***  hTERT.tcc  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610221703163153700.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610221703163153700.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610221703163153700.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 951
First residue number = 1
Last residue number = 1132
Number of atoms found = 7634
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 215.065568 +/- 21.003502 From: 175.706000 To: 267.163000
= 221.748328 +/- 19.662221 From: 181.372000 To: 267.445000
= 204.399783 +/- 17.223287 From: 166.690000 To: 246.066000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.0144 % Filled.
Pdbmat> 2660273 non-zero elements.
Pdbmat> 290541 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.12 +/- 20.19
Maximum number = 122
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 5.810820E+06
Pdbmat> Larger element = 483.844
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
951 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610221703163153700.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610221703163153700.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610221703163153700.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7634 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 951 residues.
Blocpdb> 38 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 40 atoms in block 2
Block first atom: 39
Blocpdb> 44 atoms in block 3
Block first atom: 79
Blocpdb> 48 atoms in block 4
Block first atom: 123
Blocpdb> 35 atoms in block 5
Block first atom: 171
Blocpdb> 47 atoms in block 6
Block first atom: 206
Blocpdb> 32 atoms in block 7
Block first atom: 253
Blocpdb> 49 atoms in block 8
Block first atom: 285
Blocpdb> 35 atoms in block 9
Block first atom: 334
Blocpdb> 40 atoms in block 10
Block first atom: 369
Blocpdb> 35 atoms in block 11
Block first atom: 409
Blocpdb> 41 atoms in block 12
Block first atom: 444
Blocpdb> 38 atoms in block 13
Block first atom: 485
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 523
Blocpdb> 44 atoms in block 15
Block first atom: 553
Blocpdb> 40 atoms in block 16
Block first atom: 597
Blocpdb> 38 atoms in block 17
Block first atom: 637
Blocpdb> 43 atoms in block 18
Block first atom: 675
Blocpdb> 37 atoms in block 19
Block first atom: 718
Blocpdb> 35 atoms in block 20
Block first atom: 755
Blocpdb> 32 atoms in block 21
Block first atom: 790
Blocpdb> 37 atoms in block 22
Block first atom: 822
Blocpdb> 42 atoms in block 23
Block first atom: 859
Blocpdb> 35 atoms in block 24
Block first atom: 901
Blocpdb> 30 atoms in block 25
Block first atom: 936
Blocpdb> 42 atoms in block 26
Block first atom: 966
Blocpdb> 41 atoms in block 27
Block first atom: 1008
Blocpdb> 40 atoms in block 28
Block first atom: 1049
Blocpdb> 38 atoms in block 29
Block first atom: 1089
Blocpdb> 39 atoms in block 30
Block first atom: 1127
Blocpdb> 31 atoms in block 31
Block first atom: 1166
Blocpdb> 39 atoms in block 32
Block first atom: 1197
Blocpdb> 38 atoms in block 33
Block first atom: 1236
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 1274
Blocpdb> 38 atoms in block 35
Block first atom: 1291
Blocpdb> 46 atoms in block 36
Block first atom: 1329
Blocpdb> 36 atoms in block 37
Block first atom: 1375
Blocpdb> 43 atoms in block 38
Block first atom: 1411
Blocpdb> 43 atoms in block 39
Block first atom: 1454
Blocpdb> 39 atoms in block 40
Block first atom: 1497
Blocpdb> 32 atoms in block 41
Block first atom: 1536
Blocpdb> 42 atoms in block 42
Block first atom: 1568
Blocpdb> 43 atoms in block 43
Block first atom: 1610
Blocpdb> 42 atoms in block 44
Block first atom: 1653
Blocpdb> 33 atoms in block 45
Block first atom: 1695
Blocpdb> 48 atoms in block 46
Block first atom: 1728
Blocpdb> 47 atoms in block 47
Block first atom: 1776
Blocpdb> 49 atoms in block 48
Block first atom: 1823
Blocpdb> 44 atoms in block 49
