 470.0757252
477.4939334 479.1921509 483.1089745 484.0109028 488.2610784
494.3699830 495.5740552 496.4278627 505.9598150 515.3922987
521.3095045 527.5451723 530.1589976 530.4488388 538.5430243
539.8296450 542.5617902 547.2907171 549.8609056 556.3030473
557.9272305
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6923
Rtb_to_modes> Number of blocs = 173
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0678E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5097E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9259E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8671E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7266E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1240
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1250
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2063
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2310
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2623
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3106
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4454
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4680
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5699
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6088
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.015
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.136
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.315
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.602
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.776
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.939
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.180
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.237
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.410
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.580
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.680
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.988
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.478
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.743
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.851
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.902
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.212
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.364
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.563
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.216
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.412
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.793
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.105
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.999
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.429
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.601
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.831
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.039
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.960
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99995 1.00003 0.99998
0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
1.00001 0.99995 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
0.99999 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002
1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00004 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00004 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 124614 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
0.99998 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99995 1.00003 0.99998
0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00004
1.00001 0.99995 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
0.99999 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002
1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00004 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00004 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211920472949757.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211920472949757.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610211920472949757.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610211920472949757.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 862
First residue number = 1
Last residue number = 862
Number of atoms found = 6923
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0678E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5097E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9259E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8671E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7266E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1043
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2063
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2310
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2623
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3106
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4454
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4680
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5699
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.015
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.136
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.776
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.180
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.410
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.580
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.680
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.478
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.743
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.902
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.212
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.364
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.563
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.793
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.105
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.429
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.601
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.831
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.960
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40
Bfactors> 106 vectors, 20769 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.020678
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.435 for 862 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.438 +/- 2.49
Bfactors> = 0.867 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= 0.429
Bfactors> Scaling-fct= 0.071
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610211920472949757.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610211920472949757.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.9
Chkmod> 106 vectors, 20769 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6923 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9631
0.0034 0.8187
0.0034 0.9762
0.0034 0.7476
0.0034 0.6554
0.0034 0.6622
15.6146 0.0128
17.2023 0.0164
21.5152 0.0296
26.3020 0.0479
30.1836 0.0176
35.0686 0.0449
38.2373 0.0462
38.3912 0.0575
45.3211 0.3123
49.3204 0.2136
52.1894 0.0853
55.6129 0.0322
60.5170 0.2729
72.4689 0.0640
74.2847 0.1212
81.9740 0.3840
84.7255 0.1892
99.1653 0.0707
109.3981 0.0249
115.7353 0.0166
124.5201 0.0203
133.2567 0.0381
137.4383 0.4225
144.7099 0.3003
151.2048 0.4063
156.9820 0.2096
160.3263 0.0786
162.4088 0.1334
168.5719 0.2161
174.4161 0.0545
177.7641 0.0396
179.9397 0.1616
182.5420 0.1164
187.7011 0.5017
202.5076 0.1310
204.8234 0.0300
210.0809 0.2171
213.0902 0.1752
214.4965 0.0684
222.8542 0.1242
226.8397 0.0495
231.9540 0.1760
241.0282 0.0708
247.9964 0.0636
254.4499 0.3437
274.9625 0.4485
283.0137 0.2932
287.1908 0.4932
289.4401 0.2475
307.1104 0.1721
310.2427 0.1010
315.2569 0.3062
318.4572 0.0996
322.6871 0.3684
325.3073 0.2713
326.4652 0.3659
331.6964 0.3190
335.4081 0.2251
342.6938 0.2154
345.9471 0.1790
349.6762 0.0901
359.4859 0.2416
366.7917 0.2360
373.1656 0.4469
384.2190 0.3222
389.8550 0.3544
396.7503 0.2741
403.3817 0.1757
411.7713 0.3760
415.9027 0.1744
416.3277 0.3209
427.3683 0.3213
436.9181 0.1826
440.0107 0.0428
446.9237 0.2292
450.0784 0.1336
457.7416 0.2853
463.6283 0.1677
470.0688 0.1121
477.5346 0.3598
479.1369 0.1343
483.0583 0.2419
484.0337 0.4543
488.2781 0.3294
494.3975 0.0249
495.5886 0.2058
496.4206 0.1814
505.9488 0.5026
515.4152 0.0811
521.3293 0.3853
527.5124 0.2867
530.1878 0.2689
530.4102 0.3077
538.5725 0.1031
539.7753 0.3154
542.4990 0.1298
547.2597 0.4172
549.8391 0.2130
556.2353 0.3019
557.9286 0.2777
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920472949757 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211920472949757.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920472949757 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211920472949757.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920472949757 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211920472949757.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920472949757 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211920472949757.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610211920472949757 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610211920472949757.eigenfacs
2610211920472949757.atom
making animated gifs
11 models are in 2610211920472949757.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610211920472949757.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610211920472949757.10.pdb
2610211920472949757.11.pdb
2610211920472949757.7.pdb
2610211920472949757.8.pdb
2610211920472949757.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m44.570s
user 0m44.237s
sys 0m0.308s
rm: cannot remove '2610211920472949757.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|