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LOGs for ID: 2610221703163153700

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610221703163153700.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610221703163153700.atom to be opened. Openam> File opened: 2610221703163153700.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 951 First residue number = 1 Last residue number = 1132 Number of atoms found = 7634 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 215.065568 +/- 21.003502 From: 175.706000 To: 267.163000 = 221.748328 +/- 19.662221 From: 181.372000 To: 267.445000 = 204.399783 +/- 17.223287 From: 166.690000 To: 246.066000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0144 % Filled. Pdbmat> 2660273 non-zero elements. Pdbmat> 290541 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.12 +/- 20.19 Maximum number = 122 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.810820E+06 Pdbmat> Larger element = 483.844 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 951 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610221703163153700.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610221703163153700.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610221703163153700.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7634 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 951 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 40 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 44 atoms in block 3 Block first atom: 79 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 123 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 171 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 206 Blocpdb> 32 atoms in block 7 Block first atom: 253 Blocpdb> 49 atoms in block 8 Block first atom: 285 Blocpdb> 35 atoms in block 9 Block first atom: 334 Blocpdb> 40 atoms in block 10 Block first atom: 369 Blocpdb> 35 atoms in block 11 Block first atom: 409 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 444 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 485 Blocpdb> 30 atoms in block 14 Block first atom: 523 Blocpdb> 44 atoms in block 15 Block first atom: 553 Blocpdb> 40 atoms in block 16 Block first atom: 597 Blocpdb> 38 atoms in block 17 Block first atom: 637 Blocpdb> 43 atoms in block 18 Block first atom: 675 Blocpdb> 37 atoms in block 19 Block first atom: 718 Blocpdb> 35 atoms in block 20 Block first atom: 755 Blocpdb> 32 atoms in block 21 Block first atom: 790 Blocpdb> 37 atoms in block 22 Block first atom: 822 Blocpdb> 42 atoms in block 23 Block first atom: 859 Blocpdb> 35 atoms in block 24 Block first atom: 901 Blocpdb> 30 atoms in block 25 Block first atom: 936 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 966 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 1008 Blocpdb> 40 atoms in block 28 Block first atom: 1049 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 1089 Blocpdb> 39 atoms in block 30 Block first atom: 1127 Blocpdb> 31 atoms in block 31 Block first atom: 1166 Blocpdb> 39 atoms in block 32 Block first atom: 1197 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1236 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 1274 Blocpdb> 38 atoms in block 35 Block first atom: 1291 Blocpdb> 46 atoms in block 36 Block first atom: 1329 Blocpdb> 36 atoms in block 37 Block first atom: 1375 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1411 Blocpdb> 43 atoms in block 39 Block first atom: 1454 Blocpdb> 39 atoms in block 40 Block first atom: 1497 Blocpdb> 32 atoms in block 41 Block first atom: 1536 Blocpdb> 42 atoms in block 42 Block first atom: 1568 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1610 Blocpdb> 42 atoms in block 44 Block first atom: 1653 Blocpdb> 33 atoms in block 45 Block first atom: 1695 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 1728 Blocpdb> 47 atoms in block 47 Block first atom: 1776 Blocpdb> 49 atoms in block 48 Block first atom: 1823 Blocpdb> 44 atoms in block 49 Block first atom: 1872 Blocpdb> 35 atoms in block 50 Block first atom: 1916 Blocpdb> 38 atoms in block 51 Block first atom: 1951 Blocpdb> 39 atoms in block 52 Block first atom: 1989 Blocpdb> 42 atoms in block 53 Block first atom: 2028 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2070 Blocpdb> 40 atoms in block 55 Block first atom: 2114 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2154 Blocpdb> 49 atoms in block 57 Block first atom: 2196 Blocpdb> 38 atoms in block 58 Block first atom: 2245 Blocpdb> 44 atoms in block 59 Block first atom: 2283 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 2327 Blocpdb> 45 atoms in