Block first atom: 1872
Blocpdb> 35 atoms in block 50
Block first atom: 1916
Blocpdb> 38 atoms in block 51
Block first atom: 1951
Blocpdb> 39 atoms in block 52
Block first atom: 1989
Blocpdb> 42 atoms in block 53
Block first atom: 2028
Blocpdb> 44 atoms in block 54
Block first atom: 2070
Blocpdb> 40 atoms in block 55
Block first atom: 2114
Blocpdb> 42 atoms in block 56
Block first atom: 2154
Blocpdb> 49 atoms in block 57
Block first atom: 2196
Blocpdb> 38 atoms in block 58
Block first atom: 2245
Blocpdb> 44 atoms in block 59
Block first atom: 2283
Blocpdb> 33 atoms in block 60
Block first atom: 2327
Blocpdb> 45 atoms in block 61
Block first atom: 2360
Blocpdb> 50 atoms in block 62
Block first atom: 2405
Blocpdb> 43 atoms in block 63
Block first atom: 2455
Blocpdb> 42 atoms in block 64
Block first atom: 2498
Blocpdb> 37 atoms in block 65
Block first atom: 2540
Blocpdb> 40 atoms in block 66
Block first atom: 2577
Blocpdb> 46 atoms in block 67
Block first atom: 2617
Blocpdb> 38 atoms in block 68
Block first atom: 2663
Blocpdb> 49 atoms in block 69
Block first atom: 2701
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2750
Blocpdb> 30 atoms in block 71
Block first atom: 2778
Blocpdb> 49 atoms in block 72
Block first atom: 2808
Blocpdb> 39 atoms in block 73
Block first atom: 2857
Blocpdb> 52 atoms in block 74
Block first atom: 2896
Blocpdb> 41 atoms in block 75
Block first atom: 2948
Blocpdb> 39 atoms in block 76
Block first atom: 2989
Blocpdb> 51 atoms in block 77
Block first atom: 3028
Blocpdb> 37 atoms in block 78
Block first atom: 3079
Blocpdb> 48 atoms in block 79
Block first atom: 3116
Blocpdb> 53 atoms in block 80
Block first atom: 3164
Blocpdb> 42 atoms in block 81
Block first atom: 3217
Blocpdb> 40 atoms in block 82
Block first atom: 3259
Blocpdb> 42 atoms in block 83
Block first atom: 3299
Blocpdb> 44 atoms in block 84
Block first atom: 3341
Blocpdb> 42 atoms in block 85
Block first atom: 3385
Blocpdb> 41 atoms in block 86
Block first atom: 3427
Blocpdb> 44 atoms in block 87
Block first atom: 3468
Blocpdb> 39 atoms in block 88
Block first atom: 3512
Blocpdb> 43 atoms in block 89
Block first atom: 3551
Blocpdb> 42 atoms in block 90
Block first atom: 3594
Blocpdb> 38 atoms in block 91
Block first atom: 3636
Blocpdb> 39 atoms in block 92
Block first atom: 3674
Blocpdb> 35 atoms in block 93
Block first atom: 3713
Blocpdb> 51 atoms in block 94
Block first atom: 3748
Blocpdb> 43 atoms in block 95
Block first atom: 3799
Blocpdb> 43 atoms in block 96
Block first atom: 3842
Blocpdb> 40 atoms in block 97
Block first atom: 3885
Blocpdb> 41 atoms in block 98
Block first atom: 3925
Blocpdb> 47 atoms in block 99
Block first atom: 3966
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 4013
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 4044
Blocpdb> 42 atoms in block 102
Block first atom: 4074
Blocpdb> 48 atoms in block 103
Block first atom: 4116
Blocpdb> 44 atoms in block 104
Block first atom: 4164
Blocpdb> 40 atoms in block 105
Block first atom: 4208
Blocpdb> 43 atoms in block 106
Block first atom: 4248
Blocpdb> 42 atoms in block 107
Block first atom: 4291
Blocpdb> 35 atoms in block 108
Block first atom: 4333
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 4368
Blocpdb> 43 atoms in block 110
Block first atom: 4407
Blocpdb> 34 atoms in block 111
Block first atom: 4450
Blocpdb> 41 atoms in block 112
Block first atom: 4484
Blocpdb> 43 atoms in block 113
Block first atom: 4525
Blocpdb> 42 atoms in block 114
Block first atom: 4568
Blocpdb> 38 atoms in block 115
Block first atom: 4610
Blocpdb> 41 atoms in block 116
Block first atom: 4648
Blocpdb> 41 atoms in block 117
Block first atom: 4689
Blocpdb> 35 atoms in block 118
Block first atom: 4730
Blocpdb> 44 atoms in block 119
Block first atom: 4765
Blocpdb> 46 atoms in block 120
Block first atom: 4809
