*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610221359293125904.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610221359293125904.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610221359293125904.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2870
First residue number = 1
Last residue number = 1435
Number of atoms found = 22806
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 8.929158 +/- 75.211417 From: -198.816000 To: 113.736000
= 101.806078 +/- 38.205806 From: 18.431000 To: 217.083000
= 16.911440 +/- 24.863297 From: -48.436000 To: 80.916000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.1608 % Filled.
Pdbmat> 8032953 non-zero elements.
Pdbmat> 877483 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.95 +/- 22.41
Maximum number = 130
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.754966E+07
Pdbmat> Larger element = 501.427
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2870 non-zero elements, NRBL set to 15
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610221359293125904.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 15
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610221359293125904.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610221359293125904.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 22806 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 15 residue(s) per block.
Blocpdb> 2870 residues.
Blocpdb> 102 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 133 atoms in block 2
Block first atom: 103
Blocpdb> 131 atoms in block 3
Block first atom: 236
Blocpdb> 111 atoms in block 4
Block first atom: 367
Blocpdb> 111 atoms in block 5
Block first atom: 478
Blocpdb> 124 atoms in block 6
Block first atom: 589
Blocpdb> 123 atoms in block 7
Block first atom: 713
Blocpdb> 115 atoms in block 8
Block first atom: 836
Blocpdb> 114 atoms in block 9
Block first atom: 951
Blocpdb> 118 atoms in block 10
Block first atom: 1065
Blocpdb> 121 atoms in block 11
Block first atom: 1183
Blocpdb> 107 atoms in block 12
Block first atom: 1304
Blocpdb> 112 atoms in block 13
Block first atom: 1411
Blocpdb> 112 atoms in block 14
Block first atom: 1523
Blocpdb> 120 atoms in block 15
Block first atom: 1635
Blocpdb> 108 atoms in block 16
Block first atom: 1755
Blocpdb> 121 atoms in block 17
Block first atom: 1863
Blocpdb> 125 atoms in block 18
Block first atom: 1984
Blocpdb> 121 atoms in block 19
Block first atom: 2109
Blocpdb> 135 atoms in block 20
Block first atom: 2230
Blocpdb> 123 atoms in block 21
Block first atom: 2365
Blocpdb> 119 atoms in block 22
Block first atom: 2488
Blocpdb> 107 atoms in block 23
Block first atom: 2607
Blocpdb> 97 atoms in block 24
Block first atom: 2714
Blocpdb> 109 atoms in block 25
Block first atom: 2811
Blocpdb> 127 atoms in block 26
Block first atom: 2920
Blocpdb> 112 atoms in block 27
Block first atom: 3047
Blocpdb> 117 atoms in block 28
Block first atom: 3159
Blocpdb> 132 atoms in block 29
Block first atom: 3276
Blocpdb> 118 atoms in block 30
Block first atom: 3408
Blocpdb> 124 atoms in block 31
Block first atom: 3526