block 61 Block first atom: 2360 Blocpdb> 50 atoms in block 62 Block first atom: 2405 Blocpdb> 43 atoms in block 63 Block first atom: 2455 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 2498 Blocpdb> 37 atoms in block 65 Block first atom: 2540 Blocpdb> 40 atoms in block 66 Block first atom: 2577 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 2617 Blocpdb> 38 atoms in block 68 Block first atom: 2663 Blocpdb> 49 atoms in block 69 Block first atom: 2701 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2750 Blocpdb> 30 atoms in block 71 Block first atom: 2778 Blocpdb> 49 atoms in block 72 Block first atom: 2808 Blocpdb> 39 atoms in block 73 Block first atom: 2857 Blocpdb> 52 atoms in block 74 Block first atom: 2896 Blocpdb> 41 atoms in block 75 Block first atom: 2948 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 2989 Blocpdb> 51 atoms in block 77 Block first atom: 3028 Blocpdb> 37 atoms in block 78 Block first atom: 3079 Blocpdb> 48 atoms in block 79 Block first atom: 3116 Blocpdb> 53 atoms in block 80 Block first atom: 3164 Blocpdb> 42 atoms in block 81 Block first atom: 3217 Blocpdb> 40 atoms in block 82 Block first atom: 3259 Blocpdb> 42 atoms in block 83 Block first atom: 3299 Blocpdb> 44 atoms in block 84 Block first atom: 3341 Blocpdb> 42 atoms in block 85 Block first atom: 3385 Blocpdb> 41 atoms in block 86 Block first atom: 3427 Blocpdb> 44 atoms in block 87 Block first atom: 3468 Blocpdb> 39 atoms in block 88 Block first atom: 3512 Blocpdb> 43 atoms in block 89 Block first atom: 3551 Blocpdb> 42 atoms in block 90 Block first atom: 3594 Blocpdb> 38 atoms in block 91 Block first atom: 3636 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 3674 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 3713 Blocpdb> 51 atoms in block 94 Block first atom: 3748 Blocpdb> 43 atoms in block 95 Block first atom: 3799 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 3842 Blocpdb> 40 atoms in block 97 Block first atom: 3885 Blocpdb> 41 atoms in block 98 Block first atom: 3925 Blocpdb> 47 atoms in block 99 Block first atom: 3966 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 4013 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 4044 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4074 Blocpdb> 48 atoms in block 103 Block first atom: 4116 Blocpdb> 44 atoms in block 104 Block first atom: 4164 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4208 Blocpdb> 43 atoms in block 106 Block first atom: 4248 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4291 Blocpdb> 35 atoms in block 108 Block first atom: 4333 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 4368 Blocpdb> 43 atoms in block 110 Block first atom: 4407 Blocpdb> 34 atoms in block 111 Block first atom: 4450 Blocpdb> 41 atoms in block 112 Block first atom: 4484 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 4525 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 4568 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4610 Blocpdb> 41 atoms in block 116 Block first atom: 4648 Blocpdb> 41 atoms in block 117 Block first atom: 4689 Blocpdb> 35 atoms in block 118 Block first atom: 4730 Blocpdb> 44 atoms in block 119 Block first atom: 4765 Blocpdb> 46 atoms in block 120 Block first atom: 4809 Blocpdb> 41 atoms in block 121 Block first atom: 4855 Blocpdb> 39 atoms in block 122 Block first atom: 4896 Blocpdb> 35 atoms in block 123 Block first atom: 4935 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 4970 Blocpdb> 36 atoms in block 125 Block first atom: 5006 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 5042 Blocpdb> 48 atoms in block 127 Block first atom: 5079 Blocpdb> 39 atoms in block 128 Block first atom: 5127 Blocpdb> 41 atoms in block 129 Block first atom: 5166 Blocpdb> 43 atoms in block 130 Block first atom: 5207 Blocpdb> 34 atoms in block 131 Block first atom: 5250 Blocpdb> 35 atoms in block 132 Block first atom: 5284 Blocpdb> 35 atoms in block 133 Block first atom: 5319 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 5354 Blocpdb> 42 atoms in block 135 Block first atom: 5390 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 5432 Blocpdb> 42 atoms in block 137 Block first atom: 5468 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 5510 Blocpdb> 43 atoms in block 139 Block first atom: 5552 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 5595 Blocpdb> 38 atoms in block 141 Block first atom: 5634 Blocpdb> 45 atoms in block 142 Block first atom: 5672 Blocpdb> 36 atoms in block 143 Block first atom: 5717 Blocpdb> 38 atoms in block 144 Block first atom: 5753 Blocpdb> 43 atoms in block 