Blocpdb> 41 atoms in block 121
Block first atom: 4855
Blocpdb> 39 atoms in block 122
Block first atom: 4896
Blocpdb> 35 atoms in block 123
Block first atom: 4935
Blocpdb> 36 atoms in block 124
Block first atom: 4970
Blocpdb> 36 atoms in block 125
Block first atom: 5006
Blocpdb> 37 atoms in block 126
Block first atom: 5042
Blocpdb> 48 atoms in block 127
Block first atom: 5079
Blocpdb> 39 atoms in block 128
Block first atom: 5127
Blocpdb> 41 atoms in block 129
Block first atom: 5166
Blocpdb> 43 atoms in block 130
Block first atom: 5207
Blocpdb> 34 atoms in block 131
Block first atom: 5250
Blocpdb> 35 atoms in block 132
Block first atom: 5284
Blocpdb> 35 atoms in block 133
Block first atom: 5319
Blocpdb> 36 atoms in block 134
Block first atom: 5354
Blocpdb> 42 atoms in block 135
Block first atom: 5390
Blocpdb> 36 atoms in block 136
Block first atom: 5432
Blocpdb> 42 atoms in block 137
Block first atom: 5468
Blocpdb> 42 atoms in block 138
Block first atom: 5510
Blocpdb> 43 atoms in block 139
Block first atom: 5552
Blocpdb> 39 atoms in block 140
Block first atom: 5595
Blocpdb> 38 atoms in block 141
Block first atom: 5634
Blocpdb> 45 atoms in block 142
Block first atom: 5672
Blocpdb> 36 atoms in block 143
Block first atom: 5717
Blocpdb> 38 atoms in block 144
Block first atom: 5753
Blocpdb> 43 atoms in block 145
Block first atom: 5791
Blocpdb> 40 atoms in block 146
Block first atom: 5834
Blocpdb> 40 atoms in block 147
Block first atom: 5874
Blocpdb> 28 atoms in block 148
Block first atom: 5914
Blocpdb> 40 atoms in block 149
Block first atom: 5942
Blocpdb> 34 atoms in block 150
Block first atom: 5982
Blocpdb> 42 atoms in block 151
Block first atom: 6016
Blocpdb> 39 atoms in block 152
Block first atom: 6058
Blocpdb> 42 atoms in block 153
Block first atom: 6097
Blocpdb> 41 atoms in block 154
Block first atom: 6139
Blocpdb> 41 atoms in block 155
Block first atom: 6180
Blocpdb> 36 atoms in block 156
Block first atom: 6221
Blocpdb> 45 atoms in block 157
Block first atom: 6257
Blocpdb> 33 atoms in block 158
Block first atom: 6302
Blocpdb> 49 atoms in block 159
Block first atom: 6335
Blocpdb> 39 atoms in block 160
Block first atom: 6384
Blocpdb> 42 atoms in block 161
Block first atom: 6423
Blocpdb> 43 atoms in block 162
Block first atom: 6465
Blocpdb> 40 atoms in block 163
Block first atom: 6508
Blocpdb> 37 atoms in block 164
Block first atom: 6548
Blocpdb> 41 atoms in block 165
Block first atom: 6585
Blocpdb> 41 atoms in block 166
Block first atom: 6626
Blocpdb> 48 atoms in block 167
Block first atom: 6667
Blocpdb> 36 atoms in block 168
Block first atom: 6715
Blocpdb> 45 atoms in block 169
Block first atom: 6751
Blocpdb> 48 atoms in block 170
Block first atom: 6796
Blocpdb> 44 atoms in block 171
Block first atom: 6844
Blocpdb> 40 atoms in block 172
Block first atom: 6888
Blocpdb> 34 atoms in block 173
Block first atom: 6928
Blocpdb> 40 atoms in block 174
Block first atom: 6962
Blocpdb> 36 atoms in block 175
Block first atom: 7002
Blocpdb> 30 atoms in block 176
Block first atom: 7038
Blocpdb> 28 atoms in block 177
Block first atom: 7068
Blocpdb> 32 atoms in block 178
Block first atom: 7096
Blocpdb> 44 atoms in block 179
Block first atom: 7128
Blocpdb> 38 atoms in block 180
Block first atom: 7172
Blocpdb> 44 atoms in block 181
Block first atom: 7210
Blocpdb> 46 atoms in block 182
Block first atom: 7254
Blocpdb> 41 atoms in block 183
Block first atom: 7300
Blocpdb> 37 atoms in block 184
Block first atom: 7341
Blocpdb> 37 atoms in block 185
Block first atom: 7378
Blocpdb> 42 atoms in block 186
Block first atom: 7415
Blocpdb> 33 atoms in block 187
Block first atom: 7457
Blocpdb> 34 atoms in block 188
Block first atom: 7490
Blocpdb> 30 atoms in block 189
Block first atom: 7524
Blocpdb> 40 atoms in block 190
Block first atom: 7554
Blocpdb> 41 atoms in block 191
Block first atom: 7593
Blocpdb> 191 blocks.
Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2660464 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 22902
Prepmat> Matrix trace = 5810820.0000
Prepmat> Last element read: 22902 22902 118.8946
Prepmat> 18337 lines saved.
Prepmat> 16811 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7634
RTB> Total mass = 7634.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7634
RTB> Number of blocks = 191
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 191776.0523
RTB> 52035 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1146
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52035
Diagstd> Projected matrix trace = 191776.0523
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1146 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 191776.0523
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0941860 0.2546396 0.4947636 0.5950069
0.6318527 0.8909298 1.1269252 1.1998194 1.5469980
1.7025729 1.8826453 2.2035825 2.3692887 2.6137490
2.8923623 3.2556646 3.7250127 3.8048549 4.2598529
4.8715032 5.0843200 5.3767347 5.4656696 6.0215349
6.1736151 6.3255102 7.0865396 7.7037727 7.9182837
7.9925651 8.5584111 8.9676539 9.5193382 9.8384231
10.0851049 10.4968163 10.9201476 11.3434228 11.6634730
12.0180742 12.2415043 12.5807907 13.0387001 13.4799718
13.6330063 14.4042653 14.8941528 15.3939372 15.9440164
16.0762352 16.2455440 16.5064027 16.9836810 17.5823724
17.8670680 18.0830289 18.2803347 18.6496053 19.2906829
19.5491652 19.8127748 19.9287644 20.6747452 21.1118230
21.3235909 21.6229952 21.8195179 22.3222211 22.5156783
22.7983110 23.2423365 23.6499575 24.3811739 24.5437766
24.6696745 25.5382490 25.8789566 26.1546243 26.5616210
26.9662974 27.4241224 27.9360423 28.0265120 28.3702612
28.5845556 28.9283836 29.2682949 29.5814378 29.6943548
29.7584707 30.4273343 30.7688373 31.0966291 31.1759598
31.5850286 32.5125669 32.6848813 33.0213615 33.4074075
33.6787165
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034325 0.0034325 0.0034329 0.0034337
0.0034342 33.3263990 54.7971856 76.3825485 83.7637800
86.3183674 102.4983825 115.2770440 118.9469241 135.0641727
141.6929145 148.9976896 161.1981071 167.1491890 175.5606669
184.6807475 195.9363940 209.5844998 211.8187152 224.1261773
239.6772294 244.8565468 251.7993387 253.8732650 266.4703443
269.8143565 273.1134319 289.0762350 301.4026113 305.5700668
306.9999979 317.6814469 325.1881419 335.0415425 340.6104975
344.8541767 351.8228793 358.8471768 365.7356881 370.8593429
376.4546973 379.9379495 385.1671575 392.1140726 398.6940668
400.9508121 412.1362702 419.0860289 426.0593846 433.6048648
435.3990293 437.6857524 441.1857716 447.5187046 455.3381280
459.0097652 461.7754798 464.2878848 468.9538468 476.9458578
480.1306027 483.3569106 484.7697001 493.7593845 498.9512887
501.4474779 504.9556160 507.2450941 513.0550692 515.2734884
518.4974411 523.5222845 528.0930628 536.1947860 537.9798068
539.3578330 548.7706032 552.4190686 555.3535122 559.6578097
563.9049929 568.6717436 573.9548364 574.8834502 578.3982191
580.5785718 584.0598655 587.4812240 590.6156084 591.7417707
592.3802691 599.0005665 602.3526469 605.5526893 606.3246105
610.2895271 619.1856880 620.8243414 624.0117512 627.6487488
630.1922334
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7634
Rtb_to_modes> Number of blocs = 191
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4186E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4948
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5950
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6319
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8909
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.127
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.547
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.204
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.614
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.892
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.725
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.805
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.872
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.377
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.466
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.174
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.326
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.087
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.704
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.993
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.968
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.519
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001
0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 137412 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 1.00001
0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002