Blocpdb> 115 atoms in block 32
Block first atom: 3650
Blocpdb> 123 atoms in block 33
Block first atom: 3765
Blocpdb> 113 atoms in block 34
Block first atom: 3888
Blocpdb> 112 atoms in block 35
Block first atom: 4001
Blocpdb> 109 atoms in block 36
Block first atom: 4113
Blocpdb> 131 atoms in block 37
Block first atom: 4222
Blocpdb> 101 atoms in block 38
Block first atom: 4353
Blocpdb> 112 atoms in block 39
Block first atom: 4454
Blocpdb> 118 atoms in block 40
Block first atom: 4566
Blocpdb> 117 atoms in block 41
Block first atom: 4684
Blocpdb> 120 atoms in block 42
Block first atom: 4801
Blocpdb> 115 atoms in block 43
Block first atom: 4921
Blocpdb> 129 atoms in block 44
Block first atom: 5036
Blocpdb> 139 atoms in block 45
Block first atom: 5165
Blocpdb> 113 atoms in block 46
Block first atom: 5304
Blocpdb> 112 atoms in block 47
Block first atom: 5417
Blocpdb> 128 atoms in block 48
Block first atom: 5529
Blocpdb> 124 atoms in block 49
Block first atom: 5657
Blocpdb> 113 atoms in block 50
Block first atom: 5781
Blocpdb> 127 atoms in block 51
Block first atom: 5894
Blocpdb> 125 atoms in block 52
Block first atom: 6021
Blocpdb> 131 atoms in block 53
Block first atom: 6146
Blocpdb> 131 atoms in block 54
Block first atom: 6277
Blocpdb> 131 atoms in block 55
Block first atom: 6408
Blocpdb> 127 atoms in block 56
Block first atom: 6539
Blocpdb> 118 atoms in block 57
Block first atom: 6666
Blocpdb> 121 atoms in block 58
Block first atom: 6784
Blocpdb> 114 atoms in block 59
Block first atom: 6905
Blocpdb> 122 atoms in block 60
Block first atom: 7019
Blocpdb> 120 atoms in block 61
Block first atom: 7141
Blocpdb> 132 atoms in block 62
Block first atom: 7261
Blocpdb> 126 atoms in block 63
Block first atom: 7393
Blocpdb> 112 atoms in block 64
Block first atom: 7519
Blocpdb> 117 atoms in block 65
Block first atom: 7631
Blocpdb> 140 atoms in block 66
Block first atom: 7748
Blocpdb> 143 atoms in block 67
Block first atom: 7888
Blocpdb> 130 atoms in block 68
Block first atom: 8031
Blocpdb> 112 atoms in block 69
Block first atom: 8161
Blocpdb> 115 atoms in block 70
Block first atom: 8273
Blocpdb> 118 atoms in block 71
Block first atom: 8388
Blocpdb> 112 atoms in block 72
Block first atom: 8506
Blocpdb> 112 atoms in block 73
Block first atom: 8618
Blocpdb> 120 atoms in block 74
Block first atom: 8730
Blocpdb> 126 atoms in block 75
Block first atom: 8850
Blocpdb> 110 atoms in block 76
Block first atom: 8976
Blocpdb> 113 atoms in block 77
Block first atom: 9086
Blocpdb> 134 atoms in block 78
Block first atom: 9199
Blocpdb> 112 atoms in block 79
Block first atom: 9333
Blocpdb> 110 atoms in block 80
Block first atom: 9445
Blocpdb> 116 atoms in block 81
Block first atom: 9555
Blocpdb> 108 atoms in block 82
Block first atom: 9671
Blocpdb> 108 atoms in block 83
Block first atom: 9779
Blocpdb> 127 atoms in block 84
Block first atom: 9887
Blocpdb> 110 atoms in block 85
Block first atom: 10014
Blocpdb> 125 atoms in block 86
Block first atom: 10124
Blocpdb> 115 atoms in block 87
Block first atom: 10249
Blocpdb> 123 atoms in block 88
Block first atom: 10364