145 Block first atom: 5791 Blocpdb> 40 atoms in block 146 Block first atom: 5834 Blocpdb> 40 atoms in block 147 Block first atom: 5874 Blocpdb> 28 atoms in block 148 Block first atom: 5914 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5942 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 5982 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 6016 Blocpdb> 39 atoms in block 152 Block first atom: 6058 Blocpdb> 42 atoms in block 153 Block first atom: 6097 Blocpdb> 41 atoms in block 154 Block first atom: 6139 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 6180 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 6221 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 6257 Blocpdb> 33 atoms in block 158 Block first atom: 6302 Blocpdb> 49 atoms in block 159 Block first atom: 6335 Blocpdb> 39 atoms in block 160 Block first atom: 6384 Blocpdb> 42 atoms in block 161 Block first atom: 6423 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 6465 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 6508 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 6548 Blocpdb> 41 atoms in block 165 Block first atom: 6585 Blocpdb> 41 atoms in block 166 Block first atom: 6626 Blocpdb> 48 atoms in block 167 Block first atom: 6667 Blocpdb> 36 atoms in block 168 Block first atom: 6715 Blocpdb> 45 atoms in block 169 Block first atom: 6751 Blocpdb> 48 atoms in block 170 Block first atom: 6796 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 6844 Blocpdb> 40 atoms in block 172 Block first atom: 6888 Blocpdb> 34 atoms in block 173 Block first atom: 6928 Blocpdb> 40 atoms in block 174 Block first atom: 6962 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 7002 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 7038 Blocpdb> 28 atoms in block 177 Block first atom: 7068 Blocpdb> 32 atoms in block 178 Block first atom: 7096 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 7128 Blocpdb> 38 atoms in block 180 Block first atom: 7172 Blocpdb> 44 atoms in block 181 Block first atom: 7210 Blocpdb> 46 atoms in block 182 Block first atom: 7254 Blocpdb> 41 atoms in block 183 Block first atom: 7300 Blocpdb> 37 atoms in block 184 Block first atom: 7341 Blocpdb> 37 atoms in block 185 Block first atom: 7378 Blocpdb> 42 atoms in block 186 Block first atom: 7415 Blocpdb> 33 atoms in block 187 Block first atom: 7457 Blocpdb> 34 atoms in block 188 Block first atom: 7490 Blocpdb> 30 atoms in block 189 Block first atom: 7524 Blocpdb> 40 atoms in block 190 Block first atom: 7554 Blocpdb> 41 atoms in block 191 Block first atom: 7593 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2660464 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22902 Prepmat> Matrix trace = 5810820.0000 Prepmat> Last element read: 22902 22902 118.8946 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16811 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7634 RTB> Total mass = 7634.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7634 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 191776.0523 RTB> 52035 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52035 Diagstd> Projected matrix trace = 191776.0523 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 191776.0523 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0941860 0.2546396 0.4947636 0.5950069 0.6318527 0.8909298 1.1269252 1.1998194 1.5469980 1.7025729 1.8826453 2.2035825 2.3692887 2.6137490 2.8923623 3.2556646 3.7250127 3.8048549 4.2598529 4.8715032 5.0843200 5.3767347 5.4656696 6.0215349 6.1736151 6.3255102 7.0865396 7.7037727 7.9182837 7.9925651 8.5584111 8.9676539 9.5193382 9.8384231 10.0851049 10.4968163 10.9201476 11.3434228 11.6634730 12.0180742 12.2415043 12.5807907 13.0387001 13.4799718 13.6330063 14.4042653 14.8941528 15.3939372 15.9440164 16.0762352 16.2455440 16.5064027 16.9836810 17.5823724 17.8670680 18.0830289 18.2803347 18.6496053 19.2906829 19.5491652 19.8127748 19.9287644 20.6747452 21.1118230 21.3235909 21.6229952 21.8195179 22.3222211 22.5156783 22.7983110 23.2423365 23.6499575 24.3811739 24.5437766 24.6696745 25.5382490 25.8789566 26.1546243 26.5616210 26.9662974 27.4241224 27.9360423 28.0265120 28.3702612 28.5845556 28.9283836 29.2682949 29.5814378 29.6943548 29.7584707 30.4273343 30.7688373 31.0966291 31.1759598 31.5850286 32.5125669 32.6848813 33.0213615 33.4074075 33.6787165 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034325 0.0034325 0.0034329 0.0034337 0.0034342 33.3263990 54.7971856 76.3825485 83.7637800 86.3183674 102.4983825 115.2770440 118.9469241 135.0641727 141.6929145 148.9976896 161.1981071 167.1491890 175.5606669 184.6807475 