1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610221703163153700.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610221703163153700.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610221703163153700.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610221703163153700.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 951
First residue number = 1
Last residue number = 1132
Number of atoms found = 7634
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4186E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5950
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8909
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.547
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.204
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.614
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.892
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.725
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.805
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.377
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.466
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.022
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.326
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.993
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.968
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.519
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.838
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68
Bfactors> 106 vectors, 22902 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.094186
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.520 for 951 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.065 +/- 0.06
Bfactors> = 131.541 +/- 69.47
Bfactors> Shiftng-fct= 131.476
Bfactors> Scaling-fct= 1076.906
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610221703163153700.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610221703163153700.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.2
Chkmod> 106 vectors, 22902 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7634 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9930
0.0034 0.7755
0.0034 0.7851
0.0034 0.6985
0.0034 0.7147
0.0034 0.7601
33.3250 0.4893
54.7906 0.5402
76.3821 0.5892
83.7597 0.4811
86.3179 0.6139
102.4923 0.5388
115.2759 0.5083
118.9508 0.6482
135.0585 0.3847
141.7046 0.5173
149.0053 0.5488
161.2065 0.5221
167.1318 0.6933
175.5616 0.3836
184.6613 0.5254
195.9381 0.3158
209.5751 0.5903
211.8137 0.2300
224.1204 0.3424
239.6792 0.2084
244.8383 0.0543
251.7947 0.1274
253.8700 0.2665
266.4692 0.4962
269.8112 0.3928
273.1123 0.3260
289.0732 0.6147
301.3941 0.2675
305.5515 0.5098
306.9952 0.3635
317.6602 0.4602
325.1805 0.4121
335.0212 0.1667
340.5886 0.2043
344.9231 0.0985
351.8611 0.2318
358.8293 0.3987
365.6648 0.4605
370.7882 0.3798
376.4687 0.3959
379.8983 0.5156
385.1385 0.2901
392.1168 0.3242
398.6774 0.5285
400.8894 0.4365
412.0576 0.3522
419.0096 0.3939
425.9866 0.4577
433.5316 0.3629
435.4313 0.2539
437.7270 0.3349
441.2149 0.4254
447.4510 0.3993
455.2879 0.3082
459.0277 0.2711
461.7170 0.2499
464.2637 0.4398
468.9387 0.2213
476.9169 0.4370
480.1202 0.4874
483.3023 0.4624
484.7639 0.4368
493.6815 0.2826
498.9083 0.5330
501.3837 0.3332
504.8990 0.4685
507.2289 0.5156
513.0075 0.4714
515.3008 0.3843
518.4944 0.3920
523.4735 0.5590
528.0709 0.4654
536.1589 0.5266
537.9153 0.4241
539.3382 0.5536
548.7659 0.4181
552.4065 0.3483
555.2806 0.3909
559.6167 0.3625
563.9195 0.4606
568.6046 0.3821
573.9709 0.2753
574.8945 0.3073
578.3707 0.4485
580.5074 0.3481
584.0511 0.5111
587.4731 0.4900
590.5759 0.4161
591.6730 0.5426
592.3701 0.3961
599.0011 0.4250
602.3382 0.5677
605.5595 0.4888
606.3379 0.4572
610.3114 0.5187
619.1347 0.5527
620.7513 0.3961
623.9721 0.4094
627.6462 0.4560
630.1772 0.4303
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
making animated gifs
11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
making animated gifs
11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
making animated gifs
11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
making animated gifs
11 models are in 2610221703163153700.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610221703163153700 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610221703163153700.eigenfacs
2610221703163153700.atom
making animated gifs
11 models are in 2610221703163153700.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610221703163153700.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610221703163153700.10.pdb
2610221703163153700.11.pdb
2610221703163153700.7.pdb
2610221703163153700.8.pdb
2610221703163153700.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m52.035s
user 0m51.566s
sys 0m0.449s
rm: cannot remove '2610221703163153700.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|