Blocpdb> 125 atoms in block 89
Block first atom: 10487
Blocpdb> 102 atoms in block 90
Block first atom: 10612
Blocpdb> 120 atoms in block 91
Block first atom: 10714
Blocpdb> 138 atoms in block 92
Block first atom: 10834
Blocpdb> 116 atoms in block 93
Block first atom: 10972
Blocpdb> 121 atoms in block 94
Block first atom: 11088
Blocpdb> 117 atoms in block 95
Block first atom: 11209
Blocpdb> 78 atoms in block 96
Block first atom: 11326
Blocpdb> 102 atoms in block 97
Block first atom: 11404
Blocpdb> 133 atoms in block 98
Block first atom: 11506
Blocpdb> 131 atoms in block 99
Block first atom: 11639
Blocpdb> 111 atoms in block 100
Block first atom: 11770
Blocpdb> 111 atoms in block 101
Block first atom: 11881
Blocpdb> 124 atoms in block 102
Block first atom: 11992
Blocpdb> 123 atoms in block 103
Block first atom: 12116
Blocpdb> 115 atoms in block 104
Block first atom: 12239
Blocpdb> 114 atoms in block 105
Block first atom: 12354
Blocpdb> 118 atoms in block 106
Block first atom: 12468
Blocpdb> 121 atoms in block 107
Block first atom: 12586
Blocpdb> 107 atoms in block 108
Block first atom: 12707
Blocpdb> 112 atoms in block 109
Block first atom: 12814
Blocpdb> 112 atoms in block 110
Block first atom: 12926
Blocpdb> 120 atoms in block 111
Block first atom: 13038
Blocpdb> 108 atoms in block 112
Block first atom: 13158
Blocpdb> 121 atoms in block 113
Block first atom: 13266
Blocpdb> 125 atoms in block 114
Block first atom: 13387
Blocpdb> 121 atoms in block 115
Block first atom: 13512
Blocpdb> 135 atoms in block 116
Block first atom: 13633
Blocpdb> 123 atoms in block 117
Block first atom: 13768
Blocpdb> 119 atoms in block 118
Block first atom: 13891
Blocpdb> 107 atoms in block 119
Block first atom: 14010
Blocpdb> 97 atoms in block 120
Block first atom: 14117
Blocpdb> 109 atoms in block 121
Block first atom: 14214
Blocpdb> 127 atoms in block 122
Block first atom: 14323
Blocpdb> 112 atoms in block 123
Block first atom: 14450
Blocpdb> 117 atoms in block 124
Block first atom: 14562
Blocpdb> 132 atoms in block 125
Block first atom: 14679
Blocpdb> 118 atoms in block 126
Block first atom: 14811
Blocpdb> 124 atoms in block 127
Block first atom: 14929
Blocpdb> 115 atoms in block 128
Block first atom: 15053
Blocpdb> 123 atoms in block 129
Block first atom: 15168
Blocpdb> 113 atoms in block 130
Block first atom: 15291
Blocpdb> 112 atoms in block 131
Block first atom: 15404
Blocpdb> 109 atoms in block 132
Block first atom: 15516
Blocpdb> 131 atoms in block 133
Block first atom: 15625
Blocpdb> 101 atoms in block 134
Block first atom: 15756
Blocpdb> 112 atoms in block 135
Block first atom: 15857
Blocpdb> 118 atoms in block 136
Block first atom: 15969
Blocpdb> 117 atoms in block 137
Block first atom: 16087
Blocpdb> 120 atoms in block 138
Block first atom: 16204
Blocpdb> 115 atoms in block 139
Block first atom: 16324
Blocpdb> 129 atoms in block 140
Block first atom: 16439
Blocpdb> 139 atoms in block 141
Block first atom: 16568
Blocpdb> 113 atoms in block 142
Block first atom: 16707
Blocpdb> 112 atoms in block 143
Block first atom: 16820