195.9363940 209.5844998 211.8187152 224.1261773 239.6772294 244.8565468 251.7993387 253.8732650 266.4703443 269.8143565 273.1134319 289.0762350 301.4026113 305.5700668 306.9999979 317.6814469 325.1881419 335.0415425 340.6104975 344.8541767 351.8228793 358.8471768 365.7356881 370.8593429 376.4546973 379.9379495 385.1671575 392.1140726 398.6940668 400.9508121 412.1362702 419.0860289 426.0593846 433.6048648 435.3990293 437.6857524 441.1857716 447.5187046 455.3381280 459.0097652 461.7754798 464.2878848 468.9538468 476.9458578 480.1306027 483.3569106 484.7697001 493.7593845 498.9512887 501.4474779 504.9556160 507.2450941 513.0550692 515.2734884 518.4974411 523.5222845 528.0930628 536.1947860 537.9798068 539.3578330 548.7706032 552.4190686 555.3535122 559.6578097 563.9049929 568.6717436 573.9548364 574.8834502 578.3982191 580.5785718 584.0598655 587.4812240 590.6156084 591.7417707 592.3802691 599.0005665 602.3526469 605.5526893 606.3246105 610.2895271 619.1856880 620.8243414 624.0117512 627.6487488 630.1922334 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7634 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4186E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.200 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.703 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.614 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.725 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.377 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.466 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 137412 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610221703163153700.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610221703163153700.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610221703163153700.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610221703163153700.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 951 First residue number = 1 Last residue number = 1132 Number of atoms found = 7634 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4186E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.200 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.703 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.614 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.725 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.377 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.466 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68 Bfactors> 106 vectors, 22902 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.094186 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.520 for 951 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.065 +/- 0.06 Bfactors> = 131.541 +/- 69.47 Bfactors> Shiftng-fct= 131.476 Bfactors> Scaling-fct= 1076.906 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610221703163153700.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610221703163153700.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.8 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vecteur en lecture: 528.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 7634 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9930 0.0034 0.7755 0.0034 0.7851 0.0034 0.6985 0.0034 0.7147 0.0034 0.7601 33.3250 0.4893 54.7906 0.5402 76.3821 0.5892 83.7597 0.4811 86.3179 0.6139 102.4923 0.5388 115.2759 0.5083 118.9508 0.6482 135.0585 0.3847 141.7046 0.5173 149.0053 0.5488 161.2065 0.5221 167.1318 0.6933 175.5616 0.3836 184.6613 0.5254 195.9381 0.3158 209.5751 0.5903 211.8137 0.2300 224.1204 0.3424 239.6792 0.2084 244.8383 0.0543 251.7947 0.1274 253.8700 0.2665 266.4692 0.4962 269.8112 0.3928 273.1123 0.3260 289.0732 0.6147 301.3941 0.2675 305.5515 0.5098 306.9952 0.3635 317.6602 0.4602 325.1805 0.4121 335.0212 0.1667 340.5886 0.2043 344.9231 0.0985 351.8611 0.2318 358.8293 0.3987 365.6648 0.4605 370.7882 0.3798 376.4687 0.3959 379.8983 0.5156 385.1385 0.2901 392.1168 0.3242 398.6774 0.5285 400.8894 0.4365 412.0576 0.3522 419.0096 0.3939 425.9866 0.4577 433.5316 0.3629 435.4313 0.2539 437.7270 0.3349 441.2149 0.4254 447.4510 0.3993 455.2879 0.3082 459.0277 0.2711 461.7170 0.2499 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DQ=-80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom making animated gifs 11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom making animated gifs 11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom making animated gifs 11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610221703163153700.eigenfacs 2610221703163153700.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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