Blocpdb> 128 atoms in block 144
Block first atom: 16932
Blocpdb> 124 atoms in block 145
Block first atom: 17060
Blocpdb> 113 atoms in block 146
Block first atom: 17184
Blocpdb> 127 atoms in block 147
Block first atom: 17297
Blocpdb> 125 atoms in block 148
Block first atom: 17424
Blocpdb> 131 atoms in block 149
Block first atom: 17549
Blocpdb> 131 atoms in block 150
Block first atom: 17680
Blocpdb> 131 atoms in block 151
Block first atom: 17811
Blocpdb> 127 atoms in block 152
Block first atom: 17942
Blocpdb> 118 atoms in block 153
Block first atom: 18069
Blocpdb> 121 atoms in block 154
Block first atom: 18187
Blocpdb> 114 atoms in block 155
Block first atom: 18308
Blocpdb> 122 atoms in block 156
Block first atom: 18422
Blocpdb> 120 atoms in block 157
Block first atom: 18544
Blocpdb> 132 atoms in block 158
Block first atom: 18664
Blocpdb> 126 atoms in block 159
Block first atom: 18796
Blocpdb> 112 atoms in block 160
Block first atom: 18922
Blocpdb> 117 atoms in block 161
Block first atom: 19034
Blocpdb> 140 atoms in block 162
Block first atom: 19151
Blocpdb> 143 atoms in block 163
Block first atom: 19291
Blocpdb> 130 atoms in block 164
Block first atom: 19434
Blocpdb> 112 atoms in block 165
Block first atom: 19564
Blocpdb> 115 atoms in block 166
Block first atom: 19676
Blocpdb> 118 atoms in block 167
Block first atom: 19791
Blocpdb> 112 atoms in block 168
Block first atom: 19909
Blocpdb> 112 atoms in block 169
Block first atom: 20021
Blocpdb> 120 atoms in block 170
Block first atom: 20133
Blocpdb> 126 atoms in block 171
Block first atom: 20253
Blocpdb> 110 atoms in block 172
Block first atom: 20379
Blocpdb> 113 atoms in block 173
Block first atom: 20489
Blocpdb> 134 atoms in block 174
Block first atom: 20602
Blocpdb> 112 atoms in block 175
Block first atom: 20736
Blocpdb> 110 atoms in block 176
Block first atom: 20848
Blocpdb> 116 atoms in block 177
Block first atom: 20958
Blocpdb> 108 atoms in block 178
Block first atom: 21074
Blocpdb> 108 atoms in block 179
Block first atom: 21182
Blocpdb> 127 atoms in block 180
Block first atom: 21290
Blocpdb> 110 atoms in block 181
Block first atom: 21417
Blocpdb> 125 atoms in block 182
Block first atom: 21527
Blocpdb> 115 atoms in block 183
Block first atom: 21652
Blocpdb> 123 atoms in block 184
Block first atom: 21767
Blocpdb> 125 atoms in block 185
Block first atom: 21890
Blocpdb> 102 atoms in block 186
Block first atom: 22015
Blocpdb> 120 atoms in block 187
Block first atom: 22117
Blocpdb> 138 atoms in block 188
Block first atom: 22237
Blocpdb> 116 atoms in block 189
Block first atom: 22375
Blocpdb> 121 atoms in block 190
Block first atom: 22491
Blocpdb> 117 atoms in block 191
Block first atom: 22612
Blocpdb> 78 atoms in block 192
Block first atom: 22728
Blocpdb> 192 blocks.
Blocpdb> At most, 143 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 78 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 8033145 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 68418
Prepmat> Matrix trace = 17549660.0001
Prepmat> Last element read: 68418 68418 319.7058
Prepmat> 18529 lines saved.
Prepmat> 17214 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 22806
RTB> Total mass = 22806.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 22806
RTB> Number of blocks = 192
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 145233.2030
RTB> 44424 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1152
Diagstd> Nb of non-zero elements: 44424
Diagstd> Projected matrix trace = 145233.2030
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1152 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 145233.2030
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0006577 0.0010561 0.0032890 0.0047446
0.0099739 0.0168898 0.0388482 0.0596045 0.0738335
0.1520849 0.2094659 0.2541470 0.3652291 0.3832231
0.5022375 0.5149586 0.5984574 0.7018208 0.7667542
0.8486652 0.9069146 1.0660537 1.1889008 1.2206535
1.2751736 1.3991312 1.5148400 1.6398195 1.7345007
1.8849714 1.9924764 2.1917870 2.2433964 2.5200236
2.5824895 2.6173563 2.8325918 2.9443636 3.0854592
3.1993610 3.2356785 3.5388007 3.7220337 3.8571185
3.9252587 4.0334747 4.2653398 4.3862938 4.4795213
4.7431430 5.0017024 5.0135379 5.1522505 5.4043039
5.7197801 5.8828802 6.0792597 6.1787932 6.3897749
6.6649808 6.8449931 6.8937189 6.9749040 7.4974340
7.8109212 8.0531702 8.2458033 8.4975882 8.6714356
8.7653325 8.8306097 8.9346560 9.0841490 9.3599736
9.5608779 9.7345220 10.4447392 10.7006542 10.8446744
10.9068815 11.1436500 11.4973755 11.6629987 11.7532876
12.1947388 12.3952902 12.5548063 12.6822414 13.2413782
13.3288997 13.4860064 13.8447048 14.0283466 14.0893165
14.2227083 14.6011905 14.8908919 14.9049207 15.0176729
15.4012225
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034336 0.0034338 0.0034341 0.0034341 0.0034343
0.0034343 2.7849858 3.5289804 6.2276539 7.4799139
10.8449622 14.1126195 21.4032979 26.5115284 29.5068023
42.3485277 49.6994965 54.7441520 65.6263111 67.2234989
76.9573073 77.9258267 84.0063097 90.9721355 95.0874851
100.0376508 103.4137950 112.1204460 118.4044663 119.9751984
122.6252594 128.4471567 133.6529850 139.0571431 143.0153078
149.0897056 153.2822533 160.7660911 162.6478365 172.3842516
174.5076854 175.6817721 182.7625782 186.3335247 190.7458893
194.2347385 195.3340541 204.2788176 209.5006761 213.2685274
215.1440918 218.0895971 224.2704712 227.4281096 229.8323111
236.4984991 242.8589999 243.1461682 246.4868553 252.4440633
259.7077729 263.3845426 267.7445433 269.9274872 274.4972889
280.3462364 284.1069046 285.1163124 286.7902604 297.3388157
303.4914130 308.1617413 311.8255999 316.5505843 319.7722565
321.4988902 322.6938031 324.5892989 327.2935189 332.2252153
335.7717585 338.8071723 350.9490575 355.2224827 357.6049638
358.6291425 362.5008356 368.2092017 370.8518026 372.2845064
379.2115279 382.3170172 384.7691890 386.7170209 395.1498994
396.4536587 398.7832988 404.0518779 406.7228048 407.6056940
409.5306706 414.9439283 419.0401487 419.2374926 420.8202218
426.1601910
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 22806
Rtb_to_modes> Number of blocs = 192
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5774E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0561E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2890E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7446E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9739E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6890E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8848E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9604E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3834E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2095
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3652
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3832
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5150
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7018
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8487
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9069
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.189
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.221
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.275
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.399
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.515
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.885
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.582
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.617
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.833
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.944
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.085
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.199
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.236
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.539
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.722
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.857
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.925
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.033
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.386
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.743
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.002
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.014
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.152
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.404
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.720
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.179
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.665
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.845
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.497
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.246
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.498
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.671
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.765
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.831
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.935
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.40
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 0.99999
0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998
1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00005 0.99999
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 410508 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 0.99999
0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998
1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99998 1.00005 0.99999
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610221359293125904.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610221359293125904.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610221359293125904.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610221359293125904.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2870
First residue number = 1
Last residue number = 1435
Number of atoms found = 22806
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5774E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0561E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2890E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7446E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9739E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6890E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8848E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9604E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3834E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2095
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.40
Bfactors> 106 vectors, 68418 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000658
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.018 for 2870 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.216 +/- 3.59
Bfactors> = 0.660 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= -1.555
Bfactors> Scaling-fct= 0.049
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610221359293125904.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610221359293125904.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.529
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.70
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.01
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1
Chkmod> 106 vectors, 68418 coordinates in file.
Chkmod> That is: 22806 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 89 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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generate a series of perturbations for mode 9
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2610221359293125904.11.pdb
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2610221359293125904.8.pdb
2610221359293125904.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 6m15.185s
user 6m13.262s
sys 0m1.761s
rm: cannot remove '2610221359293125904.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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